Doublet Group distance statistics: 48349

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 3, 19, 14, 7, 3, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.003, 0.008, 0.013, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.008 std_dev=0.005
N3	A	0, 0.002, 0.010, 0.017, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.010 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.007, 0.017, 0.027, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.017 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.004, 0.013, 0.023, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.013 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.009, 0.020, 0.030, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.020 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.007, 0.017, 0.028, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.017 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.008, 0.020, 0.032, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.020 std_dev=0.012
O2	A	0, 0.017, 0.045, 0.073, 0.147 max_d=0.147 avg_d=0.045 std_dev=0.028
N4	A	0, 0.023, 0.055, 0.087, 0.166 max_d=0.166 avg_d=0.055 std_dev=0.032
O4'	A	0, 0.053, 0.134, 0.215, 0.372 max_d=0.372 avg_d=0.134 std_dev=0.081
C2'	A	0, 0.067, 0.153, 0.239, 0.367 max_d=0.367 avg_d=0.153 std_dev=0.086
O2'	A	0, 0.104, 0.227, 0.349, 0.544 max_d=0.544 avg_d=0.227 std_dev=0.123
C4	B	0, 0.143, 0.266, 0.389, 0.511 max_d=0.511 avg_d=0.266 std_dev=0.123
N3	B	0, 0.122, 0.246, 0.371, 0.482 max_d=0.482 avg_d=0.246 std_dev=0.124
C3'	A	0, 0.144, 0.277, 0.410, 0.576 max_d=0.576 avg_d=0.277 std_dev=0.133
C4'	A	0, 0.099, 0.242, 0.386, 0.644 max_d=0.644 avg_d=0.242 std_dev=0.144
C2	B	0, 0.140, 0.294, 0.447, 0.804 max_d=0.804 avg_d=0.294 std_dev=0.154
N1	B	0, 0.185, 0.345, 0.505, 0.718 max_d=0.718 avg_d=0.345 std_dev=0.160
N9	B	0, 0.144, 0.306, 0.467, 1.013 max_d=1.013 avg_d=0.306 std_dev=0.161
C5	B	0, 0.182, 0.369, 0.556, 0.768 max_d=0.768 avg_d=0.369 std_dev=0.187
C1'	B	0, 0.115, 0.306, 0.497, 1.084 max_d=1.084 avg_d=0.306 std_dev=0.191
O3'	A	0, 0.251, 0.447, 0.643, 0.844 max_d=0.844 avg_d=0.447 std_dev=0.196
C6	B	0, 0.181, 0.393, 0.605, 0.863 max_d=0.863 avg_d=0.393 std_dev=0.212
C2'	B	0, 0.225, 0.452, 0.678, 1.239 max_d=1.239 avg_d=0.452 std_dev=0.227
N2	B	0, 0.146, 0.384, 0.622, 1.455 max_d=1.455 avg_d=0.384 std_dev=0.238
O4'	B	0, 0.186, 0.426, 0.665, 1.262 max_d=1.262 avg_d=0.426 std_dev=0.240
C5'	A	0, 0.140, 0.396, 0.651, 1.267 max_d=1.267 avg_d=0.396 std_dev=0.256
C8	B	0, 0.170, 0.426, 0.683, 1.522 max_d=1.522 avg_d=0.426 std_dev=0.257
N7	B	0, 0.195, 0.474, 0.753, 1.317 max_d=1.317 avg_d=0.474 std_dev=0.279
O5'	A	0, 0.152, 0.433, 0.715, 1.168 max_d=1.168 avg_d=0.433 std_dev=0.281
O2'	B	0, 0.241, 0.531, 0.821, 1.230 max_d=1.230 avg_d=0.531 std_dev=0.290
O6	B	0, 0.204, 0.497, 0.790, 1.193 max_d=1.193 avg_d=0.497 std_dev=0.293
