Doublet Group distance statistics: 48350

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 8, 10, 10, 9, 7, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.006, 0.014, 0.022, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.014 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.007, 0.016, 0.024, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.016 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.004, 0.014, 0.023, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.014 std_dev=0.009
C5	A	0, -0.001, 0.009, 0.018, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.009 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.004, 0.015, 0.026, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.015 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.005, 0.018, 0.031, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.018 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.001, 0.014, 0.027, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.014 std_dev=0.013
N4	A	0, 0.014, 0.041, 0.069, 0.138 max_d=0.138 avg_d=0.041 std_dev=0.028
O2	A	0, 0.012, 0.046, 0.081, 0.223 max_d=0.223 avg_d=0.046 std_dev=0.035
N3	B	0, 0.231, 0.382, 0.532, 0.682 max_d=0.682 avg_d=0.382 std_dev=0.151
O4'	A	0, 0.015, 0.165, 0.316, 0.981 max_d=0.981 avg_d=0.165 std_dev=0.151
N1	B	0, 0.256, 0.408, 0.561, 0.697 max_d=0.697 avg_d=0.408 std_dev=0.153
C4	B	0, 0.202, 0.357, 0.513, 0.696 max_d=0.696 avg_d=0.357 std_dev=0.155
C2	B	0, 0.231, 0.388, 0.544, 0.683 max_d=0.683 avg_d=0.388 std_dev=0.157
C2'	A	0, 0.012, 0.175, 0.338, 1.038 max_d=1.038 avg_d=0.175 std_dev=0.163
C5	B	0, 0.224, 0.397, 0.570, 0.718 max_d=0.718 avg_d=0.397 std_dev=0.173
N9	B	0, 0.209, 0.394, 0.579, 0.761 max_d=0.761 avg_d=0.394 std_dev=0.185
N2	B	0, 0.289, 0.475, 0.661, 1.009 max_d=1.009 avg_d=0.475 std_dev=0.186
C6	B	0, 0.242, 0.434, 0.626, 0.910 max_d=0.910 avg_d=0.434 std_dev=0.192
C8	B	0, 0.236, 0.441, 0.646, 0.897 max_d=0.897 avg_d=0.441 std_dev=0.205
N7	B	0, 0.245, 0.461, 0.678, 1.052 max_d=1.052 avg_d=0.461 std_dev=0.216
C1'	B	0, 0.253, 0.482, 0.711, 1.145 max_d=1.145 avg_d=0.482 std_dev=0.229
O2'	A	0, 0.008, 0.250, 0.493, 1.665 max_d=1.665 avg_d=0.250 std_dev=0.242
C4'	A	0, 0.025, 0.277, 0.529, 1.665 max_d=1.665 avg_d=0.277 std_dev=0.252
O6	B	0, 0.251, 0.528, 0.806, 1.400 max_d=1.400 avg_d=0.528 std_dev=0.277
C3'	A	0, 0.017, 0.297, 0.578, 1.855 max_d=1.855 avg_d=0.297 std_dev=0.280
C2'	B	0, 0.230, 0.578, 0.926, 1.808 max_d=1.808 avg_d=0.578 std_dev=0.348
C5'	A	0, 0.104, 0.455, 0.806, 1.926 max_d=1.926 avg_d=0.455 std_dev=0.351
O4'	B	0, 0.245, 0.600, 0.954, 2.072 max_d=2.072 avg_d=0.600 std_dev=0.355
O5'	A	0, 0.106, 0.473, 0.841, 1.772 max_d=1.772 avg_d=0.473 std_dev=0.367
O3'	A	0, 0.015, 0.456, 0.896, 2.982 max_d=2.982 avg_d=0.456 std_dev=0.440
C3'	B	0, 0.227, 0.681, 1.135, 2.877 max_d=2.877 avg_d=0.681 std_dev=0.454
