Doublet Group distance statistics: 48258

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 3, 0, 3, 3, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.009, 0.014, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.009 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.004, 0.015, 0.026, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.015 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.004, 0.020, 0.036, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.020 std_dev=0.016
C4	A	0, 0.004, 0.021, 0.037, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.021 std_dev=0.017
N7	A	0, 0.010, 0.028, 0.047, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.028 std_dev=0.019
N9	A	0, 0.005, 0.026, 0.047, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.026 std_dev=0.021
C8	A	0, 0.011, 0.033, 0.056, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.033 std_dev=0.023
C2	A	0, -0.011, 0.016, 0.043, 0.103 max_d=0.103 avg_d=0.016 std_dev=0.027
N3	A	0, -0.003, 0.025, 0.052, 0.113 max_d=0.113 avg_d=0.025 std_dev=0.028
N6	A	0, 0.000, 0.030, 0.059, 0.110 max_d=0.110 avg_d=0.030 std_dev=0.030
C1'	A	0, -0.009, 0.022, 0.053, 0.121 max_d=0.121 avg_d=0.022 std_dev=0.031
C2'	A	0, 0.044, 0.206, 0.369, 0.492 max_d=0.492 avg_d=0.206 std_dev=0.163
O4'	A	0, 0.041, 0.212, 0.382, 0.480 max_d=0.480 avg_d=0.212 std_dev=0.171
O2'	A	0, 0.099, 0.273, 0.448, 0.526 max_d=0.526 avg_d=0.273 std_dev=0.174
O2'	B	0, 0.267, 0.463, 0.660, 0.750 max_d=0.750 avg_d=0.463 std_dev=0.197
C2'	B	0, 0.310, 0.551, 0.793, 0.996 max_d=0.996 avg_d=0.551 std_dev=0.241
C3'	A	0, 0.035, 0.321, 0.608, 0.792 max_d=0.792 avg_d=0.321 std_dev=0.286
O3'	A	0, 0.104, 0.396, 0.689, 0.827 max_d=0.827 avg_d=0.396 std_dev=0.293
O3'	B	0, 0.401, 0.717, 1.033, 1.277 max_d=1.277 avg_d=0.717 std_dev=0.316
C4'	A	0, 0.044, 0.369, 0.693, 0.891 max_d=0.891 avg_d=0.369 std_dev=0.325
C1'	B	0, 0.259, 0.616, 0.974, 1.318 max_d=1.318 avg_d=0.616 std_dev=0.358
C3'	B	0, 0.354, 0.715, 1.077, 1.486 max_d=1.486 avg_d=0.715 std_dev=0.361
N3	B	0, 0.158, 0.568, 0.978, 1.640 max_d=1.640 avg_d=0.568 std_dev=0.410
C4'	B	0, 0.287, 0.763, 1.239, 1.764 max_d=1.764 avg_d=0.763 std_dev=0.476
N9	B	0, 0.197, 0.694, 1.192, 1.809 max_d=1.809 avg_d=0.694 std_dev=0.497
C4	B	0, 0.138, 0.674, 1.209, 1.962 max_d=1.962 avg_d=0.674 std_dev=0.535
O4'	B	0, 0.225, 0.768, 1.311, 1.876 max_d=1.876 avg_d=0.768 std_dev=0.543
C2	B	0, 0.134, 0.719, 1.304, 2.269 max_d=2.269 avg_d=0.719 std_dev=0.585
N2	B	0, 0.139, 0.736, 1.333, 2.385 max_d=2.385 avg_d=0.736 std_dev=0.597
C5'	B	0, 0.287, 0.927, 1.568, 2.354 max_d=2.354 avg_d=0.927 std_dev=0.641
O5'	B	0, 0.344, 1.028, 1.712, 2.577 max_d=2.577 avg_d=1.028 std_dev=0.684
C8	B	0, 0.166, 0.894, 1.622, 2.530 max_d=2.530 avg_d=0.894 std_dev=0.728
C5'	A	0, 0.026, 0.763, 1.500, 2.027 max_d=2.027 avg_d=0.763 std_dev=0.737
C5	B	0, 0.070, 0.872, 1.674, 2.761 max_d=2.761 avg_d=0.872 std_dev=0.802
N1	B	0, 0.115, 0.934, 1.753, 3.000 max_d=3.000 avg_d=0.934 std_dev=0.819
OP1	B	0, 0.252, 1.093, 1.933, 2.987 max_d=2.987 avg_d=1.093 std_dev=0.841
