Doublet Group distance statistics: 48270

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.004, 0.011, 0.018, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.011 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.005, 0.016, 0.026, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.016 std_dev=0.010
N9	A	0, 0.007, 0.018, 0.028, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.018 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.007, 0.019, 0.031, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.019 std_dev=0.012
N7	A	0, 0.007, 0.020, 0.034, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.020 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.005, 0.019, 0.033, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.019 std_dev=0.014
C6	A	0, 0.005, 0.019, 0.033, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.019 std_dev=0.014
C2	A	0, 0.002, 0.016, 0.031, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.016 std_dev=0.015
C8	A	0, 0.003, 0.021, 0.040, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.021 std_dev=0.018
N3	A	0, 0.008, 0.027, 0.046, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.027 std_dev=0.019
N6	A	0, -0.014, 0.057, 0.127, 0.178 max_d=0.178 avg_d=0.057 std_dev=0.071
O4'	A	0, 0.093, 0.290, 0.486, 0.502 max_d=0.502 avg_d=0.290 std_dev=0.196
C2'	A	0, 0.125, 0.350, 0.574, 0.552 max_d=0.552 avg_d=0.350 std_dev=0.224
O2'	A	0, 0.116, 0.379, 0.643, 0.644 max_d=0.644 avg_d=0.379 std_dev=0.263
C4'	A	0, 0.170, 0.474, 0.777, 0.766 max_d=0.766 avg_d=0.474 std_dev=0.304
C3'	A	0, 0.195, 0.556, 0.916, 0.883 max_d=0.883 avg_d=0.556 std_dev=0.361
O2'	B	0, 0.054, 0.443, 0.831, 0.926 max_d=0.926 avg_d=0.443 std_dev=0.389
C2'	B	0, 0.090, 0.500, 0.911, 1.037 max_d=1.037 avg_d=0.500 std_dev=0.410
N7	B	0, 0.173, 0.611, 1.050, 1.058 max_d=1.058 avg_d=0.611 std_dev=0.438
C8	B	0, 0.191, 0.671, 1.151, 1.179 max_d=1.179 avg_d=0.671 std_dev=0.480
C5	B	0, 0.248, 0.735, 1.221, 1.239 max_d=1.239 avg_d=0.735 std_dev=0.486
C4	B	0, 0.248, 0.763, 1.278, 1.365 max_d=1.365 avg_d=0.763 std_dev=0.515
N9	B	0, 0.177, 0.702, 1.226, 1.341 max_d=1.341 avg_d=0.702 std_dev=0.525
O3'	A	0, 0.276, 0.808, 1.340, 1.298 max_d=1.298 avg_d=0.808 std_dev=0.532
C5'	A	0, 0.316, 0.858, 1.399, 1.377 max_d=1.377 avg_d=0.858 std_dev=0.542
C3'	B	0, 0.144, 0.721, 1.299, 1.501 max_d=1.501 avg_d=0.721 std_dev=0.578
O3'	B	0, 0.164, 0.744, 1.323, 1.502 max_d=1.502 avg_d=0.744 std_dev=0.580
N3	B	0, 0.325, 0.912, 1.498, 1.613 max_d=1.613 avg_d=0.912 std_dev=0.586
C6	B	0, 0.354, 0.952, 1.551, 1.577 max_d=1.577 avg_d=0.952 std_dev=0.599
C1'	B	0, 0.182, 0.783, 1.384, 1.568 max_d=1.568 avg_d=0.783 std_dev=0.601
O5'	A	0, 0.367, 1.011, 1.655, 1.593 max_d=1.593 avg_d=1.011 std_dev=0.644
O6	B	0, 0.371, 1.023, 1.676, 1.721 max_d=1.721 avg_d=1.023 std_dev=0.652
C2	B	0, 0.434, 1.120, 1.806, 1.856 max_d=1.856 avg_d=1.120 std_dev=0.686
N1	B	0, 0.452, 1.163, 1.875, 1.903 max_d=1.903 avg_d=1.163 std_dev=0.712
O4'	B	0, 0.245, 1.050, 1.855, 2.111 max_d=2.111 avg_d=1.050 std_dev=0.805
