Doublet Group distance statistics: 48347

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.015, 0.027, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.015 std_dev=0.011
N9	A	0, 0.003, 0.020, 0.037, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.020 std_dev=0.017
C2	A	0, 0.006, 0.023, 0.041, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.023 std_dev=0.017
C1'	A	0, 0.007, 0.024, 0.041, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.024 std_dev=0.017
N3	A	0, 0.003, 0.021, 0.038, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.021 std_dev=0.017
C4	A	0, 0.008, 0.030, 0.052, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.030 std_dev=0.022
N1	A	0, 0.001, 0.024, 0.047, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.024 std_dev=0.023
C8	A	0, 0.013, 0.044, 0.076, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.044 std_dev=0.032
C5	A	0, 0.014, 0.052, 0.089, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.052 std_dev=0.037
N2	A	0, 0.015, 0.054, 0.093, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.054 std_dev=0.039
O6	A	0, 0.017, 0.059, 0.102, 0.097 max_d=0.097 avg_d=0.059 std_dev=0.042
O4'	A	0, 0.017, 0.075, 0.132, 0.140 max_d=0.140 avg_d=0.075 std_dev=0.057
N7	A	0, 0.023, 0.087, 0.150, 0.151 max_d=0.151 avg_d=0.087 std_dev=0.064
C2'	A	0, 0.047, 0.160, 0.274, 0.251 max_d=0.251 avg_d=0.160 std_dev=0.114
O2'	B	0, 0.139, 0.484, 0.829, 0.782 max_d=0.782 avg_d=0.484 std_dev=0.345
P	A	0, 0.174, 0.596, 1.018, 0.924 max_d=0.924 avg_d=0.596 std_dev=0.422
C2'	B	0, 0.189, 0.645, 1.100, 0.972 max_d=0.972 avg_d=0.645 std_dev=0.456
O5'	A	0, 0.163, 0.634, 1.106, 1.130 max_d=1.130 avg_d=0.634 std_dev=0.472
OP1	A	0, 0.190, 0.696, 1.203, 1.191 max_d=1.191 avg_d=0.696 std_dev=0.507
C4'	A	0, 0.201, 0.712, 1.223, 1.175 max_d=1.175 avg_d=0.712 std_dev=0.511
OP2	A	0, 0.231, 0.797, 1.363, 1.256 max_d=1.256 avg_d=0.797 std_dev=0.566
C1'	B	0, 0.253, 0.879, 1.504, 1.409 max_d=1.409 avg_d=0.879 std_dev=0.626
O2'	A	0, 0.265, 0.908, 1.551, 1.397 max_d=1.397 avg_d=0.908 std_dev=0.643
C5'	A	0, 0.247, 0.948, 1.649, 1.672 max_d=1.672 avg_d=0.948 std_dev=0.701
C3'	A	0, 0.324, 1.108, 1.891, 1.686 max_d=1.686 avg_d=1.108 std_dev=0.784
C6	B	0, 0.380, 1.301, 2.223, 2.018 max_d=2.018 avg_d=1.301 std_dev=0.922
N1	B	0, 0.437, 1.493, 2.548, 2.247 max_d=2.247 avg_d=1.493 std_dev=1.055
O4'	B	0, 0.432, 1.502, 2.572, 2.414 max_d=2.414 avg_d=1.502 std_dev=1.070
C3'	B	0, 0.532, 1.819, 3.106, 2.768 max_d=2.768 avg_d=1.819 std_dev=1.287
OP2	B	0, 0.518, 1.821, 3.125, 2.980 max_d=2.980 avg_d=1.821 std_dev=1.304
O3'	A	0, 0.615, 2.098, 3.582, 3.163 max_d=3.163 avg_d=2.098 std_dev=1.484
C4'	B	0, 0.622, 2.134, 3.645, 3.317 max_d=3.317 avg_d=2.134 std_dev=1.512
C5	B	0, 0.639, 2.189, 3.738, 3.376 max_d=3.376 avg_d=2.189 std_dev=1.550
