Doublet Group distance statistics: 48186

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.000, 0.002, 0.005, 0.005 max_d=0.005 avg_d=0.002 std_dev=0.002
C5	A	0, 0.000, 0.005, 0.009, 0.009 max_d=0.009 avg_d=0.005 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.000, 0.018, 0.035, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.018 std_dev=0.018
C6	A	0, 0.000, 0.024, 0.048, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.024 std_dev=0.024
C1'	A	0, 0.000, 0.024, 0.048, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.024 std_dev=0.024
C2	A	0, 0.000, 0.024, 0.048, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.024 std_dev=0.024
C4	A	0, 0.000, 0.025, 0.050, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.025 std_dev=0.025
O2	A	0, 0.000, 0.048, 0.096, 0.096 max_d=0.096 avg_d=0.048 std_dev=0.048
N4	A	0, 0.000, 0.086, 0.171, 0.171 max_d=0.171 avg_d=0.086 std_dev=0.086
O4'	B	0, 0.000, 0.208, 0.416, 0.416 max_d=0.416 avg_d=0.208 std_dev=0.208
C1'	B	0, 0.000, 0.325, 0.649, 0.649 max_d=0.649 avg_d=0.325 std_dev=0.325
O2'	A	0, 0.000, 0.330, 0.660, 0.660 max_d=0.660 avg_d=0.330 std_dev=0.330
O2'	B	0, 0.000, 0.372, 0.744, 0.744 max_d=0.744 avg_d=0.372 std_dev=0.372
C2'	A	0, 0.000, 0.384, 0.767, 0.767 max_d=0.767 avg_d=0.384 std_dev=0.384
C2'	B	0, 0.000, 0.453, 0.907, 0.907 max_d=0.907 avg_d=0.453 std_dev=0.453
O4'	A	0, 0.000, 0.473, 0.947, 0.947 max_d=0.947 avg_d=0.473 std_dev=0.473
C4'	B	0, 0.000, 0.475, 0.950, 0.950 max_d=0.950 avg_d=0.475 std_dev=0.475
C3'	B	0, 0.000, 0.555, 1.109, 1.109 max_d=1.109 avg_d=0.555 std_dev=0.555
N9	B	0, 0.000, 0.613, 1.226, 1.226 max_d=1.226 avg_d=0.613 std_dev=0.613
O3'	B	0, 0.000, 0.622, 1.244, 1.244 max_d=1.244 avg_d=0.622 std_dev=0.622
C3'	A	0, 0.000, 0.698, 1.396, 1.396 max_d=1.396 avg_d=0.698 std_dev=0.698
C5'	B	0, 0.000, 0.707, 1.414, 1.414 max_d=1.414 avg_d=0.707 std_dev=0.707
C4'	A	0, 0.000, 0.709, 1.419, 1.419 max_d=1.419 avg_d=0.709 std_dev=0.709
C4	B	0, 0.000, 0.729, 1.457, 1.457 max_d=1.457 avg_d=0.729 std_dev=0.729
C5	B	0, 0.000, 0.919, 1.839, 1.839 max_d=1.839 avg_d=0.919 std_dev=0.919
O3'	A	0, 0.000, 0.947, 1.894, 1.894 max_d=1.894 avg_d=0.947 std_dev=0.947
O5'	A	0, 0.000, 0.993, 1.985, 1.985 max_d=1.985 avg_d=0.993 std_dev=0.993
C6	B	0, 0.000, 1.064, 2.128, 2.128 max_d=2.128 avg_d=1.064 std_dev=1.064
C5'	A	0, 0.000, 1.147, 2.294, 2.294 max_d=2.294 avg_d=1.147 std_dev=1.147
N6	B	0, 0.000, 1.318, 2.636, 2.636 max_d=2.636 avg_d=1.318 std_dev=1.318
OP2	B	0, 0.000, 1.322, 2.644, 2.644 max_d=2.644 avg_d=1.322 std_dev=1.322
P	B	0, 0.000, 1.384, 2.768, 2.768 max_d=2.768 avg_d=1.384 std_dev=1.384
C8	B	0, 0.000, 1.473, 2.946, 2.946 max_d=2.946 avg_d=1.473 std_dev=1.473
