Doublet Group distance statistics: 48284

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 2, 3, 2, 2, 1, 2, 6, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.006, 0.012, 0.018, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.012 std_dev=0.006
C1'	A	0, 0.011, 0.018, 0.025, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.018 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.004, 0.011, 0.018, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.011 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.011, 0.020, 0.030, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.020 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.007, 0.017, 0.026, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.017 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.012, 0.022, 0.032, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.022 std_dev=0.010
N9	A	0, 0.013, 0.028, 0.043, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.028 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.008, 0.023, 0.039, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.023 std_dev=0.016
N6	A	0, 0.015, 0.031, 0.048, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.031 std_dev=0.016
N7	A	0, 0.012, 0.032, 0.051, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.032 std_dev=0.019
C8	A	0, 0.014, 0.040, 0.066, 0.101 max_d=0.101 avg_d=0.040 std_dev=0.026
O4'	A	0, 0.095, 0.251, 0.406, 0.669 max_d=0.669 avg_d=0.251 std_dev=0.155
C2'	A	0, 0.120, 0.276, 0.432, 0.646 max_d=0.646 avg_d=0.276 std_dev=0.156
O2'	A	0, 0.140, 0.323, 0.506, 0.764 max_d=0.764 avg_d=0.323 std_dev=0.183
C3'	B	0, 0.302, 0.503, 0.704, 0.938 max_d=0.938 avg_d=0.503 std_dev=0.201
C4'	A	0, 0.218, 0.431, 0.644, 0.846 max_d=0.846 avg_d=0.431 std_dev=0.213
C4'	B	0, 0.288, 0.508, 0.727, 0.885 max_d=0.885 avg_d=0.508 std_dev=0.219
C3'	A	0, 0.226, 0.446, 0.666, 0.995 max_d=0.995 avg_d=0.446 std_dev=0.220
O3'	B	0, 0.357, 0.599, 0.841, 1.080 max_d=1.080 avg_d=0.599 std_dev=0.242
C2'	B	0, 0.280, 0.534, 0.788, 0.896 max_d=0.896 avg_d=0.534 std_dev=0.254
C5'	B	0, 0.428, 0.684, 0.940, 1.126 max_d=1.126 avg_d=0.684 std_dev=0.256
O4'	B	0, 0.291, 0.577, 0.864, 1.003 max_d=1.003 avg_d=0.577 std_dev=0.287
O5'	B	0, 0.449, 0.744, 1.038, 1.228 max_d=1.228 avg_d=0.744 std_dev=0.294
C1'	B	0, 0.273, 0.584, 0.895, 1.088 max_d=1.088 avg_d=0.584 std_dev=0.311
O3'	A	0, 0.331, 0.644, 0.958, 1.435 max_d=1.435 avg_d=0.644 std_dev=0.313
O2'	B	0, 0.299, 0.632, 0.965, 1.100 max_d=1.100 avg_d=0.632 std_dev=0.333
P	B	0, 0.499, 0.838, 1.178, 1.528 max_d=1.528 avg_d=0.838 std_dev=0.340
OP1	B	0, 0.537, 0.885, 1.233, 1.516 max_d=1.516 avg_d=0.885 std_dev=0.348
N9	B	0, 0.348, 0.701, 1.054, 1.237 max_d=1.237 avg_d=0.701 std_dev=0.353
C8	B	0, 0.465, 0.831, 1.197, 1.386 max_d=1.386 avg_d=0.831 std_dev=0.366
C5'	A	0, 0.462, 0.846, 1.230, 1.553 max_d=1.553 avg_d=0.846 std_dev=0.384
OP2	B	0, 0.527, 0.921, 1.316, 1.693 max_d=1.693 avg_d=0.921 std_dev=0.394
