Doublet Group distance statistics: 48264

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 1, 1, 1, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.009, 0.014, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.009 std_dev=0.004
C2	A	0, 0.003, 0.007, 0.012, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.007 std_dev=0.004
N1	A	0, 0.003, 0.007, 0.012, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.007 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.004, 0.009, 0.014, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.009 std_dev=0.005
C1'	A	0, 0.004, 0.009, 0.015, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.009 std_dev=0.005
C4	A	0, 0.006, 0.011, 0.017, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.011 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.005, 0.012, 0.019, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.012 std_dev=0.007
N9	A	0, 0.005, 0.015, 0.024, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.015 std_dev=0.009
N6	A	0, 0.012, 0.023, 0.035, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.023 std_dev=0.011
N7	A	0, 0.005, 0.019, 0.032, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.019 std_dev=0.013
C8	A	0, 0.004, 0.019, 0.033, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.019 std_dev=0.014
C2'	A	0, -0.005, 0.210, 0.425, 0.566 max_d=0.566 avg_d=0.210 std_dev=0.215
C2'	B	0, 0.200, 0.421, 0.642, 0.669 max_d=0.669 avg_d=0.421 std_dev=0.221
O4'	A	0, -0.009, 0.213, 0.436, 0.580 max_d=0.580 avg_d=0.213 std_dev=0.222
O2'	A	0, -0.008, 0.283, 0.574, 0.771 max_d=0.771 avg_d=0.283 std_dev=0.291
O2'	B	0, 0.208, 0.525, 0.843, 1.017 max_d=1.017 avg_d=0.525 std_dev=0.318
C4'	A	0, -0.012, 0.316, 0.645, 0.836 max_d=0.836 avg_d=0.316 std_dev=0.328
C3'	A	0, -0.019, 0.339, 0.698, 0.928 max_d=0.928 avg_d=0.339 std_dev=0.359
C5'	A	0, -0.017, 0.524, 1.065, 1.369 max_d=1.369 avg_d=0.524 std_dev=0.541
O3'	A	0, -0.036, 0.509, 1.053, 1.414 max_d=1.414 avg_d=0.509 std_dev=0.545
C3'	B	0, 0.005, 0.849, 1.693, 2.158 max_d=2.158 avg_d=0.849 std_dev=0.844
O5'	A	0, -0.107, 0.918, 1.944, 2.483 max_d=2.483 avg_d=0.918 std_dev=1.025
C1'	B	0, -0.207, 1.036, 2.278, 3.012 max_d=3.012 avg_d=1.036 std_dev=1.243
P	A	0, -0.126, 1.181, 2.489, 3.137 max_d=3.137 avg_d=1.181 std_dev=1.308
O3'	B	0, -0.107, 1.243, 2.593, 3.362 max_d=3.362 avg_d=1.243 std_dev=1.350
OP1	A	0, -0.156, 1.396, 2.948, 3.751 max_d=3.751 avg_d=1.396 std_dev=1.552
N9	B	0, -0.325, 1.233, 2.792, 3.701 max_d=3.701 avg_d=1.233 std_dev=1.558
C4'	B	0, -0.292, 1.277, 2.847, 3.768 max_d=3.768 avg_d=1.277 std_dev=1.570
C8	B	0, -0.350, 1.279, 2.908, 3.860 max_d=3.860 avg_d=1.279 std_dev=1.629
O4'	B	0, -0.418, 1.357, 3.132, 4.180 max_d=4.180 avg_d=1.357 std_dev=1.775
N7	B	0, -0.426, 1.427, 3.279, 4.346 max_d=4.346 avg_d=1.427 std_dev=1.852
OP2	A	0, -0.364, 1.735, 3.835, 4.988 max_d=4.988 avg_d=1.735 std_dev=2.100
C4	B	0, -0.571, 1.687, 3.945, 5.252 max_d=5.252 avg_d=1.687 std_dev=2.258
C5	B	0, -0.577, 1.710, 3.998, 5.322 max_d=5.322 avg_d=1.710 std_dev=2.288
