Doublet Group distance statistics: 48211

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 7, 4, 5, 10, 8, 6, 4, 1, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.005, 0.012, 0.019, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.012 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.005, 0.013, 0.020, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.013 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.002, 0.010, 0.018, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.010 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.004, 0.014, 0.024, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.014 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.002, 0.012, 0.022, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.012 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.002, 0.013, 0.024, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.013 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.002, 0.015, 0.028, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.015 std_dev=0.013
O2	A	0, 0.015, 0.042, 0.069, 0.142 max_d=0.142 avg_d=0.042 std_dev=0.027
N4	A	0, 0.007, 0.042, 0.076, 0.206 max_d=0.206 avg_d=0.042 std_dev=0.034
O4'	A	0, 0.021, 0.088, 0.154, 0.376 max_d=0.376 avg_d=0.088 std_dev=0.066
C2'	A	0, 0.014, 0.087, 0.161, 0.410 max_d=0.410 avg_d=0.087 std_dev=0.073
O2'	A	0, 0.056, 0.145, 0.234, 0.427 max_d=0.427 avg_d=0.145 std_dev=0.089
C4'	A	0, 0.035, 0.139, 0.242, 0.613 max_d=0.613 avg_d=0.139 std_dev=0.103
C3'	A	0, 0.064, 0.170, 0.276, 0.657 max_d=0.657 avg_d=0.170 std_dev=0.106
O3'	A	0, 0.118, 0.263, 0.408, 0.915 max_d=0.915 avg_d=0.263 std_dev=0.145
O5'	A	0, 0.063, 0.241, 0.418, 0.961 max_d=0.961 avg_d=0.241 std_dev=0.177
C5'	A	0, 0.024, 0.205, 0.386, 1.056 max_d=1.056 avg_d=0.205 std_dev=0.181
O4'	B	0, 0.151, 0.354, 0.558, 0.837 max_d=0.837 avg_d=0.354 std_dev=0.204
C1'	B	0, 0.158, 0.362, 0.567, 0.873 max_d=0.873 avg_d=0.362 std_dev=0.205
C2'	B	0, 0.204, 0.429, 0.654, 1.030 max_d=1.030 avg_d=0.429 std_dev=0.225
N9	B	0, 0.105, 0.331, 0.556, 1.306 max_d=1.306 avg_d=0.331 std_dev=0.226
O5'	B	0, 0.250, 0.489, 0.727, 1.073 max_d=1.073 avg_d=0.489 std_dev=0.238
C4'	B	0, 0.195, 0.434, 0.674, 0.929 max_d=0.929 avg_d=0.434 std_dev=0.239
C5'	B	0, 0.233, 0.472, 0.712, 0.997 max_d=0.997 avg_d=0.472 std_dev=0.240
O2'	B	0, 0.268, 0.516, 0.763, 1.114 max_d=1.114 avg_d=0.516 std_dev=0.247
C3'	B	0, 0.206, 0.457, 0.709, 1.062 max_d=1.062 avg_d=0.457 std_dev=0.252
C8	B	0, 0.082, 0.344, 0.606, 1.591 max_d=1.591 avg_d=0.344 std_dev=0.262
C4	B	0, 0.058, 0.325, 0.592, 1.763 max_d=1.763 avg_d=0.325 std_dev=0.267
OP2	A	0, 0.053, 0.332, 0.611, 1.498 max_d=1.498 avg_d=0.332 std_dev=0.279
P	A	0, 0.062, 0.345, 0.627, 1.538 max_d=1.538 avg_d=0.345 std_dev=0.282
N3	B	0, 0.049, 0.339, 0.629, 1.993 max_d=1.993 avg_d=0.339 std_dev=0.290
