Doublet Group distance statistics: 48286

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 5, 4, 2, 0, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.009, 0.018, 0.026, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.018 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.009, 0.017, 0.026, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.017 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.013, 0.022, 0.030, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.022 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.013, 0.025, 0.036, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.025 std_dev=0.011
N9	A	0, 0.020, 0.033, 0.046, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.033 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.022, 0.035, 0.049, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.035 std_dev=0.014
C2	A	0, 0.017, 0.033, 0.049, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.033 std_dev=0.016
C8	A	0, 0.018, 0.036, 0.055, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.036 std_dev=0.018
C1'	A	0, 0.022, 0.041, 0.059, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.041 std_dev=0.019
N7	A	0, 0.022, 0.043, 0.063, 0.101 max_d=0.101 avg_d=0.043 std_dev=0.021
N6	A	0, 0.040, 0.067, 0.095, 0.109 max_d=0.109 avg_d=0.067 std_dev=0.027
O2'	B	0, 0.147, 0.308, 0.469, 0.655 max_d=0.655 avg_d=0.308 std_dev=0.161
O4'	A	0, 0.061, 0.242, 0.423, 0.727 max_d=0.727 avg_d=0.242 std_dev=0.181
C2'	A	0, 0.075, 0.273, 0.470, 0.739 max_d=0.739 avg_d=0.273 std_dev=0.198
O2'	A	0, 0.064, 0.323, 0.582, 1.087 max_d=1.087 avg_d=0.323 std_dev=0.259
C4'	A	0, 0.100, 0.378, 0.656, 1.184 max_d=1.184 avg_d=0.378 std_dev=0.278
C2'	B	0, 0.172, 0.451, 0.730, 1.171 max_d=1.171 avg_d=0.451 std_dev=0.279
C3'	A	0, 0.123, 0.443, 0.764, 1.230 max_d=1.230 avg_d=0.443 std_dev=0.320
O3'	A	0, 0.196, 0.667, 1.139, 1.789 max_d=1.789 avg_d=0.667 std_dev=0.472
C5'	A	0, 0.163, 0.643, 1.124, 1.927 max_d=1.927 avg_d=0.643 std_dev=0.480
N3	B	0, 0.292, 0.788, 1.285, 2.050 max_d=2.050 avg_d=0.788 std_dev=0.497
C1'	B	0, 0.159, 0.658, 1.157, 1.957 max_d=1.957 avg_d=0.658 std_dev=0.499
C2	B	0, 0.334, 0.894, 1.454, 2.209 max_d=2.209 avg_d=0.894 std_dev=0.560
C3'	B	0, 0.320, 0.891, 1.461, 2.210 max_d=2.210 avg_d=0.891 std_dev=0.570
O3'	B	0, 0.393, 1.004, 1.615, 2.295 max_d=2.295 avg_d=1.004 std_dev=0.611
N9	B	0, 0.126, 0.770, 1.415, 2.495 max_d=2.495 avg_d=0.770 std_dev=0.645
C4	B	0, 0.178, 0.823, 1.468, 2.516 max_d=2.516 avg_d=0.823 std_dev=0.645
C4'	B	0, 0.364, 1.084, 1.804, 2.605 max_d=2.605 avg_d=1.084 std_dev=0.720
O4'	B	0, 0.298, 1.033, 1.767, 2.768 max_d=2.768 avg_d=1.033 std_dev=0.735
N1	B	0, 0.289, 1.025, 1.761, 2.750 max_d=2.750 avg_d=1.025 std_dev=0.736
O5'	A	0, 0.188, 0.980, 1.771, 3.123 max_d=3.123 avg_d=0.980 std_dev=0.792
C8	B	0, 0.189, 0.984, 1.780, 3.123 max_d=3.123 avg_d=0.984 std_dev=0.796
C5	B	0, 0.215, 1.014, 1.812, 3.092 max_d=3.092 avg_d=1.014 std_dev=0.799
