Doublet Group distance statistics: 48293

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.004, 0.015, 0.025, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.015 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.008, 0.020, 0.032, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.020 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.005, 0.018, 0.031, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.018 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.006, 0.019, 0.032, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.019 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.009, 0.025, 0.040, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.025 std_dev=0.016
N1	A	0, 0.011, 0.027, 0.043, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.027 std_dev=0.016
N9	A	0, 0.010, 0.027, 0.043, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.027 std_dev=0.016
C1'	A	0, 0.013, 0.036, 0.058, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.036 std_dev=0.023
N6	A	0, 0.016, 0.044, 0.072, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.044 std_dev=0.028
N7	A	0, 0.014, 0.043, 0.072, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.043 std_dev=0.029
C8	A	0, 0.014, 0.043, 0.073, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.043 std_dev=0.030
C2'	A	0, 0.092, 0.224, 0.357, 0.341 max_d=0.341 avg_d=0.224 std_dev=0.133
O4'	A	0, 0.084, 0.246, 0.408, 0.452 max_d=0.452 avg_d=0.246 std_dev=0.162
O2'	A	0, 0.076, 0.258, 0.440, 0.498 max_d=0.498 avg_d=0.258 std_dev=0.182
C3'	A	0, 0.141, 0.404, 0.667, 0.727 max_d=0.727 avg_d=0.404 std_dev=0.263
O3'	A	0, 0.196, 0.508, 0.820, 0.793 max_d=0.793 avg_d=0.508 std_dev=0.312
C4'	A	0, 0.083, 0.418, 0.753, 0.936 max_d=0.936 avg_d=0.418 std_dev=0.335
C2'	B	0, 0.242, 0.585, 0.927, 0.864 max_d=0.864 avg_d=0.585 std_dev=0.343
C1'	B	0, 0.252, 0.632, 1.012, 0.961 max_d=0.961 avg_d=0.632 std_dev=0.380
C3'	B	0, 0.064, 0.452, 0.839, 0.964 max_d=0.964 avg_d=0.452 std_dev=0.388
C4'	B	0, 0.220, 0.621, 1.023, 1.049 max_d=1.049 avg_d=0.621 std_dev=0.402
O4'	B	0, 0.242, 0.669, 1.095, 1.081 max_d=1.081 avg_d=0.669 std_dev=0.426
O3'	B	0, 0.109, 0.591, 1.073, 1.327 max_d=1.327 avg_d=0.591 std_dev=0.482
O5'	B	0, 0.270, 0.761, 1.251, 1.283 max_d=1.283 avg_d=0.761 std_dev=0.491
N9	B	0, 0.299, 0.800, 1.302, 1.268 max_d=1.268 avg_d=0.800 std_dev=0.501
N3	B	0, 0.328, 0.868, 1.409, 1.335 max_d=1.335 avg_d=0.868 std_dev=0.540
C4	B	0, 0.336, 0.903, 1.471, 1.423 max_d=1.423 avg_d=0.903 std_dev=0.567
C5'	A	0, 0.174, 0.772, 1.369, 1.679 max_d=1.679 avg_d=0.772 std_dev=0.597
O2'	B	0, 0.340, 0.963, 1.585, 1.689 max_d=1.689 avg_d=0.963 std_dev=0.623
C8	B	0, 0.390, 1.020, 1.649, 1.595 max_d=1.595 avg_d=1.020 std_dev=0.630
O5'	A	0, 0.375, 1.012, 1.648, 1.756 max_d=1.756 avg_d=1.012 std_dev=0.637
P	B	0, 0.406, 1.072, 1.737, 1.781 max_d=1.781 avg_d=1.072 std_dev=0.665
C2	B	0, 0.423, 1.092, 1.761, 1.648 max_d=1.648 avg_d=1.092 std_dev=0.669