C5'	B	0, -0.587, 1.940, 4.466, 5.958 max_d=5.958 avg_d=1.940 std_dev=2.527
O5'	B	0, -0.565, 1.972, 4.509, 6.046 max_d=6.046 avg_d=1.972 std_dev=2.537
N3	B	0, -0.828, 2.195, 5.218, 6.972 max_d=6.972 avg_d=2.195 std_dev=3.023
C6	B	0, -0.825, 2.219, 5.263, 7.041 max_d=7.041 avg_d=2.219 std_dev=3.044
O6	B	0, -0.848, 2.307, 5.461, 7.318 max_d=7.318 avg_d=2.307 std_dev=3.154
OP2	B	0, -0.884, 2.456, 5.796, 7.786 max_d=7.786 avg_d=2.456 std_dev=3.340
P	B	0, -0.966, 2.575, 6.116, 8.232 max_d=8.232 avg_d=2.575 std_dev=3.541
N1	B	0, -1.100, 2.748, 6.595, 8.834 max_d=8.834 avg_d=2.748 std_dev=3.848
C2	B	0, -1.104, 2.753, 6.610, 8.843 max_d=8.843 avg_d=2.753 std_dev=3.857
OP1	B	0, -1.125, 2.973, 7.070, 9.486 max_d=9.486 avg_d=2.973 std_dev=4.097
N2	B	0, -1.402, 3.413, 8.228, 11.022 max_d=11.022 avg_d=3.413 std_dev=4.815

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.20	0.13	0.34	0.21
C2	0.02	0.00	0.18	0.11	0.01	0.05	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.23	0.19	0.14	0.47	0.35	1.02	0.60
C2'	0.00	0.18	0.00	0.00	0.11	0.02	0.08	0.01	0.11	0.06	0.16	0.17	0.09	0.03	0.03	0.00	0.01	0.01	0.28	0.32	0.22	0.25
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.05	0.00	0.04	0.01	0.06	0.08	0.09	0.10	0.05	0.05	0.03	0.01	0.00	0.01	0.37	0.52	0.09	0.30
C4	0.01	0.01	0.11	0.05	0.00	0.03	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.13	0.09	0.08	0.53	0.42	0.98	0.61
C4'	0.01	0.05	0.02	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.04	0.05	0.04	0.05	0.04	0.05	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.14	0.20	0.01
C5	0.00	0.01	0.08	0.04	0.00	0.04	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.10	0.06	0.05	0.71	0.64	1.29	0.81
C5'	0.01	0.13	0.01	0.01	0.09	0.00	0.11	0.00	0.12	0.10	0.13	0.11	0.13	0.11	0.07	0.02	0.02	0.01	0.01	0.31	0.40	0.02
C6	0.01	0.01	0.11	0.06	0.00	0.04	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.14	0.10	0.08	0.71	0.66	1.40	0.86
C8	0.01	0.01	0.06	0.08	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.09	0.05	0.75	0.70	1.14	0.77
N1	0.01	0.00	0.16	0.09	0.00	0.04	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.20	0.16	0.11	0.60	0.51	1.25	0.75
N3	0.02	0.00	0.17	0.10	0.00	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.22	0.17	0.13	0.40	0.27	0.84	0.49
N6	0.01	0.00	0.09	0.05	0.00	0.04	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.09	0.06	0.81	0.80	1.59	0.98
N7	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.05	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.05	0.01	0.83	0.81	1.42	0.92
N9	0.00	0.01	0.03	0.03	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.02	0.02	0.51	0.41	0.81	0.53
O2'	0.01	0.23	0.00	0.01	0.13	0.02	0.10	0.02	0.14	0.05	0.20	0.22	0.13	0.04	0.04	0.00	0.04	0.03	0.06	0.09	0.06	0.06
O3'	0.01	0.19	0.01	0.00	0.09	0.01	0.06	0.02	0.10	0.09	0.16	0.17	0.09	0.05	0.02	0.04	0.00	0.01	0.25	0.55	0.21	0.20
O4'	0.00	0.14	0.01	0.01	0.08	0.00	0.05	0.01	0.08	0.05	0.11	0.13	0.06	0.01	0.02	0.03	0.01	0.00	0.05	0.05	0.11	0.07
