Doublet Group distance statistics: 48176

back

Distances from reference structure (by RMSD)

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C1'	A	max_d=0.017 avg_d=0.010 std_dev=0.005
C6	A	max_d=0.016 avg_d=0.010 std_dev=0.005
C5	A	max_d=0.019 avg_d=0.008 std_dev=0.006
N3	A	max_d=0.017 avg_d=0.009 std_dev=0.007
C2	A	max_d=0.029 avg_d=0.013 std_dev=0.010
N1	A	max_d=0.032 avg_d=0.013 std_dev=0.010
C4	A	max_d=0.036 avg_d=0.013 std_dev=0.011
O2	A	max_d=0.055 avg_d=0.024 std_dev=0.015
N4	A	max_d=0.051 avg_d=0.030 std_dev=0.016
O4'	A	max_d=0.250 avg_d=0.103 std_dev=0.077
C4'	A	max_d=0.270 avg_d=0.161 std_dev=0.088
C2'	A	max_d=0.308 avg_d=0.123 std_dev=0.088
C3'	A	max_d=0.391 avg_d=0.189 std_dev=0.115
O2'	A	max_d=0.496 avg_d=0.170 std_dev=0.147
C5'	A	max_d=0.534 avg_d=0.240 std_dev=0.169
O3'	A	max_d=0.543 avg_d=0.296 std_dev=0.176
O2'	B	max_d=0.698 avg_d=0.437 std_dev=0.222
C2'	B	max_d=0.987 avg_d=0.594 std_dev=0.283
OP2	A	max_d=0.879 avg_d=0.504 std_dev=0.303
P	A	max_d=1.045 avg_d=0.408 std_dev=0.308
O5'	A	max_d=1.062 avg_d=0.302 std_dev=0.325
OP1	A	max_d=1.138 avg_d=0.479 std_dev=0.343
C3'	B	max_d=0.997 avg_d=0.510 std_dev=0.346
C1'	B	max_d=1.252 avg_d=0.917 std_dev=0.383
O4'	B	max_d=1.282 avg_d=0.956 std_dev=0.428
C4'	B	max_d=1.324 avg_d=0.729 std_dev=0.439
O3'	B	max_d=1.256 avg_d=0.627 std_dev=0.461
O5'	B	max_d=1.647 avg_d=0.984 std_dev=0.466
P	B	max_d=1.773 avg_d=1.072 std_dev=0.526
OP1	B	max_d=1.756 avg_d=1.030 std_dev=0.530
C5'	B	max_d=1.731 avg_d=0.950 std_dev=0.540
OP2	B	max_d=1.801 avg_d=1.213 std_dev=0.592
N9	B	max_d=1.913 avg_d=1.430 std_dev=0.612
C8	B	max_d=2.535 avg_d=1.783 std_dev=0.797
C4	B	max_d=2.652 avg_d=1.817 std_dev=0.799
N3	B	max_d=2.899 avg_d=1.860 std_dev=0.846
C5	B	max_d=3.422 avg_d=2.285 std_dev=1.032
N7	B	max_d=3.386 avg_d=2.282 std_dev=1.041
C2	B	max_d=3.809 avg_d=2.353 std_dev=1.092
C6	B	max_d=4.275 avg_d=2.748 std_dev=1.260
N1	B	max_d=4.416 avg_d=2.752 std_dev=1.270
N6	B	max_d=5.091 avg_d=3.245 std_dev=1.506