P	B	0, 0.631, 2.184, 3.737, 3.477 max_d=3.477 avg_d=2.184 std_dev=1.553
O5'	B	0, 0.650, 2.375, 4.101, 4.048 max_d=4.048 avg_d=2.375 std_dev=1.726
C2	B	0, 0.758, 2.588, 4.418, 3.905 max_d=3.905 avg_d=2.588 std_dev=1.830
O2	B	0, 0.810, 2.769, 4.729, 4.228 max_d=4.228 avg_d=2.769 std_dev=1.959
OP1	B	0, 0.717, 2.684, 4.650, 4.656 max_d=4.656 avg_d=2.684 std_dev=1.966
O3'	B	0, 0.875, 2.990, 5.104, 4.528 max_d=4.528 avg_d=2.990 std_dev=2.114
C5'	B	0, 0.874, 2.999, 5.123, 4.656 max_d=4.656 avg_d=2.999 std_dev=2.124
C4	B	0, 0.958, 3.273, 5.587, 4.966 max_d=4.966 avg_d=3.273 std_dev=2.315
N3	B	0, 1.013, 3.458, 5.903, 5.197 max_d=5.197 avg_d=3.458 std_dev=2.445
N4	B	0, 1.220, 4.167, 7.114, 6.318 max_d=6.318 avg_d=4.167 std_dev=2.947

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	0.03	0.04	0.02	0.04	0.03	0.02	0.04	0.01	0.01	0.20	0.01	0.18	0.03	0.13	0.07	0.02
C2	0.03	0.00	0.05	0.05	0.02	0.10	0.03	0.05	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.02	0.09	0.35	0.04	0.17	0.03	0.02	0.19	0.07
C2'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.08	0.04	0.02	0.05	0.05	0.04	0.03	0.01	0.00	0.03	0.03	0.23	0.03	0.23	0.08	0.11
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.08	0.01	0.17	0.03	0.15	0.27	0.09	0.07	0.04	0.25	0.13	0.00	0.01	0.01	0.09	0.18	0.24	0.14	0.02
C4	0.01	0.02	0.02	0.08	0.00	0.03	0.01	0.07	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.13	0.19	0.03	0.22	0.02	0.08	0.13	0.04
C4'	0.03	0.10	0.01	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.05	0.12	0.07	0.13	0.10	0.10	0.04	0.17	0.02	0.01	0.03	0.05	0.20	0.15	0.03
C5	0.03	0.03	0.03	0.17	0.01	0.05	0.00	0.14	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.20	0.06	0.03	0.26	0.01	0.09	0.11	0.05
C5'	0.03	0.05	0.08	0.03	0.07	0.01	0.14	0.00	0.13	0.21	0.08	0.07	0.04	0.21	0.10	0.11	0.10	0.01	0.01	0.16	0.28	0.19	0.02
C6	0.04	0.02	0.04	0.15	0.03	0.05	0.01	0.13	0.00	0.00	0.01	0.03	0.03	0.02	0.03	0.20	0.11	0.03	0.24	0.00	0.05	0.14	0.04
C8	0.02	0.01	0.02	0.27	0.01	0.12	0.01	0.21	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.22	0.15	0.02	0.27	0.01	0.15	0.04	0.08
N1	0.04	0.02	0.05	0.09	0.03	0.07	0.02	0.08	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.03	0.15	0.24	0.04	0.20	0.02	0.00	0.18	0.05
N2	0.03	0.00	0.05	0.07	0.01	0.13	0.03	0.07	0.03	0.01	0.02	0.00	0.00	0.04	0.01	0.04	0.44	0.03	0.14	0.03	0.05	0.22	0.10
N3	0.02	0.01	0.04	0.04	0.01	0.10	0.02	0.04	0.03	0.00	0.02	0.00	0.00	0.04	0.01	0.06	0.35	0.03	0.17	0.03	0.03	0.17	0.06
N7	0.04	0.04	0.03	0.25	0.03	0.10	0.01	0.21	0.02	0.01	0.03	0.04	0.04	0.00	0.04	0.25	0.12	0.03	0.29	0.02	0.14	0.06	0.09
N9	0.01	0.02	0.01	0.13	0.00	0.04	0.02	0.10	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.04	0.00	0.14	0.07	0.01	0.23	0.03	0.11	0.09	0.03
O2'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.13	0.17	0.20	0.11	0.20	0.22	0.15	0.04	0.06	0.25	0.14	0.00	0.05	0.11	0.03	0.24	0.11	0.11	0.11
