Doublet Group distance statistics: 48150

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 4, 3, 1, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.008, 0.019, 0.030, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.019 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.014, 0.025, 0.037, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.025 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.006, 0.022, 0.037, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.022 std_dev=0.016
N7	A	0, 0.012, 0.031, 0.049, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.031 std_dev=0.019
N3	A	0, 0.008, 0.027, 0.047, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.027 std_dev=0.019
N1	A	0, 0.007, 0.029, 0.051, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.029 std_dev=0.022
C8	A	0, 0.017, 0.039, 0.061, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.039 std_dev=0.022
N9	A	0, 0.020, 0.043, 0.066, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.043 std_dev=0.023
C2	A	0, 0.002, 0.026, 0.050, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.026 std_dev=0.024
N6	A	0, 0.023, 0.058, 0.093, 0.128 max_d=0.128 avg_d=0.058 std_dev=0.035
C1'	A	0, 0.003, 0.039, 0.074, 0.121 max_d=0.121 avg_d=0.039 std_dev=0.036
C2'	A	0, 0.043, 0.155, 0.267, 0.404 max_d=0.404 avg_d=0.155 std_dev=0.112
O4'	A	0, 0.031, 0.163, 0.295, 0.422 max_d=0.422 avg_d=0.163 std_dev=0.132
C3'	A	0, 0.088, 0.250, 0.412, 0.566 max_d=0.566 avg_d=0.250 std_dev=0.162
O2'	A	0, 0.066, 0.230, 0.394, 0.609 max_d=0.609 avg_d=0.230 std_dev=0.164
O3'	A	0, 0.150, 0.317, 0.484, 0.632 max_d=0.632 avg_d=0.317 std_dev=0.167
C4'	A	0, 0.096, 0.265, 0.435, 0.592 max_d=0.592 avg_d=0.265 std_dev=0.170
O3'	B	0, 0.169, 0.405, 0.641, 0.797 max_d=0.797 avg_d=0.405 std_dev=0.236
C4'	B	0, 0.125, 0.392, 0.660, 1.033 max_d=1.033 avg_d=0.392 std_dev=0.267
P	B	0, 0.074, 0.346, 0.617, 1.014 max_d=1.014 avg_d=0.346 std_dev=0.271
OP1	B	0, 0.166, 0.449, 0.732, 1.047 max_d=1.047 avg_d=0.449 std_dev=0.283
C5'	A	0, 0.147, 0.432, 0.717, 0.999 max_d=0.999 avg_d=0.432 std_dev=0.285
C3'	B	0, 0.138, 0.428, 0.717, 1.166 max_d=1.166 avg_d=0.428 std_dev=0.289
OP2	B	0, 0.228, 0.540, 0.851, 1.258 max_d=1.258 avg_d=0.540 std_dev=0.312
O4'	B	0, 0.087, 0.407, 0.728, 0.987 max_d=0.987 avg_d=0.407 std_dev=0.320
O5'	B	0, 0.093, 0.438, 0.783, 0.971 max_d=0.971 avg_d=0.438 std_dev=0.345
C1'	B	0, 0.022, 0.368, 0.713, 1.351 max_d=1.351 avg_d=0.368 std_dev=0.345
C2'	B	0, 0.115, 0.529, 0.944, 1.537 max_d=1.537 avg_d=0.529 std_dev=0.414
O5'	A	0, 0.032, 0.459, 0.886, 1.413 max_d=1.413 avg_d=0.459 std_dev=0.427
C5'	B	0, 0.073, 0.512, 0.951, 1.354 max_d=1.354 avg_d=0.512 std_dev=0.439
N1	B	0, -0.020, 0.428, 0.875, 1.747 max_d=1.747 avg_d=0.428 std_dev=0.447
