Doublet Group distance statistics: 48345

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 1, 4, 0, 1, 0, 0, 2, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N1	A	0, 0.009, 0.018, 0.026, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.018 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.008, 0.019, 0.029, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.019 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.002, 0.012, 0.023, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.012 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.013, 0.025, 0.036, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.025 std_dev=0.011
N9	A	0, 0.016, 0.028, 0.040, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.028 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.011, 0.024, 0.038, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.024 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.009, 0.023, 0.036, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.023 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.010, 0.024, 0.038, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.024 std_dev=0.014
O6	A	0, 0.021, 0.042, 0.063, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.042 std_dev=0.021
N7	A	0, 0.027, 0.050, 0.073, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.050 std_dev=0.023
C8	A	0, 0.029, 0.053, 0.076, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.053 std_dev=0.023
N2	A	0, 0.026, 0.052, 0.078, 0.102 max_d=0.102 avg_d=0.052 std_dev=0.026
O4'	A	0, 0.061, 0.134, 0.208, 0.289 max_d=0.289 avg_d=0.134 std_dev=0.074
C2'	A	0, 0.075, 0.159, 0.242, 0.299 max_d=0.299 avg_d=0.159 std_dev=0.084
C3'	A	0, 0.123, 0.245, 0.367, 0.441 max_d=0.441 avg_d=0.245 std_dev=0.122
C5	B	0, 0.098, 0.245, 0.392, 0.521 max_d=0.521 avg_d=0.245 std_dev=0.147
O2'	A	0, 0.122, 0.271, 0.420, 0.542 max_d=0.542 avg_d=0.271 std_dev=0.149
C6	B	0, 0.123, 0.290, 0.458, 0.578 max_d=0.578 avg_d=0.290 std_dev=0.167
C4'	A	0, 0.103, 0.272, 0.442, 0.708 max_d=0.708 avg_d=0.272 std_dev=0.170
C4	B	0, 0.127, 0.306, 0.485, 0.707 max_d=0.707 avg_d=0.306 std_dev=0.179
O3'	A	0, 0.178, 0.381, 0.585, 0.760 max_d=0.760 avg_d=0.381 std_dev=0.203
N1	B	0, 0.116, 0.347, 0.579, 0.923 max_d=0.923 avg_d=0.347 std_dev=0.231
N4	B	0, 0.176, 0.415, 0.653, 1.054 max_d=1.054 avg_d=0.415 std_dev=0.239
N3	B	0, 0.106, 0.345, 0.585, 0.907 max_d=0.907 avg_d=0.345 std_dev=0.239
C2	B	0, 0.091, 0.360, 0.629, 1.069 max_d=1.069 avg_d=0.360 std_dev=0.269
C2'	B	0, 0.146, 0.440, 0.733, 1.104 max_d=1.104 avg_d=0.440 std_dev=0.293
O3'	B	0, 0.177, 0.475, 0.773, 1.018 max_d=1.018 avg_d=0.475 std_dev=0.298
C1'	B	0, 0.144, 0.443, 0.743, 1.148 max_d=1.148 avg_d=0.443 std_dev=0.299
C3'	B	0, 0.160, 0.483, 0.805, 1.138 max_d=1.138 avg_d=0.483 std_dev=0.323
O4'	B	0, 0.135, 0.493, 0.851, 1.313 max_d=1.313 avg_d=0.493 std_dev=0.358
