Doublet Group distance statistics: 48320

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.002, 0.007, 0.013, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.007 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.003, 0.009, 0.014, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.009 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.005, 0.011, 0.018, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.011 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.003, 0.011, 0.018, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.004, 0.013, 0.021, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.013 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.003, 0.013, 0.024, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.013 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.002, 0.013, 0.024, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.013 std_dev=0.011
N9	A	0, 0.007, 0.022, 0.037, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.022 std_dev=0.015
N7	A	0, 0.004, 0.028, 0.051, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.028 std_dev=0.024
C8	A	0, 0.005, 0.031, 0.056, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.031 std_dev=0.026
N6	A	0, 0.015, 0.047, 0.078, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.047 std_dev=0.031
O4'	A	0, 0.011, 0.133, 0.255, 0.283 max_d=0.283 avg_d=0.133 std_dev=0.122
C2'	A	0, -0.001, 0.130, 0.262, 0.355 max_d=0.355 avg_d=0.130 std_dev=0.132
O2'	A	0, 0.008, 0.206, 0.404, 0.538 max_d=0.538 avg_d=0.206 std_dev=0.198
C3'	A	0, 0.029, 0.250, 0.472, 0.544 max_d=0.544 avg_d=0.250 std_dev=0.222
C4'	A	0, -0.009, 0.242, 0.494, 0.687 max_d=0.687 avg_d=0.242 std_dev=0.252
O3'	A	0, 0.028, 0.325, 0.622, 0.818 max_d=0.818 avg_d=0.325 std_dev=0.297
O5'	A	0, 0.123, 0.493, 0.863, 0.916 max_d=0.916 avg_d=0.493 std_dev=0.370
C1'	B	0, 0.098, 0.491, 0.883, 1.009 max_d=1.009 avg_d=0.491 std_dev=0.393
O4'	B	0, 0.115, 0.515, 0.914, 1.060 max_d=1.060 avg_d=0.515 std_dev=0.399
C2'	B	0, 0.068, 0.485, 0.902, 1.038 max_d=1.038 avg_d=0.485 std_dev=0.417
N1	B	0, 0.115, 0.538, 0.961, 1.047 max_d=1.047 avg_d=0.538 std_dev=0.423
C6	B	0, 0.146, 0.580, 1.014, 1.043 max_d=1.043 avg_d=0.580 std_dev=0.434
C5	B	0, 0.162, 0.615, 1.067, 1.099 max_d=1.099 avg_d=0.615 std_dev=0.452
O2'	B	0, 0.026, 0.489, 0.951, 1.156 max_d=1.156 avg_d=0.489 std_dev=0.463
C4'	B	0, 0.161, 0.627, 1.093, 1.121 max_d=1.121 avg_d=0.627 std_dev=0.466
C2	B	0, 0.094, 0.580, 1.067, 1.166 max_d=1.166 avg_d=0.580 std_dev=0.486
P	A	0, 0.049, 0.547, 1.044, 1.497 max_d=1.497 avg_d=0.547 std_dev=0.497
O2	B	0, 0.078, 0.586, 1.093, 1.245 max_d=1.245 avg_d=0.586 std_dev=0.507
C4	B	0, 0.140, 0.658, 1.176, 1.299 max_d=1.299 avg_d=0.658 std_dev=0.518