C5'	B	0, 0.344, 1.027, 1.710, 1.922 max_d=1.922 avg_d=1.027 std_dev=0.683
C5	B	0, 0.442, 1.157, 1.872, 1.786 max_d=1.786 avg_d=1.157 std_dev=0.715
N7	B	0, 0.473, 1.226, 1.979, 1.896 max_d=1.896 avg_d=1.226 std_dev=0.753
OP1	B	0, 0.436, 1.204, 1.972, 2.130 max_d=2.130 avg_d=1.204 std_dev=0.768
N1	B	0, 0.513, 1.314, 2.114, 1.971 max_d=1.971 avg_d=1.314 std_dev=0.801
C6	B	0, 0.530, 1.359, 2.189, 2.046 max_d=2.046 avg_d=1.359 std_dev=0.829
OP2	B	0, 0.494, 1.393, 2.292, 2.339 max_d=2.339 avg_d=1.393 std_dev=0.899
P	A	0, 0.604, 1.533, 2.462, 2.499 max_d=2.499 avg_d=1.533 std_dev=0.929
N6	B	0, 0.650, 1.636, 2.622, 2.423 max_d=2.423 avg_d=1.636 std_dev=0.986
OP2	A	0, 0.741, 1.801, 2.860, 2.611 max_d=2.611 avg_d=1.801 std_dev=1.059
OP1	A	0, 0.676, 1.823, 2.969, 3.135 max_d=3.135 avg_d=1.823 std_dev=1.147

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.32	0.28	0.30	0.24
C2	0.02	0.00	0.14	0.14	0.01	0.06	0.01	0.24	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.14	0.15	0.11	0.41	0.39	0.62	0.42
C2'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.07	0.02	0.04	0.02	0.07	0.09	0.11	0.14	0.07	0.06	0.02	0.00	0.02	0.02	0.21	0.19	0.21	0.09
C3'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.10	0.00	0.12	0.01	0.14	0.11	0.14	0.12	0.16	0.12	0.07	0.01	0.00	0.01	0.13	0.18	0.28	0.08
C4	0.01	0.01	0.07	0.10	0.00	0.09	0.00	0.26	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.07	0.09	0.06	0.39	0.37	0.53	0.36
C4'	0.01	0.06	0.02	0.00	0.09	0.00	0.14	0.01	0.14	0.18	0.10	0.05	0.18	0.18	0.10	0.05	0.01	0.00	0.03	0.17	0.28	0.02
C5	0.01	0.01	0.04	0.12	0.00	0.14	0.00	0.36	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.03	0.10	0.02	0.39	0.45	0.57	0.38
C5'	0.08	0.24	0.02	0.01	0.26	0.01	0.36	0.00	0.37	0.40	0.30	0.20	0.43	0.43	0.25	0.05	0.08	0.02	0.00	0.24	0.37	0.01
C6	0.02	0.00	0.07	0.14	0.01	0.14	0.01	0.37	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.12	0.05	0.39	0.49	0.64	0.43
C8	0.01	0.01	0.09	0.11	0.01	0.18	0.01	0.40	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.06	0.12	0.07	0.36	0.39	0.39	0.27
N1	0.02	0.00	0.11	0.14	0.01	0.10	0.01	0.30	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.14	0.09	0.41	0.46	0.66	0.44
N3	0.02	0.01	0.14	0.12	0.00	0.05	0.00	0.20	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.14	0.13	0.11	0.39	0.34	0.56	0.38
N6	0.03	0.01	0.07	0.16	0.01	0.18	0.02	0.43	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.05	0.14	0.03	0.37	0.56	0.65	0.44
N7	0.01	0.01	0.06	0.12	0.00	0.18	0.00	0.43	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.04	0.12	0.04	0.36	0.47	0.50	0.34
N9	0.01	0.01	0.02	0.07	0.01	0.10	0.01	0.25	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.06	0.01	0.37	0.33	0.41	0.30
O2'	0.01	0.14	0.00	0.01	0.07	0.05	0.03	0.05	0.06	0.06	0.11	0.14	0.05	0.04	0.01	0.00	0.04	0.07	0.11	0.18	0.22	0.06
O3'	0.02	0.15	0.02	0.00	0.09	0.01	0.10	0.08	0.12	0.12	0.14	0.13	0.14	0.12	0.06	0.04	0.00	0.04	0.18	0.31	0.40	0.23