O5'	B	0, 0.559, 1.379, 2.199, 3.503 max_d=3.503 avg_d=1.379 std_dev=0.820
C6	B	0, 0.269, 1.108, 1.947, 3.199 max_d=3.199 avg_d=1.108 std_dev=0.839
N7	B	0, 0.253, 1.137, 2.021, 3.480 max_d=3.480 avg_d=1.137 std_dev=0.884
N6	B	0, 0.344, 1.325, 2.307, 3.735 max_d=3.735 avg_d=1.325 std_dev=0.981
P	B	0, 0.270, 1.261, 2.252, 3.948 max_d=3.948 avg_d=1.261 std_dev=0.991
C5'	B	0, 0.512, 1.595, 2.678, 3.858 max_d=3.858 avg_d=1.595 std_dev=1.083
OP2	B	0, 0.390, 1.481, 2.572, 4.348 max_d=4.348 avg_d=1.481 std_dev=1.091
OP1	B	0, 0.117, 1.224, 2.332, 4.091 max_d=4.091 avg_d=1.224 std_dev=1.108
P	A	0, -0.242, 1.015, 2.272, 4.872 max_d=4.872 avg_d=1.015 std_dev=1.257
OP2	A	0, -0.033, 1.535, 3.103, 6.214 max_d=6.214 avg_d=1.535 std_dev=1.568
OP1	A	0, -0.016, 1.761, 3.537, 7.179 max_d=7.179 avg_d=1.761 std_dev=1.777

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.04	0.03	0.03	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.24	0.30	0.44	0.13
C2	0.04	0.00	0.20	0.25	0.02	0.12	0.01	0.17	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.17	0.30	0.05	0.48	0.40	0.80	0.40
C2'	0.00	0.20	0.00	0.00	0.10	0.02	0.07	0.02	0.10	0.10	0.15	0.20	0.08	0.08	0.03	0.00	0.02	0.01	0.16	0.30	0.30	0.07
C3'	0.02	0.25	0.00	0.00	0.15	0.00	0.15	0.02	0.17	0.19	0.22	0.23	0.18	0.18	0.10	0.01	0.01	0.01	0.20	0.29	0.27	0.15
C4	0.02	0.02	0.10	0.15	0.00	0.08	0.01	0.12	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.16	0.03	0.48	0.34	0.79	0.38
C4'	0.01	0.12	0.02	0.00	0.08	0.00	0.09	0.01	0.10	0.11	0.11	0.11	0.11	0.11	0.05	0.07	0.02	0.00	0.02	0.32	0.20	0.13
C5	0.03	0.01	0.07	0.15	0.01	0.09	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.08	0.18	0.03	0.59	0.53	1.00	0.55
C5'	0.02	0.17	0.02	0.02	0.12	0.01	0.16	0.00	0.17	0.18	0.17	0.14	0.19	0.19	0.10	0.07	0.03	0.02	0.01	0.24	0.12	0.02
C6	0.03	0.01	0.10	0.17	0.01	0.10	0.01	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.10	0.21	0.04	0.61	0.61	1.06	0.60
C8	0.02	0.01	0.10	0.19	0.01	0.11	0.01	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.06	0.21	0.05	0.60	0.43	0.96	0.52
N1	0.04	0.00	0.15	0.22	0.02	0.11	0.01	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.15	0.26	0.05	0.56	0.52	0.95	0.52
N3	0.03	0.00	0.20	0.23	0.01	0.11	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.17	0.26	0.04	0.42	0.33	0.69	0.32
N6	0.03	0.01	0.08	0.18	0.01	0.11	0.02	0.19	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.09	0.22	0.04	0.66	0.76	1.20	0.71
N7	0.03	0.02	0.08	0.18	0.01	0.11	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.07	0.21	0.05	0.66	0.63	1.12	0.65
N9	0.01	0.02	0.03	0.10	0.01	0.05	0.02	0.10	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.00	0.04	0.09	0.02	0.44	0.25	0.71	0.31
O2'	0.02	0.17	0.00	0.01	0.09	0.07	0.08	0.07	0.10	0.06	0.15	0.17	0.09	0.07	0.04	0.00	0.06	0.07	0.05	0.56	0.23	0.23
O3'	0.02	0.30	0.02	0.01	0.16	0.02	0.18	0.03	0.21	0.21	0.26	0.26	0.22	0.21	0.09	0.06	0.00	0.02	0.17	0.45	0.21	0.21
