Doublet Group distance statistics: 48289

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 0, 2, 2, 1, 2, 0, 2, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.013, 0.023, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.013 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.018, 0.030, 0.041, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.030 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.010, 0.024, 0.038, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.024 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.003, 0.019, 0.035, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.019 std_dev=0.016
C2	A	0, 0.003, 0.021, 0.038, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.021 std_dev=0.018
N7	A	0, 0.039, 0.059, 0.080, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.059 std_dev=0.020
N6	A	0, 0.020, 0.043, 0.067, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.043 std_dev=0.023
N3	A	0, 0.005, 0.028, 0.051, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.028 std_dev=0.023
N1	A	0, 0.011, 0.034, 0.057, 0.101 max_d=0.101 avg_d=0.034 std_dev=0.023
C8	A	0, 0.039, 0.062, 0.086, 0.097 max_d=0.097 avg_d=0.062 std_dev=0.024
N9	A	0, 0.022, 0.048, 0.074, 0.113 max_d=0.113 avg_d=0.048 std_dev=0.026
O4'	A	0, 0.067, 0.204, 0.341, 0.494 max_d=0.494 avg_d=0.204 std_dev=0.137
C2'	A	0, 0.065, 0.258, 0.452, 0.607 max_d=0.607 avg_d=0.258 std_dev=0.193
C4'	A	0, 0.128, 0.352, 0.576, 0.870 max_d=0.870 avg_d=0.352 std_dev=0.224
C1'	B	0, 0.315, 0.632, 0.949, 1.278 max_d=1.278 avg_d=0.632 std_dev=0.317
O4'	B	0, 0.348, 0.698, 1.048, 1.356 max_d=1.356 avg_d=0.698 std_dev=0.350
C2'	B	0, 0.272, 0.639, 1.006, 1.333 max_d=1.333 avg_d=0.639 std_dev=0.367
O2'	B	0, 0.203, 0.575, 0.947, 1.387 max_d=1.387 avg_d=0.575 std_dev=0.372
N9	B	0, 0.349, 0.731, 1.114, 1.584 max_d=1.584 avg_d=0.731 std_dev=0.382
C4	B	0, 0.413, 0.802, 1.190, 1.524 max_d=1.524 avg_d=0.802 std_dev=0.389
N3	B	0, 0.343, 0.747, 1.152, 1.762 max_d=1.762 avg_d=0.747 std_dev=0.404
C4'	B	0, 0.280, 0.716, 1.151, 1.570 max_d=1.570 avg_d=0.716 std_dev=0.436
O2'	A	0, -0.018, 0.441, 0.901, 1.799 max_d=1.799 avg_d=0.441 std_dev=0.459
C3'	B	0, 0.315, 0.788, 1.260, 1.712 max_d=1.712 avg_d=0.788 std_dev=0.472
C5	B	0, 0.475, 0.973, 1.472, 2.015 max_d=2.015 avg_d=0.973 std_dev=0.499
C2	B	0, 0.383, 0.882, 1.381, 2.179 max_d=2.179 avg_d=0.882 std_dev=0.499
C3'	A	0, 0.001, 0.506, 1.011, 1.995 max_d=1.995 avg_d=0.506 std_dev=0.505
C5'	A	0, 0.180, 0.693, 1.207, 1.999 max_d=1.999 avg_d=0.693 std_dev=0.513
C8	B	0, 0.342, 0.862, 1.383, 2.082 max_d=2.082 avg_d=0.862 std_dev=0.521
O3'	B	0, 0.351, 0.889, 1.428, 1.859 max_d=1.859 avg_d=0.889 std_dev=0.538
C5'	B	0, 0.361, 0.901, 1.441, 1.872 max_d=1.872 avg_d=0.901 std_dev=0.540
OP1	A	0, 0.357, 0.909, 1.461, 2.139 max_d=2.139 avg_d=0.909 std_dev=0.552
O5'	A	0, 0.243, 0.800, 1.356, 1.810 max_d=1.810 avg_d=0.800 std_dev=0.556
