Doublet Group distance statistics: 48290

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 2, 0, 2, 4, 1, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.006, 0.011, 0.017, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.011 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.006, 0.014, 0.022, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.009, 0.019, 0.029, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.019 std_dev=0.010
N9	A	0, 0.012, 0.023, 0.034, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.023 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.010, 0.021, 0.032, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.021 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.012, 0.024, 0.035, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.024 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.009, 0.021, 0.032, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.021 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.007, 0.019, 0.031, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.019 std_dev=0.012
N7	A	0, 0.011, 0.023, 0.035, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.023 std_dev=0.012
C8	A	0, 0.010, 0.029, 0.048, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.029 std_dev=0.019
N6	A	0, 0.020, 0.042, 0.065, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.042 std_dev=0.023
C3'	B	0, 0.106, 0.196, 0.286, 0.307 max_d=0.307 avg_d=0.196 std_dev=0.090
O4'	A	0, 0.017, 0.165, 0.314, 0.471 max_d=0.471 avg_d=0.165 std_dev=0.149
C2'	A	0, 0.026, 0.174, 0.323, 0.470 max_d=0.470 avg_d=0.174 std_dev=0.149
P	A	0, 0.170, 0.320, 0.470, 0.507 max_d=0.507 avg_d=0.320 std_dev=0.150
C2'	B	0, 0.151, 0.306, 0.460, 0.494 max_d=0.494 avg_d=0.306 std_dev=0.155
O4'	B	0, 0.161, 0.317, 0.473, 0.544 max_d=0.544 avg_d=0.317 std_dev=0.156
C4	B	0, 0.099, 0.263, 0.427, 0.506 max_d=0.506 avg_d=0.263 std_dev=0.164
C4'	B	0, 0.177, 0.356, 0.534, 0.614 max_d=0.614 avg_d=0.356 std_dev=0.179
N3	B	0, 0.181, 0.362, 0.543, 0.541 max_d=0.541 avg_d=0.362 std_dev=0.181
N9	B	0, 0.153, 0.339, 0.526, 0.592 max_d=0.592 avg_d=0.339 std_dev=0.186
C1'	B	0, 0.146, 0.334, 0.523, 0.600 max_d=0.600 avg_d=0.334 std_dev=0.189
O2'	A	0, 0.000, 0.206, 0.412, 0.667 max_d=0.667 avg_d=0.206 std_dev=0.206
C5	B	0, 0.079, 0.286, 0.493, 0.687 max_d=0.687 avg_d=0.286 std_dev=0.207
C4'	A	0, 0.074, 0.282, 0.490, 0.684 max_d=0.684 avg_d=0.282 std_dev=0.208
C6	B	0, 0.085, 0.313, 0.542, 0.844 max_d=0.844 avg_d=0.313 std_dev=0.228
C3'	A	0, 0.067, 0.307, 0.547, 0.800 max_d=0.800 avg_d=0.307 std_dev=0.240
N7	B	0, 0.215, 0.457, 0.699, 0.753 max_d=0.753 avg_d=0.457 std_dev=0.242
C8	B	0, 0.242, 0.485, 0.728, 0.726 max_d=0.726 avg_d=0.485 std_dev=0.243
C2	B	0, 0.212, 0.458, 0.704, 0.736 max_d=0.736 avg_d=0.458 std_dev=0.246
N1	B	0, 0.181, 0.429, 0.676, 0.870 max_d=0.870 avg_d=0.429 std_dev=0.247
N6	B	0, 0.100, 0.375, 0.649, 1.031 max_d=1.031 avg_d=0.375 std_dev=0.275
O3'	B	0, 0.260, 0.547, 0.835, 0.831 max_d=0.831 avg_d=0.547 std_dev=0.287
