Doublet Group distance statistics: 48156

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.015, 0.025, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.015 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.004, 0.016, 0.028, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.016 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.006, 0.020, 0.035, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.020 std_dev=0.014
C2	A	0, 0.006, 0.022, 0.037, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.022 std_dev=0.015
N6	A	0, -0.003, 0.012, 0.028, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.012 std_dev=0.015
N1	A	0, 0.005, 0.020, 0.036, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.020 std_dev=0.016
N3	A	0, 0.006, 0.024, 0.042, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.024 std_dev=0.018
C1'	A	0, 0.003, 0.022, 0.041, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.022 std_dev=0.019
N7	A	0, 0.008, 0.030, 0.052, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.030 std_dev=0.022
C8	A	0, 0.008, 0.036, 0.064, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.036 std_dev=0.028
N9	A	0, 0.009, 0.050, 0.092, 0.101 max_d=0.101 avg_d=0.050 std_dev=0.041
P	B	0, 0.076, 0.322, 0.567, 0.595 max_d=0.595 avg_d=0.322 std_dev=0.245
OP1	B	0, 0.102, 0.375, 0.649, 0.642 max_d=0.642 avg_d=0.375 std_dev=0.273
O3'	B	0, 0.122, 0.437, 0.752, 0.731 max_d=0.731 avg_d=0.437 std_dev=0.315
OP2	B	0, -0.049, 0.287, 0.623, 0.758 max_d=0.758 avg_d=0.287 std_dev=0.336
C3'	B	0, 0.105, 0.526, 0.946, 1.029 max_d=1.029 avg_d=0.526 std_dev=0.420
O5'	B	0, 0.138, 0.566, 0.994, 1.035 max_d=1.035 avg_d=0.566 std_dev=0.428
C5'	B	0, 0.167, 0.649, 1.130, 1.153 max_d=1.153 avg_d=0.649 std_dev=0.482
C4'	B	0, 0.194, 0.723, 1.252, 1.251 max_d=1.251 avg_d=0.723 std_dev=0.529
C2'	B	0, 0.267, 1.008, 1.749, 1.758 max_d=1.758 avg_d=1.008 std_dev=0.741
O4'	B	0, 0.299, 1.058, 1.817, 1.746 max_d=1.746 avg_d=1.058 std_dev=0.759
O2'	B	0, 0.360, 1.281, 2.203, 2.128 max_d=2.128 avg_d=1.281 std_dev=0.922
C1'	B	0, 0.397, 1.414, 2.431, 2.348 max_d=2.348 avg_d=1.414 std_dev=1.017
O4'	A	0, 0.531, 1.813, 3.095, 2.726 max_d=2.726 avg_d=1.813 std_dev=1.282
C2'	A	0, 0.534, 1.824, 3.114, 2.768 max_d=2.768 avg_d=1.824 std_dev=1.290
N1	B	0, 0.516, 1.818, 3.120, 2.980 max_d=2.980 avg_d=1.818 std_dev=1.302
C6	B	0, 0.540, 1.889, 3.237, 3.060 max_d=3.060 avg_d=1.889 std_dev=1.348
C2	B	0, 0.684, 2.402, 4.120, 3.917 max_d=3.917 avg_d=2.402 std_dev=1.718
C5	B	0, 0.731, 2.529, 4.327, 4.019 max_d=4.019 avg_d=2.529 std_dev=1.798
C3'	A	0, 0.745, 2.543, 4.341, 3.851 max_d=3.851 avg_d=2.543 std_dev=1.798
O2'	A	0, 0.744, 2.547, 4.350, 3.930 max_d=3.930 avg_d=2.547 std_dev=1.803
C4'	A	0, 0.758, 2.589, 4.421, 3.933 max_d=3.933 avg_d=2.589 std_dev=1.831