N3	B	0, 0.000, 1.507, 3.014, 3.014 max_d=3.014 avg_d=1.507 std_dev=1.507
N1	B	0, 0.000, 1.591, 3.182, 3.182 max_d=3.182 avg_d=1.591 std_dev=1.591
N7	B	0, 0.000, 1.606, 3.212, 3.212 max_d=3.212 avg_d=1.606 std_dev=1.606
O5'	B	0, 0.000, 1.653, 3.305, 3.305 max_d=3.305 avg_d=1.653 std_dev=1.653
C2	B	0, 0.000, 1.924, 3.848, 3.848 max_d=3.848 avg_d=1.924 std_dev=1.924
OP1	B	0, 0.000, 1.927, 3.853, 3.853 max_d=3.853 avg_d=1.927 std_dev=1.927
P	A	0, 0.000, 1.944, 3.888, 3.888 max_d=3.888 avg_d=1.944 std_dev=1.944
OP1	A	0, 0.000, 2.935, 5.871, 5.871 max_d=5.871 avg_d=2.935 std_dev=2.935
OP2	A	0, 0.000, 3.001, 6.001, 6.001 max_d=6.001 avg_d=3.001 std_dev=3.001

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.03	0.21	0.36	0.04
C2	0.00	0.00	0.13	0.20	0.00	0.09	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.07	0.21	0.00	0.19	0.21	0.90	0.25
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.05	0.03	0.12	0.08	0.21	0.00	0.00	0.00	0.03	0.09	0.41	0.11
C3'	0.01	0.20	0.00	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.05	0.06	0.20	0.15	0.27	0.01	0.00	0.01	0.06	0.30	0.31	0.14
C4	0.01	0.00	0.06	0.12	0.00	0.06	0.00	0.09	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.14	0.00	0.19	0.49	0.95	0.18
C4'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.03	0.03	0.09	0.07	0.11	0.00	0.00	0.00	0.01	0.11	0.00	0.03
C5	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.70	0.66	0.01
C5'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.03	0.04	0.12	0.11	0.14	0.00	0.00	0.00	0.01	0.17	0.26	0.01
C6	0.01	0.00	0.05	0.05	0.01	0.03	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.02	0.02	0.64	0.46	0.08
N1	0.00	0.00	0.03	0.06	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.06	0.00	0.10	0.35	0.61	0.09
N3	0.00	0.00	0.12	0.20	0.00	0.09	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.22	0.00	0.22	0.29	1.04	0.27
N4	0.01	0.00	0.08	0.15	0.01	0.07	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.18	0.01	0.22	0.50	1.05	0.22
O2	0.00	0.01	0.21	0.27	0.01	0.11	0.01	0.14	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.10	0.30	0.01	0.21	0.04	0.93	0.31
O2'	0.02	0.07	0.00	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.06	0.05	0.10	0.00	0.04	0.02	0.03	0.15	0.28	0.09
O3'	0.00	0.21	0.00	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00	0.05	0.06	0.22	0.18	0.30	0.04	0.00	0.00	0.08	0.58	0.23	0.19
O4'	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.06	0.25	0.12	0.02
