Doublet Group distance statistics: 48351

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 15, 14, 9, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.005, 0.010, 0.014, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.010 std_dev=0.004
N3	A	0, 0.004, 0.009, 0.015, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.009 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.008, 0.017, 0.026, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.017 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.015, 0.028, 0.041, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.028 std_dev=0.013
C6	A	0, 0.011, 0.024, 0.037, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.024 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.013, 0.026, 0.039, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.026 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.012, 0.025, 0.039, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.025 std_dev=0.014
O2	A	0, 0.028, 0.061, 0.094, 0.169 max_d=0.169 avg_d=0.061 std_dev=0.033
N4	A	0, 0.045, 0.093, 0.141, 0.219 max_d=0.219 avg_d=0.093 std_dev=0.048
C4	B	0, 0.176, 0.283, 0.390, 0.544 max_d=0.544 avg_d=0.283 std_dev=0.107
O4'	A	0, 0.030, 0.146, 0.262, 0.426 max_d=0.426 avg_d=0.146 std_dev=0.116
C6	B	0, 0.193, 0.323, 0.453, 0.616 max_d=0.616 avg_d=0.323 std_dev=0.130
C2'	A	0, 0.071, 0.203, 0.334, 0.563 max_d=0.563 avg_d=0.203 std_dev=0.131
N1	B	0, 0.117, 0.262, 0.408, 0.780 max_d=0.780 avg_d=0.262 std_dev=0.145
N3	B	0, 0.120, 0.283, 0.445, 0.718 max_d=0.718 avg_d=0.283 std_dev=0.162
C5	B	0, 0.208, 0.372, 0.535, 0.772 max_d=0.772 avg_d=0.372 std_dev=0.164
C1'	B	0, 0.221, 0.387, 0.553, 1.006 max_d=1.006 avg_d=0.387 std_dev=0.166
N9	B	0, 0.202, 0.374, 0.546, 0.864 max_d=0.864 avg_d=0.374 std_dev=0.172
O2'	A	0, 0.129, 0.311, 0.493, 0.826 max_d=0.826 avg_d=0.311 std_dev=0.182
O6	B	0, 0.234, 0.419, 0.604, 0.878 max_d=0.878 avg_d=0.419 std_dev=0.185
C4'	A	0, 0.130, 0.320, 0.510, 0.760 max_d=0.760 avg_d=0.320 std_dev=0.190
C2	B	0, 0.097, 0.304, 0.511, 0.928 max_d=0.928 avg_d=0.304 std_dev=0.207
C3'	A	0, 0.143, 0.352, 0.560, 0.841 max_d=0.841 avg_d=0.352 std_dev=0.209
C2'	B	0, 0.378, 0.591, 0.805, 1.193 max_d=1.193 avg_d=0.591 std_dev=0.213
N7	B	0, 0.264, 0.561, 0.857, 1.181 max_d=1.181 avg_d=0.561 std_dev=0.296
C8	B	0, 0.242, 0.539, 0.836, 1.139 max_d=1.139 avg_d=0.539 std_dev=0.297
C5'	A	0, 0.241, 0.554, 0.867, 1.237 max_d=1.237 avg_d=0.554 std_dev=0.313
O2'	B	0, 0.318, 0.635, 0.952, 1.489 max_d=1.489 avg_d=0.635 std_dev=0.317
O3'	A	0, 0.229, 0.547, 0.865, 1.309 max_d=1.309 avg_d=0.547 std_dev=0.318
N2	B	0, 0.148, 0.478, 0.808, 1.381 max_d=1.381 avg_d=0.478 std_dev=0.330
O4'	B	0, 0.349, 0.717, 1.085, 1.612 max_d=1.612 avg_d=0.717 std_dev=0.368
C3'	B	0, 0.575, 0.948, 1.320, 1.851 max_d=1.851 avg_d=0.948 std_dev=0.373