O2'	B	0, 0.150, 0.527, 0.904, 1.140 max_d=1.140 avg_d=0.527 std_dev=0.377
O2	B	0, 0.078, 0.457, 0.836, 1.514 max_d=1.514 avg_d=0.457 std_dev=0.379
C5'	A	0, 0.141, 0.532, 0.922, 1.669 max_d=1.669 avg_d=0.532 std_dev=0.391
C4'	B	0, 0.112, 0.538, 0.965, 1.527 max_d=1.527 avg_d=0.538 std_dev=0.426
O5'	A	0, 0.150, 0.641, 1.132, 1.695 max_d=1.695 avg_d=0.641 std_dev=0.491
C5'	B	0, 0.102, 0.655, 1.209, 1.897 max_d=1.897 avg_d=0.655 std_dev=0.554
P	A	0, 0.224, 0.794, 1.364, 1.876 max_d=1.876 avg_d=0.794 std_dev=0.570
OP2	A	0, 0.339, 0.933, 1.528, 2.019 max_d=2.019 avg_d=0.933 std_dev=0.595
OP2	B	0, -0.005, 0.632, 1.268, 2.218 max_d=2.218 avg_d=0.632 std_dev=0.637
OP1	A	0, 0.263, 0.963, 1.664, 2.218 max_d=2.218 avg_d=0.963 std_dev=0.700
O5'	B	0, -0.019, 0.784, 1.587, 2.949 max_d=2.949 avg_d=0.784 std_dev=0.803
P	B	0, -0.159, 0.769, 1.697, 3.223 max_d=3.223 avg_d=0.769 std_dev=0.928
OP1	B	0, -0.198, 0.973, 2.143, 3.984 max_d=3.984 avg_d=0.973 std_dev=1.170

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.09	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.20	0.02	0.21	0.13	0.16
C2	0.02	0.00	0.09	0.10	0.00	0.06	0.01	0.23	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.13	0.11	0.03	0.38	0.03	0.39	0.49	0.40
C2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.05	0.02	0.04	0.04	0.05	0.05	0.07	0.11	0.09	0.04	0.02	0.01	0.02	0.02	0.23	0.05	0.26	0.16	0.21
C3'	0.02	0.10	0.01	0.00	0.07	0.00	0.08	0.02	0.09	0.12	0.09	0.12	0.09	0.11	0.07	0.02	0.01	0.02	0.29	0.10	0.32	0.13	0.25
C4	0.01	0.00	0.05	0.07	0.00	0.08	0.01	0.25	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.07	0.06	0.02	0.39	0.02	0.38	0.45	0.40
C4'	0.01	0.06	0.02	0.00	0.08	0.00	0.11	0.01	0.11	0.13	0.08	0.06	0.06	0.13	0.08	0.06	0.04	0.01	0.01	0.13	0.12	0.17	0.03
C5	0.01	0.01	0.04	0.08	0.01	0.11	0.00	0.32	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.09	0.03	0.48	0.02	0.51	0.59	0.52
C5'	0.09	0.23	0.04	0.02	0.25	0.01	0.32	0.00	0.33	0.33	0.28	0.20	0.20	0.36	0.24	0.06	0.06	0.02	0.02	0.36	0.23	0.34	0.03
C6	0.02	0.02	0.05	0.09	0.02	0.11	0.01	0.33	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.07	0.10	0.03	0.50	0.01	0.55	0.66	0.56
C8	0.01	0.01	0.05	0.12	0.01	0.13	0.01	0.33	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.14	0.04	0.46	0.02	0.45	0.47	0.46
N1	0.02	0.01	0.07	0.09	0.01	0.08	0.00	0.28	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.09	0.03	0.45	0.02	0.49	0.60	0.50
N2	0.03	0.00	0.11	0.12	0.01	0.06	0.01	0.20	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.16	0.15	0.04	0.35	0.03	0.36	0.46	0.37
N3	0.02	0.00	0.09	0.09	0.00	0.06	0.01	0.20	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.13	0.10	0.03	0.34	0.03	0.33	0.40	0.34
N7	0.01	0.02	0.04	0.11	0.02	0.13	0.01	0.36	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.03	0.14	0.04	0.52	0.02	0.56	0.63	0.57
N9	0.01	0.01	0.02	0.07	0.01	0.08	0.01	0.24	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.07	0.02	0.35	0.02	0.33	0.34	0.33