C3'	B	0, 0.146, 0.689, 1.232, 1.342 max_d=1.342 avg_d=0.689 std_dev=0.543
C5'	A	0, -0.056, 0.491, 1.038, 1.510 max_d=1.510 avg_d=0.491 std_dev=0.547
N3	B	0, 0.101, 0.652, 1.203, 1.371 max_d=1.371 avg_d=0.652 std_dev=0.551
C5'	B	0, 0.223, 0.800, 1.377, 1.433 max_d=1.433 avg_d=0.800 std_dev=0.577
OP1	A	0, 0.019, 0.600, 1.181, 1.759 max_d=1.759 avg_d=0.600 std_dev=0.581
N4	B	0, 0.151, 0.746, 1.340, 1.543 max_d=1.543 avg_d=0.746 std_dev=0.595
O5'	B	0, 0.240, 0.851, 1.462, 1.421 max_d=1.421 avg_d=0.851 std_dev=0.611
P	B	0, 0.278, 0.933, 1.589, 1.505 max_d=1.505 avg_d=0.933 std_dev=0.656
O3'	B	0, 0.173, 0.849, 1.525, 1.702 max_d=1.702 avg_d=0.849 std_dev=0.676
OP2	B	0, 0.297, 0.979, 1.660, 1.590 max_d=1.590 avg_d=0.979 std_dev=0.682
OP2	A	0, -0.072, 0.620, 1.313, 2.061 max_d=2.061 avg_d=0.620 std_dev=0.693
OP1	B	0, 0.292, 0.985, 1.679, 1.643 max_d=1.643 avg_d=0.985 std_dev=0.694

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.10	0.11	0.17	0.08
C2	0.02	0.00	0.10	0.12	0.01	0.02	0.01	0.10	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.11	0.13	0.04	0.17	0.15	0.24	0.14
C2'	0.00	0.10	0.00	0.01	0.05	0.02	0.01	0.03	0.03	0.06	0.07	0.10	0.03	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.18	0.17	0.12	0.14
C3'	0.01	0.12	0.01	0.00	0.08	0.01	0.08	0.04	0.10	0.09	0.11	0.11	0.10	0.09	0.05	0.02	0.01	0.02	0.26	0.22	0.11	0.21
C4	0.01	0.01	0.05	0.08	0.00	0.03	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.07	0.07	0.02	0.19	0.16	0.24	0.16
C4'	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.00	0.07	0.01	0.06	0.12	0.04	0.03	0.08	0.12	0.05	0.05	0.02	0.00	0.02	0.14	0.17	0.03
C5	0.01	0.01	0.01	0.08	0.00	0.07	0.00	0.22	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.06	0.07	0.02	0.24	0.21	0.29	0.21
C5'	0.04	0.10	0.03	0.04	0.14	0.01	0.22	0.00	0.21	0.27	0.16	0.08	0.25	0.29	0.15	0.06	0.03	0.02	0.01	0.12	0.24	0.03
C6	0.02	0.01	0.03	0.10	0.01	0.06	0.01	0.21	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.08	0.09	0.02	0.23	0.21	0.30	0.21
C8	0.01	0.02	0.06	0.09	0.01	0.12	0.02	0.27	0.03	0.00	0.03	0.01	0.06	0.00	0.00	0.05	0.09	0.05	0.26	0.23	0.27	0.21
N1	0.02	0.00	0.07	0.11	0.01	0.04	0.01	0.16	0.00	0.03	0.00	0.00	0.03	0.02	0.01	0.09	0.12	0.03	0.21	0.17	0.27	0.18
N3	0.02	0.00	0.10	0.11	0.00	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.10	0.12	0.05	0.16	0.14	0.21	0.13
N6	0.03	0.02	0.03	0.10	0.01	0.08	0.02	0.25	0.00	0.06	0.03	0.01	0.00	0.06	0.03	0.08	0.09	0.04	0.25	0.25	0.34	0.24
N7	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.12	0.01	0.29	0.03	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.01	0.05	0.09	0.04	0.28	0.26	0.31	0.24
N9	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.04	0.04	0.01	0.19	0.16	0.21	0.15
O2'	0.02	0.11	0.01	0.02	0.07	0.05	0.06	0.06	0.08	0.05	0.09	0.10	0.08	0.05	0.04	0.00	0.01	0.04	0.08	0.12	0.15	0.06
