Doublet Group distance statistics: 48265

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 2, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.008, 0.012, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.008 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.008, 0.017, 0.025, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.017 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.010, 0.019, 0.027, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.019 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.001, 0.009, 0.018, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.009 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.004, 0.013, 0.022, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.013 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.009, 0.018, 0.027, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.018 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.010, 0.019, 0.029, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.019 std_dev=0.009
N6	A	0, 0.009, 0.023, 0.037, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.023 std_dev=0.014
N7	A	0, 0.015, 0.031, 0.047, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.031 std_dev=0.016
N9	A	0, 0.020, 0.039, 0.057, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.039 std_dev=0.019
C8	A	0, 0.009, 0.029, 0.049, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.029 std_dev=0.020
O4'	A	0, 0.147, 0.276, 0.405, 0.404 max_d=0.404 avg_d=0.276 std_dev=0.129
C2'	A	0, 0.212, 0.393, 0.573, 0.614 max_d=0.614 avg_d=0.393 std_dev=0.180
C2'	B	0, 0.310, 0.620, 0.930, 1.102 max_d=1.102 avg_d=0.620 std_dev=0.310
C4'	A	0, 0.462, 0.805, 1.148, 1.006 max_d=1.006 avg_d=0.805 std_dev=0.343
C5'	A	0, 0.412, 0.809, 1.205, 1.129 max_d=1.129 avg_d=0.809 std_dev=0.397
C3'	A	0, 0.680, 1.167, 1.654, 1.440 max_d=1.440 avg_d=1.167 std_dev=0.487
O2'	B	0, 0.579, 1.102, 1.625, 1.633 max_d=1.633 avg_d=1.102 std_dev=0.523
O2'	A	0, 0.799, 1.355, 1.910, 1.681 max_d=1.681 avg_d=1.355 std_dev=0.555
C3'	B	0, 0.850, 1.459, 2.067, 1.866 max_d=1.866 avg_d=1.459 std_dev=0.608
C1'	B	0, 0.875, 1.533, 2.191, 1.966 max_d=1.966 avg_d=1.533 std_dev=0.658
C4'	B	0, 1.041, 1.810, 2.579, 2.319 max_d=2.319 avg_d=1.810 std_dev=0.769
O3'	B	0, 1.088, 1.947, 2.807, 2.532 max_d=2.532 avg_d=1.947 std_dev=0.860
O4'	B	0, 1.138, 2.008, 2.878, 2.578 max_d=2.578 avg_d=2.008 std_dev=0.870
N9	B	0, 1.162, 2.077, 2.992, 2.681 max_d=2.681 avg_d=2.077 std_dev=0.915
O3'	A	0, 1.358, 2.315, 3.272, 2.832 max_d=2.832 avg_d=2.315 std_dev=0.957
C5'	B	0, 1.352, 2.347, 3.342, 2.985 max_d=2.985 avg_d=2.347 std_dev=0.995
OP1	B	0, 1.473, 2.502, 3.532, 3.158 max_d=3.158 avg_d=2.502 std_dev=1.030
P	A	0, 1.342, 2.372, 3.403, 3.019 max_d=3.019 avg_d=2.372 std_dev=1.031
C8	B	0, 1.383, 2.438, 3.493, 3.200 max_d=3.200 avg_d=2.438 std_dev=1.055
P	B	0, 1.501, 2.564, 3.627, 3.236 max_d=3.236 avg_d=2.564 std_dev=1.063
O5'	B	0, 1.444, 2.510, 3.577, 3.233 max_d=3.233 avg_d=2.510 std_dev=1.067
C4	B	0, 1.348, 2.530, 3.711, 3.315 max_d=3.315 avg_d=2.530 std_dev=1.182
