Doublet Group distance statistics: 48160

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.000, 0.003, 0.006, 0.006 max_d=0.006 avg_d=0.003 std_dev=0.003
C6	A	0, 0.000, 0.003, 0.007, 0.007 max_d=0.007 avg_d=0.003 std_dev=0.003
N1	A	0, 0.000, 0.004, 0.008, 0.008 max_d=0.008 avg_d=0.004 std_dev=0.004
C4	A	0, 0.000, 0.004, 0.008, 0.008 max_d=0.008 avg_d=0.004 std_dev=0.004
N3	A	0, 0.000, 0.007, 0.015, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.007 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.000, 0.009, 0.018, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.009 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.000, 0.009, 0.018, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.009 std_dev=0.009
N7	A	0, 0.000, 0.010, 0.021, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.010 std_dev=0.010
C8	A	0, 0.000, 0.013, 0.025, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.013 std_dev=0.013
N9	A	0, 0.000, 0.013, 0.026, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.013 std_dev=0.013
N6	A	0, 0.000, 0.014, 0.028, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.014
OP2	B	0, 0.000, 0.438, 0.876, 0.876 max_d=0.876 avg_d=0.438 std_dev=0.438
P	B	0, 0.000, 0.447, 0.893, 0.893 max_d=0.893 avg_d=0.447 std_dev=0.447
OP1	B	0, 0.000, 0.545, 1.091, 1.091 max_d=1.091 avg_d=0.545 std_dev=0.545
O5'	B	0, 0.000, 0.559, 1.119, 1.119 max_d=1.119 avg_d=0.559 std_dev=0.559
C1'	B	0, 0.000, 0.721, 1.441, 1.441 max_d=1.441 avg_d=0.721 std_dev=0.721
N1	B	0, 0.000, 0.774, 1.549, 1.549 max_d=1.549 avg_d=0.774 std_dev=0.774
C2'	A	0, 0.000, 0.884, 1.767, 1.767 max_d=1.767 avg_d=0.884 std_dev=0.884
O4'	A	0, 0.000, 0.928, 1.857, 1.857 max_d=1.857 avg_d=0.928 std_dev=0.928
O2	B	0, 0.000, 0.979, 1.958, 1.958 max_d=1.958 avg_d=0.979 std_dev=0.979
C3'	A	0, 0.000, 1.105, 2.209, 2.209 max_d=2.209 avg_d=1.105 std_dev=1.105
C4'	A	0, 0.000, 1.159, 2.317, 2.317 max_d=2.317 avg_d=1.159 std_dev=1.159
C2'	B	0, 0.000, 1.168, 2.337, 2.337 max_d=2.337 avg_d=1.168 std_dev=1.168
C6	B	0, 0.000, 1.183, 2.365, 2.365 max_d=2.365 avg_d=1.183 std_dev=1.183
C2	B	0, 0.000, 1.186, 2.372, 2.372 max_d=2.372 avg_d=1.186 std_dev=1.186
O4'	B	0, 0.000, 1.233, 2.466, 2.466 max_d=2.466 avg_d=1.233 std_dev=1.233
O2'	A	0, 0.000, 1.363, 2.727, 2.727 max_d=2.727 avg_d=1.363 std_dev=1.363
O3'	A	0, 0.000, 1.387, 2.774, 2.774 max_d=2.774 avg_d=1.387 std_dev=1.387
C5'	B	0, 0.000, 1.415, 2.829, 2.829 max_d=2.829 avg_d=1.415 std_dev=1.415
C4'	B	0, 0.000, 1.503, 3.005, 3.005 max_d=3.005 avg_d=1.503 std_dev=1.503
C3'	B	0, 0.000, 1.520, 3.040, 3.040 max_d=3.040 avg_d=1.520 std_dev=1.520
O2'	B	0, 0.000, 1.755, 3.511, 3.511 max_d=3.511 avg_d=1.755 std_dev=1.755
