Doublet Group distance statistics: 48279

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 11, 7, 6, 3, 8, 11, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.008, 0.014, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.008 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.006, 0.012, 0.018, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.012 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.010, 0.019, 0.028, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.019 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.007, 0.017, 0.026, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.017 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.004, 0.014, 0.023, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.014 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.005, 0.015, 0.025, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.015 std_dev=0.010
N6	A	0, 0.011, 0.024, 0.036, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.024 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.007, 0.020, 0.034, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.020 std_dev=0.013
N9	A	0, 0.006, 0.019, 0.033, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.019 std_dev=0.013
N7	A	0, 0.009, 0.023, 0.037, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.023 std_dev=0.014
C8	A	0, 0.010, 0.026, 0.042, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.026 std_dev=0.016
O2'	B	0, 0.133, 0.285, 0.436, 0.718 max_d=0.718 avg_d=0.285 std_dev=0.151
C2'	B	0, 0.308, 0.661, 1.013, 1.183 max_d=1.183 avg_d=0.661 std_dev=0.352
O4'	A	0, 0.204, 0.595, 0.986, 1.090 max_d=1.090 avg_d=0.595 std_dev=0.391
C2'	A	0, 0.249, 0.650, 1.052, 1.172 max_d=1.172 avg_d=0.650 std_dev=0.401
O2'	A	0, 0.329, 0.760, 1.190, 1.330 max_d=1.330 avg_d=0.760 std_dev=0.430
N3	B	0, 0.475, 0.961, 1.447, 1.607 max_d=1.607 avg_d=0.961 std_dev=0.486
C1'	B	0, 0.307, 0.818, 1.330, 1.543 max_d=1.543 avg_d=0.818 std_dev=0.512
C4'	A	0, 0.330, 0.898, 1.466, 1.632 max_d=1.632 avg_d=0.898 std_dev=0.568
O5'	B	0, 0.361, 0.974, 1.587, 1.942 max_d=1.942 avg_d=0.974 std_dev=0.613
C3'	A	0, 0.379, 1.010, 1.640, 1.827 max_d=1.827 avg_d=1.010 std_dev=0.631
OP2	A	0, 0.631, 1.303, 1.975, 2.374 max_d=2.374 avg_d=1.303 std_dev=0.672
O5'	A	0, 0.598, 1.318, 2.039, 2.267 max_d=2.267 avg_d=1.318 std_dev=0.721
O3'	B	0, 0.329, 1.054, 1.779, 2.301 max_d=2.301 avg_d=1.054 std_dev=0.725
C4	B	0, 0.492, 1.229, 1.967, 2.322 max_d=2.322 avg_d=1.229 std_dev=0.738
OP2	B	0, 0.718, 1.499, 2.281, 3.040 max_d=3.040 avg_d=1.499 std_dev=0.781
C3'	B	0, 0.323, 1.105, 1.886, 2.158 max_d=2.158 avg_d=1.105 std_dev=0.782
N9	B	0, 0.434, 1.224, 2.013, 2.347 max_d=2.347 avg_d=1.224 std_dev=0.790
P	A	0, 0.731, 1.527, 2.323, 2.645 max_d=2.645 avg_d=1.527 std_dev=0.796
C2	B	0, 0.571, 1.380, 2.190, 2.360 max_d=2.360 avg_d=1.380 std_dev=0.810
O3'	A	0, 0.573, 1.434, 2.294, 2.529 max_d=2.529 avg_d=1.434 std_dev=0.860
