Doublet Group distance statistics: 48216

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 2, 9, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.004, 0.009, 0.014, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.009 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.002, 0.008, 0.013, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.008 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.005, 0.012, 0.019, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.012 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.006, 0.016, 0.026, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.016 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.007, 0.017, 0.027, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.017 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.006, 0.017, 0.027, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.017 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.006, 0.017, 0.028, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.017 std_dev=0.011
O2	A	0, 0.017, 0.045, 0.074, 0.133 max_d=0.133 avg_d=0.045 std_dev=0.029
N4	A	0, 0.021, 0.050, 0.080, 0.120 max_d=0.120 avg_d=0.050 std_dev=0.030
C2'	A	0, 0.054, 0.104, 0.155, 0.204 max_d=0.204 avg_d=0.104 std_dev=0.051
O4'	A	0, 0.021, 0.091, 0.160, 0.276 max_d=0.276 avg_d=0.091 std_dev=0.069
O2'	A	0, 0.110, 0.186, 0.262, 0.317 max_d=0.317 avg_d=0.186 std_dev=0.076
C2'	B	0, 0.118, 0.217, 0.315, 0.459 max_d=0.459 avg_d=0.217 std_dev=0.099
C3'	A	0, 0.057, 0.161, 0.264, 0.426 max_d=0.426 avg_d=0.161 std_dev=0.103
C4'	A	0, 0.050, 0.155, 0.260, 0.451 max_d=0.451 avg_d=0.155 std_dev=0.105
N9	B	0, 0.124, 0.247, 0.371, 0.583 max_d=0.583 avg_d=0.247 std_dev=0.123
O3'	A	0, 0.102, 0.230, 0.359, 0.514 max_d=0.514 avg_d=0.230 std_dev=0.128
O2'	B	0, 0.129, 0.260, 0.391, 0.534 max_d=0.534 avg_d=0.260 std_dev=0.131
C1'	B	0, 0.121, 0.256, 0.390, 0.613 max_d=0.613 avg_d=0.256 std_dev=0.134
C3'	B	0, 0.111, 0.248, 0.385, 0.541 max_d=0.541 avg_d=0.248 std_dev=0.137
C4'	B	0, 0.079, 0.241, 0.403, 0.608 max_d=0.608 avg_d=0.241 std_dev=0.162
C5'	A	0, 0.063, 0.234, 0.406, 0.733 max_d=0.733 avg_d=0.234 std_dev=0.171
O4'	B	0, 0.115, 0.297, 0.479, 0.723 max_d=0.723 avg_d=0.297 std_dev=0.182
O5'	A	0, 0.072, 0.268, 0.465, 0.882 max_d=0.882 avg_d=0.268 std_dev=0.196
C5	B	0, 0.064, 0.306, 0.548, 1.087 max_d=1.087 avg_d=0.306 std_dev=0.242
C5'	B	0, 0.024, 0.295, 0.566, 1.093 max_d=1.093 avg_d=0.295 std_dev=0.271
O3'	B	0, 0.016, 0.305, 0.593, 1.277 max_d=1.277 avg_d=0.305 std_dev=0.289
O5'	B	0, 0.005, 0.347, 0.689, 1.285 max_d=1.285 avg_d=0.347 std_dev=0.342
P	A	0, -0.043, 0.308, 0.659, 1.464 max_d=1.464 avg_d=0.308 std_dev=0.351
OP2	A	0, -0.070, 0.328, 0.726, 1.580 max_d=1.580 avg_d=0.328 std_dev=0.398