C4	B	0, 0.373, 0.789, 1.205, 1.405 max_d=1.405 avg_d=0.789 std_dev=0.416
N7	B	0, 0.562, 0.990, 1.417, 1.712 max_d=1.712 avg_d=0.990 std_dev=0.427
C5	B	0, 0.505, 0.955, 1.406, 1.676 max_d=1.676 avg_d=0.955 std_dev=0.451
N3	B	0, 0.334, 0.788, 1.243, 1.433 max_d=1.433 avg_d=0.788 std_dev=0.454
O5'	A	0, 0.687, 1.181, 1.676, 1.798 max_d=1.798 avg_d=1.181 std_dev=0.495
OP1	A	0, 0.605, 1.110, 1.614, 2.032 max_d=2.032 avg_d=1.110 std_dev=0.505
C6	B	0, 0.563, 1.091, 1.618, 1.999 max_d=1.999 avg_d=1.091 std_dev=0.527
C2	B	0, 0.398, 0.927, 1.457, 1.721 max_d=1.721 avg_d=0.927 std_dev=0.530
N1	B	0, 0.498, 1.064, 1.630, 1.999 max_d=1.999 avg_d=1.064 std_dev=0.566
N6	B	0, 0.697, 1.282, 1.868, 2.388 max_d=2.388 avg_d=1.282 std_dev=0.586
P	A	0, 0.857, 1.488, 2.119, 2.369 max_d=2.369 avg_d=1.488 std_dev=0.631
OP2	A	0, 0.900, 2.264, 3.627, 4.531 max_d=4.531 avg_d=2.264 std_dev=1.364

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.17	0.10	0.33	0.20
C2	0.03	0.00	0.09	0.10	0.01	0.03	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.13	0.05	0.28	0.27	0.59	0.37
C2'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.05	0.02	0.03	0.02	0.04	0.05	0.07	0.09	0.03	0.04	0.02	0.00	0.02	0.02	0.29	0.16	0.42	0.26
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.07	0.00	0.08	0.02	0.08	0.10	0.09	0.09	0.09	0.09	0.05	0.02	0.01	0.02	0.40	0.21	0.46	0.32
C4	0.01	0.01	0.05	0.07	0.00	0.04	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.07	0.02	0.30	0.30	0.62	0.39
C4'	0.01	0.03	0.02	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.06	0.11	0.04	0.03	0.08	0.11	0.05	0.05	0.02	0.00	0.02	0.11	0.14	0.04
C5	0.01	0.01	0.03	0.08	0.00	0.07	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.08	0.02	0.38	0.44	0.80	0.51
C5'	0.03	0.10	0.02	0.02	0.13	0.01	0.19	0.00	0.19	0.22	0.15	0.08	0.22	0.24	0.13	0.05	0.07	0.01	0.00	0.12	0.30	0.02
C6	0.02	0.01	0.04	0.08	0.01	0.06	0.01	0.19	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.09	0.03	0.38	0.46	0.82	0.52
C8	0.01	0.01	0.05	0.10	0.00	0.11	0.01	0.22	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.04	0.10	0.04	0.40	0.43	0.80	0.51
N1	0.02	0.01	0.07	0.09	0.01	0.04	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.11	0.04	0.33	0.38	0.72	0.46
N3	0.03	0.01	0.09	0.09	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.11	0.04	0.25	0.22	0.51	0.32
N6	0.02	0.01	0.03	0.09	0.01	0.08	0.01	0.22	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.06	0.10	0.03	0.42	0.54	0.93	0.59
N7	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.11	0.00	0.24	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.10	0.03	0.43	0.52	0.92	0.58
N9	0.00	0.01	0.02	0.05	0.00	0.05	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.05	0.01	0.30	0.28	0.57	0.37
O2'	0.02	0.11	0.00	0.02	0.06	0.05	0.05	0.05	0.06	0.04	0.09	0.11	0.06	0.03	0.03	0.00	0.05	0.05	0.12	0.16	0.19	0.11
O3'	0.02	0.13	0.02	0.01	0.07	0.02	0.08	0.07	0.09	0.10	0.11	0.11	0.10	0.10	0.05	0.05	0.00	0.01	0.35	0.27	0.37	0.26
