Doublet Group distance statistics: 48262

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 2, 3, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.009, 0.015, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.004, 0.010, 0.015, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.010 std_dev=0.006
C1'	A	0, 0.006, 0.014, 0.023, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.014 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.009, 0.019, 0.029, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.019 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.007, 0.017, 0.028, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.017 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.007, 0.018, 0.029, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.018 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.009, 0.022, 0.035, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.022 std_dev=0.013
N9	A	0, 0.009, 0.023, 0.037, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.023 std_dev=0.014
N6	A	0, 0.013, 0.032, 0.050, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.032 std_dev=0.018
N7	A	0, 0.018, 0.039, 0.060, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.039 std_dev=0.021
C8	A	0, 0.019, 0.044, 0.069, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.044 std_dev=0.025
O4'	B	0, 0.151, 0.304, 0.457, 0.514 max_d=0.514 avg_d=0.304 std_dev=0.153
C1'	B	0, 0.170, 0.328, 0.487, 0.584 max_d=0.584 avg_d=0.328 std_dev=0.159
O4'	A	0, -0.030, 0.152, 0.334, 0.586 max_d=0.586 avg_d=0.152 std_dev=0.182
C2'	B	0, 0.195, 0.381, 0.566, 0.665 max_d=0.665 avg_d=0.381 std_dev=0.185
C2'	A	0, -0.024, 0.183, 0.390, 0.681 max_d=0.681 avg_d=0.183 std_dev=0.207
N9	B	0, 0.199, 0.429, 0.659, 0.853 max_d=0.853 avg_d=0.429 std_dev=0.230
C3'	B	0, 0.111, 0.388, 0.665, 1.028 max_d=1.028 avg_d=0.388 std_dev=0.277
C4'	B	0, 0.090, 0.374, 0.657, 1.051 max_d=1.051 avg_d=0.374 std_dev=0.284
C8	B	0, 0.199, 0.485, 0.771, 1.048 max_d=1.048 avg_d=0.485 std_dev=0.286
O2'	B	0, 0.279, 0.582, 0.885, 1.084 max_d=1.084 avg_d=0.582 std_dev=0.303
C4'	A	0, -0.067, 0.247, 0.561, 1.021 max_d=1.021 avg_d=0.247 std_dev=0.314
C4	B	0, 0.184, 0.515, 0.846, 1.270 max_d=1.270 avg_d=0.515 std_dev=0.331
N3	B	0, 0.156, 0.513, 0.870, 1.359 max_d=1.359 avg_d=0.513 std_dev=0.357
N7	B	0, 0.198, 0.589, 0.980, 1.472 max_d=1.472 avg_d=0.589 std_dev=0.391
C5	B	0, 0.185, 0.614, 1.044, 1.628 max_d=1.628 avg_d=0.614 std_dev=0.429
C2	B	0, 0.141, 0.634, 1.127, 1.838 max_d=1.838 avg_d=0.634 std_dev=0.493
O3'	B	0, -0.045, 0.495, 1.035, 1.742 max_d=1.742 avg_d=0.495 std_dev=0.540
C5'	B	0, -0.061, 0.481, 1.023, 1.879 max_d=1.879 avg_d=0.481 std_dev=0.542
N2	B	0, 0.116, 0.664, 1.211, 2.010 max_d=2.010 avg_d=0.664 std_dev=0.547
C6	B	0, 0.166, 0.738, 1.310, 2.135 max_d=2.135 avg_d=0.738 std_dev=0.572
N1	B	0, 0.149, 0.743, 1.338, 2.206 max_d=2.206 avg_d=0.743 std_dev=0.595
O5'	B	0, -0.101, 0.502, 1.105, 2.062 max_d=2.062 avg_d=0.502 std_dev=0.603
O2'	A	0, -0.230, 0.386, 1.002, 1.982 max_d=1.982 avg_d=0.386 std_dev=0.616
