Doublet Group distance statistics: 48198

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.005, 0.009, 0.014, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.009 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.003, 0.008, 0.012, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.008 std_dev=0.005
C4	A	0, 0.005, 0.011, 0.017, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.011 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.002, 0.009, 0.015, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.003, 0.010, 0.017, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.005, 0.012, 0.019, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.012 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.002, 0.012, 0.021, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.012 std_dev=0.010
N4	A	0, 0.015, 0.032, 0.049, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.032 std_dev=0.017
O2	A	0, 0.011, 0.029, 0.046, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.029 std_dev=0.018
O4'	A	0, 0.019, 0.053, 0.088, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.053 std_dev=0.035
C2'	A	0, 0.030, 0.068, 0.106, 0.106 max_d=0.106 avg_d=0.068 std_dev=0.038
C4'	A	0, 0.046, 0.104, 0.163, 0.170 max_d=0.170 avg_d=0.104 std_dev=0.058
C3'	A	0, 0.057, 0.115, 0.174, 0.161 max_d=0.161 avg_d=0.115 std_dev=0.059
O4'	B	0, 0.071, 0.151, 0.232, 0.239 max_d=0.239 avg_d=0.151 std_dev=0.081
C1'	B	0, 0.083, 0.168, 0.253, 0.234 max_d=0.234 avg_d=0.168 std_dev=0.085
O2'	A	0, 0.079, 0.172, 0.265, 0.246 max_d=0.246 avg_d=0.172 std_dev=0.093
O3'	A	0, 0.077, 0.171, 0.266, 0.291 max_d=0.291 avg_d=0.171 std_dev=0.095
C6	B	0, 0.086, 0.184, 0.283, 0.260 max_d=0.260 avg_d=0.184 std_dev=0.099
N1	B	0, 0.082, 0.183, 0.284, 0.286 max_d=0.286 avg_d=0.183 std_dev=0.101
C5'	A	0, 0.075, 0.183, 0.290, 0.323 max_d=0.323 avg_d=0.183 std_dev=0.108
C4'	B	0, 0.097, 0.207, 0.318, 0.310 max_d=0.310 avg_d=0.207 std_dev=0.110
P	A	0, 0.100, 0.216, 0.333, 0.339 max_d=0.339 avg_d=0.216 std_dev=0.117
C5	B	0, 0.093, 0.211, 0.328, 0.341 max_d=0.341 avg_d=0.211 std_dev=0.118
O5'	A	0, 0.088, 0.208, 0.328, 0.372 max_d=0.372 avg_d=0.208 std_dev=0.120
OP1	A	0, 0.107, 0.233, 0.359, 0.354 max_d=0.354 avg_d=0.233 std_dev=0.126
C2	B	0, 0.076, 0.215, 0.355, 0.421 max_d=0.421 avg_d=0.215 std_dev=0.140
C2'	B	0, 0.135, 0.276, 0.416, 0.372 max_d=0.372 avg_d=0.276 std_dev=0.141
C3'	B	0, 0.140, 0.286, 0.433, 0.391 max_d=0.391 avg_d=0.286 std_dev=0.147
O2	B	0, 0.089, 0.239, 0.389, 0.467 max_d=0.467 avg_d=0.239 std_dev=0.150
O2'	B	0, 0.121, 0.274, 0.427, 0.392 max_d=0.392 avg_d=0.274 std_dev=0.153
C4	B	0, 0.067, 0.221, 0.375, 0.455 max_d=0.455 avg_d=0.221 std_dev=0.154
C5'	B	0, 0.122, 0.285, 0.447, 0.461 max_d=0.461 avg_d=0.285 std_dev=0.163
OP2	A	0, 0.111, 0.275, 0.439, 0.472 max_d=0.472 avg_d=0.275 std_dev=0.164
O3'	B	0, 0.141, 0.307, 0.472, 0.472 max_d=0.472 avg_d=0.307 std_dev=0.166
N4	B	0, 0.076, 0.244, 0.412, 0.509 max_d=0.509 avg_d=0.244 std_dev=0.168
O5'	B	0, 0.126, 0.295, 0.464, 0.497 max_d=0.497 avg_d=0.295 std_dev=0.169
N3	B	0, 0.049, 0.223, 0.396, 0.506 max_d=0.506 avg_d=0.223 std_dev=0.174
P	B	0, 0.165, 0.381, 0.597, 0.662 max_d=0.662 avg_d=0.381 std_dev=0.216
OP2	B	0, 0.204, 0.451, 0.698, 0.758 max_d=0.758 avg_d=0.451 std_dev=0.247
OP1	B	0, 0.170, 0.419, 0.668, 0.777 max_d=0.777 avg_d=0.419 std_dev=0.249

