Doublet Group distance statistics: 48218

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 0, 4, 2, 1, 1, 0, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.003, 0.007, 0.011, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.007 std_dev=0.004
N3	A	0, 0.005, 0.010, 0.016, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.010 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.005, 0.018, 0.031, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.018 std_dev=0.013
C6	A	0, 0.011, 0.025, 0.040, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.025 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.011, 0.026, 0.041, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.026 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.011, 0.026, 0.041, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.026 std_dev=0.015
C2	A	0, 0.012, 0.027, 0.043, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.027 std_dev=0.015
O2	A	0, 0.031, 0.070, 0.108, 0.175 max_d=0.175 avg_d=0.070 std_dev=0.038
N4	A	0, 0.035, 0.081, 0.128, 0.222 max_d=0.222 avg_d=0.081 std_dev=0.046
O2'	A	0, 0.046, 0.152, 0.258, 0.406 max_d=0.406 avg_d=0.152 std_dev=0.106
C2'	A	0, 0.031, 0.138, 0.245, 0.462 max_d=0.462 avg_d=0.138 std_dev=0.107
O4'	A	0, 0.028, 0.136, 0.245, 0.486 max_d=0.486 avg_d=0.136 std_dev=0.109
C4'	A	0, 0.053, 0.252, 0.452, 0.808 max_d=0.808 avg_d=0.252 std_dev=0.199
C3'	A	0, 0.076, 0.280, 0.484, 0.823 max_d=0.823 avg_d=0.280 std_dev=0.204
C2'	B	0, 0.222, 0.504, 0.787, 0.938 max_d=0.938 avg_d=0.504 std_dev=0.283
O2'	B	0, 0.184, 0.473, 0.762, 0.935 max_d=0.935 avg_d=0.473 std_dev=0.289
C5'	A	0, 0.038, 0.336, 0.633, 1.204 max_d=1.204 avg_d=0.336 std_dev=0.297
N2	B	0, 0.316, 0.619, 0.922, 1.102 max_d=1.102 avg_d=0.619 std_dev=0.303
C2	B	0, 0.279, 0.587, 0.895, 1.012 max_d=1.012 avg_d=0.587 std_dev=0.308
N3	B	0, 0.277, 0.588, 0.900, 1.015 max_d=1.015 avg_d=0.588 std_dev=0.311
P	A	0, 0.216, 0.527, 0.839, 1.250 max_d=1.250 avg_d=0.527 std_dev=0.312
O3'	A	0, 0.166, 0.484, 0.801, 1.214 max_d=1.214 avg_d=0.484 std_dev=0.317
OP1	A	0, 0.509, 0.826, 1.143, 1.171 max_d=1.171 avg_d=0.826 std_dev=0.317
C4	B	0, 0.261, 0.586, 0.912, 1.092 max_d=1.092 avg_d=0.586 std_dev=0.326
N1	B	0, 0.271, 0.598, 0.926, 1.097 max_d=1.097 avg_d=0.598 std_dev=0.328
C1'	B	0, 0.282, 0.613, 0.943, 1.055 max_d=1.055 avg_d=0.613 std_dev=0.331
C3'	B	0, 0.279, 0.611, 0.942, 1.033 max_d=1.033 avg_d=0.611 std_dev=0.331
N9	B	0, 0.273, 0.605, 0.936, 1.109 max_d=1.109 avg_d=0.605 std_dev=0.331
C5	B	0, 0.255, 0.596, 0.936, 1.160 max_d=1.160 avg_d=0.596 std_dev=0.341
C8	B	0, 0.293, 0.638, 0.982, 1.205 max_d=1.205 avg_d=0.638 std_dev=0.344
O5'	A	0, 0.172, 0.518, 0.864, 1.568 max_d=1.568 avg_d=0.518 std_dev=0.346
C6	B	0, 0.266, 0.614, 0.961, 1.184 max_d=1.184 avg_d=0.614 std_dev=0.348
