Doublet Group distance statistics: 48296

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.003, 0.009, 0.016, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.009 std_dev=0.007
N7	A	0, -0.001, 0.012, 0.024, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.012 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.007, 0.026, 0.044, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.026 std_dev=0.018
C4	A	0, 0.004, 0.025, 0.046, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.025 std_dev=0.021
C8	A	0, 0.002, 0.027, 0.052, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.027 std_dev=0.025
N3	A	0, 0.000, 0.028, 0.055, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.028 std_dev=0.027
C2	A	0, 0.004, 0.031, 0.059, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.031 std_dev=0.027
N9	A	0, 0.009, 0.038, 0.066, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.038 std_dev=0.029
N1	A	0, 0.009, 0.039, 0.068, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.039 std_dev=0.029
N6	A	0, 0.012, 0.044, 0.076, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.044 std_dev=0.032
C1'	A	0, 0.009, 0.044, 0.078, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.044 std_dev=0.035
O4'	B	0, 0.049, 0.169, 0.288, 0.255 max_d=0.255 avg_d=0.169 std_dev=0.119
N3	B	0, 0.019, 0.154, 0.289, 0.329 max_d=0.329 avg_d=0.154 std_dev=0.135
C1'	B	0, 0.049, 0.198, 0.348, 0.361 max_d=0.361 avg_d=0.198 std_dev=0.149
C2	B	0, 0.052, 0.216, 0.381, 0.399 max_d=0.399 avg_d=0.216 std_dev=0.165
C4	B	0, 0.032, 0.207, 0.382, 0.428 max_d=0.428 avg_d=0.207 std_dev=0.175
C4'	B	0, 0.072, 0.253, 0.433, 0.410 max_d=0.410 avg_d=0.253 std_dev=0.181
C2'	A	0, 0.022, 0.213, 0.405, 0.464 max_d=0.464 avg_d=0.213 std_dev=0.191
N9	B	0, 0.074, 0.267, 0.459, 0.448 max_d=0.448 avg_d=0.267 std_dev=0.193
C2'	B	0, 0.044, 0.248, 0.452, 0.500 max_d=0.500 avg_d=0.248 std_dev=0.204
C3'	B	0, 0.047, 0.259, 0.471, 0.519 max_d=0.519 avg_d=0.259 std_dev=0.212
O4'	A	0, 0.033, 0.245, 0.458, 0.519 max_d=0.519 avg_d=0.245 std_dev=0.213
O2'	A	0, 0.017, 0.232, 0.448, 0.519 max_d=0.519 avg_d=0.232 std_dev=0.215
N1	B	0, 0.081, 0.300, 0.519, 0.517 max_d=0.517 avg_d=0.300 std_dev=0.219
C5	B	0, 0.079, 0.325, 0.572, 0.596 max_d=0.596 avg_d=0.325 std_dev=0.246
O2'	B	0, 0.085, 0.335, 0.585, 0.601 max_d=0.601 avg_d=0.335 std_dev=0.250
O3'	B	0, 0.099, 0.357, 0.615, 0.601 max_d=0.601 avg_d=0.357 std_dev=0.258
C6	B	0, 0.095, 0.359, 0.623, 0.626 max_d=0.626 avg_d=0.359 std_dev=0.264
C8	B	0, 0.111, 0.387, 0.663, 0.623 max_d=0.623 avg_d=0.387 std_dev=0.276
C5'	B	0, 0.048, 0.335, 0.623, 0.702 max_d=0.702 avg_d=0.335 std_dev=0.287
C3'	A	0, 0.038, 0.346, 0.653, 0.747 max_d=0.747 avg_d=0.346 std_dev=0.308
C4'	A	0, 0.036, 0.344, 0.652, 0.747 max_d=0.747 avg_d=0.344 std_dev=0.308
N7	B	0, 0.120, 0.428, 0.736, 0.712 max_d=0.712 avg_d=0.428 std_dev=0.308
O5'	B	0, 0.133, 0.473, 0.813, 0.786 max_d=0.786 avg_d=0.473 std_dev=0.340
