Doublet Group distance statistics: 48252

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 4, 3, 4, 0, 5, 2, 1, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.009, 0.014, 0.019, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.014 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.014, 0.025, 0.035, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.025 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.014, 0.024, 0.035, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.024 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.011, 0.022, 0.034, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.022 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.005, 0.016, 0.028, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.016 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.016, 0.028, 0.040, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.028 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.009, 0.022, 0.034, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.022 std_dev=0.013
N9	A	0, 0.018, 0.031, 0.044, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.031 std_dev=0.013
N6	A	0, 0.031, 0.051, 0.072, 0.114 max_d=0.114 avg_d=0.051 std_dev=0.020
N7	A	0, 0.032, 0.055, 0.077, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.055 std_dev=0.022
C8	A	0, 0.035, 0.059, 0.082, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.059 std_dev=0.024
O4'	A	0, 0.108, 0.228, 0.347, 0.516 max_d=0.516 avg_d=0.228 std_dev=0.119
C2'	A	0, 0.105, 0.244, 0.384, 0.588 max_d=0.588 avg_d=0.244 std_dev=0.140
C4'	A	0, 0.188, 0.351, 0.514, 0.703 max_d=0.703 avg_d=0.351 std_dev=0.163
O2'	A	0, 0.166, 0.348, 0.530, 0.778 max_d=0.778 avg_d=0.348 std_dev=0.182
C3'	A	0, 0.164, 0.377, 0.591, 0.875 max_d=0.875 avg_d=0.377 std_dev=0.213
O2'	B	0, 0.274, 0.537, 0.801, 1.032 max_d=1.032 avg_d=0.537 std_dev=0.264
C5'	A	0, 0.340, 0.634, 0.928, 1.303 max_d=1.303 avg_d=0.634 std_dev=0.294
C2'	B	0, 0.248, 0.569, 0.891, 1.195 max_d=1.195 avg_d=0.569 std_dev=0.321
O3'	A	0, 0.228, 0.566, 0.905, 1.283 max_d=1.283 avg_d=0.566 std_dev=0.339
C3'	B	0, 0.243, 0.602, 0.961, 1.427 max_d=1.427 avg_d=0.602 std_dev=0.359
C1'	B	0, 0.217, 0.586, 0.955, 1.210 max_d=1.210 avg_d=0.586 std_dev=0.369
C4'	B	0, 0.151, 0.528, 0.906, 1.564 max_d=1.564 avg_d=0.528 std_dev=0.378
O4'	B	0, 0.238, 0.648, 1.057, 1.524 max_d=1.524 avg_d=0.648 std_dev=0.409
O3'	B	0, 0.294, 0.727, 1.159, 1.553 max_d=1.553 avg_d=0.727 std_dev=0.433
O5'	A	0, 0.476, 0.935, 1.395, 1.829 max_d=1.829 avg_d=0.935 std_dev=0.459
C5'	B	0, 0.195, 0.687, 1.179, 2.087 max_d=2.087 avg_d=0.687 std_dev=0.492
N9	B	0, 0.218, 0.773, 1.327, 2.054 max_d=2.054 avg_d=0.773 std_dev=0.555
O5'	B	0, 0.291, 0.937, 1.583, 2.355 max_d=2.355 avg_d=0.937 std_dev=0.646
N3	B	0, 0.152, 0.824, 1.496, 2.533 max_d=2.533 avg_d=0.824 std_dev=0.672
C8	B	0, 0.317, 0.996, 1.675, 2.485 max_d=2.485 avg_d=0.996 std_dev=0.679
C4	B	0, 0.137, 0.844, 1.551, 2.651 max_d=2.651 avg_d=0.844 std_dev=0.707
P	A	0, 0.657, 1.467, 2.277, 3.294 max_d=3.294 avg_d=1.467 std_dev=0.810
P	B	0, 0.386, 1.253, 2.119, 2.996 max_d=2.996 avg_d=1.253 std_dev=0.866