N7	B	0, 0.272, 0.630, 0.988, 1.228 max_d=1.228 avg_d=0.630 std_dev=0.358
O3'	B	0, 0.284, 0.643, 1.002, 1.219 max_d=1.219 avg_d=0.643 std_dev=0.359
O6	B	0, 0.293, 0.680, 1.067, 1.330 max_d=1.330 avg_d=0.680 std_dev=0.387
C4'	B	0, 0.333, 0.743, 1.152, 1.290 max_d=1.290 avg_d=0.743 std_dev=0.409
O4'	B	0, 0.336, 0.751, 1.165, 1.251 max_d=1.251 avg_d=0.751 std_dev=0.415
OP2	B	0, 0.325, 0.741, 1.156, 1.539 max_d=1.539 avg_d=0.741 std_dev=0.416
P	B	0, 0.405, 0.847, 1.289, 1.462 max_d=1.462 avg_d=0.847 std_dev=0.442
OP1	B	0, 0.456, 0.944, 1.432, 1.599 max_d=1.599 avg_d=0.944 std_dev=0.488
O5'	B	0, 0.357, 0.852, 1.346, 1.729 max_d=1.729 avg_d=0.852 std_dev=0.494
C5'	B	0, 0.388, 0.931, 1.474, 1.823 max_d=1.823 avg_d=0.931 std_dev=0.543
OP2	A	0, 0.916, 1.460, 2.003, 1.925 max_d=1.925 avg_d=1.460 std_dev=0.544

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.02	0.00	0.10	0.28	0.19	0.12
C2	0.02	0.00	0.07	0.10	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.09	0.02	0.16	0.27	0.27	0.13
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.04	0.02	0.03	0.01	0.03	0.02	0.06	0.05	0.12	0.01	0.02	0.01	0.06	0.24	0.14	0.07
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.09	0.01	0.08	0.02	0.06	0.05	0.10	0.10	0.13	0.02	0.01	0.01	0.04	0.19	0.11	0.04
C4	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.10	0.02	0.19	0.22	0.37	0.12
C4'	0.01	0.05	0.02	0.01	0.05	0.00	0.06	0.01	0.05	0.03	0.05	0.05	0.08	0.06	0.03	0.00	0.01	0.20	0.08	0.05
C5	0.01	0.01	0.03	0.08	0.00	0.06	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.08	0.02	0.19	0.20	0.39	0.12
C5'	0.01	0.07	0.01	0.02	0.11	0.01	0.12	0.00	0.11	0.07	0.09	0.12	0.08	0.06	0.04	0.02	0.01	0.13	0.09	0.01
C6	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.05	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.06	0.02	0.18	0.23	0.34	0.12
N1	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.04	0.02	0.16	0.26	0.27	0.13
N3	0.02	0.00	0.06	0.10	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.11	0.02	0.18	0.25	0.32	0.12
N4	0.01	0.01	0.05	0.10	0.00	0.05	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.11	0.02	0.19	0.20	0.39	0.12
O2	0.04	0.01	0.12	0.13	0.01	0.08	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.11	0.14	0.04	0.15	0.30	0.23	0.15
O2'	0.01	0.07	0.01	0.02	0.06	0.06	0.04	0.06	0.03	0.03	0.07	0.06	0.11	0.00	0.04	0.04	0.06	0.30	0.08	0.11
O3'	0.02	0.09	0.02	0.01	0.10	0.03	0.08	0.04	0.06	0.04	0.11	0.11	0.14	0.04	0.00	0.02	0.06	0.21	0.10	0.05
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.04	0.04	0.02	0.00	0.11	0.26	0.20	0.12