O2	B	0, 0.102, 0.557, 1.013, 1.834 max_d=1.834 avg_d=0.557 std_dev=0.456
C2	B	0, 0.008, 0.510, 1.011, 1.938 max_d=1.938 avg_d=0.510 std_dev=0.501
C6	B	0, -0.015, 0.492, 0.999, 2.009 max_d=2.009 avg_d=0.492 std_dev=0.507
O2'	B	0, 0.148, 0.754, 1.360, 1.816 max_d=1.816 avg_d=0.754 std_dev=0.606
C5	B	0, -0.008, 0.603, 1.213, 2.383 max_d=2.383 avg_d=0.603 std_dev=0.611
N3	B	0, -0.042, 0.588, 1.219, 2.332 max_d=2.332 avg_d=0.588 std_dev=0.631
C4	B	0, -0.051, 0.634, 1.319, 2.551 max_d=2.551 avg_d=0.634 std_dev=0.685
P	A	0, 0.473, 1.199, 1.925, 2.541 max_d=2.541 avg_d=1.199 std_dev=0.726
O4	B	0, -0.095, 0.699, 1.493, 2.907 max_d=2.907 avg_d=0.699 std_dev=0.794
OP2	A	0, 0.753, 1.586, 2.419, 2.785 max_d=2.785 avg_d=1.586 std_dev=0.833
OP1	A	0, 0.591, 1.701, 2.810, 3.572 max_d=3.572 avg_d=1.701 std_dev=1.109

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.07	0.01	0.01	0.04	0.01	0.04	0.05	0.06	0.02	0.08	0.07	0.06	0.02	0.01	0.01	0.04	0.01	0.14	0.41	0.35	0.13
C2	0.07	0.00	0.05	0.10	0.02	0.16	0.02	0.24	0.02	0.03	0.01	0.01	0.03	0.03	0.03	0.06	0.10	0.17	0.39	0.61	0.61	0.42
C2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.03	0.02	0.04	0.08	0.05	0.06	0.06	0.05	0.07	0.06	0.03	0.00	0.01	0.01	0.09	0.48	0.35	0.14
C3'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.05	0.01	0.06	0.01	0.08	0.06	0.10	0.09	0.09	0.06	0.03	0.02	0.00	0.02	0.04	0.32	0.31	0.02
C4	0.04	0.02	0.03	0.05	0.00	0.09	0.01	0.18	0.02	0.02	0.03	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.05	0.09	0.32	0.63	0.49	0.36
C4'	0.01	0.16	0.02	0.01	0.09	0.00	0.10	0.00	0.13	0.05	0.16	0.14	0.13	0.07	0.04	0.02	0.02	0.01	0.02	0.23	0.30	0.05
C5	0.04	0.02	0.04	0.06	0.01	0.10	0.00	0.21	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.03	0.05	0.08	0.37	0.77	0.54	0.45
C5'	0.05	0.24	0.08	0.01	0.18	0.00	0.21	0.00	0.24	0.14	0.26	0.20	0.26	0.18	0.12	0.07	0.02	0.01	0.01	0.28	0.30	0.01
C6	0.06	0.02	0.05	0.08	0.02	0.13	0.01	0.24	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.04	0.07	0.12	0.42	0.80	0.62	0.51
C8	0.02	0.03	0.06	0.06	0.02	0.05	0.01	0.14	0.02	0.00	0.03	0.02	0.04	0.01	0.01	0.07	0.06	0.05	0.25	0.73	0.43	0.33
N1	0.08	0.01	0.06	0.10	0.03	0.16	0.01	0.26	0.01	0.03	0.00	0.02	0.03	0.02	0.04	0.05	0.09	0.16	0.44	0.73	0.65	0.49
N3	0.07	0.01	0.05	0.09	0.01	0.14	0.02	0.20	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.05	0.09	0.16	0.34	0.54	0.53	0.35
N6	0.06	0.03	0.07	0.09	0.03	0.13	0.03	0.26	0.00	0.04	0.03	0.02	0.00	0.04	0.05	0.05	0.07	0.11	0.44	0.89	0.65	0.56
N7	0.02	0.03	0.06	0.06	0.02	0.07	0.01	0.18	0.01	0.01	0.02	0.03	0.04	0.00	0.02	0.06	0.06	0.04	0.32	0.82	0.49	0.43
N9	0.01	0.03	0.03	0.03	0.01	0.04	0.02	0.12	0.04	0.01	0.04	0.02	0.05	0.02	0.00	0.02	0.04	0.02	0.24	0.59	0.40	0.27