O2'	0.02	0.13	0.01	0.02	0.07	0.06	0.05	0.06	0.07	0.03	0.11	0.16	0.13	0.03	0.03	0.00	0.05	0.08	0.07	0.07	0.14	0.07	0.06
O3'	0.03	0.11	0.02	0.01	0.06	0.04	0.09	0.06	0.10	0.14	0.09	0.15	0.10	0.14	0.07	0.05	0.00	0.03	0.25	0.12	0.29	0.13	0.21
O4'	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03	0.04	0.03	0.04	0.03	0.04	0.02	0.08	0.03	0.00	0.18	0.04	0.19	0.09	0.12
O5'	0.20	0.38	0.23	0.29	0.39	0.01	0.48	0.02	0.50	0.46	0.45	0.35	0.34	0.52	0.35	0.07	0.25	0.18	0.00	0.54	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.03	0.05	0.10	0.02	0.13	0.02	0.36	0.01	0.02	0.02	0.03	0.03	0.02	0.02	0.07	0.12	0.04	0.54	0.00	0.63	0.75	0.63
OP1	0.21	0.39	0.26	0.32	0.38	0.12	0.51	0.23	0.55	0.45	0.49	0.36	0.33	0.56	0.33	0.14	0.29	0.19	0.02	0.63	0.00	0.01	0.01
OP2	0.13	0.49	0.16	0.13	0.45	0.17	0.59	0.34	0.66	0.47	0.60	0.46	0.40	0.63	0.34	0.07	0.13	0.09	0.02	0.75	0.01	0.00	0.01
P	0.16	0.40	0.21	0.25	0.40	0.03	0.52	0.03	0.56	0.46	0.50	0.37	0.34	0.57	0.33	0.06	0.21	0.12	0.01	0.63	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.19	0.14	0.14	0.14	0.16	0.16	0.34	0.15	0.16	0.17	0.18	0.26	0.14	0.12	0.15	0.44	0.26	0.15	0.19
C2	0.17	0.12	0.14	0.13	0.13	0.14	0.14	0.26	0.16	0.14	0.14	0.16	0.15	0.14	0.14	0.16	0.32	0.33	0.21	0.15
C2'	0.22	0.26	0.20	0.19	0.15	0.21	0.16	0.32	0.16	0.20	0.20	0.21	0.36	0.14	0.10	0.22	0.56	0.21	0.17	0.30
C3'	0.25	0.34	0.22	0.22	0.19	0.25	0.13	0.36	0.15	0.24	0.32	0.19	0.44	0.15	0.12	0.24	0.64	0.26	0.26	0.40
C4	0.13	0.13	0.13	0.13	0.08	0.15	0.14	0.34	0.14	0.12	0.11	0.12	0.17	0.15	0.11	0.12	0.36	0.31	0.16	0.14
C4'	0.22	0.30	0.19	0.20	0.22	0.24	0.18	0.39	0.17	0.22	0.30	0.25	0.38	0.14	0.11	0.22	0.60	0.29	0.30	0.38
C5	0.09	0.11	0.11	0.13	0.07	0.17	0.09	0.39	0.11	0.08	0.12	0.10	0.14	0.18	0.10	0.09	0.31	0.34	0.18	0.14
C5'	0.36	0.43	0.36	0.39	0.41	0.42	0.36	0.58	0.35	0.38	0.45	0.44	0.48	0.30	0.30	0.38	0.78	0.52	0.57	0.62
C6	0.11	0.13	0.11	0.12	0.10	0.18	0.09	0.39	0.11	0.10	0.14	0.12	0.16	0.20	0.10	0.12	0.24	0.38	0.22	0.16
C8	0.10	0.15	0.12	0.14	0.13	0.19	0.12	0.42	0.12	0.11	0.17	0.16	0.20	0.16	0.10	0.10	0.38	0.31	0.18	0.18
N1	0.14	0.15	0.11	0.11	0.13	0.13	0.13	0.30	0.15	0.13	0.16	0.14	0.18	0.18	0.11	0.12	0.26	0.37	0.24	0.16
N2	0.20	0.16	0.16	0.15	0.17	0.17	0.15	0.21	0.17	0.17	0.20	0.21	0.19	0.15	0.18	0.20	0.33	0.32	0.24	0.17
N3	0.17	0.13	0.15	0.13	0.12	0.15	0.15	0.29	0.16	0.15	0.10	0.16	0.17	0.14	0.14	0.16	0.37	0.31	0.18	0.15
N7	0.08	0.13	0.11	0.14	0.11	0.20	0.09	0.44	0.09	0.08	0.16	0.16	0.16	0.19	0.10	0.10	0.32	0.34	0.19	0.16
N9	0.14	0.16	0.13	0.13	0.12	0.16	0.14	0.36	0.14	0.13	0.15	0.14	0.22	0.15	0.10	0.12	0.40	0.29	0.16	0.16
O2'	0.28	0.28	0.25	0.23	0.18	0.27	0.19	0.31	0.20	0.25	0.21	0.25	0.40	0.20	0.17	0.29	0.58	0.21	0.17	0.31
O3'	0.25	0.33	0.22	0.22	0.12	0.24	0.09	0.33	0.11	0.23	0.28	0.15	0.47	0.16	0.10	0.25	0.66	0.30	0.27	0.44
O4'	0.17	0.23	0.15	0.15	0.19	0.18	0.18	0.36	0.16	0.18	0.23	0.23	0.29	0.15	0.11	0.17	0.48	0.27	0.19	0.24