O5'	0.03	0.19	0.03	0.06	0.19	0.01	0.09	0.01	0.02	0.10	0.22	0.22	0.21	0.03	0.08	0.06	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.21	0.21	0.09	0.30	0.49	0.11	0.70	0.17	0.64	0.35	0.29	0.50	0.04	0.15	0.58	0.25	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.36	0.90	0.41	0.31	0.95	0.00	0.66	0.26	0.46	0.61	1.04	1.05	0.93	0.28	0.23	0.12	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.04	0.25	0.11	0.14	0.18	0.03	0.01	0.01	0.08	0.09	0.27	0.22	0.31	0.09	0.19	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.07	1.11	0.10	0.13	0.37	0.20	0.08	0.21	0.34	0.51	0.83	0.94	0.13	0.44	0.02	0.13	0.10	0.09	0.34	0.31	0.01	0.22
C2	0.01	1.04	0.02	0.06	0.31	0.15	0.01	0.15	0.25	0.62	0.74	0.90	0.03	0.54	0.09	0.06	0.02	0.06	0.26	0.22	0.08	0.15
C2'	0.10	1.24	0.07	0.10	0.45	0.20	0.15	0.22	0.44	0.47	0.96	1.04	0.22	0.39	0.03	0.10	0.03	0.14	0.31	0.30	0.00	0.23
C3'	0.20	1.45	0.16	0.14	0.63	0.22	0.38	0.22	0.70	0.26	1.21	1.21	0.52	0.14	0.19	0.14	0.04	0.19	0.28	0.28	0.07	0.23
C4	0.05	0.89	0.05	0.07	0.33	0.15	0.08	0.15	0.28	0.43	0.65	0.82	0.12	0.33	0.02	0.06	0.01	0.08	0.22	0.18	0.01	0.13
C4'	0.16	1.37	0.19	0.17	0.59	0.19	0.35	0.20	0.65	0.28	1.14	1.14	0.48	0.16	0.16	0.17	0.10	0.12	0.29	0.26	0.05	0.20
C5	0.10	0.88	0.12	0.14	0.37	0.19	0.16	0.20	0.35	0.29	0.67	0.80	0.21	0.20	0.06	0.14	0.08	0.10	0.28	0.24	0.07	0.19
C5'	0.23	1.47	0.26	0.21	0.71	0.19	0.53	0.19	0.84	0.10	1.29	1.23	0.71	0.05	0.28	0.21	0.11	0.14	0.26	0.24	0.12	0.20
C6	0.10	0.97	0.13	0.15	0.38	0.21	0.14	0.22	0.36	0.35	0.74	0.85	0.20	0.26	0.04	0.15	0.10	0.11	0.32	0.29	0.06	0.22
N1	0.06	1.04	0.08	0.11	0.36	0.19	0.07	0.20	0.32	0.49	0.77	0.91	0.12	0.41	0.02	0.11	0.07	0.09	0.31	0.27	0.01	0.20
N3	0.01	0.97	0.00	0.04	0.30	0.13	0.01	0.13	0.23	0.61	0.68	0.86	0.03	0.52	0.10	0.03	0.01	0.06	0.21	0.17	0.09	0.12
N4	0.04	0.76	0.02	0.04	0.32	0.10	0.09	0.10	0.26	0.37	0.56	0.73	0.13	0.27	0.01	0.01	0.03	0.05	0.14	0.10	0.03	0.08
O2	0.02	1.06	0.01	0.03	0.27	0.13	0.08	0.13	0.20	0.72	0.74	0.90	0.05	0.66	0.15	0.04	0.00	0.04	0.24	0.20	0.14	0.13
O2'	0.07	1.18	0.06	0.10	0.37	0.21	0.04	0.23	0.33	0.58	0.88	0.99	0.09	0.52	0.04	0.11	0.06	0.12	0.35	0.33	0.03	0.24
O3'	0.23	1.56	0.17	0.15	0.69	0.23	0.45	0.24	0.79	0.22	1.33	1.29	0.61	0.10	0.23	0.14	0.03	0.22	0.28	0.29	0.08	0.25
O4'	0.10	1.19	0.16	0.17	0.46	0.18	0.20	0.19	0.47	0.39	0.94	1.00	0.29	0.29	0.06	0.18	0.13	0.07	0.32	0.28	0.02	0.20
O5'	0.35	1.52	0.35	0.29	0.81	0.27	0.65	0.28	0.94	0.08	1.35	1.28	0.82	0.22	0.41	0.28	0.16	0.25	0.31	0.30	0.22	0.27
OP1	0.40	1.18	0.42	0.60	0.35	0.73	0.31	0.74	0.71	0.40	1.12	0.81	0.68	0.14	0.16	0.60	0.82	0.65	0.69	0.69	0.55	0.66
OP2	1.24	2.71	1.13	0.94	1.95	0.89	1.88	0.88	2.24	1.21	2.63	2.39	2.18	1.45	1.46	0.93	0.64	1.02	0.91	0.94	1.09	0.99
P	0.37	1.72	0.33	0.19	0.99	0.13	0.91	0.13	1.24	0.28	1.63	1.42	1.18	0.49	0.54	0.19	0.02	0.19	0.14	0.15	0.22	0.17

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.05	0.02	0.01	0.03	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.26	0.23	0.15	0.22