C4'	B	0, 0.254, 0.710, 1.165, 2.931 max_d=2.931 avg_d=0.710 std_dev=0.455
O2'	B	0, 0.262, 0.723, 1.185, 2.068 max_d=2.068 avg_d=0.723 std_dev=0.461
P	A	0, 0.193, 0.655, 1.117, 2.247 max_d=2.247 avg_d=0.655 std_dev=0.462
OP1	A	0, 0.262, 0.779, 1.296, 2.399 max_d=2.399 avg_d=0.779 std_dev=0.517
C5'	B	0, 0.252, 0.836, 1.420, 3.916 max_d=3.916 avg_d=0.836 std_dev=0.584
O3'	B	0, 0.270, 0.876, 1.482, 3.507 max_d=3.507 avg_d=0.876 std_dev=0.606
P	B	0, 0.342, 1.006, 1.670, 4.123 max_d=4.123 avg_d=1.006 std_dev=0.664
O5'	B	0, 0.200, 0.889, 1.577, 4.623 max_d=4.623 avg_d=0.889 std_dev=0.689
OP2	A	0, 0.096, 0.907, 1.719, 3.488 max_d=3.488 avg_d=0.907 std_dev=0.812
OP2	B	0, 0.277, 1.101, 1.926, 4.837 max_d=4.837 avg_d=1.101 std_dev=0.825
OP1	B	0, 0.313, 1.239, 2.166, 5.466 max_d=5.466 avg_d=1.239 std_dev=0.926

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.04	0.02	0.01	0.02	0.03	0.04	0.03	0.10	0.01	0.12	0.15	0.18	0.11
C2	0.03	0.00	0.10	0.12	0.02	0.05	0.02	0.11	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.10	0.10	0.04	0.19	0.27	0.29	0.18
C2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.04	0.02	0.06	0.07	0.08	0.02	0.08	0.05	0.17	0.01	0.03	0.01	0.20	0.26	0.23	0.18
C3'	0.01	0.12	0.01	0.00	0.15	0.01	0.16	0.03	0.15	0.09	0.14	0.17	0.15	0.02	0.01	0.02	0.17	0.29	0.19	0.13
C4	0.03	0.02	0.04	0.15	0.00	0.09	0.01	0.17	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.12	0.12	0.03	0.26	0.41	0.48	0.26
C4'	0.02	0.05	0.02	0.01	0.09	0.00	0.11	0.01	0.10	0.05	0.06	0.10	0.07	0.11	0.03	0.01	0.01	0.14	0.21	0.04
C5	0.02	0.02	0.06	0.16	0.01	0.11	0.00	0.18	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.13	0.16	0.05	0.27	0.41	0.51	0.26
C5'	0.04	0.11	0.07	0.03	0.17	0.01	0.18	0.00	0.15	0.10	0.14	0.19	0.10	0.06	0.09	0.02	0.01	0.21	0.29	0.02
C6	0.02	0.01	0.08	0.15	0.01	0.10	0.01	0.15	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.11	0.14	0.05	0.24	0.31	0.38	0.20
N1	0.01	0.01	0.02	0.09	0.02	0.05	0.02	0.10	0.01	0.00	0.02	0.03	0.02	0.07	0.06	0.02	0.18	0.24	0.27	0.16
N3	0.02	0.01	0.08	0.14	0.01	0.06	0.01	0.14	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.11	0.11	0.03	0.23	0.35	0.39	0.23
N4	0.03	0.02	0.05	0.17	0.01	0.10	0.01	0.19	0.02	0.03	0.02	0.00	0.03	0.12	0.15	0.04	0.27	0.46	0.55	0.28
O2	0.04	0.01	0.17	0.15	0.02	0.07	0.02	0.10	0.02	0.02	0.02	0.03	0.00	0.15	0.18	0.07	0.17	0.24	0.24	0.17
O2'	0.03	0.10	0.01	0.02	0.12	0.11	0.13	0.06	0.11	0.07	0.11	0.12	0.15	0.00	0.05	0.09	0.13	0.22	0.26	0.14
O3'	0.10	0.10	0.03	0.01	0.12	0.03	0.16	0.09	0.14	0.06	0.11	0.15	0.18	0.05	0.00	0.07	0.19	0.43	0.36	0.21
O4'	0.01	0.04	0.01	0.02	0.03	0.01	0.05	0.02	0.05	0.02	0.03	0.04	0.07	0.09	0.07	0.00	0.09	0.14	0.22	0.14
