Doublet Group distance statistics: 48316

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 4, 0, 0, 1, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.002, 0.005, 0.008, 0.009 max_d=0.009 avg_d=0.005 std_dev=0.003
C6	A	0, 0.005, 0.010, 0.015, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.010 std_dev=0.005
C1'	A	0, 0.005, 0.012, 0.018, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.012 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.007, 0.015, 0.023, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.015 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.008, 0.017, 0.026, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.017 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.007, 0.019, 0.030, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.019 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.009, 0.023, 0.037, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.023 std_dev=0.014
N9	A	0, 0.012, 0.027, 0.041, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.027 std_dev=0.015
N6	A	0, 0.013, 0.034, 0.056, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.034 std_dev=0.022
N7	A	0, 0.017, 0.042, 0.066, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.042 std_dev=0.024
C8	A	0, 0.021, 0.048, 0.075, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.048 std_dev=0.027
O4'	A	0, -0.035, 0.097, 0.230, 0.481 max_d=0.481 avg_d=0.097 std_dev=0.133
C2'	A	0, -0.007, 0.132, 0.272, 0.523 max_d=0.523 avg_d=0.132 std_dev=0.139
C4'	A	0, -0.028, 0.179, 0.385, 0.772 max_d=0.772 avg_d=0.179 std_dev=0.207
O2'	A	0, -0.001, 0.207, 0.416, 0.785 max_d=0.785 avg_d=0.207 std_dev=0.209
C3'	A	0, -0.012, 0.204, 0.420, 0.816 max_d=0.816 avg_d=0.204 std_dev=0.216
C2'	B	0, 0.087, 0.327, 0.567, 0.730 max_d=0.730 avg_d=0.327 std_dev=0.240
N1	B	0, 0.144, 0.390, 0.636, 0.864 max_d=0.864 avg_d=0.390 std_dev=0.246
C1'	B	0, 0.072, 0.338, 0.604, 0.809 max_d=0.809 avg_d=0.338 std_dev=0.266
O2'	B	0, 0.052, 0.361, 0.670, 1.019 max_d=1.019 avg_d=0.361 std_dev=0.309
C4	B	0, 0.287, 0.602, 0.916, 1.201 max_d=1.201 avg_d=0.602 std_dev=0.314
C3'	B	0, 0.041, 0.360, 0.679, 1.115 max_d=1.115 avg_d=0.360 std_dev=0.319
C5'	A	0, -0.030, 0.295, 0.620, 1.232 max_d=1.232 avg_d=0.295 std_dev=0.325
C2	B	0, 0.102, 0.444, 0.787, 1.276 max_d=1.276 avg_d=0.444 std_dev=0.342
O4'	B	0, 0.036, 0.383, 0.731, 1.204 max_d=1.204 avg_d=0.383 std_dev=0.347
O3'	A	0, -0.009, 0.340, 0.688, 1.314 max_d=1.314 avg_d=0.340 std_dev=0.348
N4	B	0, 0.385, 0.735, 1.085, 1.355 max_d=1.355 avg_d=0.735 std_dev=0.350
C6	B	0, 0.263, 0.621, 0.978, 1.136 max_d=1.136 avg_d=0.621 std_dev=0.357
O5'	A	0, -0.040, 0.322, 0.685, 1.362 max_d=1.362 avg_d=0.322 std_dev=0.363