C4'	B	0, 0.207, 1.012, 1.818, 2.087 max_d=2.087 avg_d=1.012 std_dev=0.806
N2	B	0, 0.543, 1.367, 2.190, 2.205 max_d=2.205 avg_d=1.367 std_dev=0.823
P	A	0, 0.571, 1.462, 2.353, 2.398 max_d=2.398 avg_d=1.462 std_dev=0.891
O5'	B	0, 0.514, 1.458, 2.402, 2.610 max_d=2.610 avg_d=1.458 std_dev=0.944
OP1	A	0, 0.645, 1.617, 2.589, 2.596 max_d=2.596 avg_d=1.617 std_dev=0.972
C5'	B	0, 0.367, 1.409, 2.451, 2.767 max_d=2.767 avg_d=1.409 std_dev=1.042
OP2	A	0, 0.690, 1.826, 2.961, 2.952 max_d=2.952 avg_d=1.826 std_dev=1.135
OP2	B	0, 0.582, 1.816, 3.049, 3.404 max_d=3.404 avg_d=1.816 std_dev=1.233
P	B	0, 0.643, 1.941, 3.239, 3.560 max_d=3.560 avg_d=1.941 std_dev=1.298
OP1	B	0, 0.716, 2.238, 3.759, 4.135 max_d=4.135 avg_d=2.238 std_dev=1.522

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.04	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.06	0.54	0.04	0.17
C2	0.04	0.00	0.07	0.06	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.09	0.08	0.05	0.14	0.56	0.09	0.16
C2'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.04	0.06	0.05	0.07	0.06	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.42	0.15	0.09
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.02	0.12	0.04	0.06	0.03	0.11	0.04	0.01	0.01	0.01	0.05	0.27	0.24	0.02
C4	0.02	0.01	0.04	0.02	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.06	0.02	0.03	0.13	0.56	0.06	0.16
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.00	0.03	0.07	0.03	0.04	0.04	0.07	0.03	0.04	0.01	0.00	0.02	0.29	0.09	0.07
C5	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.00	0.04	0.05	0.02	0.15	0.54	0.06	0.15
C5'	0.02	0.08	0.02	0.01	0.07	0.00	0.08	0.00	0.08	0.10	0.08	0.08	0.07	0.11	0.06	0.04	0.03	0.01	0.00	0.09	0.07	0.01
C6	0.01	0.00	0.04	0.02	0.01	0.03	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.07	0.03	0.02	0.15	0.53	0.09	0.16
C8	0.01	0.02	0.06	0.12	0.02	0.07	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.03	0.06	0.01	0.01	0.04	0.14	0.02	0.18	0.57	0.07	0.17
N1	0.02	0.00	0.05	0.04	0.01	0.03	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.08	0.05	0.04	0.15	0.54	0.09	0.16
N3	0.04	0.01	0.07	0.06	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.09	0.08	0.06	0.13	0.56	0.08	0.16
N6	0.04	0.01	0.06	0.03	0.03	0.04	0.04	0.07	0.01	0.06	0.02	0.01	0.00	0.08	0.05	0.08	0.04	0.05	0.12	0.53	0.15	0.19
N7	0.01	0.01	0.04	0.11	0.02	0.07	0.00	0.11	0.02	0.01	0.01	0.02	0.08	0.00	0.01	0.03	0.13	0.02	0.19	0.52	0.07	0.13
N9	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.03	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.00	0.03	0.05	0.01	0.12	0.57	0.04	0.17
O2'	0.02	0.09	0.00	0.01	0.06	0.04	0.04	0.04	0.07	0.04	0.08	0.09	0.08	0.03	0.03	0.00	0.04	0.03	0.04	0.39	0.18	0.07
O3'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.02	0.01	0.05	0.03	0.03	0.14	0.05	0.08	0.04	0.13	0.05	0.04	0.00	0.01	0.08	0.15	0.38	0.09
O4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.06	0.05	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.05	0.51	0.10	0.20
O5'	0.06	0.14	0.03	0.05	0.13	0.02	0.15	0.00	0.15	0.18	0.15	0.13	0.12	0.19	0.12	0.04	0.08	0.05	0.00	0.02	0.03	0.01
