Doublet Group distance statistics: 48255

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 1, 2, 4, 1, 2, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.013, 0.023, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.013 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.006, 0.018, 0.030, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.018 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.007, 0.019, 0.031, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.019 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.008, 0.021, 0.034, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.021 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.007, 0.020, 0.033, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.020 std_dev=0.013
C2	A	0, -0.002, 0.014, 0.031, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.014 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.007, 0.026, 0.044, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.026 std_dev=0.019
C1'	A	0, 0.001, 0.021, 0.042, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.021 std_dev=0.020
N6	A	0, 0.020, 0.043, 0.066, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.043 std_dev=0.023
N7	A	0, 0.010, 0.040, 0.069, 0.115 max_d=0.115 avg_d=0.040 std_dev=0.030
C8	A	0, 0.010, 0.042, 0.074, 0.122 max_d=0.122 avg_d=0.042 std_dev=0.032
O4'	A	0, 0.032, 0.258, 0.485, 0.614 max_d=0.614 avg_d=0.258 std_dev=0.227
C2'	A	0, 0.050, 0.281, 0.513, 0.750 max_d=0.750 avg_d=0.281 std_dev=0.232
O2'	B	0, 0.334, 0.567, 0.799, 0.890 max_d=0.890 avg_d=0.567 std_dev=0.232
C2'	B	0, 0.281, 0.544, 0.807, 0.954 max_d=0.954 avg_d=0.544 std_dev=0.263
C4'	A	0, 0.052, 0.394, 0.735, 0.961 max_d=0.961 avg_d=0.394 std_dev=0.341
O2'	A	0, 0.060, 0.433, 0.807, 1.540 max_d=1.540 avg_d=0.433 std_dev=0.373
C1'	B	0, 0.250, 0.643, 1.035, 1.777 max_d=1.777 avg_d=0.643 std_dev=0.393
C3'	A	0, 0.049, 0.467, 0.884, 1.246 max_d=1.246 avg_d=0.467 std_dev=0.417
O4'	B	0, 0.311, 0.834, 1.356, 2.340 max_d=2.340 avg_d=0.834 std_dev=0.523
C4'	B	0, 0.302, 0.832, 1.362, 2.193 max_d=2.193 avg_d=0.832 std_dev=0.530
C3'	B	0, 0.157, 0.742, 1.326, 2.690 max_d=2.690 avg_d=0.742 std_dev=0.584
C5'	A	0, 0.093, 0.693, 1.292, 1.612 max_d=1.612 avg_d=0.693 std_dev=0.599
N9	B	0, 0.211, 0.834, 1.457, 2.600 max_d=2.600 avg_d=0.834 std_dev=0.623
O5'	A	0, 0.089, 0.719, 1.348, 2.080 max_d=2.080 avg_d=0.719 std_dev=0.630
C5'	B	0, 0.399, 1.053, 1.708, 2.715 max_d=2.715 avg_d=1.053 std_dev=0.655
O3'	A	0, 0.039, 0.707, 1.376, 2.324 max_d=2.324 avg_d=0.707 std_dev=0.669
N3	B	0, 0.201, 0.921, 1.641, 2.930 max_d=2.930 avg_d=0.921 std_dev=0.720
C4	B	0, 0.173, 0.949, 1.726, 3.122 max_d=3.122 avg_d=0.949 std_dev=0.776
C8	B	0, 0.261, 1.037, 1.813, 3.114 max_d=3.114 avg_d=1.037 std_dev=0.776
O5'	B	0, 0.338, 1.115, 1.893, 3.121 max_d=3.121 avg_d=1.115 std_dev=0.778
N2	B	0, 0.299, 1.181, 2.063, 3.626 max_d=3.626 avg_d=1.181 std_dev=0.882
C2	B	0, 0.202, 1.105, 2.009, 3.647 max_d=3.647 avg_d=1.105 std_dev=0.904
