Doublet Group distance statistics: 48153

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.007, 0.013, 0.019, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.013 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.008, 0.016, 0.024, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.016 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.009, 0.018, 0.027, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.018 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.008, 0.017, 0.027, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.017 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.007, 0.017, 0.026, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.017 std_dev=0.010
N9	A	0, 0.012, 0.022, 0.032, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.022 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.013, 0.024, 0.035, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.024 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.012, 0.026, 0.039, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.026 std_dev=0.013
N7	A	0, 0.018, 0.033, 0.049, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.033 std_dev=0.015
N6	A	0, 0.015, 0.031, 0.046, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.031 std_dev=0.015
C8	A	0, 0.021, 0.036, 0.052, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.036 std_dev=0.016
O2'	A	0, 0.127, 0.230, 0.333, 0.341 max_d=0.341 avg_d=0.230 std_dev=0.103
O4'	A	0, 0.146, 0.251, 0.355, 0.312 max_d=0.312 avg_d=0.251 std_dev=0.105
C2'	A	0, 0.149, 0.255, 0.361, 0.317 max_d=0.317 avg_d=0.255 std_dev=0.106
C4'	A	0, 0.236, 0.406, 0.575, 0.522 max_d=0.522 avg_d=0.406 std_dev=0.169
C3'	A	0, 0.244, 0.417, 0.590, 0.525 max_d=0.525 avg_d=0.417 std_dev=0.173
O3'	A	0, 0.298, 0.511, 0.723, 0.653 max_d=0.653 avg_d=0.511 std_dev=0.212
OP1	B	0, 0.314, 0.575, 0.837, 0.827 max_d=0.827 avg_d=0.575 std_dev=0.261
C5'	A	0, 0.409, 0.698, 0.987, 0.886 max_d=0.886 avg_d=0.698 std_dev=0.289
P	B	0, 0.353, 0.660, 0.966, 0.888 max_d=0.888 avg_d=0.660 std_dev=0.307
OP2	B	0, 0.348, 0.675, 1.001, 0.973 max_d=0.973 avg_d=0.675 std_dev=0.326
O5'	A	0, 0.542, 0.925, 1.308, 1.161 max_d=1.161 avg_d=0.925 std_dev=0.383
P	A	0, 0.668, 1.144, 1.620, 1.444 max_d=1.444 avg_d=1.144 std_dev=0.476
O5'	B	0, 0.658, 1.138, 1.617, 1.491 max_d=1.491 avg_d=1.138 std_dev=0.480
O2	B	0, 0.454, 0.964, 1.475, 1.537 max_d=1.537 avg_d=0.964 std_dev=0.510
OP1	A	0, 0.704, 1.232, 1.760, 1.621 max_d=1.621 avg_d=1.232 std_dev=0.528
N3	B	0, 0.532, 1.064, 1.597, 1.662 max_d=1.662 avg_d=1.064 std_dev=0.533
C2	B	0, 0.551, 1.086, 1.621, 1.671 max_d=1.671 avg_d=1.086 std_dev=0.535
OP2	A	0, 0.712, 1.249, 1.786, 1.658 max_d=1.658 avg_d=1.249 std_dev=0.537
C4	B	0, 0.668, 1.268, 1.867, 1.888 max_d=1.888 avg_d=1.268 std_dev=0.600
C5'	B	0, 0.828, 1.429, 2.029, 1.881 max_d=1.881 avg_d=1.429 std_dev=0.600
O4	B	0, 0.643, 1.263, 1.883, 1.926 max_d=1.926 avg_d=1.263 std_dev=0.620
N1	B	0, 0.777, 1.398, 2.020, 1.967 max_d=1.967 avg_d=1.398 std_dev=0.621
O4'	B	0, 0.862, 1.496, 2.130, 1.993 max_d=1.993 avg_d=1.496 std_dev=0.634
C1'	B	0, 0.847, 1.496, 2.144, 2.041 max_d=2.041 avg_d=1.496 std_dev=0.649
C4'	B	0, 0.923, 1.595, 2.267, 2.095 max_d=2.095 avg_d=1.595 std_dev=0.672
C5	B	0, 0.904, 1.604, 2.304, 2.189 max_d=2.189 avg_d=1.604 std_dev=0.700
C6	B	0, 0.942, 1.649, 2.355, 2.204 max_d=2.204 avg_d=1.649 std_dev=0.706
C2'	B	0, 0.953, 1.662, 2.371, 2.228 max_d=2.228 avg_d=1.662 std_dev=0.709
C3'	B	0, 0.985, 1.703, 2.421, 2.229 max_d=2.229 avg_d=1.703 std_dev=0.718
O2'	B	0, 0.998, 1.735, 2.472, 2.318 max_d=2.318 avg_d=1.735 std_dev=0.737
O3'	B	0, 1.122, 1.938, 2.754, 2.508 max_d=2.508 avg_d=1.938 std_dev=0.816

