Doublet Group distance statistics: 48242

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.001, 0.006, 0.011, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.006 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.004, 0.009, 0.015, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.009 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.006, 0.012, 0.018, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.012 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.004, 0.011, 0.018, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.011 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.007, 0.014, 0.021, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.014 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.005, 0.013, 0.020, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.013 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.009, 0.020, 0.031, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.020 std_dev=0.011
N4	A	0, 0.013, 0.029, 0.045, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.029 std_dev=0.016
O2	A	0, 0.014, 0.037, 0.059, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.037 std_dev=0.022
O4'	A	0, 0.052, 0.145, 0.237, 0.251 max_d=0.251 avg_d=0.145 std_dev=0.092
C2'	A	0, 0.084, 0.178, 0.271, 0.253 max_d=0.253 avg_d=0.178 std_dev=0.094
C4'	A	0, 0.070, 0.190, 0.310, 0.327 max_d=0.327 avg_d=0.190 std_dev=0.120
O2'	A	0, 0.118, 0.248, 0.377, 0.344 max_d=0.344 avg_d=0.248 std_dev=0.129
C3'	A	0, 0.119, 0.261, 0.403, 0.399 max_d=0.399 avg_d=0.261 std_dev=0.142
O3'	A	0, 0.166, 0.354, 0.541, 0.529 max_d=0.529 avg_d=0.354 std_dev=0.187
C4'	B	0, 0.172, 0.369, 0.566, 0.596 max_d=0.596 avg_d=0.369 std_dev=0.197
C5'	A	0, 0.154, 0.373, 0.593, 0.610 max_d=0.610 avg_d=0.373 std_dev=0.220
C5'	B	0, 0.234, 0.515, 0.796, 0.837 max_d=0.837 avg_d=0.515 std_dev=0.281
O2'	B	0, 0.230, 0.515, 0.800, 0.877 max_d=0.877 avg_d=0.515 std_dev=0.285
C3'	B	0, 0.297, 0.600, 0.902, 0.814 max_d=0.814 avg_d=0.600 std_dev=0.303
C2'	B	0, 0.023, 0.379, 0.735, 1.051 max_d=1.051 avg_d=0.379 std_dev=0.356
O5'	B	0, 0.410, 0.827, 1.243, 1.116 max_d=1.116 avg_d=0.827 std_dev=0.417
O4'	B	0, 0.149, 0.584, 1.019, 1.354 max_d=1.354 avg_d=0.584 std_dev=0.435
C1'	B	0, 0.130, 0.602, 1.073, 1.452 max_d=1.452 avg_d=0.602 std_dev=0.471
C6	B	0, 0.327, 0.800, 1.273, 1.469 max_d=1.469 avg_d=0.800 std_dev=0.473
N1	B	0, 0.281, 0.820, 1.359, 1.703 max_d=1.703 avg_d=0.820 std_dev=0.539
C5	B	0, 0.429, 0.969, 1.509, 1.610 max_d=1.610 avg_d=0.969 std_dev=0.540
OP2	A	0, 0.091, 0.639, 1.187, 1.621 max_d=1.621 avg_d=0.639 std_dev=0.548
P	A	0, 0.020, 0.602, 1.184, 1.693 max_d=1.693 avg_d=0.602 std_dev=0.582
O3'	B	0, 0.408, 0.999, 1.590, 1.536 max_d=1.536 avg_d=0.999 std_dev=0.591
OP1	A	0, -0.076, 0.546, 1.167, 1.762 max_d=1.762 avg_d=0.546 std_dev=0.622
C4	B	0, 0.536, 1.204, 1.873, 2.055 max_d=2.055 avg_d=1.204 std_dev=0.669
O5'	A	0, 0.218, 0.888, 1.557, 1.875 max_d=1.875 avg_d=0.888 std_dev=0.669
C2	B	0, 0.382, 1.089, 1.797, 2.222 max_d=2.222 avg_d=1.089 std_dev=0.708
O4	B	0, 0.619, 1.336, 2.054, 2.161 max_d=2.161 avg_d=1.336 std_dev=0.717
N3	B	0, 0.512, 1.265, 2.018, 2.363 max_d=2.363 avg_d=1.265 std_dev=0.753
P	B	0, 0.514, 1.324, 2.134, 2.048 max_d=2.048 avg_d=1.324 std_dev=0.810
O2	B	0, 0.363, 1.202, 2.041, 2.568 max_d=2.568 avg_d=1.202 std_dev=0.839