N7	B	0, 0.075, 0.982, 1.889, 3.056 max_d=3.056 avg_d=0.982 std_dev=0.907
C6	B	0, 0.072, 1.019, 1.966, 3.300 max_d=3.300 avg_d=1.019 std_dev=0.947
P	B	0, 0.196, 1.157, 2.117, 3.365 max_d=3.365 avg_d=1.157 std_dev=0.960
O5'	A	0, -0.007, 0.979, 1.965, 2.604 max_d=2.604 avg_d=0.979 std_dev=0.986
O6	B	0, 0.067, 1.261, 2.454, 4.093 max_d=4.093 avg_d=1.261 std_dev=1.194
OP2	B	0, 0.083, 1.279, 2.475, 4.078 max_d=4.078 avg_d=1.279 std_dev=1.196
P	A	0, 0.030, 1.512, 2.994, 3.920 max_d=3.920 avg_d=1.512 std_dev=1.482
OP1	A	0, 0.580, 2.343, 4.107, 4.355 max_d=4.355 avg_d=2.343 std_dev=1.764
OP2	A	0, 0.243, 2.023, 3.804, 4.644 max_d=4.644 avg_d=2.023 std_dev=1.780

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.05	0.02	0.02	0.04	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.19	0.47	0.24	0.25
C2	0.06	0.00	0.14	0.16	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.14	0.17	0.08	0.42	0.87	0.64	0.60
C2'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.08	0.02	0.03	0.03	0.06	0.06	0.11	0.15	0.04	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.23	0.24	0.26	0.20
C3'	0.01	0.16	0.00	0.00	0.12	0.01	0.12	0.05	0.14	0.09	0.15	0.15	0.14	0.10	0.07	0.01	0.01	0.03	0.26	0.35	0.23	0.18
C4	0.03	0.01	0.08	0.12	0.00	0.03	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.10	0.03	0.44	0.91	0.59	0.62
C4'	0.02	0.05	0.02	0.01	0.03	0.00	0.10	0.01	0.08	0.16	0.03	0.06	0.12	0.16	0.06	0.05	0.02	0.00	0.02	0.14	0.34	0.09
C5	0.02	0.01	0.03	0.12	0.00	0.10	0.00	0.31	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.08	0.10	0.02	0.55	1.18	0.77	0.81
C5'	0.05	0.10	0.03	0.05	0.19	0.01	0.31	0.00	0.30	0.40	0.20	0.07	0.38	0.43	0.21	0.06	0.04	0.02	0.01	0.24	0.36	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.14	0.01	0.08	0.01	0.30	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.12	0.02	0.56	1.23	0.85	0.85
C8	0.02	0.01	0.06	0.09	0.01	0.16	0.00	0.40	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.06	0.08	0.08	0.56	1.16	0.65	0.78
N1	0.04	0.00	0.11	0.15	0.01	0.03	0.01	0.20	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.15	0.05	0.50	1.07	0.77	0.75
N3	0.07	0.00	0.15	0.15	0.01	0.06	0.00	0.07	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.13	0.15	0.09	0.37	0.75	0.52	0.51
N6	0.01	0.01	0.04	0.14	0.00	0.12	0.01	0.38	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.10	0.13	0.04	0.62	1.39	0.96	0.97
N7	0.01	0.01	0.04	0.10	0.01	0.16	0.00	0.43	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.07	0.09	0.07	0.62	1.35	0.83	0.92
N9	0.01	0.02	0.01	0.07	0.01	0.06	0.01	0.21	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.04	0.05	0.01	0.40	0.84	0.48	0.55
O2'	0.01	0.14	0.00	0.01	0.08	0.05	0.08	0.06	0.10	0.06	0.13	0.13	0.10	0.07	0.04	0.00	0.04	0.03	0.09	0.20	0.36	0.09
O3'	0.01	0.17	0.02	0.01	0.10	0.02	0.10	0.04	0.12	0.08	0.15	0.15	0.13	0.09	0.05	0.04	0.00	0.01	0.22	0.62	0.35	0.14
O4'	0.01	0.08	0.01	0.03	0.03	0.00	0.02	0.02	0.02	0.08	0.05	0.09	0.04	0.07	0.01	0.03	0.01	0.00	0.08	0.45	0.17	0.17
