Doublet Group distance statistics: 48251

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 1, 2, 9, 10, 10, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.008, 0.014, 0.020, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.014 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.011, 0.021, 0.031, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.021 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.017, 0.030, 0.043, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.030 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.028, 0.041, 0.054, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.041 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.011, 0.024, 0.038, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.024 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.019, 0.033, 0.047, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.033 std_dev=0.014
N9	A	0, 0.013, 0.031, 0.048, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.031 std_dev=0.017
C1'	A	0, 0.024, 0.042, 0.060, 0.126 max_d=0.126 avg_d=0.042 std_dev=0.018
N7	A	0, 0.018, 0.038, 0.058, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.038 std_dev=0.020
N6	A	0, 0.016, 0.037, 0.058, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.037 std_dev=0.021
C8	A	0, 0.023, 0.047, 0.071, 0.111 max_d=0.111 avg_d=0.047 std_dev=0.024
O4'	A	0, 0.193, 0.345, 0.497, 0.638 max_d=0.638 avg_d=0.345 std_dev=0.152
O2'	B	0, 0.349, 0.516, 0.684, 0.723 max_d=0.723 avg_d=0.516 std_dev=0.168
C2'	A	0, 0.229, 0.405, 0.581, 0.728 max_d=0.728 avg_d=0.405 std_dev=0.176
O2'	A	0, 0.260, 0.478, 0.696, 1.031 max_d=1.031 avg_d=0.478 std_dev=0.218
C2'	B	0, 0.474, 0.703, 0.933, 1.136 max_d=1.136 avg_d=0.703 std_dev=0.230
C4'	A	0, 0.347, 0.578, 0.810, 1.030 max_d=1.030 avg_d=0.578 std_dev=0.232
C3'	A	0, 0.356, 0.630, 0.904, 1.100 max_d=1.100 avg_d=0.630 std_dev=0.274
C3'	B	0, 0.586, 0.875, 1.163, 1.574 max_d=1.574 avg_d=0.875 std_dev=0.289
C1'	B	0, 0.495, 0.809, 1.124, 1.495 max_d=1.495 avg_d=0.809 std_dev=0.315
O4'	B	0, 0.605, 0.925, 1.245, 1.889 max_d=1.889 avg_d=0.925 std_dev=0.320
O3'	B	0, 0.625, 0.956, 1.286, 1.622 max_d=1.622 avg_d=0.956 std_dev=0.330
C4'	B	0, 0.545, 0.876, 1.207, 1.697 max_d=1.697 avg_d=0.876 std_dev=0.331
C5'	A	0, 0.607, 0.984, 1.362, 1.758 max_d=1.758 avg_d=0.984 std_dev=0.378
O3'	A	0, 0.513, 0.913, 1.313, 1.571 max_d=1.571 avg_d=0.913 std_dev=0.400
N3	B	0, 0.451, 0.906, 1.362, 1.904 max_d=1.904 avg_d=0.906 std_dev=0.456
O5'	B	0, 0.481, 0.938, 1.394, 2.282 max_d=2.282 avg_d=0.938 std_dev=0.457
N2	B	0, 0.462, 0.933, 1.403, 2.251 max_d=2.251 avg_d=0.933 std_dev=0.471
OP1	B	0, 0.669, 1.147, 1.625, 2.997 max_d=2.997 avg_d=1.147 std_dev=0.478
N9	B	0, 0.592, 1.073, 1.553, 1.926 max_d=1.926 avg_d=1.073 std_dev=0.480
C5'	B	0, 0.655, 1.155, 1.654, 2.309 max_d=2.309 avg_d=1.155 std_dev=0.499
C4	B	0, 0.587, 1.118, 1.649, 2.107 max_d=2.107 avg_d=1.118 std_dev=0.531
C2	B	0, 0.516, 1.050, 1.584, 2.347 max_d=2.347 avg_d=1.050 std_dev=0.534
P	B	0, 0.624, 1.168, 1.712, 3.038 max_d=3.038 avg_d=1.168 std_dev=0.544
