Doublet Group distance statistics: 48283

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 3, 11, 7, 2, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.008, 0.014, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.008 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.004, 0.010, 0.017, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.010, 0.017, 0.024, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.017 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.010, 0.017, 0.025, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.017 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.014, 0.022, 0.031, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.022 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.014, 0.023, 0.033, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.023 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.011, 0.021, 0.032, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.021 std_dev=0.010
N9	A	0, 0.014, 0.026, 0.038, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.026 std_dev=0.012
N7	A	0, 0.006, 0.020, 0.033, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.020 std_dev=0.014
C8	A	0, 0.013, 0.029, 0.044, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.029 std_dev=0.016
N6	A	0, 0.006, 0.026, 0.045, 0.104 max_d=0.104 avg_d=0.026 std_dev=0.019
O2'	B	0, 0.191, 0.325, 0.459, 0.783 max_d=0.783 avg_d=0.325 std_dev=0.134
C5	B	0, 0.094, 0.239, 0.383, 0.637 max_d=0.637 avg_d=0.239 std_dev=0.145
C4	B	0, 0.105, 0.252, 0.399, 0.702 max_d=0.702 avg_d=0.252 std_dev=0.147
C6	B	0, 0.118, 0.269, 0.419, 0.756 max_d=0.756 avg_d=0.269 std_dev=0.150
N7	B	0, 0.152, 0.305, 0.457, 0.681 max_d=0.681 avg_d=0.305 std_dev=0.153
N9	B	0, 0.174, 0.328, 0.483, 0.688 max_d=0.688 avg_d=0.328 std_dev=0.154
C8	B	0, 0.193, 0.351, 0.509, 0.692 max_d=0.692 avg_d=0.351 std_dev=0.158
N3	B	0, 0.112, 0.276, 0.439, 0.855 max_d=0.855 avg_d=0.276 std_dev=0.164
N6	B	0, 0.173, 0.340, 0.507, 0.836 max_d=0.836 avg_d=0.340 std_dev=0.167
C2'	B	0, 0.246, 0.419, 0.591, 0.795 max_d=0.795 avg_d=0.419 std_dev=0.172
N1	B	0, 0.127, 0.300, 0.472, 0.970 max_d=0.970 avg_d=0.300 std_dev=0.173
C2	B	0, 0.113, 0.289, 0.466, 0.996 max_d=0.996 avg_d=0.289 std_dev=0.176
C1'	B	0, 0.229, 0.416, 0.603, 0.774 max_d=0.774 avg_d=0.416 std_dev=0.187
C3'	B	0, 0.294, 0.538, 0.782, 1.132 max_d=1.132 avg_d=0.538 std_dev=0.244
O4'	B	0, 0.348, 0.640, 0.932, 1.170 max_d=1.170 avg_d=0.640 std_dev=0.292
C4'	B	0, 0.376, 0.681, 0.986, 1.283 max_d=1.283 avg_d=0.681 std_dev=0.305
O3'	B	0, 0.126, 0.492, 0.857, 2.138 max_d=2.138 avg_d=0.492 std_dev=0.365
O5'	B	0, 0.569, 0.944, 1.320, 1.647 max_d=1.647 avg_d=0.944 std_dev=0.375
C5'	B	0, 0.509, 0.914, 1.318, 1.775 max_d=1.775 avg_d=0.914 std_dev=0.405
P	B	0, 0.660, 1.077, 1.494, 1.940 max_d=1.940 avg_d=1.077 std_dev=0.417
O4'	A	0, -0.048, 0.386, 0.820, 2.086 max_d=2.086 avg_d=0.386 std_dev=0.434
