Doublet Group distance statistics: 48256

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 4, 3, 2, 2, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.006, 0.012, 0.019, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.012 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.011, 0.018, 0.025, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.018 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.007, 0.014, 0.022, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.004, 0.013, 0.022, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.013 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.010, 0.019, 0.029, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.019 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.011, 0.021, 0.032, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.021 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.007, 0.018, 0.029, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.018 std_dev=0.011
N9	A	0, 0.010, 0.021, 0.032, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.021 std_dev=0.011
N7	A	0, 0.011, 0.027, 0.043, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.027 std_dev=0.016
C8	A	0, 0.014, 0.032, 0.050, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.032 std_dev=0.018
N6	A	0, 0.012, 0.034, 0.056, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.034 std_dev=0.022
N9	B	0, 0.234, 0.383, 0.531, 0.588 max_d=0.588 avg_d=0.383 std_dev=0.148
C1'	B	0, 0.243, 0.391, 0.540, 0.574 max_d=0.574 avg_d=0.391 std_dev=0.149
C4	B	0, 0.231, 0.386, 0.540, 0.605 max_d=0.605 avg_d=0.386 std_dev=0.155
N3	B	0, 0.207, 0.373, 0.540, 0.667 max_d=0.667 avg_d=0.373 std_dev=0.167
C8	B	0, 0.276, 0.456, 0.636, 0.684 max_d=0.684 avg_d=0.456 std_dev=0.180
O4'	B	0, 0.290, 0.474, 0.658, 0.781 max_d=0.781 avg_d=0.474 std_dev=0.184
C2	B	0, 0.205, 0.392, 0.580, 0.697 max_d=0.697 avg_d=0.392 std_dev=0.188
N2	B	0, 0.222, 0.424, 0.627, 0.788 max_d=0.788 avg_d=0.424 std_dev=0.203
C5	B	0, 0.268, 0.484, 0.700, 0.749 max_d=0.749 avg_d=0.484 std_dev=0.216
C2'	B	0, 0.393, 0.613, 0.832, 0.896 max_d=0.896 avg_d=0.613 std_dev=0.219
N7	B	0, 0.306, 0.545, 0.784, 0.828 max_d=0.828 avg_d=0.545 std_dev=0.239
N1	B	0, 0.227, 0.469, 0.711, 0.852 max_d=0.852 avg_d=0.469 std_dev=0.242
C4'	B	0, 0.411, 0.681, 0.951, 1.126 max_d=1.126 avg_d=0.681 std_dev=0.270
O2'	B	0, 0.441, 0.718, 0.996, 1.154 max_d=1.154 avg_d=0.718 std_dev=0.277
C6	B	0, 0.265, 0.551, 0.837, 0.923 max_d=0.923 avg_d=0.551 std_dev=0.286
C3'	B	0, 0.401, 0.691, 0.980, 1.100 max_d=1.100 avg_d=0.691 std_dev=0.290
C5'	B	0, 0.464, 0.845, 1.225, 1.369 max_d=1.369 avg_d=0.845 std_dev=0.381
O6	B	0, 0.318, 0.707, 1.095, 1.302 max_d=1.302 avg_d=0.707 std_dev=0.388
O5'	B	0, 0.490, 0.880, 1.271, 1.485 max_d=1.485 avg_d=0.880 std_dev=0.391
O4'	A	0, 0.184, 0.607, 1.030, 1.464 max_d=1.464 avg_d=0.607 std_dev=0.423
C2'	A	0, 0.142, 0.571, 1.001, 1.531 max_d=1.531 avg_d=0.571 std_dev=0.429
C4'	A	0, 0.410, 0.925, 1.440, 2.231 max_d=2.231 avg_d=0.925 std_dev=0.515
O3'	B	0, 1.114, 1.666, 2.218, 2.255 max_d=2.255 avg_d=1.666 std_dev=0.552
