Doublet Group distance statistics: 48266

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.003, 0.006, 0.010, 0.011 max_d=0.011 avg_d=0.006 std_dev=0.004
C1'	A	0, 0.003, 0.009, 0.015, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.002, 0.009, 0.016, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.009 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.010 std_dev=0.010
N9	A	0, 0.004, 0.014, 0.025, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.014 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.004, 0.014, 0.025, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.003, 0.014, 0.025, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.000, 0.015, 0.029, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.015 std_dev=0.014
N6	A	0, 0.007, 0.026, 0.046, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.026 std_dev=0.019
C8	A	0, 0.010, 0.033, 0.055, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.033 std_dev=0.023
N7	A	0, 0.011, 0.034, 0.057, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.034 std_dev=0.023
C2'	A	0, 0.013, 0.136, 0.258, 0.346 max_d=0.346 avg_d=0.136 std_dev=0.122
O4'	A	0, 0.021, 0.153, 0.285, 0.374 max_d=0.374 avg_d=0.153 std_dev=0.132
O2'	A	0, 0.041, 0.179, 0.317, 0.421 max_d=0.421 avg_d=0.179 std_dev=0.138
C4'	A	0, 0.024, 0.204, 0.384, 0.508 max_d=0.508 avg_d=0.204 std_dev=0.180
C3'	A	0, 0.022, 0.229, 0.437, 0.571 max_d=0.571 avg_d=0.229 std_dev=0.207
O2'	B	0, 0.042, 0.288, 0.533, 0.709 max_d=0.709 avg_d=0.288 std_dev=0.246
OP2	A	0, 0.081, 0.355, 0.628, 0.809 max_d=0.809 avg_d=0.355 std_dev=0.273
O3'	B	0, 0.127, 0.402, 0.678, 0.821 max_d=0.821 avg_d=0.402 std_dev=0.275
C4'	B	0, 0.095, 0.373, 0.652, 0.813 max_d=0.813 avg_d=0.373 std_dev=0.278
O5'	A	0, 0.003, 0.291, 0.578, 0.804 max_d=0.804 avg_d=0.291 std_dev=0.288
C1'	B	0, 0.078, 0.368, 0.657, 0.846 max_d=0.846 avg_d=0.368 std_dev=0.290
C2'	B	0, 0.062, 0.355, 0.647, 0.852 max_d=0.852 avg_d=0.355 std_dev=0.293
O4'	B	0, 0.092, 0.385, 0.678, 0.841 max_d=0.841 avg_d=0.385 std_dev=0.293
P	A	0, 0.073, 0.369, 0.664, 0.856 max_d=0.856 avg_d=0.369 std_dev=0.296
O3'	A	0, 0.021, 0.319, 0.617, 0.809 max_d=0.809 avg_d=0.319 std_dev=0.298
C3'	B	0, 0.100, 0.403, 0.707, 0.893 max_d=0.893 avg_d=0.403 std_dev=0.304
C5'	A	0, 0.026, 0.346, 0.666, 0.887 max_d=0.887 avg_d=0.346 std_dev=0.320
OP1	A	0, 0.103, 0.427, 0.752, 0.918 max_d=0.918 avg_d=0.427 std_dev=0.324
N3	B	0, 0.094, 0.419, 0.745, 0.864 max_d=0.864 avg_d=0.419 std_dev=0.325
N9	B	0, 0.085, 0.418, 0.750, 0.949 max_d=0.949 avg_d=0.418 std_dev=0.332
C4	B	0, 0.100, 0.437, 0.774, 0.923 max_d=0.923 avg_d=0.437 std_dev=0.337
C5'	B	0, 0.140, 0.487, 0.834, 1.010 max_d=1.010 avg_d=0.487 std_dev=0.347
C5	B	0, 0.124, 0.496, 0.868, 0.932 max_d=0.932 avg_d=0.496 std_dev=0.372
C2	B	0, 0.076, 0.452, 0.828, 0.905 max_d=0.905 avg_d=0.452 std_dev=0.376
C8	B	0, 0.115, 0.493, 0.871, 1.051 max_d=1.051 avg_d=0.493 std_dev=0.378
