Doublet Group distance statistics: 48346

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 2, 1, 3, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.003, 0.010, 0.016, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.010 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.003, 0.012, 0.020, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.012 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.006, 0.017, 0.027, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.017 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.006, 0.018, 0.030, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.018 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.005, 0.018, 0.032, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.018 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.002, 0.017, 0.033, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.017 std_dev=0.015
N2	A	0, 0.008, 0.024, 0.041, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.024 std_dev=0.016
C4	A	0, 0.003, 0.024, 0.044, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.024 std_dev=0.021
N9	A	0, 0.000, 0.029, 0.059, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.029 std_dev=0.029
O6	A	0, 0.007, 0.037, 0.067, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.037 std_dev=0.030
N7	A	0, 0.003, 0.035, 0.067, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.035 std_dev=0.032
C8	A	0, 0.002, 0.043, 0.083, 0.120 max_d=0.120 avg_d=0.043 std_dev=0.041
O2'	B	0, 0.281, 0.495, 0.708, 0.816 max_d=0.816 avg_d=0.495 std_dev=0.213
O3'	B	0, 0.164, 0.378, 0.592, 0.766 max_d=0.766 avg_d=0.378 std_dev=0.214
C4'	B	0, 0.260, 0.479, 0.699, 0.755 max_d=0.755 avg_d=0.479 std_dev=0.219
C3'	B	0, 0.244, 0.479, 0.715, 0.758 max_d=0.758 avg_d=0.479 std_dev=0.235
C2'	B	0, 0.298, 0.537, 0.777, 0.869 max_d=0.869 avg_d=0.537 std_dev=0.239
C5'	B	0, 0.255, 0.506, 0.757, 0.829 max_d=0.829 avg_d=0.506 std_dev=0.251
O4'	B	0, 0.315, 0.572, 0.828, 0.898 max_d=0.898 avg_d=0.572 std_dev=0.257
C1'	B	0, 0.337, 0.609, 0.880, 0.985 max_d=0.985 avg_d=0.609 std_dev=0.272
O5'	B	0, 0.256, 0.532, 0.808, 0.982 max_d=0.982 avg_d=0.532 std_dev=0.276
O4'	A	0, -0.087, 0.197, 0.482, 0.800 max_d=0.800 avg_d=0.197 std_dev=0.285
P	B	0, 0.329, 0.644, 0.960, 1.093 max_d=1.093 avg_d=0.644 std_dev=0.316
P	A	0, 0.140, 0.469, 0.799, 1.095 max_d=1.095 avg_d=0.469 std_dev=0.330
N1	B	0, 0.345, 0.680, 1.015, 1.121 max_d=1.121 avg_d=0.680 std_dev=0.335
OP1	B	0, 0.409, 0.755, 1.102, 1.191 max_d=1.191 avg_d=0.755 std_dev=0.346
C6	B	0, 0.336, 0.682, 1.029, 1.273 max_d=1.273 avg_d=0.682 std_dev=0.346
C2'	A	0, -0.065, 0.292, 0.650, 1.058 max_d=1.058 avg_d=0.292 std_dev=0.358
C3'	A	0, -0.020, 0.364, 0.749, 1.152 max_d=1.152 avg_d=0.364 std_dev=0.384
O5'	A	0, 0.676, 1.061, 1.445, 1.427 max_d=1.427 avg_d=1.061 std_dev=0.385