N2	B	0, 0.298, 1.167, 2.037, 3.304 max_d=3.304 avg_d=1.167 std_dev=0.870
N7	B	0, 0.306, 1.180, 2.054, 3.294 max_d=3.294 avg_d=1.180 std_dev=0.874
C2	B	0, 0.135, 1.014, 1.893, 3.272 max_d=3.272 avg_d=1.014 std_dev=0.879
C5	B	0, 0.173, 1.077, 1.980, 3.406 max_d=3.406 avg_d=1.077 std_dev=0.904
OP2	B	0, 0.619, 1.555, 2.491, 3.271 max_d=3.271 avg_d=1.555 std_dev=0.936
OP1	A	0, 0.928, 1.880, 2.832, 3.939 max_d=3.939 avg_d=1.880 std_dev=0.952
OP1	B	0, 0.300, 1.287, 2.275, 3.310 max_d=3.310 avg_d=1.287 std_dev=0.988
N1	B	0, 0.086, 1.175, 2.264, 4.042 max_d=4.042 avg_d=1.175 std_dev=1.089
C6	B	0, 0.134, 1.243, 2.351, 4.170 max_d=4.170 avg_d=1.243 std_dev=1.108
OP2	A	0, 0.809, 2.082, 3.355, 5.530 max_d=5.530 avg_d=2.082 std_dev=1.273
O6	B	0, 0.197, 1.485, 2.773, 4.889 max_d=4.889 avg_d=1.485 std_dev=1.288

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.02	0.03	0.04	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.21	0.30	0.36	0.21
C2	0.04	0.00	0.14	0.10	0.01	0.03	0.01	0.14	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.18	0.16	0.09	0.37	0.55	0.77	0.49
C2'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.06	0.02	0.02	0.01	0.05	0.11	0.10	0.15	0.03	0.08	0.02	0.00	0.02	0.01	0.20	0.31	0.19	0.13
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.04	0.00	0.07	0.02	0.06	0.18	0.07	0.10	0.08	0.15	0.07	0.02	0.01	0.01	0.27	0.40	0.22	0.18
C4	0.02	0.01	0.06	0.04	0.00	0.05	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.05	0.05	0.37	0.54	0.74	0.49
C4'	0.01	0.03	0.02	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.08	0.12	0.05	0.03	0.10	0.12	0.06	0.05	0.02	0.00	0.01	0.20	0.36	0.08
C5	0.01	0.01	0.02	0.07	0.00	0.08	0.00	0.21	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.07	0.04	0.44	0.71	0.96	0.62
C5'	0.04	0.14	0.01	0.02	0.15	0.00	0.21	0.00	0.21	0.22	0.18	0.12	0.24	0.25	0.14	0.05	0.05	0.02	0.01	0.31	0.33	0.02
C6	0.02	0.01	0.05	0.06	0.01	0.08	0.01	0.21	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.05	0.05	0.45	0.75	1.03	0.66
C8	0.02	0.02	0.11	0.18	0.01	0.12	0.01	0.22	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.07	0.20	0.07	0.44	0.66	0.84	0.57
N1	0.03	0.00	0.10	0.07	0.01	0.05	0.01	0.18	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.14	0.10	0.07	0.41	0.67	0.93	0.59
N3	0.04	0.01	0.15	0.10	0.01	0.03	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.18	0.15	0.09	0.33	0.47	0.65	0.42
N6	0.02	0.02	0.03	0.08	0.01	0.10	0.01	0.24	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.07	0.08	0.05	0.48	0.86	1.17	0.74
N7	0.01	0.02	0.08	0.15	0.01	0.12	0.00	0.25	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.05	0.18	0.05	0.47	0.79	1.05	0.69
N9	0.00	0.02	0.02	0.07	0.01	0.06	0.01	0.14	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.06	0.02	0.35	0.48	0.62	0.42
O2'	0.01	0.18	0.00	0.02	0.08	0.05	0.05	0.05	0.09	0.07	0.14	0.18	0.07	0.05	0.02	0.00	0.05	0.04	0.05	0.29	0.37	0.12
O3'	0.02	0.16	0.02	0.01	0.05	0.02	0.07	0.05	0.05	0.20	0.10	0.15	0.08	0.18	0.06	0.05	0.00	0.02	0.29	0.47	0.49	0.24
O4'	0.01	0.09	0.01	0.01	0.05	0.00	0.04	0.02	0.05	0.07	0.07	0.09	0.05	0.05	0.02	0.04	0.02	0.00	0.22	0.28	0.41	0.22
