Doublet Group distance statistics: 48260

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 1, 2, 1, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.006, 0.012, 0.017, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.012 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.008, 0.015, 0.022, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.015 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.007, 0.014, 0.022, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.014 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.008, 0.016, 0.024, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.016 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.009, 0.017, 0.026, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.017 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.007, 0.015, 0.024, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.015 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.005, 0.014, 0.023, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.014 std_dev=0.009
C8	A	0, 0.019, 0.037, 0.054, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.037 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.007, 0.025, 0.044, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.025 std_dev=0.018
N7	A	0, 0.015, 0.034, 0.054, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.034 std_dev=0.020
N6	A	0, 0.028, 0.053, 0.078, 0.100 max_d=0.100 avg_d=0.053 std_dev=0.025
O4'	A	0, 0.035, 0.114, 0.194, 0.276 max_d=0.276 avg_d=0.114 std_dev=0.080
C2'	A	0, 0.027, 0.126, 0.224, 0.329 max_d=0.329 avg_d=0.126 std_dev=0.099
C3'	A	0, 0.141, 0.281, 0.421, 0.506 max_d=0.506 avg_d=0.281 std_dev=0.140
C4'	A	0, 0.122, 0.264, 0.406, 0.553 max_d=0.553 avg_d=0.264 std_dev=0.142
O2'	A	0, 0.040, 0.194, 0.347, 0.494 max_d=0.494 avg_d=0.194 std_dev=0.154
C4	B	0, 0.208, 0.385, 0.561, 0.637 max_d=0.637 avg_d=0.385 std_dev=0.177
C2	B	0, 0.270, 0.451, 0.631, 0.650 max_d=0.650 avg_d=0.451 std_dev=0.180
N9	B	0, 0.203, 0.395, 0.588, 0.657 max_d=0.657 avg_d=0.395 std_dev=0.192
N2	B	0, 0.233, 0.440, 0.648, 0.791 max_d=0.791 avg_d=0.440 std_dev=0.208
N3	B	0, 0.104, 0.316, 0.528, 0.677 max_d=0.677 avg_d=0.316 std_dev=0.212
C1'	B	0, 0.304, 0.523, 0.742, 0.796 max_d=0.796 avg_d=0.523 std_dev=0.219
O3'	A	0, 0.188, 0.410, 0.632, 0.749 max_d=0.749 avg_d=0.410 std_dev=0.222
C8	B	0, 0.213, 0.449, 0.685, 0.746 max_d=0.746 avg_d=0.449 std_dev=0.236
O4'	B	0, 0.347, 0.584, 0.822, 0.844 max_d=0.844 avg_d=0.584 std_dev=0.238
C5'	A	0, 0.170, 0.408, 0.647, 0.917 max_d=0.917 avg_d=0.408 std_dev=0.239
C5	B	0, 0.305, 0.572, 0.840, 0.843 max_d=0.843 avg_d=0.572 std_dev=0.267
P	A	0, 0.288, 0.559, 0.829, 1.039 max_d=1.039 avg_d=0.559 std_dev=0.270
O5'	A	0, 0.160, 0.451, 0.743, 0.933 max_d=0.933 avg_d=0.451 std_dev=0.291
N1	B	0, 0.371, 0.676, 0.981, 0.960 max_d=0.960 avg_d=0.676 std_dev=0.305
N7	B	0, 0.273, 0.587, 0.902, 0.930 max_d=0.930 avg_d=0.587 std_dev=0.315
C4'	B	0, 0.522, 0.856, 1.190, 1.251 max_d=1.251 avg_d=0.856 std_dev=0.334
C2'	B	0, 0.300, 0.641, 0.983, 1.079 max_d=1.079 avg_d=0.641 std_dev=0.341