O2	B	0, 0.734, 2.598, 4.462, 4.283 max_d=4.283 avg_d=2.598 std_dev=1.864
O3'	A	0, 0.794, 2.717, 4.640, 4.182 max_d=4.182 avg_d=2.717 std_dev=1.923
N3	B	0, 0.832, 2.894, 4.957, 4.650 max_d=4.650 avg_d=2.894 std_dev=2.062
C4	B	0, 0.875, 3.030, 5.185, 4.824 max_d=4.824 avg_d=3.030 std_dev=2.155
O4	B	0, 1.052, 3.623, 6.193, 5.691 max_d=5.691 avg_d=3.623 std_dev=2.570
C5'	A	0, 1.313, 4.482, 7.651, 6.745 max_d=6.745 avg_d=4.482 std_dev=3.169
O5'	A	0, 1.605, 5.479, 9.353, 8.233 max_d=8.233 avg_d=5.479 std_dev=3.874
P	A	0, 2.046, 6.985, 11.924, 10.481 max_d=10.481 avg_d=6.985 std_dev=4.939
OP2	A	0, 2.255, 7.701, 13.146, 11.584 max_d=11.584 avg_d=7.701 std_dev=5.445
OP1	A	0, 2.375, 8.108, 13.841, 12.201 max_d=12.201 avg_d=8.108 std_dev=5.733

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.06	0.01	0.02	0.04	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.22	0.00	0.16	0.05	0.61	0.35
C2	0.04	0.00	0.27	0.27	0.02	0.43	0.00	0.82	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.02	0.27	0.27	0.23	0.50	0.61	0.34	0.29
C2'	0.01	0.27	0.00	0.01	0.12	0.01	0.03	0.15	0.09	0.17	0.19	0.28	0.04	0.12	0.02	0.00	0.03	0.01	0.06	0.14	0.23	0.05
C3'	0.02	0.27	0.01	0.00	0.01	0.00	0.19	0.01	0.10	0.50	0.11	0.29	0.20	0.44	0.19	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.13	0.05
C4	0.02	0.02	0.12	0.01	0.00	0.17	0.01	0.38	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.21	0.11	0.14	0.15	0.17	0.88	0.37
C4'	0.01	0.43	0.01	0.00	0.17	0.00	0.06	0.00	0.14	0.30	0.31	0.42	0.08	0.22	0.06	0.23	0.02	0.00	0.01	0.18	0.09	0.04
C5	0.01	0.00	0.03	0.19	0.01	0.06	0.00	0.19	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.22	0.11	0.08	0.42	0.39	1.35	0.72
C5'	0.06	0.82	0.15	0.01	0.38	0.00	0.19	0.00	0.35	0.38	0.63	0.77	0.24	0.28	0.08	0.07	0.13	0.01	0.00	0.13	0.02	0.01
C6	0.01	0.02	0.09	0.10	0.00	0.14	0.00	0.35	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.26	0.07	0.13	0.28	0.30	1.21	0.55
C8	0.02	0.01	0.17	0.50	0.01	0.30	0.00	0.38	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.12	0.30	0.09	0.91	0.79	1.67	1.17
N1	0.04	0.01	0.19	0.11	0.02	0.31	0.01	0.63	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.28	0.14	0.19	0.26	0.37	0.73	0.20
N3	0.04	0.00	0.28	0.29	0.00	0.42	0.02	0.77	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.01	0.24	0.31	0.23	0.46	0.54	0.32	0.23
N6	0.01	0.03	0.04	0.20	0.01	0.08	0.00	0.24	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.26	0.16	0.10	0.44	0.47	1.48	0.76
N7	0.01	0.00	0.12	0.44	0.01	0.22	0.00	0.28	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.17	0.30	0.05	0.86	0.82	1.83	1.18
N9	0.01	0.02	0.02	0.19	0.00	0.06	0.01	0.08	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.13	0.08	0.02	0.40	0.30	1.06	0.64
