Doublet Group distance statistics: 48303

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 5, 10, 14, 14, 16, 23, 9, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.007, 0.011, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.007 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.002, 0.009, 0.016, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.009 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.000, 0.009, 0.017, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.009 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.002, 0.011, 0.019, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.003, 0.012, 0.021, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.012 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.002, 0.011, 0.020, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.011 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.002, 0.012, 0.022, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.012 std_dev=0.010
N9	A	0, 0.005, 0.017, 0.029, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.017 std_dev=0.012
N6	A	0, 0.008, 0.021, 0.034, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.021 std_dev=0.013
N7	A	0, 0.005, 0.022, 0.038, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.022 std_dev=0.017
C8	A	0, 0.007, 0.027, 0.047, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.027 std_dev=0.020
O4'	A	0, -0.052, 0.078, 0.208, 0.751 max_d=0.751 avg_d=0.078 std_dev=0.130
C2'	A	0, -0.042, 0.102, 0.247, 0.841 max_d=0.841 avg_d=0.102 std_dev=0.145
O2'	A	0, -0.014, 0.156, 0.326, 1.094 max_d=1.094 avg_d=0.156 std_dev=0.170
C2'	B	0, 0.282, 0.457, 0.632, 0.811 max_d=0.811 avg_d=0.457 std_dev=0.175
C4'	A	0, -0.046, 0.136, 0.317, 1.122 max_d=1.122 avg_d=0.136 std_dev=0.181
C1'	B	0, 0.349, 0.550, 0.752, 0.948 max_d=0.948 avg_d=0.550 std_dev=0.202
C3'	A	0, -0.051, 0.165, 0.381, 1.297 max_d=1.297 avg_d=0.165 std_dev=0.216
O2'	B	0, 0.316, 0.538, 0.759, 0.950 max_d=0.950 avg_d=0.538 std_dev=0.222
N1	B	0, 0.324, 0.580, 0.837, 1.551 max_d=1.551 avg_d=0.580 std_dev=0.257
O2	B	0, 0.320, 0.577, 0.834, 1.612 max_d=1.612 avg_d=0.577 std_dev=0.257
C3'	B	0, 0.338, 0.605, 0.873, 1.150 max_d=1.150 avg_d=0.605 std_dev=0.268
C2	B	0, 0.326, 0.629, 0.932, 1.631 max_d=1.631 avg_d=0.629 std_dev=0.303
O3'	A	0, -0.057, 0.249, 0.555, 1.808 max_d=1.808 avg_d=0.249 std_dev=0.306
O4'	B	0, 0.441, 0.757, 1.072, 1.478 max_d=1.478 avg_d=0.757 std_dev=0.316
C6	B	0, 0.365, 0.698, 1.031, 2.253 max_d=2.253 avg_d=0.698 std_dev=0.333
C5'	A	0, -0.123, 0.212, 0.547, 2.073 max_d=2.073 avg_d=0.212 std_dev=0.335
C4'	B	0, 0.441, 0.794, 1.146, 1.361 max_d=1.361 avg_d=0.794 std_dev=0.352
O5'	A	0, -0.114, 0.247, 0.608, 2.286 max_d=2.286 avg_d=0.247 std_dev=0.361
O5'	B	0, 0.491, 0.857, 1.222, 1.815 max_d=1.815 avg_d=0.857 std_dev=0.366
O3'	B	0, 0.359, 0.748, 1.138, 1.522 max_d=1.522 avg_d=0.748 std_dev=0.390
N3	B	0, 0.387, 0.827, 1.267, 2.329 max_d=2.329 avg_d=0.827 std_dev=0.440
C5	B	0, 0.360, 0.812, 1.265, 2.967 max_d=2.967 avg_d=0.812 std_dev=0.452
C5'	B	0, 0.510, 0.967, 1.424, 2.031 max_d=2.031 avg_d=0.967 std_dev=0.457
P	B	0, 0.567, 1.047, 1.526, 2.365 max_d=2.365 avg_d=1.047 std_dev=0.479
OP1	B	0, 0.677, 1.167, 1.658, 2.373 max_d=2.373 avg_d=1.167 std_dev=0.490
P	A	0, -0.147, 0.361, 0.869, 2.898 max_d=2.898 avg_d=0.361 std_dev=0.508
C4	B	0, 0.373, 0.891, 1.409, 3.003 max_d=3.003 avg_d=0.891 std_dev=0.518
OP2	B	0, 0.506, 1.025, 1.545, 2.903 max_d=2.903 avg_d=1.025 std_dev=0.520
OP2	A	0, -0.074, 0.491, 1.056, 3.276 max_d=3.276 avg_d=0.491 std_dev=0.565
OP1	A	0, -0.170, 0.419, 1.008, 3.264 max_d=3.264 avg_d=0.419 std_dev=0.589