O2'	B	0, 0.229, 0.559, 0.888, 1.097 max_d=1.097 avg_d=0.559 std_dev=0.329
O3'	A	0, 0.095, 0.468, 0.840, 1.242 max_d=1.242 avg_d=0.468 std_dev=0.373
C5'	A	0, 0.066, 0.446, 0.826, 1.220 max_d=1.220 avg_d=0.446 std_dev=0.380
C5'	B	0, 0.255, 0.645, 1.034, 1.404 max_d=1.404 avg_d=0.645 std_dev=0.389
OP2	A	0, 0.135, 0.528, 0.921, 1.211 max_d=1.211 avg_d=0.528 std_dev=0.393
O5'	A	0, 0.022, 0.482, 0.941, 1.498 max_d=1.498 avg_d=0.482 std_dev=0.459
O5'	B	0, 0.183, 0.664, 1.144, 1.665 max_d=1.665 avg_d=0.664 std_dev=0.480
OP1	A	0, 0.091, 0.630, 1.169, 1.741 max_d=1.741 avg_d=0.630 std_dev=0.539
P	B	0, 0.099, 0.852, 1.604, 2.498 max_d=2.498 avg_d=0.852 std_dev=0.752
OP2	B	0, 0.075, 0.838, 1.600, 2.473 max_d=2.473 avg_d=0.838 std_dev=0.762
OP1	B	0, -0.161, 1.319, 2.798, 4.706 max_d=4.706 avg_d=1.319 std_dev=1.479

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.11	0.39	0.09
C2	0.04	0.00	0.14	0.18	0.01	0.09	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.14	0.23	0.03	0.15	0.17	0.43	0.11
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.07	0.01	0.04	0.01	0.06	0.06	0.11	0.14	0.05	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.06	0.35	0.59	0.23
C3'	0.01	0.18	0.00	0.00	0.09	0.01	0.08	0.02	0.09	0.15	0.14	0.17	0.09	0.12	0.06	0.01	0.01	0.01	0.08	0.48	0.64	0.34
C4	0.02	0.01	0.07	0.09	0.00	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.07	0.10	0.01	0.10	0.10	0.42	0.10
C4'	0.00	0.09	0.01	0.01	0.05	0.00	0.05	0.01	0.06	0.10	0.08	0.08	0.06	0.08	0.04	0.04	0.02	0.00	0.03	0.18	0.32	0.10
C5	0.01	0.01	0.04	0.08	0.01	0.05	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.08	0.02	0.12	0.11	0.40	0.12
C5'	0.01	0.11	0.01	0.02	0.06	0.01	0.07	0.00	0.08	0.12	0.10	0.09	0.10	0.10	0.05	0.03	0.02	0.02	0.01	0.08	0.11	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.09	0.01	0.06	0.01	0.08	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.08	0.12	0.02	0.13	0.15	0.39	0.13
C8	0.02	0.01	0.06	0.15	0.01	0.10	0.01	0.12	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.04	0.16	0.03	0.17	0.05	0.37	0.09
N1	0.03	0.01	0.11	0.14	0.01	0.08	0.01	0.10	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.12	0.19	0.02	0.15	0.18	0.41	0.13
N3	0.04	0.01	0.14	0.17	0.00	0.08	0.01	0.09	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.13	0.21	0.03	0.13	0.14	0.44	0.10
N6	0.01	0.02	0.05	0.09	0.01	0.06	0.01	0.10	0.00	0.03	0.02	0.02	0.00	0.04	0.02	0.06	0.11	0.04	0.14	0.18	0.37	0.16
N7	0.01	0.01	0.04	0.12	0.01	0.08	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.01	0.02	0.13	0.03	0.15	0.06	0.37	0.11
N9	0.01	0.02	0.01	0.06	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.01	0.09	0.08	0.41	0.09
O2'	0.01	0.14	0.00	0.01	0.07	0.04	0.04	0.03	0.08	0.04	0.12	0.13	0.06	0.02	0.01	0.00	0.04	0.05	0.04	0.36	0.57	0.21
O3'	0.01	0.23	0.02	0.01	0.10	0.02	0.08	0.02	0.12	0.16	0.19	0.21	0.11	0.13	0.05	0.04	0.00	0.02	0.10	0.70	0.74	0.46
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.03	0.04	0.03	0.01	0.05	0.02	0.00	0.09	0.17	0.21	0.15
