Doublet Group distance statistics: 48217

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 3, 1, 2, 5, 1, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.003, 0.006, 0.009, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.006 std_dev=0.003
C6	A	0, 0.005, 0.010, 0.014, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.010 std_dev=0.004
N1	A	0, 0.004, 0.008, 0.012, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.008 std_dev=0.004
C4	A	0, 0.005, 0.009, 0.014, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.009 std_dev=0.005
N3	A	0, 0.004, 0.011, 0.017, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.011 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.008, 0.016, 0.024, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.016 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.008, 0.017, 0.026, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.017 std_dev=0.009
N4	A	0, 0.013, 0.030, 0.047, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.030 std_dev=0.017
O2	A	0, 0.016, 0.035, 0.054, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.035 std_dev=0.019
O4'	A	0, 0.028, 0.140, 0.251, 0.321 max_d=0.321 avg_d=0.140 std_dev=0.111
C2'	A	0, 0.013, 0.141, 0.268, 0.361 max_d=0.361 avg_d=0.141 std_dev=0.127
O2'	A	0, 0.059, 0.199, 0.339, 0.429 max_d=0.429 avg_d=0.199 std_dev=0.140
C4'	A	0, 0.056, 0.225, 0.393, 0.493 max_d=0.493 avg_d=0.225 std_dev=0.168
C3'	A	0, 0.043, 0.234, 0.424, 0.545 max_d=0.545 avg_d=0.234 std_dev=0.190
C2'	B	0, 0.207, 0.405, 0.603, 0.687 max_d=0.687 avg_d=0.405 std_dev=0.198
O2'	B	0, 0.183, 0.392, 0.600, 0.727 max_d=0.727 avg_d=0.392 std_dev=0.208
O5'	A	0, 0.192, 0.418, 0.644, 0.755 max_d=0.755 avg_d=0.418 std_dev=0.226
C3'	B	0, 0.289, 0.521, 0.752, 0.902 max_d=0.902 avg_d=0.521 std_dev=0.231
C4	B	0, 0.312, 0.568, 0.824, 1.053 max_d=1.053 avg_d=0.568 std_dev=0.256
C1'	B	0, 0.298, 0.554, 0.811, 0.988 max_d=0.988 avg_d=0.554 std_dev=0.256
C5	B	0, 0.343, 0.603, 0.862, 1.132 max_d=1.132 avg_d=0.603 std_dev=0.259
N9	B	0, 0.312, 0.574, 0.836, 1.060 max_d=1.060 avg_d=0.574 std_dev=0.262
O3'	A	0, 0.063, 0.326, 0.589, 0.771 max_d=0.771 avg_d=0.326 std_dev=0.263
C6	B	0, 0.366, 0.632, 0.899, 1.137 max_d=1.137 avg_d=0.632 std_dev=0.266
N3	B	0, 0.295, 0.563, 0.832, 1.014 max_d=1.014 avg_d=0.563 std_dev=0.268
O3'	B	0, 0.293, 0.565, 0.838, 1.037 max_d=1.037 avg_d=0.565 std_dev=0.273
O6	B	0, 0.399, 0.678, 0.956, 1.186 max_d=1.186 avg_d=0.678 std_dev=0.279
N1	B	0, 0.342, 0.627, 0.911, 1.072 max_d=1.072 avg_d=0.627 std_dev=0.285
C8	B	0, 0.340, 0.624, 0.909, 1.164 max_d=1.164 avg_d=0.624 std_dev=0.285
C2	B	0, 0.315, 0.599, 0.884, 1.025 max_d=1.025 avg_d=0.599 std_dev=0.285
N7	B	0, 0.348, 0.633, 0.919, 1.221 max_d=1.221 avg_d=0.633 std_dev=0.285
C5'	A	0, 0.101, 0.390, 0.680, 0.856 max_d=0.856 avg_d=0.390 std_dev=0.290
