Doublet Group distance statistics: 48212

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 12, 14, 18, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.003, 0.005, 0.007, 0.009 max_d=0.009 avg_d=0.005 std_dev=0.002
N3	A	0, 0.004, 0.008, 0.011, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.008 std_dev=0.003
N1	A	0, 0.005, 0.010, 0.015, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.010 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.006, 0.014, 0.022, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.014 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.006, 0.014, 0.022, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.014 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.006, 0.015, 0.023, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.015 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.005, 0.014, 0.022, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.014 std_dev=0.009
O2	A	0, 0.013, 0.037, 0.062, 0.130 max_d=0.130 avg_d=0.037 std_dev=0.024
N4	A	0, 0.012, 0.042, 0.071, 0.130 max_d=0.130 avg_d=0.042 std_dev=0.030
O4'	A	0, 0.030, 0.077, 0.124, 0.176 max_d=0.176 avg_d=0.077 std_dev=0.047
C2'	A	0, 0.077, 0.128, 0.178, 0.291 max_d=0.291 avg_d=0.128 std_dev=0.051
O2'	A	0, 0.132, 0.203, 0.273, 0.463 max_d=0.463 avg_d=0.203 std_dev=0.071
C4'	A	0, 0.059, 0.133, 0.206, 0.284 max_d=0.284 avg_d=0.133 std_dev=0.073
C3'	A	0, 0.080, 0.166, 0.252, 0.352 max_d=0.352 avg_d=0.166 std_dev=0.086
O2'	B	0, 0.261, 0.357, 0.452, 0.498 max_d=0.498 avg_d=0.357 std_dev=0.095
C5'	A	0, 0.089, 0.210, 0.331, 0.492 max_d=0.492 avg_d=0.210 std_dev=0.121
O3'	A	0, 0.094, 0.223, 0.352, 0.469 max_d=0.469 avg_d=0.223 std_dev=0.129
O5'	A	0, 0.095, 0.248, 0.402, 0.754 max_d=0.754 avg_d=0.248 std_dev=0.154
P	A	0, 0.116, 0.310, 0.503, 0.895 max_d=0.895 avg_d=0.310 std_dev=0.194
C2'	B	0, 0.107, 0.390, 0.673, 1.662 max_d=1.662 avg_d=0.390 std_dev=0.283
OP1	A	0, 0.017, 0.417, 0.817, 2.129 max_d=2.129 avg_d=0.417 std_dev=0.400
OP2	A	0, -0.030, 0.464, 0.957, 2.605 max_d=2.605 avg_d=0.464 std_dev=0.493
C8	B	0, -0.130, 0.468, 1.066, 3.290 max_d=3.290 avg_d=0.468 std_dev=0.598
C1'	B	0, -0.189, 0.498, 1.185, 3.805 max_d=3.805 avg_d=0.498 std_dev=0.687
N9	B	0, -0.256, 0.513, 1.283, 4.215 max_d=4.215 avg_d=0.513 std_dev=0.769
N7	B	0, -0.261, 0.515, 1.290, 4.205 max_d=4.205 avg_d=0.515 std_dev=0.775
C3'	B	0, -0.309, 0.489, 1.286, 4.321 max_d=4.321 avg_d=0.489 std_dev=0.798
O3'	B	0, -0.371, 0.524, 1.419, 4.837 max_d=4.837 avg_d=0.524 std_dev=0.895
O4'	B	0, -0.489, 0.585, 1.659, 5.760 max_d=5.760 avg_d=0.585 std_dev=1.074
C4'	B	0, -0.548, 0.579, 1.706, 6.017 max_d=6.017 avg_d=0.579 std_dev=1.127
C4	B	0, -0.525, 0.625, 1.775, 6.184 max_d=6.184 avg_d=0.625 std_dev=1.150