P	B	0, 0.538, 1.486, 2.433, 2.962 max_d=2.962 avg_d=1.486 std_dev=0.948
O4'	B	0, 0.307, 1.285, 2.264, 2.485 max_d=2.485 avg_d=1.285 std_dev=0.979
OP1	A	0, 0.904, 1.908, 2.912, 3.332 max_d=3.332 avg_d=1.908 std_dev=1.004
C4'	B	0, 0.259, 1.282, 2.305, 2.550 max_d=2.550 avg_d=1.282 std_dev=1.023
C5'	A	0, 0.567, 1.595, 2.622, 2.906 max_d=2.906 avg_d=1.595 std_dev=1.028
N1	B	0, 0.661, 1.863, 3.065, 3.370 max_d=3.370 avg_d=1.863 std_dev=1.202
C5	B	0, 0.601, 1.867, 3.134, 3.590 max_d=3.590 avg_d=1.867 std_dev=1.266
C8	B	0, 0.525, 1.870, 3.216, 3.676 max_d=3.676 avg_d=1.870 std_dev=1.345
C6	B	0, 0.676, 2.127, 3.577, 4.008 max_d=4.008 avg_d=2.127 std_dev=1.451
OP1	B	0, 0.543, 2.000, 3.456, 3.871 max_d=3.871 avg_d=2.000 std_dev=1.456
C5'	B	0, 0.320, 1.841, 3.362, 3.680 max_d=3.680 avg_d=1.841 std_dev=1.521
N7	B	0, 0.623, 2.239, 3.854, 4.384 max_d=4.384 avg_d=2.239 std_dev=1.615
N6	B	0, 0.768, 2.731, 4.694, 5.178 max_d=5.178 avg_d=2.731 std_dev=1.963

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.18	0.15	0.28	0.06
C2	0.03	0.00	0.22	0.34	0.01	0.17	0.01	0.26	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.40	0.03	0.33	0.13	0.21	0.17
C2'	0.00	0.22	0.00	0.00	0.10	0.01	0.03	0.02	0.07	0.13	0.16	0.24	0.05	0.09	0.02	0.00	0.02	0.01	0.31	0.32	0.10	0.21
C3'	0.01	0.34	0.00	0.00	0.18	0.00	0.09	0.03	0.16	0.18	0.28	0.33	0.12	0.10	0.03	0.01	0.01	0.01	0.40	0.41	0.09	0.31
C4	0.01	0.01	0.10	0.18	0.00	0.10	0.00	0.18	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.04	0.18	0.02	0.37	0.17	0.20	0.18
C4'	0.01	0.17	0.01	0.00	0.10	0.00	0.08	0.00	0.11	0.07	0.15	0.15	0.10	0.04	0.04	0.03	0.02	0.00	0.01	0.14	0.32	0.02
C5	0.01	0.01	0.03	0.09	0.00	0.08	0.00	0.18	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.09	0.01	0.47	0.22	0.17	0.26
C5'	0.02	0.26	0.02	0.03	0.18	0.00	0.18	0.00	0.22	0.09	0.26	0.23	0.21	0.12	0.09	0.03	0.04	0.02	0.01	0.15	0.39	0.01
C6	0.02	0.01	0.07	0.16	0.01	0.11	0.01	0.22	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.18	0.02	0.47	0.21	0.17	0.27
C8	0.01	0.01	0.13	0.18	0.01	0.07	0.01	0.09	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.08	0.19	0.02	0.52	0.29	0.15	0.28
N1	0.02	0.00	0.16	0.28	0.01	0.15	0.01	0.26	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.08	0.32	0.03	0.41	0.16	0.18	0.22
N3	0.02	0.00	0.24	0.33	0.00	0.15	0.01	0.23	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.36	0.03	0.29	0.12	0.23	0.13
N6	0.02	0.01	0.05	0.12	0.01	0.10	0.01	0.21	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.04	0.13	0.02	0.52	0.24	0.20	0.33
N7	0.01	0.01	0.09	0.10	0.01	0.04	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.07	0.12	0.02	0.55	0.29	0.17	0.33
N9	0.00	0.01	0.02	0.03	0.00	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.36	0.20	0.21	0.16
O2'	0.01	0.11	0.00	0.01	0.04	0.03	0.03	0.03	0.04	0.08	0.08	0.11	0.04	0.07	0.02	0.00	0.04	0.04	0.10	0.22	0.17	0.07
O3'	0.01	0.40	0.02	0.01	0.18	0.02	0.09	0.04	0.18	0.19	0.32	0.36	0.13	0.12	0.03	0.04	0.00	0.02	0.32	0.45	0.13	0.32
