Doublet Group distance statistics: 48348

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 6, 11, 26, 9, 2, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.001, 0.006, 0.012, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.006 std_dev=0.005
N3	A	0, 0.003, 0.010, 0.017, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.010 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.005, 0.012, 0.020, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.012 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.006, 0.015, 0.023, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.015 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.007, 0.016, 0.025, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.016 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.009, 0.019, 0.028, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.019 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.009, 0.020, 0.031, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.020 std_dev=0.011
O2	A	0, 0.019, 0.048, 0.076, 0.176 max_d=0.176 avg_d=0.048 std_dev=0.029
N4	A	0, 0.018, 0.047, 0.076, 0.128 max_d=0.128 avg_d=0.047 std_dev=0.029
C4	B	0, 0.139, 0.246, 0.353, 0.494 max_d=0.494 avg_d=0.246 std_dev=0.107
O4'	A	0, 0.067, 0.181, 0.296, 0.483 max_d=0.483 avg_d=0.181 std_dev=0.114
C2'	A	0, 0.101, 0.223, 0.344, 0.507 max_d=0.507 avg_d=0.223 std_dev=0.121
N3	B	0, 0.143, 0.268, 0.393, 0.649 max_d=0.649 avg_d=0.268 std_dev=0.125
N9	B	0, 0.162, 0.296, 0.430, 0.710 max_d=0.710 avg_d=0.296 std_dev=0.134
C2	B	0, 0.123, 0.278, 0.433, 0.776 max_d=0.776 avg_d=0.278 std_dev=0.155
N1	B	0, 0.140, 0.298, 0.456, 0.914 max_d=0.914 avg_d=0.298 std_dev=0.158
O2'	A	0, 0.158, 0.320, 0.483, 0.610 max_d=0.610 avg_d=0.320 std_dev=0.162
C4'	A	0, 0.130, 0.294, 0.458, 0.708 max_d=0.708 avg_d=0.294 std_dev=0.164
C5	B	0, 0.177, 0.344, 0.511, 0.765 max_d=0.765 avg_d=0.344 std_dev=0.167
C1'	B	0, 0.165, 0.337, 0.508, 1.115 max_d=1.115 avg_d=0.337 std_dev=0.172
C6	B	0, 0.207, 0.383, 0.559, 1.007 max_d=1.007 avg_d=0.383 std_dev=0.176
C3'	A	0, 0.165, 0.344, 0.524, 0.772 max_d=0.772 avg_d=0.344 std_dev=0.179
C2'	B	0, 0.221, 0.406, 0.591, 0.911 max_d=0.911 avg_d=0.406 std_dev=0.185
C8	B	0, 0.185, 0.413, 0.641, 1.199 max_d=1.199 avg_d=0.413 std_dev=0.228
N2	B	0, 0.169, 0.397, 0.626, 1.325 max_d=1.325 avg_d=0.397 std_dev=0.228
C3'	B	0, 0.213, 0.451, 0.690, 1.124 max_d=1.124 avg_d=0.451 std_dev=0.238
N7	B	0, 0.228, 0.473, 0.717, 1.278 max_d=1.278 avg_d=0.473 std_dev=0.244
O6	B	0, 0.283, 0.529, 0.776, 1.529 max_d=1.529 avg_d=0.529 std_dev=0.247
O4'	B	0, 0.173, 0.441, 0.709, 1.770 max_d=1.770 avg_d=0.441 std_dev=0.268
O3'	A	0, 0.252, 0.526, 0.801, 1.134 max_d=1.134 avg_d=0.526 std_dev=0.275
C5'	A	0, 0.244, 0.525, 0.806, 1.180 max_d=1.180 avg_d=0.525 std_dev=0.281
O2'	B	0, 0.313, 0.620, 0.927, 1.756 max_d=1.756 avg_d=0.620 std_dev=0.307