N1	B	0, 0.484, 1.042, 1.599, 2.276 max_d=2.276 avg_d=1.042 std_dev=0.558
C6	B	0, 0.528, 1.093, 1.657, 2.139 max_d=2.139 avg_d=1.093 std_dev=0.565
N7	B	0, 0.439, 1.020, 1.601, 2.352 max_d=2.352 avg_d=1.020 std_dev=0.581
O5'	B	0, 0.471, 1.092, 1.713, 2.457 max_d=2.457 avg_d=1.092 std_dev=0.621
N6	B	0, 0.578, 1.269, 1.959, 2.582 max_d=2.582 avg_d=1.269 std_dev=0.690
P	A	0, 0.126, 0.894, 1.663, 3.180 max_d=3.180 avg_d=0.894 std_dev=0.769
P	B	0, 0.517, 1.356, 2.196, 2.860 max_d=2.860 avg_d=1.356 std_dev=0.840
OP1	B	0, 0.491, 1.384, 2.277, 2.981 max_d=2.981 avg_d=1.384 std_dev=0.893
O3'	A	0, -0.075, 0.835, 1.745, 3.639 max_d=3.639 avg_d=0.835 std_dev=0.910
OP2	B	0, 0.589, 1.587, 2.586, 3.676 max_d=3.676 avg_d=1.587 std_dev=0.999
OP2	A	0, -0.173, 1.102, 2.378, 5.329 max_d=5.329 avg_d=1.102 std_dev=1.276

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.05	0.01	0.02	0.03	0.04	0.01	0.02	0.01	0.02	0.18	0.01	0.13	0.15	0.21	0.12
C2	0.04	0.00	0.11	0.09	0.01	0.05	0.01	0.12	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.39	0.26	0.04	0.25	0.22	0.38	0.25
C2'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.05	0.01	0.04	0.12	0.06	0.07	0.09	0.10	0.05	0.05	0.02	0.00	0.03	0.01	0.18	0.18	0.18	0.09
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.11	0.01	0.20	0.05	0.18	0.30	0.11	0.08	0.22	0.30	0.15	0.03	0.01	0.02	0.28	0.28	0.19	0.17
C4	0.02	0.01	0.05	0.11	0.00	0.05	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.26	0.12	0.01	0.27	0.22	0.40	0.26
C4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.05	0.00	0.09	0.01	0.08	0.12	0.06	0.04	0.09	0.12	0.06	0.19	0.03	0.00	0.02	0.13	0.29	0.04
C5	0.01	0.01	0.04	0.20	0.01	0.09	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.24	0.10	0.02	0.35	0.27	0.56	0.34
C5'	0.05	0.12	0.12	0.05	0.12	0.01	0.15	0.00	0.15	0.18	0.14	0.11	0.17	0.19	0.11	0.06	0.16	0.01	0.01	0.23	0.41	0.02
C6	0.01	0.02	0.06	0.18	0.01	0.08	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.31	0.10	0.02	0.36	0.28	0.60	0.36
C8	0.02	0.01	0.07	0.30	0.01	0.12	0.01	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.08	0.21	0.06	0.37	0.25	0.54	0.32
N1	0.03	0.01	0.09	0.11	0.01	0.06	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.37	0.16	0.03	0.31	0.25	0.50	0.31
N3	0.04	0.00	0.10	0.08	0.01	0.04	0.02	0.11	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.01	0.35	0.27	0.04	0.22	0.19	0.32	0.21
N6	0.01	0.02	0.05	0.22	0.02	0.09	0.02	0.17	0.01	0.02	0.02	0.03	0.00	0.02	0.02	0.29	0.13	0.04	0.40	0.32	0.71	0.41
N7	0.02	0.01	0.05	0.30	0.01	0.12	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.15	0.22	0.05	0.41	0.29	0.66	0.38
N9	0.01	0.02	0.02	0.15	0.00	0.06	0.01	0.11	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.12	0.06	0.01	0.25	0.20	0.35	0.22
O2'	0.02	0.39	0.00	0.03	0.26	0.19	0.24	0.06	0.31	0.08	0.37	0.35	0.29	0.15	0.12	0.00	0.08	0.13	0.14	0.24	0.19	0.11
O3'	0.18	0.26	0.03	0.01	0.12	0.03	0.10	0.16	0.10	0.21	0.16	0.27	0.13	0.22	0.06	0.08	0.00	0.12	0.27	0.35	0.28	0.23