O3'	0.01	0.13	0.01	0.01	0.07	0.02	0.07	0.03	0.09	0.09	0.12	0.12	0.09	0.09	0.04	0.01	0.00	0.01	0.20	0.21	0.07	0.17
O4'	0.01	0.04	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.05	0.03	0.05	0.04	0.04	0.01	0.04	0.01	0.00	0.07	0.12	0.20	0.07
O5'	0.10	0.17	0.18	0.26	0.19	0.02	0.24	0.01	0.23	0.26	0.21	0.16	0.25	0.28	0.19	0.08	0.20	0.07	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.11	0.15	0.17	0.22	0.16	0.14	0.21	0.12	0.21	0.23	0.17	0.14	0.25	0.26	0.16	0.12	0.21	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.17	0.24	0.12	0.11	0.24	0.17	0.29	0.24	0.30	0.27	0.27	0.21	0.34	0.31	0.21	0.15	0.07	0.20	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.14	0.14	0.21	0.16	0.03	0.21	0.03	0.21	0.21	0.18	0.13	0.24	0.24	0.15	0.06	0.17	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.07	0.18	0.18	0.17	0.21	0.16	0.18	0.22	0.15	0.13	0.23	0.25	0.20	0.35	0.29	0.18	0.18	0.17	0.13	0.11
C2	0.07	0.19	0.12	0.08	0.21	0.14	0.18	0.25	0.15	0.14	0.23	0.23	0.22	0.29	0.13	0.22	0.17	0.15	0.06	0.06
C2'	0.08	0.20	0.16	0.16	0.20	0.15	0.15	0.21	0.13	0.13	0.24	0.24	0.24	0.32	0.28	0.20	0.17	0.16	0.15	0.11
C3'	0.09	0.19	0.23	0.21	0.17	0.14	0.10	0.16	0.07	0.10	0.21	0.20	0.24	0.38	0.33	0.17	0.15	0.16	0.14	0.10
C4	0.07	0.15	0.19	0.16	0.17	0.15	0.16	0.21	0.14	0.11	0.19	0.20	0.17	0.37	0.26	0.17	0.16	0.16	0.12	0.09
C4'	0.05	0.15	0.24	0.22	0.19	0.14	0.15	0.16	0.11	0.08	0.20	0.23	0.19	0.42	0.37	0.12	0.16	0.20	0.13	0.13
C5	0.11	0.13	0.24	0.21	0.15	0.17	0.16	0.21	0.15	0.12	0.15	0.17	0.14	0.41	0.31	0.16	0.18	0.17	0.16	0.13
C5'	0.19	0.17	0.39	0.36	0.12	0.23	0.07	0.13	0.06	0.11	0.17	0.16	0.24	0.57	0.52	0.13	0.18	0.25	0.19	0.20
C6	0.10	0.13	0.23	0.17	0.15	0.14	0.16	0.20	0.14	0.12	0.15	0.16	0.15	0.40	0.25	0.17	0.15	0.15	0.13	0.10
C8	0.13	0.12	0.27	0.27	0.15	0.21	0.16	0.24	0.15	0.12	0.15	0.17	0.13	0.42	0.39	0.16	0.22	0.23	0.21	0.19
N1	0.06	0.15	0.15	0.09	0.17	0.14	0.16	0.24	0.14	0.11	0.17	0.18	0.17	0.32	0.15	0.22	0.15	0.15	0.07	0.06
N3	0.06	0.19	0.14	0.10	0.21	0.14	0.18	0.23	0.14	0.13	0.23	0.24	0.22	0.32	0.18	0.20	0.16	0.14	0.07	0.05
N6	0.16	0.18	0.28	0.22	0.18	0.15	0.17	0.19	0.17	0.17	0.18	0.19	0.21	0.45	0.29	0.15	0.16	0.16	0.17	0.14
N7	0.14	0.13	0.28	0.28	0.15	0.22	0.16	0.24	0.16	0.14	0.14	0.16	0.14	0.44	0.40	0.16	0.23	0.23	0.22	0.20
N9	0.09	0.14	0.22	0.20	0.17	0.17	0.16	0.22	0.14	0.11	0.18	0.20	0.16	0.39	0.32	0.17	0.18	0.18	0.15	0.13
O2'	0.16	0.30	0.14	0.16	0.32	0.20	0.26	0.27	0.22	0.23	0.35	0.36	0.32	0.27	0.25	0.26	0.21	0.18	0.17	0.13
O3'	0.10	0.21	0.21	0.20	0.20	0.14	0.13	0.17	0.10	0.13	0.24	0.23	0.26	0.35	0.33	0.18	0.15	0.16	0.15	0.11
O4'	0.09	0.15	0.23	0.22	0.21	0.18	0.20	0.21	0.16	0.11	0.21	0.25	0.16	0.41	0.36	0.14	0.20	0.22	0.14	0.15