O5'	0.19	0.42	0.23	0.26	0.44	0.02	0.55	0.01	0.56	0.56	0.50	0.37	0.62	0.62	0.40	0.09	0.22	0.08	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.47	0.87	0.24	0.35	0.91	0.14	1.18	0.24	1.23	1.16	1.07	0.75	1.39	1.35	0.84	0.20	0.62	0.45	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.24	0.64	0.26	0.23	0.59	0.34	0.77	0.36	0.85	0.65	0.77	0.52	0.96	0.83	0.48	0.36	0.35	0.17	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.25	0.60	0.20	0.18	0.62	0.09	0.81	0.02	0.85	0.78	0.75	0.51	0.97	0.92	0.55	0.09	0.14	0.17	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.26	0.18	0.13	0.17	0.17	0.30	0.20	0.37	0.19	0.30	0.20	0.29	0.12	0.27	0.24	0.11	0.11	0.39	0.31	0.23	0.28	0.38	0.36
C2	0.20	0.20	0.12	0.13	0.21	0.19	0.25	0.22	0.26	0.26	0.25	0.22	0.16	0.27	0.23	0.12	0.11	0.26	0.18	0.29	0.15	0.25	0.20
C2'	0.24	0.24	0.13	0.14	0.18	0.26	0.21	0.31	0.25	0.26	0.28	0.34	0.16	0.25	0.23	0.10	0.09	0.35	0.25	0.29	0.22	0.30	0.29
C3'	0.28	0.30	0.18	0.18	0.23	0.29	0.26	0.34	0.30	0.30	0.33	0.40	0.22	0.28	0.27	0.14	0.12	0.39	0.29	0.33	0.26	0.33	0.33
C4	0.26	0.20	0.13	0.16	0.20	0.28	0.25	0.33	0.24	0.32	0.23	0.28	0.14	0.30	0.26	0.08	0.09	0.38	0.29	0.27	0.25	0.35	0.33
C4'	0.26	0.19	0.12	0.16	0.13	0.31	0.15	0.39	0.15	0.28	0.20	0.33	0.10	0.23	0.23	0.09	0.11	0.40	0.32	0.18	0.31	0.38	0.38
C5	0.30	0.22	0.15	0.19	0.23	0.32	0.27	0.37	0.25	0.36	0.23	0.30	0.17	0.33	0.30	0.09	0.10	0.43	0.34	0.27	0.29	0.38	0.37
C5'	0.39	0.22	0.32	0.37	0.24	0.47	0.25	0.54	0.21	0.40	0.23	0.33	0.19	0.34	0.34	0.33	0.37	0.53	0.48	0.23	0.48	0.51	0.52
C6	0.32	0.22	0.18	0.19	0.25	0.30	0.29	0.34	0.26	0.36	0.24	0.27	0.20	0.34	0.31	0.10	0.10	0.41	0.31	0.28	0.25	0.35	0.33
C8	0.31	0.21	0.14	0.19	0.21	0.35	0.25	0.43	0.23	0.37	0.23	0.33	0.15	0.34	0.30	0.09	0.11	0.46	0.38	0.26	0.34	0.43	0.43
N1	0.26	0.23	0.14	0.15	0.25	0.22	0.28	0.24	0.27	0.31	0.25	0.24	0.20	0.30	0.28	0.10	0.09	0.31	0.22	0.29	0.17	0.27	0.24
N3	0.21	0.19	0.11	0.14	0.19	0.22	0.23	0.26	0.25	0.26	0.23	0.24	0.13	0.27	0.22	0.11	0.10	0.30	0.22	0.28	0.18	0.28	0.24
N6	0.35	0.23	0.23	0.25	0.27	0.36	0.30	0.38	0.27	0.39	0.24	0.27	0.22	0.36	0.34	0.17	0.14	0.46	0.36	0.28	0.29	0.37	0.37
N7	0.33	0.22	0.17	0.21	0.23	0.37	0.27	0.43	0.24	0.39	0.23	0.32	0.17	0.35	0.31	0.11	0.12	0.47	0.39	0.26	0.35	0.43	0.43
N9	0.27	0.20	0.13	0.17	0.19	0.31	0.24	0.38	0.23	0.33	0.22	0.30	0.13	0.30	0.27	0.08	0.09	0.41	0.33	0.26	0.29	0.39	0.37
O2'	0.27	0.23	0.23	0.24	0.17	0.29	0.14	0.33	0.16	0.22	0.22	0.35	0.21	0.17	0.22	0.25	0.24	0.35	0.26	0.19	0.24	0.30	0.29
O3'	0.24	0.30	0.15	0.15	0.20	0.25	0.22	0.30	0.28	0.24	0.33	0.41	0.21	0.23	0.22	0.11	0.10	0.35	0.24	0.32	0.21	0.28	0.27
O4'	0.27	0.18	0.13	0.18	0.18	0.33	0.22	0.41	0.20	0.34	0.19	0.29	0.12	0.30	0.27	0.08	0.10	0.42	0.36	0.23	0.34	0.44	0.42
O5'	0.70	0.50	0.67	0.69	0.57	0.75	0.55	0.79	0.50	0.67	0.49	0.53	0.53	0.61	0.65	0.67	0.67	0.79	0.74	0.49	0.74	0.75	0.77
OP1	1.41	0.65	1.34	1.47	1.03	1.68	1.00	1.80	0.79	1.35	0.62	0.54	0.85	1.20	1.27	1.35	1.45	1.67	1.67	0.75	1.76	1.67	1.76
OP2	0.88	0.87	1.01	1.02	0.82	0.96	0.78	0.96	0.79	0.81	0.84	0.95	0.86	0.77	0.83	1.04	1.08	0.90	0.91	0.78	0.95	0.90	0.92
P	1.01	0.62	1.01	1.07	0.78	1.15	0.75	1.20	0.64	0.94	0.59	0.61	0.71	0.84	0.92	1.03	1.07	1.14	1.12	0.61	1.15	1.11	1.16

