Doublet Group distance statistics: 48295

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.004, 0.013, 0.021, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.013 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.001, 0.012, 0.023, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.012 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.005, 0.016, 0.027, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.016 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.004, 0.016, 0.028, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.016 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.005, 0.019, 0.033, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.019 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.006, 0.021, 0.036, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.021 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.007, 0.024, 0.041, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.024 std_dev=0.017
N7	A	0, 0.011, 0.038, 0.066, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.038 std_dev=0.027
N6	A	0, 0.011, 0.039, 0.067, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.039 std_dev=0.028
C8	A	0, 0.013, 0.044, 0.075, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.044 std_dev=0.031
O2'	A	0, 0.083, 0.437, 0.790, 0.866 max_d=0.866 avg_d=0.437 std_dev=0.354
C2'	A	0, -0.010, 0.364, 0.739, 0.879 max_d=0.879 avg_d=0.364 std_dev=0.374
O4'	A	0, -0.033, 0.384, 0.801, 0.964 max_d=0.964 avg_d=0.384 std_dev=0.417
O5'	A	0, 0.057, 0.601, 1.145, 1.318 max_d=1.318 avg_d=0.601 std_dev=0.544
O2'	B	0, 0.180, 0.753, 1.327, 1.391 max_d=1.391 avg_d=0.753 std_dev=0.574
C4'	A	0, -0.044, 0.574, 1.192, 1.432 max_d=1.432 avg_d=0.574 std_dev=0.618
C3'	A	0, 0.017, 0.637, 1.257, 1.477 max_d=1.477 avg_d=0.637 std_dev=0.620
C2'	B	0, -0.029, 0.658, 1.344, 1.605 max_d=1.605 avg_d=0.658 std_dev=0.687
P	A	0, 0.133, 0.916, 1.699, 1.913 max_d=1.913 avg_d=0.916 std_dev=0.783
O3'	A	0, 0.078, 0.930, 1.781, 2.057 max_d=2.057 avg_d=0.930 std_dev=0.851
C5'	A	0, -0.051, 0.999, 2.049, 2.451 max_d=2.451 avg_d=0.999 std_dev=1.050
OP2	A	0, 0.175, 1.269, 2.362, 2.669 max_d=2.669 avg_d=1.269 std_dev=1.094
C1'	B	0, 0.382, 1.585, 2.789, 2.915 max_d=2.915 avg_d=1.585 std_dev=1.204
C3'	B	0, 0.533, 1.823, 3.114, 2.810 max_d=2.810 avg_d=1.823 std_dev=1.291
C4'	B	0, 0.600, 2.393, 4.186, 4.316 max_d=4.316 avg_d=2.393 std_dev=1.793
O4'	B	0, 0.412, 2.214, 4.017, 4.415 max_d=4.415 avg_d=2.214 std_dev=1.802
OP1	A	0, -0.025, 1.893, 3.812, 4.522 max_d=4.522 avg_d=1.893 std_dev=1.918
N9	B	0, 0.435, 2.381, 4.328, 4.767 max_d=4.767 avg_d=2.381 std_dev=1.946
O3'	B	0, 0.686, 2.824, 4.962, 5.172 max_d=5.172 avg_d=2.824 std_dev=2.138
C5'	B	0, 0.856, 3.137, 5.418, 5.354 max_d=5.354 avg_d=3.137 std_dev=2.281
C8	B	0, 0.512, 3.004, 5.496, 6.101 max_d=6.101 avg_d=3.004 std_dev=2.492
N3	B	0, 0.349, 2.875, 5.401, 6.149 max_d=6.149 avg_d=2.875 std_dev=2.526