C4'	B	0, 0.520, 0.939, 1.358, 1.925 max_d=1.925 avg_d=0.939 std_dev=0.419
O3'	B	0, 0.716, 1.247, 1.777, 2.514 max_d=2.514 avg_d=1.247 std_dev=0.531
O5'	A	0, 0.259, 0.868, 1.476, 3.271 max_d=3.271 avg_d=0.868 std_dev=0.609
C5'	B	0, 0.842, 1.487, 2.131, 2.941 max_d=2.941 avg_d=1.487 std_dev=0.645
O5'	B	0, 0.842, 1.569, 2.296, 3.570 max_d=3.570 avg_d=1.569 std_dev=0.727
OP1	A	0, 0.614, 1.362, 2.110, 5.091 max_d=5.091 avg_d=1.362 std_dev=0.748
P	A	0, 0.387, 1.225, 2.063, 4.926 max_d=4.926 avg_d=1.225 std_dev=0.838
P	B	0, 0.821, 1.839, 2.857, 5.799 max_d=5.799 avg_d=1.839 std_dev=1.018
OP2	B	0, 0.769, 1.810, 2.851, 7.230 max_d=7.230 avg_d=1.810 std_dev=1.041
OP1	B	0, 0.825, 2.176, 3.528, 7.145 max_d=7.145 avg_d=2.176 std_dev=1.352
OP2	A	0, 0.040, 1.445, 2.851, 7.175 max_d=7.175 avg_d=1.445 std_dev=1.406

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.00	0.21	0.21	0.23	0.17
C2	0.02	0.00	0.07	0.09	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.10	0.03	0.37	0.33	0.59	0.38
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.05	0.01	0.06	0.02	0.06	0.02	0.06	0.06	0.11	0.00	0.02	0.01	0.17	0.27	0.17	0.15
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.11	0.00	0.11	0.02	0.11	0.06	0.10	0.12	0.12	0.01	0.01	0.01	0.20	0.31	0.17	0.18
C4	0.02	0.01	0.05	0.11	0.00	0.07	0.00	0.16	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.13	0.03	0.51	0.52	0.96	0.61
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.07	0.00	0.09	0.01	0.08	0.04	0.05	0.08	0.04	0.04	0.02	0.00	0.02	0.21	0.19	0.08
C5	0.01	0.01	0.06	0.11	0.00	0.09	0.00	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.14	0.03	0.55	0.54	1.00	0.64
C5'	0.02	0.09	0.02	0.02	0.16	0.01	0.18	0.00	0.15	0.09	0.13	0.18	0.06	0.04	0.04	0.02	0.01	0.19	0.24	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.11	0.01	0.08	0.00	0.15	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.12	0.03	0.50	0.41	0.77	0.52
N1	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.37	0.29	0.53	0.36
N3	0.02	0.00	0.06	0.10	0.00	0.05	0.00	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.12	0.03	0.44	0.43	0.79	0.50
N4	0.02	0.01	0.06	0.12	0.00	0.08	0.01	0.18	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.15	0.03	0.54	0.60	1.09	0.68
O2	0.03	0.00	0.11	0.12	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.11	0.14	0.05	0.29	0.30	0.43	0.29
O2'	0.02	0.07	0.00	0.01	0.06	0.04	0.04	0.04	0.04	0.03	0.07	0.06	0.11	0.00	0.04	0.04	0.07	0.36	0.24	0.17
O3'	0.02	0.10	0.02	0.01	0.13	0.02	0.14	0.04	0.12	0.06	0.12	0.15	0.14	0.04	0.00	0.02	0.24	0.41	0.34	0.28
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.02	0.03	0.01	0.03	0.03	0.05	0.04	0.02	0.00	0.18	0.19	0.19	0.16