C4'	A	0, -0.063, 0.324, 0.710, 1.110 max_d=1.110 avg_d=0.324 std_dev=0.387
OP2	B	0, 0.361, 0.758, 1.155, 1.211 max_d=1.211 avg_d=0.758 std_dev=0.397
C5'	A	0, 0.060, 0.459, 0.857, 1.218 max_d=1.218 avg_d=0.459 std_dev=0.398
C5	B	0, 0.360, 0.762, 1.164, 1.373 max_d=1.373 avg_d=0.762 std_dev=0.402
C2	B	0, 0.312, 0.760, 1.209, 1.722 max_d=1.722 avg_d=0.760 std_dev=0.449
OP2	A	0, 0.757, 1.217, 1.676, 1.593 max_d=1.593 avg_d=1.217 std_dev=0.459
C4	B	0, 0.357, 0.849, 1.341, 1.775 max_d=1.775 avg_d=0.849 std_dev=0.492
O2	B	0, 0.250, 0.751, 1.251, 1.989 max_d=1.989 avg_d=0.751 std_dev=0.501
N3	B	0, 0.316, 0.852, 1.387, 2.059 max_d=2.059 avg_d=0.852 std_dev=0.535
OP1	A	0, 0.596, 1.146, 1.696, 1.970 max_d=1.970 avg_d=1.146 std_dev=0.550
N4	B	0, 0.360, 0.940, 1.521, 2.140 max_d=2.140 avg_d=0.940 std_dev=0.581
O3'	A	0, -0.063, 0.631, 1.326, 2.077 max_d=2.077 avg_d=0.631 std_dev=0.695
O2'	A	0, -0.227, 0.621, 1.469, 2.379 max_d=2.379 avg_d=0.621 std_dev=0.848

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.31	0.01	0.15	0.01	0.16	1.05	0.34
C2	0.01	0.00	0.14	0.01	0.00	0.12	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.12	0.48	0.16	0.42	0.01	0.39	0.92	0.29
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.05	0.01	0.01	0.20	0.03	0.13	0.09	0.17	0.14	0.10	0.02	0.00	0.04	0.02	0.19	0.02	0.28	0.81	0.14
C3'	0.02	0.01	0.00	0.00	0.08	0.00	0.16	0.02	0.14	0.26	0.06	0.08	0.02	0.25	0.13	0.02	0.02	0.01	0.03	0.18	0.32	0.67	0.09
C4	0.00	0.00	0.05	0.08	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.10	0.30	0.08	0.33	0.01	0.34	0.97	0.32
C4'	0.01	0.12	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.03	0.17	0.06	0.19	0.13	0.14	0.06	0.25	0.02	0.01	0.02	0.06	0.15	0.69	0.15
C5	0.00	0.00	0.01	0.16	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.26	0.18	0.02	0.32	0.01	0.42	0.93	0.35
C5'	0.05	0.13	0.20	0.02	0.06	0.00	0.08	0.00	0.07	0.15	0.09	0.19	0.14	0.15	0.05	0.04	0.17	0.02	0.02	0.10	0.26	0.35	0.03
C6	0.01	0.00	0.03	0.14	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.22	0.24	0.05	0.36	0.00	0.49	0.90	0.35
C8	0.01	0.01	0.13	0.26	0.00	0.17	0.01	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.43	0.07	0.11	0.20	0.02	0.31	0.93	0.36
N1	0.01	0.00	0.09	0.06	0.00	0.06	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.38	0.11	0.41	0.00	0.46	0.90	0.32
N2	0.02	0.00	0.17	0.08	0.01	0.19	0.01	0.19	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.23	0.60	0.20	0.46	0.01	0.37	0.87	0.25
N3	0.01	0.00	0.14	0.02	0.00	0.13	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.14	0.48	0.16	0.39	0.01	0.31	0.96	0.28
N7	0.01	0.01	0.10	0.25	0.00	0.14	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.43	0.05	0.07	0.25	0.02	0.40	0.90	0.37
N9	0.00	0.01	0.02	0.13	0.00	0.06	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.19	0.18	0.01	0.24	0.01	0.26	0.99	0.33
O2'	0.03	0.12	0.00	0.02	0.10	0.25	0.26	0.04	0.22	0.43	0.08	0.23	0.14	0.43	0.19	0.00	0.04	0.18	0.19	0.28	0.10	1.20	0.50