P	B	0, 0.166, 0.463, 0.759, 1.658 max_d=1.658 avg_d=0.463 std_dev=0.297
O3'	B	0, 0.211, 0.513, 0.815, 1.064 max_d=1.064 avg_d=0.513 std_dev=0.302
C5	B	0, 0.024, 0.342, 0.660, 2.141 max_d=2.141 avg_d=0.342 std_dev=0.318
N7	B	0, 0.030, 0.351, 0.672, 2.093 max_d=2.093 avg_d=0.351 std_dev=0.321
C2	B	0, 0.013, 0.367, 0.721, 2.490 max_d=2.490 avg_d=0.367 std_dev=0.354
C6	B	0, -0.001, 0.382, 0.764, 2.638 max_d=2.638 avg_d=0.382 std_dev=0.383
N1	B	0, -0.001, 0.392, 0.784, 2.749 max_d=2.749 avg_d=0.392 std_dev=0.392
OP1	A	0, 0.094, 0.493, 0.891, 2.287 max_d=2.287 avg_d=0.493 std_dev=0.399
N2	B	0, -0.001, 0.404, 0.809, 2.870 max_d=2.870 avg_d=0.404 std_dev=0.405
O6	B	0, -0.013, 0.432, 0.876, 3.057 max_d=3.057 avg_d=0.432 std_dev=0.444
OP1	B	0, -0.043, 0.485, 1.014, 3.720 max_d=3.720 avg_d=0.485 std_dev=0.528
OP2	B	0, -0.052, 0.532, 1.116, 4.008 max_d=4.008 avg_d=0.532 std_dev=0.584

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.05	0.08	0.05	0.03
C2	0.02	0.00	0.05	0.07	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.07	0.02	0.08	0.10	0.09	0.07
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.04	0.02	0.04	0.04	0.08	0.01	0.02	0.01	0.03	0.11	0.05	0.03
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.05	0.03	0.07	0.06	0.09	0.02	0.01	0.01	0.03	0.12	0.05	0.04
C4	0.02	0.01	0.04	0.05	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.06	0.03	0.10	0.11	0.11	0.09
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.04	0.05	0.04	0.03	0.01	0.00	0.01	0.08	0.02	0.01
C5	0.02	0.01	0.04	0.05	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.06	0.04	0.10	0.10	0.10	0.09
C5'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.06	0.01	0.06	0.00	0.05	0.03	0.05	0.07	0.04	0.03	0.02	0.01	0.01	0.08	0.02	0.01
C6	0.02	0.01	0.04	0.05	0.01	0.05	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.06	0.03	0.09	0.08	0.08	0.06
N1	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.04	0.02	0.08	0.09	0.07	0.05
N3	0.02	0.00	0.04	0.07	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.08	0.02	0.10	0.11	0.10	0.08
N4	0.02	0.01	0.04	0.06	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.04	0.07	0.04	0.10	0.12	0.12	0.10
O2	0.03	0.01	0.08	0.09	0.01	0.04	0.01	0.04	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.07	0.10	0.04	0.08	0.10	0.09	0.06
O2'	0.02	0.04	0.01	0.02	0.04	0.03	0.03	0.03	0.03	0.02	0.04	0.04	0.07	0.00	0.05	0.03	0.03	0.11	0.05	0.03
O3'	0.01	0.07	0.02	0.01	0.06	0.01	0.06	0.02	0.06	0.04	0.08	0.07	0.10	0.05	0.00	0.01	0.06	0.13	0.07	0.05
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.03	0.02	0.02	0.04	0.04	0.03	0.01	0.00	0.05	0.07	0.05	0.03