OP2	B	0, 1.650, 2.833, 4.015, 3.556 max_d=3.556 avg_d=2.833 std_dev=1.182
O5'	A	0, 0.879, 2.067, 3.255, 2.884 max_d=2.884 avg_d=2.067 std_dev=1.188
OP1	A	0, 1.785, 3.037, 4.288, 3.762 max_d=3.762 avg_d=3.037 std_dev=1.252
N3	B	0, 1.305, 2.605, 3.905, 3.493 max_d=3.493 avg_d=2.605 std_dev=1.300
N7	B	0, 1.673, 3.016, 4.359, 3.992 max_d=3.992 avg_d=3.016 std_dev=1.343
C5	B	0, 1.642, 3.054, 4.465, 4.045 max_d=4.045 avg_d=3.054 std_dev=1.412
C2	B	0, 1.553, 3.201, 4.849, 4.305 max_d=4.305 avg_d=3.201 std_dev=1.648
C6	B	0, 1.914, 3.669, 5.424, 4.903 max_d=4.903 avg_d=3.669 std_dev=1.755
OP2	A	0, 2.207, 3.998, 5.789, 5.085 max_d=5.085 avg_d=3.998 std_dev=1.791
N1	B	0, 1.826, 3.660, 5.494, 4.923 max_d=4.923 avg_d=3.660 std_dev=1.834
N2	B	0, 1.593, 3.479, 5.364, 4.733 max_d=4.733 avg_d=3.479 std_dev=1.886
O6	B	0, 2.243, 4.273, 6.303, 5.721 max_d=5.721 avg_d=4.273 std_dev=2.030

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.10	0.00	0.31	0.48	0.24	0.37
C2	0.02	0.00	0.06	0.07	0.01	0.05	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.21	0.03	0.38	0.75	0.42	0.52
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.07	0.02	0.05	0.04	0.06	0.02	0.04	0.01	0.00	0.02	0.02	0.44	0.70	0.38	0.59
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.11	0.05	0.07	0.08	0.10	0.05	0.01	0.00	0.01	0.21	0.33	0.20	0.33
C4	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.01	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.10	0.12	0.02	0.47	0.83	0.46	0.58
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.01	0.03	0.10	0.02	0.05	0.06	0.09	0.04	0.08	0.01	0.00	0.01	0.06	0.08	0.04
C5	0.01	0.01	0.01	0.06	0.00	0.05	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.12	0.07	0.02	0.60	1.09	0.63	0.73
C5'	0.03	0.05	0.07	0.01	0.08	0.01	0.15	0.00	0.14	0.19	0.09	0.03	0.18	0.20	0.10	0.05	0.06	0.02	0.01	0.11	0.13	0.01
C6	0.01	0.00	0.02	0.06	0.00	0.03	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.13	0.10	0.02	0.58	1.11	0.65	0.74
C8	0.01	0.01	0.05	0.11	0.00	0.10	0.00	0.19	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.10	0.03	0.02	0.69	1.13	0.64	0.77
N1	0.02	0.00	0.04	0.05	0.00	0.02	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.13	0.16	0.03	0.48	0.95	0.54	0.64
N3	0.02	0.00	0.06	0.07	0.00	0.05	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.11	0.20	0.03	0.34	0.66	0.35	0.46
N6	0.01	0.01	0.02	0.08	0.00	0.06	0.01	0.18	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.13	0.07	0.02	0.65	1.26	0.75	0.82
N7	0.01	0.01	0.04	0.10	0.00	0.09	0.00	0.20	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.12	0.02	0.02	0.71	1.28	0.73	0.84
N9	0.00	0.01	0.01	0.05	0.00	0.04	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.06	0.01	0.50	0.80	0.44	0.57
O2'	0.01	0.12	0.00	0.01	0.10	0.08	0.12	0.05	0.13	0.10	0.13	0.11	0.13	0.12	0.07	0.00	0.03	0.06	0.44	0.78	0.42	0.66
O3'	0.10	0.21	0.02	0.00	0.12	0.01	0.07	0.06	0.10	0.03	0.16	0.20	0.07	0.02	0.06	0.03	0.00	0.07	0.09	0.18	0.10	0.20
O4'	0.00	0.03	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.02	0.02	0.01	0.06	0.07	0.00	0.09	0.12	0.06	0.08
