Doublet Group distance statistics: 48299

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.000, 0.018, 0.036, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.018 std_dev=0.018
C6	A	0, 0.000, 0.023, 0.045, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.023 std_dev=0.023
C5	A	0, 0.000, 0.027, 0.053, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.027 std_dev=0.027
N1	A	0, 0.000, 0.032, 0.064, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.032 std_dev=0.032
N9	A	0, 0.000, 0.033, 0.066, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.033 std_dev=0.033
C8	A	0, 0.000, 0.037, 0.074, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.037 std_dev=0.037
N3	A	0, 0.000, 0.037, 0.074, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.037 std_dev=0.037
N6	A	0, 0.000, 0.042, 0.083, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.042 std_dev=0.042
C2	A	0, 0.000, 0.042, 0.084, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.042 std_dev=0.042
N7	A	0, 0.000, 0.047, 0.094, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.047 std_dev=0.047
C1'	A	0, 0.000, 0.065, 0.131, 0.131 max_d=0.131 avg_d=0.065 std_dev=0.065
C2'	A	0, 0.000, 0.088, 0.176, 0.176 max_d=0.176 avg_d=0.088 std_dev=0.088
C3'	A	0, 0.000, 0.130, 0.260, 0.260 max_d=0.260 avg_d=0.130 std_dev=0.130
OP1	B	0, 0.000, 0.139, 0.278, 0.278 max_d=0.278 avg_d=0.139 std_dev=0.139
O3'	A	0, 0.000, 0.140, 0.281, 0.281 max_d=0.281 avg_d=0.140 std_dev=0.140
O2'	A	0, 0.000, 0.142, 0.284, 0.284 max_d=0.284 avg_d=0.142 std_dev=0.142
O5'	A	0, 0.000, 0.150, 0.299, 0.299 max_d=0.299 avg_d=0.150 std_dev=0.150
O4'	A	0, 0.000, 0.161, 0.321, 0.321 max_d=0.321 avg_d=0.161 std_dev=0.161
C4'	A	0, 0.000, 0.177, 0.354, 0.354 max_d=0.354 avg_d=0.177 std_dev=0.177
N7	B	0, 0.000, 0.180, 0.359, 0.359 max_d=0.359 avg_d=0.180 std_dev=0.180
C8	B	0, 0.000, 0.197, 0.393, 0.393 max_d=0.393 avg_d=0.197 std_dev=0.197
C5'	B	0, 0.000, 0.218, 0.435, 0.435 max_d=0.435 avg_d=0.218 std_dev=0.218
C5	B	0, 0.000, 0.227, 0.454, 0.454 max_d=0.454 avg_d=0.227 std_dev=0.227
OP1	A	0, 0.000, 0.244, 0.487, 0.487 max_d=0.487 avg_d=0.244 std_dev=0.244
P	B	0, 0.000, 0.244, 0.487, 0.487 max_d=0.487 avg_d=0.244 std_dev=0.244
N1	B	0, 0.000, 0.244, 0.489, 0.489 max_d=0.489 avg_d=0.244 std_dev=0.244
N9	B	0, 0.000, 0.247, 0.493, 0.493 max_d=0.493 avg_d=0.247 std_dev=0.247
C4	B	0, 0.000, 0.247, 0.494, 0.494 max_d=0.494 avg_d=0.247 std_dev=0.247
C6	B	0, 0.000, 0.248, 0.496, 0.496 max_d=0.496 avg_d=0.248 std_dev=0.248
N6	B	0, 0.000, 0.259, 0.518, 0.518 max_d=0.518 avg_d=0.259 std_dev=0.259
C3'	B	0, 0.000, 0.260, 0.520, 0.520 max_d=0.520 avg_d=0.260 std_dev=0.260
O4'	B	0, 0.000, 0.261, 0.523, 0.523 max_d=0.523 avg_d=0.261 std_dev=0.261
P	A	0, 0.000, 0.262, 0.524, 0.524 max_d=0.524 avg_d=0.262 std_dev=0.262
C4'	B	0, 0.000, 0.266, 0.531, 0.531 max_d=0.531 avg_d=0.266 std_dev=0.266
C2	B	0, 0.000, 0.271, 0.542, 0.542 max_d=0.542 avg_d=0.271 std_dev=0.271
N3	B	0, 0.000, 0.277, 0.553, 0.553 max_d=0.553 avg_d=0.277 std_dev=0.277
C1'	B	0, 0.000, 0.287, 0.575, 0.575 max_d=0.575 avg_d=0.287 std_dev=0.287
C5'	A	0, 0.000, 0.291, 0.581, 0.581 max_d=0.581 avg_d=0.291 std_dev=0.291
C2'	B	0, 0.000, 0.314, 0.627, 0.627 max_d=0.627 avg_d=0.314 std_dev=0.314
O3'	B	0, 0.000, 0.341, 0.682, 0.682 max_d=0.682 avg_d=0.341 std_dev=0.341
O5'	B	0, 0.000, 0.341, 0.683, 0.683 max_d=0.683 avg_d=0.341 std_dev=0.341
OP2	B	0, 0.000, 0.364, 0.729, 0.729 max_d=0.729 avg_d=0.364 std_dev=0.364
OP2	A	0, 0.000, 0.388, 0.777, 0.777 max_d=0.777 avg_d=0.388 std_dev=0.388
O2'	B	0, 0.000, 0.417, 0.833, 0.833 max_d=0.833 avg_d=0.417 std_dev=0.417

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.07	0.01	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.06	0.00	0.07	0.07	0.07	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.04	0.09	0.03