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.01	0.00	0.03	0.03	0.03	0.03
C2	0.02	0.00	0.02	0.04	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.03	0.03	0.02	0.05	0.04	0.05	0.04
C2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.03	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02
C3'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.04	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.05	0.05	0.05	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02
C4	0.01	0.00	0.02	0.04	0.00	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.03	0.02	0.08	0.06	0.07	0.07
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.04	0.03	0.05	0.06	0.04	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01
C5	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.08	0.06	0.07	0.06
C5'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.11	0.01	0.11	0.00	0.09	0.06	0.10	0.12	0.06	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01
C6	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.04	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.06	0.04	0.05	0.04
N1	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.04	0.03	0.04	0.03
N3	0.02	0.00	0.03	0.05	0.00	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.04	0.02	0.06	0.05	0.06	0.05
N4	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.06	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.04	0.02	0.08	0.07	0.08	0.07
O2	0.03	0.00	0.03	0.05	0.01	0.04	0.01	0.06	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.04	0.04	0.03	0.04	0.04	0.04	0.04
O2'	0.02	0.03	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.04	0.00	0.05	0.02	0.03	0.04	0.02	0.03
O3'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.04	0.04	0.04	0.05	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02
O4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.03	0.03	0.04	0.04
O5'	0.03	0.05	0.01	0.01	0.08	0.00	0.08	0.00	0.06	0.04	0.06	0.08	0.04	0.03	0.02	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.03	0.04	0.02	0.01	0.06	0.02	0.06	0.01	0.04	0.03	0.05	0.07	0.04	0.04	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.03	0.05	0.02	0.02	0.07	0.01	0.07	0.02	0.05	0.04	0.06	0.08	0.04	0.02	0.02	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.03	0.04	0.02	0.02	0.07	0.01	0.06	0.01	0.04	0.03	0.05	0.07	0.04	0.03	0.02	0.04	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.04	0.05	0.06	0.07	0.06	0.06	0.05	0.07	0.04	0.04	0.06	0.07	0.06	0.09	0.09	0.03	0.04	0.12	0.04	0.05
C2	0.03	0.06	0.05	0.04	0.05	0.04	0.05	0.05	0.04	0.04	0.06	0.06	0.08	0.08	0.07	0.03	0.03	0.05	0.09	0.04
C2'	0.04	0.06	0.07	0.07	0.07	0.05	0.06	0.06	0.05	0.05	0.07	0.08	0.07	0.09	0.09	0.04	0.04	0.11	0.05	0.05
C3'	0.05	0.07	0.05	0.05	0.08	0.03	0.06	0.04	0.05	0.06	0.08	0.08	0.08	0.06	0.08	0.05	0.03	0.11	0.04	0.04
C4	0.03	0.07	0.04	0.03	0.05	0.04	0.05	0.04	0.04	0.04	0.07	0.06	0.10	0.06	0.05	0.03	0.04	0.03	0.10	0.05
C4'	0.07	0.08	0.06	0.04	0.08	0.03	0.07	0.03	0.07	0.07	0.08	0.08	0.09	0.07	0.07	0.08	0.03	0.11	0.05	0.04
C5	0.03	0.04	0.04	0.05	0.05	0.05	0.04	0.05	0.04	0.03	0.05	0.05	0.06	0.06	0.06	0.02	0.03	0.06	0.06	0.03
C5'	0.13	0.13	0.11	0.08	0.13	0.09	0.13	0.07	0.13	0.13	0.12	0.13	0.13	0.12	0.10	0.14	0.08	0.07	0.08	0.05
C6	0.03	0.04	0.05	0.06	0.05	0.06	0.04	0.07	0.04	0.03	0.05	0.05	0.04	0.07	0.07	0.03	0.04	0.09	0.04	0.04
