Doublet Group distance statistics: 48282

back

Distances from reference structure (by RMSD)

4, 11, 9, 2, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.014, 0.022, 0.030, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.022 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.002, 0.010, 0.018, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.010 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.019, 0.031, 0.042, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.031 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.011, 0.025, 0.038, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.025 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.016, 0.030, 0.044, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.030 std_dev=0.014
C5	A	0, 0.004, 0.019, 0.033, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.019 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.007, 0.026, 0.046, 0.105 max_d=0.105 avg_d=0.026 std_dev=0.020
N9	A	0, 0.003, 0.026, 0.050, 0.117 max_d=0.117 avg_d=0.026 std_dev=0.023
N6	A	0, 0.007, 0.037, 0.067, 0.161 max_d=0.161 avg_d=0.037 std_dev=0.030
N7	A	0, 0.000, 0.033, 0.067, 0.185 max_d=0.185 avg_d=0.033 std_dev=0.033
C8	A	0, -0.001, 0.040, 0.081, 0.222 max_d=0.222 avg_d=0.040 std_dev=0.041
C2'	B	0, 0.088, 0.220, 0.353, 0.609 max_d=0.609 avg_d=0.220 std_dev=0.132
O2'	B	0, 0.064, 0.210, 0.357, 0.556 max_d=0.556 avg_d=0.210 std_dev=0.147
O4'	A	0, 0.060, 0.270, 0.481, 1.253 max_d=1.253 avg_d=0.270 std_dev=0.211
C2'	A	0, -0.009, 0.202, 0.413, 1.200 max_d=1.200 avg_d=0.202 std_dev=0.211
C4'	A	0, -0.011, 0.252, 0.516, 1.449 max_d=1.449 avg_d=0.252 std_dev=0.264
C3'	A	0, -0.082, 0.260, 0.602, 1.850 max_d=1.850 avg_d=0.260 std_dev=0.342
O2'	A	0, -0.038, 0.368, 0.775, 2.006 max_d=2.006 avg_d=0.368 std_dev=0.407
C3'	B	0, -0.109, 0.357, 0.823, 2.180 max_d=2.180 avg_d=0.357 std_dev=0.466
C1'	B	0, -0.087, 0.410, 0.906, 2.807 max_d=2.807 avg_d=0.410 std_dev=0.497
C5'	A	0, -0.008, 0.509, 1.026, 2.753 max_d=2.753 avg_d=0.509 std_dev=0.517
O3'	A	0, -0.330, 0.292, 0.914, 3.517 max_d=3.517 avg_d=0.292 std_dev=0.622
O4'	B	0, -0.193, 0.516, 1.225, 3.853 max_d=3.853 avg_d=0.516 std_dev=0.709
C4'	B	0, -0.219, 0.518, 1.255, 3.252 max_d=3.252 avg_d=0.518 std_dev=0.737
O5'	A	0, -0.197, 0.547, 1.292, 3.132 max_d=3.132 avg_d=0.547 std_dev=0.745
O3'	B	0, -0.418, 0.424, 1.266, 4.555 max_d=4.555 avg_d=0.424 std_dev=0.842
N9	B	0, -0.258, 0.593, 1.444, 4.725 max_d=4.725 avg_d=0.593 std_dev=0.851
O5'	B	0, -0.274, 0.613, 1.499, 5.174 max_d=5.174 avg_d=0.613 std_dev=0.886
P	A	0, -0.344, 0.611, 1.567, 3.479 max_d=3.479 avg_d=0.611 std_dev=0.956
OP1	A	0, -0.373, 0.590, 1.553, 3.541 max_d=3.541 avg_d=0.590 std_dev=0.963
C5'	B	0, -0.323, 0.678, 1.678, 5.072 max_d=5.072 avg_d=0.678 std_dev=1.001
OP2	B	0, -0.259, 0.745, 1.749, 5.732 max_d=5.732 avg_d=0.745 std_dev=1.004
C8	B	0, -0.305, 0.748, 1.800, 5.904 max_d=5.904 avg_d=0.748 std_dev=1.053