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.02	0.02	0.01	0.04	0.02	0.00	0.05	0.05	0.44	0.12
O5'	0.18	0.33	0.31	0.40	0.37	0.01	0.47	0.01	0.47	0.52	0.41	0.29	0.52	0.55	0.36	0.10	0.32	0.05	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.15	0.13	0.32	0.41	0.17	0.14	0.22	0.15	0.21	0.29	0.16	0.12	0.24	0.29	0.20	0.22	0.45	0.05	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.28	0.21	0.10	0.09	0.20	0.32	0.17	0.39	0.17	0.15	0.18	0.23	0.20	0.17	0.21	0.17	0.13	0.44	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.06	0.17	0.21	0.31	0.18	0.02	0.26	0.01	0.27	0.28	0.22	0.13	0.33	0.33	0.16	0.07	0.32	0.12	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.06	0.89	0.21	0.21	0.48	0.14	0.65	0.14	0.91	0.29	1.04	0.56	1.03	0.51	0.23	0.06	0.25	0.24	0.24	0.17	0.35	0.25
C2	0.08	0.57	0.24	0.27	0.41	0.06	0.55	0.08	0.68	0.34	0.69	0.39	0.75	0.49	0.25	0.07	0.31	0.10	0.18	0.10	0.35	0.15
C2'	0.21	0.54	0.06	0.09	0.25	0.24	0.45	0.22	0.69	0.16	0.75	0.25	0.85	0.37	0.08	0.23	0.15	0.36	0.38	0.29	0.51	0.35
C3'	0.32	0.55	0.16	0.16	0.19	0.43	0.39	0.43	0.65	0.08	0.74	0.23	0.81	0.27	0.09	0.39	0.16	0.50	0.48	0.48	0.51	0.45
C4	0.10	0.74	0.17	0.14	0.37	0.18	0.48	0.20	0.69	0.18	0.81	0.48	0.75	0.35	0.15	0.07	0.19	0.29	0.25	0.22	0.31	0.25
C4'	0.15	0.88	0.06	0.06	0.44	0.33	0.63	0.34	0.93	0.22	1.07	0.52	1.09	0.48	0.16	0.24	0.09	0.37	0.36	0.35	0.37	0.35
C5	0.21	0.62	0.09	0.07	0.23	0.34	0.29	0.39	0.47	0.10	0.63	0.41	0.50	0.14	0.08	0.08	0.09	0.45	0.31	0.36	0.24	0.30
C5'	0.25	0.88	0.14	0.23	0.38	0.53	0.55	0.57	0.88	0.11	1.05	0.51	1.02	0.36	0.08	0.38	0.29	0.52	0.47	0.54	0.38	0.46
C6	0.25	0.46	0.07	0.10	0.16	0.36	0.19	0.39	0.33	0.15	0.45	0.30	0.35	0.10	0.13	0.09	0.08	0.46	0.30	0.37	0.21	0.28
C8	0.20	0.75	0.11	0.07	0.29	0.38	0.35	0.45	0.59	0.09	0.78	0.48	0.63	0.18	0.08	0.08	0.09	0.47	0.33	0.40	0.25	0.35
N1	0.14	0.41	0.14	0.11	0.23	0.14	0.30	0.13	0.41	0.12	0.46	0.28	0.45	0.23	0.10	0.07	0.17	0.25	0.22	0.20	0.27	0.19
N3	0.06	0.74	0.24	0.27	0.47	0.05	0.63	0.06	0.82	0.36	0.87	0.49	0.91	0.54	0.27	0.07	0.31	0.13	0.19	0.10	0.37	0.18
N6	0.39	0.33	0.14	0.28	0.12	0.56	0.13	0.62	0.15	0.36	0.28	0.21	0.15	0.26	0.28	0.11	0.22	0.65	0.35	0.53	0.14	0.33
N7	0.26	0.65	0.08	0.13	0.20	0.46	0.23	0.54	0.44	0.18	0.64	0.42	0.46	0.10	0.13	0.09	0.10	0.55	0.35	0.47	0.20	0.36
N9	0.11	0.81	0.16	0.12	0.39	0.23	0.50	0.26	0.74	0.16	0.89	0.52	0.82	0.35	0.14	0.07	0.17	0.33	0.28	0.26	0.31	0.28
O2'	0.10	0.60	0.17	0.25	0.36	0.09	0.61	0.07	0.85	0.33	0.87	0.31	1.05	0.55	0.19	0.14	0.33	0.22	0.29	0.14	0.52	0.27
O3'	0.38	0.43	0.23	0.21	0.14	0.46	0.35	0.44	0.61	0.09	0.67	0.14	0.80	0.27	0.14	0.47	0.21	0.53	0.53	0.53	0.59	0.48
O4'	0.07	1.06	0.22	0.18	0.59	0.17	0.75	0.19	1.05	0.35	1.21	0.71	1.17	0.59	0.31	0.06	0.18	0.22	0.21	0.18	0.26	0.23
O5'	0.32	1.21	0.52	0.44	0.78	0.12	0.88	0.08	1.13	0.51	1.29	0.93	1.21	0.70	0.52	0.36	0.45	0.09	0.20	0.13	0.33	0.20