N2	B	0, 0.319, 0.635, 0.951, 1.236 max_d=1.236 avg_d=0.635 std_dev=0.316
C4'	B	0, 0.317, 0.662, 1.007, 1.353 max_d=1.353 avg_d=0.662 std_dev=0.345
O4'	B	0, 0.302, 0.674, 1.046, 1.392 max_d=1.392 avg_d=0.674 std_dev=0.372
P	A	0, 0.239, 0.653, 1.067, 1.380 max_d=1.380 avg_d=0.653 std_dev=0.414
OP1	B	0, 0.442, 0.881, 1.319, 1.748 max_d=1.748 avg_d=0.881 std_dev=0.439
P	B	0, 0.344, 0.796, 1.248, 1.731 max_d=1.731 avg_d=0.796 std_dev=0.452
OP2	B	0, 0.329, 0.785, 1.242, 1.716 max_d=1.716 avg_d=0.785 std_dev=0.457
O5'	B	0, 0.304, 0.771, 1.238, 1.738 max_d=1.738 avg_d=0.771 std_dev=0.467
OP1	A	0, 0.378, 0.851, 1.324, 1.656 max_d=1.656 avg_d=0.851 std_dev=0.473
C5'	B	0, 0.349, 0.849, 1.349, 1.874 max_d=1.874 avg_d=0.849 std_dev=0.500
OP2	A	0, 0.246, 0.793, 1.341, 1.815 max_d=1.815 avg_d=0.793 std_dev=0.547

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.11	0.13	0.10	0.07
C2	0.01	0.00	0.07	0.07	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.08	0.08	0.02	0.19	0.19	0.18	0.14
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.02	0.01	0.04	0.02	0.06	0.01	0.05	0.02	0.12	0.00	0.01	0.01	0.05	0.17	0.09	0.06
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.04	0.00	0.05	0.02	0.06	0.02	0.06	0.05	0.11	0.03	0.00	0.00	0.05	0.18	0.07	0.06
C4	0.01	0.00	0.02	0.04	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.04	0.02	0.21	0.20	0.23	0.19
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.03	0.05	0.04	0.06	0.01	0.00	0.01	0.14	0.04	0.02
C5	0.01	0.00	0.04	0.05	0.00	0.04	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.07	0.03	0.20	0.18	0.22	0.17
C5'	0.02	0.06	0.02	0.02	0.09	0.01	0.09	0.00	0.08	0.05	0.07	0.10	0.05	0.06	0.01	0.01	0.01	0.13	0.03	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.06	0.01	0.04	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.07	0.03	0.18	0.15	0.17	0.14
N1	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.17	0.15	0.15	0.12
N3	0.01	0.00	0.05	0.06	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.08	0.07	0.02	0.21	0.20	0.22	0.17
N4	0.01	0.01	0.02	0.05	0.00	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.05	0.02	0.22	0.22	0.26	0.21
O2	0.02	0.00	0.12	0.11	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.14	0.14	0.03	0.18	0.20	0.17	0.13
O2'	0.01	0.08	0.00	0.03	0.05	0.06	0.04	0.06	0.04	0.03	0.08	0.06	0.14	0.00	0.03	0.05	0.05	0.16	0.08	0.06
O3'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.07	0.02	0.07	0.05	0.14	0.03	0.00	0.01	0.12	0.23	0.10	0.10
O4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.05	0.01	0.00	0.10	0.12	0.09	0.07