C2	0.04	0.00	0.14	0.57	0.00	0.51	0.00	0.88	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.11	0.57	0.18	1.51	1.70	1.36	1.42
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.05	0.01	0.02	0.02	0.01	0.13	0.08	0.16	0.02	0.11	0.03	0.00	0.02	0.00	0.29	0.24	0.12	0.22
C3'	0.00	0.57	0.00	0.00	0.22	0.00	0.02	0.00	0.16	0.37	0.39	0.58	0.05	0.27	0.06	0.00	0.00	0.01	0.29	0.21	0.05	0.17
C4	0.02	0.00	0.05	0.22	0.00	0.24	0.00	0.45	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.20	0.09	0.99	1.02	0.93	0.94
C4'	0.00	0.51	0.01	0.00	0.24	0.00	0.09	0.00	0.21	0.28	0.39	0.49	0.13	0.16	0.00	0.04	0.01	0.00	0.00	0.02	0.20	0.01
C5	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.09	0.00	0.26	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.00	0.03	0.85	0.96	0.93	0.88
C5'	0.05	0.88	0.02	0.00	0.45	0.00	0.26	0.00	0.45	0.32	0.73	0.80	0.34	0.15	0.08	0.04	0.05	0.01	0.00	0.03	0.30	0.01
C6	0.02	0.00	0.01	0.16	0.00	0.21	0.00	0.45	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.13	0.07	1.11	1.34	1.19	1.15
C8	0.01	0.00	0.13	0.37	0.00	0.28	0.00	0.32	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.36	0.14	0.10	0.10	0.07	0.13
N1	0.03	0.00	0.08	0.39	0.00	0.39	0.00	0.73	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.10	0.38	0.14	1.41	1.68	1.39	1.39
N3	0.04	0.00	0.16	0.58	0.00	0.49	0.00	0.80	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.10	0.55	0.18	1.36	1.40	1.14	1.22
N6	0.01	0.00	0.02	0.05	0.00	0.13	0.00	0.34	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.05	0.02	0.05	1.00	1.27	1.10	1.07
N7	0.00	0.00	0.11	0.27	0.00	0.16	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.29	0.08	0.37	0.41	0.41	0.41
N9	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.00	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.01	0.49	0.47	0.42	0.46
O2'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.05	0.04	0.04	0.04	0.06	0.02	0.10	0.10	0.05	0.00	0.01	0.00	0.06	0.02	0.06	0.06	0.03	0.07
O3'	0.03	0.57	0.02	0.00	0.20	0.01	0.00	0.05	0.13	0.36	0.38	0.55	0.02	0.29	0.05	0.06	0.00	0.03	0.13	0.08	0.15	0.06
O4'	0.00	0.18	0.00	0.01	0.09	0.00	0.03	0.01	0.07	0.14	0.14	0.18	0.05	0.08	0.01	0.02	0.03	0.00	0.01	0.02	0.13	0.01
O5'	0.26	1.51	0.29	0.29	0.99	0.00	0.85	0.00	1.11	0.10	1.41	1.36	1.00	0.37	0.49	0.06	0.13	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.23	1.70	0.24	0.21	1.02	0.02	0.96	0.03	1.34	0.10	1.68	1.40	1.27	0.41	0.47	0.06	0.08	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.15	1.36	0.12	0.05	0.93	0.20	0.93	0.30	1.19	0.07	1.39	1.14	1.10	0.41	0.42	0.03	0.15	0.13	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.22	1.42	0.22	0.17	0.94	0.01	0.88	0.01	1.15	0.13	1.39	1.22	1.07	0.41	0.46	0.07	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00