O4'	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.06	0.03	0.04	0.04	0.05	0.01	0.13	0.12	0.00	0.05	0.13	0.26	0.11
O5'	0.13	0.25	0.18	0.28	0.27	0.02	0.35	0.01	0.36	0.37	0.31	0.22	0.40	0.41	0.25	0.14	0.27	0.05	0.00	0.03	0.01	0.01
OP1	0.15	0.22	0.18	0.28	0.22	0.13	0.27	0.23	0.28	0.25	0.25	0.19	0.32	0.29	0.20	0.24	0.35	0.13	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.21	0.38	0.18	0.19	0.40	0.29	0.56	0.41	0.60	0.54	0.50	0.32	0.71	0.66	0.35	0.19	0.28	0.26	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.25	0.09	0.17	0.26	0.04	0.34	0.02	0.36	0.32	0.31	0.21	0.41	0.38	0.22	0.11	0.23	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.22	0.11	0.09	0.26	0.19	0.38	0.25	0.42	0.34	0.34	0.18	0.51	0.43	0.22	0.15	0.13	0.25	0.20	0.16	0.46	0.20
C2	0.13	0.23	0.14	0.12	0.23	0.18	0.34	0.20	0.36	0.29	0.30	0.19	0.41	0.37	0.19	0.19	0.15	0.21	0.15	0.15	0.48	0.20
C2'	0.16	0.30	0.13	0.12	0.32	0.18	0.46	0.22	0.52	0.39	0.44	0.23	0.63	0.50	0.27	0.14	0.16	0.23	0.19	0.20	0.59	0.27
C3'	0.20	0.32	0.12	0.16	0.31	0.29	0.48	0.33	0.56	0.39	0.48	0.23	0.70	0.52	0.26	0.19	0.19	0.31	0.23	0.20	0.52	0.23
C4	0.13	0.24	0.11	0.10	0.25	0.19	0.34	0.24	0.37	0.29	0.32	0.19	0.43	0.37	0.21	0.16	0.14	0.25	0.18	0.15	0.44	0.18
C4'	0.16	0.25	0.10	0.12	0.26	0.25	0.40	0.32	0.46	0.34	0.38	0.19	0.57	0.44	0.22	0.14	0.15	0.30	0.23	0.20	0.45	0.21
C5	0.16	0.29	0.15	0.13	0.27	0.22	0.33	0.27	0.36	0.27	0.34	0.25	0.40	0.33	0.22	0.18	0.17	0.27	0.22	0.18	0.43	0.20
C5'	0.23	0.39	0.16	0.19	0.35	0.32	0.47	0.39	0.54	0.38	0.51	0.30	0.64	0.48	0.29	0.17	0.21	0.36	0.30	0.27	0.49	0.28
C6	0.17	0.31	0.15	0.13	0.29	0.21	0.33	0.25	0.35	0.25	0.34	0.28	0.37	0.31	0.24	0.18	0.16	0.26	0.20	0.16	0.43	0.19
C8	0.16	0.27	0.15	0.15	0.26	0.24	0.34	0.31	0.37	0.28	0.34	0.22	0.43	0.35	0.22	0.19	0.19	0.29	0.24	0.22	0.42	0.22
N1	0.12	0.29	0.12	0.10	0.27	0.17	0.32	0.19	0.35	0.25	0.33	0.26	0.37	0.31	0.21	0.18	0.13	0.21	0.15	0.13	0.46	0.17
N3	0.13	0.21	0.12	0.11	0.23	0.18	0.35	0.21	0.37	0.31	0.30	0.16	0.44	0.39	0.20	0.17	0.14	0.22	0.17	0.15	0.47	0.19
N6	0.25	0.36	0.23	0.21	0.32	0.26	0.33	0.30	0.36	0.28	0.36	0.34	0.36	0.31	0.28	0.24	0.21	0.31	0.26	0.22	0.43	0.24
N7	0.19	0.30	0.18	0.18	0.28	0.26	0.33	0.32	0.36	0.27	0.35	0.26	0.40	0.32	0.24	0.21	0.22	0.31	0.26	0.24	0.42	0.24
N9	0.14	0.23	0.12	0.10	0.24	0.20	0.35	0.26	0.38	0.30	0.33	0.19	0.45	0.38	0.21	0.16	0.15	0.26	0.20	0.17	0.43	0.19
O2'	0.36	0.55	0.40	0.38	0.60	0.27	0.76	0.28	0.81	0.69	0.71	0.48	0.92	0.80	0.55	0.35	0.40	0.29	0.39	0.49	0.93	0.57
O3'	0.24	0.43	0.17	0.16	0.49	0.18	0.71	0.21	0.78	0.64	0.64	0.34	0.95	0.79	0.45	0.14	0.16	0.24	0.28	0.29	0.77	0.41
O4'	0.14	0.22	0.11	0.09	0.24	0.22	0.36	0.30	0.40	0.31	0.33	0.17	0.49	0.40	0.21	0.16	0.14	0.28	0.23	0.19	0.39	0.20
O5'	0.28	0.23	0.33	0.32	0.20	0.41	0.27	0.46	0.33	0.22	0.30	0.19	0.42	0.29	0.19	0.40	0.37	0.43	0.37	0.37	0.24	0.28
OP1	0.25	0.19	0.25	0.28	0.15	0.43	0.24	0.53	0.31	0.20	0.28	0.14	0.40	0.26	0.16	0.31	0.31	0.46	0.42	0.47	0.17	0.37