N6	B	0, 0.147, 0.504, 0.861, 0.769 max_d=0.769 avg_d=0.504 std_dev=0.357
O3'	A	0, 0.079, 0.496, 0.913, 1.021 max_d=1.021 avg_d=0.496 std_dev=0.417
P	B	0, 0.148, 0.611, 1.073, 1.118 max_d=1.118 avg_d=0.611 std_dev=0.462
OP1	B	0, 0.168, 0.641, 1.114, 1.128 max_d=1.128 avg_d=0.641 std_dev=0.473
O5'	A	0, -0.088, 0.411, 0.910, 1.114 max_d=1.114 avg_d=0.411 std_dev=0.499
P	A	0, 0.098, 0.604, 1.111, 1.239 max_d=1.239 avg_d=0.604 std_dev=0.506
OP2	A	0, 0.180, 0.718, 1.255, 1.293 max_d=1.293 avg_d=0.718 std_dev=0.537
OP2	B	0, 0.200, 0.744, 1.288, 1.286 max_d=1.286 avg_d=0.744 std_dev=0.544
C5'	A	0, 0.048, 0.592, 1.136, 1.314 max_d=1.314 avg_d=0.592 std_dev=0.544
OP1	A	0, 0.150, 0.731, 1.311, 1.420 max_d=1.420 avg_d=0.731 std_dev=0.581

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.02	0.04	0.04	0.03	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.06	0.04	0.02
C2	0.04	0.00	0.02	0.14	0.01	0.08	0.01	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.09	0.15	0.01	0.27	0.24	0.30	0.25
C2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.02	0.09	0.03
C3'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.09	0.00	0.05	0.01	0.08	0.03	0.11	0.14	0.07	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.07	0.04	0.10	0.06
C4	0.01	0.01	0.02	0.09	0.00	0.07	0.01	0.14	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.04	0.08	0.02	0.20	0.17	0.17	0.17
C4'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.07	0.00	0.07	0.00	0.08	0.03	0.09	0.07	0.09	0.05	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.02	0.03
C5	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.07	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.05	0.03	0.22	0.22	0.21	0.22
C5'	0.02	0.18	0.01	0.01	0.14	0.00	0.15	0.00	0.18	0.07	0.19	0.15	0.19	0.11	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.01
C6	0.03	0.00	0.01	0.08	0.02	0.08	0.01	0.18	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.07	0.03	0.26	0.28	0.30	0.28
C8	0.02	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.04	0.02	0.06	0.10	0.07	0.06
N1	0.04	0.00	0.00	0.11	0.02	0.09	0.01	0.19	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.09	0.11	0.02	0.28	0.28	0.34	0.29
N3	0.04	0.01	0.03	0.14	0.01	0.07	0.01	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.07	0.14	0.01	0.23	0.18	0.22	0.19
N6	0.03	0.01	0.02	0.07	0.02	0.09	0.01	0.19	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.06	0.06	0.04	0.27	0.32	0.34	0.32
N7	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.05	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.02	0.03	0.14	0.19	0.11	0.17
N9	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.07	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.11	0.09	0.06	0.07
O2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.09	0.07	0.06	0.03	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.05	0.05	0.02