O3'	B	0, 0.281, 0.608, 0.935, 1.553 max_d=1.553 avg_d=0.608 std_dev=0.327
C4'	B	0, 0.199, 0.538, 0.878, 1.856 max_d=1.856 avg_d=0.538 std_dev=0.340
C5'	B	0, 0.369, 0.834, 1.299, 2.851 max_d=2.851 avg_d=0.834 std_dev=0.465
O5'	A	0, 0.185, 0.652, 1.119, 2.183 max_d=2.183 avg_d=0.652 std_dev=0.467
O5'	B	0, 0.403, 0.890, 1.376, 2.935 max_d=2.935 avg_d=0.890 std_dev=0.487
P	A	0, 0.085, 0.712, 1.339, 4.045 max_d=4.045 avg_d=0.712 std_dev=0.627
P	B	0, 0.514, 1.228, 1.943, 4.125 max_d=4.125 avg_d=1.228 std_dev=0.714
OP1	B	0, 0.553, 1.329, 2.104, 4.155 max_d=4.155 avg_d=1.329 std_dev=0.775
OP1	A	0, 0.048, 0.869, 1.690, 3.990 max_d=3.990 avg_d=0.869 std_dev=0.821
OP2	A	0, -0.146, 0.793, 1.732, 5.898 max_d=5.898 avg_d=0.793 std_dev=0.939
OP2	B	0, 0.427, 1.522, 2.618, 5.330 max_d=5.330 avg_d=1.522 std_dev=1.096

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.05	0.02	0.02	0.00	0.18	0.21	0.22	0.14
C2	0.02	0.00	0.07	0.07	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.08	0.03	0.33	0.35	0.42	0.28
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.05	0.01	0.06	0.02	0.06	0.02	0.06	0.06	0.11	0.00	0.02	0.01	0.19	0.27	0.20	0.14
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.08	0.00	0.10	0.02	0.10	0.05	0.08	0.09	0.11	0.02	0.01	0.01	0.25	0.33	0.24	0.20
C4	0.02	0.01	0.05	0.08	0.00	0.07	0.00	0.16	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.09	0.03	0.46	0.52	0.66	0.46
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.07	0.00	0.09	0.01	0.08	0.04	0.05	0.07	0.05	0.05	0.02	0.00	0.02	0.19	0.23	0.09
C5	0.01	0.01	0.06	0.10	0.00	0.09	0.00	0.17	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.12	0.03	0.48	0.54	0.67	0.49
C5'	0.03	0.09	0.02	0.02	0.16	0.01	0.17	0.00	0.15	0.09	0.12	0.17	0.08	0.05	0.04	0.01	0.01	0.23	0.29	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.10	0.01	0.08	0.00	0.15	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.11	0.03	0.43	0.42	0.52	0.39
N1	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.05	0.02	0.32	0.31	0.38	0.26
N3	0.02	0.00	0.06	0.08	0.00	0.05	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.09	0.03	0.40	0.44	0.54	0.37
N4	0.02	0.01	0.06	0.09	0.00	0.07	0.01	0.17	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.11	0.03	0.49	0.58	0.75	0.52
O2	0.05	0.01	0.11	0.11	0.01	0.05	0.02	0.08	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.12	0.13	0.06	0.27	0.30	0.33	0.22
O2'	0.02	0.07	0.00	0.02	0.05	0.05	0.04	0.05	0.04	0.03	0.07	0.06	0.12	0.00	0.05	0.04	0.06	0.28	0.20	0.17
O3'	0.02	0.08	0.02	0.01	0.09	0.02	0.12	0.04	0.11	0.05	0.09	0.11	0.13	0.05	0.00	0.02	0.25	0.44	0.30	0.27
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.03	0.06	0.04	0.02	0.00	0.16	0.21	0.26	0.18