O4'	0.00	0.05	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.04	0.04	0.04	0.03	0.03	0.01	0.05	0.01	0.00	0.08	0.10	0.18	0.10
O5'	0.17	0.28	0.29	0.40	0.30	0.02	0.38	0.00	0.38	0.40	0.33	0.25	0.42	0.43	0.30	0.12	0.35	0.08	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.10	0.27	0.16	0.21	0.30	0.11	0.44	0.12	0.46	0.43	0.38	0.22	0.54	0.52	0.28	0.16	0.27	0.10	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.33	0.59	0.42	0.46	0.62	0.14	0.80	0.30	0.82	0.80	0.72	0.51	0.93	0.92	0.57	0.19	0.37	0.18	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.20	0.37	0.26	0.32	0.39	0.04	0.51	0.02	0.52	0.51	0.46	0.32	0.59	0.58	0.37	0.11	0.26	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.12	0.20	0.14	0.10	0.11	0.13	0.16	0.14	0.16	0.12	0.11	0.17	0.18	0.11	0.30	0.18	0.13	0.21	0.20	0.20	0.19
C2	0.16	0.18	0.23	0.16	0.13	0.13	0.14	0.17	0.15	0.16	0.15	0.18	0.17	0.18	0.13	0.33	0.20	0.14	0.22	0.19	0.20	0.19
C2'	0.14	0.14	0.21	0.15	0.13	0.12	0.17	0.15	0.17	0.18	0.15	0.13	0.20	0.20	0.14	0.30	0.19	0.15	0.21	0.20	0.21	0.19
C3'	0.17	0.17	0.26	0.20	0.15	0.14	0.17	0.15	0.17	0.18	0.17	0.17	0.20	0.20	0.16	0.35	0.24	0.17	0.21	0.19	0.19	0.18
C4	0.13	0.13	0.21	0.14	0.10	0.11	0.12	0.16	0.12	0.15	0.11	0.13	0.15	0.17	0.11	0.32	0.18	0.13	0.21	0.19	0.19	0.18
C4'	0.15	0.13	0.25	0.19	0.11	0.13	0.13	0.13	0.14	0.15	0.13	0.13	0.17	0.16	0.11	0.36	0.24	0.14	0.19	0.18	0.16	0.15
C5	0.13	0.13	0.21	0.15	0.10	0.11	0.12	0.16	0.12	0.15	0.12	0.13	0.14	0.16	0.11	0.33	0.19	0.13	0.20	0.19	0.19	0.18
C5'	0.24	0.18	0.36	0.30	0.16	0.23	0.14	0.19	0.13	0.17	0.14	0.20	0.13	0.16	0.18	0.46	0.36	0.20	0.22	0.23	0.16	0.18
C6	0.15	0.16	0.23	0.15	0.13	0.11	0.13	0.15	0.13	0.15	0.14	0.16	0.15	0.16	0.12	0.35	0.19	0.13	0.20	0.18	0.18	0.17
C8	0.12	0.12	0.20	0.15	0.09	0.12	0.12	0.16	0.11	0.15	0.10	0.11	0.13	0.16	0.10	0.31	0.20	0.14	0.21	0.21	0.19	0.19
N1	0.17	0.18	0.24	0.16	0.14	0.12	0.14	0.17	0.14	0.15	0.16	0.19	0.16	0.17	0.13	0.35	0.20	0.13	0.21	0.19	0.19	0.18
N3	0.14	0.15	0.22	0.15	0.12	0.12	0.14	0.16	0.14	0.16	0.13	0.15	0.17	0.18	0.12	0.32	0.19	0.13	0.21	0.19	0.20	0.19
N6	0.17	0.18	0.24	0.17	0.15	0.11	0.15	0.16	0.15	0.17	0.16	0.18	0.16	0.17	0.15	0.36	0.20	0.15	0.19	0.19	0.18	0.18
N7	0.13	0.13	0.21	0.16	0.11	0.13	0.12	0.16	0.12	0.16	0.12	0.13	0.14	0.16	0.12	0.32	0.20	0.15	0.21	0.21	0.19	0.19
N9	0.12	0.11	0.20	0.14	0.09	0.11	0.12	0.16	0.12	0.15	0.11	0.11	0.15	0.17	0.10	0.31	0.18	0.13	0.21	0.20	0.19	0.18
O2'	0.14	0.17	0.18	0.13	0.15	0.12	0.20	0.18	0.21	0.21	0.18	0.15	0.25	0.24	0.15	0.27	0.17	0.17	0.23	0.22	0.24	0.22
O3'	0.19	0.21	0.28	0.21	0.19	0.16	0.21	0.16	0.21	0.21	0.21	0.20	0.24	0.22	0.19	0.35	0.26	0.19	0.23	0.21	0.21	0.20
O4'	0.12	0.12	0.20	0.15	0.09	0.12	0.12	0.16	0.13	0.15	0.11	0.11	0.16	0.16	0.10	0.31	0.19	0.13	0.20	0.20	0.19	0.18
O5'	0.36	0.40	0.37	0.41	0.37	0.41	0.35	0.43	0.36	0.34	0.38	0.40	0.35	0.34	0.35	0.40	0.45	0.37	0.35	0.35	0.34	0.34