OP1	0.54	0.56	0.42	0.27	0.56	0.29	0.54	0.09	0.53	0.57	0.54	0.56	0.53	0.52	0.57	0.39	0.15	0.51	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.04	0.09	0.15	0.24	0.06	0.09	0.06	0.07	0.09	0.07	0.09	0.08	0.15	0.07	0.04	0.18	0.38	0.10	0.03	0.01	0.00	0.01
P	0.17	0.16	0.09	0.02	0.16	0.07	0.15	0.01	0.16	0.17	0.16	0.16	0.19	0.13	0.17	0.07	0.09	0.20	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.27	0.40	0.23	0.12	0.30	0.14	0.26	0.11	0.28	0.23	0.34	0.47	0.39	0.23	0.26	0.27	0.08	0.25	0.11	0.25	0.20	0.11	0.15
C2	0.39	0.44	0.29	0.19	0.38	0.33	0.32	0.24	0.32	0.30	0.37	0.49	0.45	0.29	0.35	0.35	0.07	0.44	0.15	0.29	0.17	0.12	0.16
C2'	0.26	0.38	0.21	0.10	0.29	0.12	0.26	0.12	0.28	0.23	0.33	0.44	0.37	0.23	0.25	0.26	0.08	0.24	0.11	0.26	0.24	0.13	0.18
C3'	0.18	0.33	0.14	0.06	0.23	0.07	0.19	0.16	0.22	0.16	0.29	0.40	0.31	0.16	0.18	0.17	0.12	0.15	0.14	0.21	0.27	0.15	0.21
C4	0.31	0.40	0.24	0.14	0.32	0.20	0.27	0.13	0.28	0.24	0.34	0.47	0.41	0.24	0.28	0.30	0.07	0.31	0.11	0.26	0.16	0.10	0.13
C4'	0.21	0.38	0.17	0.08	0.27	0.10	0.23	0.13	0.26	0.18	0.33	0.46	0.36	0.18	0.22	0.20	0.09	0.19	0.12	0.24	0.22	0.11	0.17
C5	0.30	0.40	0.24	0.14	0.32	0.18	0.27	0.11	0.28	0.23	0.34	0.47	0.41	0.23	0.28	0.30	0.07	0.29	0.10	0.25	0.14	0.09	0.11
C5'	0.20	0.39	0.15	0.10	0.27	0.12	0.23	0.18	0.27	0.17	0.34	0.47	0.36	0.17	0.21	0.17	0.14	0.17	0.15	0.24	0.24	0.13	0.20
C6	0.35	0.42	0.27	0.16	0.34	0.25	0.28	0.17	0.29	0.25	0.35	0.47	0.43	0.25	0.31	0.33	0.07	0.36	0.12	0.26	0.14	0.10	0.13
C8	0.24	0.38	0.22	0.12	0.28	0.11	0.24	0.10	0.26	0.21	0.33	0.46	0.37	0.21	0.24	0.25	0.09	0.20	0.09	0.24	0.16	0.07	0.12
N1	0.40	0.44	0.30	0.20	0.38	0.35	0.32	0.26	0.32	0.30	0.37	0.49	0.46	0.28	0.35	0.36	0.07	0.45	0.15	0.29	0.16	0.13	0.16
N3	0.35	0.42	0.26	0.16	0.35	0.26	0.30	0.18	0.30	0.27	0.36	0.48	0.43	0.26	0.32	0.32	0.06	0.37	0.12	0.28	0.17	0.11	0.14
N6	0.33	0.42	0.26	0.14	0.33	0.23	0.27	0.15	0.28	0.22	0.34	0.48	0.43	0.22	0.29	0.34	0.09	0.33	0.12	0.24	0.14	0.10	0.13
N7	0.25	0.39	0.23	0.12	0.29	0.12	0.25	0.09	0.27	0.21	0.33	0.46	0.38	0.21	0.25	0.26	0.09	0.22	0.08	0.25	0.13	0.07	0.09
N9	0.27	0.40	0.23	0.12	0.31	0.15	0.26	0.10	0.27	0.22	0.34	0.47	0.39	0.22	0.26	0.28	0.07	0.25	0.10	0.25	0.17	0.09	0.13
O2'	0.29	0.39	0.24	0.14	0.31	0.16	0.28	0.11	0.30	0.26	0.35	0.45	0.38	0.26	0.28	0.29	0.08	0.27	0.10	0.28	0.22	0.12	0.16
O3'	0.14	0.30	0.10	0.06	0.19	0.06	0.17	0.18	0.21	0.14	0.27	0.37	0.27	0.14	0.15	0.14	0.14	0.11	0.15	0.20	0.30	0.17	0.24
O4'	0.26	0.41	0.22	0.12	0.30	0.13	0.26	0.10	0.28	0.21	0.35	0.49	0.39	0.21	0.25	0.25	0.07	0.23	0.09	0.25	0.18	0.08	0.13
O5'	0.18	0.37	0.13	0.13	0.25	0.16	0.21	0.23	0.25	0.16	0.33	0.46	0.34	0.16	0.19	0.13	0.21	0.16	0.19	0.23	0.28	0.17	0.23
OP1	0.47	0.53	0.49	0.46	0.47	0.43	0.44	0.39	0.43	0.45	0.48	0.60	0.53	0.43	0.47	0.48	0.44	0.47	0.38	0.40	0.43	0.46	0.39
OP2	0.18	0.43	0.19	0.09	0.29	0.08	0.28	0.14	0.33	0.18	0.40	0.52	0.38	0.21	0.22	0.18	0.07	0.13	0.08	0.32	0.14	0.08	0.11
P	0.26	0.43	0.25	0.17	0.32	0.14	0.29	0.12	0.32	0.24	0.39	0.51	0.40	0.25	0.27	0.24	0.13	0.22	0.10	0.30	0.14	0.15	0.10