C8	B	0, 0.778, 1.384, 1.991, 2.406 max_d=2.406 avg_d=1.384 std_dev=0.607
O5'	A	0, 0.673, 1.293, 1.914, 2.643 max_d=2.643 avg_d=1.293 std_dev=0.621
N1	B	0, 0.692, 1.372, 2.052, 2.949 max_d=2.949 avg_d=1.372 std_dev=0.680
C5	B	0, 0.772, 1.463, 2.155, 2.718 max_d=2.718 avg_d=1.463 std_dev=0.692
OP2	B	0, 0.705, 1.407, 2.110, 3.459 max_d=3.459 avg_d=1.407 std_dev=0.703
N7	B	0, 0.881, 1.626, 2.370, 2.812 max_d=2.812 avg_d=1.626 std_dev=0.744
C6	B	0, 0.837, 1.614, 2.391, 3.203 max_d=3.203 avg_d=1.614 std_dev=0.777
O6	B	0, 1.026, 1.939, 2.853, 3.802 max_d=3.802 avg_d=1.939 std_dev=0.914
P	A	0, 0.712, 1.673, 2.633, 4.583 max_d=4.583 avg_d=1.673 std_dev=0.961
OP1	A	0, 0.674, 1.780, 2.886, 5.517 max_d=5.517 avg_d=1.780 std_dev=1.106
OP2	A	0, 0.385, 2.212, 4.040, 6.587 max_d=6.587 avg_d=2.212 std_dev=1.827

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.35	0.34	0.36	0.21
C2	0.03	0.00	0.16	0.16	0.01	0.06	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.18	0.21	0.06	0.59	0.27	1.01	0.58
C2'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.08	0.01	0.05	0.02	0.08	0.09	0.12	0.16	0.07	0.07	0.02	0.00	0.02	0.01	0.20	0.29	0.23	0.14
C3'	0.01	0.16	0.00	0.00	0.09	0.00	0.10	0.02	0.12	0.15	0.14	0.15	0.12	0.13	0.06	0.02	0.01	0.02	0.17	0.24	0.27	0.17
C4	0.02	0.01	0.08	0.09	0.00	0.06	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.09	0.10	0.03	0.60	0.23	1.01	0.59
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.06	0.00	0.09	0.01	0.09	0.12	0.07	0.05	0.10	0.12	0.06	0.05	0.02	0.00	0.03	0.35	0.22	0.13
C5	0.01	0.01	0.05	0.10	0.00	0.09	0.00	0.20	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.11	0.03	0.71	0.32	1.36	0.80
C5'	0.04	0.13	0.02	0.02	0.14	0.01	0.20	0.00	0.20	0.22	0.16	0.10	0.23	0.24	0.13	0.05	0.05	0.02	0.01	0.17	0.18	0.01
C6	0.02	0.01	0.08	0.12	0.01	0.09	0.01	0.20	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.14	0.03	0.72	0.37	1.46	0.84
C8	0.01	0.01	0.09	0.15	0.01	0.12	0.01	0.22	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.07	0.16	0.05	0.70	0.28	1.24	0.75
N1	0.03	0.00	0.12	0.14	0.01	0.07	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.15	0.18	0.04	0.67	0.31	1.28	0.73
N3	0.03	0.00	0.16	0.15	0.00	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.18	0.19	0.06	0.53	0.27	0.83	0.48
N6	0.02	0.01	0.07	0.12	0.01	0.10	0.01	0.23	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.09	0.15	0.03	0.77	0.48	1.68	0.97
N7	0.01	0.01	0.07	0.13	0.01	0.12	0.00	0.24	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.06	0.15	0.04	0.76	0.41	1.53	0.91
N9	0.00	0.01	0.02	0.06	0.00	0.06	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.06	0.02	0.56	0.19	0.86	0.51
O2'	0.02	0.18	0.00	0.02	0.09	0.05	0.07	0.05	0.10	0.07	0.15	0.18	0.09	0.06	0.02	0.00	0.05	0.06	0.08	0.53	0.36	0.25
O3'	0.01	0.21	0.02	0.01	0.10	0.02	0.11	0.05	0.14	0.16	0.18	0.19	0.15	0.15	0.06	0.05	0.00	0.01	0.18	0.35	0.40	0.21
O4'	0.01	0.06	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.02	0.03	0.05	0.04	0.06	0.03	0.04	0.02	0.06	0.01	0.00	0.29	0.44	0.20	0.15