P	B	0, -0.485, 0.739, 1.964, 7.046 max_d=7.046 avg_d=0.739 std_dev=1.224
OP2	A	0, -0.442, 0.805, 2.053, 4.689 max_d=4.689 avg_d=0.805 std_dev=1.248
C4	B	0, -0.556, 0.739, 2.033, 6.234 max_d=6.234 avg_d=0.739 std_dev=1.295
N3	B	0, -0.744, 0.735, 2.214, 6.545 max_d=6.545 avg_d=0.735 std_dev=1.479
N7	B	0, -0.580, 0.938, 2.455, 8.108 max_d=8.108 avg_d=0.938 std_dev=1.517
OP1	B	0, -0.808, 0.824, 2.456, 9.186 max_d=9.186 avg_d=0.824 std_dev=1.632
C5	B	0, -0.738, 0.926, 2.590, 8.352 max_d=8.352 avg_d=0.926 std_dev=1.664
C2	B	0, -1.075, 0.921, 2.917, 8.756 max_d=8.756 avg_d=0.921 std_dev=1.996
C6	B	0, -1.086, 1.106, 3.297, 10.338 max_d=10.338 avg_d=1.106 std_dev=2.192
N1	B	0, -1.234, 1.098, 3.430, 9.998 max_d=9.998 avg_d=1.098 std_dev=2.332
N6	B	0, -1.310, 1.306, 3.921, 12.556 max_d=12.556 avg_d=1.306 std_dev=2.615

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.14	0.00	0.09	0.16	0.18	0.10
C2	0.02	0.00	0.12	0.05	0.00	0.08	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.28	0.23	0.11	0.14	0.11	0.27	0.12
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.07	0.01	0.04	0.08	0.07	0.08	0.10	0.12	0.06	0.05	0.02	0.00	0.02	0.02	0.29	0.29	0.38	0.28
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.06	0.00	0.11	0.03	0.10	0.19	0.06	0.05	0.13	0.19	0.09	0.02	0.01	0.01	0.21	0.30	0.22	0.16
C4	0.01	0.00	0.07	0.06	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.17	0.12	0.06	0.14	0.09	0.25	0.14
C4'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.05	0.10	0.06	0.08	0.06	0.09	0.04	0.12	0.02	0.00	0.01	0.21	0.15	0.07
C5	0.01	0.01	0.04	0.11	0.00	0.05	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.16	0.04	0.03	0.18	0.12	0.30	0.19
C5'	0.04	0.11	0.08	0.03	0.09	0.01	0.12	0.00	0.12	0.15	0.11	0.10	0.13	0.15	0.08	0.06	0.09	0.01	0.01	0.12	0.19	0.02
C6	0.01	0.01	0.07	0.10	0.00	0.05	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.20	0.07	0.06	0.19	0.13	0.33	0.20
C8	0.01	0.01	0.08	0.19	0.01	0.10	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.14	0.12	0.06	0.19	0.13	0.24	0.20
N1	0.02	0.00	0.10	0.06	0.00	0.06	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.25	0.16	0.09	0.16	0.10	0.31	0.17
N3	0.02	0.00	0.12	0.05	0.00	0.08	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.27	0.24	0.11	0.12	0.13	0.24	0.10
N6	0.01	0.01	0.06	0.13	0.01	0.06	0.01	0.13	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.19	0.04	0.05	0.21	0.17	0.37	0.24
N7	0.01	0.01	0.05	0.19	0.01	0.09	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.14	0.11	0.04	0.22	0.17	0.30	0.23
N9	0.00	0.01	0.02	0.09	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.09	0.05	0.01	0.13	0.09	0.21	0.13
O2'	0.02	0.28	0.00	0.02	0.17	0.12	0.16	0.06	0.20	0.14	0.25	0.27	0.19	0.14	0.09	0.00	0.04	0.08	0.30	0.33	0.46	0.29
O3'	0.14	0.23	0.02	0.01	0.12	0.02	0.04	0.09	0.07	0.12	0.16	0.24	0.04	0.11	0.05	0.04	0.00	0.10	0.18	0.38	0.21	0.17
O4'	0.00	0.11	0.02	0.01	0.06	0.00	0.03	0.01	0.06	0.06	0.09	0.11	0.05	0.04	0.01	0.08	0.10	0.00	0.10	0.22	0.17	0.15