O5'	0.10	0.16	0.06	0.04	0.19	0.01	0.19	0.01	0.18	0.16	0.18	0.19	0.15	0.06	0.06	0.11	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.28	0.27	0.24	0.19	0.22	0.20	0.20	0.13	0.23	0.26	0.25	0.20	0.30	0.30	0.21	0.26	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.19	0.27	0.14	0.11	0.37	0.08	0.39	0.09	0.34	0.27	0.32	0.39	0.23	0.08	0.10	0.20	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.13	0.07	0.04	0.12	0.05	0.12	0.01	0.12	0.13	0.12	0.12	0.15	0.11	0.05	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.18	0.18	0.13	0.14	0.20	0.14	0.24	0.14	0.27	0.23	0.24	0.15	0.16	0.26	0.20	0.18	0.20	0.18	0.12	0.31	0.14	0.10	0.11
C2	0.16	0.16	0.09	0.11	0.17	0.13	0.19	0.13	0.21	0.19	0.20	0.16	0.14	0.21	0.18	0.14	0.16	0.17	0.10	0.24	0.17	0.10	0.10
C2'	0.20	0.23	0.12	0.13	0.23	0.14	0.27	0.14	0.30	0.24	0.28	0.20	0.20	0.27	0.22	0.17	0.18	0.21	0.11	0.34	0.16	0.08	0.09
C3'	0.15	0.20	0.12	0.13	0.20	0.12	0.26	0.10	0.30	0.22	0.27	0.16	0.16	0.26	0.19	0.17	0.19	0.16	0.07	0.35	0.13	0.07	0.06
C4	0.16	0.15	0.09	0.10	0.16	0.12	0.18	0.12	0.18	0.19	0.17	0.18	0.14	0.20	0.18	0.14	0.15	0.16	0.10	0.20	0.19	0.10	0.10
C4'	0.16	0.18	0.16	0.17	0.19	0.14	0.26	0.13	0.31	0.23	0.27	0.14	0.14	0.28	0.19	0.20	0.22	0.16	0.10	0.37	0.13	0.11	0.10
C5	0.16	0.14	0.11	0.13	0.16	0.14	0.19	0.13	0.20	0.20	0.17	0.16	0.12	0.22	0.18	0.19	0.19	0.16	0.11	0.22	0.16	0.10	0.10
C5'	0.20	0.21	0.22	0.23	0.23	0.20	0.31	0.20	0.36	0.28	0.30	0.18	0.18	0.33	0.23	0.25	0.28	0.19	0.16	0.43	0.18	0.17	0.17
C6	0.17	0.14	0.14	0.15	0.17	0.15	0.21	0.14	0.23	0.21	0.19	0.13	0.13	0.23	0.18	0.20	0.21	0.17	0.12	0.26	0.14	0.10	0.11
N1	0.17	0.16	0.12	0.14	0.18	0.14	0.21	0.13	0.23	0.21	0.21	0.14	0.14	0.23	0.18	0.18	0.19	0.17	0.11	0.27	0.15	0.10	0.11
N3	0.16	0.16	0.08	0.10	0.16	0.12	0.18	0.13	0.19	0.19	0.18	0.17	0.14	0.19	0.17	0.12	0.14	0.17	0.10	0.21	0.20	0.10	0.11
N4	0.17	0.18	0.11	0.11	0.18	0.12	0.18	0.13	0.18	0.20	0.18	0.20	0.17	0.20	0.19	0.12	0.15	0.17	0.11	0.19	0.22	0.12	0.12
O2	0.17	0.17	0.09	0.10	0.17	0.13	0.19	0.13	0.22	0.19	0.21	0.17	0.14	0.20	0.18	0.13	0.15	0.18	0.10	0.25	0.18	0.10	0.10
O2'	0.22	0.23	0.14	0.14	0.23	0.17	0.26	0.16	0.29	0.25	0.27	0.20	0.21	0.27	0.23	0.19	0.19	0.24	0.13	0.33	0.17	0.09	0.11
O3'	0.13	0.20	0.13	0.14	0.19	0.11	0.25	0.10	0.30	0.21	0.28	0.17	0.15	0.25	0.17	0.17	0.19	0.14	0.06	0.36	0.12	0.09	0.06
O4'	0.18	0.17	0.15	0.16	0.19	0.15	0.25	0.14	0.28	0.23	0.24	0.15	0.15	0.27	0.20	0.20	0.21	0.17	0.12	0.33	0.14	0.12	0.11
O5'	0.32	0.35	0.35	0.36	0.33	0.34	0.37	0.33	0.41	0.34	0.38	0.37	0.33	0.38	0.32	0.38	0.39	0.32	0.30	0.46	0.20	0.26	0.28
OP1	0.15	0.18	0.23	0.27	0.11	0.23	0.13	0.24	0.16	0.14	0.12	0.28	0.18	0.18	0.11	0.27	0.35	0.16	0.20	0.26	0.24	0.25	0.22
OP2	0.50	0.45	0.51	0.50	0.48	0.50	0.49	0.49	0.49	0.50	0.46	0.43	0.47	0.51	0.49	0.52	0.51	0.49	0.49	0.52	0.48	0.50	0.49
P	0.16	0.17	0.21	0.23	0.15	0.19	0.20	0.19	0.23	0.19	0.17	0.25	0.17	0.23	0.15	0.25	0.28	0.16	0.16	0.32	0.13	0.18	0.16

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.05	0.04	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.09	0.02	0.11	0.14	0.10