C2'	A	0, -0.078, 0.360, 0.799, 2.062 max_d=2.062 avg_d=0.360 std_dev=0.438
OP2	B	0, 0.660, 1.106, 1.551, 2.126 max_d=2.126 avg_d=1.106 std_dev=0.446
OP1	B	0, 0.657, 1.114, 1.572, 1.936 max_d=1.936 avg_d=1.114 std_dev=0.457
O3'	A	0, -0.133, 0.332, 0.797, 2.578 max_d=2.578 avg_d=0.332 std_dev=0.465
C3'	A	0, -0.291, 0.267, 0.826, 2.306 max_d=2.306 avg_d=0.267 std_dev=0.558
C4'	A	0, -0.149, 0.474, 1.097, 2.752 max_d=2.752 avg_d=0.474 std_dev=0.623
O2'	A	0, 0.090, 0.719, 1.349, 3.228 max_d=3.228 avg_d=0.719 std_dev=0.630
O5'	A	0, -0.252, 0.747, 1.746, 4.376 max_d=4.376 avg_d=0.747 std_dev=0.999
C5'	A	0, -0.357, 0.733, 1.823, 4.978 max_d=4.978 avg_d=0.733 std_dev=1.090
OP2	A	0, 0.186, 1.297, 2.407, 6.337 max_d=6.337 avg_d=1.297 std_dev=1.111
P	A	0, -0.243, 0.911, 2.065, 5.719 max_d=5.719 avg_d=0.911 std_dev=1.154
OP1	A	0, -0.087, 1.294, 2.675, 6.829 max_d=6.829 avg_d=1.294 std_dev=1.381

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.15	0.00	0.10	0.19	0.43	0.13
C2	0.02	0.00	0.13	0.06	0.00	0.33	0.00	0.46	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.37	0.20	0.36	0.44	0.30	0.49	0.32
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.08	0.01	0.06	0.08	0.08	0.04	0.12	0.13	0.07	0.02	0.02	0.00	0.03	0.01	0.28	0.36	0.79	0.42
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.03	0.00	0.09	0.03	0.07	0.19	0.03	0.07	0.11	0.18	0.08	0.02	0.01	0.01	0.16	0.28	0.56	0.26
C4	0.01	0.00	0.08	0.03	0.00	0.13	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.17	0.13	0.18	0.23	0.12	0.42	0.18
C4'	0.00	0.33	0.01	0.00	0.13	0.00	0.05	0.01	0.11	0.22	0.24	0.31	0.07	0.15	0.04	0.06	0.01	0.00	0.02	0.21	0.23	0.12
C5	0.01	0.00	0.06	0.09	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.10	0.06	0.07	0.18	0.12	0.41	0.22
C5'	0.03	0.46	0.08	0.03	0.18	0.01	0.06	0.00	0.16	0.32	0.35	0.43	0.09	0.24	0.06	0.04	0.10	0.02	0.01	0.03	0.07	0.01
C6	0.01	0.00	0.08	0.07	0.01	0.11	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.16	0.08	0.15	0.24	0.13	0.44	0.25
C8	0.01	0.01	0.04	0.19	0.00	0.22	0.00	0.32	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.27	0.07	0.19	0.30	0.28	0.37	0.31
N1	0.02	0.00	0.12	0.03	0.01	0.24	0.01	0.35	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.28	0.15	0.27	0.36	0.21	0.46	0.27
N3	0.02	0.00	0.13	0.07	0.00	0.31	0.00	0.43	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.35	0.21	0.37	0.40	0.29	0.49	0.30
N6	0.01	0.01	0.07	0.11	0.01	0.07	0.01	0.09	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.12	0.05	0.09	0.22	0.20	0.47	0.31
N7	0.01	0.00	0.02	0.18	0.00	0.15	0.00	0.24	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.20	0.06	0.10	0.26	0.29	0.43	0.34
N9	0.00	0.01	0.02	0.08	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.07	0.08	0.01	0.12	0.10	0.38	0.13
O2'	0.02	0.37	0.00	0.02	0.17	0.06	0.10	0.04	0.16	0.27	0.28	0.35	0.12	0.20	0.07	0.00	0.07	0.04	0.29	0.40	0.95	0.49
