Doublet Group distance statistics: 48271

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.009, 0.015, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.009 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.003, 0.012, 0.021, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.012 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.003, 0.017, 0.032, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.017 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.006, 0.021, 0.036, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.021 std_dev=0.015
N7	A	0, 0.005, 0.024, 0.042, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.024 std_dev=0.019
N3	A	0, 0.004, 0.027, 0.050, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.027 std_dev=0.023
C2	A	0, -0.002, 0.021, 0.045, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.021 std_dev=0.023
C1'	A	0, 0.003, 0.027, 0.051, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.027 std_dev=0.024
C8	A	0, 0.010, 0.035, 0.059, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.035 std_dev=0.025
N6	A	0, 0.008, 0.036, 0.064, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.036 std_dev=0.028
N9	A	0, 0.007, 0.038, 0.068, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.038 std_dev=0.031
O5'	B	0, 0.063, 0.356, 0.649, 0.718 max_d=0.718 avg_d=0.356 std_dev=0.293
P	B	0, 0.123, 0.451, 0.780, 0.774 max_d=0.774 avg_d=0.451 std_dev=0.329
O4'	A	0, -0.016, 0.324, 0.664, 0.794 max_d=0.794 avg_d=0.324 std_dev=0.340
C2'	B	0, 0.137, 0.501, 0.865, 0.855 max_d=0.855 avg_d=0.501 std_dev=0.364
C2'	A	0, -0.063, 0.301, 0.665, 0.814 max_d=0.814 avg_d=0.301 std_dev=0.364
O2'	A	0, -0.053, 0.389, 0.830, 1.006 max_d=1.006 avg_d=0.389 std_dev=0.441
C4'	A	0, -0.055, 0.450, 0.954, 1.154 max_d=1.154 avg_d=0.450 std_dev=0.504
C3'	A	0, -0.076, 0.466, 1.009, 1.227 max_d=1.227 avg_d=0.466 std_dev=0.543
O2'	B	0, 0.087, 0.635, 1.183, 1.338 max_d=1.338 avg_d=0.635 std_dev=0.548
C1'	B	0, 0.105, 0.747, 1.390, 1.568 max_d=1.568 avg_d=0.747 std_dev=0.642
C5'	B	0, 0.134, 0.819, 1.504, 1.676 max_d=1.676 avg_d=0.819 std_dev=0.685
O3'	A	0, -0.079, 0.607, 1.293, 1.566 max_d=1.566 avg_d=0.607 std_dev=0.686
OP1	B	0, -0.018, 0.704, 1.427, 1.698 max_d=1.698 avg_d=0.704 std_dev=0.723
O4'	B	0, 0.125, 0.902, 1.679, 1.897 max_d=1.897 avg_d=0.902 std_dev=0.777
C3'	B	0, 0.065, 0.859, 1.653, 1.915 max_d=1.915 avg_d=0.859 std_dev=0.794
C4'	B	0, 0.074, 0.888, 1.702, 1.967 max_d=1.967 avg_d=0.888 std_dev=0.814
OP2	B	0, 0.065, 0.927, 1.788, 2.075 max_d=2.075 avg_d=0.927 std_dev=0.862
C5'	A	0, -0.149, 0.754, 1.656, 2.022 max_d=2.022 avg_d=0.754 std_dev=0.902
N9	B	0, 0.069, 1.014, 1.960, 2.276 max_d=2.276 avg_d=1.014 std_dev=0.946
C8	B	0, 0.163, 1.139, 2.114, 2.383 max_d=2.383 avg_d=1.139 std_dev=0.976
O5'	A	0, -0.227, 0.933, 2.093, 2.568 max_d=2.568 avg_d=0.933 std_dev=1.160
C4	B	0, -0.136, 1.336, 2.808, 3.386 max_d=3.386 avg_d=1.336 std_dev=1.472
N7	B	0, 0.041, 1.531, 3.021, 3.550 max_d=3.550 avg_d=1.531 std_dev=1.490