O5'	0.09	0.14	0.29	0.21	0.14	0.01	0.18	0.01	0.19	0.19	0.16	0.12	0.21	0.22	0.13	0.30	0.18	0.10	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.16	0.11	0.29	0.30	0.09	0.21	0.12	0.12	0.13	0.13	0.10	0.13	0.17	0.17	0.09	0.33	0.38	0.22	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.18	0.27	0.38	0.22	0.25	0.15	0.30	0.19	0.33	0.24	0.31	0.24	0.37	0.30	0.21	0.46	0.21	0.17	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.10	0.12	0.28	0.16	0.14	0.07	0.19	0.02	0.20	0.20	0.17	0.10	0.24	0.23	0.13	0.29	0.17	0.15	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.21	0.94	0.08	0.30	0.41	0.15	0.27	0.39	0.43	0.32	0.76	0.80	0.36	0.34	0.17	0.10	0.56	0.15	0.69	1.27	0.78	0.93
C2	0.22	0.78	0.09	0.29	0.39	0.12	0.29	0.32	0.38	0.35	0.59	0.73	0.34	0.37	0.20	0.10	0.57	0.15	0.62	1.09	0.69	0.80
C2'	0.25	1.13	0.13	0.37	0.53	0.28	0.44	0.55	0.65	0.37	0.99	0.92	0.59	0.40	0.27	0.11	0.62	0.21	0.82	1.42	0.88	1.07
C3'	0.23	1.15	0.08	0.34	0.54	0.22	0.46	0.50	0.68	0.35	1.02	0.93	0.64	0.41	0.26	0.11	0.63	0.16	0.78	1.41	0.87	1.05
C4	0.18	0.76	0.07	0.27	0.30	0.11	0.14	0.34	0.25	0.31	0.55	0.67	0.16	0.31	0.11	0.09	0.48	0.13	0.64	1.11	0.69	0.83
C4'	0.24	0.97	0.11	0.31	0.42	0.19	0.27	0.42	0.44	0.30	0.79	0.81	0.37	0.32	0.18	0.14	0.56	0.19	0.71	1.30	0.80	0.96
C5	0.15	0.62	0.07	0.22	0.26	0.07	0.18	0.28	0.24	0.31	0.45	0.56	0.22	0.33	0.13	0.07	0.34	0.12	0.58	0.93	0.60	0.72
C5'	0.22	0.92	0.14	0.36	0.36	0.25	0.18	0.48	0.37	0.29	0.74	0.76	0.27	0.27	0.13	0.17	0.56	0.20	0.76	1.29	0.81	0.99
C6	0.15	0.53	0.07	0.19	0.27	0.06	0.25	0.22	0.29	0.33	0.40	0.49	0.30	0.35	0.17	0.07	0.27	0.11	0.51	0.79	0.52	0.62
C8	0.16	0.72	0.07	0.24	0.29	0.09	0.18	0.32	0.26	0.32	0.53	0.62	0.22	0.33	0.13	0.07	0.37	0.12	0.63	1.04	0.65	0.80
N1	0.15	0.50	0.08	0.23	0.19	0.07	0.07	0.25	0.10	0.29	0.31	0.49	0.08	0.28	0.07	0.09	0.40	0.12	0.53	0.86	0.57	0.66
N3	0.22	0.90	0.09	0.30	0.43	0.14	0.33	0.37	0.45	0.36	0.72	0.80	0.41	0.40	0.22	0.10	0.59	0.15	0.67	1.21	0.75	0.88
N6	0.18	0.66	0.07	0.15	0.48	0.10	0.54	0.15	0.62	0.44	0.66	0.58	0.65	0.54	0.35	0.07	0.12	0.13	0.41	0.58	0.41	0.49
N7	0.16	0.67	0.07	0.21	0.32	0.07	0.30	0.27	0.38	0.35	0.54	0.58	0.39	0.39	0.19	0.06	0.28	0.12	0.57	0.91	0.58	0.71
N9	0.18	0.80	0.07	0.27	0.31	0.12	0.14	0.36	0.27	0.30	0.59	0.69	0.17	0.31	0.11	0.08	0.48	0.13	0.67	1.16	0.72	0.86
O2'	0.43	1.34	0.28	0.45	0.73	0.46	0.69	0.70	0.91	0.55	1.25	1.08	0.88	0.60	0.49	0.24	0.69	0.43	0.93	1.55	1.00	1.19
O3'	0.42	1.29	0.16	0.33	0.72	0.30	0.70	0.51	0.90	0.55	1.20	1.05	0.90	0.64	0.49	0.15	0.64	0.38	0.78	1.45	0.91	1.07
O4'	0.25	0.85	0.14	0.30	0.36	0.19	0.21	0.36	0.33	0.32	0.65	0.73	0.26	0.34	0.18	0.16	0.52	0.22	0.66	1.21	0.75	0.89
O5'	0.19	0.95	0.19	0.39	0.39	0.28	0.26	0.55	0.45	0.32	0.80	0.77	0.37	0.30	0.16	0.21	0.53	0.17	0.82	1.31	0.84	1.03
OP1	0.15	0.92	0.13	0.38	0.37	0.23	0.22	0.53	0.41	0.29	0.76	0.74	0.31	0.26	0.12	0.13	0.50	0.10	0.83	1.26	0.84	1.02
