Doublet Group distance statistics: 48291

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 2, 0, 3, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.012, 0.019, 0.026, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.019 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.005, 0.017, 0.028, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.017 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.013, 0.025, 0.037, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.025 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.018, 0.030, 0.041, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.030 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.021, 0.036, 0.051, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.036 std_dev=0.015
N1	A	0, 0.023, 0.040, 0.058, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.040 std_dev=0.017
C4	A	0, 0.027, 0.046, 0.064, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.046 std_dev=0.019
N9	A	0, 0.015, 0.037, 0.059, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.037 std_dev=0.022
N7	A	0, 0.034, 0.057, 0.081, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.057 std_dev=0.023
N6	A	0, 0.028, 0.058, 0.087, 0.111 max_d=0.111 avg_d=0.058 std_dev=0.029
C8	A	0, 0.045, 0.078, 0.112, 0.124 max_d=0.124 avg_d=0.078 std_dev=0.034
O4'	A	0, 0.045, 0.165, 0.284, 0.361 max_d=0.361 avg_d=0.165 std_dev=0.119
C4'	A	0, 0.096, 0.265, 0.434, 0.485 max_d=0.485 avg_d=0.265 std_dev=0.169
C2'	A	0, 0.023, 0.194, 0.365, 0.483 max_d=0.483 avg_d=0.194 std_dev=0.171
O2'	A	0, 0.090, 0.301, 0.512, 0.637 max_d=0.637 avg_d=0.301 std_dev=0.211
C3'	A	0, 0.047, 0.280, 0.512, 0.625 max_d=0.625 avg_d=0.280 std_dev=0.233
C1'	B	0, 0.181, 0.422, 0.662, 0.876 max_d=0.876 avg_d=0.422 std_dev=0.240
C4	B	0, 0.216, 0.463, 0.710, 0.903 max_d=0.903 avg_d=0.463 std_dev=0.247
N3	B	0, 0.346, 0.609, 0.872, 0.950 max_d=0.950 avg_d=0.609 std_dev=0.263
N9	B	0, 0.154, 0.418, 0.683, 0.955 max_d=0.955 avg_d=0.418 std_dev=0.264
C6	B	0, 0.252, 0.528, 0.805, 0.926 max_d=0.926 avg_d=0.528 std_dev=0.277
C2	B	0, 0.359, 0.636, 0.914, 1.016 max_d=1.016 avg_d=0.636 std_dev=0.277
C5	B	0, 0.218, 0.496, 0.774, 0.982 max_d=0.982 avg_d=0.496 std_dev=0.278
C2'	B	0, 0.226, 0.510, 0.795, 1.090 max_d=1.090 avg_d=0.510 std_dev=0.284
O4'	B	0, 0.151, 0.435, 0.720, 0.905 max_d=0.905 avg_d=0.435 std_dev=0.285
N1	B	0, 0.262, 0.548, 0.835, 0.901 max_d=0.901 avg_d=0.548 std_dev=0.286
C5'	A	0, 0.194, 0.492, 0.791, 0.876 max_d=0.876 avg_d=0.492 std_dev=0.298
O3'	B	0, 0.436, 0.742, 1.049, 1.030 max_d=1.030 avg_d=0.742 std_dev=0.307
C3'	B	0, 0.336, 0.646, 0.955, 1.205 max_d=1.205 avg_d=0.646 std_dev=0.309
C4'	B	0, 0.237, 0.551, 0.864, 1.190 max_d=1.190 avg_d=0.551 std_dev=0.314
OP2	B	0, 0.386, 0.720, 1.054, 1.324 max_d=1.324 avg_d=0.720 std_dev=0.334
N6	B	0, 0.318, 0.660, 1.002, 1.099 max_d=1.099 avg_d=0.660 std_dev=0.342
C8	B	0, 0.148, 0.499, 0.850, 1.061 max_d=1.061 avg_d=0.499 std_dev=0.351
