Doublet Group distance statistics: 48319

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.003, 0.008, 0.013, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.008 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.006, 0.014, 0.022, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.014 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.005, 0.015, 0.025, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.015 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.008, 0.021, 0.034, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.021 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.010, 0.025, 0.039, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.025 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.006, 0.022, 0.037, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.022 std_dev=0.016
N9	A	0, 0.011, 0.030, 0.049, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.030 std_dev=0.019
C4	A	0, 0.004, 0.024, 0.044, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.024 std_dev=0.020
N7	A	0, 0.011, 0.038, 0.065, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.038 std_dev=0.027
N6	A	0, 0.017, 0.044, 0.071, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.044 std_dev=0.027
C8	A	0, 0.007, 0.039, 0.072, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.039 std_dev=0.032
C2'	A	0, -0.014, 0.107, 0.229, 0.298 max_d=0.298 avg_d=0.107 std_dev=0.122
O4'	A	0, 0.007, 0.158, 0.310, 0.377 max_d=0.377 avg_d=0.158 std_dev=0.152
C4'	A	0, 0.105, 0.349, 0.594, 0.586 max_d=0.586 avg_d=0.349 std_dev=0.244
C3'	A	0, 0.134, 0.473, 0.812, 0.829 max_d=0.829 avg_d=0.473 std_dev=0.339
O2'	A	0, 0.040, 0.395, 0.751, 0.883 max_d=0.883 avg_d=0.395 std_dev=0.356
C5'	A	0, 0.119, 0.479, 0.839, 0.917 max_d=0.917 avg_d=0.479 std_dev=0.360
O5'	A	0, 0.109, 0.537, 0.964, 1.065 max_d=1.065 avg_d=0.537 std_dev=0.428
O3'	B	0, 0.113, 0.544, 0.976, 1.117 max_d=1.117 avg_d=0.544 std_dev=0.431
O2'	B	0, 0.198, 0.636, 1.073, 1.030 max_d=1.030 avg_d=0.636 std_dev=0.437
C3'	B	0, 0.112, 0.575, 1.038, 1.186 max_d=1.186 avg_d=0.575 std_dev=0.463
C4'	B	0, 0.197, 0.662, 1.127, 1.137 max_d=1.137 avg_d=0.662 std_dev=0.465
C2'	B	0, 0.170, 0.664, 1.159, 1.249 max_d=1.249 avg_d=0.664 std_dev=0.494
OP2	A	0, 0.236, 0.731, 1.225, 1.176 max_d=1.176 avg_d=0.731 std_dev=0.494
C5'	B	0, 0.234, 0.734, 1.234, 1.194 max_d=1.194 avg_d=0.734 std_dev=0.500
P	A	0, 0.140, 0.671, 1.202, 1.352 max_d=1.352 avg_d=0.671 std_dev=0.531
O4'	B	0, 0.221, 0.772, 1.323, 1.311 max_d=1.311 avg_d=0.772 std_dev=0.551
C1'	B	0, 0.223, 0.797, 1.370, 1.390 max_d=1.390 avg_d=0.797 std_dev=0.574
N1	B	0, 0.236, 0.867, 1.498, 1.565 max_d=1.565 avg_d=0.867 std_dev=0.631
O2	B	0, 0.254, 0.896, 1.537, 1.610 max_d=1.610 avg_d=0.896 std_dev=0.641