N7	B	0, -0.041, 0.359, 0.759, 1.835 max_d=1.835 avg_d=0.359 std_dev=0.400
C4	B	0, -0.102, 0.363, 0.827, 2.092 max_d=2.092 avg_d=0.363 std_dev=0.465
OP1	A	0, -0.133, 0.354, 0.841, 1.937 max_d=1.937 avg_d=0.354 std_dev=0.487
C8	B	0, -0.143, 0.374, 0.890, 2.324 max_d=2.324 avg_d=0.374 std_dev=0.517
O6	B	0, -0.099, 0.420, 0.939, 2.303 max_d=2.303 avg_d=0.420 std_dev=0.519
P	B	0, -0.079, 0.479, 1.038, 2.279 max_d=2.279 avg_d=0.479 std_dev=0.558
OP2	B	0, -0.044, 0.569, 1.182, 2.339 max_d=2.339 avg_d=0.569 std_dev=0.613
C6	B	0, -0.203, 0.425, 1.052, 2.777 max_d=2.777 avg_d=0.425 std_dev=0.628
OP1	B	0, -0.262, 0.728, 1.718, 4.035 max_d=4.035 avg_d=0.728 std_dev=0.990
N3	B	0, -0.536, 0.537, 1.611, 4.659 max_d=4.659 avg_d=0.537 std_dev=1.073
N1	B	0, -0.659, 0.587, 1.833, 5.370 max_d=5.370 avg_d=0.587 std_dev=1.246
C2	B	0, -0.808, 0.643, 2.095, 6.234 max_d=6.234 avg_d=0.643 std_dev=1.452
N2	B	0, -1.251, 0.829, 2.909, 8.859 max_d=8.859 avg_d=0.829 std_dev=2.080

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.05	0.06	0.09	0.06
C2	0.01	0.00	0.04	0.05	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.05	0.01	0.08	0.11	0.16	0.11
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.04	0.01	0.04	0.04	0.06	0.00	0.02	0.00	0.06	0.10	0.11	0.07
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.06	0.00	0.07	0.02	0.07	0.03	0.07	0.07	0.06	0.02	0.00	0.01	0.07	0.12	0.11	0.08
C4	0.01	0.00	0.03	0.06	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.07	0.03	0.08	0.12	0.17	0.11
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.03	0.05	0.03	0.04	0.02	0.00	0.02	0.06	0.04	0.02
C5	0.01	0.00	0.03	0.07	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.08	0.03	0.07	0.09	0.13	0.09
C5'	0.01	0.04	0.02	0.02	0.06	0.01	0.06	0.00	0.05	0.03	0.06	0.07	0.05	0.05	0.04	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.07	0.01	0.05	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.07	0.02	0.05	0.06	0.11	0.07
N1	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.06	0.07	0.12	0.08
N3	0.01	0.00	0.04	0.07	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.07	0.02	0.09	0.13	0.18	0.12
N4	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.09	0.03	0.09	0.14	0.18	0.12
O2	0.02	0.01	0.06	0.06	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.07	0.07	0.01	0.09	0.12	0.16	0.11
O2'	0.01	0.04	0.00	0.02	0.02	0.04	0.02	0.05	0.03	0.01	0.04	0.03	0.07	0.00	0.04	0.03	0.06	0.11	0.10	0.06
O3'	0.01	0.05	0.02	0.00	0.07	0.02	0.08	0.04	0.07	0.03	0.07	0.09	0.07	0.04	0.00	0.01	0.09	0.16	0.14	0.11
O4'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.03	0.01	0.00	0.05	0.06	0.08	0.07