O3'	B	0, 0.146, 1.085, 2.024, 4.157 max_d=4.157 avg_d=1.085 std_dev=0.939
OP1	B	0, 0.487, 1.455, 2.422, 3.876 max_d=3.876 avg_d=1.455 std_dev=0.967
N7	B	0, 0.274, 1.253, 2.232, 3.861 max_d=3.861 avg_d=1.253 std_dev=0.979
P	A	0, 0.154, 1.138, 2.123, 2.769 max_d=2.769 avg_d=1.138 std_dev=0.984
C5	B	0, 0.204, 1.189, 2.175, 3.908 max_d=3.908 avg_d=1.189 std_dev=0.986
P	B	0, 0.409, 1.466, 2.523, 4.099 max_d=4.099 avg_d=1.466 std_dev=1.057
OP2	A	0, 0.094, 1.158, 2.223, 4.147 max_d=4.147 avg_d=1.158 std_dev=1.064
N1	B	0, 0.171, 1.302, 2.433, 4.472 max_d=4.472 avg_d=1.302 std_dev=1.131
C6	B	0, 0.199, 1.382, 2.566, 4.660 max_d=4.660 avg_d=1.382 std_dev=1.183
OP2	B	0, 0.345, 1.667, 2.989, 4.600 max_d=4.600 avg_d=1.667 std_dev=1.322
OP1	A	0, 0.085, 1.431, 2.778, 4.519 max_d=4.519 avg_d=1.431 std_dev=1.347
O6	B	0, 0.275, 1.650, 3.025, 5.440 max_d=5.440 avg_d=1.650 std_dev=1.375

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.04	0.03	0.01	0.04	0.04	0.04	0.01	0.01	0.02	0.08	0.01	0.10	0.25	0.20	0.24
C2	0.05	0.00	0.21	0.15	0.02	0.06	0.02	0.11	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	0.42	0.25	0.09	0.19	0.37	0.30	0.38
C2'	0.01	0.21	0.00	0.00	0.12	0.01	0.08	0.08	0.12	0.09	0.18	0.21	0.10	0.05	0.03	0.01	0.02	0.01	0.18	0.17	0.24	0.24
C3'	0.02	0.15	0.00	0.00	0.08	0.00	0.12	0.02	0.10	0.24	0.11	0.14	0.12	0.21	0.11	0.03	0.01	0.02	0.08	0.08	0.14	0.11
C4	0.02	0.02	0.12	0.08	0.00	0.03	0.01	0.08	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.26	0.10	0.05	0.15	0.32	0.28	0.32
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.05	0.09	0.05	0.05	0.06	0.08	0.04	0.15	0.02	0.01	0.02	0.11	0.09	0.10
C5	0.02	0.02	0.08	0.12	0.01	0.05	0.00	0.09	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.23	0.09	0.04	0.14	0.32	0.33	0.32
C5'	0.04	0.11	0.08	0.02	0.08	0.01	0.09	0.00	0.10	0.09	0.11	0.10	0.11	0.10	0.06	0.09	0.09	0.02	0.01	0.10	0.08	0.02
C6	0.03	0.01	0.12	0.10	0.02	0.05	0.02	0.10	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.30	0.11	0.06	0.16	0.35	0.33	0.35
C8	0.01	0.03	0.09	0.24	0.01	0.09	0.01	0.09	0.02	0.00	0.03	0.02	0.04	0.00	0.01	0.08	0.22	0.04	0.13	0.24	0.36	0.24
N1	0.04	0.01	0.18	0.11	0.02	0.05	0.02	0.11	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.38	0.17	0.08	0.18	0.37	0.32	0.38
N3	0.04	0.01	0.21	0.14	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.39	0.24	0.09	0.18	0.35	0.28	0.35
N6	0.04	0.01	0.10	0.12	0.02	0.06	0.02	0.11	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.04	0.04	0.28	0.12	0.06	0.16	0.35	0.37	0.35
N7	0.01	0.03	0.05	0.21	0.01	0.08	0.01	0.10	0.02	0.00	0.03	0.01	0.04	0.00	0.01	0.13	0.20	0.02	0.14	0.27	0.39	0.27
N9	0.01	0.03	0.03	0.11	0.01	0.04	0.01	0.06	0.03	0.01	0.03	0.02	0.04	0.01	0.00	0.11	0.05	0.01	0.11	0.27	0.26	0.27
O2'	0.02	0.42	0.01	0.03	0.26	0.15	0.23	0.09	0.30	0.08	0.38	0.39	0.28	0.13	0.11	0.00	0.04	0.10	0.12	0.10	0.22	0.18
O3'	0.08	0.25	0.02	0.01	0.10	0.02	0.09	0.09	0.11	0.22	0.17	0.24	0.12	0.20	0.05	0.04	0.00	0.06	0.15	0.27	0.15	0.17
O4'	0.01	0.09	0.01	0.02	0.05	0.01	0.04	0.02	0.06	0.04	0.08	0.09	0.06	0.02	0.01	0.10	0.06	0.00	0.05	0.28	0.17	0.21