O5'	0.05	0.08	0.03	0.03	0.10	0.01	0.10	0.01	0.09	0.08	0.10	0.10	0.08	0.03	0.06	0.05	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.08	0.10	0.11	0.12	0.11	0.08	0.10	0.08	0.08	0.09	0.11	0.12	0.10	0.11	0.13	0.07	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.05	0.09	0.05	0.05	0.11	0.02	0.10	0.02	0.08	0.07	0.10	0.12	0.09	0.05	0.07	0.05	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.03	0.07	0.03	0.04	0.09	0.01	0.09	0.01	0.06	0.05	0.08	0.10	0.06	0.03	0.05	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.29	0.14	0.13	0.23	0.10	0.26	0.13	0.31	0.20	0.32	0.31	0.24	0.24	0.19	0.22	0.23	0.14	0.14	0.33	0.22	0.52	0.23
C2	0.16	0.24	0.15	0.15	0.22	0.11	0.27	0.13	0.30	0.23	0.28	0.23	0.20	0.27	0.20	0.21	0.26	0.14	0.16	0.33	0.23	0.55	0.24
C2'	0.13	0.31	0.12	0.11	0.23	0.10	0.27	0.14	0.33	0.20	0.34	0.33	0.24	0.25	0.18	0.21	0.21	0.13	0.14	0.36	0.25	0.51	0.24
C3'	0.13	0.38	0.11	0.08	0.27	0.10	0.30	0.14	0.37	0.21	0.40	0.42	0.30	0.26	0.20	0.20	0.17	0.14	0.12	0.39	0.26	0.49	0.24
C4	0.16	0.20	0.15	0.15	0.20	0.12	0.24	0.12	0.26	0.22	0.24	0.18	0.18	0.24	0.19	0.20	0.27	0.13	0.15	0.28	0.23	0.53	0.24
C4'	0.15	0.38	0.11	0.08	0.27	0.12	0.29	0.16	0.35	0.20	0.39	0.43	0.31	0.25	0.20	0.20	0.16	0.16	0.13	0.37	0.24	0.48	0.23
C5	0.16	0.24	0.14	0.14	0.21	0.09	0.23	0.13	0.25	0.19	0.26	0.24	0.21	0.22	0.18	0.22	0.26	0.13	0.13	0.26	0.22	0.49	0.22
C5'	0.17	0.42	0.11	0.07	0.30	0.15	0.32	0.18	0.38	0.21	0.43	0.49	0.36	0.26	0.23	0.20	0.12	0.19	0.15	0.39	0.25	0.46	0.24
C6	0.15	0.27	0.14	0.13	0.22	0.09	0.24	0.13	0.27	0.19	0.29	0.29	0.23	0.22	0.18	0.23	0.24	0.14	0.12	0.29	0.21	0.49	0.22
N1	0.16	0.27	0.14	0.13	0.22	0.10	0.26	0.13	0.29	0.21	0.30	0.28	0.23	0.24	0.19	0.22	0.25	0.13	0.14	0.31	0.22	0.52	0.23
N3	0.16	0.21	0.15	0.16	0.21	0.13	0.26	0.13	0.28	0.23	0.26	0.19	0.18	0.27	0.19	0.20	0.27	0.14	0.17	0.31	0.24	0.55	0.25
N4	0.16	0.15	0.15	0.17	0.18	0.15	0.22	0.13	0.23	0.22	0.20	0.14	0.14	0.24	0.18	0.18	0.26	0.14	0.17	0.25	0.25	0.53	0.24
O2	0.17	0.24	0.15	0.15	0.22	0.12	0.27	0.13	0.31	0.23	0.29	0.24	0.20	0.28	0.20	0.22	0.26	0.14	0.17	0.34	0.23	0.56	0.25
O2'	0.14	0.29	0.13	0.12	0.23	0.09	0.27	0.13	0.33	0.20	0.34	0.32	0.23	0.25	0.18	0.21	0.22	0.13	0.14	0.36	0.24	0.52	0.23
O3'	0.13	0.40	0.10	0.08	0.28	0.10	0.32	0.14	0.39	0.21	0.43	0.46	0.31	0.27	0.20	0.20	0.15	0.14	0.12	0.42	0.27	0.48	0.24
O4'	0.15	0.32	0.13	0.11	0.24	0.11	0.26	0.15	0.31	0.19	0.33	0.35	0.26	0.23	0.19	0.22	0.21	0.15	0.13	0.32	0.21	0.48	0.22
O5'	0.19	0.43	0.13	0.09	0.32	0.17	0.33	0.21	0.38	0.23	0.43	0.49	0.38	0.28	0.25	0.20	0.12	0.21	0.17	0.39	0.27	0.49	0.27
OP1	0.24	0.53	0.16	0.12	0.38	0.21	0.38	0.22	0.45	0.26	0.52	0.61	0.46	0.31	0.29	0.22	0.09	0.25	0.18	0.45	0.25	0.41	0.25
OP2	0.23	0.46	0.14	0.10	0.35	0.20	0.34	0.21	0.39	0.24	0.44	0.50	0.42	0.28	0.27	0.20	0.09	0.25	0.18	0.39	0.26	0.41	0.25
P	0.22	0.46	0.14	0.10	0.34	0.20	0.34	0.22	0.39	0.24	0.45	0.52	0.41	0.28	0.27	0.21	0.08	0.24	0.18	0.40	0.26	0.43	0.26

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.05	0.00	0.07	0.02	0.24	0.18	0.12