C2	B	0, 0.245, 0.891, 1.538, 1.625 max_d=1.625 avg_d=0.891 std_dev=0.647
C6	B	0, 0.248, 0.898, 1.548, 1.610 max_d=1.610 avg_d=0.898 std_dev=0.650
N3	B	0, 0.251, 0.916, 1.582, 1.691 max_d=1.691 avg_d=0.916 std_dev=0.666
C5	B	0, 0.254, 0.923, 1.593, 1.690 max_d=1.690 avg_d=0.923 std_dev=0.670
C4	B	0, 0.249, 0.925, 1.600, 1.723 max_d=1.723 avg_d=0.925 std_dev=0.676
OP1	B	0, 0.290, 0.970, 1.651, 1.750 max_d=1.750 avg_d=0.970 std_dev=0.681
OP1	A	0, 0.240, 0.926, 1.612, 1.767 max_d=1.767 avg_d=0.926 std_dev=0.686
N4	B	0, 0.254, 0.954, 1.653, 1.796 max_d=1.796 avg_d=0.954 std_dev=0.700
O3'	A	0, 0.126, 0.826, 1.526, 1.782 max_d=1.782 avg_d=0.826 std_dev=0.700
P	B	0, 0.317, 1.022, 1.727, 1.718 max_d=1.718 avg_d=1.022 std_dev=0.705
OP2	B	0, 0.358, 1.074, 1.791, 1.621 max_d=1.621 avg_d=1.074 std_dev=0.716
O5'	B	0, 0.288, 1.029, 1.770, 1.852 max_d=1.852 avg_d=1.029 std_dev=0.741

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.08	0.00	0.06	0.08	0.05	0.05
C2	0.01	0.00	0.08	0.10	0.00	0.03	0.01	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.28	0.10	0.04	0.04	0.05	0.14	0.09
C2'	0.00	0.08	0.00	0.02	0.05	0.02	0.02	0.04	0.03	0.02	0.05	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.09	0.01	0.04	0.11	0.10	0.07
C3'	0.02	0.10	0.02	0.00	0.13	0.02	0.19	0.01	0.18	0.23	0.14	0.09	0.22	0.24	0.15	0.02	0.02	0.00	0.14	0.02	0.09	0.09
C4	0.01	0.00	0.05	0.13	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.18	0.15	0.02	0.04	0.05	0.13	0.09
C4'	0.01	0.03	0.02	0.02	0.06	0.00	0.09	0.00	0.09	0.12	0.06	0.02	0.11	0.12	0.07	0.17	0.06	0.00	0.01	0.07	0.02	0.01
C5	0.01	0.01	0.02	0.19	0.00	0.09	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.17	0.25	0.02	0.08	0.11	0.19	0.13
C5'	0.01	0.05	0.04	0.01	0.07	0.00	0.10	0.00	0.11	0.12	0.08	0.04	0.14	0.13	0.06	0.12	0.18	0.02	0.01	0.10	0.03	0.01
C6	0.01	0.00	0.03	0.18	0.01	0.09	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.22	0.23	0.02	0.09	0.13	0.22	0.15
C8	0.02	0.00	0.02	0.23	0.00	0.12	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.33	0.06	0.07	0.09	0.16	0.10
N1	0.01	0.00	0.05	0.14	0.01	0.06	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.26	0.15	0.03	0.07	0.10	0.20	0.13
N3	0.01	0.00	0.08	0.09	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.26	0.09	0.05	0.04	0.03	0.11	0.08
N6	0.02	0.01	0.01	0.22	0.01	0.11	0.01	0.14	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.20	0.29	0.03	0.12	0.19	0.28	0.19
N7	0.02	0.01	0.01	0.24	0.01	0.12	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.09	0.35	0.05	0.10	0.14	0.22	0.14
N9	0.01	0.00	0.01	0.15	0.00	0.07	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.07	0.18	0.01	0.05	0.05	0.11	0.07
O2'	0.02	0.28	0.00	0.02	0.18	0.17	0.17	0.12	0.22	0.04	0.26	0.26	0.20	0.09	0.07	0.00	0.29	0.14	0.07	0.02	0.05	0.03