OP2	0.26	0.92	0.39	0.48	0.43	0.41	0.39	0.65	0.55	0.43	0.82	0.72	0.53	0.42	0.29	0.32	0.43	0.28	0.86	1.22	0.84	1.01
P	0.19	0.94	0.21	0.33	0.42	0.20	0.31	0.48	0.48	0.31	0.80	0.77	0.42	0.31	0.20	0.17	0.41	0.13	0.76	1.18	0.77	0.94

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.18	0.00	0.12	0.37	0.28	0.23
C2	0.01	0.00	0.16	0.15	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.19	0.08	0.08	0.52	0.31	0.23
C2'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.09	0.01	0.05	0.13	0.09	0.09	0.13	0.16	0.08	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.28	0.39	0.29	0.34
C3'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.15	0.00	0.19	0.01	0.20	0.18	0.18	0.13	0.23	0.21	0.13	0.02	0.01	0.02	0.08	0.18	0.13	0.10
C4	0.01	0.01	0.09	0.15	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.13	0.11	0.04	0.08	0.53	0.28	0.23
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.07	0.10	0.05	0.04	0.09	0.10	0.05	0.18	0.02	0.00	0.02	0.10	0.18	0.03
C5	0.01	0.01	0.05	0.19	0.00	0.07	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.20	0.08	0.02	0.10	0.60	0.29	0.22
C5'	0.05	0.06	0.13	0.01	0.05	0.00	0.06	0.00	0.07	0.07	0.06	0.06	0.09	0.08	0.04	0.06	0.13	0.01	0.01	0.16	0.18	0.01
C6	0.02	0.01	0.09	0.20	0.01	0.07	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.20	0.11	0.03	0.11	0.61	0.31	0.22
C8	0.01	0.01	0.09	0.18	0.00	0.10	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.21	0.09	0.06	0.10	0.60	0.24	0.22
N1	0.01	0.00	0.13	0.18	0.01	0.05	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.15	0.15	0.06	0.10	0.57	0.31	0.23
N3	0.01	0.00	0.16	0.13	0.00	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.08	0.20	0.08	0.09	0.48	0.30	0.24
N6	0.03	0.01	0.08	0.23	0.02	0.09	0.02	0.09	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.03	0.23	0.13	0.04	0.14	0.64	0.33	0.21
N7	0.01	0.01	0.06	0.21	0.01	0.10	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.24	0.11	0.04	0.13	0.64	0.28	0.21
N9	0.00	0.01	0.02	0.13	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.00	0.13	0.06	0.01	0.07	0.50	0.26	0.23
O2'	0.01	0.10	0.00	0.02	0.13	0.18	0.20	0.06	0.20	0.21	0.15	0.08	0.23	0.24	0.13	0.00	0.05	0.12	0.22	0.31	0.27	0.29
O3'	0.18	0.19	0.02	0.01	0.11	0.02	0.08	0.13	0.11	0.09	0.15	0.20	0.13	0.11	0.06	0.05	0.00	0.12	0.17	0.46	0.27	0.27
O4'	0.00	0.08	0.01	0.02	0.04	0.00	0.02	0.01	0.03	0.06	0.06	0.08	0.04	0.04	0.01	0.12	0.12	0.00	0.07	0.26	0.31	0.17
O5'	0.12	0.08	0.28	0.08	0.08	0.02	0.10	0.01	0.11	0.10	0.10	0.09	0.14	0.13	0.07	0.22	0.17	0.07	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.37	0.52	0.39	0.18	0.53	0.10	0.60	0.16	0.61	0.60	0.57	0.48	0.64	0.64	0.50	0.31	0.46	0.26	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.28	0.31	0.29	0.13	0.28	0.18	0.29	0.18	0.31	0.24	0.31	0.30	0.33	0.28	0.26	0.27	0.27	0.31	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.23	0.23	0.34	0.10	0.23	0.03	0.22	0.01	0.22	0.22	0.23	0.24	0.21	0.21	0.23	0.29	0.27	0.17	0.00	0.01	0.01	0.00