O5'	B	0, 0.474, 0.827, 1.180, 1.187 max_d=1.187 avg_d=0.827 std_dev=0.353
C3'	B	0, 0.490, 0.869, 1.248, 1.370 max_d=1.370 avg_d=0.869 std_dev=0.379
C5'	B	0, 0.616, 1.006, 1.396, 1.397 max_d=1.397 avg_d=1.006 std_dev=0.390
C6	B	0, 0.358, 0.753, 1.148, 1.161 max_d=1.161 avg_d=0.753 std_dev=0.395
O2'	B	0, 0.363, 0.779, 1.194, 1.302 max_d=1.302 avg_d=0.779 std_dev=0.415
O3'	B	0, 0.576, 0.997, 1.418, 1.460 max_d=1.460 avg_d=0.997 std_dev=0.421
OP2	A	0, 0.704, 1.180, 1.656, 1.635 max_d=1.635 avg_d=1.180 std_dev=0.476
P	B	0, 0.754, 1.275, 1.797, 1.744 max_d=1.744 avg_d=1.275 std_dev=0.521
O6	B	0, 0.466, 1.021, 1.576, 1.605 max_d=1.605 avg_d=1.021 std_dev=0.555
OP2	B	0, 0.791, 1.355, 1.918, 2.026 max_d=2.026 avg_d=1.355 std_dev=0.564
OP1	A	0, 0.245, 0.816, 1.388, 2.201 max_d=2.201 avg_d=0.816 std_dev=0.572
OP1	B	0, 1.061, 1.814, 2.567, 2.565 max_d=2.565 avg_d=1.814 std_dev=0.753

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.05	0.11	0.14	0.11
C2	0.02	0.00	0.11	0.11	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.13	0.15	0.04	0.08	0.17	0.20	0.09
C2'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.05	0.01	0.03	0.01	0.05	0.05	0.08	0.10	0.04	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.25	0.12	0.07
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.05	0.00	0.04	0.01	0.05	0.08	0.08	0.10	0.05	0.07	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.32	0.13	0.11
C4	0.01	0.00	0.05	0.05	0.00	0.02	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.07	0.04	0.09	0.13	0.19	0.09
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.04	0.10	0.03	0.04	0.07	0.09	0.04	0.03	0.02	0.00	0.01	0.11	0.05	0.04
C5	0.01	0.00	0.03	0.04	0.00	0.05	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.06	0.05	0.13	0.13	0.21	0.09
C5'	0.02	0.05	0.01	0.01	0.07	0.00	0.12	0.00	0.11	0.16	0.08	0.04	0.15	0.17	0.07	0.04	0.04	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01
C6	0.01	0.00	0.05	0.05	0.00	0.04	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.09	0.05	0.13	0.15	0.22	0.10
C8	0.02	0.01	0.05	0.08	0.00	0.10	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.08	0.05	0.16	0.07	0.18	0.10
N1	0.02	0.00	0.08	0.08	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.11	0.12	0.04	0.10	0.17	0.21	0.09
N3	0.02	0.00	0.10	0.10	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.11	0.13	0.03	0.07	0.16	0.18	0.10
N6	0.02	0.01	0.04	0.05	0.00	0.07	0.01	0.15	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.08	0.06	0.16	0.16	0.24	0.12
N7	0.02	0.00	0.04	0.07	0.00	0.09	0.00	0.17	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.04	0.07	0.05	0.18	0.10	0.21	0.10
N9	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.03	0.09	0.10	0.17	0.10
O2'	0.02	0.13	0.00	0.02	0.06	0.03	0.05	0.04	0.08	0.05	0.11	0.11	0.07	0.04	0.03	0.00	0.06	0.03	0.02	0.25	0.11	0.06
O3'	0.02	0.15	0.02	0.01	0.07	0.02	0.06	0.04	0.09	0.08	0.12	0.13	0.08	0.07	0.02	0.06	0.00	0.02	0.05	0.47	0.18	0.19
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.05	0.04	0.03	0.06	0.05	0.03	0.03	0.02	0.00	0.07	0.12	0.15	0.17