C4'	B	0, 0.290, 0.584, 0.878, 1.492 max_d=1.492 avg_d=0.584 std_dev=0.294
C3'	B	0, 0.327, 0.628, 0.929, 1.316 max_d=1.316 avg_d=0.628 std_dev=0.301
P	A	0, 0.174, 0.598, 1.021, 2.239 max_d=2.239 avg_d=0.598 std_dev=0.423
O3'	B	0, 0.405, 0.832, 1.259, 2.248 max_d=2.248 avg_d=0.832 std_dev=0.427
C5'	B	0, 0.425, 0.880, 1.336, 2.051 max_d=2.051 avg_d=0.880 std_dev=0.455
OP1	A	0, 0.333, 0.792, 1.252, 2.081 max_d=2.081 avg_d=0.792 std_dev=0.459
O5'	B	0, 0.441, 0.933, 1.424, 2.360 max_d=2.360 avg_d=0.933 std_dev=0.492
OP2	A	0, 0.154, 0.720, 1.287, 3.432 max_d=3.432 avg_d=0.720 std_dev=0.566
P	B	0, 0.497, 1.259, 2.022, 3.148 max_d=3.148 avg_d=1.259 std_dev=0.763
OP1	B	0, 0.567, 1.488, 2.409, 3.503 max_d=3.503 avg_d=1.488 std_dev=0.921
OP2	B	0, 0.346, 1.577, 2.807, 5.783 max_d=5.783 avg_d=1.577 std_dev=1.230

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.02	0.00	0.12	0.11	0.15	0.09
C2	0.02	0.00	0.07	0.10	0.01	0.05	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.11	0.03	0.17	0.18	0.27	0.20
C2'	0.00	0.07	0.00	0.01	0.05	0.02	0.06	0.02	0.06	0.03	0.06	0.06	0.11	0.01	0.02	0.01	0.07	0.15	0.18	0.09
C3'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.12	0.01	0.13	0.02	0.12	0.07	0.12	0.14	0.12	0.02	0.01	0.01	0.06	0.17	0.20	0.12
C4	0.02	0.01	0.05	0.12	0.00	0.09	0.01	0.19	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.15	0.03	0.22	0.28	0.36	0.28
C4'	0.01	0.05	0.02	0.01	0.09	0.00	0.10	0.01	0.09	0.05	0.07	0.10	0.06	0.06	0.02	0.00	0.01	0.10	0.08	0.02
C5	0.02	0.01	0.06	0.13	0.01	0.10	0.00	0.21	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.16	0.03	0.22	0.27	0.36	0.28
C5'	0.04	0.12	0.02	0.02	0.19	0.01	0.21	0.00	0.18	0.12	0.16	0.21	0.09	0.06	0.04	0.02	0.01	0.10	0.03	0.02
C6	0.01	0.01	0.06	0.12	0.01	0.09	0.00	0.18	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.13	0.03	0.20	0.20	0.28	0.21
N1	0.01	0.01	0.03	0.07	0.01	0.05	0.01	0.12	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.07	0.02	0.16	0.15	0.23	0.16
N3	0.02	0.00	0.06	0.12	0.00	0.07	0.01	0.16	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.13	0.03	0.20	0.23	0.33	0.25
N4	0.02	0.01	0.06	0.14	0.01	0.10	0.01	0.21	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.17	0.04	0.22	0.32	0.40	0.31
O2	0.04	0.00	0.11	0.12	0.01	0.06	0.01	0.09	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.12	0.14	0.05	0.15	0.15	0.25	0.17
O2'	0.02	0.07	0.01	0.02	0.05	0.06	0.05	0.06	0.04	0.03	0.07	0.06	0.12	0.00	0.05	0.05	0.04	0.14	0.17	0.07
O3'	0.02	0.11	0.02	0.01	0.15	0.02	0.16	0.04	0.13	0.07	0.13	0.17	0.14	0.05	0.00	0.02	0.14	0.23	0.34	0.21
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.02	0.03	0.02	0.03	0.04	0.05	0.05	0.02	0.00	0.13	0.11	0.15	0.12