N3	B	0, -0.317, 1.368, 3.053, 3.742 max_d=3.742 avg_d=1.368 std_dev=1.685
O3'	B	0, -0.230, 1.540, 3.309, 4.018 max_d=4.018 avg_d=1.540 std_dev=1.770
C5	B	0, -0.155, 1.635, 3.424, 4.125 max_d=4.125 avg_d=1.635 std_dev=1.789
P	A	0, -0.503, 1.475, 3.452, 4.270 max_d=4.270 avg_d=1.475 std_dev=1.978
OP2	A	0, -0.277, 1.725, 3.728, 4.533 max_d=4.533 avg_d=1.725 std_dev=2.003
C2	B	0, -0.535, 1.696, 3.928, 4.849 max_d=4.849 avg_d=1.696 std_dev=2.232
C6	B	0, -0.388, 2.013, 4.414, 5.388 max_d=5.388 avg_d=2.013 std_dev=2.401
N2	B	0, -0.683, 1.829, 4.340, 5.380 max_d=5.380 avg_d=1.829 std_dev=2.512
N1	B	0, -0.560, 2.000, 4.561, 5.614 max_d=5.614 avg_d=2.000 std_dev=2.560
OP1	A	0, -0.525, 2.143, 4.811, 5.904 max_d=5.904 avg_d=2.143 std_dev=2.668
O6	B	0, -0.469, 2.350, 5.169, 6.314 max_d=6.314 avg_d=2.350 std_dev=2.819

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.04	0.06	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.04	0.22	0.22	0.25
C2	0.06	0.00	0.18	0.18	0.01	0.04	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.11	0.23	0.16	0.03	0.36	0.31	0.36
C2'	0.01	0.18	0.00	0.00	0.10	0.01	0.04	0.01	0.07	0.10	0.14	0.18	0.04	0.06	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.08	0.07	0.07
C3'	0.01	0.18	0.00	0.00	0.10	0.00	0.07	0.01	0.11	0.06	0.16	0.16	0.09	0.02	0.03	0.01	0.00	0.00	0.09	0.17	0.15	0.08
C4	0.03	0.01	0.10	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.12	0.07	0.04	0.31	0.32	0.33
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.02	0.06	0.01	0.05	0.04	0.06	0.02	0.03	0.02	0.00	0.03	0.09	0.03	0.06
C5	0.02	0.00	0.04	0.07	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.02	0.02	0.29	0.33	0.29
C5'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.00	0.04	0.10	0.02	0.05	0.07	0.10	0.02	0.03	0.03	0.01	0.02	0.07	0.02	0.02
C6	0.03	0.00	0.07	0.11	0.01	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.13	0.05	0.01	0.31	0.32	0.30
C8	0.02	0.01	0.10	0.06	0.00	0.06	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.07	0.08	0.13	0.05	0.22	0.34	0.24
N1	0.04	0.00	0.14	0.16	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.21	0.11	0.01	0.34	0.31	0.33
N3	0.06	0.00	0.18	0.16	0.00	0.05	0.00	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.11	0.20	0.16	0.04	0.34	0.31	0.36
N6	0.02	0.01	0.04	0.09	0.01	0.04	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.02	0.01	0.29	0.31	0.26
N7	0.01	0.00	0.06	0.02	0.00	0.06	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.06	0.02	0.08	0.02	0.23	0.35	0.23
N9	0.00	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.05	0.26	0.30	0.29
O2'	0.02	0.11	0.01	0.01	0.05	0.03	0.01	0.03	0.02	0.07	0.07	0.11	0.01	0.06	0.01	0.00	0.06	0.05	0.06	0.10	0.07	0.04
O3'	0.02	0.23	0.02	0.00	0.12	0.02	0.08	0.03	0.13	0.08	0.21	0.20	0.11	0.02	0.03	0.06	0.00	0.01	0.15	0.37	0.31	0.24
O4'	0.00	0.16	0.01	0.00	0.07	0.00	0.02	0.01	0.05	0.13	0.11	0.16	0.02	0.08	0.01	0.05	0.01	0.00	0.07	0.31	0.24	0.30