O2'	0.01	0.06	0.00	0.02	0.03	0.02	0.03	0.07	0.04	0.07	0.05	0.05	0.05	0.06	0.02	0.00	0.06	0.02	0.08	0.50	0.35	0.14
O3'	0.04	0.10	0.01	0.00	0.05	0.02	0.05	0.02	0.07	0.06	0.09	0.09	0.07	0.06	0.04	0.06	0.00	0.07	0.07	0.26	0.30	0.05
O4'	0.01	0.17	0.01	0.02	0.09	0.01	0.08	0.01	0.12	0.05	0.16	0.16	0.11	0.04	0.02	0.02	0.07	0.00	0.14	0.28	0.34	0.09
O5'	0.14	0.39	0.09	0.04	0.32	0.02	0.37	0.01	0.42	0.25	0.44	0.34	0.44	0.32	0.24	0.08	0.07	0.14	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.41	0.61	0.48	0.32	0.63	0.23	0.77	0.28	0.80	0.73	0.73	0.54	0.89	0.82	0.59	0.50	0.26	0.28	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.35	0.61	0.35	0.31	0.49	0.30	0.54	0.30	0.62	0.43	0.65	0.53	0.65	0.49	0.40	0.35	0.30	0.34	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.13	0.42	0.14	0.02	0.36	0.05	0.45	0.01	0.51	0.33	0.49	0.35	0.56	0.43	0.27	0.14	0.05	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.25	0.29	0.22	0.38	0.19	0.41	0.24	0.35	0.26	0.30	0.20	0.26	0.13	0.41	0.24	0.37	0.17	0.10	0.14
C2	0.19	0.24	0.35	0.26	0.38	0.20	0.40	0.29	0.33	0.24	0.30	0.20	0.33	0.13	0.42	0.21	0.32	0.10	0.08	0.12
C2'	0.21	0.25	0.30	0.23	0.39	0.20	0.42	0.29	0.37	0.27	0.31	0.21	0.27	0.13	0.42	0.25	0.35	0.22	0.09	0.10
C3'	0.26	0.30	0.28	0.23	0.42	0.26	0.46	0.20	0.42	0.32	0.35	0.25	0.23	0.18	0.45	0.33	0.41	0.25	0.14	0.14
C4	0.20	0.25	0.34	0.25	0.39	0.19	0.41	0.27	0.34	0.25	0.31	0.21	0.33	0.13	0.43	0.22	0.32	0.12	0.08	0.13
C4'	0.30	0.34	0.29	0.25	0.46	0.32	0.50	0.23	0.46	0.36	0.39	0.29	0.26	0.23	0.49	0.37	0.47	0.15	0.14	0.18
C5	0.20	0.26	0.36	0.25	0.40	0.18	0.41	0.26	0.33	0.25	0.33	0.22	0.37	0.13	0.45	0.22	0.29	0.14	0.09	0.13
C5'	0.35	0.41	0.30	0.27	0.52	0.40	0.55	0.37	0.50	0.42	0.46	0.37	0.28	0.28	0.55	0.44	0.49	0.09	0.13	0.20
C6	0.20	0.26	0.37	0.26	0.40	0.18	0.41	0.27	0.33	0.25	0.33	0.22	0.39	0.13	0.46	0.21	0.28	0.14	0.11	0.13
C8	0.21	0.28	0.36	0.25	0.41	0.18	0.43	0.24	0.35	0.27	0.34	0.24	0.38	0.13	0.46	0.23	0.29	0.14	0.09	0.14
N1	0.19	0.24	0.36	0.27	0.39	0.19	0.40	0.29	0.32	0.24	0.31	0.21	0.37	0.13	0.44	0.20	0.29	0.12	0.10	0.12
N3	0.20	0.24	0.34	0.26	0.37	0.21	0.40	0.29	0.33	0.25	0.29	0.20	0.32	0.13	0.41	0.22	0.33	0.10	0.07	0.12
N6	0.20	0.27	0.39	0.27	0.42	0.18	0.42	0.26	0.33	0.26	0.35	0.24	0.42	0.14	0.48	0.21	0.25	0.16	0.13	0.13
N7	0.20	0.27	0.37	0.25	0.42	0.17	0.42	0.24	0.34	0.26	0.35	0.24	0.40	0.13	0.47	0.23	0.27	0.16	0.10	0.14
N9	0.20	0.25	0.33	0.24	0.39	0.19	0.41	0.26	0.34	0.26	0.31	0.22	0.32	0.12	0.43	0.23	0.33	0.13	0.08	0.14
O2'	0.24	0.29	0.39	0.33	0.39	0.29	0.41	0.51	0.37	0.29	0.33	0.26	0.32	0.17	0.41	0.26	0.21	0.28	0.11	0.11
O3'	0.25	0.27	0.27	0.24	0.39	0.25	0.44	0.25	0.40	0.30	0.32	0.21	0.19	0.18	0.41	0.31	0.35	0.27	0.14	0.13
O4'	0.25	0.30	0.26	0.21	0.44	0.25	0.48	0.17	0.42	0.32	0.36	0.25	0.24	0.19	0.48	0.31	0.46	0.22	0.18	0.23