O2'	A	0, 0.759, 1.321, 1.882, 2.431 max_d=2.431 avg_d=1.321 std_dev=0.562
P	B	0, 0.617, 1.215, 1.814, 2.008 max_d=2.008 avg_d=1.215 std_dev=0.599
C3'	A	0, 0.414, 1.029, 1.643, 2.010 max_d=2.010 avg_d=1.029 std_dev=0.614
OP2	B	0, 0.572, 1.205, 1.837, 2.134 max_d=2.134 avg_d=1.205 std_dev=0.632
OP1	B	0, 0.733, 1.558, 2.383, 2.882 max_d=2.882 avg_d=1.558 std_dev=0.825
C5'	A	0, 0.853, 1.721, 2.590, 3.468 max_d=3.468 avg_d=1.721 std_dev=0.868
O5'	A	0, 1.402, 2.423, 3.443, 3.637 max_d=3.637 avg_d=2.423 std_dev=1.020
O3'	A	0, 0.071, 1.446, 2.821, 3.248 max_d=3.248 avg_d=1.446 std_dev=1.375
P	A	0, 2.012, 3.416, 4.819, 5.595 max_d=5.595 avg_d=3.416 std_dev=1.403
OP2	A	0, 1.653, 3.586, 5.519, 6.198 max_d=6.198 avg_d=3.586 std_dev=1.933
OP1	A	0, 2.281, 4.219, 6.158, 7.620 max_d=7.620 avg_d=4.219 std_dev=1.939

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.07	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.35	0.00	0.38	0.50	0.44	0.41
C2	0.03	0.00	0.29	0.16	0.01	0.20	0.00	0.35	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.62	0.65	0.33	0.36	0.95	0.37	0.49
C2'	0.00	0.29	0.00	0.01	0.16	0.01	0.08	0.22	0.14	0.16	0.23	0.29	0.11	0.09	0.03	0.00	0.03	0.02	0.69	0.76	0.76	0.70
C3'	0.01	0.16	0.01	0.00	0.15	0.01	0.26	0.01	0.23	0.42	0.16	0.15	0.29	0.40	0.21	0.02	0.01	0.02	0.38	0.43	0.33	0.31
C4	0.02	0.01	0.16	0.15	0.00	0.14	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.43	0.35	0.17	0.32	0.69	0.51	0.39
C4'	0.01	0.20	0.01	0.01	0.14	0.00	0.13	0.00	0.16	0.10	0.19	0.18	0.16	0.11	0.08	0.31	0.02	0.01	0.01	0.19	0.20	0.03
C5	0.01	0.00	0.08	0.26	0.00	0.13	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.41	0.15	0.08	0.41	0.80	0.72	0.52
C5'	0.07	0.35	0.22	0.01	0.18	0.00	0.16	0.00	0.24	0.17	0.32	0.29	0.22	0.13	0.06	0.09	0.24	0.01	0.01	0.39	0.37	0.01
C6	0.02	0.01	0.14	0.23	0.01	0.16	0.01	0.24	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.51	0.25	0.15	0.34	0.82	0.65	0.45
C8	0.01	0.01	0.16	0.42	0.00	0.10	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.21	0.24	0.18	0.74	1.08	0.98	0.89
N1	0.02	0.01	0.23	0.16	0.01	0.19	0.01	0.32	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.60	0.48	0.26	0.32	0.91	0.47	0.45
N3	0.03	0.00	0.29	0.15	0.00	0.18	0.01	0.29	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.57	0.65	0.32	0.32	0.82	0.33	0.42
N6	0.02	0.01	0.11	0.29	0.02	0.16	0.01	0.22	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.49	0.15	0.11	0.38	0.87	0.77	0.51
N7	0.01	0.01	0.09	0.40	0.00	0.11	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.29	0.18	0.09	0.65	1.05	1.00	0.81
N9	0.00	0.01	0.03	0.21	0.01	0.08	0.01	0.06	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.22	0.15	0.01	0.46	0.70	0.63	0.53
O2'	0.02	0.62	0.00	0.02	0.43	0.31	0.41	0.09	0.51	0.21	0.60	0.57	0.49	0.29	0.22	0.00	0.04	0.21	0.38	0.56	0.67	0.48
O3'	0.35	0.65	0.03	0.01	0.35	0.02	0.15	0.24	0.25	0.24	0.48	0.65	0.15	0.18	0.15	0.04	0.00	0.23	0.48	0.66	0.63	0.52
O4'	0.00	0.33	0.02	0.02	0.17	0.01	0.08	0.01	0.15	0.18	0.26	0.32	0.11	0.09	0.01	0.21	0.23	0.00	0.26	0.40	0.21	0.29