C5	B	0, -0.550, 0.621, 1.792, 6.270 max_d=6.270 avg_d=0.621 std_dev=1.171
O5'	B	0, -0.629, 0.735, 2.098, 7.299 max_d=7.299 avg_d=0.735 std_dev=1.364
N3	B	0, -0.742, 0.743, 2.227, 7.919 max_d=7.919 avg_d=0.743 std_dev=1.484
OP2	B	0, -0.736, 0.782, 2.300, 8.110 max_d=8.110 avg_d=0.782 std_dev=1.518
C5'	B	0, -0.796, 0.730, 2.257, 8.092 max_d=8.092 avg_d=0.730 std_dev=1.526
C6	B	0, -0.851, 0.758, 2.367, 8.536 max_d=8.536 avg_d=0.758 std_dev=1.609
O6	B	0, -0.924, 0.797, 2.517, 9.102 max_d=9.102 avg_d=0.797 std_dev=1.720
P	B	0, -0.902, 0.858, 2.617, 9.349 max_d=9.349 avg_d=0.858 std_dev=1.760
C2	B	0, -1.023, 0.864, 2.751, 9.984 max_d=9.984 avg_d=0.864 std_dev=1.887
N1	B	0, -1.084, 0.876, 2.835, 10.352 max_d=10.352 avg_d=0.876 std_dev=1.959
OP1	B	0, -1.136, 1.000, 3.136, 11.309 max_d=11.309 avg_d=1.000 std_dev=2.136
N2	B	0, -1.276, 1.000, 3.276, 11.987 max_d=11.987 avg_d=1.000 std_dev=2.276

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.16	0.10	0.04
C2	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.05	0.02	0.05	0.22	0.25	0.06
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.03	0.03	0.06	0.00	0.01	0.00	0.03	0.07	0.08	0.03
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.06	0.03	0.05	0.05	0.06	0.01	0.00	0.01	0.02	0.09	0.07	0.02
C4	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.06	0.01	0.08	0.28	0.39	0.10
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.04	0.02	0.02	0.03	0.03	0.05	0.01	0.00	0.01	0.06	0.09	0.02
C5	0.01	0.00	0.04	0.06	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.07	0.01	0.10	0.28	0.40	0.11
C5'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.06	0.00	0.07	0.00	0.06	0.04	0.04	0.06	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.06	0.16	0.01
C6	0.00	0.00	0.04	0.06	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.09	0.24	0.30	0.08
N1	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.05	0.21	0.22	0.06
N3	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.06	0.02	0.07	0.25	0.33	0.08
N4	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.06	0.02	0.09	0.30	0.44	0.11
O2	0.02	0.00	0.06	0.06	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.07	0.04	0.04	0.19	0.21	0.05
O2'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.03	0.05	0.03	0.04	0.02	0.01	0.04	0.04	0.06	0.00	0.03	0.04	0.03	0.08	0.06	0.03
O3'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.06	0.01	0.07	0.03	0.06	0.03	0.06	0.06	0.07	0.03	0.00	0.01	0.04	0.16	0.16	0.04
O4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.04	0.01	0.00	0.03	0.18	0.05	0.05