C2	0.07	0.00	0.03	0.04	0.01	0.09	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.06	0.05	0.10	0.01	0.03	0.14	0.08
C2'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.04	0.03	0.04	0.03	0.06	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.00	0.11	0.07
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.04	0.04	0.05	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.09	0.01	0.08	0.07
C4	0.04	0.01	0.02	0.02	0.00	0.05	0.00	0.06	0.02	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.04	0.03	0.06	0.01	0.01	0.13	0.06
C4'	0.01	0.09	0.01	0.01	0.05	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.07	0.09	0.06	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.08	0.04	0.01
C5	0.04	0.01	0.03	0.02	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.04	0.03	0.04	0.03	0.02	0.13	0.05
C5'	0.01	0.09	0.02	0.01	0.06	0.00	0.05	0.00	0.06	0.02	0.08	0.09	0.06	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.00	0.10	0.01	0.00
C6	0.06	0.01	0.04	0.03	0.02	0.06	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.03	0.06	0.04	0.06	0.02	0.03	0.13	0.06
C8	0.00	0.00	0.03	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.03	0.03	0.01	0.04	0.02	0.14	0.05
N1	0.07	0.01	0.04	0.04	0.02	0.07	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.06	0.04	0.09	0.00	0.03	0.14	0.07
N3	0.07	0.00	0.03	0.04	0.00	0.09	0.01	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.02	0.02	0.05	0.05	0.10	0.03	0.03	0.15	0.08
N6	0.07	0.01	0.06	0.05	0.03	0.06	0.03	0.06	0.02	0.03	0.01	0.02	0.00	0.02	0.05	0.08	0.06	0.07	0.02	0.04	0.13	0.05
N7	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.02	0.00	0.00	0.03	0.02	0.00	0.05	0.02	0.13	0.03
N9	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.03	0.00	0.03	0.02	0.05	0.00	0.00	0.03	0.03	0.02	0.02	0.00	0.13	0.05
O2'	0.02	0.06	0.01	0.01	0.04	0.01	0.04	0.02	0.06	0.03	0.06	0.05	0.08	0.03	0.03	0.00	0.02	0.02	0.06	0.02	0.10	0.06
O3'	0.02	0.05	0.01	0.00	0.03	0.02	0.03	0.01	0.04	0.03	0.04	0.05	0.06	0.02	0.03	0.02	0.00	0.02	0.11	0.02	0.06	0.07
O4'	0.01	0.10	0.01	0.01	0.06	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.09	0.10	0.07	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.06	0.08	0.05	0.01
O5'	0.02	0.01	0.06	0.09	0.01	0.00	0.03	0.00	0.02	0.04	0.00	0.03	0.02	0.05	0.02	0.06	0.11	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00
OP1	0.04	0.03	0.00	0.01	0.01	0.08	0.02	0.10	0.03	0.02	0.03	0.03	0.04	0.02	0.00	0.02	0.02	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.09	0.14	0.11	0.08	0.13	0.04	0.13	0.01	0.13	0.14	0.14	0.15	0.13	0.13	0.13	0.10	0.06	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.03	0.08	0.07	0.07	0.06	0.01	0.05	0.00	0.06	0.05	0.07	0.08	0.05	0.03	0.05	0.06	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00	0.06	0.03	0.10	0.00
C2	0.06	0.09	0.05	0.06	0.02	0.09	0.07	0.06	0.12	0.00	0.12	0.04	0.14	0.04	0.01	0.07	0.07	0.10	0.09	0.11	0.23	0.12
C2'	0.03	0.03	0.02	0.01	0.04	0.01	0.03	0.05	0.03	0.01	0.03	0.03	0.03	0.01	0.02	0.04	0.01	0.02	0.05	0.03	0.09	0.00
C3'	0.01	0.00	0.00	0.03	0.02	0.02	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.06	0.04	0.08	0.00
C4	0.02	0.03	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.06	0.15	0.05
C4'	0.02	0.04	0.03	0.06	0.02	0.05	0.02	0.09	0.03	0.03	0.04	0.03	0.03	0.03	0.03	0.01	0.06	0.02	0.10	0.02	0.07	0.02
C5	0.01	0.06	0.02	0.02	0.02	0.01	0.04	0.03	0.06	0.03	0.06	0.03	0.09	0.04	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.06	0.15	0.04
C5'	0.04	0.07	0.06	0.09	0.04	0.08	0.05	0.11	0.06	0.06	0.07	0.05	0.07	0.06	0.05	0.04	0.09	0.04	0.13	0.02	0.04	0.04
C6	0.03	0.10	0.03	0.02	0.07	0.00	0.09	0.00	0.11	0.06	0.10	0.08	0.14	0.08	0.06	0.02	0.01	0.00	0.03	0.09	0.20	0.08
C8	0.00	0.01	0.00	0.03	0.02	0.03	0.01	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.04	0.00	0.07	0.04	0.08	0.00
N1	0.00	0.13	0.00	0.02	0.09	0.06	0.12	0.05	0.15	0.05	0.13	0.10	0.16	0.08	0.06	0.01	0.03	0.05	0.08	0.10	0.23	0.11