O5'	0.12	0.17	0.07	0.06	0.22	0.01	0.22	0.01	0.20	0.16	0.20	0.22	0.15	0.04	0.14	0.13	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.11	0.18	0.15	0.17	0.28	0.10	0.27	0.10	0.20	0.15	0.23	0.32	0.15	0.14	0.23	0.11	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.15	0.27	0.18	0.20	0.36	0.08	0.36	0.03	0.28	0.23	0.33	0.40	0.25	0.17	0.34	0.15	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.20	0.09	0.12	0.28	0.02	0.28	0.02	0.21	0.16	0.25	0.31	0.17	0.07	0.21	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.11	0.23	0.31	0.13	0.18	0.18	0.26	0.22	0.16	0.18	0.11	0.11	0.20	0.13	0.25	0.36	0.12	0.45	0.28	0.48	0.73	0.48
C2	0.11	0.09	0.20	0.28	0.12	0.17	0.17	0.25	0.21	0.16	0.16	0.14	0.09	0.19	0.12	0.22	0.33	0.11	0.47	0.28	0.49	0.77	0.51
C2'	0.21	0.17	0.31	0.36	0.19	0.24	0.22	0.26	0.24	0.22	0.21	0.19	0.17	0.24	0.20	0.31	0.41	0.19	0.39	0.30	0.40	0.69	0.43
C3'	0.24	0.18	0.32	0.36	0.20	0.26	0.22	0.28	0.23	0.24	0.20	0.21	0.20	0.24	0.22	0.33	0.41	0.22	0.41	0.28	0.41	0.73	0.46
C4	0.12	0.12	0.18	0.28	0.12	0.18	0.16	0.29	0.18	0.17	0.11	0.19	0.11	0.21	0.13	0.18	0.32	0.12	0.54	0.26	0.58	0.94	0.63
C4'	0.16	0.12	0.25	0.31	0.14	0.20	0.18	0.25	0.20	0.18	0.16	0.13	0.12	0.20	0.15	0.26	0.37	0.14	0.44	0.26	0.47	0.74	0.48
C5	0.12	0.11	0.18	0.28	0.12	0.18	0.16	0.29	0.18	0.17	0.11	0.17	0.11	0.21	0.13	0.19	0.33	0.12	0.55	0.25	0.60	0.95	0.64
C5'	0.19	0.15	0.26	0.32	0.17	0.21	0.20	0.27	0.21	0.21	0.17	0.15	0.16	0.23	0.18	0.28	0.37	0.18	0.46	0.26	0.50	0.81	0.52
C6	0.11	0.09	0.19	0.28	0.11	0.17	0.16	0.28	0.19	0.16	0.12	0.14	0.10	0.20	0.12	0.21	0.33	0.11	0.52	0.26	0.56	0.88	0.59
N1	0.12	0.09	0.21	0.29	0.12	0.17	0.17	0.26	0.20	0.16	0.15	0.12	0.10	0.19	0.12	0.23	0.34	0.11	0.48	0.27	0.51	0.79	0.53
N3	0.12	0.11	0.18	0.28	0.12	0.17	0.17	0.27	0.20	0.17	0.12	0.18	0.11	0.20	0.13	0.19	0.32	0.11	0.51	0.28	0.53	0.85	0.57
N4	0.13	0.15	0.17	0.29	0.13	0.20	0.16	0.31	0.16	0.19	0.13	0.22	0.13	0.21	0.14	0.17	0.33	0.14	0.57	0.23	0.63	1.02	0.68
O2	0.12	0.10	0.22	0.29	0.12	0.17	0.17	0.24	0.22	0.15	0.19	0.11	0.10	0.18	0.12	0.24	0.34	0.11	0.43	0.27	0.45	0.68	0.45
O2'	0.23	0.22	0.34	0.38	0.22	0.27	0.26	0.29	0.29	0.25	0.27	0.22	0.21	0.27	0.23	0.33	0.45	0.22	0.39	0.33	0.40	0.64	0.41
O3'	0.30	0.22	0.37	0.40	0.24	0.31	0.25	0.30	0.25	0.28	0.23	0.25	0.24	0.28	0.27	0.38	0.44	0.28	0.40	0.30	0.39	0.71	0.44
O4'	0.13	0.11	0.22	0.30	0.13	0.18	0.18	0.27	0.21	0.16	0.17	0.11	0.11	0.20	0.13	0.26	0.36	0.12	0.48	0.28	0.53	0.77	0.52
O5'	0.23	0.19	0.28	0.34	0.21	0.25	0.23	0.31	0.23	0.25	0.19	0.21	0.20	0.26	0.23	0.30	0.37	0.23	0.48	0.27	0.52	0.89	0.57
OP1	0.29	0.23	0.31	0.36	0.27	0.30	0.29	0.35	0.28	0.32	0.24	0.23	0.25	0.33	0.29	0.33	0.39	0.29	0.49	0.32	0.55	0.96	0.62
OP2	0.38	0.33	0.38	0.42	0.36	0.38	0.36	0.42	0.35	0.39	0.32	0.35	0.35	0.39	0.37	0.41	0.43	0.38	0.55	0.37	0.62	1.07	0.70
P	0.29	0.24	0.30	0.35	0.27	0.29	0.28	0.34	0.27	0.30	0.23	0.26	0.26	0.31	0.28	0.34	0.37	0.29	0.51	0.30	0.56	0.97	0.63

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.08	0.00	0.19	0.01	0.22	0.39	0.18