N3	B	0, 0.188, 0.554, 0.919, 1.389 max_d=1.389 avg_d=0.554 std_dev=0.365
C5	B	0, 0.344, 0.714, 1.085, 1.313 max_d=1.313 avg_d=0.714 std_dev=0.370
OP2	A	0, 0.024, 0.419, 0.813, 1.486 max_d=1.486 avg_d=0.419 std_dev=0.395
C4'	B	0, -0.016, 0.383, 0.781, 1.421 max_d=1.421 avg_d=0.383 std_dev=0.399
O3'	B	0, 0.001, 0.407, 0.812, 1.489 max_d=1.489 avg_d=0.407 std_dev=0.405
C5'	B	0, -0.037, 0.431, 0.898, 1.676 max_d=1.676 avg_d=0.431 std_dev=0.467
P	A	0, -0.063, 0.416, 0.895, 1.786 max_d=1.786 avg_d=0.416 std_dev=0.479
O5'	B	0, 0.017, 0.586, 1.154, 2.084 max_d=2.084 avg_d=0.586 std_dev=0.569
O2	B	0, -0.135, 0.475, 1.085, 2.254 max_d=2.254 avg_d=0.475 std_dev=0.610
OP1	A	0, -0.148, 0.466, 1.081, 2.235 max_d=2.235 avg_d=0.466 std_dev=0.614
OP1	B	0, 0.097, 0.738, 1.378, 2.319 max_d=2.319 avg_d=0.738 std_dev=0.640
P	B	0, 0.055, 0.732, 1.409, 2.442 max_d=2.442 avg_d=0.732 std_dev=0.677
OP2	B	0, 0.104, 0.786, 1.469, 2.397 max_d=2.397 avg_d=0.786 std_dev=0.683

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.07	0.08	0.07	0.07
C2	0.01	0.00	0.12	0.09	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.16	0.14	0.05	0.12	0.13	0.17	0.15
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.07	0.01	0.06	0.02	0.09	0.04	0.11	0.11	0.08	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.07	0.05	0.03
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.03	0.00	0.03	0.02	0.05	0.09	0.08	0.07	0.05	0.05	0.03	0.02	0.01	0.01	0.04	0.08	0.06	0.04
C4	0.00	0.00	0.07	0.03	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.08	0.06	0.03	0.13	0.14	0.16	0.15
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.02	0.05	0.02	0.02	0.03	0.05	0.03	0.04	0.02	0.00	0.01	0.06	0.01	0.01
C5	0.00	0.00	0.06	0.03	0.00	0.03	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.07	0.04	0.03	0.16	0.18	0.20	0.19
C5'	0.02	0.05	0.02	0.02	0.06	0.00	0.09	0.00	0.08	0.10	0.07	0.05	0.09	0.11	0.06	0.04	0.04	0.02	0.01	0.06	0.01	0.01
C6	0.01	0.00	0.09	0.05	0.00	0.02	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.11	0.08	0.04	0.16	0.18	0.22	0.20
C8	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.10	0.01	0.17	0.18	0.17	0.17
N1	0.01	0.00	0.11	0.08	0.01	0.02	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.14	0.13	0.04	0.14	0.15	0.20	0.18
N3	0.01	0.00	0.11	0.07	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.14	0.12	0.04	0.11	0.12	0.15	0.13
N6	0.01	0.00	0.08	0.05	0.01	0.03	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.10	0.08	0.04	0.17	0.20	0.24	0.22
N7	0.01	0.01	0.02	0.05	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.06	0.02	0.18	0.20	0.22	0.21
N9	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.13	0.13	0.13	0.13
O2'	0.02	0.16	0.00	0.02	0.08	0.04	0.07	0.04	0.11	0.03	0.14	0.14	0.10	0.02	0.01	0.00	0.05	0.05	0.04	0.08	0.05	0.04