O5'	0.56	0.61	0.52	0.53	0.58	0.51	0.54	0.46	0.55	0.57	0.62	0.58	0.64	0.49	0.51	0.55	0.91	0.59	0.62	0.71
O6	0.16	0.17	0.15	0.15	0.15	0.24	0.12	0.46	0.13	0.15	0.17	0.16	0.20	0.25	0.12	0.19	0.17	0.44	0.29	0.23
OP1	0.65	0.70	0.60	0.63	0.70	0.63	0.66	0.60	0.66	0.67	0.73	0.73	0.73	0.53	0.58	0.67	1.11	0.85	0.89	0.97
OP2	0.66	0.67	0.67	0.69	0.68	0.63	0.66	0.58	0.66	0.67	0.69	0.70	0.68	0.65	0.67	0.64	1.08	0.87	0.90	0.95
P	0.60	0.64	0.57	0.59	0.64	0.56	0.60	0.52	0.60	0.61	0.66	0.66	0.66	0.54	0.57	0.59	1.00	0.73	0.77	0.84

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.03	0.02	0.01	0.01	0.09	0.01	0.01	0.03	0.03	0.07	0.03	0.17	0.00	0.31	0.14	0.27	0.17
C2	0.04	0.00	0.08	0.07	0.01	0.04	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.16	0.26	0.04	0.49	0.20	0.21	0.32
C2'	0.00	0.08	0.00	0.01	0.05	0.02	0.07	0.13	0.07	0.02	0.06	0.07	0.14	0.00	0.03	0.02	0.21	0.28	0.36	0.22
C3'	0.03	0.07	0.01	0.00	0.06	0.00	0.11	0.02	0.11	0.02	0.04	0.07	0.16	0.02	0.01	0.02	0.11	0.20	0.29	0.16
C4	0.02	0.01	0.05	0.06	0.00	0.08	0.01	0.26	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.14	0.02	0.65	0.38	0.36	0.51
C4'	0.01	0.04	0.02	0.00	0.08	0.00	0.11	0.01	0.11	0.05	0.04	0.09	0.08	0.04	0.04	0.01	0.02	0.13	0.30	0.06
C5	0.01	0.01	0.07	0.11	0.01	0.11	0.00	0.30	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.10	0.06	0.03	0.67	0.42	0.38	0.52
C5'	0.09	0.16	0.13	0.02	0.26	0.01	0.30	0.00	0.29	0.19	0.20	0.27	0.11	0.10	0.05	0.02	0.01	0.25	0.34	0.02
C6	0.01	0.01	0.07	0.11	0.01	0.11	0.01	0.29	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.09	0.06	0.04	0.60	0.32	0.25	0.40
N1	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.05	0.01	0.19	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.06	0.15	0.01	0.48	0.21	0.20	0.29
N3	0.03	0.01	0.06	0.04	0.00	0.04	0.01	0.20	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.15	0.23	0.04	0.58	0.29	0.27	0.42
N4	0.03	0.01	0.07	0.07	0.01	0.09	0.02	0.27	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.14	0.13	0.03	0.68	0.44	0.45	0.58
O2	0.07	0.00	0.14	0.16	0.01	0.08	0.01	0.11	0.02	0.02	0.02	0.02	0.00	0.25	0.39	0.07	0.39	0.15	0.20	0.24
O2'	0.03	0.16	0.00	0.02	0.12	0.04	0.10	0.10	0.09	0.06	0.15	0.14	0.25	0.00	0.10	0.05	0.20	0.45	0.44	0.31
O3'	0.17	0.26	0.03	0.01	0.14	0.04	0.06	0.05	0.06	0.15	0.23	0.13	0.39	0.10	0.00	0.16	0.11	0.22	0.27	0.15
O4'	0.00	0.04	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.02	0.04	0.01	0.04	0.03	0.07	0.05	0.16	0.00	0.29	0.19	0.30	0.20
O5'	0.31	0.49	0.21	0.11	0.65	0.02	0.67	0.01	0.60	0.48	0.58	0.68	0.39	0.20	0.11	0.29	0.00	0.03	0.03	0.01
OP1	0.14	0.20	0.28	0.20	0.38	0.13	0.42	0.25	0.32	0.21	0.29	0.44	0.15	0.45	0.22	0.19	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.27	0.21	0.36	0.29	0.36	0.30	0.38	0.34	0.25	0.20	0.27	0.45	0.20	0.44	0.27	0.30	0.03	0.01	0.00	0.01
P	0.17	0.32	0.22	0.16	0.51	0.06	0.52	0.02	0.40	0.29	0.42	0.58	0.24	0.31	0.15	0.20	0.01	0.01	0.01	0.00