OP2	0.65	0.28	0.55	0.67	0.32	0.93	0.28	1.04	0.30	0.43	0.33	0.30	0.36	0.32	0.46	0.61	0.65	0.92	0.89	0.93	0.39	0.79
P	0.36	0.18	0.29	0.34	0.15	0.56	0.20	0.66	0.27	0.23	0.26	0.14	0.35	0.23	0.22	0.35	0.33	0.59	0.55	0.58	0.17	0.47

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.03	0.03	0.02	0.04	0.05	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.05	0.14	0.39	0.17
C2	0.05	0.00	0.08	0.10	0.01	0.04	0.02	0.07	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.09	0.14	0.04	0.09	0.39	0.66	0.38
C2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.04	0.02	0.02	0.02	0.02	0.07	0.05	0.09	0.03	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.17	0.45	0.20
C3'	0.02	0.10	0.01	0.00	0.05	0.01	0.09	0.02	0.07	0.19	0.07	0.11	0.10	0.16	0.07	0.02	0.01	0.01	0.13	0.16	0.34	0.16
C4	0.03	0.01	0.04	0.05	0.00	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.06	0.06	0.03	0.07	0.24	0.50	0.26
C4'	0.01	0.04	0.02	0.01	0.02	0.00	0.04	0.01	0.04	0.10	0.03	0.04	0.05	0.08	0.04	0.07	0.01	0.01	0.03	0.07	0.25	0.09
C5	0.02	0.02	0.02	0.09	0.01	0.04	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.10	0.02	0.09	0.18	0.38	0.20
C5'	0.03	0.07	0.02	0.02	0.05	0.01	0.08	0.00	0.07	0.16	0.06	0.06	0.09	0.14	0.07	0.07	0.03	0.03	0.01	0.06	0.10	0.03
C6	0.03	0.01	0.02	0.07	0.01	0.04	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.09	0.02	0.09	0.25	0.44	0.26
C8	0.02	0.02	0.07	0.19	0.01	0.10	0.01	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.19	0.03	0.17	0.12	0.15	0.11
N1	0.04	0.00	0.05	0.07	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.09	0.03	0.08	0.34	0.58	0.34
N3	0.05	0.00	0.09	0.11	0.00	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.09	0.14	0.04	0.08	0.34	0.63	0.35
N6	0.02	0.01	0.03	0.10	0.01	0.05	0.01	0.09	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.05	0.13	0.03	0.11	0.22	0.35	0.23
N7	0.02	0.02	0.06	0.16	0.00	0.08	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.18	0.03	0.15	0.11	0.17	0.12
N9	0.01	0.02	0.01	0.07	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.07	0.02	0.07	0.13	0.37	0.16
O2'	0.02	0.09	0.00	0.02	0.06	0.07	0.05	0.07	0.05	0.03	0.08	0.09	0.05	0.03	0.03	0.00	0.03	0.06	0.08	0.11	0.39	0.15
O3'	0.02	0.14	0.01	0.01	0.06	0.01	0.10	0.03	0.09	0.19	0.09	0.14	0.13	0.18	0.07	0.03	0.00	0.01	0.17	0.15	0.27	0.14
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.02	0.03	0.03	0.04	0.03	0.03	0.02	0.06	0.01	0.00	0.11	0.12	0.33	0.16
O5'	0.05	0.09	0.07	0.13	0.07	0.03	0.09	0.01	0.09	0.17	0.08	0.08	0.11	0.15	0.07	0.08	0.17	0.11	0.00	0.02	0.03	0.01
OP1	0.14	0.39	0.17	0.16	0.24	0.07	0.18	0.06	0.25	0.12	0.34	0.34	0.22	0.11	0.13	0.11	0.15	0.12	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.39	0.66	0.45	0.34	0.50	0.25	0.38	0.10	0.44	0.15	0.58	0.63	0.35	0.17	0.37	0.39	0.27	0.33	0.03	0.01	0.00	0.01
P	0.17	0.38	0.20	0.16	0.26	0.09	0.20	0.03	0.26	0.11	0.34	0.35	0.23	0.12	0.16	0.15	0.14	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00