N7	B	0, 0.136, 0.533, 0.930, 1.032 max_d=1.032 avg_d=0.533 std_dev=0.397
N2	B	0, 0.049, 0.453, 0.857, 1.003 max_d=1.003 avg_d=0.453 std_dev=0.404
O5'	B	0, 0.212, 0.619, 1.027, 1.198 max_d=1.198 avg_d=0.619 std_dev=0.407
C6	B	0, 0.131, 0.540, 0.949, 1.065 max_d=1.065 avg_d=0.540 std_dev=0.409
N1	B	0, 0.103, 0.516, 0.928, 1.087 max_d=1.087 avg_d=0.516 std_dev=0.413
O6	B	0, 0.154, 0.607, 1.061, 1.280 max_d=1.280 avg_d=0.607 std_dev=0.454
OP1	B	0, 0.263, 0.749, 1.236, 1.379 max_d=1.379 avg_d=0.749 std_dev=0.486
P	B	0, 0.249, 0.761, 1.273, 1.461 max_d=1.461 avg_d=0.761 std_dev=0.512
OP2	B	0, 0.314, 0.904, 1.495, 1.680 max_d=1.680 avg_d=0.904 std_dev=0.591

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.04	0.05	0.09	0.03
C2	0.01	0.00	0.12	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.14	0.12	0.05	0.04	0.07	0.14	0.07
C2'	0.01	0.12	0.00	0.01	0.06	0.01	0.04	0.01	0.07	0.05	0.10	0.11	0.06	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.05	0.07	0.12	0.06
C3'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.02	0.04	0.10	0.07	0.08	0.03	0.08	0.03	0.02	0.00	0.00	0.09	0.10	0.15	0.09
C4	0.01	0.01	0.06	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.07	0.04	0.03	0.05	0.08	0.14	0.07
C4'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.06	0.02	0.00	0.02	0.04	0.04	0.02
C5	0.01	0.01	0.04	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.05	0.03	0.01	0.06	0.10	0.15	0.08
C5'	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.00	0.02	0.04	0.01	0.01	0.03	0.04	0.03	0.06	0.03	0.01	0.01	0.05	0.02	0.02
C6	0.00	0.01	0.07	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.08	0.05	0.02	0.05	0.09	0.15	0.08
C8	0.01	0.01	0.05	0.10	0.00	0.03	0.01	0.04	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.03	0.11	0.04	0.08	0.10	0.14	0.08
N1	0.01	0.01	0.10	0.07	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.12	0.10	0.03	0.04	0.08	0.14	0.08
N3	0.02	0.01	0.11	0.08	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.13	0.11	0.05	0.04	0.06	0.13	0.06
N6	0.01	0.01	0.06	0.03	0.02	0.02	0.02	0.03	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.03	0.02	0.08	0.04	0.02	0.06	0.10	0.15	0.09
N7	0.01	0.01	0.03	0.08	0.00	0.02	0.00	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.08	0.02	0.07	0.11	0.16	0.09
N9	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.06	0.07	0.13	0.06
O2'	0.02	0.14	0.01	0.02	0.07	0.06	0.05	0.06	0.08	0.03	0.12	0.13	0.08	0.01	0.02	0.00	0.05	0.04	0.08	0.09	0.13	0.07
O3'	0.02	0.12	0.02	0.00	0.04	0.02	0.03	0.03	0.05	0.11	0.10	0.11	0.04	0.08	0.03	0.05	0.00	0.02	0.11	0.11	0.15	0.10
O4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.03	0.05	0.02	0.02	0.01	0.04	0.02	0.00	0.05	0.06	0.03	0.05
O5'	0.04	0.04	0.05	0.09	0.05	0.02	0.06	0.01	0.05	0.08	0.04	0.04	0.06	0.07	0.06	0.08	0.11	0.05	0.00	0.02	0.03	0.01
OP1	0.05	0.07	0.07	0.10	0.08	0.04	0.10	0.05	0.09	0.10	0.08	0.06	0.10	0.11	0.07	0.09	0.11	0.06	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.09	0.14	0.12	0.15	0.14	0.04	0.15	0.02	0.15	0.14	0.14	0.13	0.15	0.16	0.13	0.13	0.15	0.03	0.03	0.01	0.00	0.01