O5'	0.21	0.37	0.20	0.27	0.37	0.01	0.44	0.01	0.45	0.44	0.41	0.33	0.48	0.47	0.35	0.05	0.29	0.22	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.30	0.55	0.31	0.40	0.54	0.20	0.71	0.31	0.75	0.66	0.67	0.47	0.86	0.79	0.48	0.29	0.47	0.28	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.36	0.77	0.19	0.22	0.74	0.36	0.96	0.33	1.03	0.84	0.93	0.65	1.17	1.05	0.62	0.37	0.49	0.41	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.21	0.49	0.13	0.18	0.49	0.08	0.62	0.02	0.66	0.57	0.59	0.42	0.74	0.69	0.42	0.12	0.24	0.22	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.26	0.31	0.16	0.16	0.32	0.23	0.39	0.30	0.42	0.40	0.37	0.31	0.27	0.43	0.33	0.17	0.13	0.33	0.33	0.46	0.36	0.43	0.42
C2	0.25	0.41	0.19	0.18	0.41	0.19	0.47	0.25	0.49	0.41	0.47	0.37	0.38	0.46	0.36	0.20	0.16	0.25	0.28	0.52	0.28	0.36	0.32
C2'	0.29	0.38	0.21	0.20	0.36	0.23	0.42	0.29	0.45	0.40	0.43	0.38	0.33	0.44	0.34	0.17	0.16	0.33	0.31	0.49	0.32	0.39	0.38
C3'	0.26	0.36	0.16	0.15	0.32	0.22	0.38	0.28	0.42	0.36	0.41	0.38	0.30	0.40	0.31	0.14	0.13	0.33	0.29	0.47	0.31	0.36	0.36
C4	0.27	0.28	0.15	0.15	0.32	0.22	0.38	0.29	0.39	0.39	0.34	0.25	0.26	0.42	0.33	0.16	0.12	0.33	0.31	0.42	0.33	0.40	0.39
C4'	0.26	0.33	0.14	0.15	0.32	0.25	0.39	0.32	0.43	0.39	0.40	0.35	0.27	0.43	0.32	0.15	0.15	0.34	0.33	0.49	0.37	0.42	0.43
C5	0.29	0.20	0.15	0.15	0.28	0.25	0.33	0.31	0.31	0.38	0.25	0.18	0.20	0.38	0.33	0.16	0.13	0.38	0.32	0.34	0.34	0.40	0.40
C5'	0.30	0.29	0.21	0.25	0.30	0.34	0.37	0.41	0.39	0.40	0.36	0.31	0.25	0.41	0.33	0.25	0.27	0.41	0.39	0.44	0.45	0.46	0.49
C6	0.30	0.21	0.16	0.16	0.30	0.24	0.34	0.30	0.32	0.38	0.26	0.18	0.22	0.38	0.34	0.18	0.13	0.38	0.31	0.33	0.31	0.38	0.37
C8	0.29	0.19	0.15	0.15	0.26	0.27	0.31	0.34	0.30	0.38	0.24	0.20	0.19	0.38	0.31	0.16	0.15	0.40	0.35	0.33	0.39	0.43	0.45
N1	0.27	0.30	0.17	0.16	0.36	0.20	0.40	0.26	0.40	0.39	0.35	0.25	0.30	0.42	0.36	0.19	0.14	0.30	0.27	0.42	0.27	0.35	0.32
N3	0.25	0.39	0.18	0.17	0.38	0.20	0.45	0.26	0.48	0.40	0.45	0.37	0.34	0.46	0.35	0.18	0.14	0.27	0.29	0.52	0.30	0.38	0.35
N6	0.33	0.20	0.19	0.19	0.28	0.29	0.30	0.33	0.27	0.38	0.23	0.20	0.21	0.36	0.33	0.22	0.18	0.44	0.34	0.28	0.33	0.38	0.39
N7	0.30	0.17	0.16	0.17	0.26	0.28	0.30	0.35	0.27	0.38	0.21	0.18	0.18	0.37	0.32	0.17	0.16	0.42	0.36	0.29	0.38	0.43	0.45
N9	0.27	0.26	0.15	0.15	0.30	0.24	0.36	0.31	0.37	0.39	0.31	0.24	0.23	0.41	0.32	0.15	0.12	0.35	0.32	0.40	0.36	0.42	0.42
O2'	0.32	0.45	0.27	0.26	0.42	0.25	0.49	0.31	0.54	0.44	0.52	0.47	0.39	0.50	0.39	0.22	0.22	0.33	0.34	0.59	0.35	0.44	0.41
O3'	0.28	0.42	0.19	0.17	0.37	0.23	0.43	0.28	0.49	0.39	0.48	0.45	0.35	0.44	0.34	0.15	0.15	0.33	0.29	0.54	0.30	0.37	0.35
O4'	0.26	0.30	0.15	0.16	0.32	0.25	0.39	0.33	0.42	0.41	0.37	0.30	0.26	0.44	0.33	0.16	0.15	0.35	0.35	0.47	0.40	0.46	0.46
O5'	0.43	0.42	0.47	0.48	0.39	0.49	0.39	0.53	0.40	0.41	0.41	0.46	0.40	0.40	0.40	0.52	0.52	0.48	0.48	0.42	0.52	0.47	0.53
OP1	0.89	0.55	0.88	0.94	0.69	1.01	0.67	1.06	0.60	0.82	0.54	0.51	0.63	0.75	0.80	0.92	0.96	1.01	1.00	0.59	1.06	0.97	1.04
OP2	1.01	0.62	1.08	1.16	0.76	1.22	0.71	1.29	0.61	0.89	0.57	0.59	0.72	0.79	0.89	1.14	1.22	1.13	1.19	0.57	1.32	1.13	1.26