O5'	0.35	0.59	0.20	0.17	0.60	0.03	0.71	0.01	0.72	0.70	0.67	0.53	0.77	0.76	0.56	0.08	0.18	0.29	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.34	0.27	0.29	0.24	0.23	0.35	0.32	0.17	0.37	0.28	0.31	0.27	0.48	0.41	0.19	0.53	0.35	0.44	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.36	1.01	0.23	0.27	1.01	0.22	1.36	0.18	1.46	1.24	1.28	0.83	1.68	1.53	0.86	0.36	0.40	0.20	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.21	0.58	0.14	0.17	0.59	0.13	0.80	0.01	0.84	0.75	0.73	0.48	0.97	0.91	0.51	0.25	0.21	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.16	0.21	0.30	0.14	0.14	0.16	0.15	0.18	0.14	0.18	0.18	0.14	0.15	0.13	0.19	0.45	0.18	0.16	0.19	0.17	0.30	0.15
C2	0.20	0.15	0.21	0.26	0.15	0.22	0.15	0.22	0.15	0.17	0.15	0.17	0.15	0.16	0.16	0.23	0.41	0.25	0.19	0.15	0.23	0.29	0.18
C2'	0.16	0.16	0.22	0.27	0.15	0.16	0.16	0.16	0.17	0.15	0.17	0.17	0.14	0.16	0.15	0.21	0.43	0.23	0.18	0.18	0.19	0.30	0.18
C3'	0.16	0.19	0.27	0.32	0.17	0.16	0.19	0.16	0.21	0.17	0.22	0.21	0.17	0.18	0.16	0.24	0.46	0.20	0.19	0.23	0.20	0.29	0.18
C4	0.15	0.15	0.21	0.27	0.13	0.15	0.14	0.15	0.15	0.14	0.15	0.17	0.13	0.14	0.13	0.20	0.42	0.19	0.16	0.16	0.18	0.29	0.15
C4'	0.15	0.20	0.27	0.35	0.18	0.17	0.20	0.18	0.23	0.17	0.23	0.21	0.17	0.19	0.16	0.22	0.49	0.17	0.20	0.25	0.21	0.30	0.18
C5	0.14	0.14	0.20	0.25	0.13	0.13	0.14	0.13	0.14	0.14	0.15	0.17	0.13	0.14	0.13	0.19	0.38	0.18	0.17	0.15	0.17	0.29	0.15
C5'	0.26	0.32	0.38	0.45	0.30	0.28	0.32	0.31	0.35	0.30	0.35	0.32	0.30	0.32	0.29	0.30	0.57	0.26	0.32	0.37	0.33	0.37	0.30
C6	0.17	0.15	0.19	0.21	0.15	0.15	0.15	0.14	0.15	0.15	0.15	0.17	0.15	0.15	0.15	0.20	0.33	0.21	0.17	0.15	0.19	0.28	0.15
C8	0.13	0.16	0.21	0.29	0.15	0.12	0.17	0.14	0.18	0.15	0.18	0.18	0.15	0.16	0.14	0.18	0.41	0.17	0.19	0.19	0.17	0.32	0.18
N1	0.20	0.16	0.19	0.23	0.16	0.21	0.16	0.21	0.16	0.18	0.16	0.17	0.16	0.17	0.17	0.23	0.36	0.25	0.19	0.16	0.22	0.29	0.18
N3	0.17	0.15	0.21	0.28	0.13	0.19	0.14	0.19	0.14	0.14	0.15	0.17	0.14	0.14	0.14	0.22	0.44	0.22	0.17	0.15	0.21	0.29	0.16
N6	0.17	0.18	0.17	0.17	0.17	0.14	0.17	0.14	0.18	0.17	0.18	0.19	0.18	0.17	0.17	0.19	0.25	0.20	0.19	0.18	0.20	0.28	0.17
N7	0.13	0.15	0.20	0.26	0.14	0.12	0.15	0.13	0.16	0.15	0.16	0.17	0.14	0.15	0.14	0.17	0.37	0.17	0.20	0.17	0.18	0.31	0.19
N9	0.14	0.16	0.21	0.29	0.14	0.13	0.16	0.14	0.17	0.14	0.17	0.18	0.14	0.15	0.14	0.19	0.44	0.18	0.16	0.18	0.17	0.30	0.15
O2'	0.20	0.16	0.20	0.26	0.16	0.21	0.16	0.20	0.17	0.17	0.17	0.17	0.15	0.17	0.17	0.23	0.42	0.27	0.21	0.18	0.22	0.32	0.21
O3'	0.17	0.23	0.28	0.31	0.19	0.18	0.22	0.18	0.25	0.19	0.26	0.24	0.19	0.21	0.18	0.26	0.45	0.22	0.20	0.28	0.22	0.29	0.20
O4'	0.12	0.17	0.22	0.33	0.14	0.15	0.17	0.17	0.20	0.14	0.20	0.19	0.14	0.16	0.12	0.20	0.48	0.16	0.18	0.22	0.18	0.30	0.15
O5'	0.86	0.85	0.64	0.57	0.86	0.75	0.85	0.74	0.83	0.87	0.83	0.85	0.86	0.86	0.87	0.69	0.47	0.91	0.96	0.80	0.91	0.95	0.96
OP1	0.63	0.79	0.41	0.42	0.75	0.47	0.82	0.50	0.88	0.76	0.87	0.77	0.72	0.82	0.71	0.39	0.49	0.68	0.76	0.93	0.69	0.77	0.77
OP2	2.00	2.15	1.66	1.59	2.13	1.82	2.19	1.85	2.21	2.15	2.20	2.11	2.09	2.19	2.09	1.61	1.36	2.05	2.16	2.21	2.10	2.22	2.20