O5'	0.05	0.08	0.06	0.07	0.08	0.02	0.07	0.01	0.05	0.06	0.09	0.09	0.09	0.06	0.09	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.06	0.11	0.10	0.12	0.12	0.06	0.09	0.05	0.06	0.07	0.13	0.14	0.12	0.11	0.16	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.09	0.16	0.11	0.11	0.17	0.04	0.13	0.02	0.11	0.12	0.18	0.18	0.16	0.10	0.14	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.11	0.07	0.08	0.11	0.02	0.09	0.01	0.07	0.08	0.12	0.12	0.11	0.06	0.11	0.07	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.98	0.10	0.12	0.33	0.17	0.15	0.26	0.40	0.47	0.79	1.36	0.77	0.34	0.11	0.11	0.32	0.16	0.22	0.31	0.18	0.58	0.23
C2	0.11	0.92	0.10	0.11	0.33	0.17	0.17	0.28	0.40	0.43	0.76	1.23	0.73	0.30	0.11	0.11	0.26	0.15	0.24	0.32	0.33	0.65	0.31
C2'	0.10	1.17	0.08	0.11	0.40	0.17	0.19	0.25	0.49	0.50	0.96	1.62	0.91	0.36	0.09	0.10	0.33	0.16	0.22	0.38	0.27	0.63	0.27
C3'	0.10	1.20	0.08	0.12	0.42	0.16	0.20	0.23	0.50	0.49	0.97	1.67	0.95	0.35	0.09	0.10	0.35	0.18	0.20	0.39	0.23	0.60	0.25
C4	0.10	0.65	0.09	0.11	0.26	0.17	0.13	0.27	0.29	0.33	0.53	0.83	0.55	0.22	0.09	0.10	0.23	0.14	0.25	0.23	0.35	0.64	0.33
C4'	0.10	1.06	0.08	0.13	0.36	0.15	0.17	0.22	0.43	0.46	0.85	1.47	0.84	0.32	0.09	0.09	0.35	0.16	0.19	0.33	0.12	0.52	0.18
C5	0.11	0.61	0.09	0.11	0.22	0.18	0.09	0.27	0.23	0.36	0.48	0.81	0.52	0.24	0.10	0.11	0.26	0.15	0.23	0.17	0.22	0.57	0.26
C5'	0.08	1.01	0.07	0.13	0.37	0.15	0.19	0.21	0.43	0.40	0.81	1.40	0.82	0.27	0.07	0.07	0.34	0.17	0.16	0.34	0.12	0.48	0.15
C6	0.12	0.75	0.10	0.12	0.25	0.17	0.10	0.26	0.28	0.42	0.58	1.01	0.62	0.30	0.11	0.12	0.29	0.15	0.22	0.20	0.17	0.56	0.23
N1	0.11	0.89	0.10	0.12	0.30	0.17	0.14	0.27	0.36	0.45	0.72	1.21	0.72	0.32	0.11	0.11	0.29	0.15	0.23	0.28	0.23	0.60	0.26
N3	0.11	0.81	0.10	0.11	0.31	0.17	0.18	0.28	0.38	0.37	0.68	1.05	0.66	0.25	0.10	0.11	0.23	0.15	0.25	0.30	0.39	0.67	0.34
N4	0.10	0.45	0.10	0.11	0.21	0.16	0.13	0.26	0.24	0.21	0.38	0.54	0.39	0.13	0.08	0.10	0.18	0.13	0.27	0.20	0.44	0.66	0.38
O2	0.11	0.99	0.10	0.11	0.35	0.18	0.19	0.29	0.45	0.44	0.84	1.34	0.77	0.32	0.11	0.11	0.26	0.16	0.24	0.36	0.37	0.67	0.33
O2'	0.10	1.19	0.09	0.12	0.40	0.17	0.20	0.26	0.51	0.51	0.99	1.67	0.92	0.37	0.10	0.10	0.34	0.16	0.23	0.41	0.25	0.63	0.27
O3'	0.10	1.30	0.09	0.12	0.45	0.17	0.23	0.23	0.55	0.51	1.07	1.82	1.02	0.36	0.09	0.11	0.35	0.18	0.20	0.43	0.27	0.61	0.27
O4'	0.12	0.91	0.10	0.14	0.30	0.15	0.13	0.23	0.36	0.45	0.73	1.28	0.73	0.33	0.11	0.10	0.34	0.15	0.21	0.27	0.10	0.50	0.18
O5'	0.09	0.97	0.07	0.15	0.37	0.14	0.19	0.18	0.42	0.38	0.78	1.33	0.80	0.24	0.07	0.08	0.39	0.17	0.17	0.33	0.12	0.47	0.16
OP1	0.11	1.00	0.08	0.12	0.43	0.11	0.28	0.12	0.49	0.27	0.82	1.34	0.83	0.16	0.13	0.11	0.35	0.17	0.12	0.42	0.18	0.41	0.12
OP2	0.12	0.85	0.07	0.14	0.40	0.10	0.27	0.11	0.43	0.22	0.69	1.10	0.74	0.14	0.14	0.08	0.41	0.18	0.12	0.37	0.18	0.42	0.14
P	0.10	0.90	0.07	0.12	0.39	0.12	0.24	0.14	0.43	0.26	0.73	1.20	0.76	0.16	0.11	0.09	0.36	0.17	0.11	0.36	0.16	0.41	0.11

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.17	0.01	0.18	0.01	0.34	0.41	0.29