P	0.69	0.42	0.72	0.76	0.51	0.82	0.49	0.88	0.43	0.61	0.40	0.41	0.49	0.54	0.61	0.76	0.80	0.79	0.80	0.42	0.88	0.77	0.87

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.06	0.02	0.02	0.03	0.04	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.16	0.03	0.21	0.14	0.14
C2	0.03	0.00	0.10	0.09	0.02	0.05	0.01	0.16	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.15	0.12	0.04	0.19	0.03	0.22	0.24	0.18
C2'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.05	0.02	0.03	0.02	0.05	0.05	0.08	0.12	0.10	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.11	0.05	0.25	0.23	0.16
C3'	0.02	0.09	0.00	0.00	0.07	0.01	0.09	0.02	0.09	0.13	0.08	0.11	0.08	0.12	0.07	0.02	0.01	0.01	0.09	0.09	0.27	0.22	0.15
C4	0.02	0.02	0.05	0.07	0.00	0.06	0.00	0.18	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.08	0.03	0.18	0.01	0.19	0.18	0.15
C4'	0.01	0.05	0.02	0.01	0.06	0.00	0.09	0.01	0.08	0.12	0.07	0.06	0.05	0.12	0.06	0.06	0.02	0.01	0.02	0.10	0.17	0.10	0.04
C5	0.02	0.01	0.03	0.09	0.00	0.09	0.00	0.24	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.06	0.11	0.04	0.19	0.01	0.18	0.20	0.17
C5'	0.06	0.16	0.02	0.02	0.18	0.01	0.24	0.00	0.24	0.26	0.21	0.14	0.14	0.28	0.17	0.05	0.05	0.02	0.01	0.27	0.20	0.13	0.02
C6	0.02	0.01	0.05	0.09	0.01	0.08	0.01	0.24	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.09	0.11	0.04	0.20	0.01	0.20	0.23	0.19
C8	0.02	0.01	0.05	0.13	0.01	0.12	0.01	0.26	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.16	0.04	0.19	0.02	0.16	0.17	0.15
N1	0.03	0.00	0.08	0.08	0.02	0.07	0.01	0.21	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.12	0.11	0.05	0.20	0.02	0.22	0.25	0.19
N2	0.04	0.01	0.12	0.11	0.01	0.06	0.02	0.14	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.18	0.16	0.04	0.19	0.03	0.24	0.26	0.19
N3	0.03	0.00	0.10	0.08	0.01	0.05	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.11	0.04	0.18	0.02	0.21	0.21	0.16
N7	0.02	0.01	0.04	0.12	0.01	0.12	0.00	0.28	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.16	0.04	0.19	0.02	0.18	0.21	0.17
N9	0.01	0.02	0.02	0.07	0.01	0.06	0.02	0.17	0.02	0.00	0.03	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.07	0.02	0.17	0.02	0.18	0.15	0.14
O2'	0.02	0.15	0.00	0.02	0.08	0.06	0.06	0.05	0.09	0.04	0.12	0.18	0.14	0.03	0.02	0.00	0.06	0.06	0.05	0.08	0.19	0.19	0.09
O3'	0.02	0.12	0.02	0.01	0.08	0.02	0.11	0.05	0.11	0.16	0.11	0.16	0.11	0.16	0.07	0.06	0.00	0.02	0.15	0.13	0.29	0.28	0.19
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.03	0.01	0.04	0.02	0.04	0.04	0.05	0.04	0.04	0.04	0.02	0.06	0.02	0.00	0.18	0.05	0.22	0.14	0.17
O5'	0.16	0.19	0.11	0.09	0.18	0.02	0.19	0.01	0.20	0.19	0.20	0.19	0.18	0.19	0.17	0.05	0.15	0.18	0.00	0.21	0.02	0.02	0.01
O6	0.03	0.03	0.05	0.09	0.01	0.10	0.01	0.27	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.02	0.08	0.13	0.05	0.21	0.00	0.22	0.25	0.21
OP1	0.21	0.22	0.25	0.27	0.19	0.17	0.18	0.20	0.20	0.16	0.22	0.24	0.21	0.18	0.18	0.19	0.29	0.22	0.02	0.22	0.00	0.01	0.01
OP2	0.14	0.24	0.23	0.22	0.18	0.10	0.20	0.13	0.23	0.17	0.25	0.26	0.21	0.21	0.15	0.19	0.28	0.14	0.02	0.25	0.01	0.00	0.01
P	0.14	0.18	0.16	0.15	0.15	0.04	0.17	0.02	0.19	0.15	0.19	0.19	0.16	0.17	0.14	0.09	0.19	0.17	0.01	0.21	0.01	0.01	0.00