Doublet Group distance statistics: 48288

back

Distances from reference structure (by RMSD)

3, 2, 2, 1, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N1	A	0, 0.006, 0.012, 0.019, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.012 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.005, 0.011, 0.018, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.011 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.008, 0.016, 0.025, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.016 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.010, 0.019, 0.028, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.019 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.006, 0.015, 0.024, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.015 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.011, 0.020, 0.029, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.020 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.007, 0.018, 0.029, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.018 std_dev=0.011
N9	A	0, 0.011, 0.022, 0.033, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.022 std_dev=0.011
N7	A	0, 0.017, 0.036, 0.055, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.036 std_dev=0.019
N6	A	0, 0.024, 0.043, 0.063, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.043 std_dev=0.020
C8	A	0, 0.016, 0.037, 0.057, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.037 std_dev=0.020
O3'	A	0, 0.010, 0.210, 0.410, 0.681 max_d=0.681 avg_d=0.210 std_dev=0.200
O2'	B	0, 0.054, 0.336, 0.618, 0.952 max_d=0.952 avg_d=0.336 std_dev=0.282
N9	B	0, 0.083, 0.430, 0.777, 1.041 max_d=1.041 avg_d=0.430 std_dev=0.347
C5	B	0, 0.038, 0.407, 0.776, 1.109 max_d=1.109 avg_d=0.407 std_dev=0.369
C1'	B	0, 0.063, 0.453, 0.844, 1.253 max_d=1.253 avg_d=0.453 std_dev=0.391
C2'	B	0, 0.018, 0.419, 0.820, 1.298 max_d=1.298 avg_d=0.419 std_dev=0.401
C3'	A	0, -0.164, 0.303, 0.769, 1.429 max_d=1.429 avg_d=0.303 std_dev=0.466
O4'	B	0, 0.062, 0.534, 1.005, 1.499 max_d=1.499 avg_d=0.534 std_dev=0.472
C2'	A	0, -0.218, 0.313, 0.843, 1.593 max_d=1.593 avg_d=0.313 std_dev=0.530
C4	B	0, -0.046, 0.488, 1.023, 1.654 max_d=1.654 avg_d=0.488 std_dev=0.535
O4'	A	0, -0.246, 0.297, 0.840, 1.611 max_d=1.611 avg_d=0.297 std_dev=0.543
C3'	B	0, -0.025, 0.582, 1.189, 1.954 max_d=1.954 avg_d=0.582 std_dev=0.607
C4'	A	0, -0.268, 0.374, 1.017, 1.931 max_d=1.931 avg_d=0.374 std_dev=0.642
N7	B	0, 0.002, 0.657, 1.313, 2.089 max_d=2.089 avg_d=0.657 std_dev=0.656
O3'	B	0, -0.043, 0.627, 1.297, 2.177 max_d=2.177 avg_d=0.627 std_dev=0.670
C4'	B	0, -0.012, 0.664, 1.340, 2.153 max_d=2.153 avg_d=0.664 std_dev=0.676
N6	B	0, -0.181, 0.633, 1.447, 2.460 max_d=2.460 avg_d=0.633 std_dev=0.814
C5'	B	0, -0.077, 0.793, 1.663, 2.749 max_d=2.749 avg_d=0.793 std_dev=0.870
O5'	B	0, -0.080, 0.810, 1.701, 2.871 max_d=2.871 avg_d=0.810 std_dev=0.891
O2'	A	0, -0.387, 0.517, 1.422, 2.701 max_d=2.701 avg_d=0.517 std_dev=0.904