O3'	0.01	0.14	0.02	0.01	0.06	0.02	0.04	0.04	0.08	0.10	0.13	0.12	0.08	0.06	0.02	0.05	0.00	0.01	0.07	0.13	0.10	0.08
O4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.02	0.04	0.01	0.04	0.04	0.04	0.02	0.01	0.05	0.01	0.00	0.06	0.08	0.06	0.06
O5'	0.07	0.12	0.03	0.04	0.13	0.01	0.16	0.01	0.16	0.17	0.14	0.11	0.17	0.18	0.13	0.04	0.07	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.08	0.13	0.07	0.08	0.14	0.06	0.18	0.06	0.18	0.18	0.15	0.12	0.20	0.20	0.13	0.08	0.13	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.07	0.17	0.05	0.06	0.16	0.01	0.20	0.01	0.22	0.17	0.20	0.15	0.24	0.22	0.13	0.05	0.10	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.15	0.03	0.04	0.15	0.01	0.19	0.01	0.20	0.17	0.18	0.13	0.22	0.21	0.13	0.04	0.08	0.06	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.22	0.15	0.15	0.11	0.17	0.15	0.17	0.11	0.11	0.17	0.13	0.41	0.16	0.16	0.18	0.27	0.25	0.29	0.29
C2	0.11	0.13	0.15	0.16	0.09	0.16	0.13	0.17	0.11	0.08	0.09	0.10	0.26	0.15	0.19	0.14	0.15	0.15	0.16	0.16
C2'	0.12	0.16	0.14	0.14	0.15	0.14	0.18	0.14	0.14	0.11	0.14	0.18	0.29	0.15	0.16	0.14	0.19	0.19	0.22	0.21
C3'	0.16	0.21	0.16	0.16	0.15	0.18	0.16	0.18	0.12	0.14	0.18	0.17	0.33	0.17	0.17	0.19	0.27	0.26	0.30	0.30
C4	0.14	0.19	0.15	0.15	0.09	0.17	0.14	0.17	0.11	0.10	0.13	0.12	0.37	0.17	0.17	0.17	0.24	0.23	0.25	0.25
C4'	0.19	0.26	0.17	0.17	0.12	0.20	0.12	0.20	0.09	0.15	0.21	0.13	0.43	0.18	0.17	0.21	0.34	0.32	0.38	0.36
C5	0.15	0.19	0.16	0.16	0.10	0.18	0.15	0.18	0.11	0.10	0.12	0.12	0.38	0.18	0.17	0.17	0.27	0.26	0.27	0.29
C5'	0.26	0.34	0.22	0.21	0.15	0.26	0.08	0.26	0.09	0.22	0.29	0.13	0.51	0.24	0.20	0.28	0.46	0.44	0.50	0.49
C6	0.13	0.15	0.17	0.17	0.09	0.18	0.13	0.18	0.10	0.09	0.09	0.12	0.30	0.19	0.19	0.16	0.23	0.23	0.23	0.24
C8	0.17	0.24	0.16	0.15	0.12	0.18	0.17	0.18	0.12	0.13	0.18	0.15	0.45	0.18	0.16	0.20	0.33	0.31	0.34	0.35
N1	0.11	0.12	0.16	0.17	0.09	0.17	0.13	0.17	0.11	0.09	0.09	0.11	0.23	0.16	0.20	0.14	0.17	0.17	0.17	0.17
N3	0.12	0.16	0.14	0.15	0.09	0.16	0.14	0.17	0.11	0.09	0.11	0.11	0.32	0.15	0.17	0.15	0.19	0.18	0.20	0.19
N6	0.14	0.13	0.19	0.19	0.10	0.19	0.12	0.19	0.10	0.09	0.09	0.12	0.28	0.22	0.21	0.17	0.26	0.27	0.24	0.27
N7	0.17	0.23	0.16	0.16	0.12	0.18	0.17	0.18	0.12	0.12	0.16	0.15	0.45	0.19	0.17	0.20	0.33	0.32	0.33	0.35
N9	0.16	0.22	0.15	0.15	0.11	0.17	0.16	0.17	0.11	0.11	0.16	0.13	0.41	0.17	0.17	0.18	0.28	0.27	0.30	0.30
O2'	0.10	0.15	0.14	0.14	0.15	0.12	0.19	0.12	0.16	0.10	0.13	0.18	0.27	0.13	0.17	0.11	0.14	0.14	0.17	0.17
O3'	0.15	0.19	0.16	0.16	0.18	0.17	0.18	0.17	0.14	0.14	0.19	0.21	0.29	0.16	0.16	0.17	0.23	0.23	0.27	0.26
O4'	0.19	0.27	0.17	0.17	0.11	0.19	0.13	0.19	0.09	0.14	0.22	0.12	0.47	0.19	0.17	0.21	0.35	0.33	0.38	0.37