C4	B	0, 0.378, 2.995, 5.611, 6.375 max_d=6.375 avg_d=2.995 std_dev=2.617
O5'	B	0, 1.120, 4.066, 7.012, 6.885 max_d=6.885 avg_d=4.066 std_dev=2.946
C2	B	0, 0.381, 3.685, 6.989, 8.015 max_d=8.015 avg_d=3.685 std_dev=3.304
N7	B	0, 0.456, 3.965, 7.474, 8.532 max_d=8.532 avg_d=3.965 std_dev=3.509
C5	B	0, 0.387, 3.938, 7.489, 8.606 max_d=8.606 avg_d=3.938 std_dev=3.551
P	B	0, 1.377, 5.079, 8.781, 8.718 max_d=8.718 avg_d=5.079 std_dev=3.702
OP2	B	0, 1.420, 5.438, 9.455, 9.584 max_d=9.584 avg_d=5.438 std_dev=4.018
OP1	B	0, 1.604, 5.776, 9.948, 9.705 max_d=9.705 avg_d=5.776 std_dev=4.172
N1	B	0, 0.375, 4.577, 8.779, 10.148 max_d=10.148 avg_d=4.577 std_dev=4.202
C6	B	0, 0.356, 4.755, 9.154, 10.606 max_d=10.606 avg_d=4.755 std_dev=4.399
N6	B	0, 0.335, 5.759, 11.182, 13.025 max_d=13.025 avg_d=5.759 std_dev=5.423

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.11	0.12	0.16	0.08
C2	0.01	0.00	0.23	0.33	0.01	0.11	0.01	0.18	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.40	0.07	0.21	0.62	0.22	0.32
C2'	0.00	0.23	0.00	0.00	0.13	0.01	0.07	0.01	0.11	0.08	0.18	0.24	0.08	0.03	0.03	0.00	0.01	0.01	0.25	0.14	0.23	0.22
C3'	0.01	0.33	0.00	0.00	0.22	0.00	0.19	0.01	0.24	0.09	0.30	0.31	0.21	0.10	0.10	0.01	0.00	0.00	0.35	0.10	0.30	0.32
C4	0.01	0.01	0.13	0.22	0.00	0.09	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.24	0.04	0.22	0.64	0.21	0.33
C4'	0.01	0.11	0.01	0.00	0.09	0.00	0.10	0.00	0.10	0.07	0.11	0.10	0.10	0.08	0.06	0.03	0.04	0.00	0.00	0.50	0.12	0.10
C5	0.01	0.01	0.07	0.19	0.00	0.10	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.23	0.03	0.28	0.99	0.25	0.47
C5'	0.02	0.18	0.01	0.01	0.16	0.00	0.19	0.00	0.20	0.15	0.20	0.16	0.21	0.18	0.12	0.03	0.03	0.00	0.00	0.40	0.19	0.00
C6	0.01	0.01	0.11	0.24	0.01	0.10	0.01	0.20	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.30	0.05	0.29	1.07	0.26	0.51
C8	0.01	0.01	0.08	0.09	0.00	0.07	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.10	0.03	0.30	0.93	0.23	0.46
N1	0.01	0.00	0.18	0.30	0.01	0.11	0.01	0.20	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.37	0.06	0.26	0.88	0.25	0.43
N3	0.01	0.01	0.24	0.31	0.00	0.10	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.09	0.35	0.06	0.18	0.45	0.19	0.24
N6	0.02	0.01	0.08	0.21	0.01	0.10	0.01	0.21	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.28	0.04	0.32	1.30	0.29	0.60
N7	0.01	0.01	0.03	0.10	0.00	0.08	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.13	0.01	0.32	1.19	0.26	0.56
N9	0.00	0.01	0.03	0.10	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.10	0.01	0.21	0.53	0.20	0.29
O2'	0.02	0.09	0.00	0.01	0.03	0.03	0.02	0.03	0.03	0.06	0.06	0.09	0.02	0.05	0.03	0.00	0.04	0.04	0.08	0.50	0.13	0.13
O3'	0.02	0.40	0.01	0.00	0.24	0.04	0.23	0.03	0.30	0.10	0.37	0.35	0.28	0.13	0.10	0.04	0.00	0.03	0.30	0.37	0.31	0.26
O4'	0.00	0.07	0.01	0.00	0.04	0.00	0.03	0.00	0.05	0.03	0.06	0.06	0.04	0.01	0.01	0.04	0.03	0.00	0.08	0.25	0.09	0.13