P	1.14	1.24	0.86	0.78	1.22	0.98	1.26	0.98	1.27	1.22	1.27	1.23	1.20	1.25	1.20	0.88	0.62	1.19	1.28	1.28	1.21	1.29	1.29

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.04	0.06	0.05	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.14	0.02	0.14	0.26	0.11
C2	0.05	0.00	0.16	0.20	0.01	0.08	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.14	0.25	0.06	0.29	0.02	0.20	0.35	0.24
C2'	0.01	0.16	0.00	0.01	0.08	0.01	0.06	0.02	0.07	0.11	0.12	0.20	0.16	0.09	0.03	0.01	0.01	0.01	0.23	0.07	0.23	0.26	0.16
C3'	0.02	0.20	0.01	0.00	0.12	0.01	0.11	0.04	0.13	0.16	0.17	0.24	0.19	0.14	0.07	0.01	0.01	0.02	0.31	0.13	0.31	0.28	0.25
C4	0.02	0.01	0.08	0.12	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.13	0.03	0.31	0.02	0.21	0.33	0.23
C4'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.06	0.00	0.07	0.01	0.08	0.09	0.08	0.10	0.08	0.10	0.05	0.04	0.02	0.01	0.02	0.09	0.17	0.24	0.07
C5	0.02	0.01	0.06	0.11	0.00	0.07	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.13	0.02	0.39	0.02	0.28	0.39	0.32
C5'	0.02	0.12	0.02	0.04	0.11	0.01	0.14	0.00	0.15	0.14	0.14	0.12	0.10	0.16	0.09	0.04	0.06	0.01	0.01	0.17	0.13	0.28	0.02
C6	0.03	0.01	0.07	0.13	0.01	0.08	0.01	0.15	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.07	0.16	0.03	0.40	0.01	0.31	0.43	0.35
C8	0.02	0.01	0.11	0.16	0.01	0.09	0.01	0.14	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.06	0.18	0.05	0.39	0.02	0.27	0.34	0.29
N1	0.04	0.01	0.12	0.17	0.02	0.08	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.11	0.21	0.05	0.35	0.01	0.26	0.39	0.30
N2	0.06	0.01	0.20	0.24	0.01	0.10	0.02	0.12	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.18	0.31	0.08	0.26	0.03	0.18	0.34	0.21
N3	0.05	0.01	0.16	0.19	0.01	0.08	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.22	0.06	0.25	0.02	0.17	0.31	0.19
N7	0.01	0.01	0.09	0.14	0.01	0.10	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.18	0.04	0.43	0.02	0.33	0.41	0.36
N9	0.01	0.02	0.03	0.07	0.01	0.05	0.01	0.09	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.07	0.01	0.28	0.02	0.19	0.30	0.19
O2'	0.02	0.14	0.01	0.01	0.06	0.04	0.05	0.04	0.07	0.06	0.11	0.18	0.13	0.06	0.02	0.00	0.04	0.04	0.09	0.07	0.21	0.22	0.10
O3'	0.01	0.25	0.01	0.01	0.13	0.02	0.13	0.06	0.16	0.18	0.21	0.31	0.22	0.18	0.07	0.04	0.00	0.02	0.29	0.17	0.39	0.34	0.29
O4'	0.01	0.06	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.05	0.05	0.08	0.06	0.04	0.01	0.04	0.02	0.00	0.11	0.04	0.17	0.33	0.18
O5'	0.14	0.29	0.23	0.31	0.31	0.02	0.39	0.01	0.40	0.39	0.35	0.26	0.25	0.43	0.28	0.09	0.29	0.11	0.00	0.44	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.07	0.13	0.02	0.09	0.02	0.17	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.07	0.17	0.04	0.44	0.00	0.36	0.47	0.40
OP1	0.14	0.20	0.23	0.31	0.21	0.17	0.28	0.13	0.31	0.27	0.26	0.18	0.17	0.33	0.19	0.21	0.39	0.17	0.02	0.36	0.00	0.01	0.00
OP2	0.26	0.35	0.26	0.28	0.33	0.24	0.39	0.28	0.43	0.34	0.39	0.34	0.31	0.41	0.30	0.22	0.34	0.33	0.02	0.47	0.01	0.00	0.00
P	0.11	0.24	0.16	0.25	0.23	0.07	0.32	0.02	0.35	0.29	0.30	0.21	0.19	0.36	0.19	0.10	0.29	0.18	0.01	0.40	0.00	0.00	0.00