C8	B	0, -0.131, 0.777, 1.685, 2.907 max_d=2.907 avg_d=0.777 std_dev=0.908
C6	B	0, -0.292, 0.660, 1.613, 2.884 max_d=2.884 avg_d=0.660 std_dev=0.953
C5'	A	0, -0.521, 0.676, 1.873, 3.583 max_d=3.583 avg_d=0.676 std_dev=1.197
N3	B	0, -0.442, 0.882, 2.205, 4.074 max_d=4.074 avg_d=0.882 std_dev=1.324
O5'	A	0, -0.575, 0.772, 2.118, 4.050 max_d=4.050 avg_d=0.772 std_dev=1.346
P	B	0, -0.311, 1.093, 2.498, 4.414 max_d=4.414 avg_d=1.093 std_dev=1.404
OP1	A	0, -0.515, 0.966, 2.447, 4.551 max_d=4.551 avg_d=0.966 std_dev=1.481
OP2	B	0, -0.380, 1.132, 2.645, 4.752 max_d=4.752 avg_d=1.132 std_dev=1.513
P	A	0, -0.641, 0.982, 2.604, 4.931 max_d=4.931 avg_d=0.982 std_dev=1.623
N1	B	0, -0.732, 1.057, 2.846, 5.391 max_d=5.391 avg_d=1.057 std_dev=1.789
OP2	A	0, -0.689, 1.149, 2.986, 5.618 max_d=5.618 avg_d=1.149 std_dev=1.837
C2	B	0, -0.754, 1.161, 3.076, 5.814 max_d=5.814 avg_d=1.161 std_dev=1.915
OP1	B	0, -0.641, 1.517, 3.676, 6.713 max_d=6.713 avg_d=1.517 std_dev=2.158

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.00	0.06	0.28	0.15	0.10
C2	0.02	0.00	0.20	0.05	0.00	0.29	0.00	0.45	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.53	0.11	0.37	0.35	0.39	0.28	0.27
C2'	0.00	0.20	0.00	0.00	0.11	0.01	0.06	0.04	0.10	0.11	0.16	0.19	0.08	0.06	0.02	0.00	0.02	0.00	0.07	0.50	0.22	0.23
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.04	0.04	0.03	0.03	0.02	0.02	0.01	0.01	0.05	0.52	0.17	0.24
C4	0.01	0.00	0.11	0.03	0.00	0.14	0.00	0.22	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.26	0.05	0.19	0.20	0.27	0.22	0.16
C4'	0.01	0.29	0.01	0.00	0.14	0.00	0.07	0.01	0.13	0.14	0.23	0.28	0.09	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.21	0.06	0.08
C5	0.01	0.00	0.06	0.02	0.00	0.07	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.13	0.03	0.08	0.16	0.20	0.23	0.16
C5'	0.02	0.45	0.04	0.01	0.22	0.01	0.14	0.00	0.23	0.19	0.37	0.40	0.18	0.10	0.04	0.04	0.02	0.01	0.01	0.06	0.01	0.01
C6	0.01	0.00	0.10	0.03	0.01	0.13	0.01	0.23	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.25	0.06	0.16	0.21	0.22	0.25	0.16
C8	0.01	0.01	0.11	0.03	0.00	0.14	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.25	0.06	0.19	0.18	0.19	0.23	0.27
N1	0.02	0.00	0.16	0.04	0.01	0.23	0.01	0.37	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.42	0.09	0.28	0.31	0.31	0.27	0.21
N3	0.02	0.00	0.19	0.04	0.00	0.28	0.00	0.40	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.50	0.10	0.37	0.32	0.39	0.26	0.25
N6	0.01	0.01	0.08	0.03	0.01	0.09	0.01	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.18	0.04	0.10	0.18	0.18	0.26	0.17
N7	0.01	0.01	0.06	0.03	0.00	0.08	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.14	0.05	0.10	0.13	0.20	0.25	0.26
N9	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.03	0.01	0.10	0.21	0.18	0.13
O2'	0.02	0.53	0.00	0.02	0.26	0.01	0.13	0.04	0.25	0.25	0.42	0.50	0.18	0.14	0.03	0.00	0.04	0.01	0.08	0.64	0.31	0.31
O3'	0.03	0.11	0.02	0.01	0.05	0.01	0.03	0.02	0.06	0.06	0.09	0.10	0.04	0.05	0.03	0.04	0.00	0.03	0.05	0.56	0.18	0.25