O5'	0.11	0.19	0.05	0.05	0.21	0.01	0.20	0.01	0.18	0.17	0.21	0.22	0.18	0.05	0.12	0.10	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.13	0.19	0.17	0.18	0.20	0.14	0.18	0.13	0.15	0.15	0.20	0.22	0.20	0.16	0.23	0.12	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.10	0.18	0.09	0.07	0.23	0.04	0.22	0.03	0.17	0.15	0.22	0.26	0.17	0.08	0.10	0.09	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.07	0.14	0.06	0.06	0.19	0.02	0.17	0.01	0.14	0.12	0.17	0.21	0.13	0.06	0.10	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.10	0.21	0.11	0.08	0.13	0.13	0.13	0.17	0.17	0.10	0.20	0.26	0.17	0.11	0.10	0.14	0.10	0.16	0.15	0.17	0.19	0.13	0.16
C2	0.15	0.20	0.10	0.11	0.14	0.21	0.14	0.25	0.17	0.14	0.20	0.26	0.16	0.13	0.13	0.11	0.11	0.26	0.22	0.17	0.25	0.19	0.22
C2'	0.13	0.22	0.12	0.12	0.14	0.15	0.14	0.17	0.16	0.13	0.20	0.28	0.17	0.13	0.12	0.13	0.12	0.19	0.16	0.17	0.21	0.15	0.17
C3'	0.13	0.20	0.11	0.11	0.13	0.15	0.12	0.16	0.15	0.13	0.18	0.26	0.17	0.12	0.12	0.13	0.10	0.18	0.16	0.15	0.21	0.15	0.17
C4	0.16	0.22	0.11	0.13	0.13	0.24	0.13	0.28	0.17	0.14	0.21	0.28	0.18	0.12	0.13	0.14	0.13	0.28	0.24	0.17	0.28	0.20	0.24
C4'	0.10	0.19	0.12	0.08	0.12	0.09	0.12	0.12	0.14	0.09	0.18	0.24	0.16	0.10	0.10	0.16	0.09	0.12	0.11	0.14	0.17	0.11	0.13
C5	0.10	0.23	0.12	0.10	0.14	0.17	0.14	0.21	0.17	0.10	0.22	0.28	0.20	0.11	0.10	0.18	0.11	0.19	0.18	0.17	0.23	0.15	0.19
C5'	0.09	0.17	0.12	0.08	0.11	0.07	0.11	0.09	0.12	0.09	0.15	0.20	0.15	0.09	0.09	0.17	0.09	0.09	0.09	0.12	0.15	0.10	0.11
C6	0.10	0.22	0.12	0.09	0.14	0.13	0.14	0.17	0.17	0.10	0.21	0.27	0.19	0.11	0.10	0.18	0.11	0.15	0.15	0.17	0.20	0.13	0.16
N1	0.11	0.21	0.10	0.09	0.13	0.16	0.13	0.20	0.16	0.10	0.20	0.26	0.17	0.11	0.11	0.14	0.10	0.19	0.17	0.17	0.22	0.15	0.18
N3	0.19	0.21	0.11	0.13	0.15	0.25	0.15	0.29	0.17	0.16	0.20	0.27	0.17	0.15	0.16	0.12	0.13	0.30	0.26	0.18	0.28	0.22	0.25
N4	0.22	0.23	0.13	0.17	0.15	0.30	0.14	0.33	0.17	0.17	0.21	0.30	0.18	0.15	0.17	0.16	0.16	0.35	0.29	0.17	0.32	0.24	0.28
O2	0.17	0.20	0.10	0.11	0.15	0.21	0.16	0.26	0.18	0.16	0.20	0.25	0.17	0.15	0.15	0.11	0.11	0.27	0.23	0.18	0.26	0.20	0.23
O2'	0.12	0.25	0.12	0.11	0.15	0.15	0.15	0.17	0.19	0.13	0.24	0.31	0.20	0.13	0.12	0.14	0.13	0.18	0.16	0.20	0.21	0.14	0.17
O3'	0.15	0.20	0.14	0.14	0.13	0.16	0.13	0.17	0.14	0.16	0.18	0.26	0.17	0.14	0.14	0.15	0.13	0.19	0.17	0.14	0.23	0.17	0.19
O4'	0.10	0.20	0.14	0.08	0.14	0.08	0.14	0.13	0.17	0.10	0.20	0.24	0.18	0.11	0.11	0.19	0.10	0.11	0.11	0.17	0.16	0.10	0.12
O5'	0.17	0.28	0.19	0.13	0.22	0.10	0.20	0.08	0.23	0.16	0.26	0.32	0.26	0.17	0.18	0.22	0.14	0.13	0.09	0.22	0.10	0.09	0.08
OP1	0.12	0.17	0.10	0.09	0.13	0.13	0.11	0.18	0.12	0.11	0.15	0.21	0.16	0.11	0.12	0.12	0.10	0.14	0.20	0.12	0.28	0.23	0.23
OP2	0.11	0.13	0.10	0.07	0.10	0.14	0.10	0.17	0.10	0.12	0.12	0.16	0.13	0.11	0.11	0.12	0.10	0.17	0.17	0.09	0.24	0.18	0.21
P	0.13	0.19	0.15	0.10	0.15	0.09	0.14	0.10	0.15	0.12	0.18	0.23	0.18	0.12	0.13	0.18	0.13	0.11	0.12	0.14	0.16	0.13	0.13

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.03	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.02	0.06	0.07	0.04