O5'	0.11	0.21	0.25	0.35	0.22	0.00	0.28	0.00	0.29	0.30	0.26	0.18	0.32	0.32	0.21	0.08	0.30	0.08	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.12	0.62	0.14	0.10	0.64	0.50	0.99	0.40	1.07	0.93	0.88	0.45	1.30	1.19	0.53	0.50	0.37	0.25	0.00	0.00	0.01	0.00
OP2	0.16	0.22	0.23	0.30	0.21	0.12	0.25	0.19	0.26	0.23	0.25	0.19	0.29	0.26	0.20	0.13	0.31	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.32	0.22	0.32	0.33	0.10	0.47	0.00	0.51	0.46	0.43	0.24	0.60	0.56	0.29	0.13	0.26	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.34	1.21	0.22	0.11	1.01	0.09	1.42	0.11	1.74	1.04	1.67	0.85	2.07	1.39	0.77	0.21	0.26	0.31	0.09	0.52	0.27	0.11
C2	0.38	1.54	0.07	0.26	1.48	0.21	2.13	0.23	2.48	1.60	2.20	1.09	2.83	2.12	1.15	0.29	0.51	0.24	0.39	0.75	0.29	0.46
C2'	0.17	1.02	0.30	0.27	0.85	0.22	1.33	0.23	1.67	0.95	1.53	0.66	2.07	1.35	0.62	0.32	0.40	0.09	0.35	0.55	0.44	0.36
C3'	0.28	0.80	0.42	0.29	0.63	0.26	0.97	0.28	1.23	0.66	1.14	0.56	1.55	0.97	0.44	0.36	0.31	0.25	0.43	0.41	0.63	0.44
C4	0.30	1.13	0.18	0.11	0.99	0.05	1.39	0.07	1.67	1.03	1.57	0.79	1.93	1.37	0.76	0.21	0.28	0.23	0.10	0.47	0.23	0.11
C4'	0.28	0.95	0.31	0.12	0.76	0.04	1.07	0.04	1.33	0.77	1.28	0.68	1.60	1.05	0.58	0.23	0.26	0.24	0.16	0.38	0.47	0.15
C5	0.25	0.70	0.23	0.06	0.64	0.04	0.88	0.05	1.02	0.68	0.93	0.53	1.17	0.89	0.51	0.15	0.27	0.20	0.13	0.26	0.40	0.12
C5'	0.34	0.80	0.43	0.19	0.63	0.08	0.79	0.10	0.97	0.58	0.97	0.62	1.13	0.76	0.50	0.26	0.24	0.27	0.33	0.16	0.72	0.35
C6	0.21	0.62	0.18	0.06	0.66	0.05	0.94	0.06	1.04	0.75	0.89	0.46	1.18	0.96	0.54	0.16	0.26	0.16	0.09	0.26	0.30	0.06
C8	0.29	0.70	0.30	0.10	0.57	0.13	0.71	0.13	0.83	0.55	0.82	0.56	0.94	0.69	0.46	0.12	0.31	0.26	0.24	0.22	0.60	0.27
N1	0.29	1.12	0.07	0.20	1.20	0.18	1.68	0.17	1.86	1.32	1.60	0.82	2.08	1.70	0.95	0.25	0.39	0.13	0.25	0.54	0.19	0.28
N3	0.37	1.54	0.10	0.21	1.37	0.15	1.97	0.18	2.37	1.45	2.19	1.06	2.75	1.95	1.05	0.27	0.43	0.28	0.32	0.71	0.21	0.38
N6	0.28	0.34	0.24	0.08	0.30	0.13	0.33	0.16	0.33	0.34	0.26	0.42	0.38	0.39	0.28	0.09	0.39	0.28	0.27	0.18	0.50	0.29
N7	0.30	0.66	0.31	0.12	0.50	0.14	0.56	0.16	0.63	0.45	0.65	0.57	0.67	0.54	0.41	0.09	0.39	0.27	0.32	0.21	0.66	0.36
N9	0.30	1.00	0.24	0.08	0.84	0.07	1.17	0.07	1.41	0.86	1.35	0.71	1.65	1.15	0.65	0.18	0.24	0.26	0.07	0.39	0.35	0.04
O2'	0.26	1.33	0.19	0.27	1.14	0.21	1.72	0.25	2.13	1.26	1.96	0.88	2.64	1.74	0.86	0.30	0.49	0.18	0.40	0.78	0.35	0.45
O3'	0.33	0.79	0.48	0.38	0.61	0.40	0.98	0.42	1.27	0.65	1.16	0.55	1.64	0.99	0.42	0.43	0.38	0.35	0.56	0.55	0.74	0.59
O4'	0.40	1.15	0.20	0.03	0.95	0.25	1.26	0.27	1.53	0.94	1.50	0.84	1.78	1.23	0.75	0.14	0.27	0.43	0.06	0.56	0.32	0.09
O5'	0.47	0.81	0.21	0.34	0.71	0.50	0.84	0.48	0.96	0.71	0.95	0.67	1.06	0.83	0.62	0.26	0.72	0.51	0.27	0.52	0.57	0.28
OP1	1.34	1.11	1.12	1.48	1.24	1.61	1.25	1.58	1.20	1.34	1.14	1.17	1.22	1.31	1.31	1.32	1.99	1.43	1.23	1.49	1.07	1.16