O4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.02	0.04	0.05	0.05	0.04	0.04	0.05	0.02	0.07	0.02	0.00	0.20	0.37	0.41	0.19
O5'	0.24	0.48	0.16	0.20	0.48	0.02	0.59	0.01	0.61	0.60	0.56	0.42	0.66	0.66	0.44	0.05	0.17	0.20	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.30	0.40	0.30	0.29	0.34	0.32	0.53	0.24	0.61	0.43	0.52	0.33	0.76	0.63	0.25	0.56	0.45	0.37	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.44	0.80	0.30	0.27	0.79	0.20	1.00	0.12	1.06	0.96	0.95	0.69	1.20	1.12	0.71	0.23	0.21	0.41	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.13	0.40	0.07	0.15	0.38	0.13	0.55	0.02	0.60	0.52	0.52	0.32	0.71	0.65	0.31	0.23	0.21	0.19	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.24	0.25	0.14	0.18	0.21	0.15	0.22	0.13	0.28	0.20	0.30	0.22	0.33	0.21	0.21	0.17	0.25	0.25	0.36	0.21	0.29	0.15
C2	0.27	0.30	0.14	0.15	0.21	0.18	0.21	0.15	0.25	0.22	0.31	0.24	0.27	0.19	0.22	0.20	0.24	0.29	0.29	0.26	0.28	0.16
C2'	0.26	0.23	0.15	0.18	0.22	0.18	0.22	0.16	0.25	0.23	0.26	0.22	0.28	0.21	0.23	0.15	0.24	0.29	0.34	0.23	0.25	0.16
C3'	0.26	0.24	0.22	0.25	0.25	0.21	0.25	0.20	0.27	0.27	0.28	0.24	0.31	0.26	0.26	0.19	0.30	0.29	0.39	0.27	0.28	0.22
C4	0.24	0.28	0.14	0.16	0.21	0.15	0.21	0.13	0.26	0.20	0.31	0.23	0.30	0.19	0.21	0.18	0.23	0.25	0.34	0.23	0.29	0.15
C4'	0.24	0.22	0.18	0.21	0.22	0.18	0.23	0.17	0.26	0.23	0.26	0.23	0.31	0.23	0.23	0.17	0.26	0.26	0.39	0.23	0.28	0.18
C5	0.23	0.28	0.14	0.16	0.20	0.14	0.20	0.12	0.25	0.19	0.30	0.22	0.28	0.18	0.20	0.18	0.21	0.23	0.34	0.22	0.28	0.15
C5'	0.27	0.26	0.24	0.26	0.27	0.23	0.28	0.23	0.30	0.30	0.28	0.27	0.34	0.30	0.28	0.22	0.30	0.29	0.44	0.27	0.30	0.24
C6	0.24	0.29	0.14	0.14	0.20	0.16	0.20	0.13	0.24	0.20	0.29	0.23	0.25	0.18	0.21	0.19	0.19	0.25	0.32	0.24	0.27	0.15
C8	0.20	0.23	0.14	0.18	0.18	0.13	0.21	0.13	0.27	0.17	0.29	0.19	0.32	0.19	0.18	0.17	0.24	0.20	0.37	0.21	0.30	0.15
N1	0.26	0.30	0.14	0.14	0.20	0.18	0.20	0.15	0.24	0.21	0.29	0.24	0.25	0.19	0.22	0.20	0.22	0.28	0.29	0.26	0.28	0.16
N3	0.27	0.29	0.14	0.15	0.21	0.17	0.21	0.14	0.26	0.21	0.31	0.24	0.29	0.19	0.22	0.20	0.24	0.28	0.31	0.25	0.28	0.15
N6	0.23	0.28	0.14	0.13	0.19	0.16	0.19	0.14	0.22	0.19	0.27	0.23	0.22	0.18	0.19	0.18	0.16	0.23	0.32	0.25	0.27	0.15
N7	0.19	0.25	0.14	0.18	0.18	0.13	0.20	0.12	0.26	0.17	0.30	0.19	0.30	0.19	0.17	0.17	0.22	0.19	0.37	0.21	0.29	0.15
N9	0.23	0.26	0.14	0.17	0.20	0.14	0.22	0.13	0.27	0.19	0.31	0.22	0.32	0.20	0.20	0.17	0.24	0.24	0.35	0.21	0.29	0.15
O2'	0.29	0.24	0.15	0.17	0.22	0.20	0.22	0.18	0.25	0.23	0.28	0.23	0.30	0.21	0.25	0.19	0.23	0.32	0.35	0.24	0.25	0.17
O3'	0.30	0.29	0.27	0.29	0.30	0.26	0.32	0.25	0.34	0.34	0.33	0.28	0.38	0.34	0.32	0.23	0.32	0.33	0.41	0.31	0.33	0.28
O4'	0.22	0.24	0.14	0.17	0.21	0.14	0.24	0.14	0.29	0.20	0.30	0.22	0.36	0.23	0.21	0.17	0.24	0.23	0.37	0.20	0.29	0.14
O5'	0.84	0.83	0.76	0.74	0.85	0.78	0.85	0.78	0.83	0.87	0.83	0.84	0.82	0.86	0.86	0.74	0.69	0.86	0.94	0.81	0.74	0.81
OP1	1.11	1.08	0.97	0.94	1.18	1.01	1.26	1.03	1.25	1.28	1.17	1.07	1.30	1.31	1.19	0.91	0.85	1.13	1.12	1.07	1.15	1.13