O4'	0.00	0.37	0.00	0.01	0.19	0.00	0.08	0.01	0.16	0.19	0.28	0.37	0.10	0.10	0.01	0.01	0.03	0.00	0.05	0.12	0.09	0.07
O5'	0.06	0.35	0.07	0.05	0.20	0.01	0.16	0.01	0.21	0.18	0.31	0.32	0.18	0.13	0.10	0.08	0.05	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.28	0.39	0.50	0.52	0.27	0.21	0.20	0.06	0.22	0.19	0.31	0.39	0.18	0.20	0.21	0.64	0.56	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.15	0.28	0.22	0.17	0.22	0.06	0.23	0.01	0.25	0.23	0.27	0.26	0.26	0.25	0.18	0.31	0.18	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.10	0.27	0.23	0.24	0.16	0.08	0.16	0.01	0.16	0.27	0.21	0.25	0.17	0.26	0.13	0.31	0.25	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.27	0.73	0.28	0.33	0.10	0.39	0.06	0.61	0.41	0.59	0.78	0.43	0.41	0.52	0.26	0.19	0.23	0.32	0.80	1.96	0.81	1.18
C2	0.25	1.07	0.29	0.32	0.34	0.32	0.22	0.45	0.60	0.61	1.00	0.78	0.49	0.40	0.21	0.24	0.27	0.25	0.57	1.37	0.25	0.73
C2'	0.23	0.70	0.34	0.39	0.15	0.38	0.14	0.61	0.52	0.43	0.80	0.41	0.61	0.31	0.19	0.28	0.28	0.25	0.83	2.06	0.83	1.22
C3'	0.16	0.94	0.23	0.28	0.28	0.29	0.23	0.50	0.64	0.43	1.01	0.61	0.67	0.33	0.14	0.18	0.19	0.18	0.69	1.96	0.74	1.11
C4	0.22	0.63	0.24	0.27	0.11	0.30	0.06	0.48	0.38	0.51	0.66	0.39	0.36	0.42	0.22	0.17	0.18	0.25	0.66	1.62	0.57	0.94
C4'	0.13	1.12	0.13	0.13	0.42	0.13	0.31	0.24	0.71	0.36	1.16	0.79	0.66	0.31	0.14	0.17	0.14	0.13	0.40	1.60	0.50	0.78
C5	0.16	0.19	0.17	0.17	0.11	0.21	0.13	0.37	0.17	0.26	0.22	0.12	0.19	0.24	0.18	0.10	0.09	0.18	0.56	1.37	0.51	0.80
C5'	0.39	1.20	0.37	0.36	0.66	0.38	0.56	0.28	0.89	0.21	1.25	0.94	0.87	0.24	0.39	0.35	0.40	0.43	0.19	1.20	0.25	0.41
C6	0.13	0.17	0.12	0.12	0.10	0.14	0.10	0.27	0.15	0.18	0.18	0.12	0.17	0.14	0.13	0.09	0.08	0.13	0.43	1.08	0.33	0.60
C8	0.18	0.16	0.18	0.19	0.17	0.25	0.20	0.44	0.19	0.27	0.18	0.14	0.22	0.28	0.20	0.09	0.08	0.22	0.66	1.63	0.75	0.98
N1	0.18	0.63	0.20	0.20	0.22	0.20	0.15	0.31	0.37	0.38	0.58	0.48	0.31	0.22	0.14	0.18	0.18	0.17	0.42	1.04	0.21	0.54
N3	0.26	1.08	0.30	0.34	0.29	0.36	0.18	0.53	0.63	0.66	1.07	0.73	0.54	0.49	0.24	0.23	0.27	0.28	0.68	1.67	0.45	0.93
N6	0.09	0.46	0.07	0.07	0.25	0.08	0.19	0.16	0.26	0.22	0.40	0.41	0.21	0.20	0.13	0.06	0.12	0.10	0.31	0.80	0.28	0.44
N7	0.15	0.33	0.14	0.13	0.25	0.19	0.26	0.36	0.31	0.15	0.34	0.29	0.29	0.19	0.18	0.06	0.05	0.18	0.57	1.41	0.64	0.84
N9	0.23	0.48	0.24	0.27	0.06	0.32	0.08	0.52	0.28	0.47	0.53	0.27	0.30	0.42	0.23	0.15	0.17	0.26	0.72	1.77	0.73	1.05
O2'	0.48	0.54	0.64	0.71	0.06	0.70	0.06	0.97	0.38	0.63	0.65	0.23	0.52	0.44	0.40	0.54	0.57	0.53	1.19	2.45	1.12	1.59
O3'	0.33	0.97	0.39	0.48	0.18	0.53	0.12	0.78	0.56	0.68	1.03	0.59	0.57	0.54	0.30	0.28	0.37	0.40	0.95	2.26	0.95	1.38
O4'	0.09	1.01	0.11	0.11	0.32	0.13	0.18	0.27	0.57	0.44	1.04	0.70	0.48	0.42	0.11	0.17	0.12	0.10	0.43	1.57	0.52	0.80
O5'	0.45	0.99	0.37	0.38	0.66	0.44	0.64	0.32	0.89	0.33	1.06	0.82	0.96	0.39	0.47	0.34	0.43	0.51	0.17	1.17	0.24	0.38
OP1	0.33	0.68	0.30	0.30	0.45	0.33	0.43	0.23	0.58	0.26	0.72	0.57	0.60	0.28	0.34	0.30	0.35	0.38	0.17	1.22	0.32	0.45