C2	0.03	0.00	0.16	0.10	0.01	0.04	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.22	0.15	0.11	0.18	0.01	0.16	0.19	0.15
C2'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.09	0.01	0.05	0.02	0.08	0.08	0.13	0.20	0.16	0.05	0.02	0.00	0.01	0.00	0.05	0.07	0.13	0.08	0.05
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.05	0.00	0.05	0.02	0.06	0.08	0.08	0.12	0.09	0.07	0.03	0.02	0.01	0.01	0.05	0.06	0.16	0.08	0.08
C4	0.02	0.01	0.09	0.05	0.00	0.03	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.11	0.07	0.05	0.15	0.01	0.13	0.15	0.11
C4'	0.00	0.04	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.06	0.04	0.05	0.04	0.05	0.02	0.03	0.02	0.00	0.01	0.04	0.05	0.03	0.01
C5	0.02	0.00	0.05	0.05	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.06	0.02	0.17	0.01	0.16	0.19	0.14
C5'	0.02	0.13	0.02	0.02	0.09	0.01	0.10	0.00	0.12	0.10	0.13	0.14	0.11	0.10	0.06	0.03	0.02	0.01	0.01	0.12	0.03	0.01	0.01
C6	0.02	0.01	0.08	0.06	0.01	0.04	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.08	0.04	0.19	0.00	0.18	0.22	0.17
C8	0.01	0.01	0.08	0.08	0.00	0.06	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.11	0.08	0.15	0.01	0.15	0.16	0.14
N1	0.03	0.01	0.13	0.08	0.01	0.04	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.18	0.12	0.08	0.19	0.01	0.17	0.22	0.16
N2	0.03	0.00	0.20	0.12	0.01	0.05	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.26	0.19	0.13	0.19	0.02	0.16	0.20	0.16
N3	0.03	0.00	0.16	0.09	0.00	0.04	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.20	0.14	0.10	0.16	0.01	0.13	0.16	0.12
N7	0.01	0.01	0.05	0.07	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.09	0.05	0.17	0.01	0.18	0.20	0.16
N9	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.03	0.01	0.12	0.01	0.11	0.12	0.08
O2'	0.01	0.22	0.00	0.02	0.11	0.03	0.07	0.03	0.12	0.06	0.18	0.26	0.20	0.04	0.02	0.00	0.02	0.03	0.04	0.10	0.13	0.06	0.05
O3'	0.01	0.15	0.01	0.01	0.07	0.02	0.06	0.02	0.08	0.11	0.12	0.19	0.14	0.09	0.03	0.02	0.00	0.01	0.07	0.08	0.21	0.12	0.11
O4'	0.00	0.11	0.00	0.01	0.05	0.00	0.02	0.01	0.04	0.08	0.08	0.13	0.10	0.05	0.01	0.03	0.01	0.00	0.06	0.03	0.05	0.08	0.07
O5'	0.07	0.18	0.05	0.05	0.15	0.01	0.17	0.01	0.19	0.15	0.19	0.19	0.16	0.17	0.12	0.04	0.07	0.06	0.00	0.19	0.01	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.07	0.06	0.01	0.04	0.01	0.12	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.10	0.08	0.03	0.19	0.00	0.20	0.24	0.18
OP1	0.06	0.16	0.13	0.16	0.13	0.05	0.16	0.03	0.18	0.15	0.17	0.16	0.13	0.18	0.11	0.13	0.21	0.05	0.01	0.20	0.00	0.02	0.01
OP2	0.07	0.19	0.08	0.08	0.15	0.03	0.19	0.01	0.22	0.16	0.22	0.20	0.16	0.20	0.12	0.06	0.12	0.08	0.02	0.24	0.02	0.00	0.00
P	0.04	0.15	0.05	0.08	0.11	0.01	0.14	0.01	0.17	0.14	0.16	0.16	0.12	0.16	0.08	0.05	0.11	0.07	0.01	0.18	0.01	0.00	0.00