O5'	0.21	0.37	0.17	0.20	0.51	0.02	0.55	0.01	0.50	0.37	0.44	0.54	0.29	0.07	0.24	0.18	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.21	0.33	0.27	0.31	0.52	0.21	0.54	0.19	0.41	0.29	0.43	0.60	0.30	0.36	0.41	0.19	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.23	0.59	0.17	0.17	0.96	0.19	1.00	0.24	0.77	0.53	0.79	1.09	0.43	0.24	0.34	0.19	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.17	0.38	0.15	0.18	0.61	0.08	0.64	0.01	0.52	0.36	0.50	0.68	0.29	0.17	0.28	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.10	0.08	0.21	0.23	0.08	0.13	0.12	0.21	0.15	0.10	0.11	0.12	0.09	0.13	0.08	0.24	0.35	0.19	0.47	0.21	0.84	0.57	0.47
C2	0.09	0.08	0.19	0.21	0.09	0.11	0.13	0.20	0.16	0.12	0.11	0.14	0.08	0.14	0.09	0.21	0.30	0.17	0.50	0.21	0.84	0.61	0.49
C2'	0.17	0.15	0.30	0.30	0.15	0.22	0.15	0.27	0.17	0.14	0.15	0.18	0.16	0.15	0.15	0.32	0.41	0.24	0.41	0.21	0.79	0.50	0.41
C3'	0.22	0.19	0.32	0.32	0.19	0.25	0.19	0.30	0.20	0.19	0.18	0.21	0.20	0.20	0.20	0.35	0.41	0.27	0.44	0.23	0.83	0.54	0.45
C4	0.09	0.10	0.16	0.19	0.09	0.11	0.13	0.22	0.13	0.14	0.08	0.16	0.09	0.17	0.10	0.17	0.26	0.15	0.59	0.20	0.93	0.77	0.60
C4'	0.12	0.10	0.23	0.24	0.10	0.16	0.13	0.24	0.15	0.12	0.12	0.13	0.11	0.15	0.10	0.26	0.36	0.21	0.46	0.21	0.85	0.57	0.46
C5	0.09	0.09	0.17	0.19	0.09	0.11	0.13	0.23	0.13	0.14	0.08	0.15	0.09	0.17	0.10	0.18	0.27	0.15	0.59	0.20	0.95	0.77	0.60
C5'	0.15	0.14	0.22	0.24	0.15	0.19	0.18	0.27	0.19	0.18	0.15	0.15	0.14	0.20	0.15	0.25	0.34	0.24	0.50	0.25	0.90	0.61	0.50
C6	0.09	0.08	0.18	0.20	0.09	0.11	0.13	0.22	0.14	0.13	0.09	0.14	0.08	0.16	0.09	0.20	0.29	0.16	0.55	0.21	0.92	0.70	0.56
N1	0.09	0.08	0.19	0.21	0.08	0.12	0.12	0.21	0.15	0.12	0.10	0.13	0.08	0.15	0.09	0.22	0.31	0.18	0.51	0.21	0.87	0.63	0.51
N3	0.09	0.09	0.17	0.19	0.09	0.11	0.13	0.21	0.15	0.13	0.08	0.16	0.08	0.15	0.09	0.19	0.27	0.15	0.54	0.21	0.87	0.69	0.54
N4	0.10	0.12	0.15	0.19	0.10	0.14	0.13	0.25	0.12	0.15	0.10	0.17	0.10	0.17	0.11	0.16	0.26	0.15	0.63	0.18	0.97	0.85	0.66
O2	0.11	0.10	0.21	0.23	0.10	0.13	0.13	0.20	0.17	0.11	0.15	0.13	0.09	0.14	0.10	0.23	0.34	0.19	0.46	0.21	0.78	0.53	0.44
O2'	0.18	0.15	0.30	0.31	0.15	0.22	0.16	0.27	0.18	0.15	0.17	0.17	0.16	0.16	0.15	0.33	0.43	0.26	0.37	0.22	0.76	0.45	0.38
O3'	0.29	0.24	0.39	0.37	0.25	0.32	0.23	0.36	0.23	0.25	0.22	0.26	0.26	0.24	0.26	0.43	0.47	0.33	0.43	0.25	0.82	0.53	0.46
O4'	0.11	0.09	0.20	0.22	0.09	0.13	0.12	0.21	0.15	0.11	0.11	0.13	0.09	0.14	0.09	0.23	0.34	0.19	0.50	0.21	0.88	0.62	0.50
O5'	0.36	0.35	0.34	0.34	0.37	0.37	0.40	0.43	0.41	0.39	0.38	0.34	0.35	0.41	0.37	0.36	0.39	0.43	0.61	0.45	0.95	0.77	0.63
OP1	0.44	0.41	0.42	0.43	0.45	0.46	0.48	0.52	0.49	0.49	0.44	0.40	0.42	0.51	0.45	0.45	0.47	0.51	0.60	0.54	0.91	0.74	0.59
OP2	0.67	0.63	0.59	0.64	0.73	0.71	0.83	0.80	0.85	0.83	0.74	0.54	0.63	0.89	0.74	0.55	0.60	0.76	1.00	0.96	1.32	1.20	1.07
P	0.43	0.41	0.37	0.39	0.45	0.44	0.50	0.51	0.52	0.51	0.46	0.37	0.40	0.54	0.46	0.38	0.40	0.50	0.67	0.58	1.02	0.85	0.70

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.22	0.02	0.28	0.33	0.19