O5'	0.04	0.03	0.03	0.09	0.04	0.03	0.02	0.02	0.01	0.05	0.01	0.04	0.01	0.02	0.05	0.06	0.15	0.07	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.22	0.36	0.08	0.17	0.31	0.09	0.29	0.07	0.31	0.22	0.34	0.34	0.29	0.23	0.26	0.10	0.37	0.31	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.22	0.31	0.07	0.15	0.32	0.03	0.33	0.02	0.32	0.34	0.31	0.31	0.31	0.35	0.30	0.07	0.31	0.24	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.25	0.36	0.07	0.08	0.33	0.06	0.29	0.02	0.30	0.24	0.33	0.36	0.26	0.23	0.29	0.04	0.24	0.30	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.05	0.56	0.34	0.13	0.44	0.23	0.68	0.19	0.89	0.46	0.85	0.50	0.33	0.67	0.30	0.04	0.83	0.21	0.08	1.07	0.12	0.07	0.04
C2	0.15	0.46	0.36	0.12	0.35	0.02	0.41	0.05	0.50	0.29	0.52	0.47	0.35	0.38	0.26	0.16	0.67	0.04	0.10	0.54	0.20	0.17	0.12
C2'	0.17	0.86	0.42	0.16	0.63	0.24	0.86	0.20	1.10	0.58	1.11	0.89	0.57	0.80	0.44	0.22	0.91	0.18	0.08	1.28	0.13	0.13	0.04
C3'	0.27	0.94	0.52	0.09	0.74	0.14	1.01	0.09	1.27	0.73	1.25	0.92	0.64	0.97	0.56	0.27	0.78	0.12	0.13	1.48	0.09	0.32	0.17
C4	0.05	0.45	0.35	0.09	0.36	0.14	0.54	0.12	0.67	0.38	0.64	0.39	0.28	0.52	0.25	0.06	0.73	0.14	0.08	0.78	0.13	0.03	0.07
C4'	0.18	0.68	0.46	0.09	0.60	0.11	0.90	0.07	1.13	0.67	1.04	0.56	0.44	0.90	0.47	0.11	0.70	0.12	0.13	1.38	0.12	0.33	0.19
C5	0.04	0.25	0.33	0.04	0.26	0.15	0.45	0.12	0.55	0.33	0.47	0.09	0.11	0.47	0.18	0.04	0.65	0.20	0.08	0.66	0.10	0.02	0.06
C5'	0.23	0.60	0.51	0.21	0.62	0.06	0.95	0.12	1.17	0.75	1.02	0.38	0.40	0.99	0.52	0.12	0.54	0.09	0.26	1.46	0.28	0.49	0.33
C6	0.02	0.15	0.33	0.02	0.18	0.07	0.30	0.08	0.35	0.24	0.29	0.03	0.07	0.33	0.14	0.02	0.56	0.12	0.09	0.42	0.13	0.11	0.10
C8	0.09	0.29	0.32	0.05	0.31	0.24	0.59	0.18	0.78	0.42	0.66	0.05	0.08	0.63	0.21	0.07	0.69	0.31	0.05	0.97	0.05	0.12	0.00
N1	0.10	0.29	0.34	0.08	0.24	0.03	0.30	0.04	0.35	0.23	0.35	0.27	0.22	0.29	0.19	0.11	0.59	0.02	0.11	0.39	0.19	0.20	0.14
N3	0.13	0.54	0.37	0.12	0.40	0.07	0.52	0.08	0.64	0.36	0.65	0.54	0.39	0.49	0.29	0.14	0.74	0.03	0.09	0.72	0.17	0.10	0.09
N6	0.14	0.16	0.29	0.07	0.05	0.06	0.11	0.06	0.12	0.14	0.02	0.29	0.23	0.19	0.03	0.15	0.39	0.19	0.10	0.19	0.10	0.14	0.10
N7	0.13	0.10	0.30	0.04	0.21	0.22	0.49	0.17	0.63	0.37	0.47	0.23	0.06	0.55	0.14	0.10	0.62	0.33	0.05	0.79	0.04	0.09	0.02
N9	0.04	0.48	0.34	0.09	0.39	0.20	0.62	0.16	0.80	0.43	0.75	0.37	0.26	0.62	0.27	0.04	0.76	0.21	0.07	0.96	0.10	0.06	0.03
O2'	0.12	0.83	0.34	0.28	0.58	0.34	0.81	0.30	1.07	0.51	1.09	0.88	0.54	0.74	0.38	0.16	1.04	0.23	0.16	1.25	0.24	0.05	0.12
O3'	0.35	1.09	0.57	0.11	0.86	0.12	1.13	0.09	1.41	0.82	1.41	1.10	0.78	1.08	0.66	0.36	0.81	0.12	0.17	1.64	0.12	0.39	0.22
O4'	0.07	0.46	0.36	0.05	0.43	0.16	0.70	0.10	0.90	0.52	0.80	0.31	0.26	0.73	0.32	0.04	0.70	0.18	0.04	1.13	0.04	0.19	0.08
O5'	0.22	0.58	0.49	0.21	0.60	0.07	0.93	0.12	1.16	0.73	1.01	0.32	0.37	0.97	0.50	0.10	0.53	0.09	0.26	1.44	0.27	0.47	0.33
OP1	0.10	0.22	0.30	0.17	0.40	0.02	0.75	0.13	0.95	0.64	0.67	0.13	0.11	0.86	0.36	0.21	0.54	0.03	0.26	1.31	0.30	0.50	0.36
OP2	0.13	0.24	0.33	0.22	0.44	0.08	0.82	0.15	1.05	0.67	0.78	0.27	0.14	0.90	0.39	0.18	0.49	0.05	0.28	1.39	0.32	0.49	0.37