O5'	0.10	0.19	0.18	0.08	0.15	0.02	0.14	0.01	0.16	0.13	0.18	0.18	0.16	0.14	0.11	0.12	0.15	0.05	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.25	0.37	0.17	0.08	0.32	0.11	0.32	0.10	0.35	0.24	0.37	0.35	0.35	0.27	0.27	0.10	0.27	0.28	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.20	0.30	0.24	0.14	0.28	0.09	0.33	0.08	0.33	0.36	0.32	0.28	0.37	0.39	0.26	0.22	0.15	0.17	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.24	0.38	0.24	0.11	0.32	0.10	0.32	0.02	0.35	0.24	0.38	0.35	0.35	0.27	0.27	0.18	0.17	0.21	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.33	0.43	0.20	0.34	0.38	0.38	0.39	0.39	0.43	0.35	0.45	0.46	0.39	0.37	0.35	0.19	0.69	0.41	0.36	0.44	0.41	0.40	0.40
C2	0.33	0.33	0.16	0.35	0.27	0.39	0.25	0.42	0.28	0.26	0.32	0.39	0.31	0.24	0.28	0.19	0.66	0.43	0.35	0.28	0.42	0.40	0.40
C2'	0.39	0.44	0.21	0.39	0.42	0.45	0.43	0.48	0.46	0.42	0.46	0.46	0.42	0.43	0.41	0.19	0.75	0.49	0.46	0.47	0.51	0.48	0.51
C3'	0.34	0.44	0.22	0.34	0.41	0.39	0.45	0.41	0.48	0.41	0.48	0.45	0.40	0.44	0.38	0.17	0.70	0.42	0.43	0.51	0.46	0.52	0.49
C4	0.33	0.39	0.19	0.33	0.34	0.36	0.34	0.37	0.36	0.31	0.39	0.43	0.36	0.32	0.32	0.19	0.66	0.39	0.34	0.37	0.39	0.38	0.38
C4'	0.32	0.42	0.22	0.31	0.38	0.35	0.41	0.36	0.45	0.36	0.45	0.43	0.38	0.40	0.35	0.18	0.66	0.39	0.36	0.47	0.39	0.42	0.41
C5	0.32	0.39	0.20	0.30	0.34	0.33	0.34	0.34	0.36	0.32	0.39	0.42	0.36	0.32	0.32	0.18	0.62	0.37	0.33	0.37	0.37	0.38	0.36
C5'	0.33	0.43	0.28	0.31	0.39	0.35	0.42	0.36	0.46	0.38	0.47	0.45	0.39	0.41	0.36	0.25	0.61	0.40	0.36	0.50	0.38	0.43	0.41
C6	0.31	0.33	0.18	0.30	0.29	0.33	0.28	0.34	0.30	0.28	0.32	0.37	0.32	0.27	0.29	0.19	0.60	0.36	0.31	0.30	0.37	0.37	0.35
C8	0.32	0.46	0.21	0.30	0.40	0.34	0.43	0.35	0.47	0.37	0.48	0.49	0.41	0.41	0.36	0.18	0.63	0.38	0.36	0.49	0.39	0.41	0.39
N1	0.32	0.31	0.16	0.34	0.26	0.37	0.24	0.39	0.26	0.25	0.30	0.37	0.29	0.23	0.27	0.19	0.63	0.41	0.33	0.26	0.40	0.39	0.38
N3	0.33	0.36	0.17	0.35	0.31	0.38	0.29	0.40	0.32	0.28	0.36	0.42	0.34	0.27	0.30	0.19	0.67	0.42	0.34	0.32	0.41	0.38	0.39
N6	0.29	0.30	0.18	0.26	0.28	0.29	0.27	0.30	0.28	0.27	0.30	0.32	0.30	0.27	0.28	0.18	0.50	0.32	0.29	0.28	0.34	0.37	0.33
N7	0.32	0.45	0.21	0.29	0.40	0.33	0.41	0.34	0.44	0.37	0.46	0.47	0.41	0.39	0.36	0.18	0.60	0.37	0.36	0.45	0.38	0.40	0.38
N9	0.33	0.43	0.20	0.33	0.37	0.36	0.39	0.37	0.42	0.34	0.44	0.46	0.39	0.36	0.34	0.18	0.67	0.39	0.35	0.43	0.39	0.39	0.39
O2'	0.53	0.48	0.36	0.53	0.49	0.62	0.49	0.64	0.48	0.51	0.49	0.48	0.49	0.49	0.51	0.37	0.84	0.64	0.59	0.49	0.66	0.56	0.63
O3'	0.35	0.45	0.22	0.35	0.43	0.42	0.47	0.45	0.51	0.44	0.50	0.46	0.41	0.48	0.40	0.18	0.72	0.45	0.48	0.55	0.52	0.59	0.56
O4'	0.31	0.42	0.22	0.32	0.36	0.34	0.39	0.34	0.43	0.34	0.45	0.45	0.37	0.37	0.33	0.21	0.65	0.38	0.33	0.46	0.36	0.38	0.36
O5'	0.36	0.48	0.33	0.32	0.43	0.37	0.47	0.38	0.51	0.42	0.52	0.50	0.43	0.46	0.40	0.29	0.56	0.42	0.37	0.55	0.39	0.44	0.42
OP1	0.44	0.62	0.40	0.45	0.53	0.46	0.57	0.47	0.64	0.50	0.66	0.69	0.55	0.55	0.49	0.45	0.73	0.49	0.50	0.68	0.53	0.59	0.55