OP2	0.25	0.50	0.04	0.31	0.37	0.53	0.49	0.49	0.64	0.36	0.65	0.35	0.75	0.46	0.30	0.34	0.86	0.37	0.21	0.45	0.64	0.26
P	0.63	0.71	0.36	0.65	0.68	0.83	0.76	0.80	0.82	0.71	0.81	0.63	0.89	0.76	0.67	0.57	1.13	0.72	0.47	0.75	0.57	0.44

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.16	0.00	0.26	0.45	0.33	0.24
C2	0.00	0.00	0.24	0.20	0.00	0.14	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.11	0.15	0.18	0.50	0.69	0.95	0.54
C2'	0.00	0.24	0.00	0.01	0.13	0.03	0.06	0.04	0.10	0.12	0.18	0.24	0.06	0.07	0.03	0.00	0.00	0.03	0.25	0.39	0.14	0.27
C3'	0.02	0.20	0.01	0.00	0.26	0.01	0.36	0.03	0.35	0.41	0.28	0.15	0.39	0.44	0.27	0.01	0.01	0.02	0.13	0.21	0.05	0.13
C4	0.00	0.00	0.13	0.26	0.00	0.04	0.00	0.15	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.14	0.10	0.09	0.61	0.67	1.03	0.64
C4'	0.02	0.14	0.03	0.01	0.04	0.00	0.15	0.01	0.10	0.34	0.06	0.15	0.16	0.30	0.13	0.28	0.02	0.00	0.01	0.15	0.16	0.01
C5	0.00	0.00	0.06	0.36	0.00	0.15	0.00	0.33	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.28	0.21	0.02	0.85	0.81	1.50	0.93
C5'	0.03	0.09	0.04	0.03	0.15	0.01	0.33	0.00	0.27	0.55	0.12	0.10	0.37	0.54	0.25	0.21	0.14	0.02	0.00	0.22	0.34	0.01
C6	0.00	0.00	0.10	0.35	0.01	0.10	0.01	0.27	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.26	0.18	0.06	0.84	0.84	1.57	0.95
C8	0.01	0.00	0.12	0.41	0.00	0.34	0.00	0.55	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.37	0.32	0.14	0.97	0.81	1.46	0.99
N1	0.00	0.00	0.18	0.28	0.00	0.06	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.15	0.11	0.13	0.68	0.76	1.30	0.76
N3	0.00	0.00	0.24	0.15	0.00	0.15	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.12	0.17	0.19	0.42	0.64	0.75	0.44
N6	0.01	0.00	0.06	0.39	0.01	0.16	0.01	0.37	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.35	0.25	0.03	0.96	0.94	1.86	1.13
N7	0.01	0.00	0.07	0.44	0.00	0.30	0.00	0.54	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.40	0.35	0.09	1.05	0.92	1.80	1.16
N9	0.01	0.00	0.03	0.27	0.00	0.13	0.00	0.25	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.19	0.12	0.01	0.62	0.62	0.92	0.61
O2'	0.02	0.11	0.00	0.01	0.14	0.28	0.28	0.21	0.26	0.37	0.15	0.12	0.35	0.40	0.19	0.00	0.05	0.21	0.06	0.11	0.04	0.07
O3'	0.16	0.15	0.00	0.01	0.10	0.02	0.21	0.14	0.18	0.32	0.11	0.17	0.25	0.35	0.12	0.05	0.00	0.06	0.18	0.50	0.08	0.22
O4'	0.00	0.18	0.03	0.02	0.09	0.00	0.02	0.02	0.06	0.14	0.13	0.19	0.03	0.09	0.01	0.21	0.06	0.00	0.19	0.49	0.11	0.16
O5'	0.26	0.50	0.25	0.13	0.61	0.01	0.85	0.00	0.84	0.97	0.68	0.42	0.96	1.05	0.62	0.06	0.18	0.19	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.45	0.69	0.39	0.21	0.67	0.15	0.81	0.22	0.84	0.81	0.76	0.64	0.94	0.92	0.62	0.11	0.50	0.49	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.33	0.95	0.14	0.05	1.03	0.16	1.50	0.34	1.57	1.46	1.30	0.75	1.86	1.80	0.92	0.04	0.08	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.24	0.54	0.27	0.13	0.64	0.01	0.93	0.01	0.95	0.99	0.76	0.44	1.13	1.16	0.61	0.07	0.22	0.16	0.00	0.01	0.00	0.00