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.11	0.05	0.03
C2	0.02	0.00	0.02	0.06	0.01	0.06	0.01	0.10	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.02	0.02	0.03	0.07	0.04	0.14	0.12	0.20	0.14
C2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.09	0.08	0.02
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.04	0.02	0.05	0.06	0.04	0.04	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.06	0.10	0.02
C4	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.02	0.11	0.07	0.13	0.08
C4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.04	0.00	0.03	0.00	0.04	0.02	0.05	0.06	0.04	0.03	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.08	0.06	0.03
C5	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.03	0.00	0.06	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.04	0.02	0.12	0.07	0.13	0.08
C5'	0.01	0.10	0.01	0.01	0.06	0.00	0.06	0.00	0.07	0.03	0.09	0.09	0.07	0.05	0.03	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.08	0.01
C6	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.02	0.13	0.09	0.16	0.12
C8	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.02	0.02	0.09	0.09	0.07	0.04
N1	0.02	0.00	0.02	0.05	0.02	0.05	0.02	0.09	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.06	0.03	0.14	0.11	0.19	0.14
N3	0.01	0.00	0.02	0.06	0.00	0.06	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.07	0.04	0.12	0.09	0.17	0.11
N6	0.02	0.02	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.05	0.02	0.14	0.09	0.16	0.12
N7	0.02	0.02	0.02	0.04	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.03	0.03	0.02	0.11	0.08	0.10	0.06
N9	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.08	0.08	0.08	0.03
O2'	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.03	0.03	0.03	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.12	0.07	0.04
O3'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.05	0.01	0.04	0.01	0.05	0.02	0.06	0.07	0.05	0.03	0.02	0.02	0.00	0.01	0.06	0.08	0.10	0.04
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.04	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.06	0.09	0.04	0.03
O5'	0.04	0.14	0.02	0.02	0.11	0.01	0.12	0.00	0.13	0.09	0.14	0.12	0.14	0.11	0.08	0.03	0.06	0.06	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.11	0.12	0.09	0.06	0.07	0.08	0.07	0.03	0.09	0.09	0.11	0.09	0.09	0.08	0.08	0.12	0.08	0.09	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.05	0.20	0.08	0.10	0.13	0.06	0.13	0.08	0.16	0.07	0.19	0.17	0.16	0.10	0.08	0.07	0.10	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.03	0.14	0.02	0.02	0.08	0.03	0.08	0.01	0.12	0.04	0.14	0.11	0.12	0.06	0.03	0.04	0.04	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.08	0.13	0.07	0.08	0.23	0.08	0.22	0.08	0.15	0.11	0.19	0.10	0.09	0.10	0.29	0.07	0.08	0.07	0.13	0.10
C2	0.03	0.09	0.04	0.05	0.20	0.04	0.19	0.04	0.12	0.07	0.16	0.07	0.07	0.07	0.27	0.02	0.03	0.05	0.09	0.06
C2'	0.07	0.11	0.05	0.06	0.21	0.07	0.18	0.07	0.12	0.09	0.16	0.08	0.08	0.09	0.26	0.07	0.07	0.08	0.12	0.09
C3'	0.06	0.10	0.05	0.06	0.20	0.07	0.17	0.07	0.11	0.08	0.16	0.08	0.08	0.09	0.26	0.06	0.07	0.07	0.11	0.08
C4	0.04	0.10	0.04	0.05	0.21	0.05	0.19	0.04	0.12	0.08	0.16	0.07	0.07	0.07	0.26	0.03	0.04	0.06	0.10	0.07
C4'	0.06	0.12	0.05	0.07	0.23	0.07	0.20	0.07	0.13	0.09	0.19	0.10	0.08	0.10	0.29	0.06	0.07	0.06	0.12	0.09
C5	0.03	0.08	0.04	0.05	0.18	0.03	0.18	0.03	0.11	0.07	0.14	0.07	0.07	0.07	0.24	0.02	0.04	0.06	0.08	0.06
C5'	0.07	0.13	0.06	0.08	0.23	0.08	0.20	0.08	0.13	0.10	0.20	0.12	0.08	0.11	0.30	0.06	0.07	0.06	0.12	0.09
C6	0.02	0.07	0.04	0.04	0.17	0.03	0.17	0.03	0.10	0.05	0.13	0.07	0.07	0.06	0.23	0.01	0.04	0.06	0.07	0.05
C8	0.05	0.10	0.05	0.05	0.19	0.05	0.19	0.05	0.13	0.08	0.15	0.08	0.08	0.08	0.24	0.05	0.04	0.06	0.09	0.06