C5'	A	0, 0.000, 1.759, 3.517, 3.517 max_d=3.517 avg_d=1.759 std_dev=1.759
C5	B	0, 0.000, 1.945, 3.890, 3.890 max_d=3.890 avg_d=1.945 std_dev=1.945
N3	B	0, 0.000, 2.029, 4.059, 4.059 max_d=4.059 avg_d=2.029 std_dev=2.029
O5'	A	0, 0.000, 2.326, 4.653, 4.653 max_d=4.653 avg_d=2.326 std_dev=2.326
C4	B	0, 0.000, 2.439, 4.878, 4.878 max_d=4.878 avg_d=2.439 std_dev=2.439
OP2	A	0, 0.000, 2.470, 4.940, 4.940 max_d=4.940 avg_d=2.470 std_dev=2.470
O3'	B	0, 0.000, 2.573, 5.146, 5.146 max_d=5.146 avg_d=2.573 std_dev=2.573
P	A	0, 0.000, 2.793, 5.586, 5.586 max_d=5.586 avg_d=2.793 std_dev=2.793
OP1	A	0, 0.000, 2.893, 5.785, 5.785 max_d=5.785 avg_d=2.893 std_dev=2.893
O4	B	0, 0.000, 3.218, 6.436, 6.436 max_d=6.436 avg_d=3.218 std_dev=3.218

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.13	0.00	0.03	0.06	0.15	0.02
C2	0.01	0.00	0.43	0.29	0.00	0.08	0.00	0.22	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.36	0.14	0.28	0.25	0.42	0.15	0.35
C2'	0.00	0.43	0.00	0.01	0.24	0.01	0.14	0.19	0.23	0.15	0.35	0.42	0.18	0.05	0.03	0.01	0.00	0.00	0.05	0.29	0.04	0.13
C3'	0.01	0.29	0.01	0.00	0.23	0.00	0.24	0.05	0.29	0.12	0.31	0.25	0.29	0.19	0.14	0.06	0.01	0.04	0.05	0.48	0.11	0.18
C4	0.01	0.00	0.24	0.23	0.00	0.03	0.00	0.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.10	0.09	0.15	0.09	0.07	0.02	0.10
C4'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.02	0.07	0.06	0.07	0.01	0.05	0.02	0.15	0.02	0.00	0.04	0.47	0.00	0.19
C5	0.00	0.00	0.14	0.24	0.00	0.00	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.15	0.07	0.03	0.17	0.07	0.03
C5'	0.12	0.22	0.19	0.05	0.19	0.01	0.18	0.00	0.20	0.12	0.22	0.20	0.19	0.15	0.15	0.02	0.14	0.01	0.01	0.20	0.08	0.03
C6	0.00	0.00	0.23	0.29	0.00	0.02	0.00	0.20	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.19	0.14	0.10	0.05	0.01	0.08
C8	0.01	0.01	0.15	0.12	0.00	0.07	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.28	0.06	0.15	0.20	0.55	0.27	0.34
N1	0.01	0.00	0.35	0.31	0.00	0.06	0.00	0.22	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.23	0.19	0.22	0.21	0.23	0.11	0.25
N3	0.01	0.00	0.42	0.25	0.00	0.07	0.00	0.20	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.36	0.09	0.27	0.22	0.40	0.11	0.31
N6	0.00	0.00	0.18	0.29	0.00	0.01	0.00	0.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.22	0.09	0.06	0.20	0.02	0.01
N7	0.01	0.00	0.05	0.19	0.00	0.05	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.22	0.13	0.07	0.13	0.52	0.21	0.28
N9	0.00	0.00	0.03	0.14	0.00	0.02	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.09	0.03	0.01	0.04	0.14	0.14	0.08
O2'	0.01	0.36	0.01	0.06	0.10	0.15	0.03	0.02	0.06	0.28	0.23	0.36	0.01	0.22	0.09	0.00	0.12	0.07	0.08	0.19	0.19	0.02