O3'	0.08	0.10	0.09	0.02	0.15	0.06	0.25	0.18	0.23	0.33	0.15	0.09	0.29	0.35	0.18	0.29	0.00	0.09	0.31	0.34	0.51	0.38
O4'	0.00	0.04	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.06	0.03	0.05	0.03	0.05	0.01	0.14	0.09	0.00	0.10	0.11	0.04	0.06
O5'	0.06	0.04	0.04	0.14	0.04	0.01	0.08	0.01	0.09	0.07	0.07	0.04	0.12	0.10	0.05	0.07	0.31	0.10	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.08	0.05	0.11	0.02	0.05	0.07	0.11	0.10	0.13	0.09	0.10	0.03	0.19	0.14	0.05	0.02	0.34	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.05	0.14	0.10	0.09	0.13	0.02	0.19	0.03	0.22	0.16	0.20	0.11	0.28	0.22	0.11	0.05	0.51	0.04	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.05	0.09	0.07	0.09	0.09	0.01	0.13	0.01	0.15	0.10	0.13	0.08	0.19	0.14	0.07	0.03	0.38	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.09	0.06	0.05	0.10	0.09	0.15	0.12	0.29	0.13	0.09	0.06	0.09	0.07	0.07	0.08	0.10	0.08	0.13	0.04	0.05
C2	0.21	0.15	0.18	0.15	0.18	0.23	0.23	0.29	0.24	0.20	0.14	0.17	0.09	0.19	0.16	0.23	0.19	0.15	0.14	0.18
C2'	0.13	0.11	0.11	0.14	0.12	0.16	0.15	0.26	0.16	0.13	0.10	0.12	0.11	0.12	0.13	0.12	0.01	0.19	0.10	0.11
C3'	0.21	0.17	0.21	0.19	0.21	0.20	0.25	0.24	0.25	0.20	0.17	0.21	0.11	0.23	0.19	0.20	0.25	0.15	0.15	0.19
C4	0.11	0.07	0.07	0.08	0.10	0.16	0.14	0.28	0.15	0.10	0.07	0.10	0.07	0.07	0.07	0.12	0.11	0.11	0.05	0.08
C4'	0.11	0.08	0.11	0.15	0.12	0.17	0.16	0.31	0.16	0.11	0.09	0.13	0.07	0.11	0.16	0.11	0.11	0.12	0.04	0.08
C5	0.08	0.07	0.03	0.08	0.08	0.15	0.12	0.28	0.12	0.08	0.06	0.08	0.11	0.02	0.05	0.10	0.11	0.10	0.06	0.08
C5'	0.08	0.06	0.10	0.18	0.10	0.15	0.13	0.32	0.13	0.08	0.07	0.11	0.06	0.08	0.19	0.07	0.12	0.11	0.05	0.05
C6	0.11	0.06	0.06	0.08	0.10	0.18	0.16	0.28	0.16	0.10	0.06	0.10	0.09	0.05	0.09	0.15	0.16	0.13	0.14	0.16
C8	0.09	0.10	0.07	0.14	0.08	0.16	0.10	0.31	0.10	0.09	0.09	0.08	0.15	0.03	0.12	0.09	0.11	0.12	0.07	0.04
N1	0.20	0.12	0.17	0.16	0.17	0.24	0.22	0.29	0.23	0.18	0.12	0.16	0.07	0.16	0.17	0.23	0.21	0.17	0.18	0.20
N3	0.17	0.12	0.13	0.11	0.15	0.20	0.19	0.28	0.20	0.16	0.11	0.14	0.07	0.14	0.11	0.18	0.14	0.13	0.08	0.12
N6	0.07	0.08	0.01	0.05	0.08	0.17	0.13	0.29	0.14	0.07	0.07	0.08	0.16	0.06	0.09	0.12	0.18	0.16	0.18	0.19
N7	0.09	0.11	0.08	0.13	0.08	0.15	0.09	0.30	0.10	0.09	0.10	0.08	0.17	0.05	0.10	0.09	0.11	0.09	0.06	0.02
N9	0.08	0.06	0.04	0.09	0.08	0.15	0.12	0.29	0.12	0.08	0.06	0.08	0.09	0.04	0.07	0.09	0.09	0.11	0.03	0.04
O2'	0.26	0.28	0.25	0.28	0.27	0.28	0.26	0.35	0.27	0.27	0.28	0.27	0.31	0.25	0.27	0.24	0.14	0.29	0.23	0.22
O3'	0.27	0.30	0.25	0.32	0.29	0.33	0.28	0.36	0.28	0.29	0.30	0.30	0.31	0.19	0.30	0.33	0.44	0.46	0.48	0.42
O4'	0.08	0.07	0.06	0.15	0.10	0.18	0.13	0.36	0.13	0.09	0.07	0.10	0.09	0.04	0.14	0.10	0.09	0.16	0.07	0.07
O5'	0.04	0.05	0.08	0.17	0.07	0.13	0.11	0.31	0.10	0.06	0.05	0.08	0.09	0.05	0.18	0.03	0.12	0.10	0.04	0.04