OP2	0.55	0.61	0.41	0.43	0.62	0.55	0.69	0.42	0.75	0.63	0.69	0.59	0.88	0.70	0.59	0.35	0.49	0.65	0.19	1.06	0.20	0.31
P	0.37	0.64	0.29	0.31	0.48	0.38	0.49	0.29	0.63	0.34	0.70	0.55	0.70	0.38	0.39	0.26	0.35	0.45	0.14	1.15	0.26	0.38

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.07	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03	0.00	0.00	0.01	0.05	0.00	0.21	0.34	0.33	0.27
C2	0.03	0.00	0.38	0.37	0.00	0.37	0.01	0.70	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.16	0.06	0.19	0.88	0.57	1.05	0.93
C2'	0.00	0.38	0.00	0.00	0.19	0.01	0.07	0.07	0.15	0.21	0.29	0.38	0.10	0.12	0.02	0.00	0.02	0.02	0.14	0.26	0.09	0.16
C3'	0.01	0.37	0.00	0.00	0.16	0.00	0.06	0.03	0.14	0.20	0.28	0.36	0.08	0.13	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.26	0.09	0.09
C4	0.02	0.00	0.19	0.16	0.00	0.15	0.00	0.22	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.08	0.05	0.09	0.20	0.33	0.14	0.13
C4'	0.01	0.37	0.01	0.00	0.15	0.00	0.04	0.01	0.11	0.23	0.26	0.36	0.05	0.16	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.22	0.21	0.03
C5	0.01	0.01	0.07	0.06	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.05	0.02	0.22	0.81	0.45	0.42
C5'	0.07	0.70	0.07	0.03	0.22	0.01	0.09	0.00	0.18	0.54	0.49	0.65	0.10	0.42	0.14	0.07	0.02	0.03	0.01	0.25	0.25	0.01
C6	0.02	0.01	0.15	0.14	0.01	0.11	0.01	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.05	0.05	0.18	0.56	0.20	0.18
C8	0.01	0.01	0.21	0.20	0.00	0.23	0.00	0.54	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.05	0.06	0.12	0.91	1.52	1.26	1.21
N1	0.03	0.00	0.29	0.28	0.01	0.26	0.01	0.49	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.05	0.13	0.58	0.21	0.64	0.55
N3	0.02	0.00	0.38	0.36	0.00	0.36	0.00	0.65	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.14	0.06	0.20	0.80	0.50	0.85	0.79
N6	0.03	0.01	0.10	0.08	0.01	0.05	0.01	0.10	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.09	0.05	0.02	0.19	0.88	0.41	0.39
N7	0.00	0.01	0.12	0.13	0.00	0.16	0.00	0.42	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.03	0.06	0.08	0.74	1.51	1.17	1.10
N9	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.05	0.01	0.34	0.72	0.54	0.50
O2'	0.01	0.16	0.00	0.01	0.08	0.01	0.06	0.07	0.10	0.05	0.14	0.14	0.09	0.03	0.02	0.00	0.04	0.01	0.13	0.29	0.16	0.15
O3'	0.05	0.06	0.02	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.05	0.06	0.05	0.06	0.05	0.06	0.05	0.04	0.00	0.02	0.04	0.38	0.08	0.11
O4'	0.00	0.19	0.02	0.01	0.09	0.00	0.02	0.03	0.05	0.12	0.13	0.20	0.02	0.08	0.01	0.01	0.02	0.00	0.14	0.15	0.41	0.20
O5'	0.21	0.88	0.14	0.03	0.20	0.03	0.22	0.01	0.18	0.91	0.58	0.80	0.19	0.74	0.34	0.13	0.04	0.14	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.34	0.57	0.26	0.26	0.33	0.22	0.81	0.25	0.56	1.52	0.21	0.50	0.88	1.51	0.72	0.29	0.38	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.33	1.05	0.09	0.09	0.14	0.21	0.45	0.25	0.20	1.26	0.64	0.85	0.41	1.17	0.54	0.16	0.08	0.41	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.27	0.93	0.16	0.09	0.13	0.03	0.42	0.01	0.18	1.21	0.55	0.79	0.39	1.10	0.50	0.15	0.11	0.20	0.01	0.01	0.01	0.00