O5'	0.38	0.36	0.69	0.38	0.32	0.01	0.41	0.01	0.34	0.74	0.32	0.32	0.38	0.65	0.46	0.38	0.48	0.26	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.50	0.95	0.76	0.43	0.69	0.19	0.80	0.39	0.82	1.08	0.91	0.82	0.87	1.05	0.70	0.56	0.66	0.40	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.44	0.37	0.76	0.33	0.51	0.20	0.72	0.37	0.65	0.98	0.47	0.33	0.77	1.00	0.63	0.67	0.63	0.21	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.41	0.49	0.70	0.31	0.39	0.03	0.52	0.01	0.45	0.89	0.45	0.42	0.51	0.81	0.53	0.48	0.52	0.29	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.08	0.14	0.10	0.23	0.09	0.26	0.10	0.29	0.14	0.08	0.16	0.18	0.10	0.09	0.08	0.17	0.35	0.17	0.16	0.15	0.17	0.14	0.20
C2	0.09	0.12	0.10	0.21	0.10	0.27	0.12	0.33	0.13	0.13	0.12	0.16	0.10	0.14	0.11	0.15	0.29	0.16	0.24	0.14	0.27	0.24	0.31
C2'	0.07	0.18	0.09	0.20	0.11	0.21	0.14	0.21	0.18	0.10	0.21	0.22	0.13	0.12	0.09	0.18	0.35	0.13	0.11	0.21	0.14	0.12	0.13
C3'	0.42	0.41	0.48	0.48	0.42	0.43	0.42	0.42	0.41	0.43	0.41	0.40	0.42	0.43	0.42	0.55	0.55	0.38	0.37	0.41	0.36	0.43	0.38
C4	0.07	0.13	0.08	0.20	0.08	0.25	0.09	0.28	0.11	0.09	0.12	0.17	0.10	0.10	0.08	0.16	0.31	0.16	0.16	0.11	0.17	0.15	0.21
C4'	0.27	0.12	0.34	0.48	0.11	0.47	0.10	0.47	0.15	0.15	0.18	0.16	0.10	0.11	0.18	0.35	0.57	0.33	0.34	0.20	0.37	0.31	0.35
C5	0.06	0.12	0.07	0.17	0.08	0.22	0.09	0.24	0.10	0.08	0.11	0.15	0.10	0.09	0.08	0.16	0.30	0.15	0.13	0.11	0.12	0.13	0.17
C5'	0.41	0.24	0.56	0.74	0.09	0.67	0.14	0.64	0.32	0.16	0.38	0.33	0.09	0.10	0.21	0.60	0.88	0.45	0.49	0.43	0.56	0.42	0.48
C6	0.06	0.11	0.07	0.17	0.09	0.23	0.10	0.26	0.12	0.10	0.12	0.14	0.10	0.11	0.08	0.15	0.28	0.16	0.15	0.13	0.15	0.16	0.21
C8	0.06	0.14	0.07	0.18	0.10	0.21	0.11	0.21	0.14	0.08	0.15	0.17	0.11	0.10	0.08	0.17	0.32	0.15	0.10	0.14	0.09	0.12	0.12
N1	0.08	0.12	0.09	0.20	0.10	0.25	0.13	0.31	0.14	0.14	0.13	0.15	0.10	0.15	0.11	0.15	0.28	0.16	0.22	0.15	0.24	0.23	0.29
N3	0.08	0.12	0.10	0.22	0.09	0.27	0.10	0.32	0.11	0.11	0.12	0.17	0.10	0.11	0.09	0.15	0.31	0.16	0.22	0.12	0.24	0.20	0.28
N6	0.06	0.12	0.07	0.15	0.09	0.20	0.12	0.22	0.13	0.10	0.13	0.13	0.10	0.12	0.08	0.15	0.26	0.16	0.11	0.14	0.10	0.14	0.17
N7	0.06	0.13	0.07	0.15	0.09	0.20	0.10	0.20	0.12	0.08	0.13	0.16	0.11	0.09	0.08	0.17	0.30	0.15	0.09	0.12	0.08	0.12	0.11
N9	0.07	0.14	0.08	0.20	0.09	0.24	0.10	0.26	0.12	0.08	0.14	0.18	0.10	0.09	0.08	0.17	0.33	0.16	0.14	0.13	0.13	0.13	0.17
O2'	0.42	0.46	0.38	0.44	0.44	0.49	0.45	0.52	0.47	0.44	0.47	0.46	0.44	0.44	0.43	0.36	0.53	0.49	0.50	0.48	0.49	0.47	0.51
O3'	0.10	0.36	0.14	0.19	0.25	0.22	0.32	0.24	0.40	0.21	0.42	0.40	0.26	0.29	0.18	0.27	0.34	0.14	0.11	0.46	0.16	0.14	0.13
O4'	0.16	0.24	0.20	0.39	0.10	0.44	0.15	0.46	0.25	0.08	0.30	0.32	0.12	0.11	0.08	0.17	0.48	0.29	0.30	0.30	0.33	0.23	0.32
O5'	0.31	0.95	0.39	0.70	0.62	0.63	0.80	0.62	1.06	0.49	1.14	1.08	0.64	0.69	0.42	0.38	0.91	0.43	0.46	1.20	0.50	0.28	0.43
OP1	0.95	1.60	1.01	1.41	1.20	1.36	1.43	1.38	1.80	1.08	1.90	1.76	1.21	1.31	1.01	0.88	1.63	1.11	1.19	2.02	1.26	0.92	1.16
OP2	0.41	1.53	0.29	0.52	1.09	0.38	1.38	0.41	1.75	0.92	1.84	1.66	1.10	1.24	0.78	0.42	0.80	0.47	0.46	1.96	0.42	0.58	0.44