O2'	0.01	0.27	0.00	0.01	0.21	0.23	0.22	0.07	0.26	0.12	0.28	0.24	0.26	0.17	0.13	0.00	0.03	0.17	0.01	0.02	0.18	0.10
O3'	0.22	0.27	0.03	0.01	0.11	0.02	0.11	0.13	0.07	0.30	0.14	0.31	0.16	0.30	0.08	0.03	0.00	0.17	0.10	0.02	0.11	0.09
O4'	0.00	0.23	0.01	0.01	0.14	0.00	0.08	0.01	0.13	0.09	0.19	0.23	0.10	0.05	0.02	0.17	0.17	0.00	0.18	0.01	0.51	0.34
O5'	0.16	0.50	0.06	0.01	0.15	0.01	0.42	0.00	0.28	0.91	0.26	0.46	0.44	0.86	0.40	0.01	0.10	0.18	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.05	0.61	0.14	0.08	0.17	0.18	0.39	0.13	0.30	0.79	0.37	0.54	0.47	0.82	0.30	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.61	0.34	0.23	0.13	0.88	0.09	1.35	0.02	1.21	1.67	0.73	0.32	1.48	1.83	1.06	0.18	0.11	0.51	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.35	0.29	0.05	0.05	0.37	0.04	0.72	0.01	0.55	1.17	0.20	0.23	0.76	1.18	0.64	0.10	0.09	0.34	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.25	0.11	0.13	0.36	0.15	0.37	0.22	0.33	0.25	0.30	0.21	0.20	0.14	0.39	0.16	0.16	0.10	0.21	0.13
C2	0.16	0.14	0.20	0.06	0.72	0.11	0.80	0.08	0.55	0.20	0.42	0.14	0.45	0.13	0.82	0.11	0.05	0.09	0.10	0.09
C2'	0.48	0.46	0.46	0.62	0.53	0.68	0.58	0.86	0.59	0.53	0.47	0.40	0.27	0.56	0.53	0.60	0.86	0.64	0.58	0.69
C3'	0.24	0.27	0.17	0.40	0.46	0.49	0.54	0.87	0.51	0.35	0.33	0.16	0.12	0.32	0.48	0.39	0.92	0.83	0.96	0.93
C4	0.16	0.06	0.16	0.06	0.38	0.11	0.47	0.11	0.36	0.11	0.19	0.12	0.37	0.10	0.44	0.12	0.06	0.08	0.11	0.08
C4'	0.38	0.27	0.54	0.36	0.11	0.24	0.11	0.18	0.09	0.22	0.18	0.40	0.83	0.48	0.12	0.22	0.24	0.36	0.51	0.39
C5	0.33	0.24	0.25	0.09	0.14	0.18	0.27	0.07	0.13	0.17	0.11	0.37	0.42	0.09	0.21	0.27	0.06	0.07	0.05	0.06
C5'	0.84	0.75	1.02	0.69	0.37	0.49	0.21	0.07	0.32	0.63	0.60	0.97	1.39	0.79	0.30	0.55	0.22	0.57	0.76	0.54
C6	0.41	0.36	0.31	0.13	0.16	0.20	0.35	0.07	0.13	0.24	0.18	0.54	0.48	0.13	0.27	0.30	0.07	0.08	0.03	0.07
C8	0.20	0.15	0.16	0.06	0.10	0.14	0.11	0.12	0.09	0.12	0.11	0.20	0.29	0.06	0.13	0.19	0.09	0.05	0.11	0.06
N1	0.32	0.16	0.28	0.11	0.51	0.16	0.67	0.06	0.37	0.06	0.12	0.43	0.50	0.14	0.64	0.21	0.06	0.09	0.06	0.08
N3	0.08	0.25	0.13	0.05	0.65	0.09	0.70	0.12	0.55	0.28	0.44	0.07	0.38	0.12	0.71	0.07	0.07	0.10	0.13	0.10
N6	0.50	0.60	0.37	0.18	0.17	0.25	0.07	0.12	0.11	0.43	0.48	0.74	0.51	0.15	0.09	0.36	0.11	0.08	0.04	0.09
N7	0.34	0.33	0.24	0.10	0.16	0.19	0.09	0.09	0.13	0.27	0.27	0.39	0.36	0.07	0.15	0.30	0.07	0.05	0.04	0.06
N9	0.10	0.10	0.12	0.10	0.28	0.13	0.33	0.18	0.27	0.13	0.16	0.08	0.27	0.11	0.32	0.11	0.12	0.08	0.16	0.10
O2'	0.70	0.64	0.73	0.80	0.57	0.82	0.56	0.85	0.61	0.65	0.59	0.66	0.65	0.79	0.55	0.72	0.92	0.70	0.46	0.68
O3'	0.34	0.35	0.33	0.54	0.45	0.58	0.50	0.92	0.49	0.40	0.38	0.29	0.11	0.50	0.47	0.44	1.06	1.03	1.01	1.11
O4'	0.51	0.32	0.67	0.60	0.17	0.55	0.15	0.27	0.21	0.32	0.22	0.40	0.87	0.71	0.17	0.45	0.25	0.19	0.12	0.18