C2	0.03	0.00	0.20	0.19	0.01	0.09	0.01	0.18	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.21	0.25	0.14	0.42	0.01	0.65	0.49	0.38
C2'	0.00	0.20	0.00	0.00	0.11	0.01	0.07	0.02	0.10	0.10	0.16	0.24	0.20	0.07	0.03	0.00	0.02	0.01	0.23	0.09	0.33	0.21	0.18
C3'	0.01	0.19	0.00	0.00	0.11	0.00	0.12	0.02	0.14	0.13	0.17	0.22	0.17	0.13	0.07	0.02	0.01	0.02	0.31	0.15	0.40	0.20	0.26
C4	0.02	0.01	0.11	0.11	0.00	0.06	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.10	0.14	0.08	0.45	0.01	0.60	0.52	0.40
C4'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.06	0.00	0.08	0.01	0.09	0.11	0.08	0.11	0.08	0.11	0.05	0.06	0.03	0.00	0.02	0.10	0.26	0.29	0.09
C5	0.01	0.01	0.07	0.12	0.00	0.08	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.14	0.04	0.56	0.01	0.78	0.69	0.55
C5'	0.03	0.18	0.02	0.02	0.15	0.01	0.19	0.00	0.21	0.22	0.19	0.20	0.15	0.23	0.12	0.06	0.04	0.01	0.01	0.23	0.30	0.39	0.02
C6	0.02	0.01	0.10	0.14	0.01	0.09	0.01	0.21	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.18	0.07	0.58	0.00	0.86	0.73	0.58
C8	0.01	0.01	0.10	0.13	0.00	0.11	0.01	0.22	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.15	0.08	0.58	0.02	0.68	0.67	0.56
N1	0.02	0.00	0.16	0.17	0.01	0.08	0.01	0.19	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.17	0.23	0.11	0.51	0.01	0.78	0.62	0.49
N2	0.03	0.01	0.24	0.22	0.01	0.11	0.01	0.20	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.26	0.31	0.17	0.38	0.02	0.65	0.43	0.35
N3	0.03	0.00	0.20	0.17	0.00	0.08	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.19	0.22	0.14	0.37	0.01	0.56	0.43	0.32
N7	0.01	0.01	0.07	0.13	0.00	0.11	0.00	0.23	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.15	0.05	0.64	0.02	0.85	0.80	0.66
N9	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.05	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.07	0.01	0.42	0.01	0.49	0.48	0.37
O2'	0.02	0.21	0.00	0.02	0.10	0.06	0.07	0.06	0.11	0.08	0.17	0.26	0.19	0.06	0.03	0.00	0.05	0.05	0.07	0.09	0.31	0.25	0.14
O3'	0.01	0.25	0.02	0.01	0.14	0.03	0.14	0.04	0.18	0.15	0.23	0.31	0.22	0.15	0.07	0.05	0.00	0.02	0.29	0.19	0.52	0.36	0.34
O4'	0.00	0.14	0.01	0.02	0.08	0.00	0.04	0.01	0.07	0.08	0.11	0.17	0.14	0.05	0.01	0.05	0.02	0.00	0.19	0.05	0.27	0.41	0.22
O5'	0.22	0.42	0.23	0.31	0.45	0.02	0.56	0.01	0.58	0.58	0.51	0.38	0.37	0.64	0.42	0.07	0.29	0.19	0.00	0.63	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.09	0.15	0.01	0.10	0.01	0.23	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.09	0.19	0.05	0.63	0.00	0.98	0.84	0.67
OP1	0.28	0.65	0.33	0.40	0.60	0.26	0.78	0.30	0.86	0.68	0.78	0.65	0.56	0.85	0.49	0.31	0.52	0.27	0.02	0.98	0.00	0.01	0.01
OP2	0.33	0.49	0.21	0.20	0.52	0.29	0.69	0.39	0.73	0.67	0.62	0.43	0.43	0.80	0.48	0.25	0.36	0.41	0.02	0.84	0.01	0.00	0.01
P	0.19	0.38	0.18	0.26	0.40	0.09	0.55	0.02	0.58	0.56	0.49	0.35	0.32	0.66	0.37	0.14	0.34	0.22	0.01	0.67	0.01	0.01	0.00