C2	0.01	0.00	0.33	0.38	0.00	0.33	0.01	0.67	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.18	0.33	0.11	0.55	0.02	0.56	0.35	0.47
C2'	0.00	0.33	0.00	0.01	0.18	0.02	0.10	0.08	0.17	0.11	0.26	0.39	0.32	0.04	0.03	0.00	0.06	0.01	0.24	0.13	0.25	0.31	0.25
C3'	0.02	0.38	0.01	0.00	0.16	0.01	0.06	0.03	0.14	0.19	0.28	0.49	0.36	0.12	0.01	0.03	0.01	0.01	0.25	0.09	0.13	0.31	0.20
C4	0.01	0.00	0.18	0.16	0.00	0.14	0.00	0.29	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.12	0.22	0.05	0.18	0.01	0.42	0.25	0.23
C4'	0.01	0.33	0.02	0.01	0.14	0.00	0.06	0.01	0.13	0.17	0.25	0.43	0.31	0.11	0.02	0.02	0.03	0.00	0.02	0.08	0.13	0.22	0.03
C5	0.01	0.01	0.10	0.06	0.00	0.06	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.12	0.16	0.02	0.19	0.01	0.73	0.45	0.44
C5'	0.03	0.67	0.08	0.03	0.29	0.01	0.15	0.00	0.28	0.29	0.51	0.86	0.61	0.19	0.06	0.06	0.12	0.01	0.01	0.20	0.23	0.20	0.01
C6	0.01	0.01	0.17	0.14	0.00	0.13	0.01	0.28	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.15	0.21	0.04	0.20	0.01	0.63	0.29	0.33
C8	0.00	0.01	0.11	0.19	0.00	0.17	0.00	0.29	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.04	0.08	0.58	0.01	1.16	0.87	0.88
N1	0.01	0.00	0.26	0.28	0.01	0.25	0.01	0.51	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.17	0.28	0.08	0.40	0.01	0.49	0.22	0.32
N2	0.02	0.01	0.39	0.49	0.01	0.43	0.01	0.86	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.19	0.39	0.13	0.76	0.02	0.87	0.65	0.75
N3	0.01	0.00	0.32	0.36	0.00	0.31	0.00	0.61	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.16	0.32	0.11	0.47	0.01	0.42	0.22	0.36
N7	0.01	0.01	0.04	0.12	0.00	0.11	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.09	0.07	0.05	0.47	0.01	1.18	0.81	0.83
N9	0.00	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.14	0.02	0.25	0.01	0.62	0.51	0.45
O2'	0.01	0.18	0.00	0.03	0.12	0.02	0.12	0.06	0.15	0.06	0.17	0.19	0.16	0.09	0.07	0.00	0.10	0.02	0.24	0.14	0.24	0.32	0.25
O3'	0.17	0.33	0.06	0.01	0.22	0.03	0.16	0.12	0.21	0.04	0.28	0.39	0.32	0.07	0.14	0.10	0.00	0.11	0.23	0.17	0.18	0.29	0.17
O4'	0.01	0.11	0.01	0.01	0.05	0.00	0.02	0.01	0.04	0.08	0.08	0.13	0.11	0.05	0.02	0.02	0.11	0.00	0.07	0.03	0.14	0.33	0.15
O5'	0.18	0.55	0.24	0.25	0.18	0.02	0.19	0.01	0.20	0.58	0.40	0.76	0.47	0.47	0.25	0.24	0.23	0.07	0.00	0.19	0.02	0.02	0.00
O6	0.01	0.02	0.13	0.09	0.01	0.08	0.01	0.20	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.14	0.17	0.03	0.19	0.00	0.77	0.38	0.43
OP1	0.34	0.56	0.25	0.13	0.42	0.13	0.73	0.23	0.63	1.16	0.49	0.87	0.42	1.18	0.62	0.24	0.18	0.14	0.02	0.77	0.00	0.02	0.01
OP2	0.41	0.35	0.31	0.31	0.25	0.22	0.45	0.20	0.29	0.87	0.22	0.65	0.22	0.81	0.51	0.32	0.29	0.33	0.02	0.38	0.02	0.00	0.01
P	0.29	0.47	0.25	0.20	0.23	0.03	0.44	0.01	0.33	0.88	0.32	0.75	0.36	0.83	0.45	0.25	0.17	0.15	0.00	0.43	0.01	0.01	0.00