O5'	0.49	0.40	0.70	0.33	0.10	0.12	0.29	0.49	0.16	0.23	0.21	0.69	1.17	0.48	0.18	0.17	0.56	0.80	1.23	0.86
OP1	1.17	1.05	1.56	1.14	0.39	0.80	0.19	0.17	0.36	0.84	0.80	1.42	2.13	1.40	0.27	0.75	0.14	0.34	0.89	0.39
OP2	0.12	0.14	0.42	0.13	0.85	0.24	1.09	0.83	0.85	0.34	0.42	0.29	1.02	0.34	1.00	0.30	0.74	0.78	1.47	0.95
P	0.59	0.47	0.92	0.52	0.19	0.25	0.41	0.41	0.23	0.27	0.22	0.84	1.47	0.75	0.31	0.22	0.43	0.65	1.20	0.74

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.06	0.00	0.04	0.04	0.04	0.01	0.02	0.05	0.00	0.00	0.07	0.01	0.01	0.04	0.12	0.07
C2	0.02	0.00	0.04	0.04	0.02	0.03	0.02	0.13	0.02	0.01	0.00	0.00	0.09	0.02	0.02	0.02	0.10	0.11	0.20	0.13
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.06	0.01	0.05	0.02	0.04	0.02	0.04	0.06	0.00	0.00	0.07	0.01	0.01	0.04	0.06	0.07
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.10	0.01	0.10	0.02	0.08	0.05	0.06	0.03	0.01	0.01	0.11	0.01	0.03	0.06	0.03	0.07
C4	0.06	0.02	0.06	0.10	0.00	0.12	0.01	0.27	0.02	0.04	0.00	0.01	0.08	0.08	0.01	0.07	0.28	0.28	0.31	0.27
C4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.12	0.00	0.15	0.00	0.13	0.06	0.07	0.04	0.02	0.02	0.14	0.00	0.01	0.05	0.07	0.08
C5	0.04	0.02	0.05	0.10	0.01	0.15	0.00	0.30	0.01	0.02	0.02	0.02	0.05	0.09	0.04	0.08	0.32	0.32	0.33	0.30
C5'	0.04	0.13	0.02	0.02	0.27	0.00	0.30	0.00	0.25	0.14	0.20	0.07	0.02	0.06	0.29	0.01	0.00	0.01	0.04	0.02
C6	0.04	0.02	0.04	0.08	0.02	0.13	0.01	0.25	0.00	0.01	0.02	0.01	0.04	0.07	0.04	0.07	0.25	0.25	0.27	0.24
N1	0.01	0.01	0.02	0.05	0.04	0.06	0.02	0.14	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.04	0.05	0.02	0.12	0.13	0.20	0.15
N3	0.02	0.00	0.04	0.06	0.00	0.07	0.02	0.20	0.02	0.01	0.00	0.02	0.08	0.05	0.00	0.03	0.19	0.19	0.26	0.20
O2	0.05	0.00	0.06	0.03	0.01	0.04	0.02	0.07	0.01	0.02	0.02	0.00	0.14	0.04	0.02	0.04	0.02	0.03	0.13	0.06
O2'	0.00	0.09	0.00	0.01	0.08	0.02	0.05	0.02	0.04	0.03	0.08	0.14	0.00	0.01	0.09	0.05	0.05	0.03	0.08	0.07
O3'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.08	0.02	0.09	0.06	0.07	0.04	0.05	0.04	0.01	0.00	0.10	0.01	0.02	0.06	0.06	0.06
O4	0.07	0.02	0.07	0.11	0.01	0.14	0.04	0.29	0.04	0.05	0.00	0.02	0.09	0.10	0.00	0.09	0.32	0.33	0.34	0.29
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.07	0.00	0.08	0.01	0.07	0.02	0.03	0.04	0.05	0.01	0.09	0.00	0.01	0.04	0.11	0.07
O5'	0.01	0.10	0.01	0.03	0.28	0.01	0.32	0.00	0.25	0.12	0.19	0.02	0.05	0.02	0.32	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01
OP1	0.04	0.11	0.04	0.06	0.28	0.05	0.32	0.01	0.25	0.13	0.19	0.03	0.03	0.06	0.33	0.04	0.00	0.00	0.01	0.00
OP2	0.12	0.20	0.06	0.03	0.31	0.07	0.33	0.04	0.27	0.20	0.26	0.13	0.08	0.06	0.34	0.11	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.13	0.07	0.07	0.27	0.08	0.30	0.02	0.24	0.15	0.20	0.06	0.07	0.06	0.29	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00