O5'	0.05	0.08	0.02	0.03	0.09	0.01	0.13	0.01	0.13	0.16	0.10	0.07	0.16	0.18	0.09	0.02	0.05	0.07	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.11	0.17	0.25	0.32	0.13	0.11	0.13	0.03	0.15	0.07	0.17	0.16	0.16	0.10	0.10	0.25	0.47	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.14	0.20	0.12	0.13	0.19	0.05	0.21	0.01	0.22	0.18	0.21	0.18	0.24	0.21	0.17	0.11	0.18	0.15	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.11	0.09	0.07	0.11	0.09	0.04	0.09	0.01	0.10	0.10	0.09	0.10	0.12	0.10	0.10	0.06	0.19	0.17	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.11	0.18	0.12	0.23	0.12	0.36	0.14	0.43	0.17	0.11	0.19	0.22	0.13	0.13	0.11	0.21	0.21	0.19	0.25	0.19	0.35	0.19	0.31
C2	0.14	0.21	0.21	0.32	0.15	0.42	0.17	0.55	0.22	0.14	0.23	0.26	0.16	0.16	0.13	0.26	0.29	0.20	0.42	0.24	0.56	0.38	0.51
C2'	0.13	0.17	0.15	0.27	0.12	0.40	0.13	0.50	0.17	0.11	0.19	0.20	0.13	0.12	0.11	0.21	0.24	0.22	0.32	0.19	0.46	0.28	0.41
C3'	0.12	0.12	0.15	0.24	0.08	0.38	0.10	0.46	0.14	0.08	0.15	0.16	0.10	0.09	0.09	0.24	0.22	0.19	0.27	0.17	0.39	0.29	0.38
C4	0.12	0.20	0.15	0.26	0.13	0.38	0.15	0.45	0.19	0.11	0.21	0.25	0.15	0.13	0.11	0.23	0.24	0.19	0.29	0.20	0.38	0.24	0.36
C4'	0.14	0.12	0.16	0.22	0.12	0.34	0.12	0.40	0.13	0.13	0.14	0.13	0.12	0.13	0.13	0.27	0.22	0.17	0.21	0.15	0.28	0.21	0.29
C5	0.11	0.21	0.14	0.23	0.13	0.35	0.15	0.40	0.19	0.11	0.22	0.26	0.16	0.13	0.10	0.21	0.21	0.19	0.23	0.20	0.29	0.22	0.31
C5'	0.22	0.17	0.26	0.25	0.20	0.33	0.19	0.35	0.18	0.21	0.17	0.16	0.20	0.20	0.21	0.37	0.26	0.19	0.19	0.17	0.19	0.29	0.29
C6	0.12	0.22	0.16	0.26	0.15	0.37	0.17	0.43	0.22	0.12	0.24	0.26	0.17	0.15	0.11	0.21	0.23	0.20	0.27	0.24	0.35	0.27	0.37
C8	0.10	0.18	0.11	0.19	0.12	0.32	0.13	0.35	0.17	0.10	0.20	0.23	0.13	0.12	0.10	0.21	0.18	0.17	0.16	0.19	0.21	0.20	0.24
N1	0.14	0.22	0.20	0.32	0.15	0.42	0.19	0.53	0.23	0.14	0.25	0.26	0.17	0.17	0.13	0.24	0.28	0.21	0.39	0.26	0.51	0.37	0.48
N3	0.14	0.21	0.19	0.30	0.14	0.40	0.16	0.52	0.20	0.13	0.22	0.25	0.16	0.14	0.12	0.25	0.27	0.20	0.37	0.22	0.50	0.32	0.45
N6	0.11	0.23	0.14	0.22	0.16	0.33	0.19	0.35	0.24	0.13	0.25	0.24	0.19	0.17	0.11	0.17	0.20	0.20	0.21	0.25	0.26	0.26	0.32
N7	0.10	0.19	0.11	0.18	0.12	0.31	0.13	0.33	0.17	0.10	0.20	0.25	0.14	0.12	0.09	0.20	0.18	0.18	0.14	0.19	0.18	0.22	0.24
N9	0.11	0.18	0.12	0.22	0.12	0.35	0.14	0.41	0.17	0.11	0.20	0.23	0.14	0.12	0.11	0.22	0.21	0.18	0.23	0.19	0.31	0.20	0.30
O2'	0.16	0.18	0.17	0.30	0.15	0.44	0.15	0.55	0.18	0.14	0.19	0.21	0.15	0.14	0.14	0.21	0.27	0.25	0.39	0.19	0.54	0.31	0.46
O3'	0.13	0.14	0.16	0.26	0.10	0.40	0.10	0.50	0.15	0.09	0.16	0.17	0.11	0.09	0.10	0.24	0.23	0.22	0.31	0.18	0.47	0.35	0.45
O4'	0.14	0.15	0.15	0.22	0.13	0.34	0.14	0.39	0.17	0.14	0.18	0.18	0.13	0.14	0.13	0.25	0.22	0.18	0.20	0.19	0.26	0.15	0.24
O5'	0.22	0.16	0.28	0.25	0.18	0.31	0.16	0.32	0.15	0.19	0.15	0.15	0.18	0.17	0.20	0.40	0.25	0.18	0.19	0.15	0.19	0.38	0.33
OP1	0.12	0.16	0.12	0.15	0.14	0.25	0.18	0.24	0.22	0.14	0.21	0.16	0.13	0.17	0.13	0.19	0.17	0.15	0.11	0.26	0.12	0.35	0.26
OP2	0.26	0.23	0.27	0.28	0.23	0.33	0.23	0.32	0.24	0.23	0.24	0.23	0.23	0.23	0.24	0.32	0.28	0.27	0.26	0.25	0.29	0.47	0.40