O3'	0.01	0.15	0.01	0.01	0.08	0.01	0.05	0.01	0.07	0.04	0.11	0.14	0.06	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.08	0.06	0.12	0.07
O4'	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.02	0.02	0.01	0.04	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.05	0.09	0.10	0.09
O5'	0.04	0.27	0.06	0.07	0.20	0.01	0.22	0.00	0.26	0.06	0.28	0.23	0.27	0.14	0.11	0.03	0.08	0.05	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.06	0.24	0.02	0.04	0.17	0.04	0.22	0.02	0.28	0.10	0.28	0.18	0.32	0.19	0.09	0.05	0.06	0.09	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.04	0.30	0.09	0.10	0.17	0.02	0.21	0.02	0.30	0.07	0.34	0.22	0.34	0.11	0.06	0.05	0.12	0.10	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.02	0.25	0.03	0.06	0.17	0.03	0.22	0.01	0.28	0.06	0.29	0.19	0.32	0.17	0.07	0.02	0.07	0.09	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.02	0.07	0.01	0.04	0.03	0.03	0.13	0.04	0.16	0.12	0.06	0.07	0.29	0.17	0.04	0.03	0.14	0.02	0.19	0.21	0.24	0.16
C2	0.09	0.07	0.10	0.14	0.02	0.14	0.08	0.12	0.14	0.03	0.15	0.02	0.19	0.07	0.05	0.08	0.19	0.11	0.04	0.07	0.03	0.06
C2'	0.07	0.09	0.06	0.10	0.05	0.08	0.12	0.02	0.16	0.10	0.08	0.10	0.27	0.16	0.04	0.08	0.20	0.06	0.15	0.15	0.17	0.10
C3'	0.12	0.12	0.10	0.14	0.07	0.14	0.10	0.08	0.13	0.10	0.05	0.14	0.26	0.15	0.08	0.11	0.24	0.12	0.14	0.11	0.12	0.06
C4	0.04	0.05	0.03	0.06	0.03	0.05	0.11	0.01	0.15	0.09	0.08	0.07	0.22	0.14	0.03	0.05	0.14	0.03	0.15	0.17	0.17	0.11
C4'	0.07	0.09	0.05	0.09	0.02	0.10	0.10	0.05	0.13	0.10	0.02	0.10	0.26	0.15	0.03	0.05	0.19	0.09	0.15	0.14	0.16	0.09
C5	0.04	0.11	0.04	0.03	0.06	0.00	0.08	0.05	0.09	0.09	0.07	0.10	0.13	0.11	0.05	0.06	0.10	0.01	0.19	0.21	0.20	0.15
C5'	0.13	0.16	0.10	0.15	0.08	0.17	0.03	0.12	0.06	0.05	0.06	0.16	0.20	0.10	0.08	0.10	0.24	0.16	0.10	0.08	0.08	0.03
C6	0.07	0.06	0.06	0.05	0.07	0.03	0.06	0.01	0.06	0.06	0.05	0.08	0.07	0.07	0.07	0.07	0.10	0.04	0.13	0.16	0.11	0.08
C8	0.04	0.16	0.04	0.02	0.05	0.03	0.10	0.10	0.10	0.14	0.12	0.11	0.18	0.17	0.06	0.06	0.09	0.03	0.27	0.29	0.31	0.25
N1	0.10	0.04	0.10	0.12	0.03	0.12	0.05	0.10	0.09	0.05	0.09	0.03	0.11	0.05	0.07	0.09	0.16	0.11	0.04	0.08	0.03	0.06
N3	0.06	0.04	0.06	0.11	0.03	0.11	0.11	0.07	0.18	0.07	0.15	0.03	0.25	0.12	0.02	0.06	0.18	0.08	0.07	0.10	0.09	0.02
N6	0.05	0.08	0.05	0.03	0.10	0.05	0.11	0.08	0.10	0.09	0.09	0.08	0.09	0.10	0.09	0.07	0.03	0.03	0.18	0.22	0.13	0.13
N7	0.04	0.17	0.05	0.04	0.07	0.05	0.09	0.12	0.10	0.12	0.15	0.12	0.11	0.15	0.06	0.07	0.07	0.04	0.28	0.29	0.30	0.25
N9	0.03	0.10	0.02	0.04	0.03	0.02	0.12	0.04	0.14	0.12	0.05	0.09	0.25	0.17	0.04	0.04	0.13	0.01	0.20	0.22	0.24	0.17
O2'	0.02	0.03	0.02	0.06	0.04	0.04	0.13	0.04	0.18	0.12	0.11	0.05	0.30	0.17	0.03	0.04	0.16	0.02	0.17	0.18	0.21	0.13
O3'	0.13	0.11	0.12	0.17	0.08	0.16	0.10	0.10	0.13	0.10	0.05	0.14	0.25	0.15	0.09	0.13	0.26	0.14	0.14	0.11	0.09	0.06
O4'	0.01	0.08	0.02	0.03	0.03	0.03	0.13	0.03	0.15	0.14	0.04	0.07	0.29	0.19	0.04	0.02	0.12	0.02	0.21	0.22	0.26	0.18
O5'	0.19	0.20	0.16	0.20	0.14	0.22	0.09	0.18	0.08	0.11	0.10	0.22	0.19	0.13	0.15	0.16	0.29	0.22	0.09	0.07	0.06	0.05