O5'	0.32	0.38	0.28	0.27	0.18	0.32	0.11	0.33	0.14	0.27	0.32	0.15	0.55	0.31	0.25	0.35	0.54	0.53	0.57	0.57
OP1	0.38	0.45	0.33	0.32	0.28	0.38	0.20	0.39	0.24	0.35	0.41	0.25	0.58	0.35	0.30	0.41	0.65	0.64	0.70	0.69
OP2	0.42	0.48	0.36	0.34	0.27	0.41	0.20	0.42	0.25	0.37	0.42	0.22	0.63	0.39	0.31	0.45	0.69	0.69	0.72	0.73
P	0.40	0.48	0.35	0.34	0.27	0.40	0.19	0.40	0.23	0.36	0.43	0.23	0.64	0.38	0.31	0.43	0.67	0.66	0.71	0.70

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.17	0.17	0.08	0.17
C2	0.01	0.00	0.09	0.07	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.09	0.08	0.06	0.28	0.27	0.21	0.27
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.03	0.01	0.09	0.02	0.11	0.01	0.06	0.03	0.17	0.00	0.01	0.01	0.22	0.20	0.14	0.20
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.06	0.00	0.09	0.02	0.09	0.03	0.07	0.06	0.11	0.01	0.00	0.01	0.27	0.24	0.14	0.23
C4	0.01	0.00	0.03	0.06	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.06	0.03	0.55	0.54	0.57	0.60
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.07	0.03	0.04	0.06	0.03	0.04	0.02	0.00	0.01	0.07	0.13	0.02
C5	0.01	0.01	0.09	0.09	0.00	0.07	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.07	0.11	0.07	0.68	0.65	0.72	0.75
C5'	0.02	0.06	0.02	0.02	0.10	0.01	0.13	0.00	0.13	0.06	0.08	0.11	0.07	0.04	0.04	0.01	0.01	0.10	0.23	0.01
C6	0.01	0.01	0.11	0.09	0.01	0.07	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.11	0.09	0.63	0.56	0.56	0.64
N1	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.37	0.33	0.27	0.36
N3	0.01	0.00	0.06	0.07	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.07	0.04	0.39	0.37	0.35	0.40
N4	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.07	0.03	0.59	0.60	0.65	0.66
O2	0.02	0.00	0.17	0.11	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.18	0.15	0.11	0.12	0.12	0.07	0.10
O2'	0.02	0.09	0.00	0.01	0.02	0.04	0.07	0.04	0.08	0.02	0.07	0.02	0.18	0.00	0.03	0.04	0.05	0.08	0.03	0.06
O3'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.06	0.02	0.11	0.04	0.11	0.03	0.07	0.07	0.15	0.03	0.00	0.01	0.19	0.21	0.13	0.18
O4'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.03	0.00	0.07	0.01	0.09	0.02	0.04	0.03	0.11	0.04	0.01	0.00	0.05	0.10	0.14	0.08
O5'	0.17	0.28	0.22	0.27	0.55	0.01	0.68	0.01	0.63	0.37	0.39	0.59	0.12	0.05	0.19	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.17	0.27	0.20	0.24	0.54	0.07	0.65	0.10	0.56	0.33	0.37	0.60	0.12	0.08	0.21	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.08	0.21	0.14	0.14	0.57	0.13	0.72	0.23	0.56	0.27	0.35	0.65	0.07	0.03	0.13	0.14	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.17	0.27	0.20	0.23	0.60	0.02	0.75	0.01	0.64	0.36	0.40	0.66	0.10	0.06	0.18	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00