N3	0.07	0.02	0.06	0.05	0.03	0.07	0.01	0.03	0.05	0.03	0.05	0.02	0.08	0.00	0.04	0.08	0.06	0.09	0.05	0.09	0.20	0.09
N6	0.08	0.13	0.07	0.05	0.11	0.03	0.12	0.01	0.13	0.09	0.12	0.11	0.15	0.10	0.10	0.08	0.04	0.06	0.03	0.10	0.22	0.09
N7	0.02	0.03	0.03	0.05	0.01	0.05	0.02	0.07	0.03	0.02	0.03	0.02	0.06	0.03	0.02	0.03	0.06	0.02	0.08	0.04	0.09	0.00
N9	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.05	0.04	0.11	0.01
O2'	0.03	0.05	0.03	0.01	0.05	0.00	0.05	0.04	0.06	0.02	0.05	0.05	0.07	0.03	0.03	0.06	0.01	0.02	0.04	0.01	0.09	0.00
O3'	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.01	0.06	0.03	0.08	0.00
O4'	0.03	0.06	0.04	0.06	0.02	0.05	0.03	0.09	0.04	0.03	0.06	0.04	0.05	0.03	0.03	0.02	0.06	0.02	0.10	0.03	0.08	0.01
O5'	0.04	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.05	0.02	0.04	0.05	0.02	0.03	0.03	0.05	0.04	0.04	0.00	0.04	0.04	0.10	0.11	0.05
OP1	0.01	0.01	0.03	0.08	0.01	0.08	0.01	0.12	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.09	0.03	0.16	0.01	0.03	0.07
OP2	0.16	0.16	0.18	0.21	0.15	0.20	0.15	0.24	0.15	0.17	0.16	0.15	0.17	0.17	0.16	0.17	0.23	0.16	0.26	0.07	0.11	0.15
P	0.05	0.07	0.07	0.10	0.04	0.10	0.04	0.13	0.05	0.06	0.06	0.05	0.06	0.06	0.05	0.06	0.11	0.06	0.16	0.01	0.00	0.06

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.08	0.09	0.04
C2	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.04	0.03	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.00	0.05	0.01	0.01	0.03	0.05	0.10	0.03
C2'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.05	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.10	0.06	0.06
C3'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.05	0.05	0.01	0.00	0.09	0.05	0.02	0.00	0.00	0.00	0.03	0.10	0.04	0.06
C4	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.05	0.05	0.10	0.03
C4'	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.04	0.05	0.01	0.01	0.08	0.05	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.05	0.05
C5	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.04	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01	0.09	0.05	0.08	0.05
C5'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.04	0.00	0.07	0.00	0.08	0.08	0.04	0.02	0.13	0.09	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.08	0.00
C6	0.01	0.03	0.02	0.05	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.04	0.02	0.10	0.05	0.07	0.05
C8	0.01	0.01	0.02	0.05	0.00	0.05	0.01	0.08	0.02	0.00	0.00	0.01	0.05	0.00	0.00	0.02	0.05	0.02	0.10	0.04	0.08	0.05
N1	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.00	0.01	0.05	0.03	0.10	0.03
N3	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.04	0.02	0.02	0.01	0.05	0.11	0.02
N6	0.03	0.02	0.05	0.09	0.03	0.08	0.03	0.13	0.00	0.05	0.00	0.02	0.00	0.05	0.04	0.02	0.08	0.05	0.16	0.08	0.03	0.10
N7	0.01	0.02	0.02	0.05	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.05	0.01	0.11	0.04	0.07	0.05
N9	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.05	0.06	0.09	0.04
O2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.05	0.04	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.15	0.04	0.08
O3'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.04	0.05	0.00	0.02	0.08	0.05	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.16	0.01	0.09
O4'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.09	0.03
O5'	0.01	0.03	0.02	0.03	0.05	0.00	0.09	0.00	0.10	0.10	0.05	0.01	0.16	0.11	0.05	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.08	0.05	0.10	0.10	0.05	0.08	0.05	0.01	0.05	0.04	0.03	0.05	0.08	0.04	0.06	0.15	0.16	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.09	0.10	0.06	0.04	0.10	0.05	0.08	0.08	0.07	0.08	0.10	0.11	0.03	0.07	0.09	0.04	0.01	0.09	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.04	0.03	0.06	0.06	0.03	0.05	0.05	0.00	0.05	0.05	0.03	0.02	0.10	0.05	0.04	0.08	0.09	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00