O5'	0.44	0.48	0.41	0.43	0.53	0.51	0.54	0.47	0.51	0.47	0.50	0.48	0.39	0.45	0.56	0.51	0.49	0.09	0.09	0.16
OP1	0.32	0.33	0.34	0.37	0.41	0.40	0.44	0.38	0.40	0.34	0.35	0.32	0.40	0.47	0.44	0.36	0.32	0.54	0.61	0.50
OP2	0.71	0.81	0.60	0.62	0.89	0.76	0.88	0.80	0.83	0.78	0.86	0.79	0.52	0.63	0.93	0.81	0.80	0.68	0.55	0.63
P	0.32	0.38	0.28	0.31	0.47	0.42	0.47	0.42	0.42	0.37	0.42	0.38	0.30	0.35	0.50	0.41	0.36	0.10	0.10	0.09

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.09	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.10	0.03	0.00	0.26	0.20	0.24	0.14
C2	0.02	0.00	0.13	0.06	0.01	0.02	0.01	0.17	0.01	0.01	0.00	0.01	0.19	0.10	0.01	0.07	0.35	0.25	0.34	0.25
C2'	0.01	0.13	0.00	0.01	0.03	0.02	0.09	0.13	0.13	0.01	0.10	0.24	0.01	0.02	0.04	0.02	0.53	0.49	0.28	0.43
C3'	0.02	0.06	0.01	0.00	0.04	0.01	0.07	0.03	0.08	0.02	0.05	0.12	0.02	0.01	0.05	0.01	0.30	0.38	0.14	0.26
C4	0.03	0.01	0.03	0.04	0.00	0.09	0.01	0.30	0.01	0.02	0.00	0.02	0.09	0.10	0.00	0.05	0.46	0.40	0.48	0.41
C4'	0.01	0.02	0.02	0.01	0.09	0.00	0.12	0.01	0.12	0.04	0.04	0.05	0.03	0.02	0.09	0.01	0.02	0.12	0.28	0.03
C5	0.02	0.01	0.09	0.07	0.01	0.12	0.00	0.34	0.00	0.01	0.01	0.01	0.18	0.11	0.02	0.09	0.48	0.42	0.48	0.43
C5'	0.09	0.17	0.13	0.03	0.30	0.01	0.34	0.00	0.30	0.19	0.23	0.11	0.11	0.05	0.32	0.03	0.01	0.09	0.27	0.01
C6	0.02	0.01	0.13	0.08	0.01	0.12	0.00	0.30	0.00	0.01	0.01	0.01	0.20	0.12	0.02	0.10	0.44	0.33	0.38	0.34
N1	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.19	0.01	0.00	0.02	0.01	0.05	0.10	0.02	0.02	0.35	0.24	0.31	0.23
N3	0.03	0.00	0.10	0.05	0.00	0.04	0.01	0.23	0.01	0.02	0.00	0.02	0.14	0.10	0.01	0.06	0.40	0.32	0.41	0.33
O2	0.03	0.01	0.24	0.12	0.02	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.02	0.00	0.40	0.12	0.02	0.11	0.29	0.20	0.31	0.19
O2'	0.02	0.19	0.01	0.02	0.09	0.03	0.18	0.11	0.20	0.05	0.14	0.40	0.00	0.05	0.10	0.03	0.56	0.61	0.43	0.53
O3'	0.10	0.10	0.02	0.01	0.10	0.02	0.11	0.05	0.12	0.10	0.10	0.12	0.05	0.00	0.10	0.10	0.16	0.30	0.13	0.16
O4	0.03	0.01	0.04	0.05	0.00	0.09	0.02	0.32	0.02	0.02	0.01	0.02	0.10	0.10	0.00	0.05	0.48	0.46	0.52	0.46
O4'	0.00	0.07	0.02	0.01	0.05	0.01	0.09	0.03	0.10	0.02	0.06	0.11	0.03	0.10	0.05	0.00	0.08	0.05	0.43	0.15
O5'	0.26	0.35	0.53	0.30	0.46	0.02	0.48	0.01	0.44	0.35	0.40	0.29	0.56	0.16	0.48	0.08	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.20	0.25	0.49	0.38	0.40	0.12	0.42	0.09	0.33	0.24	0.32	0.20	0.61	0.30	0.46	0.05	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.24	0.34	0.28	0.14	0.48	0.28	0.48	0.27	0.38	0.31	0.41	0.31	0.43	0.13	0.52	0.43	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.14	0.25	0.43	0.26	0.41	0.03	0.43	0.01	0.34	0.23	0.33	0.19	0.53	0.16	0.46	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00