O5'	0.31	0.38	0.44	0.21	0.47	0.01	0.60	0.01	0.58	0.69	0.48	0.34	0.65	0.71	0.50	0.44	0.09	0.09	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.48	0.75	0.70	0.33	0.83	0.06	1.09	0.11	1.11	1.13	0.95	0.66	1.26	1.28	0.80	0.78	0.18	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.24	0.42	0.38	0.20	0.46	0.08	0.63	0.13	0.65	0.64	0.54	0.35	0.75	0.73	0.44	0.42	0.10	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.37	0.52	0.59	0.33	0.58	0.04	0.73	0.01	0.74	0.77	0.64	0.46	0.82	0.84	0.57	0.66	0.20	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.62	1.19	0.09	0.21	0.98	0.41	1.09	0.48	1.23	0.87	1.29	1.27	1.00	1.01	0.82	0.09	0.32	0.72	0.62	1.29	0.71	0.85	0.70
C2	0.41	0.49	0.09	0.10	0.60	0.19	0.67	0.27	0.67	0.63	0.58	0.32	0.50	0.69	0.57	0.11	0.18	0.41	0.45	0.69	0.64	0.76	0.59
C2'	0.56	1.09	0.07	0.12	0.88	0.31	0.98	0.35	1.13	0.77	1.18	1.15	0.91	0.90	0.74	0.09	0.21	0.63	0.49	1.19	0.58	0.74	0.58
C3'	0.62	1.22	0.09	0.16	1.00	0.38	1.14	0.44	1.33	0.90	1.37	1.28	1.01	1.07	0.84	0.09	0.24	0.71	0.60	1.44	0.67	0.85	0.69
C4	0.58	1.00	0.08	0.19	0.87	0.35	0.92	0.40	0.99	0.76	1.02	0.99	0.90	0.86	0.74	0.10	0.31	0.63	0.54	1.01	0.67	0.79	0.64
C4'	0.68	1.37	0.12	0.25	1.11	0.49	1.27	0.57	1.48	1.00	1.53	1.46	1.12	1.19	0.93	0.09	0.35	0.82	0.72	1.59	0.77	0.94	0.79
C5	0.60	0.93	0.09	0.25	0.83	0.37	0.84	0.38	0.90	0.71	0.93	0.93	0.89	0.78	0.72	0.16	0.39	0.64	0.52	0.90	0.66	0.76	0.61
C5'	0.62	1.38	0.06	0.19	1.08	0.42	1.24	0.49	1.46	0.94	1.53	1.49	1.12	1.13	0.87	0.19	0.29	0.76	0.64	1.58	0.66	0.85	0.69
C6	0.54	0.66	0.09	0.23	0.67	0.29	0.67	0.30	0.68	0.60	0.67	0.61	0.68	0.64	0.62	0.17	0.38	0.53	0.46	0.68	0.64	0.72	0.57
C8	0.66	1.18	0.10	0.28	0.96	0.45	1.00	0.46	1.11	0.80	1.19	1.27	1.05	0.91	0.81	0.16	0.43	0.75	0.59	1.13	0.68	0.79	0.65
N1	0.43	0.42	0.08	0.12	0.53	0.18	0.56	0.24	0.54	0.55	0.48	0.30	0.45	0.58	0.53	0.10	0.24	0.39	0.41	0.55	0.63	0.72	0.56
N3	0.49	0.81	0.08	0.12	0.77	0.27	0.85	0.35	0.91	0.73	0.88	0.69	0.73	0.82	0.67	0.10	0.22	0.53	0.51	0.94	0.66	0.79	0.63
N6	0.51	0.57	0.12	0.31	0.57	0.29	0.56	0.27	0.57	0.51	0.57	0.54	0.59	0.53	0.54	0.26	0.50	0.50	0.42	0.56	0.62	0.67	0.53
N7	0.64	1.06	0.11	0.31	0.89	0.43	0.91	0.42	0.99	0.74	1.05	1.12	0.98	0.82	0.76	0.20	0.46	0.71	0.55	0.99	0.66	0.75	0.62
N9	0.63	1.15	0.09	0.23	0.95	0.41	1.02	0.45	1.13	0.82	1.19	1.22	1.01	0.93	0.80	0.11	0.35	0.71	0.59	1.16	0.69	0.81	0.67
O2'	0.55	0.92	0.15	0.19	0.79	0.30	0.88	0.33	0.98	0.73	1.00	0.93	0.79	0.83	0.69	0.21	0.27	0.59	0.47	1.04	0.60	0.74	0.58
O3'	0.73	1.27	0.24	0.28	1.10	0.50	1.28	0.59	1.46	1.05	1.47	1.27	1.06	1.23	0.96	0.24	0.34	0.81	0.75	1.59	0.83	1.02	0.85
O4'	0.67	1.32	0.11	0.28	1.07	0.51	1.20	0.59	1.37	0.95	1.44	1.42	1.10	1.12	0.90	0.10	0.40	0.82	0.72	1.45	0.78	0.92	0.79
O5'	0.37	1.34	0.33	0.19	0.94	0.14	1.13	0.22	1.42	0.74	1.53	1.50	1.00	0.99	0.67	0.60	0.17	0.53	0.38	1.57	0.33	0.57	0.41
OP1	0.25	1.29	0.79	0.69	0.80	0.40	1.02	0.37	1.38	0.55	1.52	1.49	0.89	0.84	0.49	1.15	0.75	0.34	0.33	1.56	0.39	0.38	0.33
OP2	0.35	1.27	0.47	0.33	0.86	0.22	1.04	0.23	1.33	0.65	1.45	1.44	0.94	0.89	0.60	0.73	0.28	0.49	0.29	1.48	0.25	0.42	0.30