O5'	0.12	0.19	0.20	0.17	0.26	0.01	0.27	0.01	0.24	0.18	0.23	0.27	0.17	0.13	0.19	0.09	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.15	0.27	0.26	0.29	0.41	0.14	0.41	0.21	0.31	0.24	0.35	0.46	0.24	0.22	0.43	0.14	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.18	0.29	0.23	0.19	0.48	0.21	0.51	0.29	0.38	0.27	0.39	0.55	0.24	0.26	0.36	0.22	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.18	0.18	0.13	0.26	0.04	0.26	0.02	0.20	0.16	0.23	0.28	0.17	0.14	0.21	0.14	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.14	0.27	0.23	0.14	0.18	0.14	0.24	0.16	0.14	0.14	0.15	0.14	0.15	0.14	0.31	0.29	0.24	0.33	0.20	0.62	0.42	0.36
C2	0.13	0.11	0.24	0.22	0.12	0.15	0.13	0.21	0.15	0.13	0.13	0.14	0.12	0.14	0.12	0.26	0.26	0.20	0.34	0.20	0.64	0.43	0.37
C2'	0.27	0.22	0.34	0.30	0.23	0.32	0.22	0.35	0.21	0.23	0.21	0.24	0.24	0.22	0.24	0.41	0.37	0.35	0.34	0.22	0.60	0.38	0.35
C3'	0.30	0.23	0.33	0.30	0.25	0.35	0.25	0.40	0.24	0.27	0.22	0.24	0.25	0.26	0.27	0.40	0.37	0.39	0.35	0.25	0.63	0.38	0.36
C4	0.12	0.12	0.21	0.23	0.11	0.14	0.12	0.23	0.13	0.13	0.11	0.16	0.11	0.15	0.12	0.22	0.26	0.17	0.38	0.18	0.73	0.49	0.42
C4'	0.20	0.16	0.27	0.23	0.17	0.24	0.17	0.30	0.17	0.18	0.15	0.17	0.17	0.18	0.17	0.32	0.29	0.29	0.32	0.19	0.63	0.40	0.35
C5	0.12	0.12	0.21	0.22	0.11	0.15	0.13	0.24	0.13	0.13	0.11	0.15	0.11	0.15	0.12	0.23	0.26	0.19	0.37	0.17	0.73	0.50	0.42
C5'	0.24	0.18	0.28	0.25	0.21	0.27	0.21	0.33	0.20	0.23	0.18	0.19	0.20	0.23	0.22	0.33	0.30	0.32	0.34	0.23	0.66	0.44	0.38
C6	0.13	0.11	0.22	0.21	0.11	0.15	0.13	0.24	0.14	0.13	0.11	0.15	0.12	0.15	0.12	0.25	0.26	0.20	0.35	0.18	0.70	0.47	0.39
N1	0.14	0.12	0.24	0.22	0.12	0.16	0.13	0.22	0.15	0.13	0.12	0.14	0.12	0.15	0.12	0.27	0.26	0.21	0.34	0.19	0.65	0.44	0.38
N3	0.13	0.12	0.23	0.22	0.11	0.14	0.13	0.21	0.14	0.12	0.11	0.16	0.12	0.14	0.11	0.24	0.26	0.18	0.36	0.19	0.68	0.46	0.39
N4	0.13	0.13	0.21	0.25	0.12	0.15	0.13	0.25	0.12	0.14	0.12	0.16	0.12	0.15	0.12	0.22	0.28	0.16	0.40	0.16	0.76	0.53	0.45
O2	0.14	0.12	0.26	0.23	0.12	0.15	0.14	0.20	0.17	0.13	0.15	0.14	0.12	0.15	0.12	0.29	0.27	0.21	0.33	0.21	0.60	0.41	0.36
O2'	0.27	0.22	0.34	0.30	0.23	0.31	0.23	0.34	0.23	0.23	0.22	0.23	0.23	0.23	0.24	0.41	0.38	0.36	0.36	0.24	0.57	0.40	0.36
O3'	0.31	0.22	0.35	0.32	0.24	0.38	0.23	0.44	0.21	0.26	0.20	0.24	0.25	0.25	0.27	0.42	0.41	0.41	0.36	0.23	0.62	0.38	0.37
O4'	0.15	0.13	0.26	0.23	0.13	0.18	0.14	0.24	0.16	0.14	0.14	0.15	0.13	0.15	0.13	0.29	0.28	0.23	0.35	0.20	0.65	0.46	0.39
O5'	0.30	0.27	0.33	0.31	0.29	0.33	0.31	0.40	0.32	0.31	0.29	0.26	0.28	0.33	0.30	0.37	0.36	0.37	0.37	0.35	0.72	0.48	0.42
OP1	0.41	0.37	0.44	0.44	0.41	0.44	0.44	0.50	0.44	0.45	0.40	0.35	0.38	0.47	0.42	0.45	0.47	0.46	0.49	0.48	0.78	0.60	0.53
OP2	0.40	0.34	0.39	0.39	0.39	0.43	0.43	0.52	0.43	0.45	0.38	0.31	0.36	0.47	0.41	0.41	0.41	0.47	0.50	0.48	0.86	0.65	0.58
P	0.32	0.27	0.33	0.32	0.30	0.34	0.32	0.41	0.32	0.34	0.28	0.26	0.28	0.35	0.32	0.36	0.35	0.38	0.38	0.34	0.75	0.50	0.44

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.06	0.02	0.02	0.04	0.05	0.04	0.02	0.01	0.02	0.10	0.01	0.14	0.02	0.23	0.29	0.15