O3'	0.20	0.35	0.03	0.01	0.19	0.02	0.06	0.10	0.11	0.15	0.24	0.44	0.35	0.12	0.07	0.05	0.00	0.10	0.10	0.06	0.19	0.24	0.08
O4'	0.01	0.04	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.04	0.03	0.03	0.03	0.01	0.11	0.10	0.00	0.15	0.03	0.11	0.11	0.01
O5'	0.18	0.17	0.23	0.09	0.22	0.03	0.26	0.01	0.24	0.27	0.20	0.14	0.17	0.29	0.23	0.03	0.10	0.15	0.00	0.27	0.02	0.02	0.01
O6	0.03	0.03	0.03	0.18	0.02	0.05	0.01	0.16	0.00	0.01	0.02	0.03	0.03	0.02	0.03	0.24	0.06	0.03	0.27	0.00	0.06	0.12	0.06
OP1	0.13	0.02	0.23	0.24	0.08	0.20	0.09	0.28	0.05	0.15	0.00	0.05	0.03	0.14	0.11	0.11	0.19	0.11	0.02	0.06	0.00	0.02	0.01
OP2	0.07	0.19	0.08	0.14	0.13	0.15	0.11	0.19	0.14	0.04	0.18	0.22	0.17	0.06	0.09	0.11	0.24	0.11	0.02	0.12	0.02	0.00	0.01
P	0.02	0.07	0.11	0.02	0.04	0.03	0.05	0.02	0.04	0.08	0.05	0.10	0.06	0.09	0.03	0.11	0.08	0.01	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.07	0.51	0.20	0.09	0.61	0.28	0.44	0.34	0.29	0.30	0.67	0.73	0.54	0.04	0.21	0.19	0.25	0.45	0.25	0.24
C2	0.16	0.51	0.18	0.07	0.52	0.20	0.39	0.24	0.29	0.33	0.59	0.58	0.59	0.03	0.27	0.06	0.15	0.36	0.18	0.15
C2'	0.01	0.41	0.18	0.10	0.55	0.32	0.38	0.37	0.23	0.22	0.59	0.67	0.42	0.04	0.18	0.28	0.31	0.49	0.29	0.29
C3'	0.10	0.54	0.21	0.11	0.69	0.25	0.51	0.30	0.35	0.34	0.73	0.83	0.54	0.05	0.21	0.16	0.21	0.39	0.26	0.20
C4	0.09	0.41	0.21	0.11	0.47	0.16	0.35	0.19	0.25	0.26	0.51	0.54	0.44	0.05	0.14	0.10	0.13	0.33	0.18	0.16
C4'	0.21	0.65	0.28	0.13	0.77	0.21	0.58	0.29	0.42	0.43	0.82	0.90	0.68	0.12	0.23	0.08	0.14	0.35	0.24	0.18
C5	0.08	0.24	0.23	0.20	0.29	0.06	0.24	0.08	0.19	0.18	0.30	0.33	0.23	0.10	0.19	0.03	0.04	0.20	0.13	0.12
C5'	0.14	0.55	0.18	0.10	0.67	0.26	0.49	0.33	0.33	0.35	0.72	0.79	0.58	0.06	0.29	0.11	0.18	0.40	0.24	0.22
C6	0.08	0.15	0.22	0.23	0.18	0.10	0.16	0.13	0.14	0.13	0.18	0.20	0.13	0.11	0.23	0.04	0.09	0.14	0.10	0.13
C8	0.06	0.28	0.23	0.19	0.36	0.07	0.28	0.09	0.20	0.19	0.37	0.42	0.26	0.07	0.18	0.09	0.07	0.25	0.14	0.12
N1	0.13	0.30	0.20	0.11	0.31	0.03	0.25	0.05	0.20	0.22	0.34	0.34	0.33	0.09	0.10	0.03	0.01	0.21	0.10	0.09
N2	0.21	0.66	0.14	0.20	0.64	0.31	0.46	0.37	0.35	0.42	0.73	0.70	0.78	0.04	0.49	0.06	0.22	0.44	0.24	0.21
N3	0.13	0.55	0.18	0.08	0.59	0.25	0.43	0.30	0.31	0.34	0.67	0.67	0.62	0.03	0.27	0.12	0.20	0.41	0.22	0.20
N7	0.07	0.18	0.25	0.27	0.24	0.08	0.21	0.11	0.17	0.14	0.23	0.28	0.15	0.11	0.28	0.03	0.07	0.16	0.14	0.13
N9	0.07	0.40	0.22	0.12	0.49	0.18	0.36	0.21	0.25	0.25	0.53	0.57	0.42	0.05	0.14	0.13	0.15	0.35	0.19	0.17
O2'	0.15	0.65	0.36	0.21	0.82	0.23	0.62	0.30	0.44	0.42	0.86	0.96	0.65	0.14	0.17	0.18	0.24	0.43	0.27	0.21
O3'	0.48	0.97	0.58	0.41	1.15	0.12	0.96	0.09	0.78	0.75	1.18	1.30	0.95	0.35	0.25	0.21	0.16	0.14	0.37	0.24
O4'	0.14	0.57	0.22	0.09	0.66	0.24	0.48	0.32	0.33	0.35	0.72	0.77	0.61	0.07	0.24	0.11	0.19	0.42	0.21	0.21