O5'	0.07	0.15	0.06	0.08	0.10	0.03	0.12	0.01	0.13	0.17	0.15	0.13	0.14	0.15	0.09	0.04	0.10	0.09	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.11	0.17	0.35	0.48	0.10	0.18	0.11	0.08	0.15	0.05	0.18	0.14	0.18	0.06	0.08	0.36	0.70	0.17	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.39	0.43	0.59	0.64	0.42	0.32	0.40	0.11	0.39	0.37	0.41	0.44	0.37	0.37	0.41	0.57	0.74	0.21	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.09	0.11	0.23	0.34	0.10	0.10	0.12	0.01	0.13	0.09	0.13	0.10	0.16	0.11	0.09	0.21	0.46	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.06	0.16	0.07	0.08	0.07	0.08	0.15	0.13	0.16	0.17	0.15	0.11	0.25	0.21	0.09	0.12	0.24	0.10	0.23	0.53	0.75	0.41
C2	0.11	0.21	0.10	0.10	0.14	0.12	0.20	0.14	0.20	0.23	0.20	0.16	0.23	0.25	0.16	0.15	0.24	0.14	0.13	0.16	0.57	0.20
C2'	0.07	0.22	0.06	0.12	0.05	0.14	0.12	0.13	0.14	0.15	0.17	0.17	0.24	0.20	0.05	0.11	0.29	0.12	0.16	0.41	0.76	0.33
C3'	0.09	0.21	0.10	0.13	0.10	0.15	0.19	0.19	0.20	0.22	0.17	0.17	0.32	0.28	0.12	0.10	0.29	0.15	0.23	0.57	0.88	0.44
C4	0.06	0.23	0.07	0.08	0.07	0.09	0.15	0.13	0.16	0.19	0.17	0.15	0.22	0.23	0.10	0.11	0.24	0.10	0.20	0.41	0.70	0.35
C4'	0.09	0.15	0.12	0.11	0.13	0.12	0.22	0.19	0.24	0.24	0.17	0.12	0.36	0.29	0.14	0.14	0.25	0.12	0.27	0.69	0.86	0.49
C5	0.06	0.28	0.06	0.08	0.06	0.09	0.11	0.14	0.11	0.17	0.20	0.21	0.16	0.21	0.07	0.09	0.23	0.09	0.21	0.48	0.72	0.39
C5'	0.14	0.17	0.17	0.15	0.17	0.15	0.27	0.23	0.28	0.28	0.19	0.15	0.42	0.35	0.19	0.19	0.26	0.14	0.31	0.83	0.90	0.56
C6	0.07	0.25	0.08	0.09	0.08	0.09	0.13	0.13	0.12	0.20	0.17	0.22	0.16	0.23	0.10	0.09	0.22	0.10	0.18	0.34	0.66	0.31
C8	0.07	0.28	0.06	0.09	0.08	0.10	0.06	0.17	0.08	0.13	0.23	0.21	0.13	0.16	0.05	0.09	0.24	0.10	0.26	0.68	0.79	0.48
N1	0.10	0.21	0.10	0.10	0.13	0.11	0.18	0.14	0.17	0.23	0.17	0.18	0.20	0.24	0.15	0.12	0.23	0.13	0.13	0.16	0.57	0.20
N3	0.08	0.20	0.08	0.09	0.12	0.10	0.20	0.12	0.21	0.21	0.19	0.13	0.25	0.24	0.14	0.14	0.24	0.12	0.16	0.26	0.64	0.26
N6	0.07	0.25	0.07	0.07	0.10	0.09	0.11	0.15	0.13	0.19	0.19	0.24	0.15	0.21	0.07	0.07	0.20	0.08	0.20	0.40	0.67	0.34
N7	0.08	0.31	0.06	0.09	0.10	0.10	0.03	0.18	0.10	0.12	0.26	0.25	0.12	0.16	0.05	0.09	0.23	0.10	0.26	0.67	0.78	0.48
N9	0.05	0.22	0.06	0.08	0.06	0.09	0.12	0.14	0.13	0.16	0.17	0.15	0.21	0.20	0.07	0.10	0.24	0.10	0.23	0.54	0.75	0.41
O2'	0.08	0.20	0.08	0.13	0.05	0.15	0.11	0.11	0.14	0.13	0.16	0.15	0.24	0.18	0.06	0.15	0.29	0.11	0.16	0.35	0.72	0.30
O3'	0.10	0.22	0.10	0.16	0.09	0.19	0.18	0.22	0.20	0.22	0.16	0.19	0.33	0.28	0.10	0.10	0.32	0.17	0.22	0.52	0.90	0.42
O4'	0.10	0.13	0.12	0.10	0.12	0.09	0.20	0.16	0.22	0.21	0.16	0.10	0.31	0.25	0.13	0.15	0.23	0.11	0.26	0.67	0.77	0.47
O5'	0.18	0.23	0.20	0.18	0.21	0.18	0.29	0.25	0.30	0.31	0.22	0.21	0.43	0.38	0.22	0.22	0.29	0.18	0.33	0.87	0.92	0.58
OP1	0.14	0.26	0.12	0.16	0.14	0.22	0.13	0.29	0.21	0.10	0.27	0.21	0.28	0.13	0.11	0.13	0.27	0.20	0.29	0.85	0.90	0.58
OP2	0.42	0.41	0.38	0.39	0.41	0.41	0.37	0.41	0.36	0.37	0.38	0.43	0.33	0.35	0.40	0.40	0.48	0.42	0.38	0.83	0.92	0.60