N4	B	0, 0.449, 1.115, 1.780, 3.741 max_d=3.741 avg_d=1.115 std_dev=0.665

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.11	0.11	0.05	0.09
C2	0.02	0.00	0.09	0.10	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.13	0.04	0.19	0.18	0.15	0.18
C2'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.05	0.01	0.03	0.02	0.04	0.06	0.07	0.09	0.05	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.11	0.13	0.06	0.09
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.06	0.01	0.05	0.02	0.06	0.08	0.08	0.10	0.06	0.07	0.03	0.02	0.01	0.01	0.13	0.15	0.06	0.10
C4	0.01	0.01	0.05	0.06	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.06	0.03	0.19	0.18	0.14	0.18
C4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.04	0.03	0.03	0.04	0.04	0.02	0.04	0.02	0.00	0.01	0.07	0.11	0.02
C5	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.06	0.02	0.24	0.23	0.20	0.23
C5'	0.02	0.05	0.02	0.02	0.04	0.01	0.05	0.00	0.06	0.06	0.05	0.04	0.06	0.06	0.04	0.03	0.02	0.02	0.01	0.10	0.17	0.01
C6	0.02	0.01	0.04	0.06	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.08	0.03	0.24	0.23	0.21	0.24
C8	0.01	0.01	0.06	0.08	0.00	0.04	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.04	0.09	0.03	0.25	0.22	0.16	0.21
N1	0.02	0.00	0.07	0.08	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.11	0.04	0.22	0.21	0.19	0.21
N3	0.02	0.00	0.09	0.10	0.01	0.03	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.12	0.04	0.17	0.16	0.12	0.16
N6	0.02	0.01	0.05	0.06	0.01	0.04	0.01	0.06	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.05	0.08	0.03	0.27	0.27	0.26	0.27
N7	0.01	0.01	0.05	0.07	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.04	0.08	0.02	0.27	0.25	0.22	0.25
N9	0.00	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.03	0.01	0.19	0.17	0.11	0.16
O2'	0.02	0.08	0.00	0.02	0.04	0.04	0.04	0.03	0.05	0.04	0.07	0.08	0.05	0.04	0.02	0.00	0.05	0.04	0.04	0.08	0.07	0.04
O3'	0.02	0.13	0.02	0.01	0.06	0.02	0.06	0.02	0.08	0.09	0.11	0.12	0.08	0.08	0.03	0.05	0.00	0.02	0.09	0.14	0.09	0.09
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.02	0.03	0.03	0.04	0.04	0.03	0.02	0.01	0.04	0.02	0.00	0.07	0.09	0.08	0.06
O5'	0.11	0.19	0.11	0.13	0.19	0.01	0.24	0.01	0.24	0.25	0.22	0.17	0.27	0.27	0.19	0.04	0.09	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.11	0.18	0.13	0.15	0.18	0.07	0.23	0.10	0.23	0.22	0.21	0.16	0.27	0.25	0.17	0.08	0.14	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.05	0.15	0.06	0.06	0.14	0.11	0.20	0.17	0.21	0.16	0.19	0.12	0.26	0.22	0.11	0.07	0.09	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.18	0.09	0.10	0.18	0.02	0.23	0.01	0.24	0.21	0.21	0.16	0.27	0.25	0.16	0.04	0.09	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.14	0.17	0.19	0.20	0.15	0.18	0.14	0.15	0.13	0.19	0.24	0.13	0.21	0.26	0.15	0.14	0.14	0.17	0.12
C2	0.18	0.15	0.21	0.25	0.15	0.24	0.15	0.24	0.16	0.15	0.16	0.17	0.16	0.26	0.31	0.20	0.22	0.24	0.21	0.21
C2'	0.12	0.14	0.14	0.15	0.19	0.13	0.16	0.13	0.13	0.13	0.18	0.22	0.14	0.17	0.21	0.16	0.13	0.13	0.15	0.10
C3'	0.12	0.15	0.12	0.12	0.19	0.13	0.17	0.14	0.14	0.13	0.18	0.23	0.14	0.15	0.17	0.18	0.14	0.13	0.18	0.12
C4	0.14	0.14	0.18	0.20	0.17	0.16	0.15	0.16	0.14	0.13	0.17	0.20	0.14	0.22	0.26	0.15	0.16	0.16	0.17	0.14
C4'	0.13	0.15	0.14	0.15	0.21	0.12	0.19	0.13	0.15	0.14	0.20	0.25	0.13	0.18	0.22	0.17	0.14	0.13	0.19	0.12
C5	0.13	0.14	0.17	0.17	0.17	0.15	0.15	0.14	0.14	0.13	0.17	0.19	0.14	0.20	0.22	0.15	0.15	0.15	0.17	0.12
C5'	0.12	0.14	0.14	0.14	0.21	0.11	0.19	0.13	0.15	0.13	0.19	0.26	0.12	0.18	0.21	0.18	0.13	0.12	0.20	0.13
C6	0.15	0.14	0.18	0.19	0.15	0.18	0.15	0.17	0.15	0.14	0.16	0.16	0.16	0.22	0.23	0.17	0.17	0.18	0.18	0.16