C2	0.03	0.00	0.05	0.03	0.01	0.04	0.02	0.09	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.12	0.10	0.05	0.13	0.02	0.34	0.21	0.16
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.01	0.02	0.04	0.03	0.04	0.04	0.07	0.05	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.08	0.03	0.21	0.19	0.15
C3'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.03	0.02	0.04	0.02	0.05	0.03	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.03	0.15	0.16	0.11
C4	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.06	0.03	0.13	0.01	0.34	0.18	0.15
C4'	0.00	0.04	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.05	0.04	0.05	0.04	0.05	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.05	0.10	0.19	0.05
C5	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.04	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.05	0.02	0.17	0.01	0.37	0.15	0.14
C5'	0.03	0.09	0.04	0.03	0.08	0.01	0.10	0.00	0.11	0.11	0.10	0.09	0.08	0.12	0.07	0.04	0.02	0.01	0.01	0.12	0.11	0.17	0.01
C6	0.02	0.02	0.03	0.02	0.01	0.04	0.01	0.11	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.06	0.03	0.17	0.01	0.38	0.16	0.15
C8	0.01	0.02	0.04	0.04	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.08	0.04	0.04	0.17	0.02	0.36	0.15	0.13
N1	0.02	0.01	0.04	0.02	0.01	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.08	0.04	0.15	0.02	0.37	0.18	0.16
N2	0.03	0.00	0.07	0.05	0.02	0.05	0.02	0.09	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.15	0.11	0.07	0.12	0.03	0.33	0.24	0.16
N3	0.02	0.00	0.05	0.03	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.12	0.09	0.06	0.11	0.02	0.32	0.22	0.16
N7	0.01	0.02	0.04	0.03	0.01	0.05	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.00	0.08	0.04	0.04	0.19	0.02	0.39	0.16	0.14
N9	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.03	0.05	0.01	0.13	0.02	0.31	0.17	0.14
O2'	0.02	0.12	0.00	0.01	0.06	0.01	0.06	0.04	0.07	0.08	0.09	0.15	0.12	0.08	0.03	0.00	0.04	0.01	0.10	0.07	0.25	0.21	0.17
O3'	0.05	0.10	0.02	0.00	0.06	0.02	0.05	0.02	0.06	0.04	0.08	0.11	0.09	0.04	0.05	0.04	0.00	0.05	0.06	0.06	0.16	0.14	0.09
O4'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.04	0.04	0.07	0.06	0.04	0.01	0.01	0.05	0.00	0.06	0.04	0.18	0.25	0.11
O5'	0.07	0.13	0.08	0.08	0.13	0.01	0.17	0.01	0.17	0.17	0.15	0.12	0.11	0.19	0.13	0.10	0.06	0.06	0.00	0.19	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.03	0.03	0.01	0.05	0.01	0.12	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.02	0.07	0.06	0.04	0.19	0.00	0.40	0.17	0.16
OP1	0.24	0.34	0.21	0.15	0.34	0.10	0.37	0.11	0.38	0.36	0.37	0.33	0.32	0.39	0.31	0.25	0.16	0.18	0.02	0.40	0.00	0.01	0.01
OP2	0.18	0.21	0.19	0.16	0.18	0.19	0.15	0.17	0.16	0.15	0.18	0.24	0.22	0.16	0.17	0.21	0.14	0.25	0.02	0.17	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.16	0.15	0.11	0.15	0.05	0.14	0.01	0.15	0.13	0.16	0.16	0.16	0.14	0.14	0.17	0.09	0.11	0.01	0.16	0.01	0.01	0.00