P	0.16	0.27	0.15	0.17	0.16	0.20	0.11	0.28	0.14	0.13	0.24	0.23	0.13	0.12	0.14	0.15	0.27	0.19	0.28	0.87	0.92	0.58

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.05	0.02	0.02	0.03	0.04	0.03	0.02	0.00	0.02	0.12	0.01	0.10	0.18	0.16	0.12
C2	0.04	0.00	0.06	0.07	0.01	0.13	0.01	0.16	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.17	0.20	0.16	0.15	0.37	0.32	0.22
C2'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.04	0.02	0.05	0.10	0.05	0.06	0.05	0.06	0.06	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.17	0.22	0.24	0.16
C3'	0.02	0.07	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.07	0.04	0.07	0.05	0.07	0.02	0.02	0.01	0.01	0.08	0.40	0.25	0.18
C4	0.02	0.01	0.04	0.03	0.00	0.05	0.00	0.12	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.07	0.14	0.08	0.18	0.44	0.31	0.26
C4'	0.02	0.13	0.02	0.00	0.05	0.00	0.04	0.01	0.06	0.11	0.09	0.13	0.07	0.09	0.02	0.04	0.03	0.00	0.02	0.32	0.13	0.07
C5	0.01	0.01	0.05	0.03	0.00	0.04	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.12	0.04	0.25	0.67	0.41	0.39
C5'	0.05	0.16	0.10	0.01	0.12	0.01	0.15	0.00	0.16	0.21	0.16	0.15	0.19	0.21	0.11	0.08	0.05	0.01	0.01	0.28	0.22	0.01
C6	0.02	0.01	0.05	0.03	0.01	0.06	0.01	0.16	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.06	0.14	0.07	0.25	0.68	0.44	0.39
C8	0.02	0.01	0.06	0.07	0.01	0.11	0.01	0.21	0.02	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.01	0.15	0.07	0.10	0.32	0.71	0.36	0.43
N1	0.03	0.00	0.05	0.04	0.02	0.09	0.01	0.16	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.12	0.18	0.12	0.19	0.54	0.40	0.31
N3	0.04	0.01	0.06	0.07	0.00	0.13	0.01	0.15	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.17	0.20	0.16	0.13	0.29	0.27	0.18
N6	0.03	0.01	0.06	0.05	0.02	0.07	0.02	0.19	0.00	0.04	0.02	0.01	0.00	0.05	0.04	0.05	0.13	0.07	0.29	0.83	0.51	0.47
N7	0.02	0.01	0.05	0.07	0.01	0.09	0.00	0.21	0.02	0.00	0.01	0.01	0.05	0.00	0.01	0.11	0.08	0.07	0.33	0.84	0.45	0.49
N9	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.11	0.02	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.03	0.10	0.01	0.19	0.42	0.26	0.26
O2'	0.02	0.17	0.00	0.02	0.07	0.04	0.04	0.08	0.06	0.15	0.12	0.17	0.05	0.11	0.03	0.00	0.09	0.02	0.21	0.27	0.36	0.22
O3'	0.12	0.20	0.02	0.01	0.14	0.03	0.12	0.05	0.14	0.07	0.18	0.20	0.13	0.08	0.10	0.09	0.00	0.11	0.07	0.51	0.26	0.21
O4'	0.01	0.16	0.01	0.01	0.08	0.00	0.04	0.01	0.07	0.10	0.12	0.16	0.07	0.07	0.01	0.02	0.11	0.00	0.12	0.16	0.26	0.13
O5'	0.10	0.15	0.17	0.08	0.18	0.02	0.25	0.01	0.25	0.32	0.19	0.13	0.29	0.33	0.19	0.21	0.07	0.12	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.18	0.37	0.22	0.40	0.44	0.32	0.67	0.28	0.68	0.71	0.54	0.29	0.83	0.84	0.42	0.27	0.51	0.16	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.16	0.32	0.24	0.25	0.31	0.13	0.41	0.22	0.44	0.36	0.40	0.27	0.51	0.45	0.26	0.36	0.26	0.26	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.22	0.16	0.18	0.26	0.07	0.39	0.01	0.39	0.43	0.31	0.18	0.47	0.49	0.26	0.22	0.21	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00