N1	0.03	0.05	0.05	0.06	0.05	0.05	0.05	0.06	0.04	0.04	0.05	0.06	0.06	0.08	0.08	0.03	0.03	0.09	0.05	0.04
N3	0.04	0.07	0.05	0.03	0.06	0.04	0.05	0.04	0.04	0.04	0.07	0.06	0.11	0.07	0.06	0.03	0.04	0.03	0.11	0.05
N4	0.04	0.10	0.04	0.03	0.06	0.04	0.05	0.04	0.04	0.06	0.09	0.06	0.13	0.05	0.05	0.03	0.07	0.04	0.14	0.08
O2	0.04	0.06	0.06	0.04	0.06	0.04	0.05	0.04	0.04	0.04	0.06	0.07	0.09	0.08	0.07	0.03	0.03	0.05	0.09	0.04
O2'	0.05	0.07	0.07	0.06	0.07	0.05	0.06	0.06	0.05	0.05	0.08	0.08	0.08	0.08	0.08	0.04	0.04	0.12	0.04	0.05
O3'	0.04	0.07	0.04	0.04	0.08	0.03	0.06	0.04	0.05	0.05	0.08	0.09	0.08	0.05	0.08	0.04	0.03	0.12	0.04	0.04
O4'	0.04	0.06	0.06	0.07	0.06	0.06	0.05	0.07	0.05	0.05	0.06	0.06	0.06	0.08	0.09	0.04	0.05	0.14	0.04	0.07
O5'	0.11	0.10	0.10	0.07	0.10	0.07	0.11	0.05	0.11	0.11	0.10	0.11	0.10	0.12	0.09	0.12	0.05	0.10	0.05	0.04
OP1	0.08	0.07	0.08	0.07	0.08	0.07	0.09	0.07	0.09	0.08	0.07	0.08	0.07	0.11	0.09	0.10	0.08	0.16	0.10	0.10
OP2	0.08	0.06	0.08	0.08	0.08	0.08	0.09	0.07	0.10	0.08	0.06	0.09	0.06	0.10	0.11	0.10	0.08	0.14	0.08	0.09
P	0.08	0.07	0.08	0.07	0.08	0.07	0.09	0.06	0.10	0.08	0.07	0.09	0.07	0.11	0.09	0.10	0.06	0.13	0.07	0.07

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.02	0.08	0.05
C2	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.05	0.01	0.01	0.08	0.06	0.16	0.10
C2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.00	0.02	0.00	0.02	0.04	0.05	0.02
C3'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.02	0.05	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.05	0.04	0.03
C4	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.03	0.01	0.12	0.15	0.24	0.17
C4'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.03	0.01
C5	0.00	0.00	0.02	0.04	0.01	0.03	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.04	0.01	0.13	0.16	0.25	0.18
C5'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.06	0.00	0.07	0.00	0.06	0.04	0.04	0.08	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01
C6	0.00	0.00	0.02	0.04	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.11	0.13	0.20	0.14
N1	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.08	0.07	0.15	0.10
N3	0.00	0.00	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.02	0.01	0.10	0.10	0.20	0.13
N4	0.00	0.01	0.02	0.05	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.05	0.01	0.14	0.19	0.28	0.20
O2	0.01	0.00	0.04	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.08	0.02	0.02	0.06	0.03	0.12	0.07
O2'	0.01	0.05	0.00	0.02	0.03	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.05	0.02	0.08	0.00	0.06	0.02	0.03	0.04	0.05	0.03
O3'	0.02	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.04	0.02	0.03	0.01	0.02	0.05	0.02	0.06	0.00	0.01	0.06	0.12	0.10	0.08
O4'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.02	0.06	0.04
O5'	0.04	0.08	0.02	0.02	0.12	0.01	0.13	0.01	0.11	0.08	0.10	0.14	0.06	0.03	0.06	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.02	0.06	0.04	0.05	0.15	0.03	0.16	0.02	0.13	0.07	0.10	0.19	0.03	0.04	0.12	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.08	0.16	0.05	0.04	0.24	0.03	0.25	0.02	0.20	0.15	0.20	0.28	0.12	0.05	0.10	0.06	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.10	0.02	0.03	0.17	0.01	0.18	0.01	0.14	0.10	0.13	0.20	0.07	0.03	0.08	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00