O3'	0.15	0.20	0.03	0.01	0.13	0.01	0.06	0.10	0.08	0.07	0.15	0.21	0.05	0.06	0.08	0.07	0.00	0.10	0.15	0.23	0.40	0.09
O4'	0.00	0.36	0.01	0.01	0.18	0.00	0.07	0.02	0.15	0.19	0.27	0.37	0.09	0.10	0.01	0.04	0.10	0.00	0.06	0.17	0.17	0.12
O5'	0.10	0.44	0.28	0.16	0.23	0.02	0.18	0.01	0.24	0.30	0.36	0.40	0.22	0.26	0.12	0.29	0.15	0.06	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.19	0.30	0.36	0.28	0.12	0.21	0.12	0.03	0.13	0.28	0.21	0.29	0.20	0.29	0.10	0.40	0.23	0.17	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.43	0.49	0.79	0.56	0.42	0.23	0.41	0.07	0.44	0.37	0.46	0.49	0.47	0.43	0.38	0.95	0.40	0.17	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.13	0.32	0.42	0.26	0.18	0.12	0.22	0.01	0.25	0.31	0.27	0.30	0.31	0.34	0.13	0.49	0.09	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.18	0.18	0.19	0.14	0.17	0.13	0.17	0.14	0.15	0.17	0.16	0.12	0.14	0.15	0.18	0.16	0.15	0.14	0.21	0.24	0.23
C2	0.14	0.15	0.19	0.20	0.11	0.16	0.10	0.15	0.12	0.08	0.14	0.15	0.14	0.10	0.10	0.20	0.20	0.13	0.15	0.18	0.24	0.21
C2'	0.22	0.38	0.18	0.19	0.29	0.22	0.32	0.22	0.40	0.23	0.43	0.32	0.46	0.27	0.24	0.17	0.17	0.23	0.16	0.22	0.29	0.26
C3'	0.25	0.23	0.23	0.26	0.26	0.30	0.31	0.35	0.32	0.33	0.28	0.23	0.39	0.36	0.28	0.16	0.19	0.30	0.28	0.28	0.25	0.23
C4	0.14	0.16	0.17	0.18	0.12	0.15	0.08	0.15	0.09	0.12	0.14	0.16	0.08	0.10	0.12	0.18	0.16	0.13	0.13	0.18	0.24	0.22
C4'	0.39	0.16	0.42	0.46	0.31	0.50	0.36	0.58	0.26	0.49	0.17	0.21	0.29	0.49	0.40	0.33	0.37	0.45	0.53	0.50	0.49	0.43
C5	0.13	0.15	0.15	0.15	0.11	0.13	0.07	0.13	0.06	0.12	0.11	0.15	0.09	0.12	0.11	0.16	0.14	0.12	0.12	0.16	0.22	0.20
C5'	0.59	0.18	0.59	0.66	0.48	0.75	0.57	0.89	0.41	0.77	0.20	0.30	0.48	0.79	0.61	0.42	0.52	0.71	0.84	0.79	0.81	0.75
C6	0.11	0.13	0.14	0.14	0.07	0.12	0.06	0.11	0.08	0.10	0.10	0.13	0.12	0.12	0.07	0.17	0.14	0.10	0.12	0.16	0.21	0.18
C8	0.15	0.19	0.15	0.15	0.15	0.15	0.14	0.15	0.13	0.15	0.16	0.18	0.12	0.15	0.15	0.15	0.14	0.15	0.13	0.17	0.23	0.22
N1	0.11	0.14	0.16	0.17	0.09	0.13	0.09	0.12	0.11	0.09	0.12	0.14	0.14	0.12	0.07	0.20	0.18	0.10	0.13	0.16	0.22	0.18
N3	0.14	0.16	0.19	0.20	0.12	0.16	0.09	0.16	0.12	0.10	0.15	0.15	0.12	0.08	0.12	0.20	0.19	0.14	0.15	0.20	0.25	0.23
N6	0.10	0.12	0.11	0.11	0.06	0.10	0.10	0.10	0.11	0.13	0.11	0.10	0.14	0.14	0.08	0.14	0.14	0.09	0.11	0.17	0.20	0.15
N7	0.15	0.18	0.14	0.14	0.14	0.14	0.12	0.14	0.11	0.14	0.14	0.17	0.12	0.14	0.14	0.15	0.14	0.14	0.12	0.16	0.22	0.20
N9	0.15	0.18	0.17	0.17	0.14	0.16	0.12	0.16	0.11	0.14	0.16	0.17	0.08	0.13	0.14	0.17	0.15	0.14	0.13	0.19	0.24	0.23
O2'	0.21	0.48	0.23	0.23	0.28	0.22	0.26	0.26	0.39	0.18	0.51	0.37	0.41	0.17	0.21	0.24	0.22	0.21	0.34	0.47	0.63	0.56
O3'	0.30	0.25	0.32	0.33	0.28	0.35	0.30	0.39	0.29	0.34	0.26	0.25	0.31	0.34	0.30	0.27	0.28	0.32	0.36	0.43	0.40	0.38
O4'	0.32	0.13	0.39	0.41	0.22	0.40	0.23	0.46	0.13	0.38	0.14	0.15	0.12	0.35	0.30	0.33	0.33	0.34	0.43	0.42	0.38	0.33
O5'	0.62	0.30	0.59	0.64	0.56	0.76	0.65	0.88	0.55	0.78	0.33	0.40	0.65	0.82	0.65	0.42	0.52	0.74	0.80	0.71	0.72	0.67