OP2	B	0, 0.501, 1.382, 2.263, 2.242 max_d=2.242 avg_d=1.382 std_dev=0.881
OP1	B	0, 0.979, 2.283, 3.588, 3.393 max_d=3.393 avg_d=2.283 std_dev=1.304

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.14	0.15	0.22	0.10
C2	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.27	0.24	0.25	0.21
C2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.18	0.19	0.17	0.12
C3'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.00	0.23	0.23	0.14	0.15
C4	0.01	0.00	0.02	0.03	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.03	0.02	0.37	0.32	0.32	0.30
C4'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.09	0.24	0.02
C5	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.04	0.03	0.39	0.33	0.32	0.32
C5'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.05	0.00	0.05	0.00	0.04	0.02	0.03	0.05	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.14	0.28	0.01
C6	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.03	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.03	0.35	0.28	0.26	0.26
N1	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.27	0.23	0.23	0.20
N3	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.32	0.28	0.29	0.26
N4	0.01	0.00	0.03	0.03	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.04	0.03	0.38	0.34	0.34	0.32
O2	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.22	0.20	0.23	0.16
O2'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.00	0.00	0.01	0.05	0.10	0.19	0.03
O3'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.02	0.04	0.03	0.04	0.01	0.03	0.04	0.02	0.00	0.00	0.01	0.19	0.21	0.13	0.12
O4'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.01	0.00	0.10	0.10	0.27	0.08
O5'	0.14	0.27	0.18	0.23	0.37	0.00	0.39	0.01	0.35	0.27	0.32	0.38	0.22	0.05	0.19	0.10	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.15	0.24	0.19	0.23	0.32	0.09	0.33	0.14	0.28	0.23	0.28	0.34	0.20	0.10	0.21	0.10	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.22	0.25	0.17	0.14	0.32	0.24	0.32	0.28	0.26	0.23	0.29	0.34	0.23	0.19	0.13	0.27	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.10	0.21	0.12	0.15	0.30	0.02	0.32	0.01	0.26	0.20	0.26	0.32	0.16	0.03	0.12	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.09	0.15	0.06	0.09	0.16	0.09	0.23	0.08	0.17	0.06	0.07	0.37	0.13	0.10	0.22	0.08	0.15	0.17	0.29	0.08
C2	0.05	0.03	0.11	0.12	0.20	0.04	0.25	0.05	0.21	0.10	0.08	0.19	0.02	0.11	0.24	0.05	0.13	0.21	0.21	0.07
C2'	0.07	0.09	0.08	0.12	0.15	0.08	0.19	0.10	0.14	0.06	0.04	0.26	0.08	0.12	0.20	0.07	0.20	0.18	0.28	0.10
C3'	0.10	0.13	0.08	0.14	0.12	0.11	0.17	0.12	0.12	0.06	0.05	0.30	0.12	0.15	0.18	0.09	0.21	0.17	0.31	0.11
C4	0.10	0.06	0.17	0.16	0.23	0.04	0.29	0.06	0.25	0.15	0.13	0.13	0.05	0.16	0.26	0.07	0.12	0.24	0.16	0.08
C4'	0.17	0.27	0.13	0.14	0.18	0.14	0.23	0.12	0.17	0.15	0.22	0.45	0.20	0.17	0.23	0.15	0.18	0.19	0.33	0.12
C5	0.06	0.05	0.08	0.11	0.21	0.07	0.28	0.07	0.24	0.10	0.07	0.29	0.11	0.09	0.24	0.06	0.12	0.19	0.22	0.05
C5'	0.27	0.40	0.20	0.19	0.29	0.20	0.28	0.16	0.23	0.26	0.38	0.55	0.27	0.22	0.32	0.24	0.18	0.23	0.37	0.16
C6	0.09	0.14	0.05	0.09	0.19	0.09	0.26	0.08	0.20	0.06	0.06	0.42	0.15	0.08	0.23	0.09	0.13	0.17	0.27	0.06
N1	0.06	0.09	0.05	0.09	0.18	0.07	0.25	0.07	0.19	0.05	0.03	0.33	0.09	0.08	0.23	0.06	0.14	0.18	0.26	0.06
N3	0.10	0.07	0.16	0.16	0.23	0.04	0.28	0.05	0.24	0.15	0.13	0.12	0.07	0.16	0.26	0.08	0.13	0.25	0.16	0.09