OP1	0.04	0.02	0.08	0.17	0.08	0.07	0.11	0.23	0.09	0.04	0.04	0.09	0.05	0.06	0.21	0.07	0.20	0.05	0.03	0.08
OP2	0.07	0.04	0.07	0.16	0.08	0.06	0.11	0.22	0.09	0.06	0.05	0.09	0.05	0.08	0.20	0.11	0.20	0.03	0.01	0.06
P	0.02	0.03	0.06	0.17	0.04	0.09	0.08	0.28	0.06	0.01	0.01	0.06	0.08	0.04	0.21	0.04	0.17	0.06	0.04	0.01

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.06	0.01	0.02	0.01	0.07	0.11	0.16	0.05
C2	0.03	0.00	0.07	0.12	0.01	0.05	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.06	0.11	0.03	0.16	0.11	0.11	0.07
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.03	0.02	0.08	0.03	0.09	0.02	0.04	0.03	0.15	0.00	0.03	0.01	0.24	0.26	0.08	0.20
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.05	0.01	0.08	0.04	0.09	0.03	0.11	0.06	0.18	0.01	0.01	0.00	0.37	0.36	0.13	0.31
C4	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.07	0.00	0.20	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.04	0.02	0.22	0.08	0.09	0.09
C4'	0.01	0.05	0.02	0.01	0.07	0.00	0.07	0.00	0.05	0.03	0.07	0.08	0.07	0.04	0.04	0.00	0.02	0.10	0.21	0.02
C5	0.01	0.01	0.08	0.08	0.00	0.07	0.00	0.18	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.07	0.05	0.23	0.09	0.09	0.09
C5'	0.03	0.15	0.03	0.04	0.20	0.00	0.18	0.00	0.13	0.11	0.19	0.22	0.13	0.03	0.07	0.02	0.01	0.12	0.35	0.01
C6	0.02	0.01	0.09	0.09	0.01	0.05	0.01	0.13	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.06	0.08	0.04	0.20	0.10	0.10	0.08
N1	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.03	0.01	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.15	0.12	0.12	0.07
N3	0.02	0.00	0.04	0.11	0.00	0.07	0.01	0.19	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.10	0.02	0.18	0.09	0.09	0.07
N4	0.02	0.01	0.03	0.06	0.00	0.08	0.01	0.22	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.05	0.02	0.23	0.09	0.10	0.11
O2	0.06	0.00	0.15	0.18	0.01	0.07	0.01	0.13	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.12	0.17	0.08	0.15	0.15	0.13	0.09
O2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.05	0.04	0.06	0.03	0.06	0.02	0.06	0.06	0.12	0.00	0.05	0.03	0.08	0.17	0.05	0.09
O3'	0.02	0.11	0.03	0.01	0.04	0.04	0.07	0.07	0.08	0.02	0.10	0.05	0.17	0.05	0.00	0.03	0.32	0.41	0.18	0.33
O4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.05	0.02	0.04	0.01	0.02	0.02	0.08	0.03	0.03	0.00	0.15	0.12	0.30	0.14
O5'	0.07	0.16	0.24	0.37	0.22	0.02	0.23	0.01	0.20	0.15	0.18	0.23	0.15	0.08	0.32	0.15	0.00	0.05	0.02	0.01
OP1	0.11	0.11	0.26	0.36	0.08	0.10	0.09	0.12	0.10	0.12	0.09	0.09	0.15	0.17	0.41	0.12	0.05	0.00	0.01	0.01
OP2	0.16	0.11	0.08	0.13	0.09	0.21	0.09	0.35	0.10	0.12	0.09	0.10	0.13	0.05	0.18	0.30	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.07	0.20	0.31	0.09	0.02	0.09	0.01	0.08	0.07	0.07	0.11	0.09	0.09	0.33	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00