P	0.10	0.26	0.31	0.17	0.43	0.04	0.81	0.11	1.04	0.66	0.77	0.13	0.13	0.90	0.38	0.20	0.54	0.08	0.25	1.39	0.29	0.49	0.34

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.09	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.37	0.00	0.25	0.02	0.28	0.34	0.26
C2	0.02	0.00	0.16	0.11	0.01	0.01	0.01	0.08	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.14	0.41	0.08	0.19	0.01	0.25	0.33	0.25
C2'	0.00	0.16	0.00	0.01	0.07	0.00	0.03	0.23	0.07	0.09	0.13	0.20	0.15	0.05	0.01	0.01	0.06	0.02	0.44	0.04	0.52	0.57	0.49
C3'	0.02	0.11	0.01	0.00	0.16	0.00	0.26	0.02	0.26	0.32	0.19	0.04	0.06	0.34	0.19	0.02	0.00	0.01	0.08	0.29	0.02	0.10	0.07
C4	0.01	0.01	0.07	0.16	0.00	0.02	0.00	0.07	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.22	0.25	0.06	0.19	0.00	0.26	0.34	0.26
C4'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.06	0.01	0.04	0.12	0.02	0.04	0.02	0.10	0.06	0.27	0.02	0.00	0.02	0.04	0.05	0.02	0.03
C5	0.02	0.01	0.03	0.26	0.00	0.06	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.30	0.06	0.05	0.16	0.01	0.24	0.33	0.25
C5'	0.09	0.08	0.23	0.02	0.07	0.01	0.07	0.00	0.07	0.07	0.07	0.09	0.08	0.08	0.06	0.04	0.22	0.01	0.01	0.08	0.06	0.01	0.02
C6	0.01	0.00	0.07	0.26	0.01	0.04	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.29	0.10	0.07	0.15	0.01	0.24	0.32	0.25
C8	0.02	0.02	0.09	0.32	0.01	0.12	0.00	0.07	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.29	0.13	0.02	0.15	0.02	0.25	0.34	0.26
N1	0.02	0.01	0.13	0.19	0.02	0.02	0.01	0.07	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.22	0.26	0.07	0.16	0.01	0.24	0.33	0.24
N2	0.02	0.00	0.20	0.04	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.08	0.54	0.09	0.20	0.02	0.25	0.34	0.25
N3	0.01	0.01	0.15	0.06	0.00	0.02	0.00	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.45	0.08	0.21	0.00	0.26	0.34	0.25
N7	0.02	0.01	0.05	0.34	0.01	0.10	0.01	0.08	0.00	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.33	0.13	0.02	0.13	0.02	0.23	0.33	0.24
N9	0.01	0.01	0.01	0.19	0.00	0.06	0.01	0.06	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.21	0.15	0.02	0.20	0.01	0.26	0.34	0.26
O2'	0.00	0.14	0.01	0.02	0.22	0.27	0.30	0.04	0.29	0.29	0.22	0.08	0.12	0.33	0.21	0.00	0.11	0.19	0.31	0.33	0.39	0.62	0.39
O3'	0.37	0.41	0.06	0.00	0.25	0.02	0.06	0.22	0.10	0.13	0.26	0.54	0.45	0.13	0.15	0.11	0.00	0.27	0.31	0.03	0.47	0.39	0.39
O4'	0.00	0.08	0.02	0.01	0.06	0.00	0.05	0.01	0.07	0.02	0.07	0.09	0.08	0.02	0.02	0.19	0.27	0.00	0.12	0.08	0.13	0.15	0.13
O5'	0.25	0.19	0.44	0.08	0.19	0.02	0.16	0.01	0.15	0.15	0.16	0.20	0.21	0.13	0.20	0.31	0.31	0.12	0.00	0.15	0.04	0.00	0.01
O6	0.02	0.01	0.04	0.29	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.33	0.03	0.08	0.15	0.00	0.25	0.32	0.26
OP1	0.28	0.25	0.52	0.02	0.26	0.05	0.24	0.06	0.24	0.25	0.24	0.25	0.26	0.23	0.26	0.39	0.47	0.13	0.04	0.25	0.00	0.00	0.01
OP2	0.34	0.33	0.57	0.10	0.34	0.02	0.33	0.01	0.32	0.34	0.33	0.34	0.34	0.33	0.34	0.62	0.39	0.15	0.00	0.32	0.00	0.00	0.00
P	0.26	0.25	0.49	0.07	0.26	0.03	0.25	0.02	0.25	0.26	0.24	0.25	0.25	0.24	0.26	0.39	0.39	0.13	0.01	0.26	0.01	0.00	0.00