OP2	0.45	0.62	0.46	0.49	0.53	0.47	0.57	0.46	0.63	0.50	0.66	0.68	0.55	0.55	0.49	0.47	0.74	0.48	0.50	0.67	0.52	0.61	0.54
P	0.46	0.57	0.43	0.48	0.50	0.49	0.52	0.48	0.56	0.47	0.58	0.63	0.53	0.50	0.47	0.46	0.75	0.51	0.48	0.59	0.50	0.52	0.50

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.19	0.01	0.14	0.02	0.17	0.28	0.19
C2	0.01	0.00	0.16	0.17	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.15	0.25	0.08	0.16	0.01	0.24	0.43	0.28
C2'	0.00	0.16	0.00	0.01	0.09	0.02	0.07	0.13	0.10	0.08	0.14	0.20	0.15	0.06	0.03	0.01	0.03	0.02	0.22	0.10	0.32	0.37	0.29
C3'	0.01	0.17	0.01	0.00	0.16	0.00	0.21	0.02	0.22	0.21	0.20	0.17	0.13	0.24	0.14	0.03	0.00	0.02	0.10	0.25	0.14	0.10	0.08
C4	0.01	0.01	0.09	0.16	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.15	0.15	0.05	0.15	0.02	0.23	0.40	0.27
C4'	0.01	0.03	0.02	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.06	0.10	0.04	0.03	0.03	0.10	0.05	0.19	0.03	0.00	0.01	0.07	0.10	0.07	0.03
C5	0.01	0.01	0.07	0.21	0.00	0.07	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.20	0.14	0.04	0.16	0.01	0.30	0.46	0.31
C5'	0.06	0.08	0.13	0.02	0.08	0.01	0.11	0.00	0.11	0.12	0.09	0.07	0.07	0.14	0.08	0.10	0.14	0.02	0.01	0.13	0.10	0.03	0.01
C6	0.02	0.01	0.10	0.22	0.01	0.06	0.01	0.11	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.21	0.18	0.06	0.17	0.01	0.34	0.48	0.33
C8	0.01	0.01	0.08	0.21	0.00	0.10	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.18	0.14	0.04	0.16	0.02	0.26	0.39	0.29
N1	0.02	0.01	0.14	0.20	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.19	0.22	0.08	0.17	0.01	0.30	0.47	0.31
N2	0.02	0.01	0.20	0.17	0.01	0.03	0.01	0.07	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.14	0.30	0.09	0.15	0.03	0.23	0.43	0.27
N3	0.01	0.01	0.15	0.13	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.25	0.07	0.15	0.01	0.21	0.39	0.25
N7	0.00	0.01	0.06	0.24	0.01	0.10	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.21	0.18	0.03	0.17	0.02	0.33	0.47	0.33
N9	0.01	0.01	0.03	0.14	0.00	0.05	0.01	0.08	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.13	0.08	0.01	0.14	0.02	0.20	0.35	0.24
O2'	0.02	0.15	0.01	0.03	0.15	0.19	0.20	0.10	0.21	0.18	0.19	0.14	0.12	0.21	0.13	0.00	0.07	0.13	0.15	0.23	0.27	0.41	0.25
O3'	0.19	0.25	0.03	0.00	0.15	0.03	0.14	0.14	0.18	0.14	0.22	0.30	0.25	0.18	0.08	0.07	0.00	0.13	0.22	0.21	0.31	0.25	0.25
O4'	0.01	0.08	0.02	0.02	0.05	0.00	0.04	0.02	0.06	0.04	0.08	0.09	0.07	0.03	0.01	0.13	0.13	0.00	0.11	0.05	0.11	0.22	0.15
O5'	0.14	0.16	0.22	0.10	0.15	0.01	0.16	0.01	0.17	0.16	0.17	0.15	0.15	0.17	0.14	0.15	0.22	0.11	0.00	0.18	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.10	0.25	0.02	0.07	0.01	0.13	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.23	0.21	0.05	0.18	0.00	0.39	0.50	0.36
OP1	0.17	0.24	0.32	0.14	0.23	0.10	0.30	0.10	0.34	0.26	0.30	0.23	0.21	0.33	0.20	0.27	0.31	0.11	0.02	0.39	0.00	0.02	0.01
OP2	0.28	0.43	0.37	0.10	0.40	0.07	0.46	0.03	0.48	0.39	0.47	0.43	0.39	0.47	0.35	0.41	0.25	0.22	0.02	0.50	0.02	0.00	0.01
P	0.19	0.28	0.29	0.08	0.27	0.03	0.31	0.01	0.33	0.29	0.31	0.27	0.25	0.33	0.24	0.25	0.25	0.15	0.01	0.36	0.01	0.01	0.00