Doublet Group distance statistics: 48243

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.003, 0.014, 0.024, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.008, 0.020, 0.031, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.020 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.005, 0.016, 0.028, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.016 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.008, 0.020, 0.032, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.020 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.008, 0.021, 0.034, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.021 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.007, 0.021, 0.035, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.021 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.008, 0.024, 0.041, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.024 std_dev=0.017
N4	A	0, 0.007, 0.027, 0.047, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.027 std_dev=0.020
O2	A	0, 0.023, 0.058, 0.094, 0.097 max_d=0.097 avg_d=0.058 std_dev=0.036
C2'	A	0, 0.036, 0.100, 0.163, 0.158 max_d=0.158 avg_d=0.100 std_dev=0.064
O4'	A	0, 0.033, 0.099, 0.165, 0.177 max_d=0.177 avg_d=0.099 std_dev=0.066
O2'	A	0, 0.053, 0.152, 0.252, 0.278 max_d=0.278 avg_d=0.152 std_dev=0.100
C3'	A	0, 0.034, 0.148, 0.262, 0.306 max_d=0.306 avg_d=0.148 std_dev=0.114
C4'	A	0, 0.045, 0.160, 0.275, 0.306 max_d=0.306 avg_d=0.160 std_dev=0.115
C5'	A	0, 0.066, 0.242, 0.418, 0.430 max_d=0.430 avg_d=0.242 std_dev=0.176
O3'	A	0, 0.042, 0.226, 0.411, 0.507 max_d=0.507 avg_d=0.226 std_dev=0.184
C1'	B	0, 0.144, 0.369, 0.593, 0.605 max_d=0.605 avg_d=0.369 std_dev=0.224
O4'	B	0, 0.156, 0.394, 0.632, 0.641 max_d=0.641 avg_d=0.394 std_dev=0.238
C2'	B	0, 0.083, 0.324, 0.565, 0.603 max_d=0.603 avg_d=0.324 std_dev=0.241
O2'	B	0, 0.132, 0.377, 0.621, 0.639 max_d=0.639 avg_d=0.377 std_dev=0.244
C4'	B	0, 0.028, 0.289, 0.549, 0.711 max_d=0.711 avg_d=0.289 std_dev=0.260
N1	B	0, 0.179, 0.472, 0.766, 0.805 max_d=0.805 avg_d=0.472 std_dev=0.294
C3'	B	0, 0.006, 0.309, 0.612, 0.808 max_d=0.808 avg_d=0.309 std_dev=0.303
C6	B	0, 0.245, 0.581, 0.918, 0.803 max_d=0.803 avg_d=0.581 std_dev=0.336
C5'	B	0, 0.132, 0.502, 0.872, 1.035 max_d=1.035 avg_d=0.502 std_dev=0.370
O3'	B	0, -0.056, 0.334, 0.725, 0.999 max_d=0.999 avg_d=0.334 std_dev=0.391
C5	B	0, 0.284, 0.678, 1.073, 0.944 max_d=0.944 avg_d=0.678 std_dev=0.395
C2	B	0, 0.176, 0.617, 1.059, 1.211 max_d=1.211 avg_d=0.617 std_dev=0.442
O5'	B	0, 0.270, 0.735, 1.200, 1.268 max_d=1.268 avg_d=0.735 std_dev=0.465
C4	B	0, 0.245, 0.721, 1.197, 1.249 max_d=1.249 avg_d=0.721 std_dev=0.476
P	B	0, 0.363, 0.873, 1.382, 1.246 max_d=1.246 avg_d=0.873 std_dev=0.509
N3	B	0, 0.197, 0.726, 1.255, 1.410 max_d=1.410 avg_d=0.726 std_dev=0.529
O2	B	0, 0.245, 0.776, 1.308, 1.458 max_d=1.458 avg_d=0.776 std_dev=0.532
OP1	B	0, 0.390, 0.949, 1.508, 1.386 max_d=1.386 avg_d=0.949 std_dev=0.559
O4	B	0, 0.264, 0.825, 1.385, 1.431 max_d=1.431 avg_d=0.825 std_dev=0.561
OP2	B	0, 0.368, 0.940, 1.512, 1.513 max_d=1.513 avg_d=0.940 std_dev=0.572
O5'	A	0, 0.358, 1.238, 2.119, 2.212 max_d=2.212 avg_d=1.238 std_dev=0.881
OP2	A	0, 0.620, 1.507, 2.394, 2.292 max_d=2.292 avg_d=1.507 std_dev=0.887
P	A	0, 0.340, 1.235, 2.129, 2.275 max_d=2.275 avg_d=1.235 std_dev=0.894
OP1	A	0, 0.621, 1.556, 2.491, 2.476 max_d=2.476 avg_d=1.556 std_dev=0.935