N4	0.15	0.12	0.23	0.21	0.25	0.06	0.30	0.06	0.27	0.19	0.17	0.06	0.15	0.22	0.26	0.12	0.11	0.28	0.11	0.11
O2	0.06	0.04	0.11	0.12	0.19	0.03	0.24	0.05	0.19	0.09	0.08	0.17	0.03	0.12	0.23	0.05	0.14	0.21	0.21	0.07
O2'	0.07	0.11	0.07	0.11	0.14	0.09	0.18	0.10	0.13	0.06	0.05	0.25	0.08	0.11	0.19	0.07	0.19	0.17	0.29	0.10
O3'	0.09	0.11	0.10	0.16	0.12	0.12	0.16	0.15	0.12	0.08	0.06	0.21	0.10	0.16	0.17	0.09	0.24	0.18	0.32	0.14
O4'	0.16	0.26	0.12	0.12	0.21	0.13	0.28	0.12	0.21	0.14	0.19	0.48	0.20	0.14	0.26	0.15	0.15	0.19	0.31	0.10
O5'	0.34	0.41	0.36	0.37	0.20	0.36	0.31	0.40	0.30	0.31	0.32	0.58	0.38	0.39	0.18	0.32	0.45	0.45	0.50	0.42
OP1	0.21	0.26	0.20	0.29	0.38	0.31	0.48	0.43	0.39	0.26	0.30	0.32	0.18	0.32	0.40	0.25	0.48	0.44	0.41	0.42
OP2	0.13	0.16	0.19	0.30	0.18	0.28	0.31	0.37	0.29	0.14	0.18	0.27	0.14	0.33	0.19	0.18	0.42	0.42	0.47	0.38
P	0.19	0.24	0.22	0.30	0.25	0.28	0.40	0.38	0.33	0.20	0.23	0.37	0.21	0.34	0.26	0.21	0.42	0.43	0.43	0.38

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.05	0.19	0.26	0.13
C2	0.02	0.00	0.03	0.03	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.02	0.01	0.05	0.14	0.20	0.20	0.14
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.09	0.03	0.01	0.09	0.00	0.01	0.05	0.00	0.06	0.10	0.29	0.06
C3'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.09	0.00	0.13	0.00	0.13	0.05	0.05	0.06	0.01	0.01	0.10	0.02	0.14	0.11	0.32	0.12
C4	0.02	0.01	0.04	0.09	0.00	0.06	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.10	0.00	0.01	0.20	0.09	0.27	0.10
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.06	0.00	0.08	0.00	0.07	0.04	0.04	0.04	0.05	0.02	0.06	0.00	0.00	0.20	0.15	0.07
C5	0.01	0.01	0.08	0.13	0.00	0.08	0.00	0.15	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.15	0.00	0.03	0.21	0.16	0.36	0.16
C5'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.13	0.00	0.15	0.00	0.13	0.08	0.10	0.06	0.04	0.04	0.14	0.00	0.00	0.13	0.05	0.01
C6	0.01	0.01	0.09	0.13	0.00	0.07	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.14	0.01	0.04	0.18	0.11	0.36	0.13
N1	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.13	0.12	0.26	0.09
N3	0.02	0.00	0.01	0.05	0.00	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.04	0.01	0.03	0.18	0.13	0.20	0.10
O2	0.04	0.00	0.09	0.06	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.13	0.08	0.01	0.08	0.13	0.30	0.17	0.20
O2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.02	0.05	0.05	0.04	0.05	0.01	0.04	0.13	0.00	0.03	0.02	0.02	0.06	0.18	0.26	0.06
O3'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.10	0.02	0.15	0.04	0.14	0.05	0.04	0.08	0.03	0.00	0.12	0.01	0.20	0.19	0.32	0.16
O4	0.02	0.01	0.05	0.10	0.00	0.06	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.12	0.00	0.01	0.21	0.11	0.27	0.11
O4'	0.00	0.05	0.00	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.03	0.08	0.02	0.01	0.01	0.00	0.09	0.25	0.26	0.19
O5'	0.05	0.14	0.06	0.14	0.20	0.00	0.21	0.00	0.18	0.13	0.18	0.13	0.06	0.20	0.21	0.09	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.19	0.20	0.10	0.11	0.09	0.20	0.16	0.13	0.11	0.12	0.13	0.30	0.18	0.19	0.11	0.25	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.26	0.20	0.29	0.32	0.27	0.15	0.36	0.05	0.36	0.26	0.20	0.17	0.26	0.32	0.27	0.26	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.13	0.14	0.06	0.12	0.10	0.07	0.16	0.01	0.13	0.09	0.10	0.20	0.06	0.16	0.11	0.19	0.00	0.01	0.00	0.00