O5'	0.20	0.47	0.28	0.37	0.53	0.01	0.71	0.01	0.71	0.75	0.60	0.40	0.81	0.83	0.51	0.06	0.25	0.05	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.13	0.35	0.32	0.52	0.42	0.14	0.64	0.31	0.66	0.70	0.51	0.27	0.80	0.81	0.41	0.09	0.55	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.34	1.02	0.22	0.09	0.98	0.20	1.29	0.40	1.40	1.14	1.25	0.84	1.59	1.42	0.81	0.06	0.21	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.21	0.60	0.25	0.30	0.61	0.01	0.81	0.02	0.86	0.77	0.75	0.49	0.98	0.92	0.53	0.06	0.20	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.73	2.46	0.34	0.46	1.47	0.48	1.29	1.05	1.71	0.41	2.26	3.03	2.10	0.67	0.87	0.47	0.94	0.29	0.95	1.62	1.96	1.06	1.31
C2	0.62	1.50	0.33	0.32	0.99	0.31	0.86	0.65	1.06	0.39	1.36	1.78	1.36	0.52	0.67	0.42	0.70	0.32	0.54	0.99	1.08	0.56	0.70
C2'	0.71	2.35	0.28	0.53	1.43	0.42	1.30	0.88	1.70	0.47	2.20	2.87	1.99	0.73	0.87	0.36	1.09	0.39	0.79	1.64	1.73	0.86	1.08
C3'	0.85	2.76	0.33	0.51	1.69	0.41	1.55	0.94	2.03	0.59	2.61	3.36	2.32	0.90	1.04	0.41	1.12	0.47	0.85	1.97	1.96	0.96	1.20
C4	0.78	2.25	0.35	0.45	1.42	0.44	1.24	0.98	1.57	0.47	2.04	2.70	1.98	0.69	0.89	0.46	0.96	0.37	0.84	1.48	1.73	0.89	1.13
C4'	0.84	2.92	0.40	0.44	1.74	0.48	1.56	1.12	2.08	0.52	2.72	3.60	2.44	0.84	1.03	0.52	0.98	0.35	1.02	2.00	2.21	1.19	1.47
C5	0.90	2.45	0.35	0.50	1.60	0.44	1.40	1.04	1.75	0.58	2.23	2.89	2.19	0.82	1.04	0.45	1.11	0.50	0.88	1.64	1.88	0.92	1.19
C5'	0.99	3.33	0.52	0.39	2.00	0.46	1.81	1.18	2.41	0.64	3.13	4.10	2.78	1.00	1.21	0.65	0.95	0.42	1.08	2.33	2.43	1.29	1.61
C6	0.93	2.12	0.35	0.47	1.47	0.37	1.28	0.89	1.54	0.61	1.92	2.43	1.95	0.80	1.02	0.43	1.09	0.58	0.71	1.43	1.54	0.71	0.94
C8	0.90	2.87	0.35	0.54	1.78	0.51	1.58	1.18	2.05	0.57	2.65	3.47	2.46	0.88	1.09	0.47	1.16	0.44	1.05	1.94	2.28	1.16	1.47
N1	0.75	1.58	0.34	0.35	1.11	0.29	0.96	0.64	1.15	0.49	1.43	1.81	1.46	0.62	0.79	0.42	0.84	0.46	0.51	1.07	1.08	0.52	0.66
N3	0.64	1.81	0.33	0.37	1.14	0.38	0.99	0.81	1.26	0.38	1.64	2.19	1.60	0.56	0.72	0.44	0.77	0.29	0.68	1.18	1.38	0.73	0.91
N6	1.09	2.23	0.34	0.53	1.66	0.33	1.45	0.88	1.68	0.76	2.04	2.47	2.10	0.96	1.20	0.38	1.27	0.78	0.70	1.56	1.59	0.66	0.91
N7	0.97	2.88	0.35	0.56	1.84	0.49	1.63	1.17	2.07	0.64	2.65	3.41	2.51	0.94	1.16	0.45	1.22	0.53	1.03	1.96	2.27	1.11	1.43
N9	0.80	2.54	0.35	0.48	1.56	0.48	1.37	1.08	1.78	0.47	2.33	3.08	2.19	0.74	0.95	0.47	1.02	0.36	0.96	1.68	2.00	1.05	1.32
O2'	0.58	2.04	0.26	0.53	1.21	0.43	1.09	0.82	1.46	0.36	1.91	2.52	1.71	0.59	0.71	0.33	1.02	0.29	0.75	1.41	1.56	0.81	0.99
O3'	0.81	2.68	0.29	0.54	1.64	0.40	1.53	0.86	2.01	0.60	2.55	3.25	2.23	0.91	1.01	0.36	1.17	0.49	0.77	1.97	1.83	0.86	1.09
O4'	0.81	2.82	0.42	0.42	1.66	0.53	1.45	1.21	1.94	0.43	2.59	3.49	2.38	0.73	0.96	0.58	0.90	0.26	1.11	1.84	2.28	1.28	1.57
O5'	1.51	3.98	1.04	0.20	2.60	0.08	2.44	0.66	3.06	1.21	3.80	4.75	3.39	1.60	1.77	1.12	0.38	0.92	0.52	2.99	1.86	0.70	1.05
OP1	1.41	4.17	0.98	0.12	2.63	0.11	2.50	0.84	3.23	1.13	4.03	5.02	3.47	1.58	1.72	1.04	0.44	0.75	0.69	3.19	2.07	0.88	1.25