P	0.03	0.07	0.06	0.09	0.07	0.02	0.08	0.02	0.08	0.08	0.08	0.06	0.09	0.09	0.06	0.07	0.10	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.05	0.17	0.07	0.08	0.08	0.10	0.05	0.16	0.09	0.05	0.14	0.22	0.15	0.04	0.05	0.05	0.07	0.07	0.17	0.06	0.19	0.18	0.20
C2	0.08	0.17	0.13	0.13	0.10	0.10	0.07	0.12	0.08	0.05	0.13	0.21	0.15	0.05	0.08	0.12	0.16	0.07	0.14	0.06	0.10	0.12	0.12
C2'	0.05	0.18	0.04	0.04	0.09	0.05	0.08	0.09	0.11	0.04	0.15	0.23	0.16	0.05	0.05	0.03	0.03	0.05	0.10	0.10	0.13	0.12	0.13
C3'	0.05	0.19	0.05	0.05	0.10	0.05	0.09	0.10	0.12	0.05	0.17	0.24	0.16	0.06	0.06	0.05	0.05	0.05	0.10	0.11	0.12	0.12	0.12
C4	0.05	0.17	0.06	0.07	0.08	0.08	0.05	0.12	0.08	0.03	0.13	0.22	0.15	0.02	0.04	0.05	0.06	0.05	0.12	0.06	0.11	0.12	0.13
C4'	0.04	0.19	0.05	0.07	0.09	0.07	0.07	0.13	0.11	0.03	0.16	0.24	0.16	0.03	0.04	0.04	0.07	0.05	0.15	0.10	0.18	0.16	0.18
C5	0.04	0.16	0.03	0.03	0.07	0.05	0.06	0.08	0.09	0.04	0.13	0.21	0.14	0.04	0.04	0.03	0.04	0.05	0.08	0.08	0.06	0.07	0.08
C5'	0.06	0.21	0.05	0.07	0.11	0.07	0.10	0.13	0.14	0.04	0.19	0.26	0.18	0.05	0.06	0.04	0.08	0.06	0.13	0.13	0.17	0.15	0.16
C6	0.03	0.15	0.05	0.04	0.06	0.04	0.05	0.05	0.07	0.05	0.12	0.20	0.13	0.04	0.03	0.06	0.05	0.05	0.06	0.06	0.04	0.06	0.05
C8	0.04	0.17	0.02	0.03	0.08	0.05	0.07	0.10	0.11	0.05	0.15	0.23	0.14	0.05	0.04	0.02	0.04	0.05	0.10	0.10	0.10	0.10	0.11
N1	0.05	0.15	0.11	0.10	0.08	0.07	0.05	0.06	0.07	0.03	0.12	0.20	0.14	0.03	0.05	0.12	0.13	0.05	0.08	0.05	0.04	0.07	0.06
N3	0.08	0.18	0.11	0.12	0.10	0.11	0.07	0.15	0.09	0.05	0.14	0.23	0.16	0.05	0.08	0.09	0.12	0.08	0.16	0.06	0.14	0.15	0.16
N6	0.07	0.14	0.02	0.03	0.07	0.06	0.07	0.06	0.08	0.09	0.11	0.19	0.11	0.08	0.06	0.04	0.04	0.10	0.07	0.07	0.07	0.07	0.07
N7	0.06	0.17	0.03	0.04	0.09	0.04	0.09	0.07	0.12	0.07	0.15	0.22	0.15	0.07	0.06	0.03	0.06	0.06	0.07	0.11	0.06	0.07	0.08
N9	0.04	0.17	0.05	0.05	0.08	0.07	0.06	0.12	0.09	0.03	0.14	0.22	0.15	0.02	0.04	0.03	0.04	0.05	0.13	0.07	0.13	0.13	0.14
O2'	0.06	0.17	0.04	0.05	0.09	0.05	0.07	0.10	0.10	0.06	0.14	0.22	0.15	0.06	0.06	0.03	0.05	0.06	0.11	0.09	0.14	0.14	0.14
O3'	0.06	0.20	0.05	0.04	0.11	0.05	0.10	0.08	0.14	0.06	0.18	0.25	0.17	0.07	0.07	0.05	0.04	0.06	0.08	0.14	0.10	0.10	0.11
O4'	0.04	0.17	0.06	0.09	0.08	0.10	0.05	0.16	0.09	0.04	0.14	0.23	0.15	0.03	0.04	0.04	0.09	0.05	0.18	0.07	0.21	0.19	0.21
O5'	0.07	0.22	0.06	0.08	0.13	0.08	0.12	0.12	0.16	0.05	0.21	0.28	0.19	0.07	0.07	0.05	0.08	0.07	0.13	0.15	0.14	0.13	0.15
OP1	0.07	0.24	0.09	0.10	0.13	0.11	0.12	0.15	0.17	0.04	0.22	0.29	0.19	0.06	0.07	0.08	0.09	0.08	0.15	0.17	0.16	0.15	0.17
OP2	0.06	0.21	0.11	0.12	0.09	0.14	0.09	0.18	0.15	0.04	0.20	0.26	0.16	0.05	0.05	0.10	0.12	0.07	0.17	0.14	0.19	0.17	0.19
P	0.05	0.21	0.07	0.08	0.10	0.09	0.10	0.13	0.15	0.03	0.20	0.27	0.17	0.04	0.05	0.06	0.08	0.05	0.13	0.14	0.15	0.13	0.15

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.07	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.03	0.05	0.09	0.06	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.04	0.03	0.04	0.07	0.06