P	0.13	0.16	0.14	0.18	0.15	0.28	0.17	0.27	0.19	0.15	0.19	0.16	0.14	0.17	0.15	0.21	0.20	0.16	0.10	0.21	0.12	0.31	0.22

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.00	0.01	0.04	0.01	0.14	0.02	0.26	0.19	0.15
C2	0.02	0.00	0.06	0.05	0.01	0.10	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.11	0.11	0.08	0.24	0.01	0.28	0.47	0.30
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.04	0.01	0.05	0.07	0.05	0.04	0.05	0.07	0.06	0.05	0.02	0.00	0.01	0.03	0.12	0.06	0.45	0.26	0.24
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.07	0.03	0.07	0.04	0.06	0.02	0.01	0.00	0.01	0.08	0.04	0.43	0.21	0.20
C4	0.01	0.01	0.04	0.02	0.00	0.02	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.07	0.03	0.29	0.01	0.35	0.46	0.34
C4'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.04	0.15	0.04	0.15	0.11	0.14	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.19	0.04	0.02
C5	0.01	0.01	0.05	0.03	0.00	0.06	0.00	0.23	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.11	0.07	0.04	0.41	0.01	0.49	0.63	0.49
C5'	0.06	0.08	0.07	0.01	0.12	0.00	0.23	0.00	0.22	0.33	0.13	0.12	0.08	0.34	0.17	0.06	0.03	0.01	0.01	0.28	0.08	0.02	0.01
C6	0.01	0.00	0.05	0.03	0.01	0.04	0.01	0.22	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.10	0.04	0.42	0.00	0.51	0.68	0.51
C8	0.02	0.01	0.04	0.07	0.00	0.15	0.01	0.33	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.16	0.04	0.10	0.48	0.03	0.53	0.56	0.51
N1	0.01	0.00	0.05	0.03	0.01	0.04	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.11	0.04	0.33	0.01	0.40	0.59	0.41
N2	0.03	0.00	0.07	0.07	0.01	0.15	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.13	0.11	0.18	0.01	0.22	0.43	0.26
N3	0.02	0.00	0.06	0.04	0.00	0.11	0.01	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.09	0.09	0.20	0.00	0.24	0.39	0.25
N7	0.02	0.01	0.05	0.06	0.00	0.14	0.00	0.34	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.17	0.05	0.09	0.51	0.03	0.61	0.71	0.59
N9	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.04	0.01	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.04	0.02	0.31	0.02	0.36	0.39	0.32
O2'	0.01	0.11	0.00	0.01	0.06	0.01	0.11	0.06	0.11	0.16	0.08	0.15	0.12	0.17	0.06	0.00	0.04	0.02	0.14	0.14	0.57	0.38	0.32
O3'	0.04	0.11	0.01	0.00	0.07	0.01	0.07	0.03	0.10	0.04	0.11	0.13	0.09	0.05	0.04	0.04	0.00	0.07	0.07	0.10	0.43	0.21	0.18
O4'	0.01	0.08	0.03	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.10	0.04	0.11	0.09	0.09	0.02	0.02	0.07	0.00	0.06	0.06	0.07	0.17	0.15
O5'	0.14	0.24	0.12	0.08	0.29	0.01	0.41	0.01	0.42	0.48	0.33	0.18	0.20	0.51	0.31	0.14	0.07	0.06	0.00	0.48	0.01	0.01	0.01
O6	0.02	0.01	0.06	0.04	0.01	0.08	0.01	0.28	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.14	0.10	0.06	0.48	0.00	0.60	0.77	0.59
OP1	0.26	0.28	0.45	0.43	0.35	0.19	0.49	0.08	0.51	0.53	0.40	0.22	0.24	0.61	0.36	0.57	0.43	0.07	0.01	0.60	0.00	0.01	0.00
OP2	0.19	0.47	0.26	0.21	0.46	0.04	0.63	0.02	0.68	0.56	0.59	0.43	0.39	0.71	0.39	0.38	0.21	0.17	0.01	0.77	0.01	0.00	0.00
P	0.15	0.30	0.24	0.20	0.34	0.02	0.49	0.01	0.51	0.51	0.41	0.26	0.25	0.59	0.32	0.32	0.18	0.15	0.01	0.59	0.00	0.00	0.00