C2	0.02	0.00	0.16	0.22	0.01	0.09	0.01	0.18	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.17	0.26	0.03	0.40	0.01	0.39	0.59	0.40
C2'	0.00	0.16	0.00	0.01	0.08	0.02	0.05	0.08	0.08	0.08	0.12	0.19	0.16	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.25	0.07	0.31	0.30	0.17
C3'	0.02	0.22	0.01	0.00	0.15	0.00	0.15	0.03	0.18	0.15	0.21	0.25	0.20	0.15	0.09	0.02	0.01	0.02	0.35	0.18	0.41	0.27	0.25
C4	0.01	0.01	0.08	0.15	0.00	0.07	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.14	0.02	0.42	0.01	0.38	0.61	0.41
C4'	0.01	0.09	0.02	0.00	0.07	0.00	0.08	0.01	0.09	0.09	0.09	0.10	0.08	0.09	0.05	0.12	0.02	0.00	0.02	0.10	0.19	0.41	0.10
C5	0.01	0.01	0.05	0.15	0.00	0.08	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.09	0.15	0.02	0.52	0.01	0.49	0.82	0.55
C5'	0.06	0.18	0.08	0.03	0.16	0.01	0.20	0.00	0.22	0.19	0.20	0.18	0.15	0.22	0.14	0.07	0.09	0.01	0.01	0.24	0.22	0.37	0.02
C6	0.01	0.01	0.08	0.18	0.01	0.09	0.01	0.22	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.12	0.20	0.02	0.53	0.00	0.53	0.87	0.59
C8	0.01	0.02	0.08	0.15	0.01	0.09	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.06	0.14	0.04	0.51	0.02	0.45	0.78	0.53
N1	0.02	0.01	0.12	0.21	0.01	0.09	0.01	0.20	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.15	0.24	0.03	0.48	0.01	0.46	0.74	0.50
N2	0.03	0.00	0.19	0.25	0.01	0.10	0.02	0.18	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.20	0.31	0.04	0.37	0.02	0.37	0.53	0.35
N3	0.02	0.01	0.16	0.20	0.01	0.08	0.01	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.16	0.22	0.03	0.36	0.01	0.34	0.51	0.33
N7	0.01	0.01	0.06	0.15	0.01	0.09	0.00	0.22	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.07	0.16	0.03	0.57	0.02	0.55	0.94	0.64
N9	0.00	0.01	0.02	0.09	0.01	0.05	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.05	0.07	0.01	0.38	0.01	0.32	0.55	0.36
O2'	0.01	0.17	0.00	0.02	0.10	0.12	0.09	0.07	0.12	0.06	0.15	0.20	0.16	0.07	0.05	0.00	0.06	0.08	0.10	0.11	0.28	0.47	0.17
O3'	0.08	0.26	0.02	0.01	0.14	0.02	0.15	0.09	0.20	0.14	0.24	0.31	0.22	0.16	0.07	0.06	0.00	0.08	0.31	0.21	0.54	0.41	0.31
O4'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.03	0.04	0.03	0.03	0.01	0.08	0.08	0.00	0.13	0.03	0.21	0.45	0.21
O5'	0.19	0.40	0.25	0.35	0.42	0.02	0.52	0.01	0.53	0.51	0.48	0.37	0.36	0.57	0.38	0.10	0.31	0.13	0.00	0.57	0.02	0.02	0.01
O6	0.01	0.01	0.07	0.18	0.01	0.10	0.01	0.24	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.11	0.21	0.03	0.57	0.00	0.60	1.00	0.67
OP1	0.22	0.39	0.31	0.41	0.38	0.19	0.49	0.22	0.53	0.45	0.46	0.37	0.34	0.55	0.32	0.28	0.54	0.21	0.02	0.60	0.00	0.01	0.01
OP2	0.39	0.59	0.30	0.27	0.61	0.41	0.82	0.37	0.87	0.78	0.74	0.53	0.51	0.94	0.55	0.47	0.41	0.45	0.02	1.00	0.01	0.00	0.01
P	0.18	0.40	0.17	0.25	0.41	0.10	0.55	0.02	0.59	0.53	0.50	0.35	0.33	0.64	0.36	0.17	0.31	0.21	0.01	0.67	0.01	0.01	0.00