C3'	A	0, -0.274, 0.379, 1.033, 2.093 max_d=2.093 avg_d=0.379 std_dev=0.654
O6	B	0, 0.164, 0.844, 1.523, 2.516 max_d=2.516 avg_d=0.844 std_dev=0.679
C5'	A	0, -0.218, 0.462, 1.142, 2.200 max_d=2.200 avg_d=0.462 std_dev=0.680
P	B	0, -0.109, 0.674, 1.457, 2.582 max_d=2.582 avg_d=0.674 std_dev=0.783
OP2	B	0, -0.052, 0.807, 1.666, 2.877 max_d=2.877 avg_d=0.807 std_dev=0.859
OP1	B	0, -0.165, 0.728, 1.622, 2.690 max_d=2.690 avg_d=0.728 std_dev=0.894
O3'	A	0, -0.574, 0.613, 1.800, 3.747 max_d=3.747 avg_d=0.613 std_dev=1.187
O5'	A	0, -0.617, 0.808, 2.233, 4.532 max_d=4.532 avg_d=0.808 std_dev=1.425
P	A	0, -0.996, 0.979, 2.954, 6.164 max_d=6.164 avg_d=0.979 std_dev=1.975
OP2	A	0, -0.936, 1.536, 4.008, 7.358 max_d=7.358 avg_d=1.536 std_dev=2.472
OP1	A	0, -1.164, 1.382, 3.928, 7.896 max_d=7.896 avg_d=1.382 std_dev=2.546

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.25	0.00	0.25	0.25	0.37	0.20
C2	0.01	0.00	0.10	0.04	0.00	0.06	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.40	0.47	0.09	0.05	0.64	0.30	0.21
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.05	0.00	0.03	0.17	0.05	0.07	0.08	0.10	0.04	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.59	0.59	0.73	0.56
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.11	0.00	0.24	0.01	0.20	0.40	0.09	0.06	0.26	0.38	0.19	0.01	0.00	0.01	0.32	0.38	0.21	0.24
C4	0.01	0.00	0.05	0.11	0.00	0.07	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.30	0.22	0.05	0.14	0.44	0.41	0.09
C4'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.07	0.00	0.12	0.00	0.12	0.14	0.09	0.04	0.14	0.15	0.08	0.23	0.02	0.00	0.01	0.17	0.19	0.01
C5	0.01	0.00	0.03	0.24	0.00	0.12	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.31	0.04	0.03	0.19	0.51	0.52	0.16
C5'	0.06	0.15	0.17	0.01	0.10	0.00	0.15	0.00	0.18	0.08	0.18	0.10	0.20	0.13	0.05	0.04	0.14	0.01	0.01	0.38	0.36	0.01
C6	0.01	0.00	0.05	0.20	0.00	0.12	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.37	0.12	0.05	0.11	0.56	0.47	0.11
C8	0.01	0.00	0.07	0.40	0.00	0.14	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.13	0.28	0.05	0.44	0.64	0.69	0.47
N1	0.01	0.00	0.08	0.09	0.01	0.09	0.00	0.18	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.41	0.32	0.08	0.03	0.63	0.37	0.17
N3	0.01	0.00	0.10	0.06	0.00	0.04	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.35	0.49	0.09	0.03	0.53	0.28	0.15
N6	0.01	0.01	0.04	0.26	0.01	0.14	0.01	0.20	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.38	0.04	0.04	0.14	0.59	0.53	0.13
N7	0.00	0.00	0.04	0.38	0.00	0.15	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.22	0.25	0.02	0.35	0.62	0.68	0.38
N9	0.00	0.01	0.01	0.19	0.00	0.08	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.16	0.06	0.00	0.28	0.40	0.49	0.24
O2'	0.01	0.40	0.00	0.01	0.30	0.23	0.31	0.04	0.37	0.13	0.41	0.35	0.38	0.22	0.16	0.00	0.03	0.17	0.34	0.43	0.69	0.39
O3'	0.25	0.47	0.02	0.00	0.22	0.02	0.04	0.14	0.12	0.28	0.32	0.49	0.04	0.25	0.06	0.03	0.00	0.18	0.10	0.22	0.11	0.03
O4'	0.00	0.09	0.01	0.01	0.05	0.00	0.03	0.01	0.05	0.05	0.08	0.09	0.04	0.02	0.00	0.17	0.18	0.00	0.06	0.14	0.14	0.07