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.03	0.06	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.02	0.09	0.07	0.07
C2	0.05	0.00	0.13	0.10	0.02	0.06	0.02	0.05	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.19	0.15	0.03	0.10	0.01	0.12	0.17	0.13
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.06	0.01	0.05	0.02	0.07	0.04	0.10	0.15	0.12	0.04	0.02	0.01	0.02	0.01	0.05	0.06	0.08	0.10	0.07
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.05	0.01	0.08	0.02	0.09	0.11	0.09	0.13	0.09	0.11	0.05	0.02	0.01	0.01	0.05	0.11	0.07	0.08	0.05
C4	0.02	0.02	0.06	0.05	0.00	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.09	0.07	0.01	0.08	0.01	0.09	0.13	0.10
C4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.02	0.00	0.05	0.01	0.05	0.08	0.03	0.08	0.06	0.08	0.02	0.05	0.02	0.00	0.02	0.08	0.08	0.03	0.03
C5	0.01	0.02	0.05	0.08	0.01	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.10	0.03	0.11	0.02	0.14	0.18	0.14
C5'	0.03	0.05	0.02	0.02	0.05	0.01	0.10	0.00	0.10	0.12	0.07	0.07	0.05	0.14	0.05	0.04	0.04	0.02	0.01	0.15	0.09	0.02	0.01
C6	0.02	0.01	0.07	0.09	0.01	0.05	0.01	0.10	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.10	0.12	0.03	0.12	0.01	0.17	0.22	0.17
C8	0.02	0.02	0.04	0.11	0.01	0.08	0.01	0.12	0.02	0.00	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.03	0.12	0.04	0.10	0.04	0.11	0.14	0.12
N1	0.03	0.01	0.10	0.09	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.16	0.13	0.02	0.10	0.01	0.14	0.19	0.15
N2	0.06	0.01	0.15	0.13	0.02	0.08	0.02	0.07	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.03	0.03	0.23	0.19	0.05	0.11	0.02	0.14	0.18	0.13
N3	0.05	0.01	0.12	0.09	0.01	0.06	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.17	0.13	0.03	0.09	0.02	0.11	0.14	0.11
N7	0.01	0.02	0.04	0.11	0.01	0.08	0.01	0.14	0.02	0.00	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.03	0.13	0.04	0.13	0.04	0.17	0.21	0.16
N9	0.00	0.02	0.02	0.05	0.00	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.05	0.01	0.07	0.02	0.07	0.09	0.08
O2'	0.01	0.19	0.01	0.02	0.09	0.05	0.07	0.04	0.10	0.03	0.16	0.23	0.17	0.03	0.03	0.00	0.04	0.05	0.03	0.09	0.07	0.07	0.04
O3'	0.01	0.15	0.02	0.01	0.07	0.02	0.10	0.04	0.12	0.12	0.13	0.19	0.13	0.13	0.05	0.04	0.00	0.02	0.09	0.14	0.08	0.09	0.06
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.03	0.04	0.02	0.05	0.03	0.04	0.01	0.05	0.02	0.00	0.09	0.05	0.11	0.05	0.07
O5'	0.07	0.10	0.05	0.05	0.08	0.02	0.11	0.01	0.12	0.10	0.10	0.11	0.09	0.13	0.07	0.03	0.09	0.09	0.00	0.17	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.06	0.11	0.01	0.08	0.02	0.15	0.01	0.04	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.09	0.14	0.05	0.17	0.00	0.24	0.28	0.22
OP1	0.09	0.12	0.08	0.07	0.09	0.08	0.14	0.09	0.17	0.11	0.14	0.14	0.11	0.17	0.07	0.07	0.08	0.11	0.02	0.24	0.00	0.01	0.01
OP2	0.07	0.17	0.10	0.08	0.13	0.03	0.18	0.02	0.22	0.14	0.19	0.18	0.14	0.21	0.09	0.07	0.09	0.05	0.02	0.28	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.13	0.07	0.05	0.10	0.03	0.14	0.01	0.17	0.12	0.15	0.13	0.11	0.16	0.08	0.04	0.06	0.07	0.01	0.22	0.01	0.01	0.00