OP1	0.47	0.39	0.55	0.60	0.41	0.60	0.38	0.63	0.36	0.43	0.37	0.41	0.34	0.40	0.44	0.59	0.66	0.51	0.56	0.62	0.54	0.56
OP2	0.95	0.93	1.01	1.05	0.91	1.01	0.86	0.98	0.85	0.85	0.88	0.95	0.82	0.83	0.91	1.05	1.15	0.92	0.89	0.86	0.86	0.85
P	0.54	0.53	0.56	0.62	0.52	0.62	0.50	0.64	0.50	0.51	0.51	0.54	0.49	0.50	0.53	0.58	0.68	0.55	0.56	0.56	0.56	0.56

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.04	0.04	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.06	0.08	0.11	0.08
C2	0.04	0.00	0.07	0.09	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.08	0.12	0.04	0.10	0.11	0.16	0.12
C2'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.04	0.01	0.03	0.02	0.04	0.03	0.06	0.07	0.04	0.03	0.02	0.00	0.03	0.01	0.06	0.11	0.13	0.07
C3'	0.02	0.09	0.01	0.00	0.07	0.00	0.06	0.02	0.07	0.05	0.09	0.09	0.07	0.06	0.04	0.02	0.01	0.01	0.08	0.14	0.12	0.09
C4	0.02	0.01	0.04	0.07	0.00	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.08	0.02	0.10	0.11	0.15	0.12
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.04	0.05	0.05	0.05	0.05	0.05	0.03	0.03	0.02	0.01	0.02	0.07	0.06	0.03
C5	0.02	0.01	0.03	0.06	0.01	0.04	0.00	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.08	0.02	0.11	0.12	0.17	0.14
C5'	0.03	0.06	0.02	0.02	0.06	0.01	0.07	0.00	0.07	0.07	0.07	0.07	0.08	0.08	0.05	0.03	0.03	0.02	0.01	0.07	0.03	0.02
C6	0.02	0.01	0.04	0.07	0.01	0.04	0.00	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.10	0.02	0.11	0.13	0.17	0.14
C8	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.06	0.03	0.11	0.12	0.16	0.13
N1	0.04	0.00	0.06	0.09	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.12	0.03	0.11	0.12	0.17	0.13
N3	0.04	0.00	0.07	0.09	0.00	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.07	0.12	0.04	0.10	0.11	0.15	0.12
N6	0.02	0.01	0.04	0.07	0.01	0.05	0.01	0.08	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.05	0.10	0.03	0.11	0.14	0.19	0.15
N7	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.05	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.03	0.07	0.03	0.11	0.13	0.17	0.15
N9	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.05	0.02	0.09	0.10	0.14	0.11
O2'	0.02	0.08	0.00	0.02	0.04	0.03	0.04	0.03	0.05	0.03	0.07	0.07	0.05	0.03	0.02	0.00	0.06	0.04	0.04	0.12	0.11	0.06
O3'	0.03	0.12	0.03	0.01	0.08	0.02	0.08	0.03	0.10	0.06	0.12	0.12	0.10	0.07	0.05	0.06	0.00	0.02	0.11	0.21	0.15	0.14
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.04	0.03	0.03	0.02	0.04	0.02	0.00	0.07	0.07	0.10	0.08
O5'	0.06	0.10	0.06	0.08	0.10	0.02	0.11	0.01	0.11	0.11	0.11	0.10	0.11	0.11	0.09	0.04	0.11	0.07	0.00	0.01	0.03	0.01
OP1	0.08	0.11	0.11	0.14	0.11	0.07	0.12	0.07	0.13	0.12	0.12	0.11	0.14	0.13	0.10	0.12	0.21	0.07	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.11	0.16	0.13	0.12	0.15	0.06	0.17	0.03	0.17	0.16	0.17	0.15	0.19	0.17	0.14	0.11	0.15	0.10	0.03	0.02	0.00	0.00
P	0.08	0.12	0.07	0.09	0.12	0.03	0.14	0.02	0.14	0.13	0.13	0.12	0.15	0.15	0.11	0.06	0.14	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00