OP2	1.52	1.52	1.40	1.38	1.57	1.46	1.60	1.47	1.60	1.62	1.57	1.51	1.59	1.62	1.58	1.34	1.30	1.55	1.63	1.51	1.46	1.53
P	1.01	1.01	0.87	0.84	1.06	0.92	1.10	0.93	1.10	1.11	1.06	1.01	1.11	1.12	1.06	0.83	0.75	1.03	1.10	0.96	0.94	1.00

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.04	0.04	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.12	0.06	0.43	0.12
C2	0.04	0.00	0.21	0.27	0.01	0.14	0.01	0.16	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.16	0.33	0.06	0.33	0.17	0.34	0.17
C2'	0.01	0.21	0.00	0.01	0.11	0.01	0.06	0.01	0.10	0.10	0.16	0.22	0.08	0.07	0.02	0.01	0.02	0.01	0.25	0.18	0.32	0.07
C3'	0.01	0.27	0.01	0.00	0.14	0.01	0.09	0.02	0.14	0.14	0.22	0.25	0.11	0.10	0.04	0.02	0.01	0.01	0.35	0.28	0.26	0.15
C4	0.02	0.01	0.11	0.14	0.00	0.07	0.00	0.09	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.16	0.04	0.34	0.16	0.35	0.15
C4'	0.01	0.14	0.01	0.01	0.07	0.00	0.06	0.01	0.08	0.08	0.12	0.12	0.08	0.06	0.03	0.04	0.03	0.00	0.02	0.08	0.41	0.07
C5	0.02	0.01	0.06	0.09	0.00	0.06	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.05	0.11	0.04	0.45	0.21	0.29	0.20
C5'	0.02	0.16	0.01	0.02	0.09	0.01	0.09	0.00	0.11	0.10	0.15	0.14	0.12	0.10	0.05	0.04	0.05	0.02	0.01	0.10	0.37	0.02
C6	0.03	0.01	0.10	0.14	0.01	0.08	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.08	0.17	0.05	0.46	0.23	0.28	0.22
C8	0.02	0.01	0.10	0.14	0.00	0.08	0.01	0.10	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.07	0.14	0.04	0.43	0.20	0.33	0.17
N1	0.04	0.00	0.16	0.22	0.02	0.12	0.01	0.15	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.13	0.28	0.06	0.41	0.21	0.31	0.20
N3	0.04	0.01	0.22	0.25	0.01	0.12	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.16	0.30	0.06	0.28	0.14	0.37	0.15
N6	0.03	0.01	0.08	0.11	0.01	0.08	0.02	0.12	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.03	0.07	0.15	0.06	0.52	0.27	0.26	0.27
N7	0.02	0.01	0.07	0.10	0.01	0.06	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.06	0.11	0.04	0.50	0.24	0.26	0.23
N9	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.05	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.04	0.02	0.30	0.13	0.38	0.13
O2'	0.02	0.16	0.01	0.02	0.07	0.04	0.05	0.04	0.08	0.07	0.13	0.16	0.07	0.06	0.02	0.00	0.04	0.04	0.08	0.13	0.37	0.07
O3'	0.02	0.33	0.02	0.01	0.16	0.03	0.11	0.05	0.17	0.14	0.28	0.30	0.15	0.11	0.04	0.04	0.00	0.02	0.31	0.37	0.23	0.20
O4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.02	0.05	0.04	0.06	0.06	0.06	0.04	0.02	0.04	0.02	0.00	0.12	0.10	0.52	0.21
O5'	0.12	0.33	0.25	0.35	0.34	0.02	0.45	0.01	0.46	0.43	0.41	0.28	0.52	0.50	0.30	0.08	0.31	0.12	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.06	0.17	0.18	0.28	0.16	0.08	0.21	0.10	0.23	0.20	0.21	0.14	0.27	0.24	0.13	0.13	0.37	0.10	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.43	0.34	0.32	0.26	0.35	0.41	0.29	0.37	0.28	0.33	0.31	0.37	0.26	0.26	0.38	0.37	0.23	0.52	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.17	0.07	0.15	0.15	0.07	0.20	0.02	0.22	0.17	0.20	0.15	0.27	0.23	0.13	0.07	0.20	0.21	0.01	0.00	0.01	0.00