O5'	0.18	0.33	0.19	0.25	0.46	0.02	0.48	0.01	0.43	0.32	0.40	0.49	0.27	0.06	0.25	0.16	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.21	0.35	0.27	0.33	0.52	0.19	0.54	0.23	0.42	0.31	0.44	0.58	0.30	0.28	0.44	0.21	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.22	0.42	0.20	0.24	0.66	0.23	0.67	0.29	0.52	0.38	0.54	0.75	0.33	0.20	0.30	0.26	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.14	0.28	0.14	0.20	0.46	0.09	0.49	0.01	0.39	0.26	0.37	0.52	0.22	0.17	0.27	0.18	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.12	0.17	0.19	0.11	0.12	0.13	0.17	0.16	0.12	0.12	0.19	0.14	0.15	0.11	0.23	0.24	0.13	0.41	0.23	0.50	0.66	0.43
C2	0.12	0.14	0.15	0.17	0.11	0.11	0.13	0.18	0.15	0.12	0.11	0.22	0.14	0.15	0.10	0.20	0.21	0.11	0.43	0.23	0.51	0.69	0.45
C2'	0.19	0.18	0.23	0.24	0.17	0.19	0.17	0.20	0.19	0.17	0.17	0.22	0.19	0.18	0.17	0.27	0.30	0.19	0.37	0.25	0.43	0.58	0.37
C3'	0.22	0.20	0.24	0.25	0.18	0.21	0.18	0.22	0.20	0.19	0.18	0.24	0.21	0.20	0.19	0.28	0.30	0.22	0.38	0.25	0.43	0.61	0.39
C4	0.12	0.18	0.13	0.15	0.12	0.13	0.13	0.22	0.13	0.14	0.14	0.25	0.15	0.16	0.12	0.17	0.18	0.12	0.49	0.18	0.60	0.83	0.55
C4'	0.15	0.14	0.18	0.20	0.12	0.14	0.14	0.17	0.16	0.13	0.13	0.20	0.15	0.16	0.13	0.24	0.25	0.15	0.39	0.22	0.48	0.65	0.42
C5	0.12	0.17	0.13	0.15	0.12	0.12	0.13	0.21	0.12	0.14	0.13	0.24	0.15	0.16	0.11	0.17	0.18	0.12	0.49	0.18	0.60	0.83	0.55
C5'	0.17	0.17	0.19	0.21	0.15	0.16	0.16	0.20	0.17	0.16	0.15	0.22	0.17	0.18	0.15	0.24	0.26	0.16	0.44	0.23	0.52	0.72	0.47
C6	0.12	0.15	0.14	0.16	0.11	0.11	0.12	0.19	0.13	0.13	0.11	0.23	0.14	0.15	0.11	0.19	0.20	0.11	0.46	0.20	0.56	0.77	0.51
N1	0.12	0.14	0.15	0.17	0.10	0.11	0.12	0.18	0.15	0.12	0.11	0.21	0.14	0.15	0.10	0.20	0.22	0.11	0.43	0.22	0.52	0.71	0.46
N3	0.12	0.16	0.13	0.15	0.11	0.11	0.13	0.19	0.14	0.13	0.11	0.24	0.14	0.15	0.11	0.18	0.19	0.11	0.46	0.22	0.55	0.76	0.50
N4	0.14	0.20	0.13	0.16	0.14	0.15	0.14	0.25	0.13	0.16	0.18	0.25	0.17	0.17	0.14	0.15	0.18	0.15	0.53	0.15	0.64	0.90	0.60
O2	0.14	0.12	0.16	0.19	0.11	0.13	0.14	0.17	0.17	0.13	0.14	0.20	0.13	0.15	0.11	0.22	0.24	0.12	0.39	0.24	0.47	0.62	0.41
O2'	0.23	0.19	0.25	0.27	0.19	0.22	0.19	0.22	0.21	0.19	0.19	0.22	0.21	0.20	0.20	0.30	0.33	0.23	0.37	0.26	0.45	0.54	0.37
O3'	0.28	0.24	0.30	0.30	0.23	0.27	0.23	0.27	0.23	0.24	0.21	0.27	0.26	0.24	0.25	0.34	0.35	0.28	0.38	0.27	0.41	0.57	0.37
O4'	0.13	0.12	0.17	0.19	0.10	0.12	0.13	0.18	0.15	0.12	0.10	0.19	0.13	0.15	0.10	0.23	0.24	0.12	0.43	0.22	0.53	0.70	0.46
O5'	0.37	0.37	0.37	0.39	0.38	0.37	0.41	0.42	0.42	0.41	0.39	0.37	0.37	0.44	0.39	0.38	0.40	0.38	0.58	0.46	0.67	0.83	0.63
OP1	0.46	0.43	0.46	0.47	0.46	0.46	0.49	0.51	0.50	0.50	0.46	0.43	0.44	0.52	0.47	0.46	0.48	0.46	0.60	0.54	0.69	0.92	0.67
OP2	0.52	0.51	0.50	0.52	0.55	0.53	0.60	0.59	0.61	0.61	0.55	0.48	0.51	0.65	0.56	0.49	0.51	0.55	0.79	0.67	0.87	1.10	0.87
P	0.34	0.34	0.35	0.36	0.35	0.35	0.39	0.40	0.40	0.40	0.36	0.34	0.34	0.43	0.36	0.36	0.38	0.35	0.59	0.45	0.68	0.91	0.66

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.20	0.01	0.33	0.24	0.22