OP1	0.16	0.17	0.13	0.17	0.11	0.22	0.05	0.20	0.04	0.06	0.08	0.18	0.15	0.08	0.12	0.10	0.24	0.21	0.02	0.01	0.05	0.05
OP2	0.15	0.14	0.10	0.16	0.08	0.22	0.06	0.21	0.08	0.07	0.03	0.16	0.24	0.14	0.09	0.07	0.23	0.22	0.02	0.03	0.05	0.06
P	0.17	0.16	0.13	0.18	0.11	0.22	0.06	0.20	0.06	0.07	0.07	0.18	0.19	0.10	0.12	0.11	0.25	0.22	0.03	0.01	0.04	0.04

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.00	0.05	0.00	0.04	0.27	0.27	0.17
C2	0.03	0.00	0.03	0.04	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.04	0.09	0.02	0.11	0.27	0.27	0.17
C2'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.04	0.03	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.30	0.32	0.20
C3'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.04	0.04	0.03	0.01	0.02	0.00	0.00	0.05	0.31	0.25	0.17
C4	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.07	0.01	0.11	0.27	0.29	0.19
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.03	0.03	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.22	0.13	0.09
C5	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.04	0.07	0.01	0.13	0.25	0.29	0.20
C5'	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.04	0.04	0.03	0.02	0.05	0.05	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.12	0.00	0.00
C6	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.08	0.01	0.13	0.25	0.28	0.19
C8	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.05	0.06	0.02	0.11	0.25	0.30	0.21
N1	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.08	0.02	0.12	0.26	0.28	0.18
N3	0.03	0.00	0.03	0.04	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.04	0.08	0.02	0.09	0.27	0.27	0.17
N6	0.02	0.01	0.04	0.04	0.01	0.03	0.02	0.05	0.01	0.03	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.06	0.09	0.02	0.13	0.22	0.26	0.18
N7	0.01	0.00	0.03	0.03	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.05	0.06	0.02	0.13	0.25	0.30	0.21
N9	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.06	0.01	0.09	0.27	0.29	0.19
O2'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.02	0.01	0.04	0.02	0.04	0.05	0.03	0.04	0.06	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.05	0.31	0.36	0.21
O3'	0.05	0.09	0.02	0.00	0.07	0.01	0.07	0.00	0.08	0.06	0.08	0.08	0.09	0.06	0.06	0.02	0.00	0.03	0.05	0.32	0.26	0.16
O4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.06	0.22	0.16	0.11
O5'	0.04	0.11	0.02	0.05	0.11	0.00	0.13	0.00	0.13	0.11	0.12	0.09	0.13	0.13	0.09	0.05	0.05	0.06	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.27	0.27	0.30	0.31	0.27	0.22	0.25	0.12	0.25	0.25	0.26	0.27	0.22	0.25	0.27	0.31	0.32	0.22	0.00	0.00	0.01	0.01
OP2	0.27	0.27	0.32	0.25	0.29	0.13	0.29	0.00	0.28	0.30	0.28	0.27	0.26	0.30	0.29	0.36	0.26	0.16	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.17	0.17	0.20	0.17	0.19	0.09	0.20	0.00	0.19	0.21	0.18	0.17	0.18	0.21	0.19	0.21	0.16	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00