O4'	0.00	0.11	0.02	0.01	0.06	0.00	0.02	0.02	0.05	0.07	0.09	0.11	0.03	0.04	0.01	0.07	0.04	0.00	0.32	0.34	0.31	0.31
O5'	0.32	0.41	0.21	0.13	0.39	0.03	0.39	0.00	0.39	0.36	0.41	0.39	0.37	0.36	0.37	0.11	0.18	0.32	0.00	0.01	0.03	0.01
OP1	0.28	0.39	0.19	0.18	0.37	0.17	0.45	0.24	0.49	0.39	0.46	0.34	0.56	0.47	0.33	0.18	0.31	0.34	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.30	0.62	0.21	0.28	0.53	0.28	0.57	0.37	0.64	0.39	0.66	0.56	0.65	0.50	0.41	0.22	0.40	0.31	0.03	0.00	0.00	0.00
P	0.24	0.42	0.09	0.08	0.36	0.02	0.38	0.01	0.43	0.27	0.44	0.38	0.44	0.34	0.30	0.06	0.23	0.31	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.11	0.21	0.29	0.21	0.23	0.31	0.50	0.29	0.34	0.13	0.13	0.39	0.40	0.24	0.22	0.18	0.23	0.51	0.41	0.59	0.40
C2	0.24	0.05	0.24	0.23	0.22	0.20	0.26	0.34	0.18	0.33	0.06	0.10	0.20	0.33	0.27	0.25	0.13	0.28	0.44	0.32	0.47	0.33
C2'	0.11	0.04	0.12	0.21	0.15	0.18	0.28	0.45	0.27	0.32	0.10	0.03	0.39	0.39	0.19	0.17	0.09	0.18	0.48	0.36	0.63	0.38
C3'	0.17	0.14	0.20	0.25	0.21	0.18	0.34	0.43	0.33	0.36	0.20	0.13	0.47	0.44	0.24	0.24	0.17	0.17	0.53	0.44	0.69	0.43
C4	0.18	0.13	0.19	0.27	0.17	0.23	0.26	0.48	0.17	0.34	0.06	0.11	0.22	0.37	0.23	0.20	0.16	0.23	0.50	0.38	0.57	0.38
C4'	0.24	0.29	0.28	0.33	0.29	0.22	0.38	0.47	0.40	0.37	0.33	0.25	0.52	0.44	0.29	0.30	0.26	0.20	0.54	0.46	0.61	0.41
C5	0.14	0.22	0.15	0.27	0.11	0.24	0.14	0.53	0.07	0.30	0.17	0.17	0.06	0.30	0.18	0.17	0.19	0.19	0.51	0.38	0.59	0.39
C5'	0.35	0.37	0.37	0.30	0.37	0.25	0.43	0.37	0.45	0.44	0.42	0.34	0.57	0.48	0.37	0.46	0.30	0.31	0.58	0.54	0.62	0.47
C6	0.14	0.23	0.15	0.25	0.10	0.23	0.08	0.48	0.08	0.27	0.18	0.19	0.04	0.22	0.16	0.16	0.18	0.20	0.49	0.34	0.54	0.37
C8	0.13	0.21	0.13	0.29	0.11	0.25	0.17	0.58	0.10	0.28	0.18	0.15	0.13	0.31	0.16	0.17	0.22	0.16	0.52	0.43	0.63	0.42
N1	0.20	0.14	0.20	0.22	0.11	0.20	0.14	0.36	0.05	0.28	0.08	0.12	0.07	0.24	0.22	0.22	0.12	0.26	0.44	0.31	0.47	0.33
N3	0.23	0.07	0.23	0.25	0.25	0.21	0.32	0.39	0.26	0.36	0.11	0.12	0.29	0.38	0.28	0.24	0.14	0.27	0.47	0.34	0.52	0.35
N6	0.11	0.27	0.10	0.26	0.18	0.27	0.14	0.55	0.20	0.16	0.26	0.24	0.16	0.10	0.12	0.13	0.24	0.13	0.49	0.34	0.55	0.38
N7	0.11	0.26	0.11	0.29	0.11	0.26	0.12	0.59	0.13	0.25	0.24	0.19	0.09	0.26	0.13	0.15	0.24	0.14	0.52	0.42	0.63	0.42
N9	0.17	0.14	0.18	0.29	0.16	0.24	0.26	0.52	0.19	0.33	0.08	0.11	0.26	0.38	0.22	0.20	0.18	0.21	0.52	0.41	0.60	0.40
O2'	0.15	0.13	0.14	0.23	0.20	0.20	0.31	0.46	0.32	0.32	0.20	0.12	0.42	0.39	0.22	0.12	0.07	0.23	0.45	0.33	0.59	0.35
O3'	0.15	0.11	0.18	0.24	0.20	0.18	0.33	0.43	0.33	0.36	0.19	0.10	0.47	0.44	0.23	0.22	0.15	0.17	0.53	0.43	0.72	0.44
O4'	0.30	0.32	0.34	0.42	0.33	0.31	0.41	0.58	0.42	0.41	0.34	0.30	0.51	0.46	0.34	0.31	0.34	0.28	0.60	0.52	0.62	0.46
O5'	0.74	0.78	0.83	0.90	0.82	0.69	0.92	0.85	0.94	0.88	0.85	0.77	1.05	0.96	0.81	0.75	0.87	0.63	1.04	0.94	1.08	0.87
OP1	0.89	0.85	1.01	1.05	0.95	0.79	1.06	0.80	1.05	1.09	0.93	0.85	1.18	1.17	0.97	0.95	1.06	0.76	1.28	1.24	1.39	1.14
OP2	1.10	1.11	1.22	1.17	1.20	0.88	1.31	0.78	1.30	1.28	1.17	1.12	1.40	1.39	1.19	1.20	1.18	0.91	1.28	1.16	1.26	1.06