O3'	0.13	0.14	0.00	0.01	0.09	0.02	0.15	0.14	0.19	0.06	0.19	0.09	0.22	0.13	0.03	0.12	0.00	0.10	0.09	0.77	0.12	0.25
O4'	0.00	0.28	0.00	0.04	0.15	0.00	0.07	0.01	0.14	0.15	0.22	0.27	0.09	0.07	0.01	0.07	0.10	0.00	0.08	0.07	0.21	0.04
O5'	0.03	0.25	0.05	0.05	0.09	0.04	0.03	0.01	0.10	0.20	0.21	0.22	0.06	0.13	0.04	0.08	0.09	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01
OP1	0.06	0.42	0.29	0.48	0.07	0.47	0.17	0.20	0.05	0.55	0.23	0.40	0.20	0.52	0.14	0.19	0.77	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.15	0.15	0.04	0.11	0.02	0.00	0.07	0.08	0.01	0.27	0.11	0.11	0.02	0.21	0.14	0.19	0.12	0.21	0.00	0.01	0.00	0.00
P	0.02	0.35	0.13	0.18	0.10	0.19	0.03	0.03	0.08	0.34	0.25	0.31	0.01	0.28	0.08	0.02	0.25	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.09	0.72	0.41	0.74	1.33	0.49	1.15	0.45	0.74	0.53	1.09	0.56	0.68	1.39	1.63	0.06	0.04	0.09	0.06	0.06
C2	0.21	0.62	0.25	0.51	1.07	0.22	0.97	0.17	0.68	0.51	0.88	0.50	0.47	1.04	1.28	0.26	0.12	0.10	0.11	0.10
C2'	0.65	1.36	0.20	0.15	1.92	0.02	1.68	0.03	1.28	1.11	1.74	1.22	0.12	0.82	2.19	0.54	0.47	0.25	0.40	0.38
C3'	0.30	1.24	0.17	0.62	1.95	0.55	1.58	0.61	1.06	0.89	1.74	1.09	0.52	1.36	2.34	0.09	0.07	0.30	0.13	0.13
C4	0.20	0.63	0.26	0.53	1.08	0.26	0.98	0.22	0.68	0.51	0.89	0.51	0.47	1.07	1.28	0.23	0.08	0.04	0.08	0.06
C4'	0.11	0.83	0.69	1.13	1.72	0.92	1.39	0.90	0.79	0.52	1.39	0.61	1.04	1.94	2.19	0.23	0.40	0.43	0.42	0.36
C5	0.25	0.55	0.16	0.41	0.88	0.12	0.82	0.09	0.61	0.47	0.74	0.46	0.33	0.86	1.02	0.30	0.13	0.10	0.14	0.12
C5'	0.09	0.96	0.73	1.21	2.00	0.99	1.64	0.96	0.95	0.63	1.60	0.69	1.11	2.09	2.50	0.24	0.43	0.40	0.41	0.32
C6	0.27	0.52	0.13	0.35	0.80	0.05	0.76	0.01	0.58	0.46	0.67	0.44	0.28	0.77	0.91	0.35	0.17	0.16	0.17	0.15
C8	0.21	0.59	0.21	0.49	0.97	0.23	0.90	0.21	0.64	0.49	0.81	0.49	0.39	0.98	1.12	0.24	0.07	0.01	0.07	0.04
N1	0.25	0.56	0.18	0.41	0.90	0.12	0.84	0.06	0.62	0.48	0.76	0.46	0.36	0.88	1.06	0.32	0.15	0.15	0.15	0.14
N3	0.18	0.66	0.30	0.58	1.16	0.30	1.04	0.25	0.71	0.52	0.95	0.52	0.53	1.15	1.41	0.20	0.08	0.04	0.07	0.06
N6	0.30	0.44	0.05	0.24	0.61	0.06	0.60	0.11	0.50	0.42	0.53	0.39	0.17	0.59	0.67	0.40	0.21	0.22	0.21	0.19
N7	0.26	0.52	0.12	0.36	0.78	0.08	0.75	0.06	0.57	0.46	0.67	0.44	0.27	0.78	0.88	0.32	0.14	0.09	0.15	0.12
N9	0.17	0.66	0.29	0.59	1.15	0.33	1.04	0.30	0.70	0.52	0.95	0.53	0.52	1.16	1.37	0.18	0.04	0.02	0.03	0.01
O2'	0.65	1.27	0.23	0.04	1.76	0.11	1.56	0.16	1.22	1.06	1.60	1.14	0.11	0.67	2.01	0.59	0.68	0.53	0.59	0.57
O3'	0.14	1.18	0.31	0.76	1.95	0.76	1.53	0.81	0.96	0.78	1.74	1.03	0.72	1.52	2.41	0.11	0.19	0.40	0.22	0.23
O4'	0.34	0.41	0.92	1.31	1.21	1.02	0.98	0.97	0.45	0.18	0.89	0.21	1.19	2.02	1.61	0.39	0.56	0.52	0.57	0.51
O5'	0.70	0.36	1.39	1.93	1.49	1.62	1.12	1.59	0.37	0.02	1.03	0.10	1.67	2.79	2.09	0.83	1.14	0.99	1.11	0.98