C2	0.07	0.00	0.09	0.08	0.01	0.07	0.01	0.06	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.14	0.10	0.06	0.08	0.02	0.07	0.07	0.08
C2'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.05	0.01	0.03	0.02	0.05	0.02	0.08	0.12	0.08	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.05	0.03	0.03	0.06	0.06
C3'	0.02	0.08	0.00	0.00	0.05	0.00	0.04	0.02	0.03	0.04	0.06	0.11	0.08	0.05	0.04	0.02	0.00	0.01	0.05	0.03	0.03	0.04	0.04
C4	0.03	0.01	0.05	0.05	0.00	0.02	0.01	0.04	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.06	0.06	0.02	0.07	0.02	0.06	0.06	0.07
C4'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.07	0.04	0.10	0.07	0.07	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.05	0.03	0.03	0.03
C5	0.02	0.01	0.03	0.04	0.01	0.03	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.05	0.03	0.10	0.01	0.07	0.05	0.08
C5'	0.02	0.06	0.02	0.02	0.04	0.01	0.07	0.00	0.07	0.09	0.05	0.09	0.06	0.10	0.03	0.02	0.02	0.01	0.01	0.11	0.03	0.01	0.01
C6	0.03	0.01	0.05	0.03	0.02	0.03	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.08	0.06	0.03	0.11	0.00	0.09	0.07	0.10
C8	0.03	0.02	0.02	0.04	0.01	0.07	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.00	0.00	0.02	0.05	0.06	0.10	0.02	0.07	0.05	0.07
N1	0.05	0.01	0.08	0.06	0.01	0.04	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.12	0.08	0.03	0.09	0.01	0.07	0.06	0.08
N2	0.09	0.01	0.12	0.11	0.02	0.10	0.01	0.09	0.02	0.03	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.18	0.13	0.08	0.08	0.03	0.09	0.08	0.09
N3	0.06	0.01	0.08	0.08	0.00	0.07	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.12	0.09	0.06	0.08	0.01	0.08	0.08	0.08
N7	0.02	0.01	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.06	0.12	0.03	0.09	0.06	0.10
N9	0.00	0.02	0.02	0.04	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.06	0.02	0.06	0.08	0.07
O2'	0.01	0.14	0.00	0.02	0.06	0.02	0.05	0.02	0.08	0.02	0.12	0.18	0.12	0.01	0.02	0.00	0.05	0.01	0.04	0.07	0.02	0.05	0.04
O3'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.06	0.01	0.05	0.02	0.06	0.05	0.08	0.13	0.09	0.06	0.05	0.05	0.00	0.00	0.06	0.06	0.01	0.03	0.03
O4'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.06	0.03	0.08	0.06	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.05	0.03	0.07	0.05
O5'	0.04	0.08	0.05	0.05	0.07	0.02	0.10	0.01	0.11	0.10	0.09	0.08	0.08	0.12	0.06	0.04	0.06	0.03	0.00	0.15	0.02	0.01	0.01
O6	0.03	0.02	0.03	0.03	0.02	0.05	0.01	0.11	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.07	0.06	0.05	0.15	0.00	0.13	0.12	0.15
OP1	0.04	0.07	0.03	0.03	0.06	0.03	0.07	0.03	0.09	0.07	0.07	0.09	0.08	0.09	0.06	0.02	0.01	0.03	0.02	0.13	0.00	0.01	0.01
OP2	0.07	0.07	0.06	0.04	0.06	0.03	0.05	0.01	0.07	0.05	0.06	0.08	0.08	0.06	0.08	0.05	0.03	0.07	0.01	0.12	0.01	0.00	0.00
P	0.06	0.08	0.06	0.04	0.07	0.03	0.08	0.01	0.10	0.07	0.08	0.09	0.08	0.10	0.07	0.04	0.03	0.05	0.01	0.15	0.01	0.00	0.00