C2	0.03	0.00	0.12	0.15	0.01	0.07	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.13	0.19	0.03	0.36	0.01	0.43	0.55	0.36
C2'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.06	0.01	0.04	0.02	0.06	0.07	0.09	0.15	0.12	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.21	0.06	0.31	0.24	0.19
C3'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.09	0.00	0.08	0.02	0.10	0.11	0.13	0.18	0.14	0.10	0.05	0.02	0.01	0.02	0.30	0.10	0.32	0.31	0.22
C4	0.02	0.01	0.06	0.09	0.00	0.05	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.10	0.01	0.39	0.01	0.44	0.55	0.37
C4'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.07	0.09	0.07	0.08	0.06	0.09	0.04	0.05	0.02	0.00	0.02	0.08	0.27	0.21	0.17
C5	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.07	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.09	0.01	0.49	0.01	0.54	0.76	0.51
C5'	0.03	0.13	0.02	0.02	0.12	0.01	0.17	0.00	0.18	0.17	0.16	0.12	0.10	0.20	0.11	0.05	0.04	0.01	0.01	0.20	0.17	0.27	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.10	0.01	0.07	0.01	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.12	0.02	0.50	0.00	0.57	0.82	0.54
C8	0.01	0.01	0.07	0.11	0.00	0.09	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.13	0.03	0.51	0.02	0.53	0.70	0.50
N1	0.02	0.00	0.09	0.13	0.01	0.07	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.16	0.02	0.44	0.01	0.50	0.70	0.45
N2	0.03	0.00	0.15	0.18	0.01	0.08	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.16	0.24	0.04	0.32	0.02	0.41	0.49	0.32
N3	0.03	0.00	0.12	0.14	0.00	0.06	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.17	0.03	0.32	0.01	0.40	0.45	0.30
N7	0.01	0.01	0.05	0.10	0.00	0.09	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.12	0.03	0.55	0.02	0.62	0.87	0.60
N9	0.00	0.01	0.02	0.05	0.01	0.04	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.05	0.01	0.38	0.01	0.40	0.47	0.33
O2'	0.02	0.13	0.00	0.02	0.07	0.05	0.06	0.05	0.08	0.04	0.11	0.16	0.12	0.04	0.03	0.00	0.04	0.05	0.07	0.08	0.38	0.23	0.25
O3'	0.02	0.19	0.02	0.01	0.10	0.02	0.09	0.04	0.12	0.13	0.16	0.24	0.17	0.12	0.05	0.04	0.00	0.02	0.30	0.12	0.38	0.40	0.27
O4'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.04	0.03	0.03	0.01	0.05	0.02	0.00	0.17	0.02	0.34	0.26	0.26
O5'	0.20	0.36	0.21	0.30	0.39	0.02	0.49	0.01	0.50	0.51	0.44	0.32	0.32	0.55	0.38	0.07	0.30	0.17	0.00	0.54	0.02	0.02	0.01
O6	0.01	0.01	0.06	0.10	0.01	0.08	0.01	0.20	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.08	0.12	0.02	0.54	0.00	0.65	0.94	0.62
OP1	0.33	0.43	0.31	0.32	0.44	0.27	0.54	0.17	0.57	0.53	0.50	0.41	0.40	0.62	0.40	0.38	0.38	0.34	0.02	0.65	0.00	0.01	0.01
OP2	0.24	0.55	0.24	0.31	0.55	0.21	0.76	0.27	0.82	0.70	0.70	0.49	0.45	0.87	0.47	0.23	0.40	0.26	0.02	0.94	0.01	0.00	0.01
P	0.22	0.36	0.19	0.22	0.37	0.17	0.51	0.02	0.54	0.50	0.45	0.32	0.30	0.60	0.33	0.25	0.27	0.26	0.01	0.62	0.01	0.01	0.00