O3'	0.31	0.48	0.04	0.02	0.30	0.02	0.18	0.17	0.24	0.07	0.38	0.60	0.48	0.05	0.18	0.04	0.00	0.22	0.24	0.17	0.24	0.64	0.17
O4'	0.01	0.16	0.02	0.01	0.08	0.01	0.02	0.02	0.05	0.11	0.11	0.20	0.16	0.07	0.01	0.18	0.22	0.00	0.14	0.03	0.24	1.01	0.36
O5'	0.15	0.42	0.19	0.03	0.33	0.02	0.32	0.02	0.36	0.20	0.41	0.46	0.39	0.25	0.24	0.19	0.24	0.14	0.00	0.35	0.02	0.02	0.01
O6	0.01	0.01	0.02	0.18	0.01	0.06	0.01	0.10	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.28	0.17	0.03	0.35	0.00	0.54	0.87	0.37
OP1	0.16	0.39	0.28	0.32	0.34	0.15	0.42	0.26	0.49	0.31	0.46	0.37	0.31	0.40	0.26	0.10	0.24	0.24	0.02	0.54	0.00	0.01	0.01
OP2	1.05	0.92	0.81	0.67	0.97	0.69	0.93	0.35	0.90	0.93	0.90	0.87	0.96	0.90	0.99	1.20	0.64	1.01	0.02	0.87	0.01	0.00	0.01
P	0.34	0.29	0.14	0.09	0.32	0.15	0.35	0.03	0.35	0.36	0.32	0.25	0.28	0.37	0.33	0.50	0.17	0.36	0.01	0.37	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.16	0.10	0.12	0.13	0.10	0.11	0.11	0.10	0.13	0.15	0.13	0.19	0.10	0.20	0.12	0.08	0.18	0.09	0.11
C2	0.12	0.13	0.09	0.08	0.12	0.07	0.11	0.06	0.11	0.12	0.13	0.12	0.14	0.09	0.14	0.11	0.07	0.08	0.07	0.06
C2'	0.20	0.20	0.21	0.29	0.21	0.29	0.22	0.36	0.22	0.20	0.20	0.22	0.21	0.17	0.37	0.23	0.33	0.50	0.35	0.39
C3'	0.12	0.15	0.09	0.08	0.12	0.09	0.09	0.08	0.09	0.12	0.14	0.12	0.18	0.10	0.09	0.11	0.08	0.10	0.07	0.07
C4	0.13	0.16	0.09	0.08	0.14	0.07	0.12	0.05	0.12	0.13	0.16	0.14	0.19	0.09	0.15	0.12	0.05	0.11	0.06	0.06
C4'	0.19	0.18	0.16	0.14	0.17	0.15	0.19	0.12	0.19	0.19	0.17	0.17	0.19	0.18	0.09	0.18	0.17	0.09	0.15	0.13
C5	0.16	0.19	0.10	0.07	0.18	0.08	0.16	0.06	0.16	0.17	0.19	0.18	0.22	0.10	0.12	0.15	0.08	0.07	0.09	0.06
C5'	0.19	0.17	0.17	0.14	0.17	0.15	0.20	0.12	0.20	0.19	0.17	0.17	0.17	0.19	0.09	0.18	0.18	0.09	0.16	0.13
C6	0.19	0.21	0.12	0.09	0.20	0.12	0.20	0.11	0.19	0.20	0.21	0.20	0.22	0.11	0.10	0.19	0.12	0.07	0.15	0.10
C8	0.14	0.19	0.09	0.07	0.17	0.07	0.14	0.06	0.13	0.16	0.20	0.18	0.23	0.09	0.15	0.13	0.06	0.12	0.07	0.06
N1	0.16	0.16	0.10	0.09	0.16	0.11	0.16	0.10	0.17	0.16	0.16	0.16	0.17	0.09	0.10	0.17	0.12	0.08	0.13	0.10
N2	0.12	0.13	0.12	0.10	0.11	0.09	0.09	0.07	0.10	0.11	0.13	0.12	0.15	0.11	0.16	0.10	0.07	0.09	0.07	0.07
N3	0.12	0.13	0.09	0.09	0.11	0.07	0.10	0.07	0.10	0.11	0.13	0.12	0.15	0.09	0.17	0.10	0.05	0.11	0.06	0.06
N7	0.16	0.22	0.10	0.07	0.20	0.08	0.17	0.06	0.16	0.18	0.22	0.20	0.25	0.10	0.13	0.15	0.07	0.08	0.09	0.06
N9	0.13	0.17	0.09	0.09	0.14	0.07	0.12	0.07	0.11	0.14	0.16	0.14	0.20	0.09	0.17	0.11	0.06	0.14	0.07	0.08
O2'	0.19	0.22	0.23	0.38	0.20	0.33	0.22	0.44	0.22	0.19	0.22	0.21	0.29	0.17	0.53	0.21	0.42	0.66	0.44	0.49
O3'	0.52	0.50	0.51	0.53	0.52	0.55	0.54	0.54	0.54	0.52	0.50	0.51	0.49	0.50	0.49	0.54	0.60	0.49	0.56	0.55
O4'	0.22	0.20	0.18	0.14	0.20	0.17	0.21	0.13	0.22	0.21	0.20	0.19	0.21	0.20	0.08	0.21	0.18	0.09	0.17	0.15