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.11	0.13	0.15	0.13
C2	0.02	0.00	0.04	0.04	0.03	0.01	0.02	0.05	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.05	0.05	0.01	0.14	0.18	0.23	0.19
C2'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.07	0.01	0.08	0.02	0.07	0.04	0.05	0.08	0.03	0.01	0.02	0.01	0.04	0.12	0.11	0.06
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.07	0.00	0.09	0.02	0.08	0.04	0.05	0.08	0.03	0.03	0.01	0.01	0.05	0.14	0.11	0.06
C4	0.02	0.03	0.07	0.07	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.08	0.09	0.03	0.16	0.24	0.31	0.24
C4'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.03	0.02	0.02	0.03	0.02	0.06	0.02	0.01	0.02	0.10	0.04	0.02
C5	0.01	0.02	0.08	0.09	0.00	0.04	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.07	0.10	0.05	0.17	0.26	0.32	0.25
C5'	0.03	0.05	0.02	0.02	0.08	0.00	0.09	0.00	0.08	0.06	0.06	0.09	0.04	0.06	0.02	0.01	0.01	0.11	0.03	0.02
C6	0.01	0.00	0.07	0.08	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.09	0.05	0.17	0.23	0.27	0.23
N1	0.01	0.00	0.04	0.04	0.01	0.02	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.04	0.05	0.02	0.15	0.18	0.22	0.19
N3	0.01	0.01	0.05	0.05	0.01	0.02	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.07	0.07	0.01	0.15	0.21	0.27	0.22
N4	0.02	0.03	0.08	0.08	0.00	0.03	0.01	0.09	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.09	0.10	0.04	0.16	0.26	0.32	0.25
O2	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.02	0.02	0.04	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.05	0.04	0.03	0.12	0.15	0.20	0.17
O2'	0.01	0.05	0.01	0.03	0.08	0.06	0.07	0.06	0.05	0.04	0.07	0.09	0.05	0.00	0.04	0.03	0.05	0.08	0.08	0.05
O3'	0.02	0.05	0.02	0.01	0.09	0.02	0.10	0.02	0.09	0.05	0.07	0.10	0.04	0.04	0.00	0.02	0.11	0.21	0.17	0.13
O4'	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.05	0.02	0.01	0.04	0.03	0.03	0.02	0.00	0.12	0.12	0.14	0.14
O5'	0.11	0.14	0.04	0.05	0.16	0.02	0.17	0.01	0.17	0.15	0.15	0.16	0.12	0.05	0.11	0.12	0.00	0.04	0.02	0.00
OP1	0.13	0.18	0.12	0.14	0.24	0.10	0.26	0.11	0.23	0.18	0.21	0.26	0.15	0.08	0.21	0.12	0.04	0.00	0.04	0.01
OP2	0.15	0.23	0.11	0.11	0.31	0.04	0.32	0.03	0.27	0.22	0.27	0.32	0.20	0.08	0.17	0.14	0.02	0.04	0.00	0.00
P	0.13	0.19	0.06	0.06	0.24	0.02	0.25	0.02	0.23	0.19	0.22	0.25	0.17	0.05	0.13	0.14	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.28	0.16	0.21	0.28	0.19	0.39	0.17	0.42	0.36	0.36	0.24	0.52	0.45	0.25	0.15	0.38	0.16	0.20	0.21	0.33	0.21
C2	0.19	0.37	0.16	0.19	0.34	0.16	0.44	0.13	0.49	0.37	0.44	0.32	0.58	0.49	0.28	0.14	0.33	0.17	0.21	0.19	0.28	0.19
C2'	0.22	0.36	0.22	0.25	0.35	0.22	0.45	0.20	0.49	0.40	0.43	0.31	0.59	0.50	0.31	0.17	0.42	0.21	0.21	0.17	0.36	0.22
C3'	0.22	0.30	0.23	0.27	0.31	0.25	0.41	0.24	0.44	0.39	0.38	0.27	0.53	0.47	0.29	0.17	0.46	0.23	0.23	0.20	0.40	0.25
C4	0.20	0.34	0.17	0.19	0.32	0.17	0.40	0.15	0.42	0.36	0.39	0.31	0.49	0.44	0.28	0.14	0.30	0.18	0.22	0.17	0.21	0.15
C4'	0.15	0.22	0.16	0.21	0.25	0.21	0.36	0.22	0.38	0.36	0.30	0.19	0.47	0.44	0.24	0.14	0.40	0.17	0.20	0.25	0.39	0.26
C5	0.17	0.25	0.17	0.20	0.26	0.18	0.33	0.17	0.34	0.33	0.30	0.23	0.41	0.39	0.24	0.13	0.33	0.17	0.20	0.17	0.25	0.16
C5'	0.16	0.19	0.18	0.21	0.24	0.22	0.34	0.26	0.35	0.37	0.26	0.18	0.44	0.43	0.24	0.15	0.39	0.19	0.22	0.28	0.42	0.29
C6	0.17	0.24	0.17	0.21	0.25	0.20	0.34	0.19	0.36	0.34	0.30	0.22	0.43	0.41	0.24	0.15	0.37	0.17	0.20	0.20	0.30	0.19
N1	0.17	0.30	0.16	0.21	0.29	0.18	0.39	0.16	0.42	0.36	0.36	0.26	0.51	0.45	0.26	0.14	0.36	0.16	0.20	0.20	0.30	0.19
N3	0.21	0.40	0.17	0.19	0.36	0.17	0.45	0.15	0.50	0.38	0.46	0.35	0.58	0.49	0.30	0.15	0.31	0.19	0.23	0.19	0.25	0.18
N4	0.23	0.38	0.19	0.20	0.35	0.19	0.41	0.18	0.43	0.37	0.41	0.35	0.48	0.44	0.30	0.17	0.27	0.21	0.24	0.18	0.18	0.16
O2	0.19	0.41	0.16	0.19	0.36	0.16	0.47	0.13	0.54	0.38	0.49	0.35	0.64	0.51	0.29	0.14	0.34	0.17	0.22	0.20	0.29	0.20
O2'	0.23	0.38	0.22	0.24	0.37	0.22	0.48	0.20	0.53	0.42	0.47	0.33	0.64	0.53	0.32	0.17	0.41	0.21	0.22	0.16	0.38	0.22
O3'	0.25	0.33	0.25	0.29	0.34	0.28	0.44	0.27	0.47	0.41	0.40	0.30	0.57	0.50	0.31	0.19	0.49	0.26	0.25	0.22	0.42	0.28
O4'	0.14	0.20	0.15	0.20	0.23	0.19	0.34	0.20	0.36	0.35	0.28	0.17	0.46	0.42	0.22	0.15	0.38	0.15	0.20	0.26	0.34	0.23
O5'	0.20	0.24	0.22	0.22	0.27	0.22	0.37	0.24	0.37	0.40	0.30	0.22	0.45	0.45	0.28	0.22	0.39	0.21	0.20	0.27	0.39	0.27
OP1	0.38	0.37	0.39	0.40	0.41	0.42	0.47	0.48	0.45	0.51	0.40	0.37	0.51	0.54	0.42	0.38	0.43	0.41	0.38	0.37	0.45	0.37
OP2	0.39	0.38	0.40	0.37	0.41	0.35	0.47	0.35	0.46	0.51	0.41	0.37	0.50	0.53	0.43	0.43	0.42	0.37	0.28	0.30	0.43	0.30
P	0.31	0.30	0.32	0.32	0.34	0.32	0.40	0.35	0.39	0.45	0.34	0.30	0.45	0.48	0.36	0.33	0.40	0.31	0.27	0.31	0.43	0.31