O5'	0.25	0.05	0.59	0.32	0.14	0.01	0.19	0.01	0.11	0.44	0.03	0.03	0.14	0.35	0.28	0.34	0.10	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.25	0.64	0.59	0.38	0.44	0.17	0.51	0.38	0.56	0.64	0.63	0.53	0.59	0.62	0.40	0.43	0.22	0.14	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.37	0.30	0.73	0.21	0.41	0.19	0.52	0.36	0.47	0.69	0.37	0.28	0.53	0.68	0.49	0.69	0.11	0.14	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.20	0.21	0.56	0.24	0.09	0.01	0.16	0.01	0.11	0.47	0.17	0.15	0.13	0.38	0.24	0.39	0.03	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.35	0.05	0.19	0.27	0.16	0.30	0.14	0.36	0.22	0.38	0.39	0.29	0.27	0.21	0.13	0.39	0.08	0.07	0.38	0.11	0.21	0.06
C2	0.14	0.16	0.09	0.13	0.16	0.16	0.16	0.21	0.16	0.16	0.16	0.16	0.16	0.16	0.16	0.20	0.20	0.09	0.11	0.15	0.13	0.11	0.15
C2'	0.13	0.30	0.06	0.15	0.25	0.09	0.29	0.06	0.33	0.23	0.34	0.32	0.25	0.27	0.20	0.10	0.37	0.12	0.14	0.35	0.14	0.26	0.11
C3'	0.22	0.09	0.30	0.45	0.13	0.35	0.11	0.29	0.08	0.15	0.07	0.08	0.13	0.12	0.17	0.32	0.65	0.20	0.20	0.06	0.20	0.17	0.19
C4	0.13	0.27	0.07	0.15	0.23	0.14	0.24	0.13	0.27	0.20	0.28	0.29	0.24	0.23	0.19	0.15	0.33	0.08	0.07	0.27	0.10	0.17	0.06
C4'	0.09	0.24	0.19	0.42	0.12	0.34	0.17	0.29	0.25	0.06	0.29	0.29	0.14	0.13	0.04	0.18	0.65	0.12	0.14	0.29	0.18	0.16	0.13
C5	0.13	0.26	0.07	0.13	0.23	0.13	0.25	0.09	0.26	0.21	0.26	0.25	0.24	0.23	0.20	0.13	0.34	0.10	0.11	0.26	0.14	0.23	0.10
C5'	0.22	0.29	0.37	0.62	0.09	0.49	0.17	0.40	0.32	0.05	0.38	0.38	0.12	0.10	0.07	0.39	0.90	0.23	0.26	0.38	0.31	0.22	0.23
C6	0.13	0.15	0.08	0.11	0.18	0.12	0.18	0.10	0.17	0.18	0.16	0.12	0.17	0.18	0.17	0.15	0.27	0.09	0.09	0.17	0.11	0.17	0.07
C8	0.13	0.38	0.07	0.16	0.30	0.14	0.34	0.09	0.39	0.25	0.41	0.41	0.31	0.31	0.23	0.10	0.41	0.11	0.16	0.40	0.20	0.32	0.16
N1	0.14	0.12	0.09	0.10	0.15	0.13	0.14	0.17	0.13	0.16	0.12	0.10	0.14	0.15	0.15	0.19	0.19	0.09	0.08	0.12	0.08	0.10	0.11
N3	0.13	0.23	0.08	0.15	0.20	0.16	0.20	0.19	0.22	0.17	0.23	0.24	0.21	0.19	0.17	0.19	0.27	0.08	0.08	0.22	0.11	0.12	0.11
N6	0.13	0.09	0.09	0.09	0.16	0.12	0.16	0.10	0.14	0.18	0.11	0.07	0.12	0.18	0.17	0.12	0.26	0.12	0.15	0.13	0.19	0.22	0.13
N7	0.14	0.34	0.08	0.15	0.28	0.13	0.32	0.09	0.35	0.25	0.36	0.35	0.29	0.30	0.23	0.09	0.39	0.13	0.19	0.36	0.23	0.33	0.19
N9	0.13	0.34	0.06	0.17	0.27	0.15	0.30	0.11	0.34	0.22	0.36	0.37	0.28	0.27	0.21	0.13	0.38	0.09	0.09	0.36	0.12	0.23	0.08
O2'	0.45	0.58	0.35	0.19	0.56	0.30	0.60	0.36	0.62	0.56	0.61	0.56	0.54	0.60	0.53	0.34	0.12	0.47	0.47	0.64	0.42	0.56	0.44
O3'	0.06	0.09	0.05	0.13	0.05	0.10	0.06	0.11	0.10	0.06	0.11	0.12	0.05	0.05	0.05	0.11	0.29	0.12	0.12	0.12	0.20	0.20	0.12
O4'	0.06	0.42	0.05	0.32	0.28	0.28	0.33	0.24	0.42	0.19	0.47	0.49	0.31	0.28	0.18	0.07	0.55	0.05	0.07	0.46	0.14	0.18	0.08
O5'	0.05	0.81	0.24	0.56	0.49	0.35	0.63	0.24	0.85	0.32	0.94	0.95	0.54	0.51	0.27	0.31	0.90	0.05	0.08	0.95	0.19	0.23	0.07
OP1	0.75	1.13	0.94	1.32	0.78	1.11	0.93	1.00	1.21	0.69	1.33	1.30	0.81	0.82	0.67	0.98	1.69	0.78	0.75	1.36	0.84	0.53	0.75
OP2	0.22	1.18	0.22	0.50	0.79	0.24	0.99	0.29	1.28	0.60	1.39	1.34	0.84	0.85	0.52	0.40	0.92	0.33	0.44	1.43	0.44	0.62	0.45