P	0.25	1.28	0.49	0.34	0.84	0.06	1.02	0.09	1.32	0.60	1.45	1.47	0.93	0.86	0.56	0.79	0.34	0.42	0.21	1.47	0.15	0.37	0.23

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.00	0.01	0.21	0.00	0.14	0.01	0.32	0.28	0.20
C2	0.02	0.00	0.25	0.19	0.01	0.06	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.09	0.10	0.18	0.11	0.01	0.18	0.11	0.09
C2'	0.00	0.25	0.00	0.00	0.13	0.01	0.06	0.17	0.11	0.14	0.19	0.30	0.25	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.37	0.08	0.69	0.68	0.57
C3'	0.01	0.19	0.00	0.00	0.21	0.00	0.26	0.01	0.28	0.22	0.24	0.17	0.16	0.27	0.17	0.01	0.00	0.02	0.03	0.31	0.42	0.22	0.23
C4	0.01	0.01	0.13	0.21	0.00	0.01	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.08	0.04	0.10	0.08	0.00	0.16	0.12	0.09
C4'	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.00	0.04	0.12	0.02	0.09	0.06	0.11	0.04	0.22	0.01	0.00	0.01	0.07	0.20	0.09	0.08
C5	0.00	0.00	0.06	0.26	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.20	0.10	0.05	0.06	0.01	0.08	0.09	0.07
C5'	0.07	0.14	0.17	0.01	0.08	0.00	0.06	0.00	0.07	0.05	0.11	0.16	0.13	0.06	0.05	0.06	0.17	0.01	0.00	0.07	0.03	0.01	0.01
C6	0.01	0.00	0.11	0.28	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.17	0.10	0.08	0.06	0.00	0.07	0.11	0.08
C8	0.01	0.01	0.14	0.22	0.00	0.12	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.32	0.13	0.09	0.05	0.02	0.09	0.11	0.07
N1	0.01	0.00	0.19	0.24	0.01	0.02	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.04	0.15	0.08	0.01	0.11	0.08	0.07
N2	0.02	0.00	0.30	0.17	0.01	0.09	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.19	0.16	0.21	0.12	0.02	0.22	0.12	0.11
N3	0.02	0.00	0.25	0.16	0.00	0.06	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.11	0.13	0.17	0.12	0.01	0.22	0.15	0.12
N7	0.00	0.01	0.08	0.27	0.00	0.11	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.32	0.17	0.05	0.07	0.02	0.07	0.10	0.09
N9	0.00	0.01	0.01	0.17	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.16	0.03	0.01	0.09	0.01	0.19	0.17	0.11
O2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.08	0.22	0.20	0.06	0.17	0.32	0.07	0.19	0.11	0.32	0.16	0.00	0.02	0.15	0.28	0.22	0.66	0.80	0.55
O3'	0.21	0.10	0.01	0.00	0.04	0.01	0.10	0.17	0.10	0.13	0.04	0.16	0.13	0.17	0.03	0.02	0.00	0.15	0.15	0.16	0.16	0.06	0.05
O4'	0.00	0.18	0.01	0.02	0.10	0.00	0.05	0.01	0.08	0.09	0.15	0.21	0.17	0.05	0.01	0.15	0.15	0.00	0.03	0.06	0.10	0.05	0.04
O5'	0.14	0.11	0.37	0.03	0.08	0.01	0.06	0.00	0.06	0.05	0.08	0.12	0.12	0.07	0.09	0.28	0.15	0.03	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.08	0.31	0.00	0.07	0.01	0.07	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.22	0.16	0.06	0.08	0.00	0.11	0.17	0.13
OP1	0.32	0.18	0.69	0.42	0.16	0.20	0.08	0.03	0.07	0.09	0.11	0.22	0.22	0.07	0.19	0.66	0.16	0.10	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00
OP2	0.28	0.11	0.68	0.22	0.12	0.09	0.09	0.01	0.11	0.11	0.08	0.12	0.15	0.10	0.17	0.80	0.06	0.05	0.01	0.17	0.01	0.00	0.00
P	0.20	0.09	0.57	0.23	0.09	0.08	0.07	0.01	0.08	0.07	0.07	0.11	0.12	0.09	0.11	0.55	0.05	0.04	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00