OP1	0.45	0.27	0.42	0.49	0.38	0.60	0.46	0.74	0.37	0.60	0.27	0.29	0.44	0.62	0.47	0.27	0.37	0.57	0.67	0.61	0.67	0.60
OP2	0.57	0.46	0.55	0.58	0.56	0.65	0.63	0.73	0.61	0.68	0.49	0.49	0.71	0.71	0.60	0.48	0.50	0.64	0.65	0.52	0.55	0.49
P	0.49	0.33	0.46	0.50	0.44	0.61	0.52	0.72	0.45	0.62	0.33	0.36	0.53	0.64	0.51	0.33	0.41	0.59	0.63	0.53	0.57	0.51

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.12	0.00	0.08	0.07	0.14	0.14
C2	0.02	0.00	0.06	0.05	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.12	0.18	0.05	0.10	0.14	0.24	0.23
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.04	0.04	0.07	0.05	0.06	0.04	0.06	0.03	0.00	0.04	0.01	0.05	0.17	0.06	0.06
C3'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.03	0.08	0.03	0.05	0.04	0.07	0.03	0.01	0.01	0.00	0.06	0.27	0.08	0.13
C4	0.01	0.00	0.03	0.02	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.13	0.03	0.10	0.15	0.24	0.23
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.04	0.06	0.03	0.03	0.05	0.06	0.03	0.01	0.04	0.00	0.01	0.08	0.02	0.03
C5	0.01	0.00	0.04	0.04	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.10	0.02	0.12	0.21	0.28	0.28
C5'	0.02	0.07	0.04	0.01	0.07	0.00	0.10	0.00	0.10	0.10	0.08	0.05	0.11	0.11	0.06	0.02	0.06	0.01	0.00	0.09	0.02	0.01
C6	0.01	0.00	0.04	0.03	0.00	0.04	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.11	0.03	0.12	0.22	0.29	0.28
C8	0.01	0.00	0.07	0.08	0.00	0.06	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.07	0.07	0.03	0.12	0.23	0.26	0.28
N1	0.01	0.00	0.05	0.03	0.01	0.03	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.15	0.04	0.11	0.18	0.27	0.26
N3	0.02	0.00	0.06	0.05	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.12	0.18	0.05	0.10	0.12	0.22	0.21
N6	0.01	0.00	0.04	0.04	0.01	0.05	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.09	0.03	0.13	0.26	0.31	0.31
N7	0.01	0.01	0.06	0.07	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.06	0.02	0.13	0.26	0.30	0.31
N9	0.00	0.01	0.03	0.03	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.10	0.01	0.10	0.14	0.21	0.22
O2'	0.01	0.12	0.00	0.01	0.06	0.01	0.04	0.02	0.06	0.07	0.10	0.12	0.06	0.06	0.03	0.00	0.06	0.01	0.06	0.26	0.07	0.08
O3'	0.12	0.18	0.04	0.01	0.13	0.04	0.10	0.06	0.11	0.07	0.15	0.18	0.09	0.06	0.10	0.06	0.00	0.10	0.12	0.38	0.17	0.21
O4'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.04	0.05	0.03	0.02	0.01	0.01	0.10	0.00	0.09	0.14	0.14	0.17
O5'	0.08	0.10	0.05	0.06	0.10	0.01	0.12	0.00	0.12	0.12	0.11	0.10	0.13	0.13	0.10	0.06	0.12	0.09	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.07	0.14	0.17	0.27	0.15	0.08	0.21	0.09	0.22	0.23	0.18	0.12	0.26	0.26	0.14	0.26	0.38	0.14	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.14	0.24	0.06	0.08	0.24	0.02	0.28	0.02	0.29	0.26	0.27	0.22	0.31	0.30	0.21	0.07	0.17	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.14	0.23	0.06	0.13	0.23	0.03	0.28	0.01	0.28	0.28	0.26	0.21	0.31	0.31	0.22	0.08	0.21	0.17	0.00	0.01	0.01	0.00