OP1	1.95	1.04	2.60	3.01	0.02	2.57	0.37	2.42	1.05	1.38	0.39	1.23	2.71	3.58	0.68	1.96	2.12	1.77	1.84	1.89
OP2	1.09	0.07	1.89	2.28	1.35	1.90	0.87	1.74	0.08	0.31	0.87	0.25	2.24	3.15	2.11	1.17	1.31	1.05	1.13	1.07
P	1.50	0.40	2.25	2.73	0.83	2.31	0.41	2.16	0.38	0.77	0.35	0.67	2.49	3.57	1.54	1.57	1.75	1.41	1.52	1.47

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.08	0.03	0.02	0.05
C2	0.00	0.00	0.03	0.02	0.01	0.01	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.11	0.04	0.01	0.01	0.13	0.03	0.25	0.05
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.06	0.02	0.11	0.02	0.10	0.03	0.01	0.11	0.00	0.04	0.07	0.01	0.01	0.02	0.22	0.07
C3'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.17	0.00	0.23	0.01	0.21	0.09	0.08	0.07	0.03	0.01	0.18	0.01	0.05	0.06	0.44	0.17
C4	0.01	0.01	0.06	0.17	0.00	0.07	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.21	0.00	0.01	0.30	0.17	0.38	0.03
C4'	0.00	0.01	0.02	0.00	0.07	0.00	0.10	0.01	0.09	0.04	0.03	0.02	0.10	0.01	0.08	0.00	0.01	0.03	0.30	0.03
C5	0.00	0.00	0.11	0.23	0.00	0.10	0.00	0.15	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.27	0.00	0.02	0.38	0.21	0.33	0.07
C5'	0.01	0.04	0.02	0.01	0.12	0.01	0.15	0.00	0.14	0.06	0.07	0.01	0.10	0.01	0.13	0.00	0.00	0.05	0.30	0.01
C6	0.00	0.00	0.10	0.21	0.00	0.09	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.24	0.00	0.02	0.35	0.14	0.23	0.04
N1	0.00	0.00	0.03	0.09	0.01	0.04	0.01	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.11	0.01	0.00	0.19	0.05	0.18	0.03
N3	0.00	0.00	0.01	0.08	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.09	0.10	0.00	0.00	0.19	0.09	0.34	0.02
O2	0.01	0.00	0.11	0.07	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.19	0.08	0.00	0.03	0.04	0.02	0.21	0.08
O2'	0.00	0.11	0.00	0.03	0.04	0.10	0.02	0.10	0.03	0.03	0.09	0.19	0.00	0.06	0.04	0.07	0.04	0.07	0.36	0.13
O3'	0.02	0.04	0.04	0.01	0.21	0.01	0.27	0.01	0.24	0.11	0.10	0.08	0.06	0.00	0.23	0.01	0.11	0.10	0.73	0.27
O4	0.01	0.01	0.07	0.18	0.00	0.08	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.23	0.00	0.00	0.32	0.21	0.41	0.05
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.00	0.03	0.07	0.01	0.00	0.00	0.10	0.08	0.03	0.12
O5'	0.08	0.13	0.01	0.05	0.30	0.01	0.38	0.00	0.35	0.19	0.19	0.04	0.04	0.11	0.32	0.10	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.03	0.03	0.02	0.06	0.17	0.03	0.21	0.05	0.14	0.05	0.09	0.02	0.07	0.10	0.21	0.08	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.02	0.25	0.22	0.44	0.38	0.30	0.33	0.30	0.23	0.18	0.34	0.21	0.36	0.73	0.41	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.05	0.05	0.07	0.17	0.03	0.03	0.07	0.01	0.04	0.03	0.02	0.08	0.13	0.27	0.05	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00