OP1	B	0, 0.312, 0.667, 1.021, 1.338 max_d=1.338 avg_d=0.667 std_dev=0.355
O2'	B	0, 0.284, 0.644, 1.005, 1.256 max_d=1.256 avg_d=0.644 std_dev=0.360
O3'	A	0, 0.036, 0.397, 0.758, 0.897 max_d=0.897 avg_d=0.397 std_dev=0.361
N7	B	0, 0.218, 0.582, 0.946, 1.131 max_d=1.131 avg_d=0.582 std_dev=0.364
P	B	0, 0.240, 0.636, 1.031, 1.518 max_d=1.518 avg_d=0.636 std_dev=0.396
C5'	B	0, 0.212, 0.631, 1.049, 1.586 max_d=1.586 avg_d=0.631 std_dev=0.418
O5'	B	0, 0.037, 0.551, 1.066, 1.793 max_d=1.793 avg_d=0.551 std_dev=0.515
O5'	A	0, 0.237, 0.770, 1.303, 2.001 max_d=2.001 avg_d=0.770 std_dev=0.533
P	A	0, 0.340, 0.977, 1.614, 2.221 max_d=2.221 avg_d=0.977 std_dev=0.637
OP2	A	0, 0.425, 1.272, 2.119, 3.141 max_d=3.141 avg_d=1.272 std_dev=0.847
OP1	A	0, 0.070, 1.429, 2.789, 4.513 max_d=4.513 avg_d=1.429 std_dev=1.360

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.23	0.38	0.35	0.24
C2	0.03	0.00	0.11	0.15	0.02	0.07	0.02	0.14	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.11	0.17	0.03	0.48	0.83	0.47	0.52
C2'	0.01	0.11	0.00	0.01	0.05	0.03	0.02	0.04	0.04	0.07	0.08	0.11	0.03	0.04	0.01	0.01	0.03	0.01	0.23	0.36	0.26	0.24
C3'	0.01	0.15	0.01	0.00	0.09	0.01	0.10	0.03	0.11	0.12	0.14	0.14	0.11	0.12	0.06	0.03	0.01	0.02	0.24	0.28	0.18	0.20
C4	0.01	0.02	0.05	0.09	0.00	0.05	0.00	0.14	0.00	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.07	0.09	0.01	0.49	0.80	0.46	0.51
C4'	0.02	0.07	0.03	0.01	0.05	0.00	0.07	0.01	0.08	0.10	0.08	0.06	0.08	0.10	0.05	0.09	0.04	0.01	0.03	0.09	0.28	0.07
C5	0.01	0.02	0.02	0.10	0.00	0.07	0.00	0.18	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.10	0.02	0.59	1.00	0.55	0.64
C5'	0.04	0.14	0.04	0.03	0.14	0.01	0.18	0.00	0.19	0.20	0.18	0.12	0.21	0.22	0.13	0.10	0.05	0.02	0.01	0.18	0.24	0.03
C6	0.01	0.01	0.04	0.11	0.00	0.08	0.01	0.19	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.07	0.13	0.02	0.61	1.06	0.59	0.67
C8	0.01	0.03	0.07	0.12	0.01	0.10	0.02	0.20	0.02	0.00	0.04	0.02	0.03	0.00	0.01	0.04	0.13	0.03	0.59	0.90	0.50	0.59
N1	0.03	0.00	0.08	0.14	0.03	0.08	0.02	0.18	0.01	0.04	0.00	0.01	0.02	0.03	0.03	0.09	0.16	0.04	0.55	0.97	0.54	0.61
N3	0.03	0.01	0.11	0.14	0.00	0.06	0.01	0.12	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.14	0.03	0.43	0.72	0.43	0.45
N6	0.01	0.02	0.03	0.11	0.01	0.08	0.01	0.21	0.01	0.03	0.02	0.01	0.00	0.03	0.01	0.06	0.13	0.03	0.66	1.19	0.66	0.74
N7	0.01	0.02	0.04	0.12	0.01	0.10	0.01	0.22	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.00	0.01	0.04	0.12	0.03	0.64	1.08	0.58	0.69
N9	0.01	0.02	0.01	0.06	0.00	0.05	0.01	0.13	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.06	0.02	0.45	0.70	0.42	0.45
O2'	0.01	0.11	0.01	0.03	0.07	0.09	0.05	0.10	0.07	0.04	0.09	0.11	0.06	0.04	0.03	0.00	0.04	0.06	0.07	0.11	0.24	0.08
O3'	0.03	0.17	0.03	0.01	0.09	0.04	0.10	0.05	0.13	0.13	0.16	0.14	0.13	0.12	0.06	0.04	0.00	0.04	0.11	0.21	0.17	0.08
O4'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.04	0.03	0.03	0.03	0.02	0.06	0.04	0.00	0.12	0.24	0.40	0.19