C2	0.04	0.00	0.20	0.18	0.01	0.08	0.02	0.16	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.19	0.20	0.13	0.28	0.02	0.52	0.35	0.30
C2'	0.01	0.20	0.00	0.01	0.11	0.01	0.08	0.09	0.11	0.10	0.16	0.24	0.19	0.07	0.03	0.00	0.02	0.01	0.14	0.10	0.20	0.42	0.26
C3'	0.01	0.18	0.01	0.00	0.13	0.01	0.15	0.03	0.17	0.15	0.18	0.20	0.16	0.16	0.10	0.02	0.01	0.02	0.20	0.18	0.20	0.34	0.22
C4	0.02	0.01	0.11	0.13	0.00	0.05	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.09	0.11	0.07	0.29	0.01	0.49	0.33	0.29
C4'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.05	0.00	0.07	0.01	0.07	0.10	0.07	0.10	0.07	0.10	0.04	0.11	0.02	0.00	0.02	0.08	0.13	0.27	0.07
C5	0.02	0.02	0.08	0.15	0.01	0.07	0.00	0.18	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.09	0.13	0.04	0.36	0.01	0.63	0.43	0.38
C5'	0.06	0.16	0.09	0.03	0.14	0.01	0.18	0.00	0.19	0.17	0.18	0.16	0.14	0.20	0.12	0.06	0.09	0.02	0.01	0.21	0.23	0.24	0.01
C6	0.02	0.02	0.11	0.17	0.01	0.07	0.01	0.19	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.10	0.16	0.07	0.38	0.01	0.68	0.48	0.41
C8	0.02	0.02	0.10	0.15	0.01	0.10	0.01	0.17	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.15	0.14	0.08	0.37	0.02	0.54	0.36	0.34
N1	0.04	0.01	0.16	0.18	0.01	0.07	0.01	0.18	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.15	0.18	0.11	0.33	0.02	0.62	0.43	0.37
N2	0.05	0.01	0.24	0.20	0.02	0.10	0.02	0.16	0.02	0.03	0.01	0.00	0.02	0.03	0.03	0.25	0.24	0.16	0.25	0.03	0.49	0.34	0.28
N3	0.04	0.01	0.19	0.16	0.01	0.07	0.01	0.14	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.18	0.18	0.13	0.24	0.02	0.44	0.31	0.25
N7	0.02	0.02	0.07	0.16	0.01	0.10	0.00	0.20	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.00	0.01	0.13	0.16	0.05	0.41	0.02	0.67	0.48	0.42
N9	0.01	0.02	0.03	0.10	0.01	0.04	0.01	0.12	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.06	0.07	0.01	0.27	0.02	0.41	0.28	0.25
O2'	0.02	0.19	0.00	0.02	0.09	0.11	0.09	0.06	0.10	0.15	0.15	0.25	0.18	0.13	0.06	0.00	0.05	0.08	0.07	0.11	0.15	0.50	0.23
O3'	0.10	0.20	0.02	0.01	0.11	0.02	0.13	0.09	0.16	0.14	0.18	0.24	0.18	0.16	0.07	0.05	0.00	0.09	0.23	0.18	0.30	0.33	0.23
O4'	0.01	0.13	0.01	0.02	0.07	0.00	0.04	0.02	0.07	0.08	0.11	0.16	0.13	0.05	0.01	0.08	0.09	0.00	0.18	0.06	0.24	0.31	0.17
O5'	0.14	0.28	0.14	0.20	0.29	0.02	0.36	0.01	0.38	0.37	0.33	0.25	0.24	0.41	0.27	0.07	0.23	0.18	0.00	0.41	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.10	0.18	0.01	0.08	0.01	0.21	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.02	0.11	0.18	0.06	0.41	0.00	0.75	0.56	0.46
OP1	0.23	0.52	0.20	0.20	0.49	0.13	0.63	0.23	0.68	0.54	0.62	0.49	0.44	0.67	0.41	0.15	0.30	0.24	0.02	0.75	0.00	0.01	0.01
OP2	0.29	0.35	0.42	0.34	0.33	0.27	0.43	0.24	0.48	0.36	0.43	0.34	0.31	0.48	0.28	0.50	0.33	0.31	0.02	0.56	0.01	0.00	0.01
P	0.15	0.30	0.26	0.22	0.29	0.07	0.38	0.01	0.41	0.34	0.37	0.28	0.25	0.42	0.25	0.23	0.23	0.17	0.01	0.46	0.01	0.01	0.00