O5'	0.30	0.70	0.33	0.11	0.78	0.14	0.60	0.22	0.47	0.49	0.84	0.90	0.74	0.23	0.11	0.12	0.14	0.39	0.04	0.08
O6	0.06	0.04	0.20	0.32	0.01	0.23	0.04	0.28	0.05	0.02	0.05	0.03	0.10	0.13	0.40	0.11	0.21	0.09	0.12	0.20
OP1	0.16	0.61	0.12	0.19	0.69	0.33	0.47	0.45	0.31	0.36	0.77	0.82	0.68	0.04	0.46	0.10	0.23	0.56	0.28	0.30
OP2	0.03	0.30	0.04	0.23	0.36	0.35	0.20	0.42	0.10	0.12	0.41	0.45	0.34	0.11	0.42	0.21	0.27	0.57	0.32	0.33
P	0.10	0.49	0.09	0.16	0.56	0.30	0.37	0.40	0.24	0.28	0.63	0.67	0.55	0.00	0.39	0.13	0.22	0.53	0.25	0.27

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.07	0.01	0.05	0.02	0.05	0.03	0.06	0.08	0.05	0.00	0.02	0.01	0.18	0.16	0.27	0.11
C2	0.05	0.00	0.08	0.10	0.02	0.04	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.03	0.02	0.05	0.10	0.07	0.31	0.20	0.45	0.15
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.07	0.00	0.02	0.02	0.03	0.03	0.08	0.08	0.12	0.00	0.01	0.01	0.21	0.36	0.29	0.22
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.11	0.01	0.07	0.01	0.04	0.06	0.11	0.12	0.12	0.01	0.01	0.01	0.22	0.50	0.22	0.26
C4	0.07	0.02	0.07	0.11	0.00	0.07	0.01	0.03	0.03	0.04	0.00	0.01	0.02	0.06	0.13	0.10	0.42	0.25	0.58	0.21
C4'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.07	0.00	0.06	0.01	0.05	0.03	0.05	0.07	0.05	0.03	0.03	0.01	0.01	0.21	0.10	0.06
C5	0.05	0.01	0.02	0.07	0.01	0.06	0.00	0.04	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.09	0.08	0.42	0.24	0.60	0.22
C5'	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.04	0.00	0.03	0.01	0.01	0.04	0.02	0.03	0.01	0.02	0.00	0.28	0.23	0.02
C6	0.05	0.02	0.03	0.04	0.03	0.05	0.01	0.03	0.00	0.02	0.02	0.03	0.04	0.04	0.05	0.07	0.38	0.21	0.53	0.20
N1	0.03	0.02	0.03	0.06	0.04	0.03	0.02	0.01	0.02	0.00	0.03	0.05	0.03	0.02	0.06	0.04	0.30	0.19	0.43	0.16
N3	0.06	0.01	0.08	0.11	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.02	0.06	0.13	0.08	0.37	0.23	0.53	0.19
N4	0.08	0.03	0.08	0.12	0.01	0.07	0.01	0.04	0.03	0.05	0.02	0.00	0.03	0.07	0.16	0.10	0.43	0.25	0.62	0.22
O2	0.05	0.02	0.12	0.12	0.02	0.05	0.02	0.02	0.04	0.03	0.02	0.03	0.00	0.07	0.11	0.07	0.25	0.19	0.36	0.10
O2'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.06	0.03	0.03	0.03	0.04	0.02	0.06	0.07	0.07	0.00	0.06	0.03	0.04	0.22	0.14	0.11
O3'	0.02	0.10	0.01	0.01	0.13	0.03	0.09	0.01	0.05	0.06	0.13	0.16	0.11	0.06	0.00	0.02	0.13	0.55	0.13	0.22
O4'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.10	0.01	0.08	0.02	0.07	0.04	0.08	0.10	0.07	0.03	0.02	0.00	0.10	0.07	0.20	0.12
O5'	0.18	0.31	0.21	0.22	0.42	0.01	0.42	0.00	0.38	0.30	0.37	0.43	0.25	0.04	0.13	0.10	0.00	0.01	0.04	0.00
OP1	0.16	0.20	0.36	0.50	0.25	0.21	0.24	0.28	0.21	0.19	0.23	0.25	0.19	0.22	0.55	0.07	0.01	0.00	0.03	0.01
OP2	0.27	0.45	0.29	0.22	0.58	0.10	0.60	0.23	0.53	0.43	0.53	0.62	0.36	0.14	0.13	0.20	0.04	0.03	0.00	0.04
P	0.11	0.15	0.22	0.26	0.21	0.06	0.22	0.02	0.20	0.16	0.19	0.22	0.10	0.11	0.22	0.12	0.00	0.01	0.04	0.00