O5'	0.23	0.48	0.23	0.24	0.49	0.03	0.59	0.01	0.61	0.59	0.55	0.43	0.66	0.64	0.45	0.07	0.11	0.12	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.38	0.83	0.36	0.28	0.80	0.09	1.00	0.18	1.06	0.90	0.97	0.72	1.19	1.08	0.70	0.11	0.21	0.24	0.01	0.00	0.03	0.01
OP2	0.35	0.47	0.26	0.18	0.46	0.28	0.55	0.24	0.59	0.50	0.54	0.43	0.66	0.58	0.42	0.24	0.17	0.40	0.02	0.03	0.00	0.02
P	0.24	0.52	0.24	0.20	0.51	0.07	0.64	0.03	0.67	0.59	0.61	0.45	0.74	0.69	0.45	0.08	0.08	0.19	0.01	0.01	0.02	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.25	0.28	0.27	0.21	0.20	0.19	0.18	0.16	0.19	0.17	0.22	0.27	0.25	0.20	0.20	0.38	0.25	0.16	0.30	0.16	0.16	0.18
C2	0.30	0.21	0.23	0.25	0.20	0.26	0.17	0.23	0.16	0.21	0.13	0.26	0.26	0.25	0.23	0.30	0.21	0.26	0.29	0.15	0.15	0.16
C2'	0.28	0.27	0.27	0.24	0.23	0.22	0.20	0.16	0.20	0.19	0.23	0.27	0.25	0.19	0.24	0.33	0.23	0.22	0.31	0.15	0.14	0.18
C3'	0.25	0.26	0.25	0.24	0.22	0.24	0.17	0.15	0.17	0.17	0.23	0.26	0.15	0.14	0.21	0.29	0.21	0.24	0.20	0.15	0.15	0.11
C4	0.26	0.25	0.25	0.21	0.19	0.19	0.18	0.15	0.19	0.17	0.16	0.27	0.27	0.23	0.19	0.36	0.23	0.16	0.27	0.17	0.18	0.17
C4'	0.25	0.30	0.28	0.24	0.21	0.23	0.15	0.15	0.16	0.13	0.25	0.28	0.15	0.11	0.19	0.36	0.25	0.19	0.22	0.14	0.14	0.12
C5	0.22	0.20	0.24	0.18	0.15	0.15	0.21	0.09	0.23	0.18	0.14	0.23	0.30	0.26	0.15	0.38	0.25	0.09	0.24	0.23	0.22	0.20
C5'	0.33	0.40	0.38	0.33	0.31	0.33	0.26	0.25	0.26	0.24	0.35	0.38	0.22	0.21	0.29	0.44	0.29	0.29	0.17	0.16	0.13	0.09
C6	0.22	0.14	0.21	0.18	0.14	0.16	0.24	0.11	0.24	0.22	0.13	0.19	0.32	0.31	0.15	0.35	0.21	0.10	0.23	0.26	0.23	0.20
C8	0.19	0.24	0.26	0.19	0.14	0.13	0.17	0.07	0.21	0.13	0.18	0.22	0.29	0.20	0.13	0.41	0.31	0.06	0.25	0.23	0.22	0.20
N1	0.27	0.15	0.21	0.22	0.14	0.23	0.19	0.19	0.19	0.22	0.11	0.21	0.30	0.30	0.18	0.30	0.20	0.22	0.25	0.20	0.19	0.17
N3	0.30	0.26	0.25	0.24	0.22	0.24	0.18	0.21	0.16	0.20	0.17	0.29	0.24	0.23	0.24	0.33	0.21	0.23	0.30	0.15	0.15	0.17
N6	0.15	0.10	0.18	0.14	0.18	0.12	0.29	0.10	0.28	0.29	0.17	0.13	0.34	0.35	0.17	0.35	0.22	0.05	0.20	0.34	0.29	0.26
N7	0.17	0.20	0.24	0.18	0.14	0.13	0.21	0.07	0.24	0.16	0.18	0.20	0.30	0.24	0.12	0.40	0.31	0.06	0.24	0.27	0.25	0.22
N9	0.23	0.27	0.26	0.20	0.18	0.17	0.18	0.11	0.19	0.15	0.19	0.26	0.27	0.20	0.17	0.39	0.26	0.12	0.27	0.18	0.18	0.18
O2'	0.32	0.27	0.31	0.29	0.28	0.27	0.28	0.24	0.26	0.29	0.24	0.29	0.33	0.30	0.30	0.36	0.25	0.27	0.43	0.26	0.19	0.30
O3'	0.23	0.25	0.21	0.22	0.21	0.23	0.17	0.13	0.17	0.17	0.21	0.24	0.14	0.15	0.20	0.22	0.22	0.24	0.20	0.18	0.18	0.13
O4'	0.24	0.33	0.29	0.22	0.19	0.17	0.14	0.11	0.17	0.11	0.26	0.29	0.19	0.13	0.17	0.42	0.32	0.13	0.26	0.16	0.16	0.17
O5'	0.87	0.90	0.98	0.88	0.85	0.78	0.80	0.71	0.81	0.77	0.87	0.88	0.77	0.75	0.84	1.09	0.79	0.74	0.86	0.54	0.56	0.67
OP1	1.42	1.37	1.58	1.48	1.34	1.32	1.26	1.28	1.23	1.27	1.29	1.38	1.14	1.21	1.35	1.72	1.46	1.28	1.48	1.06	1.17	1.26
OP2	0.82	0.81	1.00	0.87	0.74	0.76	0.64	0.68	0.60	0.66	0.68	0.82	0.52	0.60	0.74	1.14	0.79	0.67	0.74	0.44	0.52	0.57