O5'	0.03	0.05	0.03	0.02	0.08	0.01	0.10	0.01	0.09	0.05	0.07	0.09	0.04	0.03	0.04	0.03	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.16	0.22	0.07	0.09	0.28	0.06	0.28	0.06	0.24	0.21	0.25	0.30	0.19	0.08	0.16	0.18	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.10	0.25	0.08	0.07	0.39	0.09	0.40	0.16	0.30	0.22	0.33	0.44	0.21	0.06	0.16	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.04	0.06	0.03	0.02	0.10	0.02	0.11	0.01	0.08	0.06	0.08	0.11	0.05	0.03	0.04	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.26	0.69	0.08	0.07	0.53	0.14	0.57	0.27	0.67	0.38	0.72	0.74	0.59	0.49	0.40	0.10	0.11	0.12	0.17	0.70	0.17	0.11	0.17
C2	0.23	0.82	0.08	0.18	0.60	0.32	0.65	0.48	0.78	0.38	0.86	0.89	0.69	0.52	0.41	0.12	0.17	0.08	0.34	0.81	0.41	0.21	0.35
C2'	0.19	0.59	0.07	0.06	0.46	0.22	0.52	0.37	0.62	0.35	0.65	0.63	0.49	0.45	0.33	0.08	0.12	0.09	0.24	0.67	0.23	0.12	0.23
C3'	0.16	0.39	0.08	0.10	0.34	0.15	0.39	0.26	0.45	0.30	0.45	0.39	0.33	0.37	0.27	0.09	0.23	0.09	0.15	0.49	0.12	0.12	0.12
C4	0.25	0.62	0.07	0.13	0.52	0.24	0.56	0.34	0.63	0.39	0.65	0.62	0.55	0.48	0.40	0.12	0.12	0.08	0.20	0.64	0.18	0.10	0.18
C4'	0.26	0.48	0.11	0.19	0.42	0.09	0.46	0.10	0.51	0.37	0.51	0.48	0.43	0.43	0.35	0.07	0.32	0.17	0.09	0.53	0.20	0.20	0.13
C5	0.28	0.43	0.09	0.12	0.41	0.09	0.45	0.12	0.47	0.38	0.46	0.40	0.40	0.43	0.37	0.09	0.20	0.17	0.09	0.49	0.18	0.19	0.12
C5'	0.30	0.34	0.17	0.33	0.36	0.22	0.39	0.17	0.40	0.38	0.37	0.30	0.33	0.40	0.35	0.06	0.49	0.25	0.23	0.42	0.45	0.37	0.32
C6	0.27	0.48	0.09	0.13	0.43	0.08	0.47	0.13	0.51	0.38	0.51	0.48	0.44	0.43	0.37	0.09	0.22	0.16	0.09	0.53	0.16	0.18	0.11
N1	0.26	0.67	0.07	0.06	0.53	0.16	0.56	0.28	0.65	0.38	0.70	0.70	0.58	0.48	0.40	0.10	0.08	0.11	0.18	0.68	0.17	0.10	0.16
N3	0.22	0.82	0.10	0.24	0.61	0.38	0.66	0.53	0.78	0.39	0.85	0.87	0.69	0.53	0.42	0.14	0.26	0.09	0.37	0.81	0.44	0.23	0.38
N4	0.25	0.58	0.09	0.21	0.52	0.30	0.56	0.38	0.61	0.41	0.61	0.56	0.53	0.49	0.41	0.15	0.25	0.08	0.23	0.62	0.20	0.10	0.19
O2	0.21	0.94	0.10	0.25	0.65	0.40	0.70	0.60	0.88	0.37	0.98	1.05	0.77	0.54	0.41	0.13	0.25	0.11	0.45	0.92	0.60	0.33	0.50
O2'	0.21	0.72	0.07	0.09	0.53	0.26	0.60	0.43	0.73	0.37	0.78	0.78	0.59	0.50	0.37	0.08	0.08	0.10	0.30	0.78	0.34	0.18	0.31
O3'	0.13	0.34	0.08	0.10	0.29	0.18	0.36	0.31	0.42	0.26	0.41	0.34	0.28	0.34	0.23	0.10	0.23	0.12	0.19	0.47	0.13	0.11	0.15
O4'	0.31	0.61	0.11	0.16	0.51	0.10	0.53	0.10	0.60	0.40	0.63	0.65	0.54	0.47	0.41	0.09	0.24	0.22	0.09	0.62	0.15	0.17	0.11
O5'	0.26	0.20	0.17	0.36	0.27	0.22	0.31	0.19	0.29	0.35	0.23	0.15	0.21	0.35	0.30	0.07	0.54	0.22	0.25	0.31	0.52	0.42	0.36
OP1	0.12	0.36	0.13	0.23	0.19	0.17	0.16	0.20	0.23	0.13	0.32	0.47	0.29	0.13	0.13	0.26	0.40	0.13	0.21	0.22	0.61	0.37	0.38
OP2	0.67	0.29	0.68	0.96	0.53	0.79	0.58	0.80	0.48	0.76	0.35	0.16	0.37	0.71	0.66	0.53	1.17	0.67	0.87	0.51	1.27	1.08	1.04
P	0.28	0.13	0.22	0.50	0.19	0.37	0.22	0.39	0.17	0.34	0.12	0.20	0.12	0.31	0.27	0.09	0.70	0.30	0.42	0.18	0.80	0.60	0.58

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.11	0.00	0.05	0.01	0.16	0.08	0.06