C2	0.04	0.00	0.14	0.12	0.01	0.05	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.17	0.15	0.05	0.14	0.01	0.16	0.22	0.16
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.06	0.01	0.04	0.02	0.06	0.09	0.09	0.17	0.14	0.08	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.05	0.16	0.07	0.04
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.06	0.00	0.05	0.02	0.05	0.12	0.08	0.16	0.12	0.11	0.04	0.02	0.01	0.01	0.06	0.06	0.19	0.10	0.07
C4	0.02	0.01	0.06	0.06	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.06	0.03	0.15	0.02	0.16	0.21	0.16
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.05	0.09	0.03	0.07	0.05	0.09	0.04	0.05	0.02	0.00	0.01	0.07	0.13	0.04	0.02
C5	0.02	0.01	0.04	0.05	0.01	0.05	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.04	0.04	0.20	0.01	0.21	0.24	0.21
C5'	0.02	0.04	0.02	0.02	0.06	0.01	0.11	0.00	0.11	0.14	0.07	0.05	0.03	0.15	0.07	0.05	0.04	0.02	0.01	0.15	0.12	0.03	0.01
C6	0.02	0.01	0.06	0.05	0.01	0.05	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.10	0.05	0.04	0.21	0.00	0.23	0.27	0.23
C8	0.02	0.01	0.09	0.12	0.00	0.09	0.01	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.13	0.06	0.21	0.03	0.19	0.20	0.18
N1	0.03	0.00	0.09	0.08	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.14	0.10	0.04	0.18	0.01	0.20	0.26	0.20
N2	0.05	0.01	0.17	0.16	0.01	0.07	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.22	0.21	0.06	0.12	0.02	0.14	0.22	0.15
N3	0.04	0.00	0.14	0.12	0.00	0.05	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.16	0.15	0.05	0.12	0.02	0.13	0.20	0.14
N7	0.02	0.01	0.08	0.11	0.01	0.09	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.11	0.06	0.23	0.03	0.23	0.25	0.23
N9	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.04	0.02	0.14	0.02	0.14	0.18	0.14
O2'	0.02	0.17	0.00	0.02	0.08	0.05	0.07	0.05	0.10	0.07	0.14	0.22	0.16	0.07	0.03	0.00	0.04	0.04	0.04	0.09	0.17	0.07	0.05
O3'	0.02	0.15	0.02	0.01	0.06	0.02	0.04	0.04	0.05	0.13	0.10	0.21	0.15	0.11	0.04	0.04	0.00	0.01	0.11	0.05	0.25	0.15	0.12
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.02	0.04	0.06	0.04	0.06	0.05	0.06	0.02	0.04	0.01	0.00	0.12	0.06	0.11	0.17	0.13
O5'	0.09	0.14	0.03	0.06	0.15	0.01	0.20	0.01	0.21	0.21	0.18	0.12	0.12	0.23	0.14	0.04	0.11	0.12	0.00	0.25	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.05	0.06	0.02	0.07	0.01	0.15	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.09	0.05	0.06	0.25	0.00	0.27	0.32	0.28
OP1	0.11	0.16	0.16	0.19	0.16	0.13	0.21	0.12	0.23	0.19	0.20	0.14	0.13	0.23	0.14	0.17	0.25	0.11	0.02	0.27	0.00	0.01	0.00
OP2	0.14	0.22	0.07	0.10	0.21	0.04	0.24	0.03	0.27	0.20	0.26	0.22	0.20	0.25	0.18	0.07	0.15	0.17	0.02	0.32	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.16	0.04	0.07	0.16	0.02	0.21	0.01	0.23	0.18	0.20	0.15	0.14	0.23	0.14	0.05	0.12	0.13	0.01	0.28	0.00	0.01	0.00