OP1	0.09	1.08	0.22	0.13	0.57	0.32	0.68	0.41	0.99	0.24	1.19	0.76	1.09	0.47	0.26	0.12	0.16	0.32	0.16	0.35	0.17	0.16
OP2	0.26	0.70	0.16	0.23	0.25	0.51	0.29	0.62	0.53	0.18	0.73	0.45	0.57	0.14	0.14	0.19	0.24	0.55	0.30	0.51	0.17	0.29
P	0.12	1.06	0.30	0.19	0.58	0.21	0.66	0.30	0.92	0.25	1.12	0.77	0.99	0.45	0.29	0.18	0.20	0.24	0.09	0.23	0.25	0.09

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.33	0.11	0.54	0.35
C2	0.03	0.00	0.09	0.11	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.15	0.02	0.70	0.34	1.43	0.84
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.07	0.01	0.11	0.01	0.13	0.08	0.11	0.06	0.15	0.11	0.05	0.00	0.02	0.01	0.36	0.25	0.54	0.32
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.10	0.00	0.16	0.01	0.18	0.13	0.15	0.08	0.21	0.17	0.08	0.02	0.01	0.02	0.44	0.34	0.58	0.35
C4	0.02	0.01	0.07	0.10	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.05	0.13	0.01	0.74	0.31	1.40	0.85
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.07	0.05	0.06	0.04	0.08	0.06	0.03	0.05	0.01	0.00	0.01	0.06	0.03	0.02
C5	0.01	0.01	0.11	0.16	0.00	0.06	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.21	0.02	0.94	0.42	1.87	1.12
C5'	0.02	0.05	0.01	0.01	0.06	0.00	0.08	0.00	0.09	0.09	0.07	0.04	0.11	0.10	0.05	0.05	0.03	0.01	0.01	0.06	0.02	0.01
C6	0.02	0.01	0.13	0.18	0.01	0.07	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.25	0.02	0.96	0.47	2.02	1.19
C8	0.01	0.01	0.08	0.13	0.01	0.05	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.17	0.04	0.94	0.34	1.67	1.05
N1	0.03	0.00	0.11	0.15	0.01	0.06	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.21	0.02	0.85	0.43	1.79	1.05
N3	0.03	0.00	0.06	0.08	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.10	0.03	0.60	0.28	1.18	0.70
N6	0.02	0.01	0.15	0.21	0.01	0.08	0.01	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.31	0.03	1.06	0.53	2.31	1.35
N7	0.01	0.01	0.11	0.17	0.01	0.06	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.23	0.04	1.05	0.44	2.08	1.26
N9	0.00	0.01	0.05	0.08	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.10	0.01	0.68	0.24	1.18	0.74
O2'	0.02	0.08	0.00	0.02	0.05	0.05	0.09	0.05	0.11	0.05	0.10	0.06	0.14	0.08	0.03	0.00	0.05	0.03	0.06	0.13	0.07	0.06
O3'	0.01	0.15	0.02	0.01	0.13	0.01	0.21	0.03	0.25	0.17	0.21	0.10	0.31	0.23	0.10	0.05	0.00	0.01	0.27	0.39	0.33	0.16
O4'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.03	0.03	0.04	0.01	0.03	0.01	0.00	0.12	0.10	0.20	0.15
O5'	0.33	0.70	0.36	0.44	0.74	0.01	0.94	0.01	0.96	0.94	0.85	0.60	1.06	1.05	0.68	0.06	0.27	0.12	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.11	0.34	0.25	0.34	0.31	0.06	0.42	0.06	0.47	0.34	0.43	0.28	0.53	0.44	0.24	0.13	0.39	0.10	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.54	1.43	0.54	0.58	1.40	0.03	1.87	0.02	2.02	1.67	1.79	1.18	2.31	2.08	1.18	0.07	0.33	0.20	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.35	0.84	0.32	0.35	0.85	0.02	1.12	0.01	1.19	1.05	1.05	0.70	1.35	1.26	0.74	0.06	0.16	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00