P	0.87	0.93	0.98	1.00	0.97	0.73	1.07	0.75	1.10	1.03	1.01	0.91	1.23	1.12	0.95	0.95	1.00	0.70	1.13	1.05	1.14	0.94

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.03	0.01	0.06	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.31	0.33	0.25	0.28
C2	0.03	0.00	0.12	0.12	0.00	0.03	0.00	0.18	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.27	0.15	0.04	0.40	0.41	0.39	0.35
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.06	0.01	0.04	0.02	0.06	0.06	0.09	0.12	0.04	0.04	0.02	0.00	0.01	0.01	0.19	0.28	0.16	0.18
C3'	0.02	0.12	0.00	0.00	0.14	0.00	0.21	0.01	0.20	0.27	0.15	0.10	0.24	0.28	0.16	0.01	0.01	0.01	0.07	0.25	0.11	0.06
C4	0.02	0.00	0.06	0.14	0.00	0.06	0.00	0.26	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.20	0.08	0.04	0.41	0.43	0.37	0.35
C4'	0.03	0.03	0.01	0.00	0.06	0.00	0.15	0.00	0.12	0.24	0.05	0.04	0.17	0.23	0.11	0.10	0.00	0.00	0.01	0.13	0.11	0.02
C5	0.01	0.00	0.04	0.21	0.00	0.15	0.00	0.40	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.20	0.14	0.05	0.47	0.50	0.45	0.41
C5'	0.06	0.18	0.02	0.01	0.26	0.00	0.40	0.00	0.39	0.48	0.29	0.14	0.48	0.52	0.28	0.08	0.05	0.03	0.00	0.26	0.24	0.01
C6	0.02	0.01	0.06	0.20	0.01	0.12	0.01	0.39	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.24	0.13	0.05	0.47	0.51	0.48	0.42
C8	0.01	0.01	0.06	0.27	0.00	0.24	0.01	0.48	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.12	0.25	0.04	0.48	0.51	0.41	0.42
N1	0.02	0.00	0.09	0.15	0.01	0.05	0.01	0.29	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.26	0.11	0.05	0.44	0.46	0.45	0.38
N3	0.03	0.00	0.12	0.10	0.00	0.04	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.24	0.15	0.04	0.38	0.39	0.35	0.33
N6	0.02	0.01	0.04	0.24	0.01	0.17	0.01	0.48	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.23	0.18	0.06	0.50	0.56	0.54	0.47
N7	0.01	0.01	0.04	0.28	0.01	0.23	0.00	0.52	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.17	0.25	0.05	0.50	0.56	0.49	0.46
N9	0.00	0.01	0.02	0.16	0.00	0.11	0.01	0.28	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.12	0.10	0.03	0.41	0.42	0.33	0.34
O2'	0.01	0.27	0.00	0.01	0.20	0.10	0.20	0.08	0.24	0.12	0.26	0.24	0.23	0.17	0.12	0.00	0.04	0.10	0.05	0.18	0.08	0.06
O3'	0.03	0.15	0.01	0.01	0.08	0.00	0.14	0.05	0.13	0.25	0.11	0.15	0.18	0.25	0.10	0.04	0.00	0.01	0.22	0.24	0.35	0.21
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.03	0.05	0.04	0.05	0.04	0.06	0.05	0.03	0.10	0.01	0.00	0.32	0.32	0.30	0.31
O5'	0.31	0.40	0.19	0.07	0.41	0.01	0.47	0.00	0.47	0.48	0.44	0.38	0.50	0.50	0.41	0.05	0.22	0.32	0.00	0.01	0.00	0.00
OP1	0.33	0.41	0.28	0.25	0.43	0.13	0.50	0.26	0.51	0.51	0.46	0.39	0.56	0.56	0.42	0.18	0.24	0.32	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.25	0.39	0.16	0.11	0.37	0.11	0.45	0.24	0.48	0.41	0.45	0.35	0.54	0.49	0.33	0.08	0.35	0.30	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.28	0.35	0.18	0.06	0.35	0.02	0.41	0.01	0.42	0.42	0.38	0.33	0.47	0.46	0.34	0.06	0.21	0.31	0.00	0.00	0.00	0.00