OP2	2.55	5.40	1.99	1.05	3.85	0.92	3.73	0.17	4.47	2.33	5.27	6.23	4.68	2.80	2.91	2.00	0.40	1.89	0.34	4.43	1.21	0.23	0.27
P	1.75	4.49	1.28	0.36	2.96	0.20	2.80	0.60	3.51	1.45	4.32	5.34	3.81	1.88	2.05	1.36	0.22	1.08	0.45	3.45	1.91	0.67	1.04

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.02	0.04	0.13	0.07
C2	0.03	0.00	0.25	0.22	0.01	0.03	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.20	0.32	0.18	0.05	0.02	0.06	0.17	0.15
C2'	0.00	0.25	0.00	0.00	0.13	0.02	0.06	0.01	0.11	0.14	0.18	0.30	0.25	0.08	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.08	0.06	0.07	0.04
C3'	0.01	0.22	0.00	0.00	0.13	0.00	0.07	0.02	0.12	0.13	0.18	0.27	0.21	0.06	0.02	0.02	0.00	0.01	0.04	0.10	0.07	0.05	0.03
C4	0.01	0.01	0.13	0.13	0.00	0.02	0.00	0.06	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.10	0.16	0.10	0.04	0.01	0.06	0.16	0.11
C4'	0.00	0.03	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.03	0.02	0.03	0.01	0.06	0.02	0.00	0.02	0.02	0.05	0.05	0.02
C5	0.01	0.01	0.06	0.07	0.00	0.02	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.09	0.06	0.05	0.01	0.08	0.16	0.12
C5'	0.01	0.10	0.01	0.02	0.06	0.01	0.07	0.00	0.08	0.03	0.10	0.12	0.09	0.05	0.04	0.06	0.04	0.01	0.01	0.08	0.05	0.02	0.00
C6	0.01	0.01	0.11	0.12	0.01	0.02	0.01	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.17	0.09	0.05	0.01	0.09	0.17	0.14
C8	0.01	0.01	0.14	0.13	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.10	0.15	0.08	0.04	0.01	0.07	0.14	0.08
N1	0.02	0.00	0.18	0.18	0.02	0.03	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.15	0.26	0.15	0.06	0.02	0.08	0.18	0.15
N2	0.03	0.00	0.30	0.27	0.02	0.03	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.26	0.39	0.21	0.05	0.03	0.06	0.17	0.15
N3	0.02	0.01	0.25	0.21	0.01	0.02	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.20	0.29	0.17	0.04	0.02	0.05	0.16	0.13
N7	0.01	0.01	0.08	0.06	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.08	0.03	0.05	0.01	0.09	0.16	0.10
N9	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.03	0.01	0.05	0.14	0.09
O2'	0.01	0.20	0.00	0.02	0.10	0.06	0.04	0.06	0.08	0.10	0.15	0.26	0.20	0.06	0.00	0.00	0.04	0.05	0.05	0.06	0.08	0.08	0.05
O3'	0.01	0.32	0.02	0.00	0.16	0.02	0.09	0.04	0.17	0.15	0.26	0.39	0.29	0.08	0.02	0.04	0.00	0.01	0.05	0.14	0.10	0.04	0.04
O4'	0.00	0.18	0.01	0.01	0.10	0.00	0.06	0.01	0.09	0.08	0.15	0.21	0.17	0.03	0.02	0.05	0.01	0.00	0.06	0.07	0.05	0.13	0.09
O5'	0.04	0.05	0.03	0.04	0.04	0.02	0.05	0.01	0.05	0.04	0.06	0.05	0.04	0.05	0.03	0.05	0.05	0.06	0.00	0.06	0.01	0.02	0.00
O6	0.02	0.02	0.08	0.10	0.01	0.02	0.01	0.08	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.06	0.14	0.07	0.06	0.00	0.10	0.17	0.13
OP1	0.04	0.06	0.06	0.07	0.06	0.05	0.08	0.05	0.09	0.07	0.08	0.06	0.05	0.09	0.05	0.08	0.10	0.05	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00
OP2	0.13	0.17	0.07	0.05	0.16	0.05	0.16	0.02	0.17	0.14	0.18	0.17	0.16	0.16	0.14	0.08	0.04	0.13	0.02	0.17	0.01	0.00	0.00
P	0.07	0.15	0.04	0.03	0.11	0.02	0.12	0.00	0.14	0.08	0.15	0.15	0.13	0.10	0.09	0.05	0.04	0.09	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00