C8	0.13	0.15	0.15	0.15	0.20	0.13	0.18	0.14	0.15	0.14	0.19	0.24	0.13	0.18	0.20	0.17	0.13	0.13	0.18	0.12
N1	0.18	0.15	0.21	0.24	0.15	0.24	0.15	0.24	0.16	0.16	0.16	0.16	0.17	0.25	0.28	0.21	0.22	0.23	0.21	0.21
N3	0.15	0.14	0.20	0.23	0.16	0.20	0.15	0.20	0.15	0.14	0.16	0.19	0.15	0.24	0.29	0.17	0.19	0.20	0.19	0.17
N6	0.15	0.16	0.16	0.17	0.16	0.16	0.15	0.16	0.15	0.15	0.17	0.17	0.18	0.19	0.19	0.17	0.17	0.16	0.18	0.15
N7	0.13	0.14	0.14	0.14	0.19	0.13	0.17	0.14	0.15	0.13	0.18	0.22	0.13	0.17	0.19	0.17	0.13	0.13	0.17	0.12
N9	0.13	0.14	0.17	0.18	0.19	0.14	0.17	0.14	0.14	0.13	0.18	0.23	0.13	0.21	0.24	0.15	0.14	0.14	0.17	0.12
O2'	0.13	0.15	0.17	0.18	0.20	0.14	0.17	0.14	0.14	0.13	0.19	0.24	0.14	0.20	0.25	0.15	0.14	0.15	0.15	0.11
O3'	0.13	0.16	0.11	0.11	0.20	0.13	0.18	0.16	0.15	0.14	0.19	0.23	0.15	0.13	0.16	0.19	0.15	0.15	0.18	0.14
O4'	0.14	0.16	0.18	0.19	0.23	0.15	0.20	0.14	0.17	0.15	0.21	0.27	0.14	0.22	0.27	0.17	0.15	0.15	0.19	0.13
O5'	0.34	0.36	0.34	0.34	0.37	0.34	0.36	0.35	0.35	0.35	0.36	0.39	0.36	0.36	0.36	0.36	0.35	0.35	0.36	0.34
OP1	0.35	0.38	0.34	0.34	0.40	0.36	0.39	0.38	0.38	0.37	0.39	0.42	0.38	0.35	0.35	0.39	0.39	0.39	0.41	0.39
OP2	0.35	0.38	0.33	0.34	0.40	0.35	0.39	0.38	0.37	0.37	0.39	0.41	0.38	0.34	0.34	0.38	0.39	0.38	0.41	0.38
P	0.34	0.37	0.34	0.34	0.39	0.34	0.38	0.36	0.36	0.36	0.38	0.40	0.36	0.36	0.36	0.37	0.37	0.37	0.39	0.37

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.06	0.06	0.09	0.05
C2	0.01	0.00	0.07	0.06	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.08	0.04	0.13	0.11	0.22	0.15
C2'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.07	0.02	0.06	0.03	0.13	0.00	0.01	0.01	0.10	0.11	0.12	0.07
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.04	0.00	0.07	0.02	0.08	0.03	0.05	0.04	0.10	0.01	0.01	0.01	0.13	0.14	0.14	0.11
C4	0.02	0.01	0.03	0.04	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.05	0.04	0.19	0.21	0.34	0.25
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.05	0.02	0.03	0.05	0.03	0.03	0.01	0.00	0.02	0.08	0.06	0.04
C5	0.02	0.01	0.05	0.07	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.08	0.05	0.21	0.23	0.34	0.27
C5'	0.01	0.04	0.01	0.02	0.07	0.00	0.08	0.00	0.07	0.04	0.06	0.08	0.04	0.03	0.03	0.01	0.01	0.06	0.11	0.02
C6	0.01	0.01	0.07	0.08	0.01	0.05	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.09	0.05	0.18	0.18	0.26	0.21
N1	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	0.02	0.13	0.11	0.19	0.14
N3	0.02	0.00	0.06	0.05	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.07	0.04	0.16	0.16	0.29	0.20
N4	0.02	0.01	0.03	0.04	0.00	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.05	0.04	0.20	0.25	0.38	0.28
O2	0.02	0.00	0.13	0.10	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.12	0.13	0.07	0.10	0.08	0.18	0.10
O2'	0.02	0.07	0.00	0.01	0.04	0.03	0.05	0.03	0.05	0.03	0.07	0.05	0.12	0.00	0.03	0.03	0.04	0.12	0.07	0.05
O3'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.05	0.01	0.08	0.03	0.09	0.03	0.07	0.05	0.13	0.03	0.00	0.01	0.12	0.19	0.14	0.12
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.04	0.04	0.07	0.03	0.01	0.00	0.05	0.07	0.09	0.07
O5'	0.06	0.13	0.10	0.13	0.19	0.02	0.21	0.01	0.18	0.13	0.16	0.20	0.10	0.04	0.12	0.05	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.06	0.11	0.11	0.14	0.21	0.08	0.23	0.06	0.18	0.11	0.16	0.25	0.08	0.12	0.19	0.07	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.09	0.22	0.12	0.14	0.34	0.06	0.34	0.11	0.26	0.19	0.29	0.38	0.18	0.07	0.14	0.09	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.05	0.15	0.07	0.11	0.25	0.04	0.27	0.02	0.21	0.14	0.20	0.28	0.10	0.05	0.12	0.07	0.00	0.01	0.01	0.00