P	0.18	0.90	0.47	0.81	0.47	0.54	0.66	0.42	0.97	0.25	1.09	1.08	0.54	0.51	0.18	0.58	1.20	0.17	0.28	1.12	0.42	0.29	0.24

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.00	0.00	0.01	0.11	0.00	0.11	0.02	0.33	0.19	0.16
C2	0.03	0.00	0.03	0.08	0.00	0.07	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.28	0.07	0.22	0.01	0.31	0.34	0.21
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.02	0.04	0.04	0.03	0.03	0.02	0.04	0.03	0.00	0.02	0.02	0.05	0.04	0.44	0.22	0.22
C3'	0.02	0.08	0.00	0.00	0.02	0.00	0.04	0.02	0.02	0.10	0.04	0.12	0.08	0.09	0.03	0.00	0.01	0.00	0.05	0.03	0.47	0.20	0.24
C4	0.02	0.00	0.03	0.02	0.00	0.02	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.18	0.03	0.26	0.01	0.36	0.34	0.25
C4'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.02	0.00	0.06	0.01	0.04	0.13	0.04	0.11	0.08	0.12	0.05	0.01	0.02	0.00	0.02	0.05	0.24	0.08	0.09
C5	0.01	0.00	0.04	0.04	0.00	0.06	0.00	0.21	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.13	0.02	0.34	0.01	0.42	0.43	0.33
C5'	0.05	0.08	0.02	0.02	0.14	0.01	0.21	0.00	0.20	0.27	0.14	0.06	0.06	0.29	0.16	0.02	0.02	0.02	0.01	0.23	0.05	0.02	0.01
C6	0.02	0.00	0.04	0.02	0.01	0.04	0.01	0.20	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.17	0.03	0.34	0.01	0.40	0.45	0.33
C8	0.01	0.01	0.04	0.10	0.00	0.13	0.00	0.27	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.09	0.03	0.04	0.38	0.01	0.47	0.41	0.37
N1	0.02	0.00	0.03	0.04	0.01	0.04	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.24	0.05	0.29	0.01	0.35	0.41	0.27
N2	0.03	0.00	0.03	0.12	0.00	0.11	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.33	0.08	0.18	0.01	0.26	0.31	0.17
N3	0.03	0.00	0.02	0.08	0.00	0.08	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.26	0.07	0.19	0.01	0.29	0.30	0.18
N7	0.00	0.00	0.04	0.09	0.00	0.12	0.00	0.29	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.09	0.06	0.02	0.40	0.01	0.48	0.48	0.40
N9	0.00	0.01	0.03	0.03	0.01	0.05	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.10	0.00	0.25	0.02	0.38	0.31	0.25
O2'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.05	0.01	0.07	0.02	0.07	0.09	0.06	0.06	0.05	0.09	0.05	0.00	0.01	0.01	0.05	0.08	0.50	0.24	0.23
O3'	0.11	0.28	0.02	0.01	0.18	0.02	0.13	0.02	0.17	0.03	0.24	0.33	0.26	0.06	0.10	0.01	0.00	0.05	0.05	0.16	0.54	0.23	0.25
O4'	0.00	0.07	0.02	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.03	0.04	0.05	0.08	0.07	0.02	0.00	0.01	0.05	0.00	0.04	0.03	0.16	0.06	0.03
O5'	0.11	0.22	0.05	0.05	0.26	0.02	0.34	0.01	0.34	0.38	0.29	0.18	0.19	0.40	0.25	0.05	0.05	0.04	0.00	0.37	0.02	0.01	0.00
O6	0.02	0.01	0.04	0.03	0.01	0.05	0.01	0.23	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.08	0.16	0.03	0.37	0.00	0.43	0.49	0.36
OP1	0.33	0.31	0.44	0.47	0.36	0.24	0.42	0.05	0.40	0.47	0.35	0.26	0.29	0.48	0.38	0.50	0.54	0.16	0.02	0.43	0.00	0.01	0.00
OP2	0.19	0.34	0.22	0.20	0.34	0.08	0.43	0.02	0.45	0.41	0.41	0.31	0.30	0.48	0.31	0.24	0.23	0.06	0.01	0.49	0.01	0.00	0.01
P	0.16	0.21	0.22	0.24	0.25	0.09	0.33	0.01	0.33	0.37	0.27	0.17	0.18	0.40	0.25	0.23	0.25	0.03	0.00	0.36	0.00	0.01	0.00