C2	0.03	0.00	0.20	0.13	0.01	0.10	0.00	0.17	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.19	0.05	0.18	0.11	0.01	0.13	0.12	0.09
C2'	0.00	0.20	0.00	0.00	0.10	0.01	0.05	0.06	0.09	0.11	0.16	0.24	0.19	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.07	0.37	0.29	0.25
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.13	0.00	0.17	0.02	0.18	0.15	0.16	0.12	0.11	0.18	0.11	0.01	0.00	0.01	0.04	0.19	0.27	0.10	0.12
C4	0.01	0.01	0.10	0.13	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.03	0.10	0.07	0.01	0.09	0.13	0.09
C4'	0.00	0.10	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.03	0.14	0.06	0.14	0.10	0.12	0.04	0.14	0.01	0.00	0.01	0.04	0.12	0.03	0.04
C5	0.01	0.00	0.05	0.17	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.09	0.08	0.04	0.10	0.01	0.12	0.21	0.17
C5'	0.02	0.17	0.06	0.02	0.06	0.00	0.05	0.00	0.06	0.18	0.12	0.23	0.16	0.14	0.04	0.07	0.09	0.01	0.01	0.05	0.04	0.01	0.01
C6	0.01	0.00	0.09	0.18	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.10	0.08	0.08	0.00	0.12	0.23	0.16
C8	0.01	0.01	0.11	0.15	0.00	0.14	0.00	0.18	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.26	0.09	0.11	0.21	0.01	0.15	0.21	0.23
N1	0.02	0.00	0.16	0.16	0.01	0.06	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.07	0.14	0.08	0.01	0.10	0.17	0.11
N2	0.03	0.00	0.24	0.12	0.01	0.14	0.01	0.23	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.28	0.07	0.21	0.15	0.01	0.17	0.11	0.10
N3	0.02	0.00	0.19	0.11	0.00	0.10	0.00	0.16	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.18	0.06	0.18	0.11	0.01	0.14	0.10	0.08
N7	0.01	0.00	0.06	0.18	0.00	0.12	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.22	0.12	0.06	0.19	0.01	0.20	0.28	0.27
N9	0.00	0.01	0.01	0.11	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.09	0.02	0.01	0.07	0.01	0.08	0.10	0.10
O2'	0.01	0.19	0.00	0.01	0.03	0.14	0.09	0.07	0.04	0.26	0.10	0.28	0.18	0.22	0.09	0.00	0.03	0.10	0.09	0.08	0.36	0.34	0.24
O3'	0.11	0.05	0.01	0.00	0.03	0.01	0.08	0.09	0.10	0.09	0.07	0.07	0.06	0.12	0.02	0.03	0.00	0.07	0.13	0.13	0.16	0.08	0.06
O4'	0.00	0.18	0.01	0.01	0.10	0.00	0.04	0.01	0.08	0.11	0.14	0.21	0.18	0.06	0.01	0.10	0.07	0.00	0.04	0.06	0.06	0.05	0.05
O5'	0.05	0.11	0.14	0.04	0.07	0.01	0.10	0.01	0.08	0.21	0.08	0.15	0.11	0.19	0.07	0.09	0.13	0.04	0.00	0.10	0.02	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.07	0.19	0.01	0.04	0.01	0.05	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.13	0.06	0.10	0.00	0.17	0.28	0.20
OP1	0.16	0.13	0.37	0.27	0.09	0.12	0.12	0.04	0.12	0.15	0.10	0.17	0.14	0.20	0.08	0.36	0.16	0.06	0.02	0.17	0.00	0.01	0.00
OP2	0.08	0.12	0.29	0.10	0.13	0.03	0.21	0.01	0.23	0.21	0.17	0.11	0.10	0.28	0.10	0.34	0.08	0.05	0.01	0.28	0.01	0.00	0.00
P	0.06	0.09	0.25	0.12	0.09	0.04	0.17	0.01	0.16	0.23	0.11	0.10	0.08	0.27	0.10	0.24	0.06	0.05	0.00	0.20	0.00	0.00	0.00