O5'	0.22	0.29	0.17	0.19	0.33	0.23	0.31	0.31	0.29	0.27	0.33	0.35	0.28	0.25	0.27	0.30	0.25	0.28	0.17	0.20
OP1	0.19	0.25	0.20	0.24	0.28	0.24	0.27	0.30	0.25	0.23	0.29	0.31	0.24	0.29	0.35	0.28	0.28	0.38	0.17	0.24
OP2	0.29	0.18	0.38	0.40	0.26	0.36	0.34	0.40	0.35	0.27	0.19	0.25	0.11	0.48	0.50	0.33	0.44	0.57	0.37	0.43
P	0.19	0.19	0.24	0.26	0.25	0.24	0.27	0.30	0.26	0.21	0.23	0.27	0.16	0.35	0.37	0.26	0.30	0.40	0.20	0.27

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.04	0.01	0.01	0.01	0.10	0.11	0.14	0.13
C2	0.02	0.00	0.10	0.09	0.02	0.04	0.02	0.06	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.09	0.10	0.02	0.11	0.13	0.14	0.12
C2'	0.00	0.10	0.00	0.01	0.02	0.01	0.06	0.02	0.08	0.01	0.07	0.02	0.18	0.00	0.01	0.01	0.04	0.11	0.11	0.05
C3'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.09	0.01	0.16	0.02	0.17	0.06	0.08	0.10	0.17	0.02	0.01	0.01	0.10	0.17	0.17	0.11
C4	0.02	0.02	0.02	0.09	0.00	0.06	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.11	0.04	0.14	0.14	0.15	0.12
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.06	0.00	0.09	0.01	0.09	0.04	0.04	0.06	0.07	0.04	0.01	0.00	0.04	0.09	0.05	0.05
C5	0.03	0.02	0.06	0.16	0.01	0.09	0.00	0.15	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.19	0.06	0.15	0.14	0.15	0.12
C5'	0.02	0.06	0.02	0.02	0.12	0.01	0.15	0.00	0.13	0.06	0.08	0.12	0.07	0.05	0.03	0.02	0.02	0.11	0.04	0.03
C6	0.02	0.01	0.08	0.17	0.01	0.09	0.00	0.13	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.04	0.18	0.07	0.11	0.11	0.14	0.10
N1	0.01	0.01	0.01	0.06	0.01	0.04	0.02	0.06	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.05	0.02	0.09	0.11	0.14	0.11
N3	0.02	0.00	0.07	0.08	0.01	0.04	0.00	0.08	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.08	0.09	0.02	0.11	0.13	0.14	0.11
N4	0.03	0.02	0.02	0.10	0.01	0.06	0.02	0.12	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.04	0.12	0.04	0.15	0.15	0.17	0.14
O2	0.04	0.00	0.18	0.17	0.02	0.07	0.02	0.07	0.02	0.02	0.02	0.03	0.00	0.17	0.21	0.05	0.12	0.16	0.16	0.14
O2'	0.01	0.09	0.00	0.02	0.04	0.04	0.03	0.05	0.04	0.03	0.08	0.04	0.17	0.00	0.04	0.04	0.04	0.12	0.09	0.06
O3'	0.01	0.10	0.01	0.01	0.11	0.01	0.19	0.03	0.18	0.05	0.09	0.12	0.21	0.04	0.00	0.01	0.14	0.26	0.26	0.19
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.00	0.06	0.02	0.07	0.02	0.02	0.04	0.05	0.04	0.01	0.00	0.18	0.18	0.22	0.22
O5'	0.10	0.11	0.04	0.10	0.14	0.04	0.15	0.02	0.11	0.09	0.11	0.15	0.12	0.04	0.14	0.18	0.00	0.02	0.02	0.02
OP1	0.11	0.13	0.11	0.17	0.14	0.09	0.14	0.11	0.11	0.11	0.13	0.15	0.16	0.12	0.26	0.18	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.14	0.14	0.11	0.17	0.15	0.05	0.15	0.04	0.14	0.14	0.14	0.17	0.16	0.09	0.26	0.22	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.13	0.12	0.05	0.11	0.12	0.05	0.12	0.03	0.10	0.11	0.11	0.14	0.14	0.06	0.19	0.22	0.02	0.01	0.01	0.00