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.10	0.13	0.27	0.05
C2	0.01	0.00	0.04	0.09	0.01	0.03	0.01	0.06	0.02	0.00	0.00	0.02	0.01	0.04	0.10	0.01	0.26	0.21	0.51	0.28
C2'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.03	0.08	0.00	0.01	0.01	0.19	0.16	0.27	0.14
C3'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.06	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.09	0.07	0.11	0.02	0.01	0.01	0.29	0.26	0.25	0.25
C4	0.03	0.01	0.02	0.06	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.09	0.05	0.42	0.47	0.78	0.53
C4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.03	0.05	0.05	0.02	0.01	0.01	0.17	0.19	0.04
C5	0.03	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.05	0.44	0.50	0.77	0.55
C5'	0.01	0.06	0.00	0.02	0.07	0.01	0.05	0.00	0.04	0.04	0.07	0.07	0.06	0.04	0.02	0.01	0.00	0.10	0.25	0.02
C6	0.03	0.02	0.04	0.01	0.01	0.03	0.01	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.05	0.37	0.35	0.59	0.41
N1	0.01	0.00	0.01	0.04	0.02	0.01	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.25	0.18	0.45	0.25
N3	0.02	0.00	0.04	0.09	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.04	0.12	0.03	0.35	0.34	0.66	0.41
N4	0.02	0.02	0.03	0.07	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.03	0.11	0.04	0.45	0.56	0.89	0.61
O2	0.03	0.01	0.08	0.11	0.01	0.05	0.02	0.06	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.06	0.13	0.02	0.18	0.12	0.42	0.18
O2'	0.01	0.04	0.00	0.02	0.03	0.05	0.03	0.04	0.03	0.02	0.04	0.03	0.06	0.00	0.03	0.04	0.04	0.32	0.15	0.10
O3'	0.01	0.10	0.01	0.01	0.09	0.02	0.03	0.02	0.00	0.04	0.12	0.11	0.13	0.03	0.00	0.02	0.28	0.28	0.17	0.24
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.05	0.02	0.03	0.04	0.02	0.04	0.02	0.00	0.09	0.20	0.23	0.09
O5'	0.10	0.26	0.19	0.29	0.42	0.01	0.44	0.00	0.37	0.25	0.35	0.45	0.18	0.04	0.28	0.09	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.13	0.21	0.16	0.26	0.47	0.17	0.50	0.10	0.35	0.18	0.34	0.56	0.12	0.32	0.28	0.20	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.27	0.51	0.27	0.25	0.78	0.19	0.77	0.25	0.59	0.45	0.66	0.89	0.42	0.15	0.17	0.23	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.05	0.28	0.14	0.25	0.53	0.04	0.55	0.02	0.41	0.25	0.41	0.61	0.18	0.10	0.24	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.10	0.17	0.12	0.08	0.15	0.02	0.12	0.07	0.11	0.12	0.17	0.22	0.13	0.10	0.15	0.07	0.04	0.25	0.05	0.09
C2	0.07	0.12	0.09	0.05	0.10	0.04	0.08	0.10	0.08	0.08	0.12	0.17	0.11	0.05	0.10	0.06	0.08	0.28	0.10	0.13
C2'	0.09	0.14	0.10	0.06	0.13	0.04	0.11	0.09	0.11	0.10	0.14	0.18	0.11	0.08	0.13	0.09	0.07	0.26	0.06	0.10
C3'	0.12	0.18	0.13	0.11	0.17	0.05	0.15	0.01	0.15	0.14	0.19	0.21	0.14	0.13	0.18	0.09	0.04	0.16	0.06	0.00
C4	0.07	0.10	0.08	0.05	0.10	0.03	0.09	0.05	0.10	0.08	0.10	0.14	0.11	0.04	0.10	0.06	0.03	0.18	0.03	0.05
C4'	0.14	0.22	0.14	0.11	0.22	0.04	0.18	0.02	0.16	0.17	0.24	0.27	0.14	0.12	0.23	0.10	0.04	0.17	0.06	0.01
C5	0.13	0.18	0.14	0.12	0.17	0.07	0.15	0.04	0.15	0.15	0.18	0.21	0.14	0.13	0.17	0.09	0.06	0.11	0.08	0.05
C5'	0.20	0.30	0.19	0.16	0.31	0.11	0.26	0.07	0.24	0.24	0.32	0.33	0.18	0.16	0.32	0.16	0.12	0.08	0.17	0.10
C6	0.13	0.20	0.15	0.13	0.19	0.06	0.16	0.03	0.16	0.16	0.21	0.24	0.16	0.14	0.19	0.09	0.05	0.14	0.06	0.03
N1	0.10	0.16	0.12	0.08	0.14	0.02	0.12	0.06	0.11	0.12	0.16	0.21	0.13	0.10	0.14	0.07	0.03	0.23	0.03	0.08
N3	0.06	0.09	0.07	0.04	0.08	0.05	0.08	0.11	0.08	0.06	0.09	0.14	0.11	0.03	0.08	0.06	0.09	0.27	0.10	0.13