P	0.95	0.96	1.10	0.98	0.91	0.84	0.85	0.79	0.84	0.84	0.91	0.94	0.79	0.80	0.90	1.24	0.92	0.80	0.95	0.61	0.67	0.76

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.07	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.05	0.02	0.04	0.04	0.08	0.04	0.03	0.01	0.03	0.16	0.01	0.15	0.23	0.14	0.12
C2	0.07	0.00	0.15	0.11	0.02	0.05	0.01	0.09	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.21	0.24	0.04	0.30	0.24	0.23	0.22
C2'	0.01	0.15	0.00	0.01	0.07	0.02	0.03	0.14	0.05	0.09	0.10	0.16	0.05	0.07	0.02	0.00	0.02	0.03	0.22	0.34	0.24	0.26
C3'	0.02	0.11	0.01	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.03	0.05	0.07	0.11	0.03	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.25	0.08	0.14
C4	0.02	0.02	0.07	0.04	0.00	0.01	0.01	0.12	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.10	0.18	0.03	0.30	0.25	0.23	0.22
C4'	0.02	0.05	0.02	0.01	0.01	0.00	0.05	0.01	0.05	0.08	0.04	0.05	0.09	0.08	0.03	0.07	0.03	0.01	0.01	0.19	0.08	0.06
C5	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.05	0.00	0.16	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.02	0.01	0.12	0.16	0.06	0.34	0.31	0.29	0.28
C5'	0.05	0.09	0.14	0.02	0.12	0.01	0.16	0.00	0.15	0.21	0.11	0.09	0.19	0.21	0.13	0.07	0.10	0.03	0.01	0.14	0.08	0.02
C6	0.02	0.01	0.05	0.03	0.01	0.05	0.02	0.15	0.00	0.04	0.01	0.01	0.00	0.04	0.02	0.14	0.18	0.07	0.33	0.33	0.30	0.29
C8	0.04	0.02	0.09	0.05	0.01	0.08	0.02	0.21	0.04	0.00	0.04	0.02	0.07	0.01	0.02	0.17	0.10	0.04	0.35	0.31	0.30	0.28
N1	0.04	0.01	0.10	0.07	0.02	0.04	0.02	0.11	0.01	0.04	0.00	0.02	0.03	0.04	0.03	0.16	0.22	0.06	0.31	0.29	0.26	0.26
N3	0.08	0.01	0.16	0.11	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.20	0.24	0.03	0.28	0.22	0.21	0.20
N6	0.04	0.02	0.05	0.03	0.02	0.09	0.03	0.19	0.00	0.07	0.03	0.01	0.00	0.08	0.05	0.15	0.18	0.11	0.33	0.39	0.36	0.33
N7	0.03	0.02	0.07	0.04	0.01	0.08	0.02	0.21	0.04	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.01	0.17	0.11	0.05	0.36	0.36	0.33	0.32
N9	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.13	0.02	0.02	0.03	0.03	0.05	0.01	0.00	0.08	0.14	0.02	0.28	0.23	0.22	0.20
O2'	0.03	0.21	0.00	0.01	0.10	0.07	0.12	0.07	0.14	0.17	0.16	0.20	0.15	0.17	0.08	0.00	0.07	0.04	0.22	0.37	0.23	0.29
O3'	0.16	0.24	0.02	0.01	0.18	0.03	0.16	0.10	0.18	0.10	0.22	0.24	0.18	0.11	0.14	0.07	0.00	0.13	0.14	0.25	0.12	0.14
O4'	0.01	0.04	0.03	0.01	0.03	0.01	0.06	0.03	0.07	0.04	0.06	0.03	0.11	0.05	0.02	0.04	0.13	0.00	0.13	0.28	0.15	0.16
O5'	0.15	0.30	0.22	0.12	0.30	0.01	0.34	0.01	0.33	0.35	0.31	0.28	0.33	0.36	0.28	0.22	0.14	0.13	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.23	0.24	0.34	0.25	0.25	0.19	0.31	0.14	0.33	0.31	0.29	0.22	0.39	0.36	0.23	0.37	0.25	0.28	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.14	0.23	0.24	0.08	0.23	0.08	0.29	0.08	0.30	0.30	0.26	0.21	0.36	0.33	0.22	0.23	0.12	0.15	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.12	0.22	0.26	0.14	0.22	0.06	0.28	0.02	0.29	0.28	0.26	0.20	0.33	0.32	0.20	0.29	0.14	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00