N1	0.02	0.08	0.04	0.05	0.19	0.03	0.18	0.03	0.11	0.06	0.14	0.06	0.07	0.06	0.25	0.01	0.03	0.05	0.08	0.05
N3	0.04	0.10	0.04	0.05	0.21	0.04	0.20	0.05	0.12	0.08	0.17	0.07	0.07	0.08	0.28	0.03	0.04	0.06	0.11	0.07
N6	0.03	0.06	0.05	0.05	0.15	0.04	0.15	0.04	0.09	0.05	0.11	0.08	0.07	0.06	0.20	0.03	0.06	0.07	0.07	0.05
N7	0.03	0.08	0.04	0.04	0.18	0.03	0.17	0.03	0.11	0.06	0.13	0.07	0.07	0.07	0.23	0.02	0.04	0.06	0.07	0.05
N9	0.06	0.11	0.05	0.06	0.21	0.06	0.20	0.06	0.14	0.09	0.17	0.08	0.08	0.09	0.27	0.05	0.06	0.06	0.11	0.08
O2'	0.06	0.09	0.05	0.06	0.19	0.06	0.16	0.06	0.10	0.07	0.15	0.07	0.07	0.07	0.25	0.07	0.07	0.09	0.11	0.08
O3'	0.04	0.07	0.02	0.04	0.16	0.04	0.13	0.05	0.07	0.05	0.13	0.06	0.05	0.07	0.23	0.05	0.05	0.06	0.08	0.06
O4'	0.09	0.16	0.08	0.09	0.27	0.09	0.24	0.10	0.17	0.13	0.22	0.13	0.10	0.12	0.33	0.08	0.08	0.08	0.15	0.11
O5'	0.08	0.16	0.09	0.11	0.24	0.11	0.20	0.12	0.14	0.12	0.21	0.15	0.11	0.16	0.30	0.07	0.08	0.10	0.13	0.12
OP1	0.15	0.14	0.15	0.12	0.14	0.12	0.12	0.11	0.13	0.14	0.14	0.17	0.12	0.08	0.19	0.16	0.15	0.08	0.08	0.08
OP2	0.06	0.13	0.05	0.06	0.21	0.06	0.17	0.07	0.11	0.09	0.18	0.13	0.05	0.09	0.28	0.05	0.05	0.07	0.11	0.09
P	0.07	0.11	0.06	0.05	0.18	0.05	0.15	0.05	0.10	0.08	0.16	0.13	0.04	0.07	0.24	0.07	0.06	0.03	0.07	0.04

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.05	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.04	0.07	0.05
C2	0.03	0.00	0.05	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.09	0.03	0.01	0.02	0.09	0.09	0.08	0.07
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.04	0.09	0.00	0.01	0.03	0.01	0.03	0.05	0.06	0.04
C3'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.08	0.00	0.11	0.01	0.10	0.04	0.04	0.07	0.01	0.00	0.09	0.01	0.02	0.07	0.04	0.03
C4	0.02	0.01	0.03	0.08	0.00	0.07	0.01	0.13	0.02	0.02	0.00	0.01	0.05	0.08	0.01	0.03	0.18	0.17	0.15	0.16
C4'	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.00	0.09	0.01	0.08	0.02	0.03	0.06	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.04	0.04	0.03
C5	0.01	0.01	0.04	0.11	0.01	0.09	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.12	0.03	0.03	0.19	0.17	0.13	0.15
C5'	0.02	0.04	0.01	0.01	0.13	0.01	0.15	0.00	0.11	0.05	0.08	0.05	0.03	0.02	0.15	0.01	0.00	0.05	0.02	0.02
C6	0.02	0.02	0.04	0.10	0.02	0.08	0.01	0.11	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.11	0.04	0.03	0.14	0.11	0.04	0.08
N1	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.02	0.01	0.05	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.01	0.08	0.07	0.05	0.05
N3	0.02	0.01	0.04	0.04	0.00	0.03	0.01	0.08	0.02	0.02	0.00	0.01	0.09	0.03	0.01	0.02	0.14	0.14	0.12	0.12
O2	0.05	0.01	0.09	0.07	0.01	0.06	0.01	0.05	0.02	0.02	0.01	0.00	0.15	0.10	0.01	0.05	0.08	0.09	0.09	0.08
O2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.05	0.03	0.03	0.03	0.03	0.02	0.09	0.15	0.00	0.03	0.06	0.03	0.02	0.06	0.04	0.02
O3'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.08	0.01	0.12	0.02	0.11	0.03	0.03	0.10	0.03	0.00	0.10	0.01	0.01	0.09	0.04	0.03
O4	0.02	0.01	0.03	0.09	0.01	0.08	0.03	0.15	0.04	0.02	0.01	0.01	0.06	0.10	0.00	0.04	0.21	0.22	0.21	0.20
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.05	0.03	0.01	0.04	0.00	0.03	0.04	0.08	0.06
O5'	0.04	0.09	0.03	0.02	0.18	0.01	0.19	0.00	0.14	0.08	0.14	0.08	0.02	0.01	0.21	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.04	0.09	0.05	0.07	0.17	0.04	0.17	0.05	0.11	0.07	0.14	0.09	0.06	0.09	0.22	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.07	0.08	0.06	0.04	0.15	0.04	0.13	0.02	0.04	0.05	0.12	0.09	0.04	0.04	0.21	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.07	0.04	0.03	0.16	0.03	0.15	0.02	0.08	0.05	0.12	0.08	0.02	0.03	0.20	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00