N4	0.07	0.08	0.10	0.05	0.09	0.04	0.09	0.05	0.09	0.08	0.08	0.11	0.16	0.05	0.09	0.06	0.04	0.16	0.03	0.04
O2	0.06	0.10	0.08	0.05	0.08	0.06	0.08	0.13	0.08	0.07	0.10	0.16	0.12	0.05	0.08	0.06	0.12	0.34	0.15	0.18
O2'	0.09	0.14	0.10	0.06	0.13	0.06	0.11	0.12	0.11	0.10	0.15	0.20	0.12	0.07	0.13	0.10	0.10	0.31	0.10	0.15
O3'	0.14	0.19	0.15	0.13	0.19	0.07	0.18	0.02	0.17	0.17	0.20	0.22	0.16	0.14	0.20	0.11	0.06	0.13	0.10	0.03
O4'	0.11	0.20	0.12	0.09	0.19	0.01	0.14	0.05	0.13	0.14	0.21	0.25	0.12	0.10	0.20	0.07	0.02	0.22	0.01	0.06
O5'	0.35	0.27	0.30	0.32	0.26	0.41	0.30	0.46	0.32	0.31	0.25	0.25	0.30	0.31	0.26	0.43	0.41	0.54	0.37	0.44
OP1	0.65	0.64	0.50	0.46	0.67	0.61	0.67	0.64	0.66	0.66	0.65	0.62	0.46	0.34	0.67	0.72	0.62	0.71	0.59	0.64
OP2	0.86	0.75	0.75	0.74	0.74	0.88	0.80	0.91	0.83	0.82	0.71	0.71	0.72	0.65	0.71	0.94	0.87	0.98	0.80	0.88
P	0.59	0.51	0.47	0.45	0.51	0.59	0.55	0.62	0.57	0.56	0.50	0.48	0.44	0.36	0.50	0.66	0.59	0.70	0.54	0.60

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.02	0.03	0.01	0.03	0.07	0.01	0.02	0.03	0.00	0.05	0.03	0.11	0.07
C2	0.04	0.00	0.09	0.07	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.10	0.09	0.01	0.03	0.09	0.10	0.18	0.12
C2'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.06	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.08	0.13	0.00	0.01	0.06	0.00	0.05	0.08	0.07	0.05
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.06	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.07	0.11	0.00	0.01	0.08	0.01	0.04	0.12	0.08	0.07
C4	0.03	0.01	0.06	0.06	0.00	0.05	0.01	0.06	0.02	0.02	0.00	0.01	0.07	0.07	0.01	0.04	0.09	0.14	0.21	0.13
C4'	0.00	0.04	0.01	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.04	0.08	0.05	0.01	0.06	0.00	0.01	0.07	0.01	0.01
C5	0.02	0.01	0.02	0.05	0.01	0.05	0.00	0.05	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.03	0.06	0.08	0.13	0.20	0.13
C5'	0.02	0.06	0.01	0.01	0.06	0.01	0.05	0.00	0.04	0.04	0.06	0.09	0.05	0.01	0.07	0.01	0.00	0.06	0.02	0.02
C6	0.03	0.01	0.00	0.04	0.02	0.04	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.03	0.06	0.07	0.09	0.18	0.12
N1	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.03	0.02	0.01	0.08	0.08	0.16	0.11
N3	0.03	0.01	0.08	0.07	0.00	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.10	0.09	0.01	0.02	0.09	0.12	0.20	0.13
O2	0.07	0.00	0.13	0.11	0.01	0.08	0.02	0.09	0.02	0.02	0.01	0.00	0.16	0.15	0.02	0.08	0.11	0.12	0.18	0.13
O2'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.07	0.05	0.02	0.05	0.01	0.03	0.10	0.16	0.00	0.03	0.07	0.04	0.02	0.12	0.04	0.03
O3'	0.02	0.09	0.01	0.01	0.07	0.01	0.04	0.01	0.03	0.03	0.09	0.15	0.03	0.00	0.09	0.01	0.05	0.19	0.14	0.11
O4	0.03	0.01	0.06	0.08	0.01	0.06	0.03	0.07	0.03	0.02	0.01	0.02	0.07	0.09	0.00	0.05	0.11	0.16	0.23	0.15
O4'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.01	0.02	0.08	0.04	0.01	0.05	0.00	0.04	0.01	0.12	0.08
O5'	0.05	0.09	0.05	0.04	0.09	0.01	0.08	0.00	0.07	0.08	0.09	0.11	0.02	0.05	0.11	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.03	0.10	0.08	0.12	0.14	0.07	0.13	0.06	0.09	0.08	0.12	0.12	0.12	0.19	0.16	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.11	0.18	0.07	0.08	0.21	0.01	0.20	0.02	0.18	0.16	0.20	0.18	0.04	0.14	0.23	0.12	0.01	0.00	0.00	0.01
P	0.07	0.12	0.05	0.07	0.13	0.01	0.13	0.02	0.12	0.11	0.13	0.13	0.03	0.11	0.15	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00