O5'	0.49	0.49	0.49	0.42	0.49	0.40	0.51	0.33	0.51	0.50	0.48	0.48	0.48	0.52	0.36	0.45	0.42	0.29	0.40	0.36
O6	0.24	0.26	0.16	0.13	0.26	0.16	0.26	0.15	0.25	0.25	0.26	0.26	0.27	0.13	0.10	0.23	0.16	0.10	0.20	0.15
OP1	0.36	0.46	0.44	0.45	0.45	0.36	0.38	0.37	0.35	0.39	0.48	0.48	0.48	0.41	0.53	0.32	0.34	0.34	0.35	0.33
OP2	0.79	0.79	0.78	0.85	0.77	0.89	0.74	0.94	0.74	0.77	0.79	0.78	0.80	0.75	0.89	0.84	0.83	0.91	0.82	0.86
P	0.21	0.26	0.24	0.28	0.25	0.26	0.19	0.30	0.18	0.21	0.27	0.26	0.27	0.21	0.34	0.22	0.23	0.29	0.24	0.25

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.05	0.07	0.04	0.05
C2	0.01	0.00	0.08	0.06	0.01	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.08	0.08	0.06	0.04	0.02	0.08	0.03
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.02	0.00	0.06	0.01	0.09	0.01	0.07	0.03	0.13	0.00	0.02	0.00	0.03	0.03	0.09	0.04
C3'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.10	0.03	0.06	0.04	0.09	0.01	0.01	0.00	0.08	0.06	0.11	0.08
C4	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.03	0.05	0.01	0.07	0.06	0.10	0.05
C4'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.04	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.00	0.01	0.06	0.03	0.02
C5	0.01	0.00	0.06	0.08	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.11	0.04	0.08	0.08	0.09	0.07
C5'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.05	0.00	0.07	0.00	0.06	0.04	0.05	0.06	0.07	0.02	0.03	0.01	0.01	0.08	0.02	0.01
C6	0.00	0.00	0.09	0.10	0.01	0.04	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.12	0.06	0.08	0.07	0.07	0.07
N1	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.05	0.04	0.05	0.03
N3	0.01	0.01	0.07	0.06	0.00	0.01	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.08	0.08	0.05	0.05	0.03	0.09	0.04
N4	0.02	0.02	0.03	0.04	0.00	0.02	0.01	0.06	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.05	0.06	0.01	0.07	0.08	0.11	0.06
O2	0.02	0.00	0.13	0.09	0.02	0.03	0.00	0.07	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.14	0.13	0.10	0.03	0.03	0.08	0.05
O2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.03	0.02	0.05	0.02	0.07	0.01	0.08	0.05	0.14	0.00	0.04	0.03	0.04	0.03	0.08	0.04
O3'	0.01	0.08	0.02	0.01	0.05	0.02	0.11	0.03	0.12	0.03	0.08	0.06	0.13	0.04	0.00	0.01	0.15	0.14	0.17	0.15
O4'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01	0.06	0.01	0.05	0.01	0.10	0.03	0.01	0.00	0.09	0.13	0.06	0.10
O5'	0.05	0.04	0.03	0.08	0.07	0.01	0.08	0.01	0.08	0.05	0.05	0.07	0.03	0.04	0.15	0.09	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.07	0.02	0.03	0.06	0.06	0.06	0.08	0.08	0.07	0.04	0.03	0.08	0.03	0.03	0.14	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.04	0.08	0.09	0.11	0.10	0.03	0.09	0.02	0.07	0.05	0.09	0.11	0.08	0.08	0.17	0.06	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.05	0.03	0.04	0.08	0.05	0.02	0.07	0.01	0.07	0.03	0.04	0.06	0.05	0.04	0.15	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00