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.02	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.04	0.10	0.01	0.08	0.15	0.17	0.08
C2	0.03	0.00	0.03	0.04	0.01	0.09	0.02	0.14	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.08	0.12	0.09	0.10	0.10	0.22	0.14
C2'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.02	0.02	0.04	0.03	0.03	0.05	0.03	0.03	0.05	0.05	0.03	0.00	0.03	0.02	0.09	0.18	0.17	0.07
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.04	0.03	0.04	0.03	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.09	0.21	0.18	0.11
C4	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.05	0.11	0.05	0.11	0.11	0.21	0.14
C4'	0.01	0.09	0.02	0.01	0.05	0.00	0.04	0.01	0.06	0.05	0.08	0.08	0.05	0.05	0.03	0.05	0.06	0.01	0.02	0.17	0.10	0.04
C5	0.01	0.02	0.04	0.02	0.00	0.04	0.00	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.08	0.11	0.04	0.13	0.15	0.27	0.19
C5'	0.04	0.14	0.03	0.03	0.11	0.01	0.12	0.00	0.13	0.13	0.14	0.13	0.13	0.14	0.09	0.04	0.05	0.02	0.01	0.15	0.05	0.02
C6	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.06	0.01	0.13	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.11	0.05	0.12	0.14	0.29	0.20
C8	0.02	0.01	0.05	0.04	0.00	0.05	0.01	0.13	0.02	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.00	0.13	0.11	0.03	0.19	0.17	0.25	0.20
N1	0.03	0.01	0.03	0.03	0.01	0.08	0.00	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.12	0.07	0.11	0.11	0.26	0.18
N3	0.03	0.00	0.03	0.04	0.00	0.08	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.08	0.12	0.09	0.10	0.11	0.20	0.12
N6	0.02	0.02	0.05	0.03	0.01	0.05	0.01	0.13	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.12	0.12	0.04	0.13	0.19	0.33	0.23
N7	0.01	0.02	0.05	0.03	0.01	0.05	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.13	0.11	0.03	0.18	0.19	0.29	0.23
N9	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.04	0.10	0.03	0.12	0.12	0.20	0.13
O2'	0.04	0.08	0.00	0.05	0.05	0.05	0.08	0.04	0.08	0.13	0.06	0.08	0.12	0.13	0.04	0.00	0.07	0.05	0.09	0.20	0.14	0.07
O3'	0.10	0.12	0.03	0.01	0.11	0.06	0.11	0.05	0.11	0.11	0.12	0.12	0.12	0.11	0.10	0.07	0.00	0.07	0.09	0.28	0.24	0.17
O4'	0.01	0.09	0.02	0.01	0.05	0.01	0.04	0.02	0.05	0.03	0.07	0.09	0.04	0.03	0.03	0.05	0.07	0.00	0.11	0.16	0.18	0.12
O5'	0.08	0.10	0.09	0.09	0.11	0.02	0.13	0.01	0.12	0.19	0.11	0.10	0.13	0.18	0.12	0.09	0.09	0.11	0.00	0.05	0.03	0.01
OP1	0.15	0.10	0.18	0.21	0.11	0.17	0.15	0.15	0.14	0.17	0.11	0.11	0.19	0.19	0.12	0.20	0.28	0.16	0.05	0.00	0.04	0.01
OP2	0.17	0.22	0.17	0.18	0.21	0.10	0.27	0.05	0.29	0.25	0.26	0.20	0.33	0.29	0.20	0.14	0.24	0.18	0.03	0.04	0.00	0.01
P	0.08	0.14	0.07	0.11	0.14	0.04	0.19	0.02	0.20	0.20	0.18	0.12	0.23	0.23	0.13	0.07	0.17	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00