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.04	0.04	0.02	0.04	0.05	0.05	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.12	0.04	0.14	0.13	0.10
C2	0.05	0.00	0.12	0.13	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.15	0.14	0.05	0.21	0.02	0.24	0.30	0.22
C2'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.06	0.01	0.03	0.03	0.05	0.05	0.09	0.14	0.13	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.07	0.05	0.12	0.13	0.09
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.09	0.00	0.09	0.03	0.10	0.09	0.12	0.14	0.12	0.10	0.06	0.01	0.00	0.01	0.09	0.11	0.11	0.10	0.07
C4	0.02	0.01	0.06	0.09	0.00	0.04	0.01	0.10	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.09	0.01	0.21	0.03	0.24	0.26	0.21
C4'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.04	0.00	0.07	0.02	0.07	0.10	0.06	0.06	0.05	0.11	0.04	0.03	0.02	0.00	0.03	0.09	0.10	0.06	0.04
C5	0.02	0.01	0.03	0.09	0.01	0.07	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.10	0.02	0.26	0.02	0.31	0.34	0.29
C5'	0.04	0.09	0.03	0.03	0.10	0.02	0.15	0.00	0.16	0.18	0.13	0.08	0.08	0.20	0.10	0.02	0.04	0.02	0.02	0.19	0.10	0.05	0.02
C6	0.04	0.01	0.05	0.10	0.02	0.07	0.01	0.16	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.08	0.12	0.02	0.28	0.01	0.33	0.38	0.32
C8	0.02	0.01	0.05	0.09	0.01	0.10	0.01	0.18	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.04	0.10	0.07	0.27	0.02	0.30	0.27	0.28
N1	0.04	0.01	0.09	0.12	0.02	0.06	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.12	0.13	0.03	0.25	0.01	0.30	0.36	0.28
N2	0.05	0.01	0.14	0.14	0.01	0.06	0.01	0.08	0.02	0.02	0.02	0.00	0.00	0.02	0.02	0.18	0.16	0.06	0.19	0.03	0.22	0.28	0.19
N3	0.05	0.00	0.13	0.12	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.14	0.13	0.05	0.19	0.01	0.21	0.24	0.18
N7	0.02	0.01	0.04	0.10	0.01	0.11	0.01	0.20	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.12	0.06	0.30	0.02	0.35	0.36	0.34
N9	0.00	0.02	0.01	0.06	0.01	0.04	0.01	0.10	0.03	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.01	0.20	0.03	0.22	0.21	0.19
O2'	0.01	0.15	0.00	0.01	0.07	0.03	0.05	0.02	0.08	0.04	0.12	0.18	0.14	0.03	0.01	0.00	0.04	0.04	0.04	0.07	0.08	0.10	0.04
O3'	0.01	0.14	0.02	0.00	0.09	0.02	0.10	0.04	0.12	0.10	0.13	0.16	0.13	0.12	0.06	0.04	0.00	0.01	0.13	0.14	0.11	0.10	0.07
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.07	0.03	0.06	0.05	0.06	0.01	0.04	0.01	0.00	0.11	0.04	0.11	0.05	0.06
O5'	0.12	0.21	0.07	0.09	0.21	0.03	0.26	0.02	0.28	0.27	0.25	0.19	0.19	0.30	0.20	0.04	0.13	0.11	0.00	0.31	0.01	0.01	0.01
O6	0.04	0.02	0.05	0.11	0.03	0.09	0.02	0.19	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.07	0.14	0.04	0.31	0.00	0.38	0.44	0.37
OP1	0.14	0.24	0.12	0.11	0.24	0.10	0.31	0.10	0.33	0.30	0.30	0.22	0.21	0.35	0.22	0.08	0.11	0.11	0.01	0.38	0.00	0.01	0.01
OP2	0.13	0.30	0.13	0.10	0.26	0.06	0.34	0.05	0.38	0.27	0.36	0.28	0.24	0.36	0.21	0.10	0.10	0.05	0.01	0.44	0.01	0.00	0.00
P	0.10	0.22	0.09	0.07	0.21	0.04	0.29	0.02	0.32	0.28	0.28	0.19	0.18	0.34	0.19	0.04	0.07	0.06	0.01	0.37	0.01	0.00	0.00