P	0.43	1.27	0.54	0.92	0.82	0.79	1.08	0.77	1.44	0.66	1.54	1.44	0.85	0.93	0.56	0.54	1.19	0.54	0.62	1.64	0.67	0.41	0.56

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.09	0.00	0.07	0.01	0.17	0.14	0.08
C2	0.02	0.00	0.07	0.06	0.01	0.07	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.14	0.21	0.08	0.12	0.01	0.16	0.21	0.11
C2'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.04	0.01	0.05	0.04	0.05	0.06	0.06	0.08	0.06	0.05	0.03	0.00	0.03	0.01	0.10	0.05	0.24	0.17	0.10
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.02	0.08	0.03	0.09	0.06	0.07	0.02	0.01	0.01	0.01	0.08	0.03	0.24	0.23	0.12
C4	0.01	0.01	0.04	0.02	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.14	0.04	0.14	0.01	0.18	0.21	0.12
C4'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.03	0.09	0.04	0.10	0.07	0.08	0.03	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.14	0.11	0.04
C5	0.01	0.01	0.05	0.03	0.00	0.03	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.05	0.10	0.02	0.19	0.01	0.22	0.25	0.17
C5'	0.03	0.07	0.04	0.01	0.06	0.00	0.10	0.00	0.10	0.15	0.08	0.09	0.06	0.15	0.07	0.04	0.03	0.01	0.01	0.12	0.09	0.04	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01	0.03	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.13	0.03	0.19	0.00	0.21	0.27	0.18
C8	0.01	0.01	0.06	0.08	0.00	0.09	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.07	0.03	0.06	0.22	0.02	0.24	0.24	0.19
N1	0.01	0.00	0.06	0.03	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.18	0.06	0.16	0.01	0.19	0.24	0.14
N2	0.03	0.01	0.08	0.09	0.01	0.10	0.02	0.09	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.17	0.25	0.10	0.10	0.02	0.14	0.20	0.09
N3	0.02	0.01	0.06	0.06	0.01	0.07	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.20	0.08	0.10	0.01	0.15	0.19	0.09
N7	0.01	0.01	0.05	0.07	0.01	0.08	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.06	0.05	0.04	0.24	0.02	0.25	0.28	0.22
N9	0.00	0.01	0.03	0.02	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.08	0.01	0.14	0.01	0.19	0.18	0.12
O2'	0.01	0.14	0.00	0.01	0.07	0.01	0.05	0.04	0.07	0.07	0.11	0.17	0.13	0.06	0.02	0.00	0.04	0.02	0.11	0.07	0.28	0.18	0.11
O3'	0.09	0.21	0.03	0.01	0.14	0.02	0.10	0.03	0.13	0.03	0.18	0.25	0.20	0.05	0.08	0.04	0.00	0.07	0.08	0.12	0.28	0.26	0.14
O4'	0.00	0.08	0.01	0.01	0.04	0.00	0.02	0.01	0.03	0.06	0.06	0.10	0.08	0.04	0.01	0.02	0.07	0.00	0.07	0.03	0.10	0.11	0.06
O5'	0.07	0.12	0.10	0.08	0.14	0.01	0.19	0.01	0.19	0.22	0.16	0.10	0.10	0.24	0.14	0.11	0.08	0.07	0.00	0.22	0.02	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.05	0.03	0.01	0.04	0.01	0.12	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.07	0.12	0.03	0.22	0.00	0.23	0.29	0.21
OP1	0.17	0.16	0.24	0.24	0.18	0.14	0.22	0.09	0.21	0.24	0.19	0.14	0.15	0.25	0.19	0.28	0.28	0.10	0.02	0.23	0.00	0.01	0.00
OP2	0.14	0.21	0.17	0.23	0.21	0.11	0.25	0.04	0.27	0.24	0.24	0.20	0.19	0.28	0.18	0.18	0.26	0.11	0.01	0.29	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.11	0.10	0.12	0.12	0.04	0.17	0.01	0.18	0.19	0.14	0.09	0.09	0.22	0.12	0.11	0.14	0.06	0.00	0.21	0.00	0.01	0.00